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1、穩(wěn)轉(zhuǎn)慢病毒一、所需試劑1、慢病毒載體(詳細(xì)信息見(jiàn)附錄及質(zhì)粒的擴(kuò)增提取)(大腸桿菌-80保存2-3年,質(zhì)粒-20保存2-3年,病毒液-80保存1年)(1)載體質(zhì)粒:兩端的LTR、剪切位點(diǎn)、包裝信號(hào)以及抗性或熒光基因、gag基因5端350bp的序列及位于env序列中的RRE,含宿主RNA聚合酶識(shí)別部分(2)包裝質(zhì)粒(psPAX2):包含了pol、gag包裝成分(3)包膜質(zhì)粒(pMD2.G):用其他病毒的包膜蛋白代替了env基因.三種質(zhì)粒共同轉(zhuǎn)染產(chǎn)生不具有自我復(fù)制能力的病毒載體。2、包裝細(xì)胞:293T細(xì)胞3、菌株:大腸桿菌,用于提取質(zhì)粒4、轉(zhuǎn)染試劑:XTREME-GENE(-20保存,不可分裝),一
2、種脂質(zhì)與其他組份構(gòu)成的混合物5、濃縮試劑(配好后4保存,原材料室溫保存):5X PEG8000/NaCl溶液(聚乙二醇):NaCl 8.766 g; PEG8000 50g溶解在200ml Milli-Q純水中,高壓蒸汽滅菌*也可直接從公司買來(lái)病毒液(-80封口膜封口凍存管保存,4保存3天):滴度一般為108TU/ml6、10mg/ml polybrene(-20分裝保存):溴化己二甲銨。是帶正電的小分子,與細(xì)胞表面的陰離子結(jié)合,提高慢病毒對(duì)細(xì)胞的感染效率,通常加入polybrene 能提高感染效率210 倍。有一定細(xì)胞毒性,需要摸索濃度(110g/ml)7、無(wú)血清培養(yǎng)基:optimen8、貼
3、壁細(xì)胞(復(fù)蘇后3代以上的細(xì)胞)9、puromycin:嘌呤霉素,用于篩選穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞二、具體步驟<一>病毒包裝與收集(中皿,轉(zhuǎn)染步驟類似于瞬轉(zhuǎn))第一天1、種板,10×105個(gè)293T細(xì)胞,加入全培養(yǎng)基雙抗DMEM 4-5ml,過(guò)夜2、配制5X PEG8000/NaCl溶液稱取NaCl 8.766 g; PEG8000 50g溶解在200ml Milli-Q純水中;121攝氏度 30min 濕熱滅絕 30min;保存在4第二天1、配管試劑加樣量/l推薦量/l、g合計(jì)A管PLKO.1/pCDH3206psPAX21pMD2.G2Opti200B管XTREME-GENE6206Op
4、ti200A+B混合室溫靜置20min2、加入2ml全培養(yǎng)基DMEM3、將1加入2,孵育10h,換成5ml全培養(yǎng)基第四天第五天:1、9:00和17:00各收取一次5ml培養(yǎng)液,共20ml(-80保存)2、過(guò)濾:用孔徑為0.45mm的過(guò)濾器除去上清中的293T細(xì)胞3、加入5ml 5XPEG8000/NaCl溶液,每30min-1h上下?lián)u勻一次4、4過(guò)夜第六天1、4,3500rpm,20min2、棄上清,倒扣紙上靜置1-2min,吸干殘余液體3、加入120-150l PBS,緩慢吹打,以防形成氣溶膠4、50l分裝,-80保存。<二>慢病毒轉(zhuǎn)染靶細(xì)胞前期預(yù)實(shí)驗(yàn)MOI(步驟同正式試驗(yàn))(見(jiàn)
5、三2,直接訂購(gòu)病毒液時(shí)才需要)細(xì)胞種類DU145PC322RV1LNCaPRWPE-1MOI2422前期測(cè)病毒滴度(稀釋法,還有一種qPCR法見(jiàn)資料)1、第一天:準(zhǔn)備96孔板,每孔加入10000個(gè)293T,為每個(gè)病毒準(zhǔn)備20個(gè)孔(稀釋10個(gè)濃度,各2個(gè)副孔)。放入37,5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。2、第二天:在EP管中做10倍梯度稀釋,連續(xù)10個(gè)稀釋度。稀釋方法如下:每種病毒準(zhǔn)備10個(gè)1.5ml EP管,每管加入207µl培養(yǎng)液,往第一個(gè)管中加入23µl病毒原液,混勻后,吸取23µl加入第二個(gè)管混勻。依此類推,做十個(gè)稀釋度(1010-8)。吸取96孔板中原有的培養(yǎng)基,
6、加入含稀釋好的病毒液。并做好標(biāo)記。3、第三天:換液4、第四天:觀察結(jié)果并計(jì)算滴度在熒光顯微鏡下觀察結(jié)果,并數(shù)出最后兩個(gè)有熒光的熒光細(xì)胞克隆數(shù)。假設(shè)為X和Y,則滴度(TU/ml)=(X+Y×10)/2/X孔的病毒液的含量(µl )×1000。(前面算出的是沒(méi)l病毒量,所以乘于1000)第一天:1、種板(12/24孔板)需第二天為50%-70%,大約12孔板1×105細(xì)胞種類種板數(shù)收獲細(xì)胞數(shù)DU145PC322RV1LNCaPRWPE-1第二天1、準(zhǔn)備病毒液(可在第一天做):在冰上融解2、準(zhǔn)備完全培養(yǎng)基和 Polybrene 混合物(1:1000-1:200
7、0稀釋,終濃度在5-10g/ml之間),加入相應(yīng)培養(yǎng)板中(6孔板2ml,12孔板1ml,24孔板500l)3、加入濃縮病毒液(12孔板30l-50l)(如果是直接購(gòu)買病毒液需根據(jù)MOI確定病毒液量加入病毒液,自己包的病毒可以)4、培養(yǎng)過(guò)夜,對(duì)polybrene毒性敏感的細(xì)胞在4-6小時(shí)候換液第三天1、對(duì)細(xì)胞進(jìn)行換液第五天1、用藥物進(jìn)行穩(wěn)定株的篩選(具體篩選藥物根據(jù)載體內(nèi)的基因定,用氨芐青霉素0.5g/ml-10g/ml)2、需設(shè)置空白對(duì)照(未處理細(xì)胞加入相同濃度氨芐青霉素,黨對(duì)照全部死光為篩選周期)第六天之后(根據(jù)篩選周期)1、換液傳代2、觀察GFP報(bào)告基因確定轉(zhuǎn)染效率,或用qRT-PCR確定
8、轉(zhuǎn)染效率三、注意事項(xiàng)及知識(shí)點(diǎn)1、名詞解釋(1)病毒感染復(fù)數(shù)(multiplicity of infection MOI):含義是感染時(shí)病毒與細(xì)胞數(shù)量的比值,即為每個(gè)細(xì)胞被多少個(gè)有活力病毒所感染2、慢病毒摸索時(shí)加入梯度(具體見(jiàn)自己的說(shuō)明書(shū))3、慢病毒的儲(chǔ)存與稀釋:可以將病毒暫時(shí)放置于4 保存;如需長(zhǎng)期保存請(qǐng)放置于-80(病毒置于凍存管,并使用封口膜封口) A病毒可以存放于-80 6個(gè)月以上;但如果病毒儲(chǔ)存時(shí)間超過(guò)6個(gè)月,我們建議在使用前需要重新滴定病毒滴度 B反復(fù)凍融會(huì)降低病毒滴度:每次凍融會(huì)降低病毒滴度10%;因此在病毒使用過(guò)程中按照每次的使用量進(jìn)行分裝。4、慢病毒載體示意圖1載體質(zhì)粒(PLK
9、O.1 抑制載體,PCDH-GFP+puro過(guò)表達(dá)載體):(1)5LTR:long terminal repeat即長(zhǎng)末端重復(fù)序列,不編碼蛋白質(zhì),但含有啟動(dòng)子,增強(qiáng)子等調(diào)控元件(2)包組信號(hào):LTR-通過(guò)包裝細(xì)胞的RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄為RNA,通過(guò)信號(hào)起始包裝(3)啟動(dòng)子、酶切位點(diǎn)和抗性基因(amp氨芐青霉素puro嘌呤霉素)(4)stuffer:目的基因插入位點(diǎn)(慢病毒載體可插入5kbp左右)(5)GFP:green fluorescent protein綠色熒光蛋白(6)WPRE:Woodchuck Hepatitis Virus (WHP) Posttranscriptional Regul
10、atory Element 肝炎病毒轉(zhuǎn)錄后調(diào)控元件。轉(zhuǎn)錄后可形成三級(jí)結(jié)構(gòu),促進(jìn)基因的表達(dá)(7)cPPT/CTS: 逆轉(zhuǎn)錄病毒順式作用區(qū)域,其中該cPPT和CTS區(qū)域誘導(dǎo)三鏈結(jié)構(gòu)(更新于2018.11)2包裝質(zhì)粒(1)gag基因編碼病毒的核心蛋白基質(zhì)蛋白、衣殼蛋白、核衣殼蛋白等(2)pol基因編碼病毒復(fù)制所需的酶類,如反轉(zhuǎn)錄酶、整合酶、蛋白酶(3)pro基因則編碼切割蛋白前體所需的蛋白酶(4)多種酶切位點(diǎn)和巨細(xì)胞病毒啟動(dòng)子3包膜載體(1)VSV-G:水皰性口炎病毒糖蛋白G基因,用于代替env基因 可修改 歡迎下載 精品 Word親愛(ài)的用戶:煙雨江南,畫(huà)屏如展。在那桃花盛開(kāi)的地方,在這醉人芬芳的季
11、節(jié),愿你生活像春天一樣陽(yáng)光,心情像桃花一樣美麗,感謝你的閱讀。1、最困難的事就是認(rèn)識(shí)自己。22.2.142.14.202222:5222:52:032月-2222:522、自知之明是最難得的知識(shí)。二二二二二二年二月十四日2022年2月14日星期一3、越是無(wú)能的人,越喜歡挑剔別人。22:522.14.202222:522.14.202222:5222:52:032.14.202222:522.14.20224、與肝膽人共事,無(wú)字句處讀書(shū)。2.14.20222.14.202222:5222:5222:52:0322:52:035、三軍可奪帥也。星期一, 二月 14, 2022二月 22星期一, 二月 14, 20222
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