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文檔簡(jiǎn)介
1、BRET 生物發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù)簡(jiǎn)介:生物發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移(BRET)技術(shù)是近10年來(lái)出現(xiàn)的一種新的檢測(cè)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù).它的最大優(yōu)勢(shì)是能在活細(xì)胞中實(shí)時(shí)進(jìn)行檢測(cè),因此能夠進(jìn)行相互作用動(dòng)力學(xué)的研究。在應(yīng)用這個(gè)系統(tǒng)研究感興趣的蛋白前,首先需要將Rluc或者EYFP 融合到每個(gè)蛋白或者他們的輔蛋白上。在細(xì)胞中,融合蛋白共表達(dá),然后和熒光素酶和其底物腔腸素反應(yīng),當(dāng)能量供體Rluc,能量受體EYFP 之間距離比較近的時(shí)候(10-100Å),那么光將從Rluc(峰值480nm發(fā)射)傳遞到EYFP,形成它的激發(fā),并且發(fā)射一個(gè)波長(zhǎng)在530nm 的發(fā)射光,BRET 量化的程度以發(fā)射光53
2、0nm 和480nm 的比率表示。實(shí)驗(yàn)流程1、用于BRET的表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建;2、融合蛋白表達(dá)檢測(cè);3、BRET實(shí)驗(yàn);4、實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析及提交實(shí)驗(yàn)報(bào)告客戶提供1、目的基因cDNA(也可由我公司提供基因克隆)2、用于實(shí)驗(yàn)細(xì)胞(如果我公司細(xì)胞庫(kù)有可不需提供)公司提供詳細(xì)實(shí)驗(yàn)步驟、使用儀器、及結(jié)果分析等詳細(xì)實(shí)驗(yàn)報(bào)告。服務(wù)周期和價(jià)格具體咨詢本公司熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)熒光共振能量轉(zhuǎn)移-FRET(Fluorescent Resonance Energy Transfer)指兩個(gè)熒光發(fā)色基團(tuán)在足夠靠近時(shí),當(dāng)供體分子吸收一定頻率的光子后被激發(fā)到更高的電子能態(tài),在該電子回到基態(tài)前,通過(guò)偶極子相互作用,實(shí)現(xiàn)了能
3、量向鄰近的受體分子轉(zhuǎn)移。 (1)FRET發(fā)生條件: 能量匹配:供體分子的發(fā)射光譜可以被受體分子吸收并產(chǎn)生熒光信號(hào)。供體分子的發(fā)射光譜應(yīng)與受體分子的激發(fā)光譜必須有顯著重疊(>30%); 作用距離:供體分子與受體分子的作用距離為1-10nm; FRET效率公式:用于計(jì)算分子/基團(tuán)間作用距離R 偶極-偶極作用:供體分子與受體分子作用時(shí)的向量必須滿足一定條件。(2)FRET的應(yīng)用:通過(guò)FRET技術(shù)可以獲得有關(guān)兩個(gè)蛋白分子之間相互作用
4、的空間信息(作用距離、作用方向、能量傳遞效率)。常用于解決如下問(wèn)題:蛋白分子的共定位;蛋白分子聚合體;轉(zhuǎn)錄機(jī)制;轉(zhuǎn)化途徑;分子運(yùn)動(dòng);蛋白折疊等生物學(xué)問(wèn)題。(3)FRET常見(jiàn)的供體-受體熒光分子對(duì):熒光蛋白類:
5、0; 染料類:FRET檢測(cè)HIV附屬蛋白與細(xì)胞膜CD分子相互作用摘自:A Flow Cytometry-Based FRET Assay to Identify and Analyse Protein-Protein Interactions in Living CellsCarina Banning, Jo¨ r
6、g Votteler, et al. 圖釋:流式細(xì)胞儀FACSAria檢測(cè)FRET信號(hào)。(a)活的293T細(xì)胞分別單獨(dú)轉(zhuǎn)入CFP、YFP、CFP/YFP 、CFP/YFP融合蛋白作為對(duì)照,確定最好的圈門(mén)方式為CFP/FRET。(b)293T細(xì)胞經(jīng)過(guò)2%PFA處理后,YFP熒光強(qiáng)度出現(xiàn)明顯下降。篩選有相互作用的未知蛋白質(zhì)的流程 圖釋:流式細(xì)胞儀FACSAria進(jìn)行FACS-FRET高通量篩選感興趣蛋白相互作用的未知蛋白。(a)FACS-FRET篩選流程。(b)在活的293T細(xì)胞中轉(zhuǎn)入Vpu-YFP作為誘餌,與等量的CFP融合蛋白(蛋白的cDNA庫(kù))相互作用36小時(shí)后,分選FE
7、RT+細(xì)胞。 FRET研究蛋白酶功能摘自:Detection of Infective Poliovirus by a Simple, Rapid, and Sensitive Flow Cytometry Method Based on Fluorescence Resonance Energy Transfer TechnologyJason L. Cantera et al. Applied and environmental microbiology, Jan. 2010, p. 584-588 圖釋:流式細(xì)胞儀 FACSAria檢測(cè)脊髓灰質(zhì)
8、炎病毒(PV1)10倍感染BGM-PV細(xì)胞,8小時(shí)后上機(jī)檢測(cè)。AC病毒濃度分別為0.40.004,D為陰性對(duì)照。雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)BiFC(Bimolecular Fluorescence Complementation)是將熒光報(bào)告蛋白按照規(guī)則分成沒(méi)有熒光的兩段,分別與誘餌蛋白和捕獲蛋白融合,只有在誘餌蛋白和捕獲蛋白發(fā)生相互作用的情況下,兩段不完整的熒光報(bào)告蛋白才會(huì)形成完整的報(bào)告蛋白,發(fā)出熒光?;罴?xì)胞收集后,在流式細(xì)胞儀中的檢測(cè)是實(shí)時(shí)進(jìn)行的,只要細(xì)胞中有熒光產(chǎn)生就會(huì)被捕捉到信號(hào),因此,不論是親和力較弱的結(jié)合還是暫時(shí)性的結(jié)合都不會(huì)被遺漏。 雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)原理示意圖(a) 誘餌和捕
9、獲蛋白分別攜帶CYFP和NYFP兩段YFP熒光蛋白片段(b) 誘餌和捕獲蛋白結(jié)合同時(shí)CYFP與NYFP形成YFP (c) 形成的YFP發(fā)出熒光(1)BiFC檢測(cè)的特點(diǎn): 活細(xì)胞分析; 可以用于研究2種或2種以上的啟動(dòng)子調(diào)控之下的蛋白質(zhì)相互作用; 具有很高的信噪比,弱蛋白相互作用也可以檢測(cè)到(>7nm)。(2)可用于BiFC的熒光蛋白: GFP、BFP、CFP、YFP,生理?xiàng)l件可用的黃色的Venus和citrine,青色的cerulean;
10、0; 紅色系統(tǒng):mRFP2Q66T、mCherry;Venus(EYFP的變體)是目前用于 BiFC分析最多的熒光蛋白,因?yàn)槠錈晒鈴?qiáng)且背景敏感度降低,是BiFC分析理想的熒光蛋白。 常見(jiàn)的用于雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)的熒光蛋白BiFC研究復(fù)合體中亞基間的相互作用摘自:Detection and Characterization of Influenza A Virus PA-PB2 Interaction through a Bimolecular Fluorescence Complementation AssayJoseph N. Hemerka, Dan Wa
11、ng,et al. JOURNAL OF VIROLOGY, Apr. 2009, p. 3944-3955圖釋:流式細(xì)胞儀 FACSCalibur檢測(cè)流感病毒復(fù)合體中亞基PA-PB2間的相互作用。(B)流式檢測(cè)同時(shí)轉(zhuǎn)入PA/PB2的COS-1細(xì)胞及單轉(zhuǎn)入PA-VC的細(xì)胞的Venus熒光信號(hào),顯示轉(zhuǎn)入24小時(shí)后的熒光強(qiáng)度。(C)螢火蟲(chóng)熒光蛋白酶顯示,轉(zhuǎn)入單或雙質(zhì)粒的細(xì)胞,螢火蟲(chóng)熒光蛋白酶活性一致。BiFC研究信號(hào)傳導(dǎo)通路中蛋白質(zhì)間的相互作用摘自:Characterization of the latent membrane protein 1 signaling complex of Epst
12、ein-Barr virus in the membrane of mammalian cells with bimolecular fluorescence complementationPooja Talaty, Amanda Emery, et al. Virology Journal 2011, 8:414 圖釋:流式細(xì)胞儀FACSLSRII檢測(cè)BiFC信號(hào)。LMP1-NYFP和LMP1-NYFP突變體分別與CYFP-TRAF2、CYFP-TRAF3轉(zhuǎn)入細(xì)胞內(nèi),檢測(cè)其相互作用。曲線藍(lán)色部分為出現(xiàn)YFP的熒光陽(yáng)性表達(dá),表明LMP1與CYFP、CYFP均存在相互作用??破找幌耂C
13、I科學(xué)引文索引(Science Citation Index, 簡(jiǎn)稱 SCI )于1957 年由美國(guó)科學(xué)信息研究所(Institute for Scientific Information, 簡(jiǎn)稱 ISI)在美國(guó)費(fèi)城創(chuàng)辦,是由美國(guó)科學(xué)信息研究所(ISI)1961年創(chuàng)辦出版的引文數(shù)據(jù)庫(kù)。SCI(科學(xué)引文索引 )、EI(工程索引 )、ISTP(科技會(huì)議錄索引 ) 是世界著名的三大科技文獻(xiàn)檢索系統(tǒng),是國(guó)際公認(rèn)的進(jìn)行科學(xué)統(tǒng)計(jì)與科學(xué)評(píng)價(jià)的主要檢索工具。1976 年,ISI 在 SCI 基礎(chǔ)上引出期刊引用報(bào)告(journal citation report,JCR),提供了一套統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),展示科學(xué)期刊被引用
14、情況、發(fā)表論文數(shù)量以及論文的平均被引用情況。在 JCR 中可以計(jì)算出每種期刊的影響因子(Impact Factor,IF)。影響因子的高低,在一定程度上可以反應(yīng)一個(gè)期刊的影響力。(百度百科)期刊的影響因子(Impact factor;IF)計(jì)算方式:IF 2014 = (該雜志2012-2013年發(fā)表文章在2014年被引用的次數(shù) / (該雜志2012-2013年發(fā)表文章的總數(shù))附件是最近兩年的SCI期刊列表,2014年植物學(xué)類我紅色標(biāo)注了部分,不過(guò)期刊名都是縮寫(xiě), 2013年的是全稱期刊名。影響因子從高到低排列,大體代表了期刊的水平檔次。三大國(guó)際頂尖期刊CNS, 指CELL, NATURE, SCIENCE。國(guó)際植物學(xué)專業(yè)期刊中,最好的研究論文期刊是Plant Cell ( IF2004=9.338),當(dāng)然今年新創(chuàng)刊的NATUR
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