Mimics中文培訓(xùn)手冊

Preparedon24November2020

MimicsInnovationSuite

基于解剖學(xué)的工程學(xué)

Mimics培訓(xùn)手冊

/公告

這本培訓(xùn)手冊是為了幫助用戶順利地開始Mimics軟件的使用而編寫的,并不能夠代替

Mimics用戶手冊,也不能代替Materialise公司提供的培訓(xùn)。

這本培訓(xùn)手冊在不同的練習(xí)中使用了Mimics全部的模塊,如果沒有相關(guān)模塊的使

用權(quán)無法完成練習(xí)。請注意:這本培訓(xùn)手冊的使用以熟悉Windows系統(tǒng)操作技能

為前提。

聽而易忘

見而易記

做而易般

孔子

2011Materialise

Mimics,Materialise,andanyandallMaterialisebrand,product,serviceandfeature

names,logosandslogansmentionedinthisdocumentareregisteredtrademarks

and/ortradenamesofMaterialiseandareprotectedbytrademarklawsintheUnited

Statesorothercountries.Allotherbrand,product,serviceandfeaturenamesor

trademarksarethepropertyoftheirrespectiveowners.Nouserhasanyright,title,or

interestinthosemarksornamesnotpreviouslyexpresslygrantedinwritingtosuch

userbyMaterialise.

1

/目錄

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2

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3

/Mimics簡介

Mimics是一個連接二維圖像數(shù)據(jù)b,MRI,工業(yè)掃描數(shù)據(jù)和三維工程學(xué)應(yīng)用的圖像

處理工具。應(yīng)用領(lǐng)域包括:解剖學(xué)測量、三維分析、有限元分析胃已"、客制化植入體

或裝置設(shè)計、加法制邀也被稱為三維打為以及手術(shù)計劃和模擬。

通過使用Mimics的圖像分割方法,用戶能夠從醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)中選擇特點的感興趣區(qū)域,

將結(jié)果計算成精確的三維模型。

Mimics的功能模塊為用戶提供了其它應(yīng)用領(lǐng)域的接口。這意味著Mimics的功能可以

方便的根據(jù)用戶的需要進行組合。

另外,Mimics是MimicsInnovationSuite的一部分,這一套裝也包括了3-matic。在套裝中,Mimics

被用來生成精確的三維模型,之后3-matic被用來在解剖學(xué)模型的基礎(chǔ)上進行設(shè)計和

網(wǎng)格操作。因此,3-matic極大程度的擴展了Mimics在基于解剖數(shù)據(jù)的工程學(xué)方面

的應(yīng)用的可能性。

Mimics被廣泛的應(yīng)用在骨科、頜面外科以及心血管行業(yè)的學(xué)術(shù)及商業(yè)研究領(lǐng)域。

Mimics的主要優(yōu)勢：

?Mimics界面友好容易掌握。

?快速的分割工具（基于閾值和輪廓）和精確的三維計算保證了快捷的取道精細的三

維模型。

?Mimics在ISO環(huán)境下開發(fā),具有CE初FDA市場認證。

?M\E\cs基于市場要求持續(xù)開發(fā),每年有兩個版本的更新。

?當(dāng)Mimics和3-matic被聯(lián)合應(yīng)用時,用戶可以直接在STL文件的基礎(chǔ)上進

行設(shè)計和網(wǎng)格操作,無需逆向工程。這使用戶可以:

o基于解剖數(shù)據(jù)改進植入體

o設(shè)計客制化的植入體和手術(shù)導(dǎo)板

?Mimics的才發(fā)旖Materialise是創(chuàng)新軟件和加法制造技術(shù)的世界領(lǐng)跑者。

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Mimics模塊

Mimics包括多個模塊。下方的圖片給出了基礎(chǔ)模塊與功能模塊之間的鏈接,以及主要的應(yīng)用領(lǐng)域。

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/導(dǎo)入圖像

這一章的練習(xí)會幫助您了解:

如何導(dǎo)入bmp圖像以及對圖像尺寸進行修改

,如何自動導(dǎo)入DICOM數(shù)據(jù)

'確以圖像方向

注意

Mimics不僅支持Dicom格式數(shù)據(jù),而且能夠直接導(dǎo)入掃描原始數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)可以

通過硬盤、光盤或磁盤導(dǎo)入。Mimics也支持BMP,JPEG以及TIFF格式文件的導(dǎo)

Ao源文件可以通過在importwizard的第一步選擇torcemanualimport的方式手動

導(dǎo)入。

在開始之前

保證您已經(jīng)安裝了培訓(xùn)數(shù)據(jù)、頭影測量數(shù)據(jù)庫以及牽引器數(shù)據(jù)庫。您可以在培訓(xùn)光盤

中找到這些安裝程序。

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練習(xí)1.昱Abitmap圖像

1.從主工具欄中選擇newprojectwizard

2.瀏^TrainingData文件夾

(C\MedData\TrainingData)/選擇BITMAPjf件夾.

點擊Next.

3.在Imageproperties窗口標(biāo)示出掃描分辨率。

像素大?。?56pm,層距為4mm。然后選擇Next.

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4.空尸一個雄77Editimages,您可以通過調(diào)節(jié)圖像周圍的線框的大小來對該項目進行修剪。

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5.在這個窗口,您也可以編輯像素映射圖

的屬性。完成編輯后,點擊Next.

6.在方向窗口標(biāo)示出圖像的方向。點擊0K打開Mimics項目,您就可以開始進行圖像分割T\

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練習(xí)2:反ADICOM圖像

1.從主工具欄選擇newprojectwizard

2.瀏覽$11TrainingData文徉夾(C\MedData\TrainingData),選擇

DICOM文件夾。點擊Next.

3.Mimics會直接讀取DICOM圖像所帶有的標(biāo)簽,自動創(chuàng)建一個Mimics項目

文件。點擊

Convert完成轉(zhuǎn)化。

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4.在方向窗口確定圖像方向

5.點擊0K打開項目。

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/導(dǎo)航&項目管理器

這一章的內(nèi)容將告訴您如何瀏覽圖像。所涵蓋的內(nèi)容如下:

"一鍵導(dǎo)航功能的使用

"通過窗口操作增強圖像數(shù)據(jù)的可視性

圖像的放大縮小

'圖像的平移

"快捷鍵

"Mimics幫助

選項

項目管理器給您提供了該項目所有對象的概況。在項目管理器中可以通過標(biāo)簽工具欄

迅速實現(xiàn)對象最常用的功能。其余的操作在action的按鈕下被列出。

這個練習(xí)使用的數(shù)據(jù)文件來自“自動導(dǎo)入”練習(xí)。

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練習(xí)t導(dǎo)航

任務(wù)1.一鍵導(dǎo)航、放大縮小、平移

1.在一個視圖上（例如軸位視圖）點擊一次鼠標(biāo)左鍵,所有的視圖都會立刻

更新顯示同一個點。

一鍵導(dǎo)航在三維模型上也同樣適用。

2.點擊主工具欄中的,zoorri'工具,按住鼠標(biāo)左鍵在感興趣的區(qū)域拖拽一

個方框。

3.4想恢復(fù)原來大小,選擇'unzoomtoor點擊您想要恢復(fù)原來大小的區(qū)

域。

4.口選擇、u\\screed工具將其中一個視圖放大到全屏。

_5.選擇'PanMeW'工具來平移視圖,按住左鍵移動鼠標(biāo)。

選擇"unzoom”點擊想要操作的視圖,使視圖恢復(fù)原來位置。

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任務(wù)2.快捷鍵的使用

1.嘗試快捷鍵的使

用

Shift+鼠標(biāo)右鍵平移:按住鼠標(biāo)右鍵移動

縮放:按住鼠標(biāo)右鍵垂直移動來放

Ctrl+鼠標(biāo)右鍵大縮小

ArrowUp/藤超1up進入下一層

ArrowDown/^^down進入前一層

PageUp向上進10層

PageDown向下進10層

CTRL+L使層指示器可見不可見

空格鍵使鼠標(biāo)所在視窗放大到全屏

在放大縮小和恢復(fù)原始大小之間

回格鍵切換

任務(wù)3.幫助文檔

您可以通過Mimics的幫助文檔來學(xué)習(xí)新的技巧。

1.您可以通過訪問菜單欄打開幫助文檔,訪問路徑如下He\pGeneral

Help或按F1

打開幫助文檔.

2.選擇主菜單欄中的“contexthelp"按鈕,打開對某一特定工具的幫助文

檔。選擇后,點擊您想要查詢的工具,幫助文檔就會立刻打開到相關(guān)頁面。

3.0想了解更多項目相關(guān)信息（患者信息,掃描協(xié)議等）您可以點擊工具欄中

的DisplayProjectInformation按鈕。

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練習(xí)2.項目管理器

項目管理器是所有Mimics對象的數(shù)據(jù)庫,每個標(biāo)簽都對應(yīng)著Mimics的一個對象類

型。最常用的工具在項目管理器的每個標(biāo)簽下方列出。當(dāng)您點擊action按鈕時,會

看到所有工具的列表。

任務(wù)1.熟悉項目管理器的使用

1.盾I點擊PM按鈕使其變得可見,或者通過View-ProjectManagement

來查看

2.熟悉不同的標(biāo)簽和不同的工具欄。

3.▼每個標(biāo)簽都包含了一個action按鈕,列出了所有已選擇操作對象可用的

工具。

任務(wù)2.視窗操作

視窗操作讓您能夠?qū)D像的灰度值線形地映射到您的顯示器。CT圖像的灰度值是以

Hounsfield(HU)痂漫家表示的。這個標(biāo)度共有4095個梯度02bits),這些梯度映射

到您顯示器的256個灰階型bits)。

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涵蓋了直方圖上全部范圍的視窗可以觀察到所有的組織。而范圍較窄的視窗使您能夠

更好的觀察軟組織或松質(zhì)骨內(nèi)部的細微差別。

1.選擇項目管理器中的Contrast標(biāo)簽。

2.左鍵按住線或兩端點其中一點,移動鼠標(biāo)改變

窗口設(shè)置。試著改善軟組織結(jié)構(gòu)的對比度。

這一操作只能改變對比度設(shè)置,不會影響接下來的閾值分割。

3.觀察不同的對比度預(yù)設(shè)置

任務(wù)3.體渲染

體渲染使您能夠不經(jīng)過任何瞬值分割,迅速的實現(xiàn)二維圖像的三維可視化。三維對象

基于數(shù)據(jù)的體素信息而建立。

體素的透明度由灰度值決定。體渲染是純粹的可視化工具,不能用來做其它操作（例

如數(shù)據(jù)的導(dǎo)出）。

1.選擇Volumerendering標(biāo)簽。從預(yù)先確定的設(shè)置中,選承Boneand

SoftTissue".

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2.在三維工具欄中激活volumerendering按鈕。

3.通過降低體渲染圖表的第二個點來使軟組織變得透明。

4.右鍵點擊彩色欄的第五個點。選擇Changecolor將顯示顏色改為紅棕

色。

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操作后請關(guān)閉volumerendering按鈕。Volumerendering比較占用系統(tǒng)資源,會使操作變慢。

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/測量工具

本章練習(xí)幫助您學(xué)習(xí)不同測量工具的使用:

距離測量

角度測星

密度潮量

例面線

標(biāo)注

測量結(jié)果和坐標(biāo)信息可以以TXT的格式被輸出,在統(tǒng)計軟件中進行進一步的分析。

剖面線以圖表形式給出了沿著該線的圖像密度信息。這個圖表是好的閾值分割的第一

步。在下一章中我們會詳細解釋。

標(biāo)注工具使您能夠在二維圖像或三維對象上增加注釋。這些注釋可以被用于和接下來

的研究人員、修復(fù)醫(yī)師及醫(yī)生等之間的交流。

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練習(xí)1.測量工具

任務(wù)1.距離測量

1.激活measurement工具欄。

2./+遴薦distancemeasuretool.在圖像上點擊兩次來指出要測量的距離。

3.現(xiàn)在來創(chuàng)造一個新的距離測量,我們來到measurements標(biāo)簽,點擊工具欄

上的‘new"按鈕。選擇distancemeasure.在圖像上點擊兩次來確定要測量的

距離。

任務(wù)2,角度測量

1.使用任務(wù)1中的方法在不同層創(chuàng)造角度測量。

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2.選擇measurement標(biāo)簽里的一個距離測量。使用locate按鈕來定位

這一測量。

任務(wù)3.測量的導(dǎo)出

1.將測量以TXT.格式導(dǎo)出,路徑Export-Txt...

2.選擇要導(dǎo)出的測量結(jié)果,點擊'add'.

點擊“0K”來導(dǎo)出測量結(jié)果及坐標(biāo)信息到指定的目錄下。

任務(wù)4.密度測量

密度測量工具測量在橢圓或矩形內(nèi)的平均密度。

1.□。逸萍其中一0'Density”工具,點擊想要測量的區(qū)域。這一測量會給出

面積,平均密度以及標(biāo)準(zhǔn)差。

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2.按住橢圓或矩形上的點可以改變測量工具的大小。

練習(xí)2.剖面線

剖面線給出了沿著該線分布的Hounsfield值或灰度值的分布情況。

1.匕在軸位視窗跨過股骨頭畫一條剖面線。選擇profileline點擊圖像兩次來創(chuàng)造一條剖面線。

2.為了能夠更好的觀察軟組織,皮質(zhì)骨及松質(zhì)骨的過渡,選承Scaletofit”選

項。

練習(xí)3.評注

使用標(biāo)注工具可以在圖像或三維對象上添加注釋。

1.AddTextAnnotation"點擊要添加標(biāo)注的位置。

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2.在跳出的對話框中添加注釋,然后點擊,0K.

您可以通過按住箭頭和內(nèi)容來移動其位置。

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/基本閾值分割&三維模型操作

閾值分割是從二維圖像提取三維信息的非常重要的第一步。Mimics有很多工具幫助您

高效提取您感興趣區(qū)域。

本章練習(xí)描述了基于Hounsfield值進行組織提取的方法。從這一選擇,或mask開

始,您可以進行3Dmodel的計算,步驟如下:

1.閾值分割:通過選擇一定的像素灰度值范圍來定義一個對象

2.區(qū)域增長:只選擇相連的像素

3.計算三維模型:由mask計算三維模型

接下來的練習(xí)將為您介紹不同的三維操作工具:

旋轉(zhuǎn)和平移

放大縮小

透明度選項

在二維視窗顯示三維模型的輪廓

剖切

三維定位

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練習(xí)1.髏部的分割

任務(wù)1.閾值分割（使用剖面線）

口閾值分割是通過選擇一定的像素灰度值范圍來定義一個對象的一種分割方法。

1.一、到measurement標(biāo)簽中,選擇profileline,點擊locate按鈕來定位

profileline。

2.通過選擇properties按鈕打開profileline對話框。

3.點擊'startthresholding*',您可以通過按住鼠標(biāo)左鍵選擇綠色的線移動來改

變最低閾值。當(dāng)最低閾值降低后,您可以看到您選擇了軟組織。當(dāng)您選擇

了一個較高的閾值,您會發(fā)現(xiàn)您只選擇了致密的骨皮質(zhì)。

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在CT圖像中選擇骨組織的經(jīng)驗方法是將最低閾值放在皮質(zhì)骨峰的1\3處。在這個項目中,選擇骨組織

的合適最低閾值為255。

在進行閾值分割操作時,您仍然可以進行圖像的導(dǎo)航。這有利于您確定自己選擇的正

確性!

任務(wù)2.計算三維模型

Calculate3D工具基于mask計算三維模型。

1.?在mask標(biāo)簽欄您會發(fā)現(xiàn)出現(xiàn)了一個綠色的masko

為了計算三維模型,選擇greenmask點擊

"calculate3D”按鈕。您可以在mask標(biāo)簽的工具欄中

找到這個按鈕。

2.在calculate3D對話框，您可以選擇不同的模型質(zhì)量。選擇高質(zhì)量的設(shè)置

需要更長的計算時間,但是會得到更精確的三維模型。

在這個練習(xí)中,我們只是快速的預(yù)覽一下我們的三維模型,所以選擇Low.

點擊'Calculate”梗計堂繼續(xù)。

3.一個跳出的窗口提示要生成的模型包含多個部分。點擊,Yes”繼續(xù)。

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通過對感興趣區(qū)域的區(qū)域增長可以避免此類對話框的彈出。這一功能鍵我們會在下個

任務(wù)中詳細說明。

4.結(jié)果:

任務(wù)3.區(qū)域增長

區(qū)域增長從選擇的對象中分離去掉離散的體素。

1.我們用區(qū)域增長的方法來將靜脈以及一些離散的體素從髓部上分

離出來。

從segmentation工具欄或mask標(biāo)簽欄的action列表中選擇“regiongrowing”工具。

在區(qū)域增長前需要先進行閾值分割,因為當(dāng)閾值改變,所有之前的工作都會的丟失。

2.在骨頭的部分點擊鼠標(biāo),所有相連的體素都會被添加到新的yellowmask

中。

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KeepMultiplelayer,不選LeaveOriginalMask。區(qū)域增長會在多層,而不只是一層進行。

3.*重新計算三維模型來觀察結(jié)果。

在mask標(biāo)簽中選擇yellowmask點擊calculate3D按鈕。這次的質(zhì)量選擇為optimal.

4.結(jié)果:

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練習(xí)2.分離動脈I；

閾值法

任務(wù)1.閾值分割（使用剖面線）和區(qū)域增長

1.單擊mask標(biāo)簽的"new/'創(chuàng)造一個新的mask。

2.￡\點擊跳出閾值分割窗口的Apply,然后點擊clearmask按鈕。

3.在動脈上畫一條剖面線。點擊'startthresholding’.

將最低閾值設(shè)為176,最高閾值設(shè)為280o

4.用區(qū)域增長來把動脈和骨組織分開。

任務(wù)3.計算三維模型

1.在mask標(biāo)簽欄選擇Fuchsiamask.再次點擊mask的名字:Tuchsia",您現(xiàn)在可以改變

mask的名■先把名字改為Artery。用同樣的方法,您引以把Yellowmask成為Bone。

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2.洪選擇其余的mask,單擊"delete"按鈕來刪除它們。

為了方便區(qū)分,請給mask重新命名。當(dāng)您創(chuàng)建了許多mask的時候,重新命名可

以幫助您了解哪個mask包含了什么內(nèi)容。

3./龍薦Arterymask,點擊Calculate3D按鈕。

在calculate3D"對話框中,選擇customquality,點擊options。在選項中

選擇不同的質(zhì)量設(shè)置,觀察參數(shù)是如何變化的。

InterpolationMethod:醫(yī)學(xué)圖像通常使用"Contourinterpolation”.Grayvalue

interpolation一般被

用于處理工業(yè)CT圖像。

Slices:通過規(guī)定切層的位置（例如:半個顱部）可以重建特定的部位。

MatrixReduction:

這個選項能夠改變創(chuàng)建的三角片的質(zhì)量（三維模型是由三角片組成的）。

"XY"reduction將像素組合,“

Z"reduction將體素組合。

Shellreduction:使用該選項得到有著最大表面的she"。具體數(shù)值會影響生成的

shell的數(shù)量。小的shell則不會被計算出來。

Smoothing:5iterations（迭代次數(shù)）,factor的值在0和1之間,1表示光滑的程度

最高。需要注意的

是進行光順會損失模型的精度。

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Trianglereduction:使用這個工具來減少三角片的數(shù)量不會損失太多的精度。

Tolerance應(yīng)該設(shè)置在

像素值/8左右,EdgeAngle設(shè)為20,Iterations設(shè)為10。

4.Highqualitysetting透Rsmoothing.在選項對話框中點擊'OK然后點擊G怎cu\市e3D

計算三維模型。

5.刊點擊s央e按鈕保存項目。

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練習(xí)3.分離動脈II；

動態(tài)區(qū)域增長法

這次我們使用動態(tài)區(qū)域增長工具來分離動脈。

動態(tài)區(qū)域增長是帶有動態(tài)閾值范圍的區(qū)域增長工具。由一個種子點開始,向感興趣區(qū)

域生長,并且以動態(tài)閾值范圍為邊界。

這個工具對于分離脈管結(jié)構(gòu),如動脈或者小氣道是非常有用的。

任務(wù)1.動態(tài)區(qū)域增長

1./(segmentation工＜欄或mask標(biāo)簽欄的激活菜單選擇,dynamicregiongrowing工具。

2.點擊圖襟中的動脈,所有相連的體素都會被添加到新的orangemask.

在這個例子中,為了得到最好的分離效果,將deviation的最大值設(shè)為40HU將最小

值設(shè)為30HUo

選中FillCavities填補選中mask中小的縫隙,選中MultipleLayer來對整個數(shù)

據(jù)集而不是單層圖像進行操作。

3.?計算三維模型檢查結(jié)果。選擇mask點擊Calculate3D按鈕。再次選擇

Highquality?

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4.結(jié)果:

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練習(xí)4.三維導(dǎo)航

對三維對象的導(dǎo)航和對二維圖像的導(dǎo)航是基本類似的,有著相同的工具和快捷方式。

任務(wù)1.一鍵導(dǎo)航、放大縮小、平移、旋轉(zhuǎn)

1.通過左鍵點擊三維模型上一點,使所有二維圖像迅速追蹤到同一點。

2.i&在主菜單欄上點擊zoom工具。在三維對象上畫一個方框來放大方框內(nèi)

選中的對象。

3.也要使顯示恢復(fù)原來大小,unzoomtool,然后點擊三維視窗。

4.□選擇zoomto“fullscreen”d或按分整建使三維視窗放大至全屏。

5.+從主工具欄或3D工具欄中選擇,pad工具進行視圖移動。鼠標(biāo)左鍵按

住3D視圖進行移動。選擇,unzoom”點擊想要操作的視圖,使視圖恢復(fù)原

來位置。

6.0

選擇rotate按鈕,在3D視窗中按住鼠標(biāo)左鍵移動來旋轉(zhuǎn)3D對象。當(dāng)松

開鼠標(biāo)后,旋轉(zhuǎn)視圖的功能也就不再處于激活狀態(tài)了。

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旋轉(zhuǎn)的模式和您點擊的部位是有關(guān)的。當(dāng)您點擊視窗的周圍時,三維對象是繞著垂直

于視窗的軸進行旋轉(zhuǎn)的。點擊對象中心時,對象是按照其垂直軸或水平軸來進行旋轉(zhuǎn)

的。

任務(wù)2.使用快捷方式進行導(dǎo)航

1.嘗試這些快捷鍵的使用

鼠標(biāo)右鍵旋轉(zhuǎn):長按住鼠標(biāo)右鍵移動鼠標(biāo)

SHIFT平移:長按住鼠標(biāo)右鍵和SHIFT鍵移動進行平移

放大縮小:長按住鼠標(biāo)右鍵和CTRL鍵垂直移動鼠標(biāo)進

CTRL+鼠標(biāo)右鍵行敖夫縮小

ArrowUp/PageUp分步向上旋轉(zhuǎn)

ArrowDown/PageDown分步向下旋轉(zhuǎn)

ArrowRight/End分步向右旋轉(zhuǎn)

ArrowLeft/Home分步向左旋轉(zhuǎn)

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練習(xí)5.從骨盆上分離脊椎

在本次練習(xí)中，您將學(xué)到如何使用Editmasks工具分開相連的兩個部分。

1.在復(fù)制bonemask,選擇要操作的mask點擊Duplicate按鈕。

2.在冠狀位視窗中,您可以清楚的看到脊椎和骼骨相連的情況。

3.，為了把它們分開我們要使用Editmask工具。這個工具讓您能夠像在

Paint中編輯圖片一樣的對mask進行編輯。你可以選擇以下編輯模式:

'Draw(Ctrl+D):通過光標(biāo)在像素上移動來對激活的maa增加像素。

'Erase(Ctrl+E):通過在圖像上移動光標(biāo)來擦除激活mask上的像素。

'Threshold(Ctrl+T):這一模式用來設(shè)定一個局部閾值。在您光標(biāo)所在區(qū)

域應(yīng)用該局部閾值分割。

4.將光標(biāo)的類型設(shè)為Circle,選擇Erase模式,在軸面視窗移出骼骨所在的

像素。

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按住CTRL鍵和鼠標(biāo)左鍵來改變光標(biāo)的大小,左/右移動鼠標(biāo)來使光標(biāo)變大/小。

為了分開兩個部分,您只需要將mask中相連接的部分擦除。您不需要將其中一個部

分完全的擦除。之后我們可以使用區(qū)域增長來將已經(jīng)不相連的兩個部分分離開。

需要注意的是,兩個部分可能會在不同的層面出現(xiàn)連接的部分。兩個部分可能在每一

層已經(jīng)沒有連接的部分,但是在層間還存在連接。所以在編輯的時候范圍相對廣一

些,以避免這種情況的出現(xiàn)。

5.移除像素后使用regiongrowing工具。選中脊椎,將‘Red"mask重命

名為'Spine”

6.Z我們現(xiàn)在使用Buaean減法來生成只有骨盆的mask

選擇Booleanfunction,從Bone中減掉Spine生成新的mask

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7.您現(xiàn)在可以分別計算骨盆及脊柱的三維模型。

您可以使用同樣的步驟將股骨從骨盆上分離出來。

記得保存項目!

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練習(xí)6.三維工具

在本次練習(xí)中，您可以對應(yīng)用于三維模型的不同工具有一個概覽。

1.「在"3Dobjects''標(biāo)簽中,您可以通過點擊信息按鈕檢查三維模型的屬

性。在

properties對語暫聲，您可以改變?nèi)S模型的顏色以及名字。同時對話框也

給出了不同的測量數(shù)據(jù),如表面積、體積、三角片的數(shù)量等…

2.在三維模型處于可視的狀態(tài)時,您可以在二維圖像中高亮顯示三維模型的輪

廓,在3Dobjects標(biāo)簽中contour欄點亮眼鏡。這一輪廓有助您評價三維

模型的精確度。

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3.叵在三維工具欄中選擇transparency工具,這使您能夠看到三維對象的

內(nèi)表面形態(tài)。您

還可以在3Dobject標(biāo)簽欄或3Dproperties中設(shè)置透明的程度。

4.

Transparency工具7T方效是clipping工具,這一工具能夠幫助您按照切層

的位置來剖切三維對象。選擇Clipping工具進行軸向的剖切,在軸向視窗

滾動鼠標(biāo)滾輪來改變剖切平面。為了在其它平面進行剖切,選擇clipping

標(biāo)簽欄.選擇saggital平面。

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Clipping標(biāo)簽中的其它選項如下:

Clip:當(dāng)該選項位于缺省狀態(tài)下時,剖切平面的方向由視角來定義。當(dāng)您選擇了其中一

邊時，您就固定

了剖切的一半。

Lock:剖切平面的位置通過切層的位置來定義。不選擇lock,您就可以通過Clipping

標(biāo)簽底部的滑塊

來定義剖切的平面。

Texture:設(shè)置剖切平面的質(zhì)地。您可以選擇對象組織、全部切層以及無對象三種質(zhì)

地。

Clipping標(biāo)簽欄的下拉菜單使您可以選擇要進行剖切的三維對象。

前面章節(jié)所描述的距離和角度測量同樣可以應(yīng)用于三維對象。

5./到Measurement工具欄中選擇DistanceMeasurement/直接在三維對象上標(biāo)記點。

6.+《：AngleMeasurement的操作同上。

7.』使用MeasureDistanceOverSurface工具測量表面上兩點之間的最短

路徑。

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練習(xí)7.提取膝關(guān)節(jié)

3D磁性套索功能

3D磁性套索工具國是一種交互式的分割方法,您可以在對象的二維邊界指定一些點

來確定輪廓。基于這些輪廓,三維mask能夠根據(jù)對象的實際邊緣被創(chuàng)建。這一功能

非常適合用于分割提取MR以及低分辨率圖像。

任務(wù)1：使用3D磁性套索提取脛骨

1.宜通過路徑File-Openproject打開項目文件。君

是一組膝關(guān)節(jié)的MR數(shù)據(jù)。

2.田在segmentation標(biāo)簽欄,點擊3DLiveWire按鈕。

3.窗口彈出。選擇＜NewMask＞作為Target

4.在冠狀位視窗選擇切層。

5.用您的鼠標(biāo)點擊選擇脛骨的邊緣。選

擇邊緣。當(dāng)您需要直線的時候,按

CTRL按鈕。

雙擊鼠標(biāo)閉合曲線。

6.在第*81,和53層重復(fù)這一操作。

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7.在矢狀位視窗選擇第105層。

使用磁性套索選擇脛骨的邊緣輪廓。

8.在第90,83,64和41層重復(fù)這一操作。

9.在軸位視窗，您會看到根據(jù)冠狀位和矢狀位視窗的輪廓線而生成的結(jié)構(gòu)

線。

10.瀏覽軸位圖像。刪除不必要的結(jié)構(gòu)線。

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11.點擊LiveWire工具欄里的Segment。

創(chuàng)建mask,點LiveWire工具欄里的Close。

12.少瀏覽圖像檢查masko在個別部位可能需要手動的編輯。添加mask

缺損的像素或者擦除不屬于mask的多余的像素。

13.對GreenMask進行RegionGrowing()

14.'D點擊Segmentation工具欄中SmoothMask按鈕,光順mask兩次。

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15.%根據(jù)yellowmask使用highquality計算三維模型。

16.幫到工具欄的Tools中選擇Wrap按鈕,對三維模型進行包裹運

算。

17.6皿潑欄Tools中選卒Smoothing按鈕,對三維模型進行光順。

迭代3次。

18.結(jié)果如下:

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/導(dǎo)出功能

本章內(nèi)容幫助您對Mimics基礎(chǔ)模塊和不L+模塊的導(dǎo)出選項有一個概要的了解。

在Mimics基礎(chǔ)模塊中您可以將原始的醫(yī)學(xué)圖像以Dicom的格式導(dǎo)出。您也可以將

當(dāng)前激活的Mask信息,通過將切層以BMP/JPEG的格式導(dǎo)出的方式導(dǎo)出。

灰度值選項,將mask中體素的灰度值和坐標(biāo)信息一同導(dǎo)出。

導(dǎo)出影片選項幫助您以影片的形式導(dǎo)出正在操作Mimics用戶界面,另外這個選項也

能夠?qū)С鲂D(zhuǎn)的三維對象影片。

STL+模塊讓您能夠以如下格式導(dǎo)出三維信息:

BinarySTL

ASCIISTL

MGX(STLZip)

DXF

VRML

PLY

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練習(xí)1.導(dǎo)出切層

任務(wù)1.導(dǎo)出DICOM

1.在Export菜單中，選擇ExporttoDicom

2.在Dicomexport對話框中虛擇目標(biāo)文件夾點擊OK導(dǎo)出數(shù)據(jù)。

任務(wù)2,導(dǎo)出BMP

1.在Export菜單中,選擇ExporttoBMP/JPEG

2.在對話框中，您可以選擇您想導(dǎo)出的視窗。您可以選擇導(dǎo)出所有圖像或其中

的一部分圖像。

任務(wù)3.導(dǎo)出電影

1.在export菜單中,選擇exporttoMovie

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2.選擇錄制按鈕開始屏幕捕捉。您可以同時捕捉您的操作過程。點擊停止按鈕停止捕捉.

如果想錄制旋轉(zhuǎn)的三維模型,請在選項中選中Autorotate3Dview并且錄制BottomRightView.

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練習(xí)2.導(dǎo)出STL

所有不L+的導(dǎo)出方式都和本次練習(xí)講解的導(dǎo)出方式類似。

1.導(dǎo)出STL的操作是很簡單的。在export菜單中,選擇exporttoBinary

STL。

2.螃3D標(biāo)簽。從列表中選擇要導(dǎo)出的對象點擊Add次賓?復(fù)■制期Objecttoconvert”列表。

3.向您可以通過點擊文件夾形按鈕來改變輸出路徑。點擊Finish完成導(dǎo)

出。

您也可以從mask開始計算三維模型。這么做的好處是可以為計算三維模型提供更

多的內(nèi)存。

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/高級分割

本章對高級分割工具進行了介紹,這些工具使分割變得更快捷而簡便。本章練習(xí)將向

您解釋以下操作:

CropMask

Morphologicaloperations

Editmaskin3D

Multipleslicesegmentation

要請您注意的是,為了進行分割我們通常要進行以下步驟:

1.Thresholding:塞干陵敢對家

2.Cropmask:將mask限制至感興趣的區(qū)域

3.RegionGrow:去除離散的像素,分割不同部位

4.Calculate3D:在3D視圖下分析分割情況

5.Editmask:將另外一個部分與目標(biāo)相連的像素去除gS\tmask,multipleslice

edit,Morphologicaloperations)

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練習(xí)1.分離腦組織

任務(wù)1.修剪感興趣的區(qū)域

1.宜通過路徑File-Openproject打開項目。

這是T1加權(quán)像腦部磁共振片。

2.對該數(shù)據(jù)集使用圖像濾波器。對比不同濾波器對圖像的不同影響。

對于該數(shù)據(jù)最適合的濾波器是CurvatureFlow,將timestep設(shè)為，迭代次數(shù)5.

3.跨過腦畫一條剖面線。以曲線圖為基礎(chǔ)定義閾值范圍。注意腦的前部比較亮

而后部比較暗。這是MRI常見的鷹像,是由于組織的不均一性造成的。這使

分割變得更困難。在設(shè)定閾值時盡量將整個腦部都包括在內(nèi)。

對這個案幽較合適的閾值范圍是400到1330.

4.雷使用CropMask工具將感興趣的區(qū)域限制在腦組織周圍。鼠標(biāo)左鍵按住

方框的一邊拖拽,改變方框的大小,點擊0K修剪masko

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5.選擇regiongrowing工具,在腦組織上點擊,來去除離散的像素。

您會注意到部分頭部的軟組織和腦還是相連的,我們要在下一個任務(wù)中分離

它們。

任務(wù)2.形態(tài)學(xué)操作: