二代測序技術(shù)在血液系統(tǒng)疾病中的應(yīng)用淺談

1、整理課件1二代測序技術(shù)二代測序技術(shù)在血液系統(tǒng)疾病中的應(yīng)用在血液系統(tǒng)疾病中的應(yīng)用整理課件2Sequencing the Human GenomeYearYearpriceprice2010199720081086422010: 10K$, a few days?2007: 4541M$, 3 months2001: Celera100M$, 3 years2001: Human Genome Project2.7G$, 11 yearsTrends in Sequencing Technology2003Sanger2008: ABI SOLiD60K$, 2 weeks2009: Illumi

2、na, Helicos40-50K$2012: 5K$,24 hrs?2015: 1K$,5% 的病例）的病例）NGS在AML中的應(yīng)用整理課件23AML基基因因圖圖譜譜Blood. 2016 January 7; 127(1): 2941. 整理課件24NGS在MDS中的應(yīng)用738 例例 MDS, MDS MPN患者患者通過通過NGS檢測了檢測了111 個癌癥相關(guān)基因，結(jié)果顯示：個癌癥相關(guān)基因，結(jié)果顯示：78% 的患者至少有的患者至少有1種致癌基因的突變種致癌基因的突變骨髓或外周血提取骨髓或外周血提取DNA沒有系統(tǒng)差異沒有系統(tǒng)差異致癌基因突變的總數(shù)越多，結(jié)果越差致癌基因突變的總數(shù)越多，結(jié)果越差

3、整理課件25髓系腫瘤突變圖譜AML, MDS, MPN, MDS/MPNMatynia et al et al. 2015. Archives of Pathology and Laboratory Medicine.整理課件26總生存率總生存率復(fù)發(fā)率復(fù)發(fā)率Ivey et al., N Engl J Med 2016;374:422-33MRD in Standard-Risk AML有MRD的患者預(yù)后差，復(fù)發(fā)率高整理課件27Ivey et al., N Engl J Med 2016;374:422-33MRD in Standard-Risk AML有MRD攜帶FLT3-ITD 的患者復(fù)發(fā)

4、率高復(fù)發(fā)復(fù)發(fā)無 FLT3-ITD mutations復(fù)發(fā)復(fù)發(fā)有FLT3-ITD mutations整理課件28Ivey et al., N Engl J Med 2016;374:422-33MRD in Standard-Risk AML有有MRD攜帶攜帶DNMT3A的患者復(fù)發(fā)率低的患者復(fù)發(fā)率低復(fù)發(fā)復(fù)發(fā)without DNMT3A mutations復(fù)發(fā)with DNMT3A mutations整理課件29NGS在T-ALL中的應(yīng)用 NGS（外顯子測序，全基因組測序或轉(zhuǎn)錄組（外顯子測序，全基因組測序或轉(zhuǎn)錄組測序）已經(jīng)鑒定出測序）已經(jīng)鑒定出T-ALL中突變的中突變的100多個多個基因。基因。

5、只有兩個基因只有兩個基因NOTCH1和和CDKN2A / 2B在超在超過過50的的T-ALL病例中突變，其余基因以病例中突變，其余基因以較低的頻率突變較低的頻率突變整理課件3063個基因的靶向測序（個基因的靶向測序（TGS）相關(guān)信號通路相關(guān)基因NOTCH信號通路NOTCH1、FBXW7NF-B信號通路MYD88、RIPK1、DDX3X、TRAF3、TRAF2、SAMHD1、BIRC3、BRAF、EGR2、IRF4、BCOR、BTK、NFKBIE、TNFAIP3、CD79B、ITPKB、CARD11、PLCG2Wnt信號通路MED12、FUBP1、MGA、MYCDNA損傷及細(xì)胞周期相關(guān)POT1、

6、ATM、CHEK2、DYRK1A、BRCC3、TP53表觀遺傳學(xué)相關(guān)HIST1H1B、HIST1H1E、DDX3X、ZMYM3、CHD2、EZH2、KMT2C、KMT2D、BAZ2A、TET2、CREBBP、EP300、ASXL1、IKZF3RNA和核糖體加工SF3B1、EWSR1、NXF1、XPO4、RPS15Others FAT1、FAT3、IGLL5、MTOR、CACNA1E、BCL6、PRDM1、BCL2、PIM1、KIT、KLHL6、CXCR4、PIK3CA、SOCS1NGS在CLL 臨床診療中的應(yīng)用整理課件31不同的panel針對不同的需求IG/TCR產(chǎn)品名稱檢測方法ALL（10種

7、）NGS檢測AML-MDS-MPN（34基因）NGS檢測MPN/MDS（25種）NGS檢測髓系-large（58種）NGS檢測AML（22種）NGS檢測ABL激酶區(qū)NGS檢測淋系-largeNGS檢測血液腫瘤（42種）NGS檢測PH-likeNGS檢測噬血細(xì)胞綜合征NGS檢測易栓癥NGS檢測整理課件32展展 望望 NGS正在為病理學(xué)和實驗醫(yī)學(xué)帶來改革正在為病理學(xué)和實驗醫(yī)學(xué)帶來改革 真正實現(xiàn)真正實現(xiàn)“個體化治療個體化治療”、“精準(zhǔn)治療精準(zhǔn)治療” 有利于進(jìn)行靶向治療有利于進(jìn)行靶向治療 費(fèi)用的快速降低，技術(shù)的持續(xù)提高費(fèi)用的快速降低，技術(shù)的持續(xù)提高 仍面臨的挑戰(zhàn)仍面臨的挑戰(zhàn) 費(fèi)用及醫(yī)保報銷政策費(fèi)用及醫(yī)保報銷政策 數(shù)據(jù)分