第6章細菌的分類和命名課件

第6章細菌的分類和命名1微生物的分類分類是認識客觀事物的一種基本方法。因此，我們要認識、研究和利用各種微生物資源也必須對它們進行分類。分類學(xué)涉及三個相互依存又有區(qū)別的組成部分：分類、鑒定、命名2分類:

根據(jù)一定的原則(表型特征相似性或系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)性)對微生物進行分群歸類，根據(jù)相似性或相關(guān)性水平排列成系統(tǒng)，并對各個分類群的特征進行描述，以便查考和對未被分類的微生物進行鑒定。(根據(jù)現(xiàn)有數(shù)據(jù)建立系統(tǒng)的過程)鑒定：借助于現(xiàn)有的微生物分類系統(tǒng)，通過特征測定，確定未知的、或新發(fā)現(xiàn)的、或未明確分類地位的微生物所應(yīng)歸屬分類群的過程。(根據(jù)現(xiàn)有系統(tǒng)確定未知微生物分類歸屬的過程)命名：是根據(jù)命名法規(guī)，給每一個分類群一個專有的名稱。(分類系統(tǒng)建立過程中的步驟之一)3第一節(jié) 細菌的分類地位4細菌過去歸屬植物界，自1974年以來，劃為原核生物。細菌屬于原核生物界，為種系分類的真細菌；廣義的細菌包括各類原核細胞型微生物，如細菌、放線菌、衣原體、支原體、立克次體和螺旋體；狹義的細菌專指其中的細菌，它的種類最多、數(shù)量最大、最具代表性。細菌的分類層次

與其他生物相同，也是界、門、綱、目、科、屬、種。在細菌中常用屬和種。細菌在原核生物界的位置《手冊》第八版把細菌、放線菌、粘細菌、螺旋體、支

原體和立克次氏體等歸于原核生物界。原核生物界共設(shè)2門、

6綱、19部分。原核生物界（Kingdom:Procaryolae）光合營養(yǎng)原核生物門（Photobacteria）綱Ⅰ.藍綠色光合細菌綱(Bluc-green

Photobacteria)

綱Ⅱ.紅色光合細菌綱（Red

Photobacteria）綱Ⅲ.綠色光合細菌綱（Green

Photobacteria）第1部分化能營養(yǎng)原核生物門（Scolobacteria）

綱Ⅰ.

細菌綱(Bacteria)第2至第17部分綱Ⅱ.立克次體綱（Rickettsia）第18部分

綱Ⅲ.柔膜體綱（Molliculcs）第19部分567古細菌8是一個獨特的系統(tǒng)進化類別，其成員產(chǎn)甲烷、極端耐鹽、高度嗜熱，其細胞壁組成與細菌不同。這些極端微生物被認為是生物進化過程中的早期產(chǎn)物，因此稱之為古細菌。在獸醫(yī)微生物學(xué)中，不占重要地位。910細菌的分類等級11屬

具有共性的若干種的組合，應(yīng)與其它屬有明顯的差異。不同的屬之間的16S

rRNA序列有較大差異，差異應(yīng)大于5～7％。種

是微生物學(xué)分類的最基本單元，可以認為是一群性質(zhì)相似的菌株，與其它菌株群體有明顯差異。凡是16S

rRNA序列同源性大于97％的兩株細菌，即可確定為同一種。12亞種

是指同一菌種的各個細菌，雖然基本性狀基本相同，但是在某些方面仍有一定差異，差異較明顯的稱為亞種，差異不明顯的稱為型。13新種

是指權(quán)威性的分類、鑒定手冊種從未記載過的一種新分離并鑒定過的微生物。菌株

是不同來源的某一種細菌的純培養(yǎng)物。同一種細菌可有許多菌株，其主要性狀應(yīng)完全相同，次要性狀可稍有差異。14又叫模式菌株，具有某種細菌典型特征標準菌株的菌株。種和亞種指定模式菌株（type

strain）；15亞屬和屬指定模式種（type

species）；屬以上至目級分類單元指定模式屬（type

genus）；模式菌株應(yīng)送交菌種保藏機構(gòu)保藏，以便備查考和索取。第二節(jié) 細菌的命名16依據(jù)“國際細菌命名法規(guī)”的規(guī)定，采用拉丁雙名法，每個菌名由兩個部分組成，前一字為屬名，用名詞，第一個字母大寫；后一字為種名，用形容詞，小寫。

均為斜體。中文的命名次序 與拉丁相反，種名在前，屬名在后。金黃色葡萄球菌種名 屬名Staphylococcus

aureus屬名 種名亞種

在學(xué)名后加上ssp.或subsp.（正體）。17新種在學(xué)名后加上sp.nov.（正體）。屬名

通常是一個描述生物形態(tài)的名詞或發(fā)現(xiàn)該生物的人名，詞首必須大寫。種名

表示該生物的某種特征、寄居部位或所致疾病等，字母須小寫。18Staphylococcus

aureusEscherichia

coli金黃色葡萄球菌大腸埃希氏菌拉丁文學(xué)名應(yīng)該按拉丁文字母的發(fā)音規(guī)則讀念，用英語讀念是錯誤的。19第三節(jié) 細菌分類鑒定的標準20形態(tài)特征培養(yǎng)特征生理特征生態(tài)特征化學(xué)組成血清學(xué)反應(yīng)遺傳學(xué)特性細菌分類依據(jù)經(jīng)典鑒定方法的指標基本形態(tài):球狀—球菌；桿狀—桿菌；螺旋狀—螺旋菌21B.

細胞的形狀、大小、結(jié)構(gòu)和染色反應(yīng)2223C.

細胞的群體形態(tài)242526D.

生化性質(zhì)和生態(tài)特征272.分子生物學(xué)方法分類的依據(jù)：遺傳特征282930第四節(jié) 細菌分類的方法31一、雙歧檢索條目分類法細菌分類采用傳統(tǒng)的雙歧檢索條目分類法。此法首選要在細菌的各種性狀中，選擇一項或數(shù)項被認為是最主要的基本性質(zhì)，作為分類指征，在最高一級的分類等階上將細菌分成若干類別；然后在

這些類別中選擇數(shù)項次要性狀為指征，將細菌作次一等階分類，依此類推，一直劃分到種。人為影響因素多，但實際臨床檢驗很實用。二、數(shù)值分類法32原理 根據(jù)數(shù)值分析，借助電子計算機，將

擬分類的細菌按其性狀相似程度歸類定位。各種性狀同等重要，應(yīng)用多菌株比較。所選性狀越多，正確性越高，至少要達到100個，否則易誤判。優(yōu)點：科學(xué)、規(guī)范缺點：需要電子計算機1、《伯吉氏細菌鑒定手冊》（Bergey’s

Manual

ofDeterminative Bacteriology)，D.

Bergey（美國細菌學(xué)家），1923年第1版，1994年第9版。2、《伯吉氏系統(tǒng)細菌學(xué)手冊》（Bergey’s

Manual

ofSystematic

Bacteriology)，Holt（美國細菌學(xué)家），1984-1989年編寫完第1版共4卷，2001年開始發(fā)行第2版共5卷。33第五節(jié) 細菌的分類體系3、Balows等編著的“原核生物”(The

Prokaryyotes

):第二版，1992，可彌補伯吉氏手冊的不足。344、國際系統(tǒng)與進化微生物學(xué)雜志（InternationalJournal

of

Systematic

and

Evolutionary

Microbiology,IJSEM

）：是細菌分類命名的世界公認的權(quán)威期刊，由國際微生物學(xué)會聯(lián)合會（International

Union

ofMicrobiological

Societies）于1901年創(chuàng)刊出版。第六節(jié) 細菌的鑒定一、分類培養(yǎng)一般只有純培養(yǎng)的細菌才能進行鑒定。35二、鑒定方法36除按表型特征、DNA同源性或rRNA序列比較等方

法鑒定細菌外.其他方法，如測定細菌的脂肪酸組成，用氣相－液相－質(zhì)譜分析細菌的脂肪酸譜，每一種細菌的脂肪酸譜是恒定的，可重復(fù)性好，因此此法可用于細菌的鑒定或分類，往往結(jié)合常規(guī)方法參照應(yīng)用。在有條件的單位可用PCR技術(shù)檢測鑒定細菌。用商品化的細菌鑒定試劑盒，取代自行選擇若干檢測項目。細菌學(xué)診斷標本的采集和運送避免雜菌污染不同期不同標本用抗菌素以前標本必須新鮮運送注意保存采集病變明顯部位37革蘭陽性細菌球