向GenBank批量上傳序列的方法_第1頁
向GenBank批量上傳序列的方法_第2頁
向GenBank批量上傳序列的方法_第3頁
向GenBank批量上傳序列的方法_第4頁
向GenBank批量上傳序列的方法_第5頁
已閱讀5頁，還剩9頁未讀， 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明：本文檔由用戶提供并上傳，收益歸屬內(nèi)容提供方，若內(nèi)容存在侵權(quán)，請進行舉報或認領(lǐng)

文檔簡介

向GenBank批量上傳序列的方法Qin1.利用DNAstar的editSeq制作待序列的FASTA文檔：待上傳序列刪減至合適長度后，將待上傳序列全部打開隨后點擊File-exportasone，保存文件格式為：*.fas，將待上傳序列全部歸至一個FASTA文檔。注意序列命名：2.在GenBank的SubmissionTools里，下載序列信息編輯軟件Sequin。網(wǎng)址：/Sequin/（下圖中點擊Instructions下載軟件）注意打開安裝文件后，程序會自動安裝在安裝包所在的文件夾。3.打開Sequin，點擊StartNewSubmission。導(dǎo)入之后，輸入序列ID（序號ID相當(dāng)于編號，可以自由命名，只要各個序列的ID不一致即可。在這里以病人編號作為序列ID）：導(dǎo)入序列成功后，顯示各個序列信息如下：點擊SequencingMethod，將測序方法輸入：選擇上傳序列的用途：病毒類型：編輯每條序列的信息：點擊ImportSourceTable可以導(dǎo)入模板，點擊ExportThisTable可以輸出模板備用。選擇核酸類型，序列內(nèi)容后，點擊OpenRecordViewer。添加每條序列的信息，包括編碼區(qū)重復(fù)區(qū)RNA結(jié)構(gòu)等等。雙擊相關(guān)信息可進行修改，點擊Annotate添加相關(guān)信息。檢查信息是否有誤（也可以點擊Search里的Validate檢測是否有明顯錯誤）：有些錯誤是可以忽略的，如上傳的序列為CDS序列，那么軟件報錯”序列無終止子”時可忽略。隨后，點擊Done保存待上傳序列：注意此時保存的文件包含所有序列信息，因此只需保存一次即可。12.將保存好的文件作為郵件附件，發(fā)送

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明，都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等，如果需要附件，請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙，網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽，若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲空間，僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理，對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯，并不能對任何下載內(nèi)容負責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容，請與我們聯(lián)系，我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評論

0/150

提交評論