豬全基因組選育尾組織樣品采集規(guī)程

1豬全基因組選育尾組織樣品采集規(guī)程本文件規(guī)定了豬全基因組選育尾組織樣品采集操作步驟要求。本文件適用于豬全基因組選育樣品采集，其他動(dòng)物樣品采集可參考使用。2規(guī)范性引用文件下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中，注日期的引用文件，僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改單）適用于本文件。GB/T22283長白豬種豬GB/T22284大約克夏豬種豬GB/T22285杜洛克豬種豬GB/T40184-2021畜禽基因組選育育種技術(shù)規(guī)程GB/T33681.12017高通量基因測序樣本預(yù)處理方法第一部分：動(dòng)物組織樣本預(yù)處理NY/T820-2004種豬登記技術(shù)規(guī)范全國生豬遺傳改良計(jì)劃（2021-2035）3術(shù)語和定義3.1全基因組選育Whole-genomebreeding利用覆蓋于全基因組的遺傳標(biāo)記估計(jì)或預(yù)測畜禽個(gè)體育種值，從而實(shí)現(xiàn)個(gè)體遺傳評估并進(jìn)行種用個(gè)體選擇的方法。3.2核心群NucleusGroup根據(jù)育種目的按照一定的選擇標(biāo)準(zhǔn)，選出的優(yōu)秀群體，它的生產(chǎn)性能、品種特征等高于一般生產(chǎn)群，是育種的核心。3.3仔豬斷尾Pigletsdockedtails2小豬在出生1-3天后，采用人工斷尾的方法，將仔豬的尾骨在距尾根2～3節(jié)尾骨處進(jìn)行切割。3.4樣品采集Samplecollection為實(shí)施全基因組選育，從豬身體上采集可以提取DNA的生物樣本（尾組織）。按照GB/T33681.12017的規(guī)定執(zhí)行。4樣品采集要求4.1采集對象核心群母豬所分娩的1-3日齡仔豬。4.2采樣要求1.5厘米尾組織。4.3采集數(shù)量核心群后代公豬至少每窩采集1頭，母豬至少采集2頭，批次生產(chǎn)的每個(gè)批次的樣本采集數(shù)量不低于本批次后備豬選留計(jì)劃中公豬的100倍，母豬的3倍。5樣本編號(hào)5.1豬只編碼規(guī)則采用《NY/T820-2004種豬登記技術(shù)規(guī)范》中規(guī)定的15位耳號(hào)編碼規(guī)則。5.2樣本編碼規(guī)則兩年內(nèi)不得有重復(fù)的樣本編碼，建議使用二維碼編碼。6操作步驟及要求6.1采樣物資準(zhǔn)備凍存管、凍存盒、冷凍標(biāo)簽、95%酒精、電熱斷尾鉗、采樣表、簽字筆、標(biāo)簽紙，凍存管貼好冷凍標(biāo)簽放入凍存盒中備用。冷凍標(biāo)簽要求耐水、耐酒精、耐低溫（-20℃至-80℃)。6.2樣品采集時(shí)間仔豬出生1-3天后，斷尾的同時(shí)進(jìn)行樣品采集。6.3樣品采集方法及步驟將仔豬腹部朝下橫抱，另一人左手將仔豬尾巴拉直，右手用預(yù)熱的斷尾鉗將尾巴在距離尾根3厘米處剪斷。用斷尾鉗修剪斷掉的尾組織，保留任意處1.5厘米，放入貼好標(biāo)簽的凍存管內(nèi)，同時(shí)在采樣表上記錄好仔豬所在欄位、樣品標(biāo)簽號(hào)及仔豬耳號(hào)。樣品收集人員將裝有樣品的凍存管中加入95%酒精，讓酒精沒過樣品，擰好凍存管蓋子。將帶有二維碼的圓形冷凍標(biāo)簽，貼在與凍存管上對應(yīng)號(hào)的凍存管蓋子上。將樣品與采樣記錄進(jìn)行核對，核對無誤后，將凍存盒蓋好，貼好對應(yīng)批次標(biāo)簽，放入-20℃冰箱內(nèi)保存。3根據(jù)采樣記錄，在10根10的凍存盒中進(jìn)行所需送檢樣品查找，一般每盒樣品的樣品編號(hào)最好是連續(xù)的，這樣方便樣品檢索。將需要送去檢測的樣品，放到凍存盒，用膠帶封好凍存盒，避免運(yùn)輸過程中顛簸，導(dǎo)致樣品損壞，郵寄樣品時(shí)，要在包裝盒中加入冰袋，延長樣品保存時(shí)