甲狀腺乳頭狀癌的核外分子遺傳和表觀遺傳學(xué)研究的開題報(bào)告

甲狀腺乳頭狀癌的核外分子遺傳和表觀遺傳學(xué)研究的開題報(bào)告【摘要】甲狀腺乳頭狀癌是一種較為常見的甲狀腺惡性腫瘤，而其核外分子遺傳和表觀遺傳學(xué)特征目前還未完全闡明。本研究將通過基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)，綜合研究甲狀腺乳頭狀癌患者與正常對照組在基因表達(dá)、DNA甲基化水平以及組蛋白修飾等方面的差異，以期揭示其發(fā)生機(jī)制和臨床治療的候選靶點(diǎn)?！娟P(guān)鍵詞】甲狀腺乳頭狀癌；核外分子；基因組學(xué)；轉(zhuǎn)錄組學(xué)；表觀遺傳學(xué)【引言】甲狀腺乳頭狀癌（PTC）是一種主要起源于甲狀腺濾泡上皮細(xì)胞的惡性腫瘤，而且在世界范圍內(nèi)都是最普遍的甲狀腺疾病之一（1）。隨著分子生物學(xué)和分子遺傳學(xué)的發(fā)展，人們對于PTC的病因和分子機(jī)制的認(rèn)識已經(jīng)有了一定的突破。然而，對于PTC的核外分子遺傳和表觀遺傳學(xué)特征的研究還比較缺乏。目前，在核外分子遺傳方面，與PTC相關(guān)的研究主要集中于miRNA、lncRNA等小分子RNA的調(diào)控功能，但其在多個(gè)實(shí)驗(yàn)中的表達(dá)水平和作用機(jī)制并不一致（2）。同時(shí)，PTC的表觀遺傳學(xué)也受到人們的重視，DNA甲基化和組蛋白修飾是兩個(gè)關(guān)鍵的表觀遺傳標(biāo)志，主要參與基因表達(dá)調(diào)控和染色質(zhì)狀態(tài)維持。近期研究發(fā)現(xiàn)，PTC中某些靶基因的DNA甲基化和/或組蛋白修飾水平與該腫瘤的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和臨床預(yù)后相關(guān)（3）。因此，從核外分子遺傳和表觀遺傳學(xué)方面系統(tǒng)性地研究PTC的特征，對于揭示其發(fā)生機(jī)制和潛在的治療靶點(diǎn)具有重要的意義。【研究問題】PTC的核外分子遺傳和表觀遺傳學(xué)特征是怎樣的？其與該腫瘤的發(fā)生機(jī)制和臨床特征有何關(guān)系？是否存在潛在的治療靶點(diǎn)？【研究目的】通過基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)，系統(tǒng)性地研究PTC患者與正常對照組在核外分子遺傳和表觀遺傳學(xué)方面的差異，

分析其與該腫瘤的關(guān)系和臨床意義，為該腫瘤的預(yù)后和治療提供新的方向?！狙芯糠椒ā?.樣本采集：收集PTC患者和正常對照組的甲狀腺組織標(biāo)本。2.基因組學(xué)研究：

采用高通量測序技術(shù)（如RNA-seq）對患者和對照組的全基因組進(jìn)行測序，以獲得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。利用軟件（如DESeq2）對兩組數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析，篩選出差異表達(dá)基因（DEGs），并進(jìn)行GO、KEGG等富集分析。3.轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究：通過芯片技術(shù)，對兩組樣本進(jìn)行基因表達(dá)分析，篩選出差異表達(dá)的基因。根據(jù)差異表達(dá)的miRNA和lncRNA，多重相關(guān)分析，共同預(yù)測和確認(rèn)PTC潛在的自然靶標(biāo)和調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)。4.表觀遺傳學(xué)研究：利用MeDIP-seq、ChIP-seq等技術(shù)，研究PTC患者和對照組在DNA甲基化和/或組蛋白修飾水平上的差異。對差異信號進(jìn)行生物信息學(xué)分析，找出PTC的表觀修飾微環(huán)境及其潛在調(diào)控機(jī)制?！狙芯績?nèi)容】本研究將通過上述三個(gè)方面的研究，綜合分析PTC患者與對照組在基因表達(dá)、DNA甲基化和組蛋白修飾等方面的差異，挖掘該腫瘤的特征和潛在的治療靶點(diǎn)。其中，要重點(diǎn)關(guān)注PTC的個(gè)體差異性和預(yù)后因子與表觀修飾信號的關(guān)系，探討其預(yù)測性和診斷/治療潛力。【預(yù)期成果】1.揭示PTC的核外分子遺傳和表觀遺傳學(xué)特征，對該腫瘤的發(fā)生機(jī)制和潛在的治療靶點(diǎn)進(jìn)行挖掘。2.確認(rèn)PTC中與miRNA和lncRNA相關(guān)的靶標(biāo)和調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)，為基于此的治療提供新想法。3.發(fā)現(xiàn)PTC患者與正常對照組在DNA甲基化和組蛋白修飾水平上的差異，并分析其與預(yù)后和治療效果的相關(guān)性，為該腫瘤的治療和診斷提供新的方向和標(biāo)志物?！狙芯?/p>