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文檔簡(jiǎn)介
ICS65.020.30
B40DB32
江蘇省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB32/T3686—2019
山羊副流感病毒3型檢測(cè)技術(shù)規(guī)程
TechnicalregulationsfordetectionofCaprineparainfluenzavirus3
2019-12-03發(fā)布2019-12-25實(shí)施
江蘇省市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布
DB32/T3686—2019
山羊副流感病毒3型檢測(cè)技術(shù)規(guī)程
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了山羊副流感病毒3型(Caprineparaifluenzavirus3,CPIV3)的病原學(xué)檢測(cè)(病毒核酸
的RT-PCR和熒光定量RT-PCR檢測(cè))、血清學(xué)檢測(cè)(血凝抑制(HI)試驗(yàn))的技術(shù)要求。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于山羊副流感病毒3型及其感染情況的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修訂單)適用于本文件。
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范
3病原學(xué)檢測(cè)
3.1材料
微量移液器及吸頭、DEPC水處理的離心管、吸頭、PCR擴(kuò)增管、TRIzol試劑、三氯甲烷、異丙醇、
DEPC處理水(用水符合GB/T6682規(guī)定)、反轉(zhuǎn)錄酶/TaqDNA聚合酶混合液、2×一步法RT-PCR反應(yīng)緩
沖液、一步法熒光定量RT-PCR試劑盒、TAE緩沖液、瓊脂糖、核酸染料、引物MF/MR、引物qMF/qMR
與探針(附錄A)。
3.2儀器設(shè)備
PCR儀、熒光定量PCR儀、臺(tái)式冷凍離心機(jī)、電泳儀和水平電泳槽、凝膠成相儀(或紫外透射儀)。
3.3反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)
3.3.1樣品處理與RNA的提取
采集羊的鼻拭子、氣管拭子或肺臟(樣品的采集、保存和運(yùn)輸應(yīng)符合NY/T541相關(guān)規(guī)定)。取200
μL待檢樣品液至無(wú)菌無(wú)RNA酶的EP管中,使用TRIzol試劑、RNA提取試劑盒或自動(dòng)化核酸提取儀等方
法提取RNA。
3.3.2RT-PCR反應(yīng)
RT-PCR反應(yīng)使用20μL體系:10μL2×一步法RT-PCR反應(yīng)緩沖液、引物MF/MR各0.5μL(10
μmol/L)、0.4μL反轉(zhuǎn)錄酶/TaqDNA聚合酶混合液、4μLRNA模板,4.6μLDEPC處理水。反應(yīng)條件為:
45℃反轉(zhuǎn)錄30min;94℃預(yù)變性2min;94℃30s,54℃30s,72℃30s,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);72℃延伸
10min。
3.3.3結(jié)果判定
取PCR產(chǎn)物10μL,在1.2%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳,在凝膠成像系統(tǒng)中觀察結(jié)果。樣品PCR檢測(cè)產(chǎn)
物電泳后有大小為346bp的片段判斷為山羊副流感病毒3型核酸陽(yáng)性,無(wú)條帶判斷為陰性。每次試驗(yàn)應(yīng)
設(shè)置陰陽(yáng)性對(duì)照,陰陽(yáng)性對(duì)照應(yīng)不出現(xiàn)或出現(xiàn)相應(yīng)大小的條帶。
1
DB32/T3686—2019
3.4熒光定量反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(熒光定量RT-PCR)
3.4.1核酸提取與熒光定量RT-PCR反應(yīng)
核酸提取同3.3.1。熒光定量RT-PCR反應(yīng)使用20μL體系:10μL2×一步法反應(yīng)緩沖液,0.4μL反轉(zhuǎn)
錄酶,0.4μLDNA聚合酶,引物qMF/qMR各0.4μL(10μmol/L),0.8μL探針,0.4μL染料,2μLRNA
模板,5.2μLDEPC處理水。將PCR管置于熒光定量PCR儀器上進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,程序如下:42℃5min;
95℃10s;95℃5s,60℃34s,共進(jìn)行40個(gè)循環(huán)。
3.4.2熒光定量RT-PCR結(jié)果判定
陽(yáng)性對(duì)照擴(kuò)增曲線呈標(biāo)準(zhǔn)的S曲線,且Ct值<30。陰性對(duì)照擴(kuò)增曲線應(yīng)為基線下的水平線。若樣本
曲線呈S形曲線,且Ct值<38為陽(yáng)性;未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線為陰性。
4血清學(xué)檢測(cè)——血凝抑制(HI)試驗(yàn)
4.1材料
微量移液器及配套吸頭、96孔V型微量反應(yīng)板、生理鹽水、1%豚鼠紅細(xì)胞懸液(配制方法見(jiàn)附錄B)、
病毒液(相關(guān)試驗(yàn)操作應(yīng)符合GB19489的要求)、標(biāo)準(zhǔn)陽(yáng)性血清、標(biāo)準(zhǔn)陰性血清。
4.2儀器設(shè)備
離心機(jī)、恒溫培養(yǎng)箱。
4.3病毒血凝效價(jià)測(cè)定
每次HI試驗(yàn)前應(yīng)對(duì)病毒血凝效價(jià)進(jìn)行測(cè)定,檢測(cè)與判定方法如下:
——在反應(yīng)板一排各孔中加25μL生理鹽水;
——第一孔中加25μL病毒分離液,按照1:2倍比稀釋,最后一孔不加抗原作陰性對(duì)照。每孔中再加
25μLPBS;
——每孔加25μL1%豚鼠紅細(xì)胞液,37℃孵育40min;
——當(dāng)紅細(xì)胞被凝集時(shí),紅細(xì)胞均勻分布在反應(yīng)板底部,反應(yīng)板傾斜片刻,紅細(xì)胞不下滑;紅細(xì)胞
未被凝集時(shí),反應(yīng)板傾斜片刻,可見(jiàn)沉淀的紅細(xì)胞向下滑動(dòng),形成流線。HA效價(jià)為全部紅細(xì)
胞出現(xiàn)凝集時(shí)的最高稀釋倍數(shù)。
4.4HI試驗(yàn)
按如下方法進(jìn)行HI試驗(yàn):
——在96孔V型微量反應(yīng)板各孔中加25μL生理鹽水;
——加25μL經(jīng)處理的血清于第一孔中,混勻后取25μL加到第2孔中,依次倍比稀釋,從第2孔
加至第11孔,第11孔混勻后吸取25μL棄去,最后1孔不加血清作為對(duì)照;
——每孔中加25μL4個(gè)HA單位的病毒抗原,37℃孵育40min;
——每孔加25μL1%豚鼠紅細(xì)胞液,37℃孵育40min。
4.5結(jié)果判定
將反應(yīng)板傾斜70度左右,若無(wú)凝集反應(yīng),則沉淀的紅細(xì)胞向下滑動(dòng),呈流線狀,記錄為抗體陽(yáng)性。
完全抑制凝集的抗體最高稀釋倍數(shù)為血清的HI抗體滴度。
抗體滴度大于等于16為陽(yáng)性,小于等于8為陰性。若檢測(cè)發(fā)病后雙份血清(第一份血清應(yīng)在臨床癥
狀出現(xiàn)后立即采集,第二份血清在兩周后采集),抗體滴度上升4倍或4倍以上時(shí),表明羊只近期被感染。
2
DB32/T3686—2019
附錄A
(資料性附錄)
引物
A.1引物序列
表A.1用于RT-PCR和熒光定量RT-PCR檢測(cè)的引物、探針
引物靶基因序列(5’-3’)產(chǎn)物
MFM基因AGTGATCTAGATGATGATCCA
346bp
MRM基因GTTATTGATCCAATTGCTGT
qMFM基因GCTTGGCTTCTTTGAAATGG
150bp
qMRM基因GCCTGCAGAAGTTCCTTGTC
FAM-CAATCGGACTAGCCAAGTATGGTGG
CPIV3ProbeM基因
GA-TAMRA
A.2引物的溶解
引物MF、MR、qMF、qMR用滅菌的DEPC處理水溶解到濃度為10μmol/L;CPIV3Probe用滅菌的
DEPC處理水溶解到濃度為10μmol/L。
3
DB32/T3686—2019
附錄B
(資料性附錄)
1%豚鼠紅細(xì)胞的配制
B.1生理鹽水配制方法
氯化鈉(NaCl)0.9g
去離子水加至100mL,121℃高壓滅菌15min,冷卻后保存于2℃~8℃冰箱中備用。
B.21%豚鼠細(xì)胞懸液制備
無(wú)菌采集豚鼠血液,置于EDTA抗凝管中混勻,2℃~8℃保存。使用前吸取紅細(xì)胞懸液置離心管中,
加入生理鹽水洗滌3次,每次以2000r/min離心5min,將血漿、白細(xì)胞等充分洗去,沉積的紅細(xì)胞用生
理鹽水稀釋成1%的懸液,保存于2℃~8℃冰箱中備用。
───────────
4
DB32/T3686—2019
前言
本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/T1.1—2009給出的規(guī)則起草。
本標(biāo)準(zhǔn)由江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院提出并歸口。
本標(biāo)準(zhǔn)起草單位:江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院。
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:李文良、毛立、李基棕、郝飛、劉茂軍、楊蕾蕾、孫敏。
I
DB32/T3686—2019
山羊副流感病毒3型檢測(cè)技術(shù)規(guī)程
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了山羊副流感病毒3型(Caprineparaifluenzavirus3,CPIV3)的病原學(xué)檢測(cè)(病毒核酸
的RT-PCR和熒光定量RT-PCR檢測(cè))、血清學(xué)檢測(cè)(血凝抑制(HI)試驗(yàn))的技術(shù)要求。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于山羊副流感病毒3型及其感染情況的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修訂單)適用于本文件。
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范
3病原學(xué)檢測(cè)
3.1材料
微量移液器及吸頭、DEPC水處理的離心管、吸頭、PCR擴(kuò)增管、TRIzol試劑、三氯甲烷、異丙醇、
DEPC處理水(用水符合GB/T6682規(guī)定)、反轉(zhuǎn)錄酶/TaqDNA聚合酶混合液、2×一步法RT-PCR反應(yīng)緩
沖液、一步法熒光定量RT-PCR試劑盒、TAE緩沖液、瓊脂糖、核酸染料、引物MF/MR、引物qMF/qMR
與探針(附錄A)。
3.2儀器設(shè)備
PCR儀、熒光定量PCR儀、臺(tái)式冷凍離心機(jī)、電泳儀和水平電泳槽、凝膠成相儀(或紫外透射儀)。
3.3反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)
3.3.1樣品處理與RNA的提取
采集羊的鼻拭子、氣管拭子或肺臟(樣品的采集、保存和運(yùn)輸應(yīng)符合NY/T541相關(guān)規(guī)定)。取200
μL待檢樣品液至無(wú)菌無(wú)RNA酶的EP管中,使用TRIzol試劑、RNA提取試劑盒或自動(dòng)化核酸提取儀等方
法提取RNA。
3.3.2RT-PCR反應(yīng)
RT-PCR反應(yīng)使用20μL體系:10μL2×一步法RT-PCR反應(yīng)緩沖液、引物MF/MR各0.5μL(10
μmol/L)、0.4μL反轉(zhuǎn)錄酶/TaqDNA聚合酶混合液、4μLRNA模板,4.6μLDEPC處理水。反應(yīng)條件為:
45℃反轉(zhuǎn)錄30min;94℃預(yù)變性2min;94℃30s,54℃30s,72℃30s,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);72℃延伸
10min。
3.3.3結(jié)果判定
取PCR產(chǎn)物10μL,在1.2%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳,在凝膠成像系統(tǒng)中觀察結(jié)果。樣品PCR檢測(cè)產(chǎn)
物電泳后有大小為346bp的片段判斷為山羊副流感病毒3型核酸陽(yáng)性,無(wú)條帶判斷為陰性。每次試驗(yàn)應(yīng)
設(shè)置陰陽(yáng)性對(duì)照,陰陽(yáng)性對(duì)照應(yīng)不出現(xiàn)或出現(xiàn)相應(yīng)大小的條帶。
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DB32/T3686—2019
3.4熒光定量反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(熒光定量RT-PCR)
3.4.1核酸提取與熒光定量RT-PCR反應(yīng)
核酸提取同3.3.1。熒光定量RT-PCR反應(yīng)使用20μL體系:10μL2×一步法反應(yīng)緩沖液,0.4μL反轉(zhuǎn)
錄酶,0.4μLDNA聚合酶,引物qMF/qMR各0.4μL(10μmol/L),0.8μL探針,0.4μL染料,2μLRNA
模板,5.2μLDEPC處理水。將PCR管置于熒光定量PCR儀器上進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,程序如下:42℃5min;
95℃10s;95℃5s,60℃34s,共進(jìn)行40個(gè)循環(huán)。
3.4.2熒光定量RT-PCR結(jié)果判定
陽(yáng)性對(duì)照擴(kuò)增曲線呈標(biāo)準(zhǔn)的S曲線,且Ct值<30。陰性對(duì)照擴(kuò)增曲線應(yīng)為基線下的水平線。若樣本
曲線呈S形曲線,且Ct值<38為陽(yáng)性;未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線為陰性。
4血清學(xué)檢測(cè)——血凝抑制(HI)試驗(yàn)
4.1材料
微量移液器及配套吸頭、96孔V型微量反應(yīng)板、生理鹽水、1%豚鼠紅細(xì)胞懸液(配制方法見(jiàn)附錄B)、
病毒液(相關(guān)試驗(yàn)操作應(yīng)符合GB19489的要求)、標(biāo)準(zhǔn)陽(yáng)性血清、標(biāo)準(zhǔn)陰性血清。
4.2儀器設(shè)備
離心機(jī)、恒溫培養(yǎng)箱。
4.3病毒血凝效價(jià)測(cè)定
每次HI試驗(yàn)前應(yīng)對(duì)病毒血凝效價(jià)進(jìn)行測(cè)定,檢測(cè)與判定方法如下:
——在反應(yīng)板一排各孔中加25μL生理鹽水;
——第一孔中加25μL病毒分離液,按照1:2倍比稀釋,最后一孔不加抗原作陰性對(duì)照。每孔中再加
25μLPBS;
——每孔加25μL1%豚鼠紅細(xì)胞液,37℃孵育40min;
——當(dāng)紅細(xì)胞被凝集時(shí),紅細(xì)胞均勻分布在反應(yīng)板底部,反應(yīng)板傾斜片刻,紅細(xì)胞不下滑;紅細(xì)胞
未被凝集時(shí),反應(yīng)板傾斜片刻,可見(jiàn)沉淀的紅細(xì)胞向下滑動(dòng),形成流線。HA效價(jià)為全部紅細(xì)
胞出現(xiàn)凝集時(shí)的最高稀釋倍數(shù)。
4.4HI試驗(yàn)
按如下方法進(jìn)行HI試驗(yàn):
——在96孔V型微量反應(yīng)板各孔中加25μL生理鹽水;
——加25μL經(jīng)處理的血清于第一孔中,混勻后取25μL加到第2孔中,依次倍比稀釋,從第2孔
加至第11孔,第11孔混勻后吸取25μL棄去,最后1孔不加血清作為對(duì)照;
——每孔中加25μL4個(gè)HA單位的病毒抗原,37℃孵育40min;
——每孔加25μL1%豚鼠紅細(xì)胞液,37℃孵育40min。
4.5結(jié)果判定
將反應(yīng)板傾斜70度左右,若無(wú)凝集反應(yīng),則沉淀的紅細(xì)胞向下滑動(dòng),呈流線狀,記錄為抗體陽(yáng)性。
完全抑制凝集的抗體最高稀釋倍數(shù)為血清的HI抗體滴度。
抗體滴度大于等于16為陽(yáng)性,小于等于8為陰性。若檢測(cè)發(fā)病后雙份血清(第一份血清應(yīng)在臨床癥
狀出現(xiàn)后立即采集,第二份血清在兩周后采集),抗體滴度上升4倍或4倍以上時(shí),表明羊只近期被感染。
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