大白豬和二花臉豬妊娠后期胎盤(pán)轉(zhuǎn)錄譜比較及印記基因鑒定研究的開(kāi)題報(bào)告

大白豬和二花臉豬妊娠后期胎盤(pán)轉(zhuǎn)錄譜比較及印記基因鑒定研究的開(kāi)題報(bào)告開(kāi)題報(bào)告一、研究背景和意義胎盤(pán)是母體和胎兒之間的重要交流器官，不僅可以提供營(yíng)養(yǎng)、氧氣和排泄代謝產(chǎn)物，還可以通過(guò)分泌多種激素和生長(zhǎng)因子調(diào)節(jié)胎兒和母體的代謝和免疫狀態(tài)。研究胎盤(pán)的轉(zhuǎn)錄譜可以揭示其在胎兒生長(zhǎng)發(fā)育和母體適應(yīng)妊娠過(guò)程中的分子調(diào)控機(jī)制。鑒定胎盤(pán)印記基因，即只在父或母親的基因中表達(dá)的基因，可以幫助確定胎兒遺傳信息的來(lái)源，監(jiān)測(cè)母體和胎兒的健康狀況。大白豬和二花臉豬是常見(jiàn)的養(yǎng)殖豬種，其產(chǎn)仔數(shù)量和品質(zhì)對(duì)養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展至關(guān)重要。然而，這兩個(gè)品種在妊娠過(guò)程中的胎盤(pán)轉(zhuǎn)錄譜和印記基因表達(dá)差異仍未被充分研究。本研究旨在借助高通量測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)分析手段，比較大白豬和二花臉豬胎盤(pán)轉(zhuǎn)錄譜的差異，鑒定印記基因并分析其在豬妊娠適應(yīng)性和遺傳調(diào)控中的作用，為育種和豬健康管理提供科學(xué)依據(jù)。二、研究?jī)?nèi)容和方法1.研究?jī)?nèi)容(1)比較大白豬和二花臉豬妊娠后期胎盤(pán)轉(zhuǎn)錄譜差異；(2)鑒定大白豬和二花臉豬胎盤(pán)中的印記基因；(3)分析印記基因在豬妊娠和遺傳調(diào)控中的作用。2.研究方法(1)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物和樣本采集：選取12頭大白豬和12頭二花臉豬，分別從妊娠后期胎盤(pán)中提取RNA樣本。(2)RNA測(cè)序和數(shù)據(jù)分析：采用IlluminaHiSeq平臺(tái)進(jìn)行RNA測(cè)序，利用STRING、GO和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄譜分析。通過(guò)基因家族、調(diào)節(jié)因子和信號(hào)通路分析揭示差異表達(dá)基因的生物學(xué)功能。利用DIP-seq技術(shù)鑒定印記基因。(3)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè):利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對(duì)轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。三、預(yù)期結(jié)果和創(chuàng)新性(1)比較大白豬和二花臉豬妊娠后期胎盤(pán)轉(zhuǎn)錄譜的差異，鑒定差異表達(dá)基因和相關(guān)信號(hào)通路，為豬生殖管理和育種提供科學(xué)依據(jù)。(2)鑒定大白豬和二花臉豬胎盤(pán)中的印記基因，探討其在豬妊娠和遺傳調(diào)控中的作用，為養(yǎng)殖業(yè)健康管理提供理論支持。(3)本研究采用高通量測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)分析手段，為研究胎盤(pán)轉(zhuǎn)錄譜差異和印記基因鑒定提供了新思路和新方法，具有一定的創(chuàng)新性。四、研究進(jìn)度本研究計(jì)劃于2021年6月開(kāi)始，數(shù)據(jù)分析和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證預(yù)計(jì)完成時(shí)間為2022年6月，論文撰寫(xiě)預(yù)計(jì)在2022年9月前完成。五、參考文獻(xiàn)1.FowdenAL,ForheadAJ.Endocrineregulationoffeto-placentalgrowth.HormRes.2009;72(5):257-265.2.ChelbiST,VaimanD.Geneticandepigeneticfactorscontributetotheonsetofpreeclampsia.MolCellEndocrinol.2008;282(1-2):120-129.3.TunsterSJ,OddieTH,JohnRM.TheimprintedgeneGrb10isaregulatorofembryonicandplacentalgrowthinmice.BiolReprod.2011;84(1):122-130.4.WangL,Johnson-RestrepoB,ClarkL,etal.Identificationofaplacental-specificIGF-IIgeneanditspotentialroleinfetalgrowth.MolEndocrinol.1999;13(12):2079-2090.6.CuiSS,KongF,WangXY,etal.Identificationandcomparisonofimprinting-relateddifferentiallyexpressedgenes