
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1、蛋白質(zhì)分子質(zhì)量測定蛋白質(zhì)分子質(zhì)量測定方法概述方法概述目錄目錄其他方法其他方法sds-pagesds-page凝膠電泳凝膠電泳v聚丙烯酰胺凝膠電泳技術(shù)是實驗室進(jìn)行蛋白質(zhì)研究中最常用的技術(shù),兼有電泳和分子篩的雙重作用。vsds是一種陰離子去污劑,可使蛋白質(zhì)變性,與其蛋白質(zhì)結(jié)合成帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)-sds復(fù)合體,消除電泳過程中蛋白質(zhì)所帶電荷對電泳結(jié)果的影響,從而保證蛋白質(zhì)電泳僅受分子質(zhì)量大小的影響。在一定的電場作用下,該復(fù)合體沿著以聚丙烯酰胺凝膠形成的分子篩向電場的正極移動,從而將蛋白質(zhì)根據(jù)他們的分子量大小而分開。v蛋白質(zhì)-sds復(fù)合體:形狀一定、電荷密度一定sds-pagesds-page凝膠電泳凝
2、膠電泳上樣:防止樣品溢出、正負(fù)極、電壓sds-pagesds-page凝膠電泳凝膠電泳當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)分子量在10-200kda時,樣品的遷移率和分子量的對數(shù)呈對數(shù)關(guān)系,符合如下方程式: lgmw = -brf + k其中,mw為蛋白質(zhì)分子質(zhì)量,rf為相對遷移率,b為斜率,k為截距,當(dāng)條件一定時,b和k為常數(shù)。因此通過已知分子量的蛋白和未知分子量蛋白的比較,就能得出未知蛋白的分子量。 影響分子量測定的因素很多,包括蛋白質(zhì)與sds的結(jié)合量的不同,凝膠濃度和交聯(lián)劑濃度等,如圖所示。研究者測定了當(dāng)交聯(lián)劑濃度不變,改變凝膠濃度,下圖分別對應(yīng)于凝膠濃度為5%,10%,15%。sds-pagesds-page凝膠
3、電泳凝膠電泳 優(yōu)點(diǎn)優(yōu)點(diǎn):操作簡單,容易掌握,成本低,分辨率高,重復(fù)效果好。 缺點(diǎn)缺點(diǎn):對于電荷異?;蛘邩?gòu)象異常的蛋白、帶有較大輔基的蛋白及一些結(jié)構(gòu)蛋白測定的分子質(zhì)量不太可靠,而且電泳結(jié)束后還需要染色,染色,脫色比較耗時。sds-pagesds-page凝膠電泳凝膠電泳凝膠滲透層析法凝膠滲透層析法定義:又叫體積排阻層析、分子篩層析,當(dāng)生物大分子通過裝有凝膠顆粒的層析柱時,根據(jù)它們分子大小不同而進(jìn)行的分離技術(shù)。固定相:惰性凝膠顆粒,顆粒內(nèi)部立體網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),形成許多孔穴原理:原理:凝膠滲透層析法凝膠滲透層析法常用凝膠:交聯(lián)葡聚糖凝膠(sephadex)、聚丙烯酰胺凝膠、瓊脂糖凝膠(sepharose)
4、凝膠滲透層析法凝膠滲透層析法洗脫體積ve與分子量的關(guān)系可用下式表示:ve=k1k2logmw(k1、k2為常數(shù),mw為分子量)從公式可以看出,目標(biāo)樣品的流出體積與分子量對數(shù)成線性關(guān)系。在實際操作過程中,選取標(biāo)準(zhǔn)品與樣品同時通過凝膠柱,通過已知標(biāo)準(zhǔn)品的流出體積和分子量可以計算出曲線中的k1、k2值,再根據(jù)已知的曲線方程和樣品流出體積計算樣品的分子量。凝膠滲透層析法凝膠滲透層析法 優(yōu)點(diǎn):優(yōu)點(diǎn):操作簡單,設(shè)備簡單,樣品用量少,周期簡單,條件溫和,一般不引起生物活性的改變。 缺點(diǎn):缺點(diǎn):應(yīng)用具有一定的局限性,在ph68的范圍內(nèi),線性關(guān)系比較好,但在極端ph時,一般蛋白質(zhì)有可能因變性而偏離。糖蛋白在含糖
5、量超過5%時,測得分子量比真實的要大,鐵蛋白則與此相反,測得的分子量比真實的要小。質(zhì)譜法質(zhì)譜法 1906年,thomson發(fā)明了質(zhì)譜技術(shù),最初只是用于無機(jī)化學(xué)中的同位素分析,直至20世紀(jì)40年代末才發(fā)展成為有機(jī)質(zhì)譜。近年來,生物質(zhì)譜技術(shù)取得了突飛猛進(jìn)的發(fā)展,其中以分別由美國科學(xué)家john.b.fenn和日本科學(xué)家田中耕一發(fā)明的電噴霧離子化質(zhì)譜技術(shù)(電噴霧離子化質(zhì)譜技術(shù)(esi-msesi-ms)及基質(zhì)輔助激光解吸基質(zhì)輔助激光解吸電離質(zhì)譜技術(shù)(電離質(zhì)譜技術(shù)(maldi-msmaldi-ms)的貢獻(xiàn)最為突出。可準(zhǔn)確測定分子量1.電噴霧離子化質(zhì)譜技術(shù)(電噴霧離子化質(zhì)譜技術(shù)(esi-ms)原理:原理:
6、電噴霧離子化質(zhì)譜技術(shù)(esi-ms)是在毛細(xì)管的出口處施加一高電壓,所產(chǎn)生的高電場使從毛細(xì)管流出的液體霧化成細(xì)小的帶電液滴,隨著溶劑蒸發(fā),液滴表面的電荷密度逐漸增大,最后液滴崩解為大量帶一個或多個電荷的離子,致使分析物以單電荷或多電荷離子的形式進(jìn)入氣相的質(zhì)譜技術(shù)。esi-ms測定蛋白質(zhì)大分子是根據(jù)一簇多電荷的質(zhì)譜峰群,通過解卷積的方式計算得到蛋白質(zhì)的分子量,由于esi-ms可以產(chǎn)生多電荷峰,因此使得測試的分子質(zhì)量范圍大大擴(kuò)大。1.電噴霧離子化質(zhì)譜技術(shù)(電噴霧離子化質(zhì)譜技術(shù)(esi-ms) 電噴霧是一種離子化方法,可以用作質(zhì)譜儀的離子源1.電噴霧離子化質(zhì)譜技術(shù)(電噴霧離子化質(zhì)譜技術(shù)(esi-ms
7、)多電荷使得樣品譜圖復(fù)雜荷質(zhì)比:1.電噴霧離子化質(zhì)譜技術(shù)(電噴霧離子化質(zhì)譜技術(shù)(esi-ms)優(yōu)點(diǎn):優(yōu)點(diǎn):(1)對樣品的消耗少,不會造成樣品的大量浪費(fèi);(2)對樣品分子質(zhì)量測試靈敏度、分辨力和準(zhǔn)確度都相當(dāng)高;(3)能夠方便地與多種分離技術(shù)聯(lián)用,如毛細(xì)管電泳、高效液相色譜等,是解決非揮發(fā)性、熱不穩(wěn)定性、極性強(qiáng)的復(fù)雜組分化合物的定性定量的高靈敏度檢測方法。缺點(diǎn):缺點(diǎn):對樣品純度要求高,且會形成多電荷的質(zhì)譜峰群,難以分辨,使得結(jié)果分析較為困難。2.基質(zhì)輔助激光解吸電離質(zhì)譜技術(shù)(基質(zhì)輔助激光解吸電離質(zhì)譜技術(shù)(maldi-ms)原理:原理:基質(zhì)輔助激光解吸電離質(zhì)譜技術(shù)(maldi-ms)是將待測物懸浮或
8、溶解在一個基體中,基體與待測物形成混晶,當(dāng)基體吸收激光的能量后,均勻傳遞給待測物,使待測物瞬間氣化并離子化。將它與經(jīng)典的脈沖化工作方式的飛行時間質(zhì)譜儀(tof)直接聯(lián)用,即我們常聽到的基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(maldi-tof-ms)。tof的原理是離子在電場作用下加速飛過飛行管道,根據(jù)到達(dá)檢測器的飛行時間不同而被檢測即測定離子的質(zhì)荷比(m/z)與離子的飛行時間成正比,檢測離子。2.基質(zhì)輔助激光解吸電離質(zhì)譜技術(shù)(基質(zhì)輔助激光解吸電離質(zhì)譜技術(shù)(maldi-ms)優(yōu)點(diǎn):優(yōu)點(diǎn):(1)同esi-ms 一樣對樣品的消耗很少;(2)maldi-ms 的最高分辨率不斷提高,甚至超過esi-ms;
9、(3)有利于對復(fù)雜混合物的分析,且能忍受較高濃度的鹽、緩沖劑和其他難揮發(fā)成分,降低了對樣品預(yù)處理的要求;(4)maldi-tof 質(zhì)譜對生物大分子分子量的測定范圍是所有測試技術(shù)中最廣。缺點(diǎn):缺點(diǎn):在與高效液相色譜、毛細(xì)管電泳等分離設(shè)備的聯(lián)用時,目前只能采取離線的方式,致使分析結(jié)果的重復(fù)性較差,與maldi-ms 本身高精密度的特性不匹配。其他方法其他方法 除了以上幾種目前實驗室常用的測定方法,還有一些現(xiàn)在在實驗室一般不太使用的方法,包括粘度法,滲透壓法,輻射失活法,超速離心沉降法,光散射法等。1.1.粘度法粘度法 粘度法是指通過測定樣品溶液的粘度,從而計算樣品的的分子量的方法。一定溫度條件下,
10、高聚物稀溶液的粘度與其分子量之間呈正相關(guān)性,隨著分子量的增大,聚合物溶液的粘度增大。通過測定高聚物稀溶液粘度隨濃度的變化,即可計算出其平均分子量(粘均分子量)。如果高聚物分子的分子量愈大,則它與溶劑間的接觸表面也愈大,摩擦就大,表現(xiàn)出的特性粘度也大。特性粘度與相對分子量m之間遵循mark-houwink經(jīng)驗方程:=km。k和值與溫度、聚合物、溶劑性質(zhì)有關(guān),也和分子量大小有關(guān)。2.2.滲透壓法滲透壓法在一種理想溶液中,滲透壓與溶質(zhì)濃度成正比。但是實際上蛋白質(zhì)溶液與理想溶液有較大的偏差。滲透壓法測定蛋白質(zhì)分子量靈敏度較低,測定誤差較大,與sds-page法和凝膠色譜法等相比不常用于蛋白質(zhì)分子量的測
11、定。 rtkccrtmrcrtmcr0lim3.3.輻射失活法輻射失活法 輻射失活法無需純化和溶解蛋白質(zhì),可在原位測定其分子量。高能射線照射生物組織會產(chǎn)生電離作用,若在一定范圍內(nèi)輻射能量破壞蛋白質(zhì)分子的c-h鍵,使蛋白質(zhì)喪失功能,電離作用減少。 d:輻射能量輻射失活法作為一種獨(dú)特的蛋白質(zhì)分子量測定方法,具有獨(dú)特的優(yōu)點(diǎn),尤其是在膜蛋白研究方面,提供了一個測定膜蛋白分子量和研究其結(jié)構(gòu)的手段,但由于高能射線使用的局限性,在生化研究中不常用。dmr11104.64.4.超速離心沉降法超速離心沉降法 利用超速離心沉降法測蛋白質(zhì)的分子量是在較低轉(zhuǎn)速下進(jìn)行的(8000-20000r/min)。離心開始時,分子顆粒發(fā)生沉降,一段時間以后,沉降的結(jié)果造成了濃度梯度,因而產(chǎn)生了蛋白質(zhì)分子反向擴(kuò)散運(yùn)動,當(dāng)反向擴(kuò)散與離心沉降達(dá)到平衡時,濃度梯度就固定不變了,但是目前由于操作繁瑣,已經(jīng)不在一般實驗室使用。5.5.光散射法光散射法 主要基于染料陰離子在蛋白質(zhì)等電點(diǎn)前與肽鏈上帶正電荷的基團(tuán)上的結(jié)合作用。此時生色團(tuán)聚集于蛋白質(zhì)
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