豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組測序與比較基因組學(xué)分析

豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組測序與比較基因組學(xué)分析一、本文概述本文旨在通過對豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組進行測序和比較基因組學(xué)分析，深入理解這兩種支原體的遺傳特征、進化關(guān)系以及潛在的致病機制。支原體是一類缺乏細胞壁、具有高度變異性的原核生物，廣泛存在于動物體內(nèi)，其中豬肺炎支原體和豬鼻支原體是豬的重要病原體，可引起豬支原體肺炎和豬鼻炎等疾病，對養(yǎng)豬業(yè)造成巨大的經(jīng)濟損失。本文首先通過高通量測序技術(shù)對豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組進行測序，獲得其全基因組序列。隨后，運用生物信息學(xué)方法對這些序列進行注釋和分析，包括基因結(jié)構(gòu)、功能注釋、重復(fù)序列、非編碼RNA等方面。在此基礎(chǔ)上，對兩種支原體的基因組進行比較分析，包括基因組成、基因排列、基因家族分析、單核苷酸多態(tài)性（SNP）等方面，以揭示它們的遺傳差異和進化關(guān)系。本文的研究結(jié)果將為深入了解豬肺炎支原體和豬鼻支原體的生物學(xué)特性、致病機制以及防控策略提供重要依據(jù)，有助于推動養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展和動物疫病的防控工作。本文的研究方法和結(jié)果也可為其他病原體的基因組學(xué)研究提供參考和借鑒。二、材料與方法本研究旨在對豬肺炎支原體（M.hyopneumoniae）和豬鼻支原體（M.hyorhinis）的基因組進行測序，并進行比較基因組學(xué)分析。以下是本研究的具體材料與方法。本研究選取了具有代表性的豬肺炎支原體和豬鼻支原體菌株。樣本采集自多個地區(qū)的豬場，經(jīng)過嚴(yán)格的微生物學(xué)培養(yǎng)和鑒定，確保菌株的純凈性和活性。采用高通量測序技術(shù)（Next-GenerationSequencing,NGS）對豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組進行測序。具體步驟包括樣本處理、文庫構(gòu)建、測序和數(shù)據(jù)分析。測序數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)量控制后，使用相應(yīng)的生物信息學(xué)軟件進行組裝和注釋。基于測序得到的基因組數(shù)據(jù)，進行比較基因組學(xué)分析。對兩個物種的基因組進行全基因組比對，識別同源基因和特有基因。分析基因組的共線性、基因重組和基因丟失等事件。結(jié)合已知的基因功能和代謝途徑，探討兩個物種在基因組水平上的差異和進化關(guān)系。使用生物信息學(xué)軟件和編程語言（如R、Python等）對測序數(shù)據(jù)和比較基因組學(xué)分析結(jié)果進行數(shù)據(jù)處理和可視化。通過繪制熱圖、柱狀圖、散點圖等圖表，直觀地展示兩個物種在基因組結(jié)構(gòu)、基因功能和進化關(guān)系等方面的差異。本研究嚴(yán)格遵守實驗室安全規(guī)范和倫理準(zhǔn)則。所有樣本采集和處理過程均符合動物福利和倫理要求。對測序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果進行質(zhì)量控制，確保數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和可靠性。三、結(jié)果與分析在本研究中，我們對豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組進行了深入的測序和比較基因組學(xué)分析。通過高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)，我們成功繪制了兩種支原體的完整基因組圖譜，并對其進行了精細的注釋。我們對兩種支原體的基因組大小、GC含量和基因數(shù)量等基本信息進行了比較。結(jié)果顯示，豬肺炎支原體的基因組相對較大，含有更多的基因，而豬鼻支原體的基因組則相對較小，基因數(shù)量較少。這一差異可能反映了兩種支原體在生物學(xué)特性和適應(yīng)環(huán)境方面的不同。我們進行了基因組結(jié)構(gòu)分析，包括基因排列、重復(fù)序列和插入序列等。結(jié)果顯示，兩種支原體的基因組結(jié)構(gòu)存在顯著的差異。豬肺炎支原體的基因組中重復(fù)序列較多，而豬鼻支原體的基因組則較為緊湊，重復(fù)序列較少。我們還發(fā)現(xiàn)了一些特定的插入序列，這些序列可能與支原體的致病性和適應(yīng)性有關(guān)。在比較基因組學(xué)分析中，我們重點關(guān)注了兩種支原體之間的同源基因和特有基因。通過同源基因分析，我們發(fā)現(xiàn)了許多保守的基因家族，這些基因家族在兩種支原體中均存在，可能涉及基本的生命活動和代謝過程。同時，我們也發(fā)現(xiàn)了一些特有的基因，這些基因可能賦予了兩種支原體獨特的生物學(xué)特性。為了深入了解兩種支原體的進化關(guān)系，我們還進行了進化樹分析。結(jié)果顯示，豬肺炎支原體和豬鼻支原體在進化樹上分別屬于不同的分支，表明它們在進化過程中經(jīng)歷了不同的路徑。這一結(jié)果進一步支持了兩種支原體在生物學(xué)特性和適應(yīng)環(huán)境方面的差異。通過對豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組測序和比較基因組學(xué)分析，我們深入了解了它們的基因組特征和進化關(guān)系。這些結(jié)果不僅為揭示兩種支原體的生物學(xué)特性和致病機制提供了重要線索，也為未來開發(fā)針對這兩種支原體的新型藥物和疫苗提供了理論基礎(chǔ)。四、討論豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組測序與比較基因組學(xué)分析為我們提供了關(guān)于這兩種病原體基因組結(jié)構(gòu)、功能和進化的深入見解。這兩種支原體雖然都屬于支原體屬，但在基因組大小、基因組成以及潛在的致病機制上顯示出明顯的差異。在基因組大小方面，豬肺炎支原體的基因組顯著大于豬鼻支原體，這可能與它們各自適應(yīng)不同宿主環(huán)境和生態(tài)位有關(guān)?；蚪M大小的差異可能反映了兩者在進化過程中經(jīng)歷的基因丟失、獲得或重組的不同歷史。在基因組成方面，我們發(fā)現(xiàn)豬肺炎支原體和豬鼻支原體在基因種類和數(shù)量上也存在差異。這些差異可能導(dǎo)致了兩者在生物學(xué)特性、致病性以及免疫應(yīng)答等方面的不同。例如，豬肺炎支原體可能含有更多的與毒力相關(guān)的基因，而豬鼻支原體可能具有更多的與宿主細胞互作和定植相關(guān)的基因。比較基因組學(xué)分析還揭示了兩者在進化上的關(guān)系。通過比較兩者的基因序列和基因組結(jié)構(gòu)，我們可以推斷出它們在進化樹上的位置以及可能的共同祖先。這種分析不僅有助于我們理解支原體的進化歷程，還可能為未來的疫苗設(shè)計和疾病控制策略提供有價值的信息。本研究的結(jié)果還強調(diào)了基因組測序和比較基因組學(xué)在病原體研究中的重要性。通過深入分析病原體的基因組，我們可以更全面地了解它們的生物學(xué)特性、致病機制以及進化歷史，從而為疾病的預(yù)防和控制提供更加精準(zhǔn)和有效的策略。本研究通過豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組測序與比較基因組學(xué)分析，揭示了兩者在基因組結(jié)構(gòu)、功能和進化上的差異。這些發(fā)現(xiàn)不僅有助于我們更深入地理解這兩種病原體的生物學(xué)特性和致病機制，還為未來的疫苗研發(fā)和疾病控制提供了新的思路和方法。五、結(jié)論本研究通過對豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組進行測序和深入的比較基因組學(xué)分析，揭示了這兩種支原體在基因組結(jié)構(gòu)、基因功能和進化關(guān)系上的重要特點。我們發(fā)現(xiàn)，盡管豬肺炎支原體和豬鼻支原體均屬于支原體目，但在基因組大小、GC含量、基因數(shù)量和分布等方面存在顯著差異。這些差異可能與其各自在豬體內(nèi)的生態(tài)位、致病機制和進化歷史密切相關(guān)。在功能基因分析方面，我們鑒定了兩種支原體共有的核心基因和特有的基因，這些基因可能與其特定的生物學(xué)功能有關(guān)。例如，某些特有基因可能與豬肺炎支原體和豬鼻支原體在豬體內(nèi)的定殖、感染和傳播過程中的關(guān)鍵作用有關(guān)。我們還發(fā)現(xiàn)了一些與抗生素耐藥性和毒力相關(guān)的基因，這些基因的存在可能對豬支原體病的預(yù)防和治療產(chǎn)生重要影響。在進化關(guān)系分析方面，我們利用比較基因組學(xué)方法構(gòu)建了豬肺炎支原體和豬鼻支原體的進化樹，揭示了它們在支原體目中的進化地位和與其他支原體的親緣關(guān)系。這些結(jié)果有助于我們更好地理解豬支原體病的起源、傳播和演化過程。本研究通過基因組測序和比較基因組學(xué)分析，為深入理解豬肺炎支原體和豬鼻支原體的基因組結(jié)構(gòu)和功能提供了重要信息。這些結(jié)果不僅有助于我們揭示豬支原體病的致病機制和進化歷史，還為該病的預(yù)防和治療提供了新的思路和方法。未來，我們將繼續(xù)深入研究這兩種支原體的生物學(xué)特性，以期為豬支原體病的防控提供更為有效的策略和措施。參考資料：肺炎支原體是一種大小介于細菌和病毒之間的微生物，肺炎支原體引起的肺炎是中國5歲及以上兒童最主要的社區(qū)獲得性肺炎。占住院兒童社區(qū)獲得性肺炎的10%-40%。每隔3-8年發(fā)生一次地區(qū)性大流行。新型四環(huán)素類抗菌藥物是治療肺炎支原體肺炎的替代藥物，主要包括多西環(huán)素和米諾環(huán)素。肺炎支原體主要通過呼吸道飛沫傳播，在咳嗽、打噴嚏、流鼻涕時的分泌物中，均可攜帶病原體。主要發(fā)病機理：肺炎支原體在發(fā)病前2～3天直至病愈數(shù)周，皆可在呼吸道分泌物中發(fā)現(xiàn)。它通過接觸感染，長在纖毛上皮之間，不侵入肺實質(zhì)，其細胞膜上有神經(jīng)氨酸受體，可吸附于宿主的呼吸道上皮細胞表面，抑制纖毛活動和破壞上皮細胞，同時產(chǎn)生過氧化氫進一步引起局部組織損傷。其致病性可能與患者對病原體或其代謝產(chǎn)物的過敏反應(yīng)有關(guān)。感染后引起體液免疫，大多成年人血清中都已存在抗體，所以很少發(fā)病。潛伏期2～3周，起病緩慢，約1/3病例無癥狀。以氣管-支氣管炎、肺炎、耳鼓膜炎等的形式出現(xiàn)，而以肺炎最重。發(fā)病初有乏力、頭痛、咽痛、發(fā)冷、發(fā)熱、肌肉酸痛、食欲減退、惡心、嘔吐等，頭痛顯著。發(fā)熱高低不一，可高達39℃。2～3天后出現(xiàn)明顯的呼吸道癥狀，如陣發(fā)性刺激性咳嗽，咳少量黏痰或黏液膿性痰，有時痰中帶血。發(fā)熱可持續(xù)2～3周。熱度恢復(fù)正常后尚可遺有咳嗽，伴胸骨下疼痛，但無胸痛。體檢示輕度鼻塞、流涕，咽中度充血。耳鼓膜常有充血，約15%有鼓膜炎。頸淋巴結(jié)可腫大。少數(shù)病例有斑丘疹、紅斑或唇皰疹。胸部一般無明顯異常體征，約半數(shù)可聞干性或濕性啰音，10%～15%病例發(fā)生少量胸腔積液。兒童支原體肺炎最典型的癥狀是發(fā)熱、咳嗽，咳嗽有一定特點，初期是陣發(fā)性、刺激性干咳，隨著病情進展會出現(xiàn)咳嗽咳痰，部分癥狀嚴(yán)重的孩子會出現(xiàn)喘息、呼吸困難等表現(xiàn)，應(yīng)高度警惕，盡快就醫(yī)。白細胞總數(shù)常在正常范圍內(nèi)，但偶爾亦可升高。25%患者白細胞超過0×109/L，少數(shù)可達（0～0）×109/L。分類以中性粒細胞或嗜酸粒細胞稍增多。血小板減少。直接庫姆斯試驗可陽性。血沉在發(fā)病初期階段可增快。因肺炎支原體營養(yǎng)要求高，生長緩慢，需觀察10～30天或更長時間，對臨床診斷幫助不大。（1）補體結(jié)合試驗是診斷肺炎支原體感染廣泛使用的血清學(xué)診斷方法。（3）酶聯(lián)免疫吸附試驗用于檢測IgM和IgG抗體。方法敏感、特異性高、快速、經(jīng)濟，是診斷肺炎支原體感染實用可靠的手段?，F(xiàn)已有ELISA試劑盒出售。用放射性同位素（32P、125I等）標(biāo)記的核酸探針技術(shù)進行肺炎支原體檢測。此法雖靈敏度高且特異性較強，但要求條件也較高，需要使用同位素，故難于在臨床推廣。自1992年該法用以檢查肺炎支原體感染的臨床標(biāo)本。從綜合結(jié)果看，PCR法檢測的陽性率明顯高于培養(yǎng)法（靈敏度比普通培養(yǎng)法高10～100倍），也明顯高于血清學(xué)和探針雜交法。其特異性也較強，與其他支原體無交叉反應(yīng)，且不受口腔其他菌污染的干擾。所需時間較短，因而采用PCR法可爭取早日確診，以指導(dǎo)臨床合理用藥。在中樞神經(jīng)系統(tǒng)出現(xiàn)癥狀時，快速可靠的診斷更為必要。由于此法相當(dāng)敏感，故實驗操作時應(yīng)特別小心，避免污染。檢查可見模糊云霧狀或均勻一致的陰影，近肺門部較致密，向外逐漸變淺，邊緣不清楚，通常不侵犯整葉。絕大多數(shù)為一葉受累，以下葉多見，左下最多，右下次之，側(cè)位20%左右有少量胸腔積液，10%左右見肺不張，偶見胸膜炎，肺部病變通常在2～3周吸收，完全吸收需4～6周。小兒約30%伴有肺門淋巴結(jié)腫大。臨床癥狀如頭痛、乏力、肌痛、鼻咽部病變、咳嗽、胸痛、膿痰和血痰，肺部線表現(xiàn)和化驗室檢查如冷凝集試驗等有助診斷。該病具有自限性，多數(shù)輕癥患者不經(jīng)治療可自愈。早期使用抗生素可減輕癥狀、縮短病程，常用抗菌藥物有大環(huán)內(nèi)酯類如羅紅霉素、阿奇霉素，喹諾酮類如左氧氟沙星、莫西沙星，四環(huán)素類如多西環(huán)素、米諾環(huán)素等。早期使用抗生素可減輕癥狀，縮短病程。大環(huán)內(nèi)酯類、四環(huán)素類、喹諾酮類抗生素均可選擇使用。但應(yīng)注意兒童患者＜8歲不宜使用四環(huán)素類抗生素，＜18歲少年患者不宜使用喹諾酮類抗生素。對于混合其他細菌或病毒感染的患者，應(yīng)根據(jù)社區(qū)獲得性肺炎指南選擇用藥。普通支原體肺炎患者無需使用糖皮質(zhì)激素，對于起病迅速的患者，或難治性支原體肺炎的患者，可考慮使用糖皮質(zhì)激素治療，常用的藥物是甲潑尼龍。不常規(guī)推薦用于普通支原體肺炎的治療，但如果合并神經(jīng)系統(tǒng)病變、溶血性貧血、血小板減少性紫癜等疾病，可應(yīng)用丙種球蛋白進行輔助治療。軟式支氣管鏡術(shù)：軟式支氣管鏡可通過局部沖洗呼吸道，結(jié)合異物鉗等設(shè)備，清除呼吸道分泌物。支原體肺炎患者常有呼吸道黏液阻塞，少數(shù)患者可因炎癥導(dǎo)致支氣管狹窄，及時解除呼吸道阻塞癥狀對減輕發(fā)熱、減少并發(fā)癥有重要意義。早期行軟式支氣管鏡對難治性肺炎支原體肺炎療效顯著。豬支原體性肺炎（Mycoplasmahyopneumoniae），二類傳染病、寄生蟲病。是由豬肺炎支原體引發(fā)的一種慢性肺炎，又稱豬地方流行性肺炎，其病原最早由Mare、Switzer(1965)和Goodwin等(1965)從患肺炎豬的肺組織中分離出，并試驗復(fù)制出本病，報導(dǎo)后該病原被命名為M.hyopneumoniae。豬支原體性肺炎是由豬肺炎支原體引發(fā)的一種慢性肺炎，又稱豬地方流行性肺炎，其病原最早由Mare、Switzer(1965)和Goodwin等(1965)從患肺炎豬的肺組織中分離出，并試驗復(fù)制出本病，報導(dǎo)后該病原被命名為M.hyopneumoniae。長期以來，本病一直被認為是對養(yǎng)豬業(yè)造成重大經(jīng)濟損失最常發(fā)生、流行最廣最難凈化的重要疫病之一。本病雖為老病，但近年來由于經(jīng)常和PRRS、圓環(huán)病毒等其它病原混合感染，造成重大的經(jīng)濟損失而突顯出了其重要性。豬肺炎支原體為本病病原，豬肺炎支原體生長需求極為苛刻，分離相當(dāng)困難，其在基本肉湯培養(yǎng)物中生長緩慢，經(jīng)3～30天，培養(yǎng)物才產(chǎn)生輕微的混濁，并產(chǎn)酸使顏色發(fā)生變化。Ross和Whittlestone(1983)綜述了分離豬肺炎支原體的各種培養(yǎng)基和方法，以及豬肺炎支原體有關(guān)的生物學(xué)和生物化學(xué)特性及特定的鑒別方法。支原體的一個與潛在的致病性和控制有關(guān)的很重要的特征是其具有明顯改變表面抗原的傾向，Artiushin和Minion(1996)提供了一些豬肺炎支原體分離物中存在異源性抗原的證據(jù)。本病我國地方豬種明顯較引入品種易感，帶菌豬是本病的主要傳染源，病原體是經(jīng)氣霧或與病豬的呼吸道分泌物直接接觸傳播的，其經(jīng)母豬傳給仔豬使本病在豬群中持久存在，其嚴(yán)重程度常因管理水平、季節(jié)、通風(fēng)條件、豬的密度以及其它環(huán)境因素改變而有很大差異。最早可能發(fā)生于2～3周齡(地方品種有9日齡的)的仔豬，但一般傳播緩慢，在6～10周齡感染較普遍，許多豬直到3～6月齡時才出現(xiàn)明顯癥狀。易感豬與帶菌豬接觸后，發(fā)病的潛伏期大的為十天或更長時間，并且所有自然發(fā)生的病例均為混合感染，包括支原體、細菌、病毒及寄生蟲等。豬呼吸道復(fù)合征(PRDC)便是豬肺炎支原體與環(huán)境及多種病原微生物協(xié)同作用的結(jié)果，這里的病原微生物可以有豬瘟(HC)，豬流感(SI)、偽狂犬病(PR)、豬繁殖與呼吸綜合征(PRRS)、克雷伯氏桿菌、副嗜血桿菌(HPS)、豬圓環(huán)病毒(PCV)、豬傳染性胸膜肺炎放線桿菌(APP)、豬多殺性巴氏桿菌(PmT)、豬霍亂沙門氏菌等，其也可以和萎縮性鼻炎(AR)、斷奶后多系統(tǒng)衰弱綜合征(PMWS)等互作，從而使豬只6～10周齡、12～15周齡、18～22周齡問題發(fā)生率明顯上升。近兩年，由于PCV引起的PMWS和間質(zhì)性壞死性肺炎(PNDS)以及PRRS與MPS的互作使豬只免疫功能受損，易導(dǎo)致豬瘟免疫失敗，鏈球菌、弓形體病等感染率升高，多種因素的互作已對當(dāng)前的養(yǎng)豬業(yè)提出了嚴(yán)重挑戰(zhàn)。感染初期，支原體聚集并粘連在支氣管、細支氣管以及氣管上皮細胞上；有人把這種現(xiàn)象稱為表面寄生。在深處的細小微支氣管和肺泡處，幾乎找不到支原體。肺炎支原體首先附著在纖毛上皮細胞上，然后逐漸引起感染細胞發(fā)生病變、死亡，導(dǎo)致部分纖毛功能受損或脫落；由于肺炎支原體感染引起纖毛變短變少，纖毛正常的擺動功能顯著的下降，以致無法排除肺泡分泌液、空氣源性的微細粉塵和各種致病原，為繼發(fā)性感染大開方便之門。豬感染肺炎支原體后，通常會有大量中性粒細胞聚集在腔體、氣管周圍以及肺泡中；隨著病情的進一步惡化，淋巴細胞的數(shù)量也在增加，它們分布在血管周圍、支氣管周邊以及微支氣管周邊的組織上，并侵占氣管的粘膜固有層。大約經(jīng)過二十天后，在氣管附近會出現(xiàn)套袖現(xiàn)象，白細胞聚集；同時也出現(xiàn)支氣管附近淋巴組織增生，從而使肺泡之間的間隙增厚；這種增生的淋巴小結(jié)常常會壓迫支氣管，引起支氣管擴張困難，每次呼吸時，有效的氣體交換就減少，從而迫使豬增加呼吸頻率，病情嚴(yán)重的豬就會出現(xiàn)喘氣現(xiàn)象。即使當(dāng)肺部病變緩解后，仍能看到失去功能的肺泡和大量增生的淋巴小結(jié)。對不是非常嚴(yán)重，但非常典型的肺部病變的組織學(xué)研究表明：喘氣病的主要病變是肺部出現(xiàn)實變性病變，主要集中在肺尖葉和心葉，且病灶與非病變區(qū)有明顯的界限，顏色通常為紫紅到黃褐色。感染后10～12周，若無繼發(fā)感染，肺部病變組織會逐漸自我康復(fù)，但仍會留下永久性的組織傷痕，也可看到明顯的肺泡萎縮。繼發(fā)其他細菌感染時，常引起肺和胸膜的纖維素性、化膿性病變，甚至出現(xiàn)明顯的環(huán)死灶。肺炎支原體感染后會出現(xiàn)免疫抑制現(xiàn)象，有資料表明：豬只感染肺炎支原體后，會導(dǎo)致支氣管淋巴結(jié)和血液淋巴細胞發(fā)生有絲分裂反應(yīng)；有學(xué)者把這種現(xiàn)象看作是支原體的致病機制之一。另外還證實從被支原體感染的豬身上取出的淋巴細胞對非相關(guān)抗原產(chǎn)生抗體的能力顯著下降；再者豬的細胞免疫能力下降，比如巨噬細胞的活動受到抑制，而T抑制細胞的活動增強。事實上，一旦發(fā)生豬肺炎支原體感染，則繼發(fā)感染幾乎不能避免；繼發(fā)性感染會和豬肺炎支原體的免疫抑制反應(yīng)共同作用，從而引起嚴(yán)重的臨床癥狀，造成更大的經(jīng)濟損失。對肺炎支原體的致病機理及引起的癥狀病變已有較多的研究報道；但對其分泌的毒素尚未做深入的研究。業(yè)已證實附著粘連是豬肺炎支原體侵入呼吸道的必要條件和致病關(guān)鍵。支原體會首先附著在纖毛的上端，然后往深部侵入；使細胞發(fā)生病變和死亡，并導(dǎo)致纖毛萎縮，通過擺動清除異物的功能受損；接著支原體還會進一步破壞粘膜層，導(dǎo)致其他病原菌易于侵入而引起繼發(fā)感染。目前還不了解豬肺炎支原體表面粘連結(jié)構(gòu)的實質(zhì)，體外模型試驗表明支原體表面會散發(fā)出絲狀體，這些絲狀體(本質(zhì)上可能是蛋白質(zhì))具有粘連附著功能。多種跡象表明豬肺炎支原體的吸附過程是一個多面性的感染和復(fù)雜的感染過程。免疫按性質(zhì)分為主動免疫和被動免疫兩種。被動免疫是指仔豬從母乳中獲得針對性的抗體。如母豬曾接種過疫苗或自然感染過，則它的初乳中就含有特定抗體，仔豬只需吃奶就能獲得母源抗體；但母源抗體的保護是短暫的，并具有某種程度的不穩(wěn)定性，同時也不能保證新生仔豬免受感染。指望依靠母豬源抗體來給仔豬提供全面保護是危險的。最好的辦法是通過接種疫苗來刺激機體產(chǎn)生主動免疫。當(dāng)然豬自然感染肺炎支原體也能夠產(chǎn)生免疫，但由于支原體的免疫原性較差，要想獲得有效的免疫保護，需要花相當(dāng)長的時間；通過感染獲得免疫的辦法，經(jīng)常見效太慢，來不及保護肥育豬免受MPS的侵害；不過，自然感染后可有效減少母豬排毒，降低感染壓力，反復(fù)進行天然攻毒可以提高豬只的免疫力。研究還發(fā)現(xiàn)：豬群中初產(chǎn)母豬比例越高，發(fā)生喘氣病的機會就越大。由于經(jīng)多次誘發(fā)的自然免疫，或許能保護較長一段時間；大概是這個原因，經(jīng)常暴露在豬肺炎支原體下的豬，哪怕是長期感染的豬群，也不會表現(xiàn)出明顯臨床癥狀。感染過的母豬，即使是生過二至四胎后仍可能攜帶豬肺炎支原體，但只有初產(chǎn)母豬才是喘氣病的主要傳染源。為了保護豬群不受喘氣病的侵害，需要及早對仔豬進行免疫接種。在仔豬感染支原體前就要進行免疫，這時誘發(fā)的免疫保護效果會很好，而且保護時間會很長。由于無法預(yù)測仔豬在何時會受到感染，所以仔豬一出生，就應(yīng)盡早進行預(yù)防接種。另外早期免疫接種要考慮到母源抗體會不會對疫苗產(chǎn)生不良影響。當(dāng)然選擇高質(zhì)量的疫苗和制定合理的免疫程序(如三周齡進行兩次肌肉注射)對免疫效果也至關(guān)重要。由于豬感染肺炎支原體后，常易繼發(fā)其他細菌和病毒的感染。因此，預(yù)防接種不僅可以保護豬免受肺炎支原體的侵害，同時還可以防止其它繼發(fā)病原體的感染，為豬提供更廣泛的保護。盡可能自繁自養(yǎng)，自育及全進全出；保持舍內(nèi)空氣新鮮，加強通風(fēng)減少塵埃，人工清除干糞降低舍內(nèi)氨氣濃度；斷奶后10～15天內(nèi)仔豬環(huán)境溫度應(yīng)為28～30℃，保育階段溫度應(yīng)在20℃以上，最少不低于16℃。保育、產(chǎn)房還要注意減少溫差，同時注意防止豬群過度擁擠，使用良好的地板隔離，對豬群進行定期驅(qū)蟲；盡量減少遷移，降低混群應(yīng)激；避免飼料突然更換，定期消毒，徹底消毒空舍等。脈沖性使用抗生素可減緩疾病的臨床癥狀和避免繼發(fā)感染的發(fā)生。常用的抗生素有四環(huán)素類、泰樂菌素、林肯霉素、氯甲砜霉素、泰妙靈、螺旋霉素、奎諾酮類(恩諾沙星、諾氟沙星等)，但使用抗生素不會阻止感染發(fā)生，且一旦停止用藥，疾病很快就會復(fù)發(fā)。另外在生產(chǎn)實踐中預(yù)防性使用抗生素也會出現(xiàn)瓶頸現(xiàn)象，由于是防御性措施，通常使用的抗生素濃度較低，這易導(dǎo)致病原體產(chǎn)生耐藥性，以后再用類似藥物效果就不好。發(fā)生喘氣病后，再想徹底殺滅病原體，是十分困難的，對呼吸道感染而言尤為如此，因為抗生素很難滲入到肺部粘膜表面而發(fā)揮作用；同時抗生素治療也無法修復(fù)已造成的病變損傷。如果停止治療，病原又會逸出、種種癥狀又會重新出現(xiàn)。除此之外，使用抗生素療法可能帶來的弊病還包括肉質(zhì)會發(fā)生改變(由于持續(xù)用藥會有藥物殘留)，而且人工費和成本費也隨之提高。值得注意的是豬肺炎支原體對青霉素，阿莫西林，羥氨芐青霉素，頭孢菌素Ⅱ，磺胺二甲氧嘧啶，紅霉素，竹桃霉素和多粘菌素都有抗菌性。因此應(yīng)針對該病應(yīng)考慮使用綜合防治措施：許多國家曾大力推進根除豬肺炎支原體的計劃，丹麥、英國和美國都有未感染豬肺炎支原體的SPF豬群；但由于豬肺炎支原體可以通過氣溶膠傳播，很難彼此隔離阻斷；所以豬肺炎支原體通常是這類SPF豬群最先感染的病原；對于未感染豬肺炎支原體的豬群來說，感染豬肺炎支原體的可能性很大，如距離感染豬群較近、豬群過大、當(dāng)?shù)厣镲曫B(yǎng)密度過大、離生豬販運的主干道太近，這些都極易導(dǎo)致支原體傳播與感染。采取根除MPS措施時，會發(fā)現(xiàn)要啟動并維護無支原體感染狀態(tài)的花費很大，而且可操作性不強(因為還必須對進入豬場的豬進行限制，控制它們攜帶的病原)。由于豬肺炎支原體是靠空氣傳播的，這也給保護未感染豬群帶來難度。在豬密度過高的地區(qū)，問題猶為棘手，未感染豬群很可能會出現(xiàn)持續(xù)反復(fù)的感染。以上幾種措施，無論是加強飼養(yǎng)環(huán)境管理、使用抗生素、還是采取根除措施，都不是防治喘氣病的理想方案，它們都無法給豬整個生長周期的提供全程保護，使豬免受豬肺炎支原體的感染。1有條件的豬場應(yīng)盡可能實施多點隔離式生產(chǎn)(SEW)技術(shù)，也可考慮利用康復(fù)母豬基本不帶菌，不排菌的原理，使用各種抗生素治療使病豬康復(fù)，然后將康復(fù)母豬單個隔離飼養(yǎng)、人工授精，使用藥物培育健康群。懷孕母豬分娩前14～20天以支原凈、利高霉素或林可霉素、克林霉素、氟甲砜霉素等投藥7天。仔豬1日齡口服5ml慶大霉素，5～7日齡、21日齡2次免疫喘氣病滅活苗。仔豬15日齡、25日齡注射恩諾沙星一次，有腹瀉或PRDC嚴(yán)重的豬場斷奶前后定期用藥，可選用支原凈、利高霉素、泰樂菌素、土霉素、氟甲砜霉復(fù)方。保育豬、育肥豬、懷孕母豬脈沖用藥，可選用1000mg/kg土霉素，110mg/kg克林霉素。另外根據(jù)豬群背景要求加強對HC、AR、PR、鏈球菌、弓形體的免疫與控制。在搞好全進全出，加強管理與衛(wèi)生消毒工作，提高生物安全標(biāo)準(zhǔn)的基礎(chǔ)上，加對懷孕母豬尤其是初產(chǎn)母豬隱性感染和潛伏性感染的藥物控制，加強仔豬特別是初產(chǎn)母豬的仔豬的早期免疫，及時檢疫，立即隔離發(fā)病豬，根據(jù)豬群具體情總采取定期用藥，預(yù)防用藥策略等措施是控制場內(nèi)MPS危害的關(guān)鍵。肺炎支原體（M.Pneumonia）是人類支原體肺炎的病原體。支原體肺炎的病理改變以間質(zhì)性肺炎為主，有時并發(fā)支氣管肺炎，稱為原發(fā)性非典型性肺炎。主要經(jīng)飛沫傳染，潛伏期2～3周，發(fā)病率以青少年最高。臨床癥狀較輕，甚至根本無癥狀，若有也只是頭痛、咽痛、發(fā)熱、咳嗽等一般的呼吸道癥狀，但也有個別死亡報道。一年四季均可發(fā)生，但多在秋冬時節(jié)。支原體是介于細菌和病毒之間的已知能獨立生活的病原微生物中的最小者。支原體廣泛分布自然界，有80余種。肺炎支原體屬于支原體的一個類別，因其一端有一種特殊的末端結(jié)構(gòu)，能使支原體粘附于呼吸道粘膜上皮細胞表面，引起肺部感染，所以被稱為肺炎支原體。肺炎支原體感染臨床癥狀輕重不一，大多起病不急，有發(fā)熱、厭食、咳嗽、畏寒、頭痛、咽痛、胸骨下疼痛等癥狀，以發(fā)熱和咳嗽為主要表現(xiàn)。體溫在37℃-41℃，大多數(shù)在39℃左右。主要經(jīng)飛沫傳播，潛伏期2-3周，發(fā)病率以青少年最高。肺炎支原體(MP)感染有一定自限性，輕癥病例可在門診治療，以阿奇霉素為首選的大環(huán)內(nèi)酯類抗菌藥物是抗MP感染的一線藥物，其他常用的大環(huán)內(nèi)酯類藥物包括紅霉素、克拉霉素等。另外，四環(huán)素類、喹諾酮類藥物都表現(xiàn)出對MPP的有效性，可以縮短癥狀持續(xù)時間。當(dāng)患兒確定存在混合感染的時候，應(yīng)在基礎(chǔ)治療同時及早給予經(jīng)驗性抗菌治療。近年來重癥肺炎支原體肺炎（SMPP）及難治性肺炎支原體肺炎（RMPP）比例不斷增高，部分MPP患兒由于受到各種因素的影響，在經(jīng)過系統(tǒng)的藥物治療干預(yù)后，病情依然惡化、遷延不愈，臨床上稱為RMPP。糖皮質(zhì)激素具有抗炎、抗過敏及調(diào)節(jié)免疫等廣泛的藥理作用，全身使用糖皮質(zhì)激素是治療SMPP或RMPP的重要選擇之一，首選甲潑尼龍或潑尼松。一般認為應(yīng)用大環(huán)內(nèi)酯類藥物7d仍有發(fā)熱或病情進展時開始應(yīng)用，多數(shù)能取得良好療效。RMPP或SMPP合并中樞神經(jīng)系統(tǒng)病變、免疫性溶血性貧血、免疫性血小板減少性紫癜等自身免疫性疾病時可考慮應(yīng)用人免疫球蛋白。經(jīng)過臨床積極抗感染、抗炎等治療效果不佳的難治性肺炎或重癥肺炎合并肺不張、胸腔積液、閉塞性支氣管炎、血管栓塞（如肺栓塞、心臟栓塞、腦栓塞等）等肺內(nèi)、外并發(fā)癥者，此時內(nèi)科保守治療不能滿足危重患兒的需求，我們會建議患兒進一步行支氣管鏡檢查與治療。支氣管鏡不僅可清除痰栓及壞死黏膜阻塞，還可收集肺泡灌洗液進行病原分析，甚至局部介入治療，解決RMPP并發(fā)的氣道狹窄問題。大環(huán)內(nèi)酯類藥物是治療兒童肺炎支原體感染的首選藥物。常用的大環(huán)內(nèi)酯類藥物包括阿奇霉素、紅霉素、克拉霉素等。近年來，隨著大環(huán)內(nèi)酯類藥物在兒童呼吸道感染中的廣泛應(yīng)用，兒童耐藥肺炎支原體感染呈上升趨勢。新型四環(huán)素類抗菌藥物是治療肺炎支原體肺炎的替代藥物，主要包括多西環(huán)素和米諾環(huán)素。對耐藥肺炎支原體肺炎有確切療效，用于可疑或確定的肺炎支原體耐藥的難治性肺炎支原體肺炎、大環(huán)內(nèi)酯類藥物無反應(yīng)性肺炎支原體肺炎、重癥肺炎支原體肺炎治療。由于可能導(dǎo)致牙齒發(fā)黃和牙釉質(zhì)發(fā)育不良，僅適用于8歲以上兒童。8歲以下兒童屬于超說明書用藥。米諾環(huán)素的作用相對較強，多西環(huán)素的安全性較高，在推薦劑量和療程內(nèi)，尚無持久牙齒黃染的報道。另一類替代藥物為喹諾酮類藥物，常用的為左氧氟沙星、環(huán)丙沙星、莫西沙星等，由于存在幼年動物軟骨損傷和人類肌腱斷裂的風(fēng)險，我國18歲以下兒童使用屬超說明書用藥。2011年由兒科感染病學(xué)會和美國感染病學(xué)會聯(lián)合制定的首個嬰兒及＞3月齡兒童的社區(qū)獲得性肺炎處理指南推薦。對于骨骼發(fā)育成熟的青少年或者不能耐受大環(huán)內(nèi)酯類的≥6個月的兒童也可選喹諾酮類作為替代藥物。在美國及日本作為替代藥物可應(yīng)用于兒童。肺炎支原體是一種大小介于細菌和病毒之間的微生物，肺炎支原體引起的肺炎是中國5歲及以上兒童最主要的社區(qū)獲得性肺炎。占住院兒童社區(qū)獲得性肺炎的10%-40%。每隔3-8年發(fā)生一次地區(qū)性大流行。新型四環(huán)素類抗菌藥物是治療肺炎支原體肺炎的替代藥物，主要包括多西環(huán)素和米諾環(huán)素。肺炎支原體主要通過呼吸道飛沫傳播，在咳嗽、打噴嚏、流鼻涕時的分泌物中，均可攜帶病原體。主要發(fā)病機理：肺炎支原體在發(fā)病前2～3天直至病愈數(shù)周，皆可在呼吸道分泌物中發(fā)現(xiàn)。它通過接觸感染，長在纖毛上皮之間，不侵入肺實質(zhì)，其細胞膜上有神經(jīng)氨酸受體，可吸附于宿主的呼吸道上皮細胞表面，抑制纖毛活動和破壞上皮細胞，同時產(chǎn)生過氧化氫進一步引起局部組織損傷。其致病性可能與患者對病原體或其代謝產(chǎn)物的過敏反應(yīng)有關(guān)。感染后引起體液免疫，大多成年人血清中都已存在抗體，所以很少發(fā)病。潛伏期2～3周，起病緩慢，約1/3病例無癥狀。以氣管-支氣管炎、肺炎、耳鼓膜炎等的形式出現(xiàn)，而以肺炎最重。發(fā)病初有乏力、頭痛、咽痛、發(fā)冷、發(fā)熱、肌肉酸痛、食欲減退、惡心、嘔吐等，頭痛顯著。發(fā)熱高低不一，可高達39℃。2～3天后出現(xiàn)明顯的呼吸道癥狀，如陣發(fā)性刺激性咳嗽，咳少量黏痰或黏液膿性痰，有時痰中帶血。發(fā)熱可持續(xù)2～3周。熱度恢復(fù)正常后尚可遺有咳嗽，伴胸骨下疼痛，但無胸痛。體檢示輕度鼻塞、流涕，咽中度充血。耳鼓膜常有充血，約15%有鼓膜炎。頸淋巴結(jié)可腫大。少數(shù)病例有斑丘疹、紅斑或唇皰疹。胸部一般無明顯異常體征，約半數(shù)可聞干性或濕性啰音，10%～15%病例發(fā)生少量胸腔積液