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文檔簡介
1、SPSS Survival(生存分析)菜單SPSS Survival菜單包括Life Tables過程、Kaplan-Meier過程、Cox Regression過程、Cox w/Time-Dep Cov過程。這里只介紹Life Tables過程和Kaplan-Meier過程。Life Tables過程Life Tables過程用于:1、估計(jì)某生存時(shí)間的生存率。2、繪制各種曲線如生存函數(shù)、風(fēng)險(xiǎn)函數(shù)曲線等。3、對(duì)某一研究因素不同水平的生存時(shí)間分布進(jìn)行比較,控制另一因素后對(duì)研究因素不同水平的生存時(shí)間分布進(jìn)行比較,包括從總體上比較和不同水平之間進(jìn)行兩兩比較。一、建立數(shù)據(jù)文件 定義兩個(gè)列變量:時(shí)間變量
2、: 取名“time”,label標(biāo)上“survival time(week)”。生存狀態(tài)變量:取名“status”,并賦值:0=“刪失”,1=“死亡”。二、操作過程 從菜單選擇1、Analyze=Survival =Life Tables2、Time框:選入time3、Display Time Intervals框:在by前面的框內(nèi)填入生存時(shí)間上限,本例填入20(此區(qū)間必須包括生存時(shí)間的最大值);在by后面的框內(nèi)填入生存時(shí)間的組距,本例填入5,以保證結(jié)果列出“15-”的組段。4、Status框:選入status;擊define events鈕,在single value框右邊的空格中輸入15、
3、單擊Option按鈕,彈出對(duì)話框:lLife Table(s) 輸出壽命表,系統(tǒng)默認(rèn)lPlots: 選Survival(累積生存函數(shù)曲線)擊Continue6、單擊OK鈕附:界面說明圖1 壽命表主對(duì)話框【Time】框選入生存時(shí)間變量?!綝isplay Time Intervals】框欲輸出生存時(shí)間范圍及組距。在by前面的框內(nèi)填入生存時(shí)間上限,本例填入200(此區(qū)間必須包括生存時(shí)間的最大值);在by后面的框內(nèi)填入生存時(shí)間的組距,本例填入20,以保證結(jié)果列出“100-”的組段?!維tatus】框選入生存狀態(tài)變量,并定義終結(jié)事件的標(biāo)記值。選入變量“Status”后,【Define Event】鈕被激
4、活變黑,擊該按鈕,彈出定義終結(jié)事件標(biāo)記值的對(duì)話框(圖1)。對(duì)二分類變量,一般以死亡、復(fù)發(fā)、惡化等表示終結(jié)事件。本例以死亡為終結(jié)事件,其標(biāo)記值為1,故在Single value 框內(nèi)填入1。擊Continue鈕。若生存狀態(tài)變量取值為一連續(xù)型變量,如反應(yīng)變量為收縮壓,則在下面的Range of values 框中輸入140 through 400,此處上限輸入400是我隨便輸入的一個(gè)上限,目的是為了定義高血壓患者,實(shí)際上恐怕沒有人的血壓能達(dá)到400,這樣才能保證包括所有的高血壓病例,具體情況具體分析。圖2 定義終結(jié)事件標(biāo)記值的對(duì)話框【Factor】框定義第1層因素,即分組因素。【By Factor
5、】框定義第2層因素,即分層因素?!綩ptions】選項(xiàng)擊Options按鈕,彈出選項(xiàng)對(duì)話框。(圖3)圖3 壽命表選項(xiàng)對(duì)話框 Life Table(s):輸出壽命表,系統(tǒng)默認(rèn)。Plot:統(tǒng)計(jì)圖。 Survival:累積生存函數(shù)曲線。 Hazard:累積風(fēng)險(xiǎn)函數(shù)散點(diǎn)圖。 One minus survival:生存函數(shù)被1減后的曲線。 Log survival:對(duì)數(shù)累積生存函數(shù)曲線。 Density:密度函數(shù)散點(diǎn)圖。Compare Levels of First Factor:對(duì)第1層因素不同水平的比較,即主對(duì)話框(圖1)中的factor框中所選入的因素。 None:不做比較。系統(tǒng)默認(rèn)。 Overa
6、ll:整體比較。 Pairwise:兩兩比較。 壽命表各個(gè)指標(biāo)的意義Intrvl Start Time:生存時(shí)間的組段下限。Number Entrng this Intrvl:進(jìn)入該組段的觀察例數(shù)。Number Wdrawn During Intrval:該組段的刪失例數(shù)。Number Exposed to Risk:暴露于危險(xiǎn)因素的例數(shù),即有效觀察例數(shù)(校正觀察人數(shù))。Number of Termnl Events:終結(jié)事件的例數(shù),即死亡例數(shù)。Propn Terminating:終結(jié)事件比例,即死亡比例。Propn Surviving:生存比例。Cumul Propn Surv at End
7、:至本組段上限的累積生存率。Probability Densty:概率密度。所有個(gè)體在時(shí)點(diǎn)t后單位時(shí)間內(nèi)死亡概率的估計(jì)值。Hazard Rate:風(fēng)險(xiǎn)率?;钸^時(shí)點(diǎn)t的個(gè)體,在時(shí)點(diǎn)t后單位時(shí)間內(nèi)死亡概率的估計(jì)值。SE of Cumul Surviving:累積生存率的標(biāo)準(zhǔn)誤。SE of Probability Densty:概率密度的標(biāo)準(zhǔn)誤。SE of Hazard Rate:風(fēng)險(xiǎn)率的標(biāo)準(zhǔn)誤。 Kaplan-Meier過程采用乘積極限法(Product-limit estimates)來估計(jì)生存率,同時(shí)還可以對(duì)一個(gè)因素進(jìn)行檢驗(yàn)。適用于以個(gè)體為單位來收的未分組生存資料,是最基本的一種生存分析方法。
8、Kaplan-Meier法用于:1、估計(jì)某研究因素不同水平的中位生存時(shí)間。2、比較該研究因素不同水平的生存時(shí)間有無差異。3、控制一分層因素后對(duì)研究因素不同水平的生存時(shí)間比較(此時(shí)將按分層因素的不同水平對(duì)研究因素對(duì)生存時(shí)間的影響分別進(jìn)行分析)。操作過程:1.Analyze=Survival =Kaplan-Meier2. Time框:選入 time3. Status框:選入status;擊define events鈕,在single value框右邊的空格中輸入14. Factor框:選入group;5. Compare factors列表框:l Test Statistics:選擇Log ra
9、nk、Breslow、Tarone-Warel Linear trend for factor levels:選Pooled over strata或Pairwise over strata6. Option列表框:l Statistics: 選Survival table(s)、Mean and median、Survivall Plots: 選Survival單擊OK鈕三、界面說明圖1 Kaplan-Meier法主對(duì)話框【Time】框選入生存時(shí)間變量。【Status】框選入生存狀態(tài)變量?!綟actor】框選入分組變量?!維trata】框選入分層變量?!綥ables Cases】框給個(gè)體標(biāo)記
10、。【Compare Factor】選項(xiàng)擊Compare Factor按鈕,彈出選項(xiàng)對(duì)話框。(圖2)圖2 分組因素水平間比較對(duì)話框l Test Statistics:檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量。Log rank:檢驗(yàn)生存分布是否相同,各時(shí)間點(diǎn)權(quán)重一樣。Breslow:檢驗(yàn)生存分布是否相同,以各時(shí)間點(diǎn)的觀察例數(shù)為權(quán)重。Tarone-Ware:檢驗(yàn)生存分布是否相同,以各時(shí)間點(diǎn)的觀察例數(shù)的平方根為權(quán)重。Linear trend for factor levels:分組因素水平間的線性趨勢檢驗(yàn)。 Pooled over strata:水平間的整體比較。系統(tǒng)默認(rèn)。 For each stratum:按分層變量,對(duì)每一層進(jìn)
11、行分組因素各水平間的整體比較。 Pairwise over strata:分組因素各水平間的兩兩比較。 Pairwise for each stratum:按分層變量,對(duì)每一層進(jìn)行分組因素各水平間的兩兩比較?!維ave】 選項(xiàng)擊Save按鈕,彈出Save New Variables(保存新變量)對(duì)話框(圖7)。圖3 保存新變量對(duì)話框Survival:累積生存率估計(jì)。Standard error of survival:累積生存率估計(jì)的標(biāo)準(zhǔn)誤。Hazard:累積風(fēng)險(xiǎn)函數(shù)估計(jì)。Cumulative events:終結(jié)事件的累積頻數(shù)。在各水平內(nèi),按生存時(shí)間和生存狀態(tài)排序?!綩ptions】選項(xiàng)擊Options按鈕,彈出選項(xiàng)對(duì)話框(圖8)。圖4 K-M法選項(xiàng)對(duì)話框lStatistics:統(tǒng)計(jì)量。Survival table(s):生存分析表。Mean and median survival:平均生存時(shí)間和中位生存時(shí)間及其標(biāo)準(zhǔn)誤和可信區(qū)間。Q
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