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文檔簡介

向GenBank批量上傳序列的方法Qin1.利用DNAstar的editSeq制作待序列的FASTA文檔：待上傳序列刪減至合適長度后，將待上傳序列全部打開隨后點擊File-exportasone，保存文件格式為：*.fas，將待上傳序列全部歸至一個FASTA文檔。注意序列命名：2.在GenBank的SubmissionTools里，下載序列信息編輯軟件Sequin。網(wǎng)址：/Sequin/（下圖中點擊Instructions下載軟件）注意打開安裝文件后，程序會自動安裝在安裝包所在的文件夾。3.打開Sequin，點擊StartNewSubmission。導(dǎo)入之后，輸入序列ID（序號ID相當(dāng)于編號，可以自由命名，只要各個序列的ID不一致即可。在這里以病人編號作為序列ID）：導(dǎo)入序列成功后，顯示各個序列信息如下：點擊SequencingMethod，將測序方法輸入：選擇上傳序列的用途：病毒類型：編輯每條序列的信息：點擊ImportSourceTable可以導(dǎo)入模板，點擊ExportThisTable可以輸出模板備用。選擇核酸類型，序列內(nèi)容后，點擊OpenRecordViewer。添加每條序列的信息，包括編碼區(qū)重復(fù)區(qū)RNA結(jié)構(gòu)等等。雙擊相關(guān)信息可進(jìn)行修改，點擊Annotate添加相關(guān)信息。檢查信息是否有誤（也可以點擊Search里的Validate檢測是否有明顯錯誤）：有些錯誤是可以忽略的，如上傳的序列為CDS序列，那么軟件報錯”序列無終止子”時可忽略。隨后，點擊Done保存待上傳序列：注意此時保存的文件包含所有序列信息，因此只需保存一次即可。12.將保存好的文件作為郵件附件，發(fā)送

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