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文檔簡(jiǎn)介

ICS65.020.30

B40DB32

江蘇省地方標(biāo)準(zhǔn)

DB32/T3686—2019

山羊副流感病毒3型檢測(cè)技術(shù)規(guī)程

TechnicalregulationsfordetectionofCaprineparainfluenzavirus3

2019-12-03發(fā)布2019-12-25實(shí)施

江蘇省市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布

DB32/T3686—2019

山羊副流感病毒3型檢測(cè)技術(shù)規(guī)程

1范圍

本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了山羊副流感病毒3型(Caprineparaifluenzavirus3,CPIV3)的病原學(xué)檢測(cè)(病毒核酸

的RT-PCR和熒光定量RT-PCR檢測(cè))、血清學(xué)檢測(cè)(血凝抑制(HI)試驗(yàn))的技術(shù)要求。

本標(biāo)準(zhǔn)適用于山羊副流感病毒3型及其感染情況的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)。

2規(guī)范性引用文件

下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。

凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修訂單)適用于本文件。

GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法

GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求

NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范

3病原學(xué)檢測(cè)

3.1材料

微量移液器及吸頭、DEPC水處理的離心管、吸頭、PCR擴(kuò)增管、TRIzol試劑、三氯甲烷、異丙醇、

DEPC處理水(用水符合GB/T6682規(guī)定)、反轉(zhuǎn)錄酶/TaqDNA聚合酶混合液、2×一步法RT-PCR反應(yīng)緩

沖液、一步法熒光定量RT-PCR試劑盒、TAE緩沖液、瓊脂糖、核酸染料、引物MF/MR、引物qMF/qMR

與探針(附錄A)。

3.2儀器設(shè)備

PCR儀、熒光定量PCR儀、臺(tái)式冷凍離心機(jī)、電泳儀和水平電泳槽、凝膠成相儀(或紫外透射儀)。

3.3反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)

3.3.1樣品處理與RNA的提取

采集羊的鼻拭子、氣管拭子或肺臟(樣品的采集、保存和運(yùn)輸應(yīng)符合NY/T541相關(guān)規(guī)定)。取200

μL待檢樣品液至無(wú)菌無(wú)RNA酶的EP管中,使用TRIzol試劑、RNA提取試劑盒或自動(dòng)化核酸提取儀等方

法提取RNA。

3.3.2RT-PCR反應(yīng)

RT-PCR反應(yīng)使用20μL體系:10μL2×一步法RT-PCR反應(yīng)緩沖液、引物MF/MR各0.5μL(10

μmol/L)、0.4μL反轉(zhuǎn)錄酶/TaqDNA聚合酶混合液、4μLRNA模板,4.6μLDEPC處理水。反應(yīng)條件為:

45℃反轉(zhuǎn)錄30min;94℃預(yù)變性2min;94℃30s,54℃30s,72℃30s,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);72℃延伸

10min。

3.3.3結(jié)果判定

取PCR產(chǎn)物10μL,在1.2%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳,在凝膠成像系統(tǒng)中觀察結(jié)果。樣品PCR檢測(cè)產(chǎn)

物電泳后有大小為346bp的片段判斷為山羊副流感病毒3型核酸陽(yáng)性,無(wú)條帶判斷為陰性。每次試驗(yàn)應(yīng)

設(shè)置陰陽(yáng)性對(duì)照,陰陽(yáng)性對(duì)照應(yīng)不出現(xiàn)或出現(xiàn)相應(yīng)大小的條帶。

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DB32/T3686—2019

3.4熒光定量反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(熒光定量RT-PCR)

3.4.1核酸提取與熒光定量RT-PCR反應(yīng)

核酸提取同3.3.1。熒光定量RT-PCR反應(yīng)使用20μL體系:10μL2×一步法反應(yīng)緩沖液,0.4μL反轉(zhuǎn)

錄酶,0.4μLDNA聚合酶,引物qMF/qMR各0.4μL(10μmol/L),0.8μL探針,0.4μL染料,2μLRNA

模板,5.2μLDEPC處理水。將PCR管置于熒光定量PCR儀器上進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,程序如下:42℃5min;

95℃10s;95℃5s,60℃34s,共進(jìn)行40個(gè)循環(huán)。

3.4.2熒光定量RT-PCR結(jié)果判定

陽(yáng)性對(duì)照擴(kuò)增曲線呈標(biāo)準(zhǔn)的S曲線,且Ct值<30。陰性對(duì)照擴(kuò)增曲線應(yīng)為基線下的水平線。若樣本

曲線呈S形曲線,且Ct值<38為陽(yáng)性;未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線為陰性。

4血清學(xué)檢測(cè)——血凝抑制(HI)試驗(yàn)

4.1材料

微量移液器及配套吸頭、96孔V型微量反應(yīng)板、生理鹽水、1%豚鼠紅細(xì)胞懸液(配制方法見(jiàn)附錄B)、

病毒液(相關(guān)試驗(yàn)操作應(yīng)符合GB19489的要求)、標(biāo)準(zhǔn)陽(yáng)性血清、標(biāo)準(zhǔn)陰性血清。

4.2儀器設(shè)備

離心機(jī)、恒溫培養(yǎng)箱。

4.3病毒血凝效價(jià)測(cè)定

每次HI試驗(yàn)前應(yīng)對(duì)病毒血凝效價(jià)進(jìn)行測(cè)定,檢測(cè)與判定方法如下:

——在反應(yīng)板一排各孔中加25μL生理鹽水;

——第一孔中加25μL病毒分離液,按照1:2倍比稀釋,最后一孔不加抗原作陰性對(duì)照。每孔中再加

25μLPBS;

——每孔加25μL1%豚鼠紅細(xì)胞液,37℃孵育40min;

——當(dāng)紅細(xì)胞被凝集時(shí),紅細(xì)胞均勻分布在反應(yīng)板底部,反應(yīng)板傾斜片刻,紅細(xì)胞不下滑;紅細(xì)胞

未被凝集時(shí),反應(yīng)板傾斜片刻,可見(jiàn)沉淀的紅細(xì)胞向下滑動(dòng),形成流線。HA效價(jià)為全部紅細(xì)

胞出現(xiàn)凝集時(shí)的最高稀釋倍數(shù)。

4.4HI試驗(yàn)

按如下方法進(jìn)行HI試驗(yàn):

——在96孔V型微量反應(yīng)板各孔中加25μL生理鹽水;

——加25μL經(jīng)處理的血清于第一孔中,混勻后取25μL加到第2孔中,依次倍比稀釋,從第2孔

加至第11孔,第11孔混勻后吸取25μL棄去,最后1孔不加血清作為對(duì)照;

——每孔中加25μL4個(gè)HA單位的病毒抗原,37℃孵育40min;

——每孔加25μL1%豚鼠紅細(xì)胞液,37℃孵育40min。

4.5結(jié)果判定

將反應(yīng)板傾斜70度左右,若無(wú)凝集反應(yīng),則沉淀的紅細(xì)胞向下滑動(dòng),呈流線狀,記錄為抗體陽(yáng)性。

完全抑制凝集的抗體最高稀釋倍數(shù)為血清的HI抗體滴度。

抗體滴度大于等于16為陽(yáng)性,小于等于8為陰性。若檢測(cè)發(fā)病后雙份血清(第一份血清應(yīng)在臨床癥

狀出現(xiàn)后立即采集,第二份血清在兩周后采集),抗體滴度上升4倍或4倍以上時(shí),表明羊只近期被感染。

2

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附錄A

(資料性附錄)

引物

A.1引物序列

表A.1用于RT-PCR和熒光定量RT-PCR檢測(cè)的引物、探針

引物靶基因序列(5’-3’)產(chǎn)物

MFM基因AGTGATCTAGATGATGATCCA

346bp

MRM基因GTTATTGATCCAATTGCTGT

qMFM基因GCTTGGCTTCTTTGAAATGG

150bp

qMRM基因GCCTGCAGAAGTTCCTTGTC

FAM-CAATCGGACTAGCCAAGTATGGTGG

CPIV3ProbeM基因

GA-TAMRA

A.2引物的溶解

引物MF、MR、qMF、qMR用滅菌的DEPC處理水溶解到濃度為10μmol/L;CPIV3Probe用滅菌的

DEPC處理水溶解到濃度為10μmol/L。

3

DB32/T3686—2019

附錄B

(資料性附錄)

1%豚鼠紅細(xì)胞的配制

B.1生理鹽水配制方法

氯化鈉(NaCl)0.9g

去離子水加至100mL,121℃高壓滅菌15min,冷卻后保存于2℃~8℃冰箱中備用。

B.21%豚鼠細(xì)胞懸液制備

無(wú)菌采集豚鼠血液,置于EDTA抗凝管中混勻,2℃~8℃保存。使用前吸取紅細(xì)胞懸液置離心管中,

加入生理鹽水洗滌3次,每次以2000r/min離心5min,將血漿、白細(xì)胞等充分洗去,沉積的紅細(xì)胞用生

理鹽水稀釋成1%的懸液,保存于2℃~8℃冰箱中備用。

───────────

4

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前言

本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/T1.1—2009給出的規(guī)則起草。

本標(biāo)準(zhǔn)由江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院提出并歸口。

本標(biāo)準(zhǔn)起草單位:江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院。

本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:李文良、毛立、李基棕、郝飛、劉茂軍、楊蕾蕾、孫敏。

I

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山羊副流感病毒3型檢測(cè)技術(shù)規(guī)程

1范圍

本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了山羊副流感病毒3型(Caprineparaifluenzavirus3,CPIV3)的病原學(xué)檢測(cè)(病毒核酸

的RT-PCR和熒光定量RT-PCR檢測(cè))、血清學(xué)檢測(cè)(血凝抑制(HI)試驗(yàn))的技術(shù)要求。

本標(biāo)準(zhǔn)適用于山羊副流感病毒3型及其感染情況的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)。

2規(guī)范性引用文件

下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。

凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修訂單)適用于本文件。

GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法

GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求

NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范

3病原學(xué)檢測(cè)

3.1材料

微量移液器及吸頭、DEPC水處理的離心管、吸頭、PCR擴(kuò)增管、TRIzol試劑、三氯甲烷、異丙醇、

DEPC處理水(用水符合GB/T6682規(guī)定)、反轉(zhuǎn)錄酶/TaqDNA聚合酶混合液、2×一步法RT-PCR反應(yīng)緩

沖液、一步法熒光定量RT-PCR試劑盒、TAE緩沖液、瓊脂糖、核酸染料、引物MF/MR、引物qMF/qMR

與探針(附錄A)。

3.2儀器設(shè)備

PCR儀、熒光定量PCR儀、臺(tái)式冷凍離心機(jī)、電泳儀和水平電泳槽、凝膠成相儀(或紫外透射儀)。

3.3反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)

3.3.1樣品處理與RNA的提取

采集羊的鼻拭子、氣管拭子或肺臟(樣品的采集、保存和運(yùn)輸應(yīng)符合NY/T541相關(guān)規(guī)定)。取200

μL待檢樣品液至無(wú)菌無(wú)RNA酶的EP管中,使用TRIzol試劑、RNA提取試劑盒或自動(dòng)化核酸提取儀等方

法提取RNA。

3.3.2RT-PCR反應(yīng)

RT-PCR反應(yīng)使用20μL體系:10μL2×一步法RT-PCR反應(yīng)緩沖液、引物MF/MR各0.5μL(10

μmol/L)、0.4μL反轉(zhuǎn)錄酶/TaqDNA聚合酶混合液、4μLRNA模板,4.6μLDEPC處理水。反應(yīng)條件為:

45℃反轉(zhuǎn)錄30min;94℃預(yù)變性2min;94℃30s,54℃30s,72℃30s,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);72℃延伸

10min。

3.3.3結(jié)果判定

取PCR產(chǎn)物10μL,在1.2%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳,在凝膠成像系統(tǒng)中觀察結(jié)果。樣品PCR檢測(cè)產(chǎn)

物電泳后有大小為346bp的片段判斷為山羊副流感病毒3型核酸陽(yáng)性,無(wú)條帶判斷為陰性。每次試驗(yàn)應(yīng)

設(shè)置陰陽(yáng)性對(duì)照,陰陽(yáng)性對(duì)照應(yīng)不出現(xiàn)或出現(xiàn)相應(yīng)大小的條帶。

1

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3.4熒光定量反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(熒光定量RT-PCR)

3.4.1核酸提取與熒光定量RT-PCR反應(yīng)

核酸提取同3.3.1。熒光定量RT-PCR反應(yīng)使用20μL體系:10μL2×一步法反應(yīng)緩沖液,0.4μL反轉(zhuǎn)

錄酶,0.4μLDNA聚合酶,引物qMF/qMR各0.4μL(10μmol/L),0.8μL探針,0.4μL染料,2μLRNA

模板,5.2μLDEPC處理水。將PCR管置于熒光定量PCR儀器上進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,程序如下:42℃5min;

95℃10s;95℃5s,60℃34s,共進(jìn)行40個(gè)循環(huán)。

3.4.2熒光定量RT-PCR結(jié)果判定

陽(yáng)性對(duì)照擴(kuò)增曲線呈標(biāo)準(zhǔn)的S曲線,且Ct值<30。陰性對(duì)照擴(kuò)增曲線應(yīng)為基線下的水平線。若樣本

曲線呈S形曲線,且Ct值<38為陽(yáng)性;未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線為陰性。

4血清學(xué)檢測(cè)——血凝抑制(HI)試驗(yàn)

4.1材料

微量移液器及配套吸頭、96孔V型微量反應(yīng)板、生理鹽水、1%豚鼠紅細(xì)胞懸液(配制方法見(jiàn)附錄B)、

病毒液(相關(guān)試驗(yàn)操作應(yīng)符合GB19489的要求)、標(biāo)準(zhǔn)陽(yáng)性血清、標(biāo)準(zhǔn)陰性血清。

4.2儀器設(shè)備

離心機(jī)、恒溫培養(yǎng)箱。

4.3病毒血凝效價(jià)測(cè)定

每次HI試驗(yàn)前應(yīng)對(duì)病毒血凝效價(jià)進(jìn)行測(cè)定,檢測(cè)與判定方法如下:

——在反應(yīng)板一排各孔中加25μL生理鹽水;

——第一孔中加25μL病毒分離液,按照1:2倍比稀釋,最后一孔不加抗原作陰性對(duì)照。每孔中再加

25μLPBS;

——每孔加25μL1%豚鼠紅細(xì)胞液,37℃孵育40min;

——當(dāng)紅細(xì)胞被凝集時(shí),紅細(xì)胞均勻分布在反應(yīng)板底部,反應(yīng)板傾斜片刻,紅細(xì)胞不下滑;紅細(xì)胞

未被凝集時(shí),反應(yīng)板傾斜片刻,可見(jiàn)沉淀的紅細(xì)胞向下滑動(dòng),形成流線。HA效價(jià)為全部紅細(xì)

胞出現(xiàn)凝集時(shí)的最高稀釋倍數(shù)。

4.4HI試驗(yàn)

按如下方法進(jìn)行HI試驗(yàn):

——在96孔V型微量反應(yīng)板各孔中加25μL生理鹽水;

——加25μL經(jīng)處理的血清于第一孔中,混勻后取25μL加到第2孔中,依次倍比稀釋,從第2孔

加至第11孔,第11孔混勻后吸取25μL棄去,最后1孔不加血清作為對(duì)照;

——每孔中加25μL4個(gè)HA單位的病毒抗原,37℃孵育40min;

——每孔加25μL1%豚鼠紅細(xì)胞液,37℃孵育40min。

4.5結(jié)果判定

將反應(yīng)板傾斜70度左右,若無(wú)凝集反應(yīng),則沉淀的紅細(xì)胞向下滑動(dòng),呈流線狀,記錄為抗體陽(yáng)性。

完全抑制凝集的抗體最高稀釋倍數(shù)為血清的HI抗體滴度。

抗體滴度大于等于16為陽(yáng)性,小于等于8為陰性。若檢測(cè)發(fā)病后雙份血清(第一份血清應(yīng)在臨床癥

狀出現(xiàn)后立即采集,第二份血清在兩周后采集),抗體滴度上升4倍或4倍以上時(shí),表明羊只近期被感染。

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附錄A

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