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文檔簡介

1、 料推薦用 NTSYSpc 2.10e 制作聚類圖(實例講解)1. 在 EXCEL 表中 先建立一個 0, 1 構成的矩陣:按如下規(guī)則輸入數據,A1=1 表示有帶記為1,B1=38 表示 AFLP/SSR/RFLP有 38 個條帶,C1=60表示樣本數,D1=0 表示無帶記為0。如圖 ( 每個列為一個樣本的條帶情況) :2. 將 EXCEL數據復制粘貼到文本格式,命名保存sz2.txt。3. 打開 ntsys軟件的, 將文本文件導入軟件中:點 Similarity,選中 Qualitative data, input file欄導入保存的sz2.txt。在Output file欄輸入 sz3

2、,點 Compute,會出現一個報告:4. 點 Clustering,選 SAHN, inputfile欄導入 sz3.NTS,Outputtreefile欄輸入 sz4,1 料推薦點 Compute,又會出現一個報告:5. 點 Graphics,選 Tree plot, input file欄導入sz4.NTS,點 Compute,就出現一個報告和聚類圖:2 料推薦因為默認設置顯示樣本數是30,需改變設置為60,點聚類圖的Options,選 plot options,在Phenogram 中的 OTUs/page 欄改 30 為 60:點 OK, 全部樣本的聚類圖就出來了:點 File進行圖片保存即可。注:F

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