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文檔簡介
1、DICOM數(shù)據(jù)格式,張靜遠(yuǎn),1,DICOM數(shù)據(jù)格式,DICOM全稱為醫(yī)療數(shù)位影像傳輸協(xié)定(DigitalImaging and Commun- ications inMedicine),是一組通用的標(biāo)準(zhǔn)協(xié)定,在對于醫(yī)學(xué)影像的處理、儲存、打印、傳輸上。它包含了檔案格式的定義及網(wǎng)絡(luò)通信協(xié)定。DICOM是以TCP/IP為基礎(chǔ)的應(yīng)用協(xié)定,并以TCP/IP聯(lián)系各個系統(tǒng)。兩個能接受DICOM格式的醫(yī)療儀器間,可借由DICOM格式的檔案,來接收與交換影像及病人資料。 AS = Angioscopy 血管鏡 BI = Biomagnetic Imaging 生物磁場成像 CD = Color Flow Dop
2、pler 彩色血流多普勒 CF = Cinefluorography 熒光透視 CR = Computed Radiography 計算機(jī)X光攝影 CS = Cystoscopy 膀胱鏡 CT = Computed Tomography 電腦斷層攝影 DD = Duplex Doppler 雙工多普勒 DG = Diaphanography 透視攝影,2,DICOM文件結(jié)構(gòu),3,文件頭,文件頭包含了標(biāo)識數(shù)據(jù)集合的相應(yīng)信息,由128字節(jié)的文字導(dǎo)言構(gòu)成。如果該導(dǎo)言不傳達(dá)信息,可由十六進(jìn)制的00填充。 文件頭之后是DICOM前綴,內(nèi)容是字符串“DICM”,表示是DICOM文件。 文件頭之后是數(shù)據(jù)集合
3、,文件頭也可以缺省,4,數(shù)據(jù)集合,標(biāo)簽:4字節(jié)無符號整數(shù),分為組號和元素號 VR:數(shù)據(jù)類型 數(shù)據(jù)長度:2字節(jié)或4字節(jié) 數(shù)值:長度為偶數(shù)字節(jié),5,28001100,5553,0200,0001,28001100:圖像高度標(biāo)簽 5553:數(shù)據(jù)類型 0200:數(shù)據(jù)長度為2字節(jié) 0001:數(shù)值為256,6,DICOM處理流程,頭動校正,標(biāo)準(zhǔn)化,平滑,7,頭動校正,1、解頭動參數(shù) 2、再切片,8,1、解頭動參數(shù),由于頭動校正是處理的是同一被試,所以可以看做是剛性變換,分為平移和旋轉(zhuǎn)兩部分,方程為,T為平移參數(shù),R為相對坐標(biāo)軸的旋轉(zhuǎn)參數(shù),9,之后再通過高斯迭代,可以求解方程,其中表示第i個體素的坐標(biāo),M為
4、變換矩陣,f(*)表示資源圖像的灰度值,g(*)表示參考圖像的灰度值,q7為灰度平衡參數(shù)。q7引入是為了平衡兩幅圖像的灰度。向量q擴(kuò)展到七維,10,2、重切片,重切片包括重新分割空間和計算新像素的灰度值。 計算新像素的灰度值的主要方法有:最近相鄰法(nearest neighbor)、三線性插值法(tr-i linear interpolation)和正弦插值法(sinc interpolation)等,選擇何種方法根據(jù)計算精度和計算能力來定,11,標(biāo)準(zhǔn)化,由于被試間腦結(jié)構(gòu)存在差異,因此需要用帶有整體形變的仿射變換和局部非線性變換將它們同一化到標(biāo)準(zhǔn)腦上 SPM 軟件中采用了Ta2lairach 和Tournoux所定義的腦圖譜空間作為變換的基礎(chǔ),制作了不同成像方法(如MRI、PET 和CT 等) 的標(biāo)準(zhǔn)腦基準(zhǔn)圖像,用戶做圖像標(biāo)準(zhǔn)化時,可根據(jù)具體的成像方法選擇相應(yīng)的基準(zhǔn)圖像,12,平滑,空間平滑就是將數(shù)據(jù)在空間上用一個光滑
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