蛋白質(zhì)組信息學智慧樹知到期末考試答案章節(jié)答案2024年中南大學

蛋白質(zhì)組信息學智慧樹知到期末考試答案+章節(jié)答案2024年中南大學Ensembl是非冗余的已測序的脊椎動物的基因組信息。（）

答案:錯SILAC即細胞培養(yǎng)條件下穩(wěn)定同位素標記技術(shù)。（）

答案:對MaxQuant能在蘋果系統(tǒng)上運行。（）

答案:錯Mascot被認為是蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定行業(yè)標準。（）

答案:對固定修飾是指某一種氨基酸殘基可能會被某種基因修飾。（）

答案:錯六框翻譯數(shù)據(jù)庫是識別6個氨基酸信息作為翻譯數(shù)據(jù)庫。（）

答案:錯ProteoSuite是可視化mzQuantML文件的工具。（）

答案:對修飾肽段鑒定可以使用denova方法計算。（）

答案:錯2020年4月，Luck等在自然《Nature》雜志上發(fā)表了《人類二元蛋白質(zhì)相互作用的參考圖譜》是迄今為止規(guī)模最大的人類蛋白互作組數(shù)據(jù)庫。（）

答案:對缺失值過多蛋白通常不具有分析價值。（）

答案:對蛋白組數(shù)據(jù)可以推導出基因序列。（）

答案:錯修飾肽段可以不經(jīng)過富集直接檢測。（）

答案:對TraML是一種基于xml的編碼轉(zhuǎn)換表，用于靶向蛋白質(zhì)組學方法，如選擇反應(yīng)監(jiān)測（SRM）。（）

答案:對UniProt中的數(shù)據(jù)都是經(jīng)過審核驗證，并保證格式一致性。（）

答案:錯UniProt為科學界提供全面、高質(zhì)量和免費獲取的蛋白質(zhì)序列和功能信息資源。（）

答案:對有關(guān)mzML描述正確的是（）

答案:mzML是一種基于XML的質(zhì)譜數(shù)據(jù)格式;吸取了mzData和mzXML兩種格式的優(yōu)點;mzML框架具有較好的靈活性與穩(wěn)定性;存儲從質(zhì)譜儀輸出的質(zhì)譜數(shù)據(jù)及其元數(shù)據(jù)ProteomeXchangeConsortium成員中，來自美國的有（）

答案:MassIVE;PeptideAtlas;Panorama以下哪些屬于蛋白基因組學工具（）。

答案:MutationDB;customProDB;Pypgatk如何計算聚類分析里的“相似”程度（）。

答案:距離度量;相似度度量進行蛋白質(zhì)的功能富集分析常用的工具有和（）。

答案:Metascape;DAVID將蛋白質(zhì)酶切成肽段，（）。

答案:減少了蛋白質(zhì)的復雜性;低豐度蛋白質(zhì)的鑒定概率;提高了蛋白質(zhì)的采樣率;翻譯后修飾的鑒定概率研究蛋白質(zhì)的相互作用方法主要有（）。

答案:信息分析學方法;分子生物學方法;遺傳學方法;生物物理化學方法利用蛋白質(zhì)組信息學對細胞和組織進行哪維度的蛋白質(zhì)組分析（）

答案:總蛋白豐度、活性和磷酸化計量化學;蛋白質(zhì)理化特性;組織分布、翻譯后修飾、細胞周期、周轉(zhuǎn)、豐度、同源異構(gòu)體、定位和相互作用等;細胞周期、定位和周轉(zhuǎn)率肽質(zhì)量指紋圖譜存在的主要問題有（）。

答案:蛋白數(shù)據(jù)庫中，肽段的數(shù)量是很龐大，很多肽段的質(zhì)量非常接近;長鏈蛋白里的多肽數(shù)目較多，被隨機匹配的概率加大;不適合分析復雜樣品一個mzTab文件最多包括幾個部分。（）

答案:元數(shù)據(jù);肽;肽譜匹配（PSM）;小分子;蛋白質(zhì)PNGaseF（）。

答案:是一個酶;是糖基化修飾肽段鑒定中需要用到的一個試劑構(gòu)建特定樣本的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫的流程包括（）

答案:采用下一代全基因組和轉(zhuǎn)錄組測序;取得某一組織樣本;識別和量化肽和蛋白質(zhì);基因突變分析、選擇剪接、基因融合和從頭表達MassIVE提供的功能有（）

答案:獲取公共數(shù)據(jù)集;結(jié)果比較;搜索識別（初始和重新分析）;重新分析質(zhì)譜;共享重新分析蛋白質(zhì)組學(Proteomics)是（）

答案:揭示蛋白質(zhì)功能與細胞生命活動規(guī)律;當前生物學研究的熱點和發(fā)展最快的學科領(lǐng)域;分析細胞內(nèi)動態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成分、表達水平與修飾狀態(tài);了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系質(zhì)譜由三部分組成（）。

答案:離子源;檢測器;質(zhì)量分析器mzIdentML不包括以下信息（）

答案:原始質(zhì)譜數(shù)據(jù)RefSeq的顯著特征（）

答案:非冗余一級質(zhì)譜所測量的碎裂前的離子稱為（）。

答案:母離子蛋白組學的質(zhì)譜數(shù)據(jù)通常（）。

答案:由色譜圖和質(zhì)譜圖組成目前多肽譜匹配鑒定的統(tǒng)計學評估算法有基于概率模型的方法和（）。

答案:PSM可信度評估方法當前蛋白質(zhì)組分析的主流技術(shù)是（）

答案:串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)質(zhì)譜圖的橫軸就是質(zhì)荷比，縱軸是離子強度。（）。

答案:質(zhì)荷比，離子強度使用參考基因組注釋數(shù)據(jù)庫進行蛋白組分析（）。

答案:可以對蛋白質(zhì)進行定量下列哪一個數(shù)據(jù)倉儲不是ProteomeXchangeConsortium成員。（）

答案:GPMDBBottom-up又被稱為（）。

答案:鳥槍法蛋白質(zhì)組學磷酸化的修飾位點不包括（）。

答案:精氨酸STRING數(shù)據(jù)庫中設(shè)置更改互作網(wǎng)絡(luò)的標簽為（）。

答案:Settings以下哪種不是分類方法（）。

答案:主成分分析下列哪一個軟件工具未采用mzIdentML格式（）

答案:PASSELBottom-up方法基本思路是：先用蛋白酶把蛋白序列進行酶切，再（）。

答案:針對酶切后的肽段進行鑒定突變蛋白研究的數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建需要（）。

答案:基因組上蛋白編碼區(qū)上的錯義突變信息二級質(zhì)譜檢測是（）。

答案:肽段的碎片下列哪一個數(shù)據(jù)倉儲不是以物種為中心的聯(lián)盟（）

答案:EnsemblR語言可以進行質(zhì)譜定量數(shù)據(jù)分析，但是不能鑒定譜圖特征。（）

答案:錯R語言是（）。

答案:可以在蘋果系統(tǒng)上使用;一個免費的軟件R語言有Bioconductor和CRAN2個官方在線倉庫。（）

答案:對R語言（）。

答案:可以直接讀取文件PSM是質(zhì)譜圖與理論肽段譜圖匹配程度高，通過了統(tǒng)計學校正的圖譜數(shù)據(jù)表。（）

答案:對蛋白基因組目前的主要研究方向（）。

答案:基因注釋;宏蛋白質(zhì)組;突變蛋白檢測以下哪個選項不屬于目前蛋白質(zhì)組學實驗步驟（）。

答案:肽段富集蛋白基因組和蛋白質(zhì)組最大的區(qū)別是提取蛋白質(zhì)的方法不一樣。（）

答案:錯肽段鑒定離不開好的譜圖質(zhì)量。（）

答案:對蛋白基因組學是（）。

答案:探討基因組和蛋白質(zhì)之間聯(lián)系目前翻譯后修飾相關(guān)數(shù)據(jù)庫多集中在泛素化和糖基化。（）

答案:錯蛋白質(zhì)修飾類型包括（）。

答案:糖基化;磷酸化;甲基化;泛素化翻譯后修飾檢索的參數(shù)設(shè)置不包括（）。

答案:設(shè)置碎裂電壓蛋白質(zhì)翻譯后修飾的預測工具通常是根據(jù)臨近序列特征進行預測。（）

答案:對翻譯后修飾肽段的鑒定步驟（）。

答案:定量肽段表達值;識別具有修飾的肽段;確定化學修飾位置分層聚類是把原本多個變量化為少數(shù)幾個綜合指標的一種統(tǒng)計分析方法。（）

答案:錯聚類算法對基因表達數(shù)據(jù)的分析主要是分為以下幾個層次（）。

答案:分析單個基因的表達水平;將基因分組，研究基因的共同功能、相互作用及調(diào)控等;推斷潛在的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)從整體上來看GO注釋系統(tǒng)是一個有向無環(huán)圖。（）

答案:對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和核糖體屬于哪一類GO術(shù)語（）。

答案:細胞組分質(zhì)心法定義（）。

答案:兩個類的質(zhì)心間的距離作為兩類間距離石油醚自上而下運動的一相，一般是氣體或液體，稱為（）。

答案:流動相質(zhì)譜儀是用來測定氣態(tài)離子質(zhì)荷比（m/z）的儀器。（）

答案:對可以使用低溫條件下操作來減少蛋白質(zhì)降解。（）

答案:對串聯(lián)質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)的方法主要包括和（）。

答案:基于蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫搜索;從頭測序?qū)Φ鞍踪|(zhì)進行變性的作用是打開蛋白質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)，同時（）。

答案:增加蛋白質(zhì)的溶解度基于XML的質(zhì)譜相關(guān)的數(shù)據(jù)格式是（）

答案:mzML;mzQuantML;mzIdentMLmzML格式吸取了哪些格式的優(yōu)點（）

答案:mzData;mzXMLHUPO-PSI制定的蛋白質(zhì)組信息學標準屬于ISO標準。（）

答案:錯質(zhì)譜數(shù)據(jù)標準的制定組織主要有（）

答案:EBI;PSI;ISBHUPO-PSI制定的質(zhì)譜相關(guān)的受控詞表主要有（）

答案:PSI-MSProteomeXchangeConsortium成員有（）

答案:JPOST;PRIDE;Panorama;MassIVE;iProx;PeptideAtlasUniProt包括（）

答案:UniProt參考集（UniRef）;UniProt知識庫（UniProtKB）;UniProt存檔庫（UniParc）;物種蛋白質(zhì)組(SpeciesProteomes)下列哪一個數(shù)據(jù)庫不是以物種為中心的聯(lián)盟（）

答案:EnsemblRefSeq是非冗余的參考序列數(shù)據(jù)庫（）

答案:對Ensembl的顯著特征是（）

答案:基于證據(jù)的物種基因集蛋白質(zhì)組信息學應(yīng)用于（）

答案:發(fā)育研究;肽、蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)復合物研究;亞細胞和細胞上研究;細胞外和細胞內(nèi)研究屬于無凝膠的蛋白質(zhì)組學技術(shù)的是（）

答案:LC-MS;Proteinchip蛋白質(zhì)組學源于基因組學，但是超越了基因組學，這是因為：（）

答案:由于選擇性剪接等原因，