文獻檢索pubmed講解資料

1、PubMed文獻服務系統(tǒng)及PubMed RSS學科跟蹤服務,PubMed簡介,PubMed(Medline)由美國國立醫(yī)學圖書館（NLM）、國際MEDLARS成員（中國為第16個成員國）及合作的專業(yè)組織共同研制開發(fā)，是目前國際上公認的檢索生物醫(yī)學文獻最具權威、利用率最高、影響最廣的數(shù)據(jù)庫，也是我國衛(wèi)生部認定的科技查新必須檢索的國外醫(yī)學數(shù)據(jù)庫。,提 綱,PubMed概況 PubMed功能欄介紹 認識PubMed文獻 PubMed基本檢索 PubMed高級檢索 主題詞MeSH檢索 循證及臨床查詢檢索 PubMed全文獲取 PubMed RSS學科跟蹤,概況,網(wǎng)址：www.ncbi.nlm.nih.

2、gov/pubmed 或 PubMed收錄的期刊最早追溯至1865年，共收錄了70余個國家36000余種期刊，1900多萬篇文獻； PubMed 的子集Medline收錄的文獻最早追溯至1902年，現(xiàn)有記錄1790多萬篇； 目前每年增加約60余萬條文獻記錄； 在全部記錄中有76%的文獻為英文；在2000年以來的記錄中90%的文獻為英文，共計收錄國內(nèi)出版的期刊170余種。,/pubmed,Welcome to PubMed,使用幫助,檢索詞輸入框,常用工具,更多服務,認識PubMed文獻,出處SO,篇名TI,作者AU,文獻類型

3、(狀態(tài)),Summary,認識PubMed文獻,調整顯示設置 可改變顯示模 式，顯示數(shù)量 及檢索結果排 序,顯示設置,顯示摘要,顯示數(shù)量,排序模式,認識PubMed文獻,在摘要顯示模 式下可以看到 詳細的文獻信 息,作者地址,文獻摘要,文獻作者,文獻篇名,全文鏈接,文獻類型,文獻主題詞,認識PubMed文獻,出版社上傳,PreMedline,PubMed,Medline,PubMed數(shù)據(jù) 庫收錄的文獻 的狀態(tài)，主要 為Medline,認識PubMed文獻,非英文的文獻 篇名上有方括 號 且注明 有語種,英文文獻,土耳其語, 篇名 ,英文文獻,認識PubMed文獻,電子優(yōu)先即最 新文獻，一般 比

4、印刷出版提 前三個月以上,電子優(yōu)先,2009年5月,2008年9月,PubMed基本檢索,自由詞檢索 在檢索框中鍵入一個或多個英文單詞（大寫或小寫均可），點擊GO按鈕，PubMed系統(tǒng)會自動在主題詞表，期刊名表，短語表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動詞匯匹配功能”。 例如：檢索腫瘤 (cancer)方面的文章。 在檢索框中輸入：“cancer”，再點擊“Go”按鈕。 PubMed將自動地利用它的“自動詞匯匹配”功能將重要的詞語結合在一起，并將不規(guī)范的詞語轉換成MeSH詞表中規(guī)范的用詞進行檢索，比如，檢索“cancer” 將自動轉換為： neoplasmsMeSH T

5、erms OR neoplasmsAll Fields OR cancerAll Fields,自由詞檢索時 PubMed自動 將不規(guī)范的詞 轉換成規(guī)范的 詞進行檢索,自動詞匯轉換,PubMed基本檢索,PubMed基本檢索,布爾邏輯組合 檢索，常用的 邏輯關系詞有 AND，OR， NOT等,邏輯與（AND） -檢出記錄中同時含有檢索詞A和檢索詞B. 如：A AND B,邏輯非（NOT） -在含檢索詞A的記錄中，去掉含檢索詞B的記錄。 如：A NOT B,邏輯或（OR） -檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B或同時含有檢索詞A和B的文獻。 如：A OR B,PubMed基本檢索,作者姓名檢索 按照

6、姓+名縮寫（不用標點）的格式鍵入作者姓名，如：smith ja或jones k, 系統(tǒng)會自動在作者字段內(nèi)進行檢索。姓名第一個字母可用大寫也可用小寫，姓前名后,姓用全稱，名字一般用縮寫。 考慮到作者姓名的不同形式，PubMed采用自動轉換功能進行作者姓名檢索，如：smith j將檢索成smith ja,smith jb,smith jr 等。 精確檢索：可以用雙引號將作者名引起來，再加作者字段限定AU，如：smith jau，這樣可避免PubMed自動轉換，實現(xiàn)精確查找。,PubMed基本檢索,作者姓名檢索 按照姓(全寫) +名(縮寫)， 之間不用標點 鍵入作者姓名,smith j,PubMed

7、基本檢索,精確檢索避免 PubMed自動 詞匯轉換，實 現(xiàn)精確查找,smith jau,PubMed基本檢索,期刊檢索 在檢索框中鍵入期刊名，如：European journal of immunology，系統(tǒng)的“自動詞語匹配”功能會將它轉換成Eur J ImmunolJournal OR european journal of immunologyAll Fields進行檢索。 也可以直接輸入Medline的期刊標準縮寫形式，如： Eur J Immunol ，或者是輸入刊物的ISSN（國際標準出版物代碼）進行檢索，如：0014-2980。 如果一個雜志名恰好是主題詞或關鍵詞，如：canc

8、er， science，cell等，PubMed會首先將這些詞轉換成MeSH詞表中的主題詞進行檢索。因此，需要將檢索請求進行標準化處理，即在雜志名后面加TA。如：cellta,PubMed基本檢索,期刊的一般檢 索，是在檢索 輸入框中鍵入 期刊名或期刊 的ISSN號,Eur J Immunol,PubMed基本檢索,期刊的標準檢 索，是在期刊 名后面加字段 限定TA. 比 如:cellta,cellta,PubMed基本檢索,期刊數(shù)據(jù)庫（journal database) 期刊數(shù)據(jù)庫的作用： 1、可以查看期刊的詳細信息，包括出版國家，出版社，出版語言，期刊類目等等； 2、可以根據(jù)期刊的主題分類

9、，查看medline收錄的各學科的期刊，比如查看medline收錄的關于麻醉學(Anesthesiology)方面的期刊； 2、方便檢索某本期刊上被PubMed收錄的所有文章。 比如：我們想知道期刊Acad Pediatr的全稱以及具體的出版社，以方便投稿，如何查？ 操作方法：點擊導航欄上的Journal database，打開期刊數(shù)據(jù)庫檢索界面，在檢索框中輸入Acad Pediatr，再點擊Go按鈕即可。,PubMed基本檢索,期刊數(shù)據(jù)庫在 PubMed首頁 導航欄的右下 角部分,期刊數(shù)據(jù)庫,PubMed基本檢索,期刊數(shù)據(jù)庫可 以查看指定期 刊的詳細信息,Elsevier出版,期刊數(shù)據(jù)庫,P

10、ubMed基本檢索,按期刊主題瀏 覽medline收 錄的各學科的 期刊,期刊主題,期刊數(shù)據(jù)庫,PubMed基本檢索,按字母順序瀏 覽medline收 錄的各學科期 刊,麻醉學方面,PubMed基本檢索,期刊數(shù)據(jù)庫可 以方便的查看 medline收錄 的各學科方面 的期刊,medline收錄的麻醉學方面的期刊,PubMed基本檢索,截詞檢索 截詞檢索的作用：擴大檢索范圍，提高查全率。 截詞符： 用*表示，代表多個字符，將*加在檢索詞后可以表示對所有以該詞開頭的詞進行檢索。 如：bacter*，可以檢出bacter，bacteria， bacteriophage ，bacterium，等最多60

11、0個單詞。,PubMed基本檢索,截詞檢索可以 擴大檢索范圍 提高查全率。,bacter*TI,PubMed基本檢索,字段限制檢索 采用字段限制方式進行檢索，其規(guī)則是： 檢索詞1字段標識 邏輯運算符 檢索詞2字段標識 如：查找作者為crick在1993年發(fā)表的有關DNA方面的文獻. 檢索式： crickau AND 1993dp AND DNA,PubMed基本檢索,crickau AND 1993dp AND DNA,字段限制檢索 其規(guī)則是：檢 索詞+字段 標識,PubMed基本檢索,常用檢索字段描述和標識 Titleti：篇名字段 Abstractab：摘要字段 Affiliation a

12、d：著者地址字段。 Author nameau：文章的作者，檢索格式：姓+名。如：smith jaau Journal titleta：期刊名稱。如：cellta Languagela：論文出版語種。語種檢索時可只輸入前3個字母，如：chila=chinesela；Englishlang=engla 比如：檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻 檢索式:hypertensionti AND chila,PubMed基本檢索,hypertensionti AND chila,檢索文章題目 中含有高血壓 的中文文獻,PubMed基本檢索,常用檢索字段描述和標識 Publication datedp:出

13、版日期 指論文所在期刊的出版日期 日期檢索的形式為：YYYY/MM/DDDP 要檢索一段時期內(nèi)的文章，日期之間可以加冒號，如： 1993/01:1995/06DP Publication typept:出版類型。有綜述，新聞，傳記，臨床試驗等。如：reviewpt MeSH termsmh：主題詞字段。如：hypertensionmh Subheadingssh:副主題詞。與主題詞組配檢索. 比如：檢索1995年到1996年出版的關于高血壓方面的綜述性文獻。 1995/01:1996/12DP AND hypertensionmh AND reviewpt,PubMed基本檢索,檢索 1995

14、 年 到 1996 年出 版的關于高血 壓方面的綜述 性文獻,1995/01:1996/12DP AND hypertensionmh AND reviewpt,PubMed基本檢索,常用檢索字段描述和標識 FILTER Filter： 由PubMed系統(tǒng)鏈接的外部資源站點所使用的用來限定文獻的技術標識，此檢索字段常用來限定檢索比如被F1000M評價的文獻等 Faculty of 1000是英國現(xiàn)代生物出版集團（BioMed Central）為彌補只用期刊影響因子（IF）來衡量刊物的不足，近年來提出了“Faculty of 1000”計劃。從全世界邀請數(shù)千名頂尖的生物學家和醫(yī)學專家，請他們從每

15、年所發(fā)表的生物醫(yī)學SCI論文中評選出一小部分（約占0.1%）的文章，賦予F1000論文稱號，推薦給全世界的生物學和醫(yī)學工作者，并由“Faculty of 1000”中的科學家對F1000論文逐篇加以評論。 例如：檢索“鼻咽癌nasopharyngeal cancer治療方面的被Medline正式收錄且被F1000評價過的研究文獻”要求查準不要求查全，對此構建的檢索式： (nasopharyngeal cancer) AND (Therapy/Narrowfilter) AND medlinesb AND loprovf1000mfilter,PubMed基本檢索,檢索鼻咽癌治 療方面的且被 M

16、edline正式 收錄及F1000 評價過的研究 文獻,F1000M文獻評價,PubMed基本檢索,強制檢索功能 PubMed允許使用雙引號來強制系統(tǒng)進行短語檢索。 如：在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“single cell”，并用雙引號引起來。點擊“GO”按鈕，系統(tǒng)會將其作為一個不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進行檢索。 如果不使用雙引號進行強制檢索，系統(tǒng)就會將其分成2個詞：single和cell檢索，其檢索表達式為：single AND cell. 很明顯這樣的檢索結果是不符號要求的。,PubMed基本檢索,強制檢索,普通檢索,single cell,single cell,Pub

17、Med高級檢索,高級檢索,PubMed高級檢索,限定欄,預覽,高級檢索界面 下可以看到明 細欄，預覽， 檢索史，限定 和高級檢索等,檢索史,明細欄,高級檢索,更多服務,PubMed高級檢索,姚開泰院士 2001年以來 被Medline 收錄的文獻,姚開泰,作者,PubMed高級檢索,姚開泰院士 2001年以來 被Medline 收錄的文獻,時間,2001,使用說明,PubMed高級檢索,Limit限定,年齡,物種,子集,全文,字段,時間,性別,語言,文獻類型,PubMed高級檢索,限定檢索范圍 為近半年來以 英文發(fā)表的循 證醫(yī)學方面的 文獻,限定為英文,限定為循證等文獻,限定為近半年,PubM

18、ed高級檢索,限定檢索范圍 為被Medline 正式收錄的有 電子全文鏈接 的中老年病例,限定為Medline,限定為有電子全文,限定為中老年,主題詞MeSH檢索,醫(yī)學主題詞表數(shù)據(jù)庫(MeSH Database) 醫(yī)學主題詞表是對生物醫(yī)學文獻進行主題分析、標引和檢索的權威性詞表，它的作用是使醫(yī)學文獻的主題標引和檢索達到統(tǒng)一和一致，并指導用戶高質量地檢索醫(yī)學文獻。它可以指導用戶從同義詞發(fā)現(xiàn)主題詞，告訴用戶主題詞如何使用，顯示主題詞之間的相互關系。,主題詞MeSH檢索,醫(yī)學主題詞表數(shù)據(jù)庫(MeSH Database) 利用主題詞進行檢索 方法: 1、點擊主頁右下角的MeSH Database進入主

19、題詞檢索界面； 2、輸入檢索詞后，點擊go按鈕，系統(tǒng)將顯示與該詞有關主題詞； 3、點擊該主題詞進一步顯示該主題詞的定義、樹狀結構、組配的副主題詞； 4、選擇合適的主題詞與副主題詞后，點擊send to按鈕，進入檢索表達式瀏覽窗口； 5、點擊Search PubMed將顯示檢索結果。,主題詞MeSH檢索,主題詞數(shù)據(jù)庫 在PubMed首 頁導航欄的右 下角,主題詞數(shù)據(jù)庫,主題詞MeSH檢索,輸入普通詞 查找對應主題詞,MeSH,主題詞檢索可 以指導用戶高 質量地檢索醫(yī) 學文獻,主題詞MeSH檢索,一般一個主題 詞還要配合一 個副主題詞進 行組合檢索,選擇副主題詞,Search Box with A

20、ND,主題詞MeSH檢索,點Sent to 將 檢索詞添加到 檢索表達式瀏 覽窗口,主題詞MeSH檢索,Search PubMed,主題詞檢索可 以達到比較滿 意的查全率和 查準率,主題詞MeSH檢索,主題詞檢索是 在有主題標引 的Medline數(shù) 據(jù)庫中檢索,主題詞檢索結果,主題詞MeSH檢索,普通詞不是規(guī) 范化的主題詞 檢索結果相關 度低,普通詞檢索結果,臨床查詢檢索,“Clinical queries”是專門為臨床醫(yī)生研究設計的內(nèi)置的臨床方法學“過濾器” （Clinical Methodology Filters），這組檢索策略模型是由加拿大臨床流行病學和生物統(tǒng)計學研究人員Haynes

21、RB等人在1994年提出來的，并進行了查全率和查準率分析。用戶通過這一臨床方法學檢索過濾器，不需掌握復雜的檢索策略，即可檢索所需的臨床研究文獻。,臨床查詢檢索,使用方法: 1、點擊主頁左側導航欄的Clinical Queries進入臨床查詢頁面； 2、在檢索框中輸入檢索詞，并選擇副主題詞組配，指定檢索結果是查全(sensitive)，還是查準(specific)； 3、點擊GO按鈕執(zhí)行檢索。 例如： 檢索“鼻咽癌nasopharyngeal cancer治療方面的研究文獻”,臨床查詢檢索,臨床查詢在 PubMed首 頁導航欄的 中間部分,臨床查詢,臨床查詢檢索,臨床查詢主要 用于檢索臨床 方面

22、的研究文 獻,臨床查詢檢索,臨床查詢檢索,臨床查詢主要 包括某種疾病 的治療，診斷 病因和預后四 個方面,檢索結果,PubMed全文獲取,通過PubMed檢索出來的文獻，部分我們通過瀏覽摘要即可，部分我們還需要查看全文，以作進一步的研究，那么，我們?nèi)绾潍@取全文呢？ 一：免費的全文,PubMed全文獲取,PubMed收錄 的文獻大約有 5%是免費的 可以直接打開 全文,免費全文可直接打開,PubMed全文獲取,打開PDF全文,免費的全文并 不代表學術價 值低，大部分 的生命科學的 全文都是免費 的,PubMed全文獲取,二：學校已訂購的全文 如果我們所需要的文獻，學校已訂購了該文獻所在的全文型數(shù)據(jù)庫，我們也可以直接打開或到相應的全文數(shù)據(jù)庫中查找。,國內(nèi)出版的期 刊，學校一般 都有訂購，請 查找清華同方 或維普，萬方,學校已訂購,PubMed全文獲取,PubMed全文獲取,SpringerLink 和EBSCO等外 文全文庫，