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1、分子診斷學(xué)重點(diǎn)內(nèi)容( Navy )1 、分子診斷學(xué)( molecular diagnostics )是利用分子生物學(xué)技術(shù)來(lái)研究機(jī)體外源性 和內(nèi)源性生物大分子和大分子體系的存在、結(jié)構(gòu)或表達(dá)調(diào)控的改變,從而為疾病的預(yù) 測(cè)、預(yù)防、診治和轉(zhuǎn)歸提供分子水平信息。2 、基因: 是一段攜帶功能產(chǎn)物(多肽,蛋白質(zhì), tRNA 和 rRNA 和某些小分子RNA )信息的 DNA 片段,是控制某種性狀的的遺傳單位。3 、密碼子偏愛(ài)( codon bias )指在不同物種的基因中經(jīng)常為某種氨基酸編碼的只是 其中的一個(gè)密碼子。當(dāng)鑒別到一個(gè) ORF 時(shí),密碼子偏愛(ài)常常用來(lái)確定這個(gè) ORF 是否 是一個(gè)基因。4 、基因組
2、( genome ): 指一個(gè)細(xì)胞或生物體的一套完整的單倍體遺傳物質(zhì)。5、C 值矛盾: 生物體的進(jìn)化程度與基因組大小之間不完全成比例的現(xiàn)象稱為C 值矛盾也稱 C 值佯謬( C value paradox )6、N 值矛盾:基因組中基因數(shù)目與生物進(jìn)化程度或復(fù)雜程度的不對(duì)稱性,稱為N 值矛盾或 N 值佯謬( N value paradox )。7 、基因組計(jì)劃 是指以獲得某物種基因組全序列為主要目標(biāo)的科學(xué)計(jì)劃。8 、厘摩爾根( cM )即重組頻率為 1% 的兩個(gè)基因間的遺傳距離9 、基因組學(xué)( Genomics )指對(duì)所有基因進(jìn)行基因組作圖(包括遺傳圖譜、物理圖 譜、轉(zhuǎn)錄圖譜)核苷酸序列分析,基因
3、定位和基因功能分析的一門科學(xué)。10 、鑒別蛋白質(zhì)編碼基因的五項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)是什么? 開(kāi)放閱讀框、密碼子偏愛(ài)、序列保守性、轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物、基因失活11 、原核生物 是細(xì)菌等原始生物的總稱,是最簡(jiǎn)單的細(xì)胞生物體12 、質(zhì)粒: 獨(dú)立于細(xì)菌細(xì)胞染色體以外,能自主復(fù)制并穩(wěn)定遺傳的共價(jià)閉合環(huán)狀DNA ( cccDNA )分子,稱為質(zhì)粒 (plasmid)13 、瓊脂糖凝膠電泳泳動(dòng)速度:超螺旋 DNA 分子 線性 DNA 分子半開(kāi)環(huán) DNA 分子14 、接合作用 (conjugation) 當(dāng)細(xì)胞與細(xì)胞、或細(xì)菌通過(guò)菌毛相互接觸時(shí),質(zhì)粒 DNA 從一個(gè)細(xì)胞(細(xì)菌)轉(zhuǎn)移至另一細(xì)胞(細(xì)菌)的 DNA 轉(zhuǎn)移稱為接合作 (conj
4、ugation) 。15 、轉(zhuǎn)化作用 (transformation) 通過(guò)自動(dòng)獲取或人為地供給外源 DNA ,使細(xì)胞或培 養(yǎng)的受體細(xì)胞獲得新的遺傳表型,稱為轉(zhuǎn)化作用 (transformation) 。16 、轉(zhuǎn)導(dǎo) : 以噬菌體為媒介把細(xì)菌的基因從一個(gè)細(xì)菌細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)菌細(xì)胞的過(guò) 程.一般是針對(duì)溫和噬菌體 , 溶血性噬菌體則不會(huì)發(fā)生轉(zhuǎn)導(dǎo) .17 、轉(zhuǎn)染: 病毒侵入宿主細(xì)胞過(guò)程 . 對(duì)原核生物說(shuō) , 轉(zhuǎn)染是噬菌體侵入細(xì)菌細(xì)胞的過(guò)程18 、轉(zhuǎn)座: 由插入序列和轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的基因移位或重排稱為轉(zhuǎn)座 (transposition) 。19 、轉(zhuǎn)座因子 可移動(dòng)的基因成分,即能在一個(gè) DNA 分子內(nèi)部
5、或兩個(gè) DNA 分子之間 移動(dòng)的 DNA 片段,稱為轉(zhuǎn)座因子 (transposable element )在細(xì)菌中,指可在質(zhì)粒和染色體之間或質(zhì)粒和質(zhì)粒之間可移動(dòng)的 DNA 片段20 、轉(zhuǎn)座因子的分類: 插入序列、轉(zhuǎn)座子、可轉(zhuǎn)座的噬菌體21 、基因轉(zhuǎn)移的方式: 接合、轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)、轉(zhuǎn)染22 、真核生物基因組的一般特征(一)基因組龐大 (二)線狀雙鏈 DNA 和二倍體 (三)非編碼區(qū)遠(yuǎn)多于編碼區(qū)(四)斷裂基因( split gene ) (五)大量重復(fù)序列存在23 、衛(wèi)星 DNA :由于這類序列的堿基組成不同于其他部份,可用等密度梯度離心法 將其與主體 DNA 分開(kāi),因而稱為衛(wèi)星 DNA (或隨體
6、 DNA )24 、中度重復(fù)序列片段較長(zhǎng)( 100- 幾千 bp) 具有種屬特異性,可作為 DNA 標(biāo)記25 、基因家族 (gene family) 一組功能相似且核苷酸序列具有同源性的基因,在進(jìn)化 過(guò)程中從一個(gè)祖先基因經(jīng)重復(fù)和突變演變而來(lái)的。26 、假基因( pseudogene )與具正常功能的基因序列相似,但無(wú)轉(zhuǎn)錄功能或轉(zhuǎn)錄產(chǎn) 物無(wú)功能的基因。27 、所有組蛋白基因都不含內(nèi)含子,而且組蛋白基因序列都很相似,從而編碼的組蛋 白在結(jié)構(gòu)上和功能上也極為相似28 、質(zhì)粒與核 DNA 區(qū)別:1. 非孟德?tīng)柕哪赶颠z傳2. 高突變率 3. 異質(zhì)性和復(fù)制分離4. 閾值效應(yīng) 5. 半自主復(fù)制與協(xié)同作用29
7、 、線粒體?。?由于線粒體呼吸鏈功能不良所導(dǎo)致的臨床表現(xiàn)多樣化的一組疾病。30 、CpG 島:大約有一半的人類基因富含 CpG 的順序,稱為 CpG 島31 、單核苷酸的多態(tài)性 ( single nucleotide polymorphism, SNP)主要用途: 疾病的連鎖分析與基因的定位 指導(dǎo)用藥和藥物設(shè)計(jì) 用于進(jìn)化和種群多樣性的研究32 、短串聯(lián)重復(fù)序列 ( short tandem repeat , STR)STR 在人類基因組內(nèi)平均 15-20kb 就有一個(gè) STR 點(diǎn)位,占基因組的 10% ,多 存在于非編碼區(qū)及內(nèi)含子中。主要用途:人類基因遺傳圖譜的制作。目的基因篩選和基因診斷。法
8、醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別和親權(quán)鑒定。33 、病毒( virus ) 是一類比較原始的、有生命特征的、能夠自我復(fù)制的、嚴(yán)格細(xì)胞內(nèi) 寄生的非細(xì)胞生物,是結(jié)構(gòu)最簡(jiǎn)單、最微小的生命形式。34 、末端正向重復(fù)序列 又稱末端冗余( terminal redundancy )是指雙鏈 DNA 分子 兩端有一段相同的核苷酸序列35 、末端反向重復(fù)序列( inverted terminal repeat,ITR )指病毒基因組兩端的反向互補(bǔ)重復(fù)序列。 ITR 可能與病毒的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄及整合有關(guān)36 、重疊基因: 許多病毒基因組的一段 DNA 序列有兩個(gè)或兩個(gè)以上的開(kāi)放讀碼框 架,可以編碼兩種或兩種以上的多肽鏈,稱為重疊基因3
9、7 、分段基因組: 指病毒基因組由數(shù)條不同的核酸分子組成,多見(jiàn)于 RNA 病毒38 、乙肝病毒( hepatitis B virus,HBV )是目前已知感染人類的最小的雙鏈 DNA病毒39 、RNA 病毒基因組為線狀單鏈或雙鏈,正鏈 RNA 病毒基因組均為線狀 RNA 分子 僅 HDV 的負(fù)鏈 RNA 病毒基因組為環(huán)狀,其余的負(fù)鏈 RNA 病毒均為線狀40 、正鏈 RNA 病毒: 基因組序列與 mRNA 相同,可直接作蛋白質(zhì)合成的模板,此類 RNA 病毒具有侵染能力41、負(fù)鏈 RNA ( -RNA )病毒: 基因組序列與 mRNA 互補(bǔ),基因組只有在其核衣殼 蛋白轉(zhuǎn)錄酶存在下,才具有侵染能力
10、42 、蛋白質(zhì)組 是指特定細(xì)胞、組織乃至機(jī)體作為一個(gè)生命單元中所擁有蛋白質(zhì)的集合 即生命體中攜帶的基因信息在某一時(shí)段所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。43 、蛋白質(zhì)組學(xué) 是指對(duì)在特定的時(shí)間和環(huán)境下所表達(dá)的群體蛋白質(zhì)研究的一門學(xué)問(wèn)。 主要在蛋白質(zhì)水平上探索蛋白質(zhì)的表達(dá)模式、作用模式、功能機(jī)制、調(diào)節(jié)控制以及蛋 白質(zhì)群體內(nèi)的相互作用。是在生物體或其細(xì)胞的整體蛋白質(zhì)水平上進(jìn)行的,并從一個(gè)機(jī)體或一個(gè)細(xì)胞的蛋白質(zhì)整體活動(dòng)來(lái)揭示生命的規(guī)律。44 、二維凝膠電泳 是目前蛋白質(zhì)組研究中最有效的分離技術(shù)。它由兩向電泳組成,第一向以蛋白質(zhì)電荷差異為基礎(chǔ)進(jìn)行分離的等電聚焦凝膠電泳,第二向是以蛋白質(zhì)分子量差異為基礎(chǔ)的 SDS- 聚丙
11、烯酰胺凝膠電泳。45、質(zhì)譜技術(shù)是樣品分子離子化后,根據(jù)不同離子間的質(zhì)量、電荷比值(質(zhì)荷比,m/z)差異來(lái)確定分子量的技術(shù)。46 、凝膠滯后實(shí)驗(yàn) 是近年來(lái)發(fā)展起來(lái)的用聚丙烯酰胺凝膠電泳直接分析核酸與蛋白質(zhì)結(jié)合的簡(jiǎn)單、快速、敏感方法。通過(guò)蛋白質(zhì)與末端標(biāo)記的核酸探針特異性結(jié)合,電泳時(shí)這種復(fù)合物較無(wú)蛋白結(jié)合的探針在凝膠中的泳動(dòng)速度要慢,即表現(xiàn)為相對(duì)滯后。47 、細(xì)胞的破碎方法機(jī)械法 :液體剪切法與固體剪切法本法不適合于染色體 DNA 的分離與純化非機(jī)械法 :干燥法與溶胞法溶胞法溫和,能保證較高的得率與較好地保持核酸的完整性而得到廣泛的應(yīng)用48 、核酸的分離與純化應(yīng)去除的污染物主要包括非核酸的大分子污染
12、物非需要的核酸分子在核酸的分離純化過(guò)程中加入的對(duì)后繼實(shí)驗(yàn)與應(yīng)用有影響的溶液與試劑49 、核酸濃縮最常用的方法 - 沉淀。其優(yōu)點(diǎn)很容易地調(diào)整核酸溶液至所需濃度,能去 除部分雜質(zhì)與某些鹽離子。50、核酸沉淀的洗滌:用 70%75%的乙醇51、 核酸濃度測(cè)定 紫外分光光度法:適用于>0.25 口 g/的核酸溶液52、熒光光度法:用溴化乙錠(EB)。靈敏度可達(dá)1ng5ng,適合低濃度核酸溶液 的定量分析。 SYBR Gold 作為一種新的超靈敏熒光染料,可檢出 <20pg 的雙鏈 DNA53 、核酸純度鑒定(1) 紫外分光光度法: A260/A280純 DNA 比值為 1.8,純 RNA
13、比值為 2.0。比值升高與降低均表示不純。比值為 1.8 的 DNA 溶液不一定為純的 DNA 溶液一般 28S RNA 的熒光強(qiáng)度約為 18S RNA 的 2 倍,否則提示有 RNA 的降解。如果在加樣槽附近有著色條帶,則說(shuō)明有 DNA 的污染。54 、核酸的保存DNA的保存 DNA溶于TE緩沖液中在-70 C可以儲(chǔ)存數(shù)年。RNA的保存 RNA可溶于0.3mol/L NaAc 溶液或雙蒸水中,在-70 C至-80 C保存。以焦碳酸二乙酯(DEPC)水溶解RNA可延長(zhǎng)保存時(shí)間。RNA沉淀溶于70%乙醇或去離 子甲酰胺液中,可在-20 C中長(zhǎng)期保存。55 、基因組 DNA 分離與純化的方法酚抽提
14、法、甲酰胺解聚法 、玻棒纏繞法、其他 DNA 快速提取法56 、裂解緩沖液中各成分的作用:EDTA :二價(jià)金屬離子螯合劑,可抑制 DNA 酶活性,并降低細(xì)胞膜的穩(wěn)定性。SDS : 陰離子去污劑,可降解細(xì)胞膜、乳化脂質(zhì)和蛋白質(zhì),并使它們沉淀,同時(shí)降解DNA 酶。無(wú) DNA 酶的 RNA 酶:可有效水解 RNA 而避免 DNA 的消化蛋白酶K :水解蛋白質(zhì),可消化 DNA酶和細(xì)胞中的蛋白質(zhì)。酚: 可使蛋白變性沉淀、抑制 DNA 酶活性。pH8.0 的 Tris 溶液: 能保證抽提后 DNA 進(jìn)入水相,而避免滯留于蛋白質(zhì)層。57 、甲酰胺是一種離子化溶劑 , 其作用:裂解蛋白質(zhì)與 DNA 的復(fù)合物、
15、使釋放的蛋白質(zhì)變性、對(duì)蛋白酶K 的活性無(wú)顯著影響58 、玻璃纏繞法得到的DNA 用途: 構(gòu)建基因組 DNA 文庫(kù)、 Southern 印跡、 PCR 擴(kuò)59 、從瓊脂糖凝膠中回收 DNA 片段DEAE 纖維素膜插片電泳法 操作簡(jiǎn)單、對(duì)小于 5kb 片段回收率好、回收 DNA 純度 高、但不能回收單鏈 DNA 、不適于大于 15kb 的 DNA 片段回收。電泳洗脫法 液氮冷凍擠壓法 低熔點(diǎn)瓊脂糖凝膠塊回收法 商品試劑盒 ( 柱層析)60 、從聚丙烯酰胺凝膠中回收 DNA 片段標(biāo)準(zhǔn)方法: 壓碎與浸泡法本法能很好地回收v 1kb的單鏈或雙鏈DNA61 、堿裂解法提取質(zhì)粒 DNA 基本原理: pH12
16、.6 高堿性條件下,染色體 DNA 和質(zhì) 粒 DNA 都變性,但質(zhì)粒 DNA 超螺旋共價(jià)閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的兩條互補(bǔ)鏈不會(huì)完全分離。當(dāng)以 pH4.8 的 KAc 高鹽緩沖液調(diào)節(jié)其 pH 至中性時(shí),變性的質(zhì)粒 DNA 又恢復(fù)到原來(lái) 構(gòu)型,保存在溶液中。 染色體 DNA 不能復(fù)性而形成纏連的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。通過(guò)離心,染 色體DNA與不穩(wěn)定的大分子 RNA、蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物等一起沉淀下來(lái)而被除去。62 、質(zhì)粒純化: CsCl-EB 等密度梯度超速離心法 (標(biāo)準(zhǔn)方法 )63 、聚乙二醇 (PEG) 沉淀法優(yōu)點(diǎn) :簡(jiǎn)單、經(jīng)濟(jì)、適用廣泛,尤其對(duì)堿裂解法提取質(zhì)粒的純化效果好.適用: 分子克隆中所有常規(guī)的酶學(xué)反應(yīng)、高
17、效的哺乳動(dòng)物細(xì)胞的轉(zhuǎn)染。缺點(diǎn): 不能有效分離帶切口的環(huán)狀質(zhì)粒 DNA 與閉環(huán)質(zhì)粒 DNA 。64、總 RNA 的分離與純化: (異)硫氰酸胍 -酚氯仿法總 RNA 提取法中最常使用的是一步法。(異)硫氰酸胍 -酚氯仿法是經(jīng)典的一步法65、同時(shí)制備 RNA 、 DNA 與蛋白質(zhì)的一步法: 是(異)硫氰酸胍 -酚氯仿一步法的改進(jìn) 方法。 (異)硫氰酸胍 -酚的單相裂解試劑裂解細(xì)胞,再加入氯仿后形成兩相。變性的DNA 與蛋白質(zhì)位于兩相的界面。上層水相 -RNA :通過(guò)異丙醇沉淀與 75%乙醇洗滌 而獲得。可用于 mRNA 的純化、 Northern 雜交、逆轉(zhuǎn)錄和 RT-PCR 反應(yīng)等。處于界 面的
18、 DNA 與蛋白質(zhì)可通過(guò)乙醇和異丙醇分級(jí)沉淀出來(lái)。制備的 DNA: 作 PCR 反應(yīng)模 板,蛋白質(zhì)樣品 : 主要用于免疫印跡。66 、DNA 重組( DNA recombination)不同來(lái)源的 DNA 分子,通過(guò)磷酸二酯鍵連接而重新組合的過(guò)程67 、重組 DNA :在體外用限制性內(nèi)切酶 ,將不同來(lái)源的 DNA 分子進(jìn)行特異地切割, 獲得的目的基因或 DNA 片段與載體重新連接,從而組成一個(gè)新的 DNA 分子。68 、克隆( clone )由一個(gè)細(xì)胞經(jīng)過(guò)無(wú)性繁殖以后形成的子代群體。69 、DNA 分子克?。?構(gòu)建 DNA 重組體并導(dǎo)入宿主細(xì)胞建立無(wú)性繁殖體系70 、基因克隆: 重組的 DNA
19、 分子能夠通過(guò)一定的方式進(jìn)入相應(yīng)的宿主細(xì)胞,在宿主 細(xì)胞中進(jìn)行無(wú)性增殖,獲得大量的目的基因或 DNA 片段的過(guò)程。71 、限制性內(nèi)切酶: 一類核酸水解酶,能識(shí)別和切割雙鏈 DNA 分子中的特定核苷酸 序列, 識(shí)別序列一般具雙重對(duì)稱性 (回文結(jié)構(gòu)) .72 、限制性內(nèi)切酶的主要用途: 改造和組建質(zhì)粒組建基因組 DNA 物理圖譜基因組DNA同源性研究 DNA重組克隆及亞克隆DNA雜交與序列分析73 、DNA 連接酶 (DNA ligase) 基因工程的縫紉針催化雙鏈DNA 一端的3 -OH與另一雙鏈DNA5 '端的磷酸根形成3 ','磷酸二酯 鍵,使具有相同粘末端或平端的D
20、NA末端連接起來(lái)。T4噬菌體DNA連接酶-常用大腸桿菌 DNA 連接酶 少用74、 堿性磷酸酶:催化DNA , RNA以及核糖和脫氧核糖三磷酸上的5 '磷酸基團(tuán)水 解。75、載體(Vector)攜帶靶DNA片段進(jìn)入宿主細(xì)胞進(jìn)行擴(kuò)增和表達(dá)的運(yùn)載工具。76 、載體具備的條件 宿主細(xì)胞中有自主復(fù)制能力或能整合到宿主染色體上與基因組一同復(fù)制的能力; 有合適的限制性酶切位點(diǎn)供外源DNA 片段插入 分子量不宜過(guò)大,便于容納較大的外源DNA片段并獲得較高的拷貝數(shù),也利于體外重組操作; 具有合適的篩選標(biāo)記,如抗藥性、酶基因、營(yíng)養(yǎng)缺陷型或形成噬菌斑的能力等; 配備與宿主相適應(yīng)的調(diào)控元件,如啟動(dòng)子、增強(qiáng)子
21、和前導(dǎo)序列等。77 、用作克隆載體的理想質(zhì)粒一般具備的特點(diǎn):具有松馳型復(fù)制子;復(fù)制子外存在多克隆位點(diǎn);具有插入失活的篩選標(biāo)記,如 Ampr和Tetr ;分子量相對(duì)較小但有較高的拷貝 數(shù)。78 、噬菌體( Bacteriophage , phage )是一類細(xì)菌病毒的總稱,即感染細(xì)菌的病 毒。噬菌體嚴(yán)格依賴于細(xì)菌宿主細(xì)胞生長(zhǎng)與繁殖,一旦脫離宿主細(xì)胞,盡管可以生存 但不能生長(zhǎng)與復(fù)制。79 、噬菌粒( phagemid )是一類由質(zhì)粒與單鏈?zhǔn)删w結(jié)合而成的載體。常用的噬菌 粒有 pUC118 /pUC119 和 pTZ19U80、黏粒(cosmid )又稱柯斯質(zhì)粒,是一種以入噬菌體為基礎(chǔ),專門為克隆
22、大片段而 設(shè)計(jì)、并和質(zhì)粒共同構(gòu)建的雜合載體。黏粒載體具有質(zhì)粒和噬菌體載體的雙重特性; 具有高容量的克隆能力(3145kb );具有與同源序列質(zhì)粒進(jìn)行重組的能力。黏粒主 要同于真核細(xì)胞基因組文庫(kù)的構(gòu)建。81、構(gòu)建基因組文庫(kù)多用入噬菌體和黏性質(zhì)粒作為載體;構(gòu)建 CDNA文庫(kù)和克隆較小 DNA 片段常用 pUC 系列質(zhì)粒; M13 噬菌體則用于克隆一些待測(cè)的 DNA 序列。82 、轉(zhuǎn)化作用 (transformation) 將重組的 DNA 分子引入細(xì)菌 (原核細(xì)胞 ),使其在細(xì)菌 體內(nèi)擴(kuò)增及表達(dá)的過(guò)程83 、轉(zhuǎn)染作用 (transfection) 將噬菌體、病毒或以它們?yōu)檩d體構(gòu)建的 DNA 重組體
23、導(dǎo) 入真核細(xì)胞的過(guò)程84、在生長(zhǎng)過(guò)程中只有某一階段的細(xì)菌才能成為轉(zhuǎn)化的接受體,這稱為 感受態(tài) (competent) 細(xì)菌 。細(xì)菌的感受態(tài)可誘導(dǎo)產(chǎn)生,如氯化鈣法就可誘導(dǎo)細(xì)菌成為感受 態(tài)。感受態(tài)細(xì)菌表面其正電荷增加,細(xì)胞壁和膜通透性增加,有利于DNA 分子吸附與吸收 .85 、 PCR 技術(shù)的基本原理: 在合適的緩沖體系中 ,通過(guò)加熱使模板 DNA 雙鏈中的氫鍵斷裂形成單鏈,這個(gè)過(guò)程稱為變性。在合適的溫度條件下,特異性引物與模板DNA根據(jù)堿基互補(bǔ)的原則形成雙鏈,這個(gè)過(guò)程稱為退火。在 DNA 聚合酶的作用下,引物 延伸,形成新的 DNA 鏈。如此循環(huán)往復(fù),經(jīng)過(guò)多個(gè)循環(huán)后,模板 DNA 在 2 個(gè)特
24、異性 引物之間的序列就會(huì)大量擴(kuò)增。86 、 PCR 技術(shù)的特點(diǎn): 高度的靈敏性、特異性、操作簡(jiǎn)便易行、用途廣泛87 、PCR 反應(yīng)體系的影響因素 :DNA 模板、引物、 Taq DNA 聚合酶、 dNTP 、緩沖 液、熱循環(huán)參數(shù)88 、PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)和分析:Gel electrophoresis 、 Restriction endonuclease、Single strand conformationpolymorphism(SSCP)、 Nucleic acid sequence 、 Molecular hybridization89、熒光定量PCR :通過(guò)熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性
25、的探針 ,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記 跟蹤 ,實(shí)時(shí)在線監(jiān)控反應(yīng)過(guò)程 ,結(jié)合相應(yīng)的軟件可以對(duì)結(jié)果進(jìn)行分析 ,計(jì)算待測(cè)樣品的初始 模板量90 、基線: 是擴(kuò)張曲線的水平部分91 、 CT 值: 從基線到指數(shù)增長(zhǎng)期的拐點(diǎn)所對(duì)應(yīng)的循環(huán)次數(shù)92 、絕對(duì)定量: 用于確定未知樣品中某個(gè)核酸序列的絕對(duì)量值,即通常說(shuō)的拷貝數(shù)。93 、相對(duì)定量: 用于測(cè)定一個(gè)測(cè)試樣本中目標(biāo)核酸序列與校正樣本中同一序列表達(dá)的 相對(duì)變化94 、熒光定量實(shí)時(shí) PCR 與普通 PCR 的比較實(shí)時(shí)在線監(jiān)控 :對(duì)樣品擴(kuò)增的整個(gè)過(guò)程進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)控,能夠?qū)崟r(shí)地觀察到產(chǎn)物的增加 ,直觀地看到反應(yīng)的對(duì)數(shù)期降低反應(yīng)的非特異性:使用引物和熒光探針同時(shí)與模板特異
26、性結(jié)合,提高了 PCR 反應(yīng)的特異性增加定量的精確性:全程監(jiān)控 ,準(zhǔn)確的算法進(jìn)行定量結(jié)果分析更加快捷方便 ,無(wú)需跑膠95、 PCR-ASO檢測(cè)基因點(diǎn)突變:是利用PCR技術(shù)擴(kuò)增靶基因的適當(dāng)片段 ,然后用人工 合成的含突變位點(diǎn)的標(biāo)記寡核苷酸探針雜交96、 臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室衛(wèi)生部批準(zhǔn)項(xiàng)目:二級(jí)醫(yī)院以上 HBV 、 HCV、 TB、 CT、 HIV 、 HLA97、 標(biāo)準(zhǔn)臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室必須包括四個(gè)工作區(qū)域(working zones) :試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū) 標(biāo)本制備區(qū) 擴(kuò)增反應(yīng)區(qū) 產(chǎn)物分析區(qū) 四區(qū)須互相獨(dú)立,并嚴(yán)格按照上述順序設(shè)置,并遵循單一走向的工作區(qū)域。98 、環(huán)境污染處理 (Cont
27、amination around circumstances)稀酸或消毒液處理法、紫外線照射法99、反應(yīng)液污染的處理: 在PCR反應(yīng)液(不含Taq DNA 聚合酶和模板)中加入0.5uDNase I 或核酸內(nèi)切酶(如 10u 的 Msp I ),室溫下 30-60 分鐘。加熱滅活DNase I 或核酸內(nèi)切酶,再加入 Taq DNA 聚合酶和模板做 PCR100 、 變性( denaturation )在一定的條件下,雙螺旋之間氫鍵斷裂,雙螺旋解開(kāi), 形成無(wú)規(guī)則線團(tuán),雙鏈解鏈成為單鏈。101 、 變性核酸的特點(diǎn): 粘度下降、沉降速度增加、浮力上升、紫外吸收增加102、融解溫度(Tm)在DNA熱變
28、性時(shí),其A260的升高達(dá)最大值一半時(shí)的溫度103 、 影響 Tm 的因素: DNA 堿基的組成、溶液的離子強(qiáng)度、 pH 值、變性劑104 、 復(fù)性: 變性 DNA 經(jīng)過(guò)一定處理重新形成雙螺旋的過(guò)程。105 、 影響復(fù)性速度的因素: DNA 濃度、 DNA 片段的大小、 DNA 片段復(fù)雜性、合適的復(fù)性溫度、適當(dāng)?shù)碾x子強(qiáng)度106 、 雜交: 兩條來(lái)源不同,但具有互補(bǔ)序列的核酸,按堿基配對(duì)原則復(fù)性形成一個(gè) 雜交體,這個(gè)過(guò)程即雜交,或稱分子雜交。107 、 探針( probe ) 指能與特定靶分子發(fā)生特異性相互作用,并能被特殊方法所檢測(cè) 的分子。108 、 基因探針: 指能與特定核苷酸序列發(fā)生特異互補(bǔ)
29、雜交,雜交后又能被特殊方法 檢測(cè)的已知被標(biāo)記(同位素或非同位素標(biāo)記)的核苷酸鏈。109 、各類探針特點(diǎn):基因組DNA探針:無(wú)性繁殖、制備方法簡(jiǎn)單;不易降解(與 RNA比較);標(biāo) 記方法成熟。cDNA 探針 (complementary DNA ):不含內(nèi)含子及高度重復(fù)序列但不易獲得RNA 探針: 雜交效率高,穩(wěn)定性高,非特異性,雜交較少,未雜交探針可用 RNase降解,減少本底的干擾。易降解,標(biāo)記方法復(fù)雜寡核苷酸探針:可根據(jù)需要合成相應(yīng)序列;探針短,序列復(fù)雜性低,分子量小,因此雜交時(shí)間短 ; 長(zhǎng) 度只有 1050bp ,該識(shí)別序列內(nèi) 1 個(gè)堿基的變化可明顯降低雜交Tm值??纱罅亢铣桑瑑r(jià)格低,能
30、夠用酶學(xué)或化學(xué)方法進(jìn)行非放射性標(biāo)記。110 、理想的探針標(biāo)記物應(yīng)具備:高度的敏感性標(biāo)記物與探針結(jié)合后,不影響雜交時(shí)堿基配對(duì)及探針?lè)肿拥闹饕砘再|(zhì);檢測(cè)方法除有高靈敏性、高特異性、假陽(yáng)性綠低外,尚需考慮環(huán)境污染 少,價(jià)格低;若用酶促方法標(biāo)記,應(yīng)對(duì)酶的Km值影響不大,以保證標(biāo)記反應(yīng)的效率和標(biāo)記產(chǎn)物的比活性。111 、放射性核素標(biāo)志物優(yōu)點(diǎn):可準(zhǔn)確定量,靈敏度高可檢測(cè)固相介質(zhì)上 10fg(10-15g) 的 DNA ;本底低,易 除去舊探針重新雜交新探針;特異性高 , 對(duì)雜交無(wú)影響缺點(diǎn):短半衰期的探針要求臨時(shí)制備 , 隨用隨標(biāo)、放射性遞減使探針降解、放射性對(duì)人 體有害 ,需防護(hù)、費(fèi)用貴112 、非放
31、射性標(biāo)記 優(yōu)點(diǎn):無(wú)放射性,對(duì)人體的危害??;探針性質(zhì)穩(wěn)定,可供長(zhǎng)時(shí)間內(nèi)持續(xù)使用;檢測(cè)過(guò) 程快,可同時(shí)進(jìn)行不同標(biāo)記探針的雜交;本底較低缺點(diǎn):靈敏度和特異性不如放射性探針,雜交條件受到報(bào)告基團(tuán)的限制,重新雜交新 探針較困難113、 直接放射自顯影: 在暗室中將含放射性的濾膜與 X 線膠片緊密的貼在一起,放 入不透光的盒子 .114 、 間接放射自顯影 為增加 32P 檢測(cè)敏感性, X 線膠片被夾在增感屏和濾膜之 間,增感屏是一種有彈性的塑料片,由閃爍物如鎢酸鈣覆蓋,這種物質(zhì)在受到激發(fā)時(shí) 可發(fā)光 .115、 化學(xué)發(fā)光 是指化學(xué)反應(yīng)中釋放的能量以光的形式發(fā)射出來(lái)116 、 液相雜交: 一種研究最早且操作
32、簡(jiǎn)便的雜交類型,應(yīng)用較少117 、 Southern 印跡雜交: 是一種使凝膠中的 DNA 轉(zhuǎn)移到載體膜上的方法。118、Northern 印跡雜交:將RNA樣品變性和通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行分離,再轉(zhuǎn) 移到 NC 膜等固相載體上,用標(biāo)記的 DNA 或 RNA 特異探針對(duì)固定在膜上的 RNA 進(jìn) 行雜交。119 、 Southern 印跡雜交與 Northern 印跡雜交的異同:同:基本原理異:變性方法(N:聚乙二醛、二甲亞砜、甲醛、甲基氫氧化汞;S:堿變性)120、點(diǎn)雜交(dot blot)/狹縫雜交(slot blot):將少量 RNA樣品點(diǎn)在 Dot和Slot雜交濾器中的 NC 膜上,濾膜
33、干燥后用 32P 標(biāo)記的 RNA 或 DNA 探針進(jìn)行雜交和用 X 線片進(jìn)行放射性自顯影。較 Northern blot 省去了電泳和毛細(xì)轉(zhuǎn)膜過(guò)程121 、 點(diǎn)/狹縫雜交方法學(xué)評(píng)價(jià): 僅需少量樣品、不需電泳與轉(zhuǎn)膜過(guò)程,方法快捷、適 用于同時(shí)分析多個(gè)樣品,方便雜交條件的摸索。不能檢出基因的大小或重復(fù)的程度。 本法是快速確定目標(biāo)基因是否存在的檢測(cè)方法。122 、 原位雜交( in situ hybridization )應(yīng)用核酸探針與組織或細(xì)胞中的核酸按堿 基配對(duì)原則進(jìn)行特異性結(jié)合形成雜交體,然后應(yīng)用組織化學(xué)或免疫組織化學(xué)方法在顯 微鏡下進(jìn)行細(xì)胞內(nèi)定位或基因表達(dá)的檢測(cè)技術(shù)。123、 生物芯片: 將
34、大量生物分子探針( DNA 、蛋白質(zhì))固定于支持物上后與帶熒光 標(biāo)記的 DNA 樣品分子進(jìn)行雜交,通過(guò)檢測(cè)每個(gè)探針?lè)肿拥碾s交信號(hào)強(qiáng)度進(jìn)而獲取樣 品分子的數(shù)量和序列信息。124 、 1992 對(duì)原位合成制備的 DNA 芯片作了首次報(bào)道,這是世界上第一塊基因芯 片。 1 996 年創(chuàng)造了世界上第一塊商業(yè)化的生物芯片。125 、 生物芯片的特點(diǎn): 高通量、集成化、并行化、微型化126 、生物芯片可以分為哪些?微陣列芯片 microarray : 基于生物分子間的親和作用基因芯片( cDNA 或寡核苷酸);蛋白質(zhì)芯片; 細(xì)胞芯片;組織芯片;微流體芯片 microfluid : 基于各種微結(jié)構(gòu)毛細(xì)管電泳
35、芯片; PCR 反應(yīng)芯片;介電電泳芯片微縮芯片實(shí)驗(yàn)室 lab-on-a-chip127、基因芯片(gene chip) 又稱 DNA 芯片(DNA chip) 或 DNA 微陣列(DNA microarray) 。將大量的基因片段有序地、高密度地排列在玻璃片或纖維膜等載體上,稱之為 基因芯片。128 、 基因芯片技術(shù)步驟: 芯片制備、樣品制備、雜交反應(yīng)、信號(hào)檢測(cè)、結(jié)果分析。129 、 探針在載體表面的固定方法:原位合成(即在支持物表面原位合成寡核苷酸探針),適用于寡核苷酸;合成后點(diǎn)樣,多用于大片段 DNA ,有時(shí)也用于寡核苷酸,甚 至 mRNA 。130 、雜交反應(yīng) 是熒光標(biāo)記的樣品與芯片上的
36、探針進(jìn)行的反應(yīng)產(chǎn)生一系列信息的過(guò) 程。131 、 蛋白質(zhì)芯片( protein chip ),又稱蛋白質(zhì)微陣列 (protein microarray) ,是用 于蛋白質(zhì)功能研究及相互作用分析的生物芯片,采用原位合成、機(jī)械點(diǎn)樣或共價(jià)結(jié)合 的等方法將多肽、蛋白、酶、抗原、抗體固定于硅片、玻璃片、塑料片、凝膠、尼龍 膜等固相介質(zhì)上形成的生物分子點(diǎn)陣。132 、蛋白芯片的原理: 在待分析樣品中的生物分子與蛋白質(zhì)芯片的探針?lè)肿影l(fā)生雜 交或相互作用后,利用激光共聚焦顯微掃描儀對(duì)雜交信號(hào)進(jìn)行高通量檢測(cè)和分析,從 而實(shí)現(xiàn)對(duì)多肽、蛋白質(zhì)及其他生物成份進(jìn)行高通量檢測(cè)。133 、芯片實(shí)驗(yàn)室 是將樣品制備、生化反應(yīng)
37、和檢測(cè)分析的全過(guò)程集約化,并縮微到一張芯片上自動(dòng)完成,形成的所謂微型全分析系統(tǒng)(micro total an alysis syste n,(i-TAS),或稱“縮微芯片實(shí)驗(yàn)室” (lab-on-a-chip )。134、縮微芯片實(shí)驗(yàn)室特點(diǎn): 分析全過(guò)程自動(dòng)化、生產(chǎn)成本低、防污染、分析速度 快、所需樣品少、極高的樣品并行處理能力、體積小、重量輕、便于攜帶。135 、復(fù)雜性疾?。?發(fā)病原因不完全明了,由多個(gè)基因和環(huán)境因素共同參與,不符合 孟德?tīng)栠z傳規(guī)律,不僅在特定家系發(fā)病率高,而且對(duì)群體影響大,經(jīng)過(guò)多個(gè)階段才出 現(xiàn),當(dāng)出現(xiàn)典型臨床表現(xiàn)時(shí)往往已處于病程中后期,多數(shù)已失去最佳治療時(shí)期,此類 疾病成為
38、 。136 、分子診斷: 以 DNA 和 RNA 為主要診斷材料,通過(guò)檢測(cè)基因的結(jié)構(gòu)或表達(dá)功能 的異常,對(duì)人體狀態(tài)和疾病作出診斷的方法和過(guò)程。137 、復(fù)雜性疾病分子診斷的特點(diǎn)直接檢測(cè)疾病相關(guān)基因,屬病因診斷,針對(duì)性強(qiáng)特異性強(qiáng)、靈敏度高:分子雜交、PCR、生物芯片、質(zhì)譜等技術(shù)適用范圍廣:遺傳疾病、腫瘤、感染、心血管等疾病138、 血漿 DNA (plasma DNA ) 又稱循環(huán) DNA ( circulating DNA ) ,是一種無(wú)細(xì) 胞狀態(tài)的細(xì)胞外 DNA (extra cellular DNA) ,由長(zhǎng)度不等的單鏈或雙鏈 DNA 及其混 合物組成,主要以 DNA- 蛋白質(zhì)混合物形式存
39、在,但也存在部分游離 DNA 。139 、 斑點(diǎn)雜交 :將待測(cè)的 DNA 變性后點(diǎn)加在硝酸纖維素膜(或尼龍膜)上,用已標(biāo) 記的探針進(jìn)行雜交,洗膜 (除去未接合的探針 ),放射自顯影,判斷是否有雜交及其雜交 強(qiáng)度,主要用于基因缺失或拷貝數(shù)改變的檢測(cè)。140 、 ASO 為一種以雜交為基礎(chǔ)對(duì)已知突變的檢測(cè)技術(shù)。設(shè)計(jì)一段 19bp 左右的寡核 苷酸片段,其中包含了發(fā)生突變的部位,經(jīng)標(biāo)記后作為探針,與固定在膜上的樣品 DNA 雜交。同時(shí)以野生型探針(無(wú)突變)為對(duì)照,如出現(xiàn)陽(yáng)性雜交帶,則表明樣品中 存在與該 ASO 探針相應(yīng)的點(diǎn)突變。用于已知突變類型的遺傳病,如地中海貧血、苯丙 酮尿癥、某些癌基因、抑癌
40、基因點(diǎn)突變。141 、PCR-SSCP ,利用 PCR 從提取出的 DNA 中擴(kuò)增目標(biāo)基因,用外切核酸酶消化 掉一條鏈,相同長(zhǎng)度的單鏈 DNA 因序列,甚至單個(gè)堿基不同,所形成的構(gòu)象不同, 在非變性凝膠中的遷移率不同,標(biāo)記后可顯影觀察。用于點(diǎn)突變的遺傳疾病,苯丙酮 尿癥、某些癌基因、抑癌基因點(diǎn)突變。142 、RFLP ,檢測(cè) DNA 在限制性內(nèi)切酶酶切后形成的特定 DNA 片段的大小。凡是 可以引起酶切位點(diǎn)變異的突變?nèi)琰c(diǎn)突變(新產(chǎn)生和去除酶切位點(diǎn))和一段 DNA 的重新組織(如插入和缺失造成酶切位點(diǎn)間的長(zhǎng)度發(fā)生變化)等均可導(dǎo)致RFLP 的產(chǎn)生。143 、簡(jiǎn)述腫瘤的發(fā)病機(jī)制?階梯式遺傳性疾病、基
41、因變異 、表觀遺傳學(xué)改變 、DNA 損傷及其分子改變腫瘤基因組的不穩(wěn)定性 、腫瘤中染色體的異常 、腫瘤中的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性144 、癌基因分類: 生長(zhǎng)因子類;酪氨酸激酶類; GTP 結(jié)合蛋白類;核蛋白類;端粒 酶。145 、癌基因的活化機(jī)制: 轉(zhuǎn)導(dǎo);點(diǎn)突變;插入突變;易位;基因擴(kuò)增;基因甲基化 改變。146 、 常見(jiàn)的抑癌基因: Rb 基因; p53 基因; APC 基因147 、腫瘤分子診斷需考慮的因素: 特殊類型腫瘤的靶基因 不同腫瘤特定靶基因 的突變譜 供檢測(cè)使用的合適臨床樣本 分子診斷技術(shù)的敏感性148 、肺癌相關(guān)基因改變: 基因點(diǎn)突變檢測(cè): K-ras 基因和 p53 基因抑癌基因啟動(dòng)
42、子甲基化檢測(cè): APC 基因149 、目前最常用的甲基化檢測(cè)技術(shù): 甲基化特異性引物基因擴(kuò)增( MSP)甲基化特異性序列分析( MSS )150 、 結(jié)腸直腸癌早期分子診斷: 癌基因 K-ras 和抑癌基因 APC 的突變發(fā)生在早期。糞便中 K-ras 突變檢測(cè),但糞便中 K-ras 突變并非全是腸源性。 CD44 與結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移 有關(guān)。151、乳腺癌早期分子診斷:90%家族性乳腺癌涉及 BRCA1和BRCA2基因突變。152 、 原發(fā)胰腺癌早期分子診斷: p53 和 CD44153、 胰腺癌早期分子診斷 : 72 % -100% 的原發(fā)性胰腺腺癌發(fā)生 K-ras 基因突變154 、 腫瘤微小殘
43、留?。?腫瘤患者原發(fā)病灶去除后,體內(nèi)仍存在來(lái)自原發(fā)病灶的腫瘤 細(xì)胞,以單個(gè)腫瘤細(xì)胞或肉眼不可見(jiàn)細(xì)胞集落的形式存于腫瘤患者血液或組織中。微 小殘留病是腫瘤復(fù)發(fā)的根本原因,其分子診斷對(duì)病人的治療和預(yù)后具有重要意義。155 、 原發(fā)性高血壓的定義: 又稱高血壓病,是指收縮壓或舒張壓升高臨床綜合征。(1)確診高血壓 指收縮壓160mmHg 和/或舒張壓95mmHg ,兩者有一項(xiàng)經(jīng)核實(shí) 即可確診。 臨界高血壓 指收縮壓140mmHg 但v 160mmHg 和(或)舒張壓90mmHg 但v 95mmHg 。156、 原發(fā)性高血壓的分子遺傳:腎素基因、血管緊張素原基因、血管緊張素轉(zhuǎn)化酶(ACE )基因、心鈉
44、素基因157、 HLA class Ian tige ns (A, B & C)將內(nèi)源性多肽遞呈給 CD8陽(yáng)性毒性T細(xì) 胞。158、 HLA class II antigens將外源性抗原肽遞呈給 CD4陽(yáng)性T細(xì)胞159 、 HLA 的遺傳特點(diǎn): 單倍型遺傳、共顯性遺傳、連鎖不平衡160 、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性 (RFLP) 是最早應(yīng)用于 HLA 基因分型的方法。161 、序列特異性寡核苷酸探針技術(shù) (SSOP) 根據(jù)固定在雜交膜上的是 PCR 產(chǎn)物或特異 性探針而將其區(qū)分為正向 SSOP和反向SSOP。反向雜交技術(shù)是將一套設(shè)計(jì)合理的探 針固定于雜交膜上,再與擴(kuò)增產(chǎn)物雜交,因其一次雜交即可檢測(cè)所有等位基因,大大 簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)操作,從而被多數(shù)實(shí)驗(yàn)室接受。162、PCR-序列特異性引物(SSP)用作臨床常規(guī)分型方法163 、 FCM 技術(shù)可定性也可定量,而且特異、敏感、快速,同其它檢測(cè)技術(shù)比較,其 最獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)是可幾秒鐘內(nèi)同時(shí)檢測(cè)上千個(gè)細(xì)胞,因而該技術(shù)更多地應(yīng)用于批量測(cè) 量。而且流式細(xì)胞術(shù) 無(wú)假陰性和假陽(yáng)性 出現(xiàn),因此該技術(shù)具有廣闊的應(yīng)用前景。164、以堿基序列為基礎(chǔ)的 HLA分型(SBT)直接對(duì)HLA的DNA序列進(jìn)行分析比檢測(cè) 其表型更加直觀、可靠、準(zhǔn)確。是鑒定 HLA 等位基因的
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