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文檔簡(jiǎn)介
1、海南省漢、黎族人群缺失型-地中海貧血的研究 關(guān)鍵詞:地中海貧血;聚合酶鏈反應(yīng)(PCR);少數(shù)民族;海南省 摘要:目的 研究海南省漢、黎族人群中東南亞型缺失(- SEA )、右側(cè)缺失(- 3.7 )和左側(cè)缺失(- 4.2 )三種-地中海貧血缺失突變的攜帶率、基因頻率及基因型的分布特點(diǎn)。 方法 應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)技術(shù)直接篩查海南省漢、黎族人群中的東南亞型缺失(- SEA )、右側(cè)缺失(- 3.7 )和左側(cè)
2、缺失(- 4.2 )三種-地中海貧血缺失突變。 結(jié)果 在197例海南漢族人中檢出25例-地中海貧血攜帶者,攜帶率為12.69%;三種-地中海貧血缺失突變的基因頻率為0.0635,其中- SEA 、- 3.7 和- 4.2 的基因頻率分別為0.0127、0.0305、0.0203,共發(fā)現(xiàn)- SEA /、- 3.7 /和- 4.2 /三種基因型,其中- SEA /5例,- 3.7 /12例,-
3、0;4.2 /8例。在201例海南黎族人中檢出114例-地中海貧血攜帶者,攜帶率為56.72%,三種-地中海貧血缺失突變的基因頻率為0.3607,其中- SEA 、- 3.7 和- 4.2 的基因頻率分別為0.3607、0.0075、0.1891,共發(fā)現(xiàn)- SEA /、- 3.7 /、- 3.7 /- 3.7 、- 3.7 /- 4.2 、- 4.2 /、和- 4.2
4、;/- 4.2 六種基因型,其中- SEA /3例,- 3.7 /39例,- 3.7 /- 3.7 6例,- 3.7 /- 4.2 18例,- 4.2 /38例,- 4.2 /- 4.2 10例。 結(jié)論 海南省漢、黎族人群是-地中海貧血的高發(fā)群體。 關(guān)鍵詞:地中海貧血;聚合酶鏈反應(yīng)(PCR);少數(shù)民族;海南省
5、60; Investigation into the deletion types of-thalassemia in Han and LI Nationalities in Hainan Province. Abstract:Objective To investigate the incidences、the allelic frequencies and t
6、he genotypes frequencies of three-tha-lassemia deletion types(- SEA 、- 3.7 、- 4.2 )and their distributions in Han and Li nationalities in Hainan Province. Methods Three-thalassemia
7、 deletion types,i.e Southeast Asia deletion(- SEA ),right deletion(- 3.7 )and left deletion(- 4.2 ),were screened based on polymerase chain reaction(PCR)in Han and Li nationalities
8、 in Hainan. Results 25carriers were detected in197Han individuals,and the incidence of carriers was12.69%.The gene frequency of these three deletion types was0.0127,0.0305and0.0203respectively,to
9、tally0.0635in Han nationality in Hainan.Three genotypes of5(- SEA /)cases,12(- 3.7 /)cases and8(- 4.2 /)cases were detected.On the contrary,114carriers were detected from201individuals in Li
10、 nationality,and the incidence of carriers was56.72%.The gene frequency of these three deletion types was0.0075,01716and0.1891respec-tively,totally0.3607in Li nationality.Six genotypes were detected i
11、ncluding3(- SEA /)cases,39(- 3.7 /)cases,6(- 3.7 /- 3.7 )cases,18(- 3.7 /- 4.2 )cases,38(- 4.2 /)cases and10(- 4.2 /- 4.2 )cases. Conclusion There is a high incidence of-
12、thalassemia in Han and Li nationalities in Hainan province. Key words:Thalassemia;Polymerase chain reaction(PCR);Minority nationality;Hainan Province -地中海貧血(-地貧)是一種嚴(yán)重危
13、害人類健康的遺傳病,其主要特征是-珠蛋白鏈合成減少( + 地貧)或缺如( 0 地貧)。-地貧分子缺陷有基因的大片段缺失和非缺失突變兩大類 1 ,-珠蛋白基因缺失是導(dǎo)致-地貧的主要原因。目前全世界已發(fā)現(xiàn)了35種-珠蛋白基因缺失突變,在中國人中已發(fā)現(xiàn)7種,其中東南亞型缺失突變(- SEA )、右側(cè)缺失型突變(- 3.7 )和左側(cè)缺失型突變(- 4.2 )三種突變類型是我國南方最常見的缺失類型 24 。為了研究海南省漢、黎族人群中-地中海貧血的發(fā)病率及其基因型的
14、分布特點(diǎn),我們應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)技術(shù)直接篩查197例海南漢族人和201例海南黎族人中的東南亞型缺失、右側(cè)缺失和左側(cè)缺失這三種最常見的缺失型-地貧突變類型,現(xiàn)將結(jié)果報(bào)告如下。 1 材料與方法 1.1 DNA樣品 用EDTA抗凝,采取海南省白沙、昌江、陵水、瓊中、保亭等縣正常體檢、兵檢和中小學(xué)生黎族人末梢血;采取海南省文昌市正常體檢、兵檢的海南籍漢族人群末梢血,按Lahiri等方法 5 提取DNA,陽性對(duì)照標(biāo)本由南方醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)遺
15、傳學(xué)教研室徐湘民教授惠贈(zèng)。 1.2 PCR擴(kuò)增 東南亞型缺失突變分析按文獻(xiàn) 6 進(jìn)行;右側(cè)缺失型突變和左側(cè)缺失型突變分析參照Amold S.-C.Tan 7 等報(bào)道合成引物。擴(kuò)增- SEA 、- 3.7 和- 4.2 的多重PCR體系均采用TaKaRa LA Taq TMJ 及緩沖液(寶生物工程有限公司產(chǎn)品),PCR反應(yīng)體積為25l,在PCR緩沖液(1×G
16、C Buffer,2.5mmol/L MgCl 2 )中含模板DNA0.2g,引物0.20.5mol/L,dNTP為200mol/L,1U Taq DNA聚合酶,循環(huán)參數(shù)為99變性5min,85加酶,56退火1min,72延伸2min,然后951min,561min,722min,30個(gè)循環(huán)后72延伸7min。擴(kuò)增產(chǎn)物在1%瓊脂糖凝膠中電泳,經(jīng)EB染色在紫外光燈下觀察結(jié)果并照相。 2 結(jié)果 2.1 - SEA 、- 3.7 和
17、- 4.2 缺失型突變的多重PCR擴(kuò)增 在PCR反應(yīng)體系中同時(shí)擴(kuò)增了2基因的一個(gè)1800bp的片段,用以判斷樣品DNA的2基因是否缺失,從而判斷-地中海貧血突變患者是雜合子還是純合子。無- SEA 、- 3.7 和- 4.2 缺失型突變的正常人DNA樣品經(jīng)PCR擴(kuò)增后只出現(xiàn)一條1800bp的2基因擴(kuò)增片段;東南亞缺失型雜合子(- SEA /)的DNA樣品經(jīng)PCR擴(kuò)增后除出現(xiàn)一條1800bp的2基因擴(kuò)增片段外,還出現(xiàn)一條740bp的特異擴(kuò)增片段;右側(cè)缺失型雜合子(- 3.7
18、160;/)的DNA樣品經(jīng)PCR擴(kuò)增后除出現(xiàn)一條1800bp的2基因擴(kuò)增片段外,還出現(xiàn)一條2022bp的特異擴(kuò)增片段;右側(cè)缺失型純合子(- 3.7 /- 3.7 )的DNA樣品經(jīng)PCR擴(kuò)增后只出現(xiàn)一條2022bp的特異擴(kuò)增片段;左側(cè)缺失型雜合子(- 4.2 /)的DNA樣品經(jīng)PCR擴(kuò)增后除出現(xiàn)一條1800bp的2基因擴(kuò)增片段外,還出現(xiàn)一條1628bp的特異擴(kuò)增片段;左側(cè)缺失型純合子(- 4.2 /- 4.2 )的DNA樣品經(jīng)PCR擴(kuò)增后只出現(xiàn)一條1628bp的特異擴(kuò)增片段;右側(cè)缺失型并左側(cè)缺失型雙重雜合子(- 3.7 /- 4.2 )的DNA樣品經(jīng)PCR擴(kuò)增后同時(shí)出現(xiàn)2022bp和1628bp兩條特異擴(kuò)增片段。見圖1。 圖1 - SEA 、- 3.7 和- 4.2 缺失型突變的多重PCR檢測(cè)結(jié)果(略) Fig1 The PCR-amplified result of- SEA 、- 3.7
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