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文檔簡介

1、醫(yī)院病理科分子病理實驗室建設(shè)方案目錄第一部分分子病理概述31.1 分子病理診斷的應(yīng)用范圍51.2 常用分子病理技術(shù)51.3 FISH-熒光原位雜交61.4 部分FISH產(chǎn)品對比(廠家提供,僅供參考)71.5 實時熒光定量PCR81.6 基因測序10第二部分分子病理實驗室設(shè)施與環(huán)境10第三部分病理科實驗室質(zhì)量管理標(biāo)準(zhǔn)11第四部分分子病理常用檢測設(shè)備131、熒光顯微鏡原位雜交圖像分析系統(tǒng)132、LeicaBond-Max全自動免疫組化和原位雜交多功能染色機163、羅氏LightCycler?480模塊式高通量實時熒光定量PCR系統(tǒng)164、羅氏BenchMarkGX全自動多功能組織病理檢測系統(tǒng)175

2、、IlluminaHiSeq2000高通量測序儀186、NatureGeneTermoBrite原位雜交儀187、力康HFsafe-1200ClassnTypeA2生物安全柜208、Neofuge1600Healforce臺式高速冷凍大容量離心機21第五部分分子病理實驗室推薦設(shè)備型號及預(yù)算22方案一初級配置方案22方案二專業(yè)性配置方案22方案三科研型配置方案23第六部分分子病理常用試劑及價格23第七部分分子病理經(jīng)濟效益分析257.1 熒光原位雜交(FISH)檢測項目的經(jīng)濟價值257.2 實時熒光定量PCR項目的經(jīng)濟價值26第一部分分子病理概述病理為醫(yī)之本Asisourpathology,soi

3、sourmedicine18-19世紀(jì)器官病理學(xué)早期尸檢尋找器官病變119世紀(jì)組織細胞病理學(xué)手術(shù)切除組織標(biāo)本病理檢測19世紀(jì)中葉臨床病理取活體病變組織做病檢120世紀(jì)免疫組化提高病理診斷準(zhǔn)確性1f20世紀(jì)分子病理早期診斷、靶向治療病理學(xué)發(fā)展過程分子病理學(xué)中常用的分子生物學(xué)技術(shù)主要有核酸分子雜交、PCR相關(guān)技術(shù)、免疫熒光化學(xué)、基因芯片以及DNA序列分析等。由于分子病理學(xué)的應(yīng)用,使得我們對疾病本質(zhì)的認(rèn)識更加深化,對于腫瘤的診斷和治療也取得很大的進展。主要表現(xiàn)在以下幾個方面:1、月中瘤易感基因的檢測:腫瘤遺傳相關(guān)的易感基因檢測對于腫瘤高危人群的篩檢具有實用價值,已明確的腫瘤易感基因及其相關(guān)腫瘤有Rb

4、1(視網(wǎng)膜母細胞瘤卜WT1(腎母細胞瘤)等。除了檢測高危人群的易感基因外,有方法也應(yīng)用于正常人群腫瘤易感性檢測,如檢測Ret基因突變用于診斷n型多發(fā)性內(nèi)分泌腫瘤,通過分析GST基因型以判斷個體暴露于致癌物時的致癌危險性等。2、月中瘤相關(guān)病毒的檢測:如HPV病毒與宮頸癌的發(fā)生有很大關(guān)系,通過對HPV病毒的檢測可起到預(yù)防和提早治療的作用。而當(dāng)前國際上診斷HPV感染以DNA檢測為主。3、月中瘤的早期診斷:K-ras基因突變在結(jié)腸癌、胰腺癌和肺癌等腫瘤中發(fā)生率較高。應(yīng)用細針穿刺活檢材料檢測胰腺癌的第12密碼子變突。應(yīng)用PCR-RFLP方法檢測結(jié)腸癌患者糞便中的Ras基因突變,其檢出率與瘤組織中相似,可

5、用于高危人群的篩選。4、疑難月中瘤的診斷和分類:傳統(tǒng)的病理學(xué)診斷主要通過形態(tài)學(xué)和免疫表型來判斷淋巴細胞增生與淋巴細胞性腫瘤,但對對醫(yī)生的經(jīng)驗要求較高,且難度較大。應(yīng)用RFLP分析免疫球蛋白或T細胞受體基因重排,具有鑒別診斷作用,且這種分子病理分型比免疫學(xué)分型更為準(zhǔn)確。對Bcr區(qū)基因重排的檢測,可對慢性粒細胞性白血病和急性粒細胞性白血病進行鑒別診斷。N-myc和C-myc擴增和表達的檢測,對鑒別神經(jīng)母細胞瘤和神經(jīng)上皮瘤具有應(yīng)用價值,因前者N-myc明顯擴增,而后者則為C-myc明顯擴增。5、月中瘤的預(yù)后監(jiān)測:利用癌癥患者的全基因序列開發(fā)出的個性化血液檢測方法有助于醫(yī)生調(diào)整癌癥患者的治療方案,可以

6、監(jiān)測癌癥治療后的情況以及發(fā)現(xiàn)癌癥是否復(fù)發(fā)。6、為月中瘤個體化和預(yù)見性治療提供依據(jù):腫瘤在發(fā)生、發(fā)展的不同時期,可能涉及不同基因的不同變化形式,而這種變化與腫瘤臨床治療的敏感性密切相關(guān),如能在分子水平對腫瘤基因變化提供指標(biāo),對腫瘤的個體化和預(yù)見性治療具有指導(dǎo)意義。如在90%的胰腺癌、50%的結(jié)腸癌、30%的非小細胞肺癌中存在Ras基因的?敷活,50%左右的腫瘤有P53基因不同形式的突變,這些基因的異常,使腫瘤對某些放療或化療的方法具有抵抗性,如能從基因水平上改變異常基因的狀態(tài),則可提高放、化療的敏感性。7、月中瘤的預(yù)后判斷:腫瘤基因的突變、擴增及過表達等改變常與腫瘤的預(yù)后密切相關(guān)。如HER2基因

7、擴增與乳腺癌發(fā)生發(fā)展及臨床預(yù)后密切相關(guān),HER2的陽性表達提示預(yù)后不良,可通過熒光原位雜交(FISH)技術(shù)進行檢測,配合術(shù)后治療,指導(dǎo)臨床用藥。組織病理學(xué)診斷十免疫病理學(xué)診斷-H分子病理學(xué)診斷病埋學(xué)診斷及鑒別診斷腫瘤“個體化”靶向治療藥物療效的評價臨床預(yù)后評估及預(yù)測1.1 分子病理診斷的應(yīng)用范圍人類遺傳病的基因診斷和產(chǎn)前診斷月中瘤分子靶向治療明確感染性疾病的病源體(細胞、真菌、病毒)多基因病研究組織器官移植配型輔助病理診斷法醫(yī)學(xué)性別鑒定基礎(chǔ)研究通過PCR技術(shù)確認(rèn)Ig和TCR基因是否發(fā)生重排,判定淋巴造血系統(tǒng)疾病的良惡性。 FISH法檢測乳腺癌her-2基因是否發(fā)生擴增,指導(dǎo)臨床靶向藥物(赫賽汀

8、)治療。 FISH法檢測滑膜肉瘤SYT基因是否發(fā)生易位,協(xié)助臨床診斷。 通過對結(jié)直腸癌KRAS基因的突變測序分析,指導(dǎo)靶向用藥(愛比妥)。 HPV多亞型檢測,提示宮頸癌的發(fā)病風(fēng)險。 肺癌分子靶向治療EGFR酪氨酸激酶抑制劑:吉非替尼(gefitinib,商品名Iressa)、埃羅替尼(Erlotinib,商品名Tarceva) 檢測HER2狀態(tài)的臨床價值胃癌靶向治療患者篩選、療效預(yù)測1.2 常用分子病理技術(shù) 免疫組織化學(xué)(IHC)技術(shù)檢測蛋白 分子原位雜交DNA,RNA 熒光原位雜交(FISH)技術(shù)DNA,RNA 多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)PCR技術(shù)DNA,RNA 熒光定量PCR-DNA,RNA DNA測

9、序技術(shù)DNA突變生物芯片技術(shù)一DNA,RNA,蛋白質(zhì)等 DNA跡(Southernblot)微衛(wèi)星不穩(wěn)定檢測(MSI)醫(yī)院病理科開展分子病理實驗項目,一般從實用出發(fā),二級醫(yī)院主要開展熒光原位雜交(FISH)項目,三級醫(yī)院主要開展熒光原位雜交(FISH)、熒光定量PCR項目,有條件的三級醫(yī)院可以開展DNA基因測序項目。1.3 FISH-熒光原位雜交FISH技術(shù)是一種通過熒光標(biāo)記的DNA探針與細胞核內(nèi)的DNA靶序列雜交,在熒光顯微鏡下能原位顯示細胞核內(nèi)雜交信號的分子細胞遺傳學(xué)技術(shù)。FISH技術(shù)檢測基因擴增的準(zhǔn)確性比其他檢測技術(shù)高,可以避免由于染色體的多體而呈現(xiàn)的假陽性,被譽為金標(biāo)準(zhǔn)”。實驗流程FI

10、SH樣本的制備-探針的制備-探針標(biāo)記-雜交-(染色體顯帶)-熒光顯微鏡檢測-結(jié)果分析FISH優(yōu)點1 .熒光探針商業(yè)化、采購方便、保存安全。2 .實驗周期短、特異性好、定位準(zhǔn)確。3 .可定位1KB的DNA序列,靈敏度高4 .一次染色可獲取24種不同顏色的染色體,對于隱匿性的缺失、異位診斷準(zhǔn)確。 FISH技術(shù)在醫(yī)院的運用一切與染色體相關(guān)的科室。特別是病理科、血液科、婦產(chǎn)科、生殖中心(產(chǎn)前診斷、植入前診斷)等。目前應(yīng)用于臨床檢測的FISH基因探針有接近于一百種。在美國,F(xiàn)ISH探針已被FDA列為特異性分析試劑”,不需批準(zhǔn)即可用于臨床醫(yī)學(xué)檢測。所以,F(xiàn)ISH檢測在國外應(yīng)用非常廣泛和迅速。如Vysis、

11、Cytocell等公司,其產(chǎn)品已遍布全球,但其價格較貴,嚴(yán)重阻礙了在我國國內(nèi)的推廣。國內(nèi)廠家,如金菩嘉和廣州安必平,近年來發(fā)展迅速,品種覆蓋范圍較廣,且產(chǎn)品質(zhì)量保證、性價比高。并且,更為有利的是,國內(nèi)公司供貨快速及時、售后服務(wù)好。由于國內(nèi)廠家的崛起,近年來國內(nèi)醫(yī)院開展FISH檢測的速度大大加快。 FISH技術(shù)實驗室基本要求實驗室環(huán)境:樣本準(zhǔn)備區(qū)、暗室(10-15平米左右);實驗設(shè)備:熒光顯微鏡以及熒光成像分析系統(tǒng)、水浴鍋、原位雜交儀、冰箱、離心機、恒溫箱辦公設(shè)備:電腦、打印機實驗耗材:FISH探針,進口如雅培、羅氏細胞類探針:諸如血液病類,如白血病、淋巴瘤、骨髓瘤等。其次,產(chǎn)前診斷和產(chǎn)后篩查類

12、;實體腫瘤類探針:病理科在檢測乳腺癌、子宮頸癌、膀胱癌、肺癌、宮頸癌、軟組織肉瘤、前列腺癌、甲狀腺癌等方面。技術(shù)人員:1人1.4 部分FISH產(chǎn)品對比(廠家提供,僅供參考)品牌比較廣州安必平金菩嘉雅培(Vysis)探針種類覆蓋70種腫瘤探針,品種齊全,覆蓋了實體瘤及血液疾病。約40種,部分腫瘤沒有覆蓋。覆蓋70種腫瘤探針,品種齊全,覆蓋了實體瘤及血液疾病。探針質(zhì)量用多個克隆標(biāo)記探針,信號靈敏,背景低,質(zhì)量與國外相當(dāng)。實體瘤探針質(zhì)量與國外相當(dāng),但血液病探針信號不佳。探針信號靈敏,背景低,質(zhì)量好。價格由于有自己的研發(fā)團隊,探針都為自產(chǎn),成本較低,具有強大的價格競爭力,本公司的出現(xiàn)也打破了國內(nèi)公司一

13、家獨大的壟斷。價格比雅培低,但高于安必平。由于異國操作,運營成本高,價格高。操作便利性即用型探針:探針溶液已包含雜交液組分,可直接點樣雜交,無需雜交前溶解探針和混勻探針及雜交液,方便操作和減少出錯。探針與雜交液分開,雜交前需在黑暗環(huán)境中混合兩者,操作不變、容易出錯。探針與雜交液分開,雜交前需在黑暗環(huán)境中混合兩者,操作不變、容易出錯。輔助試劑配送FISH所需的常規(guī)試劑(蛋白酶K或胃蛋白酶、NP-40、多聚甲醛、20XSSC等),節(jié)約客戶采購時間及成本。搭配蛋白酶K一起銷售。搭配蛋白酶K、NP-40等一起銷售。熒光顯微系統(tǒng)配置從客戶出發(fā),幫客戶選用性價比高的熒光顯微鏡及圖像分析軟件,操作便利,性價

14、比高。滿足要求,但價格較高。滿足要求,但價格較高,且客戶可能需自己配置系統(tǒng)。顯微鏡明場觀察配相差功能,可鏡下仔細觀察蛋白酶消化狀態(tài),對小體積樣本及珍貴樣本處理特別有效,避免消化不佳導(dǎo)致雜交結(jié)果不好。不配相差功能。不配相差功能。標(biāo)配濾塊對新客戶標(biāo)配四種顏色的熒光濾塊(DAPI、綠、紅、青),可同時滿足實體瘤及產(chǎn)前診斷。只標(biāo)配三種顏色濾塊(DAPI、綠、紅),如需開展產(chǎn)前診斷的話客戶還要額外購買青色濾塊。只標(biāo)配三種顏色濾塊(DAPI、綠、紅);如需開展產(chǎn)前診斷的話客戶還要額外購買青色濾塊,且需用到金色濾塊(容易出現(xiàn)竄色),濾塊配置要求太高。檢測靶標(biāo)因為標(biāo)配了四種濾塊,可同時檢測三個靶標(biāo)(綠紅青),

15、臨床檢測效率高、能降低試劑成本、且能應(yīng)用于多靶標(biāo)檢測的科研課題。只有兩個靶標(biāo)的試劑(綠紅),靶向選擇及組合受限。有同時檢測三個靶標(biāo)的試劑,但因為不是標(biāo)配,應(yīng)用受限。圖像分析軟件有自主研發(fā)的圖像分析軟件,降低客戶采購成本。外購。外購。品種設(shè)計因為所有探針都為自主研發(fā),可為客戶靈活設(shè)計產(chǎn)品探針組成,以便臨床、科研充分使用及降低試劑成本探針不能根據(jù)客戶需求進行調(diào)整,可能存在試劑成本較高的風(fēng)險。探針不能根據(jù)客戶需求進行調(diào)整,可能存在試劑成本較高的風(fēng)險。特色產(chǎn)品能設(shè)計多個“二合一”探針組合;15種微缺失探針(用于流產(chǎn)原因篩查及其他少見綜合癥);只有部分基因探針。不能根據(jù)客戶需求設(shè)計“二合一”探針。國內(nèi)S

16、FDA證書兩個產(chǎn)品取得注冊受理號,即將取得注冊證書。幾個產(chǎn)品取得注冊證書。兩個產(chǎn)品取得注冊證書。地理位置位于廣州,華南地區(qū)客戶地理位置近,送貨及服務(wù)及時到位。位于北京,華南地區(qū)服務(wù)不便。位于國外,國內(nèi)雖有代理,但售后服務(wù)及技術(shù)支持不能最快反應(yīng)。平臺支持有多年其他產(chǎn)品的網(wǎng)絡(luò)支持,如病理科中的液基細胞學(xué)平臺,與客戶建立了多年來的良好關(guān)系。產(chǎn)品單一,只有FISH試劑J,設(shè)備、人員投入高。有其他試劑,但病理科中只有FISH,無其他平臺支持。售后服務(wù)借助于廣泛的液基細胞學(xué)網(wǎng)絡(luò)及合作公司達安基因的全國網(wǎng)絡(luò),售后服務(wù)迅速周到。售后服務(wù)網(wǎng)絡(luò)單一,售后服務(wù)風(fēng)險較高。售后服務(wù)網(wǎng)絡(luò)單一,售后服務(wù)風(fēng)險較高。優(yōu)勢資源與

17、達安基因合資,充分利用全國廣泛的銷售及技術(shù)支持資源。特殊資源有自己的學(xué)術(shù)核心期刊分子診斷與治療,方便客戶課題研究。無無1.5 實時熒光定量PCR實時熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進行定量分析的方法。臨床疾病診斷:各型肝炎、艾滋病、禽流感、結(jié)核、性病等傳染病診斷和療效評價;地中海貧血、血友病、性別發(fā)育異常、智力低下綜合癥、胎兒畸形等優(yōu)生優(yōu)育檢測;腫瘤標(biāo)志物及瘤基因檢測實現(xiàn)腫瘤病診斷;遺傳基因檢測實現(xiàn)遺傳病診斷。實時熒光定量PCR分子病理診斷應(yīng)用?絕對定量(AbsoluteQuantification)病原

18、體檢測(HiV,HBV,結(jié)核桿菌,H1N1等)基因表達研究(白血病融合基因表達檢測)?相對定量(RelativeQuantification)腫瘤組織中的特定基因表達(EGFR,VEGFR,BRCA1&2,ERCC1&2,RRM1)腫瘤Bio-Marker特定miRNA檢測1900多個試劑盒CNV研究超過160萬個TaqManCopyNumerAssay藥物療效考核?突變分型(AllelicDiscrimination)基因突變分析-腫瘤個體化醫(yī)療SNP研究一一2600個藥物代謝試劑盒,個體化醫(yī)療物種鑒定、菌株鑒定?陰陽性檢驗(Plus/MinuswithIPC)?稀有突變檢測

19、(早期月中瘤診斷:外周血痕量月中瘤細胞等熒光定量PCR顯著優(yōu)點(1)、可以進行準(zhǔn)確的定量檢測,可適用于基因診斷的各種疾病;(2)、定量范圍極寬,樣品無需做梯度稀釋;(3)、特異性更強,克服了假陽性的主要來源;(4)、操作快速,無需PCR后處理;(5)、技術(shù)簡單,易于學(xué)習(xí)和掌握;(6)、安全,對操作員和環(huán)境都無危害。(7)、易于進行電腦化操作和數(shù)據(jù)管理,有利于醫(yī)院的現(xiàn)代化建設(shè)。實時熒光定量PCR檢測月中瘤的有關(guān)項目CEAmRNA、AFPmRNA、uPAmRNA、CK19mRNA、CK20mRNA、MDRImRNA。1.6基因測序DNA測序技術(shù)主要依據(jù)Sanger的雙脫氧鏈終止法。以DNA單鏈為模

20、板,在特定條件下,用特異的引物在測序級DNA聚合酶的作用下,根據(jù)堿基互補配對原則,不斷將4種脫氧核糖核甘酸(dNTP)加到引物的3”-羥基末端并使引物鏈得到延伸。將測序結(jié)果用DNAsequencinganalysis5.1軟件自動分析原始測序數(shù)據(jù),獲取測序電泳圖和序列圖。臨床基因測序檢測對病理科的形態(tài)診斷金標(biāo)準(zhǔn)含金量的提升和分子病理技術(shù)的開發(fā)及經(jīng)濟效益改善有現(xiàn)實意義。對于可疑癌前病變患者可以明確其病變標(biāo)本是否真正含有候選基因的突變,以解除大量由免疫組化標(biāo)記癌基因陽性患者的心理恐慌和經(jīng)濟負擔(dān)。對癌癥家族有血緣關(guān)系的親屬檢測相關(guān)癌基因突變或多態(tài)性,具有亞健康診斷和體檢意義。1、2、第二部分分子病理

21、實驗室設(shè)施與環(huán)境布局合理、實驗室各區(qū)域的劃分;水電、照明、通風(fēng)符合實驗室基本要求;3、消防設(shè)施齊全、消防通道暢通;4、石蠟組織、DNA樣本的存放;5、實驗室記錄、操作手冊等文件存放;6、實驗室耗材、試劑的存放;7、安裝生物安全防護設(shè)施;8、廢棄物的處置9、實驗室的清潔與日常消毒、并有相關(guān)記錄其中:PCR實驗環(huán)境要求明確分區(qū),一般分為4個工作區(qū);各區(qū)獨立,互不相通;設(shè)置緩沖間,設(shè)置傳遞窗;單一方向FISH實驗環(huán)境要求:需要避光獨立的暗室,專門的熒光顯微鏡觀察室第三部分病理科實驗室質(zhì)量管理標(biāo)準(zhǔn)1、2、衛(wèi)生部【2009】31號文件病理科建設(shè)與管理指南(試行)2006年6月1日實施的醫(yī)療機構(gòu)臨床實驗室

22、管理辦法3、全國各省市的關(guān)于臨床病理專業(yè)質(zhì)量檢查及評價標(biāo)準(zhǔn)4、美國CAP認(rèn)可標(biāo)準(zhǔn)5、歐洲NordiQC認(rèn)證標(biāo)準(zhǔn)6、國際標(biāo)準(zhǔn)化組織制定并于2003年正式發(fā)布醫(yī)學(xué)實驗室的管理標(biāo)準(zhǔn):ISO15189:2003醫(yī)學(xué)實驗室質(zhì)量和能力的專用要求,由國際實驗室認(rèn)可合作組織(ILAC)推薦執(zhí)行。適合臨床多學(xué)科實驗室對檢驗前、中、后全過程的管理。第四部分分子病理常用檢測設(shè)備1、銖卡Leica熒光顯微鏡原位雜交圖像分析系統(tǒng)品牌/型號:LEICADM2500技術(shù)參數(shù)一、熒光顯微鏡部分1、配顯微鏡主機2、光學(xué)系統(tǒng):無限遠校正光學(xué)系統(tǒng)。3、具有明場、熒光觀察功能。4、6位物鏡轉(zhuǎn)換器。5、總放大倍數(shù):50X-1000X。

23、6、*三目觀察鏡筒,分光比例:100%/0,50%/50%,0/100%7、透射光照明:12V100W構(gòu)素?zé)簟?、底座帶濾片架和日光濾光片。9、*單手操作樣夾,方便同時記錄。10、*調(diào)焦與X-Y調(diào)節(jié)全對稱,實現(xiàn)無疲勞操作。11、*調(diào)焦旋鈕高度可調(diào)12、*3步聚焦(粗/中/細),鈕距可調(diào),停焦可調(diào)。13、*聚光鏡:帶與物鏡放大倍數(shù)相匹配白孔鏡光欄彩色標(biāo)記,方便聚光鏡調(diào)節(jié)14、超硬鍍陶瓷載物臺15、*載物臺調(diào)節(jié)左右手可以更換。16、X-Y移動無暴露齒條。17、配平場半復(fù)消色差物鏡:1.25x(NA=0.04),平場半復(fù)消色差熒光物鏡10x(NA=0.30),平場復(fù)消色差熒光物鏡63x(NA=1.3

24、0)oil,平場半復(fù)消色差熒光物鏡100x(NA=1.30)oil。18、目鏡:10X寬視野目鏡,視野數(shù)為25mm19、熒光裝置:5位熒光濾塊轉(zhuǎn)換器,配紫外、藍色、綠色熒光激發(fā)。UV激發(fā):激發(fā)340-380nm;阻擋400nm;發(fā)射:425nm;Blue激發(fā):激發(fā)480/40nm;阻擋505nm;發(fā)射:527/30nm;Green激發(fā):激發(fā)546/12nm;阻擋565nm;發(fā)射:600/40nm20、外置熒光光源:外置金屬鹵化物光源,長壽命,免調(diào)節(jié)工作時間2000小時以上。光源通過光纖傳輸,無熱力傳輸。21、*有熒光“零像素點漂移”技術(shù)。22、*有光陷言十可以確保有很黑的背景:傾斜的發(fā)射光濾塊

25、,吸收用隹光的黑色涂層,磨光表面和減少反射的涂層。23、配1x接口二、數(shù)碼成像系統(tǒng)部分:配高靈敏度雙速單色冷CCD碼攝像頭參數(shù),半導(dǎo)體式制冷,-20度。2/3英寸CCD像素1392x1040(1.4Mpixel),像素大小6.45x6.45umpixels,感光面積8.9*6.6mm三、細胞染色體核型及熒光原位雜交分析軟件1、CytoVisionkaryotyping染色體核型及熒光原位雜交分析1.1、 有完備的染色體圖象處理技術(shù),對染色體之間的重疊交叉和連接等都可用單鍵自動分割或手動畫線分割,劃線切割時畫錯可以任意后退回擦;1.2、 畫中軸線分離染色體時,不同染色體自動用不同顏色突出;1.3

26、、 可對顯帶不夠清晰的染色體應(yīng)用不同的高斯數(shù)陣顯示格式使條帶明晰;1.4、 染色體放大、縮小、旋轉(zhuǎn)、翻轉(zhuǎn)、鏡向翻轉(zhuǎn);1.5、 可自動或人工干預(yù)識別著絲粒位置,可自動或手動將染色體拉直1.6、 可以創(chuàng)建用于自己染色體樣品的分類體系以增加分類的精確性,也可以對已有的分類器進行訓(xùn)練,使之與分析對象更匹配1.7、 快速校正錯放和未識別的染色體1.8、 可以編輯定義染色體標(biāo)準(zhǔn)模式圖1.9、 強大的(CASEVIEW功能,可對捕獲的中期相圖進行分類標(biāo)記,可根據(jù)需要選擇不同的中期相分別進行核型分析、染色體數(shù)目直接計數(shù)和中期染色體直接標(biāo)記1.10、 強大的多細胞平行比較(MULTICELL)功能,方便比較同一

27、或不同玻片上的同一號染色體的差異1.11、 強大的主任管理(DIRECTORREVIEW期能,方便和復(fù)查相關(guān)病例的核型結(jié)果;1.12、 可識別GRQCDAPI的顯帶分型,G帶有300、400、550、700、850條帶的分類標(biāo)準(zhǔn)、R帶有400、550條帶的標(biāo)準(zhǔn);1.13、 強大的實驗室管理、質(zhì)量控制和數(shù)據(jù)統(tǒng)計功能,可追蹤染色體分析的數(shù)量,可對各種不同類型病例進行分類統(tǒng)計。2、CytoVisionFISH熒光原位雜交分析模塊2.1、 多通道顏色采集,不限數(shù)量2.2、 可以識別出DAPI和PI染色的染色體分帶細節(jié)2.3、 可對FISH圖像的探針信號對比度調(diào)節(jié)2.4、 可對部分選擇對目標(biāo)信號單獨修飾

28、2.5、 有對信號的感興趣區(qū)采集功能2.6、 可用于探針標(biāo)記和G-帶染色體比較2.7、 可計算FISH信號的強度面積距離等2.8、 可測量P端長度比(FLPTER值2.9、 可對中期FISH圖中的信號進行定位2.10、 可對中期FISH圖進行染色體分割排列2.11、 核型圖可顯示為反轉(zhuǎn)黑白條帶(與G帶帶紋匹配)2.12、 FISH核型圖可顯示為彩色熒光圖2.13、 彩色熒光信號可明確顯示位于哪條染色體具體什么位置2.14、 強大的捕獲中和鋪貨后圖像處理功能(除常規(guī)GAMMA對比度、銳化柔化、消除等等功能外,還可以使用多種高斯數(shù)陣改變圖像顯示方式)2.15、 可手工直接對間期細胞進行分類標(biāo)記,然

29、后自動統(tǒng)計每一類細胞的數(shù)量和百分比2.16、 可在FISH圖像上添加文字和圖譜2.17、 可與染色體標(biāo)準(zhǔn)模式圖或核型圖比較2.18、 可與染色體核型圖出在一張報告上;2.19、 Z軸分層采集:每種熒光素獨立設(shè)置不同參數(shù),分別進行分層采集,然后自動合彩色圖像,層間距根據(jù)細胞大小靈活設(shè)置,層數(shù)根據(jù)目標(biāo)厚度靈活設(shè)置,探針大小可靈活設(shè)置,克服了熒光信號不在同一焦平面上倒置部分信號虛化或缺失的問題,使FISH信號點數(shù)清晰可數(shù),使FISH圖像漂亮美觀2.20、 熒光點分類計數(shù):自動搜索間期細胞、定位間期細胞、自動采集、統(tǒng)計每個間期細胞上不同熒光信號數(shù)量,統(tǒng)計融合信號,統(tǒng)計不同類細胞數(shù)量和百分比,可在掃描捕

30、獲中使用z軸分層采集3、原裝進口Dell電腦,Windows7控制系統(tǒng);22”LCD顯示屏。選配:建議核型加熒光原位雜交一起購買這樣對用戶老師使用范圍更廣,含蓋的面就比較全,如細胞中期和間期的熒光原位雜交都可以觀察,而且精度就會很高。2、LeicaBond-Max全自動免疫組化和原位雜交多功能染色機Bond-Max是一臺性能卓越的全自動免疫組化染色機,免疫組化的所有步驟-烤片、脫蠟、抗原修復(fù)、阻斷、標(biāo)記一炕、標(biāo)記二抗、顯色直到復(fù)染-都可以由Bond-Max自動完成,每個Bond-Max有3個玻片盤,同時最多可容納30張玻片,而每個玻片盤可獨立執(zhí)行不同程序3、羅氏LightCycler?480模

31、塊式高通量實時熒光定量PCR系統(tǒng)超過10年的實時定量PCR系統(tǒng)與試劑研發(fā)的豐富經(jīng)驗,凝聚成今日業(yè)界的經(jīng)典之作。先進 Therma-BaseTM熱循環(huán)技術(shù)和改良光路設(shè)計確保檢測均一性,徹底消除邊緣效應(yīng)。 可以進行高分辨率熔解曲線分析的模塊式高通量熒光定量PCR系統(tǒng)。 配合LIMS系統(tǒng)及自動進樣機械臂可實現(xiàn)遠程控制和自動化運作。準(zhǔn)確度高 動力學(xué)范圍廣,可檢測到100-1010個拷貝DNA。 重復(fù)性高,CVV0.15%。 高重復(fù)性,孔間溫度均一性可達垃1C 高分辨率,輕松區(qū)分1000與2000拷貝模板濃度差異。靈活 96孔、384孔熱循環(huán)模塊用戶自助更換。 熒光染料和試劑完全開放。 5個激發(fā)通道,6

32、個檢測通道,支持多種檢測模式。 可廣泛應(yīng)用于絕對定量、相對定量、產(chǎn)物鑒定、終點法基因分型、熔解曲線基因分型、MicroRNA研究、DNA甲基化研究、HRM基因掃描等研究。高速 反應(yīng)時間(40個循環(huán)):384孔V40分鐘,96孔V60分鐘。4、羅氏BenchMarkGX全自動多功能組織病理檢測系統(tǒng)柔性自動化使IHC、ISH和FITC載片的所有制備步驟實現(xiàn)完全自動化;可單獨或同步處理IHC、ISH和FITC檢測。靈活優(yōu)化臨床研究方案可選擇您自己的原抗體,也可選擇Ventana提供的即用型抗體可根據(jù)您的比容量/通量要求選擇一個或多個BenchMark一觸式雙色方案染色自動烤片一流技術(shù)自動烤片自動脫蠟

33、自動細胞調(diào)節(jié)自動染色5、IlluminaHiSeq2000高通量測序儀NatureGeneHiSeq2000測序涉及生物學(xué)各領(lǐng)域,包才DNA測序、RNA測序、宏基因組測序、甲基化測序、外顯子捕獲測序、ChIP-Seq等。因止匕,HiSeq2000能夠為基因調(diào)控分析、轉(zhuǎn)錄組分析、SNP位點、結(jié)構(gòu)變異分析和疾病分析等提供迅捷、龐大、準(zhǔn)確的信息數(shù)據(jù)。TermoBrite原位雜交儀一次可進行12張切片的實驗反應(yīng)艙密封禁閉,溫度適宜精確的溫控,溫室均勻一致三種固定運行模式四十種自定義編輯程序數(shù)字鍵盤操作,方便易行TermoBrite是原位雜交領(lǐng)域的領(lǐng)航者,其優(yōu)質(zhì)的性能在廣大原位雜交用戶中得到好評。嚴(yán)格溫

34、度控制 溫差在設(shè)定溫度C 超強的溫度均一性 不受切片數(shù)量影響 理想的溫度控制簡單程序設(shè)置 40種使用者自定義的程序 3種已設(shè)置運行模式 顯示屏隨時顯示實驗條件,實驗過程一目了然尺寸146mm>228mmM51mm重量8.5kg容量12張玻片功率240VAC1.6A處理時間可持續(xù)0-100小時溫度控制溫度范圍30-99C環(huán)境溫度5-40C7、力康HFsafe-1200ClassRTypeA2生物安全柜HealForce做為中國最早和最權(quán)威的生物安全柜品牌之一,一直憑借優(yōu)異的產(chǎn)品品質(zhì)、良好的用戶口碑和專業(yè)的售后服務(wù)品質(zhì)深得全球100多個國家用戶的肯定,是中華人民共和國醫(yī)藥行業(yè)YY0569-2

35、005生物安全柜產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)白主要起草單位。HealForce品牌生物安全柜在中國各級疾病控制中心、醫(yī)院臨檢系統(tǒng)和科研院所系統(tǒng)是廣大科研工作者進行生物安全研究的重要防護屏障。8、Neofuge1600Healforce臺式高速冷凍大容量離心機HEALFORCE是中國唯家同時獲得德國TUVISO9001質(zhì)量管理體系認(rèn)證和歐盟CE產(chǎn)品質(zhì)量認(rèn)證的離心機品牌,全系列產(chǎn)品獲得中國SFDA認(rèn)證的品牌,是全球首家采用“StrongDrive'驅(qū)動軸技術(shù)、真正掌握膨脹閥反饋調(diào)節(jié)制冷技術(shù)以及離心機轉(zhuǎn)子硬質(zhì)陽極氧化處理工藝的離心機品牌,采用德國的工藝技術(shù),優(yōu)質(zhì)的售后服務(wù),多年的客戶好評,保證了絕對的市場占有率

36、。最高車t速16000rpm最大容量4X100ml最大離心力24900Xg驅(qū)動系統(tǒng)無碳刷變頻電機溫度控制范圍10C40C/-溫度控制精度+1C時間設(shè)定9h59min內(nèi)重量79/58Kg外形尺寸(長嫡高)580X520X315mmHealForceNeofuge15臺式高速離心機第五部分分子病理實驗室推薦型號及預(yù)算方案一初級配置方案序號設(shè)備品牌型號單價數(shù)量金額備注01熒光顯微鏡成像分析系統(tǒng)奧林巴斯BX41或者NIKONEclipse50i或者國產(chǎn)3900001390000低端顯微鏡國產(chǎn)CCD熒光激發(fā)器國產(chǎn)軟件02恒溫加熱平臺常州菲普DB-3A型650016500高溫變性及烤片用03電熱恒溫水槽常

37、州菲普SHA-CA型11000111000洗滌用04電熱恒溫培養(yǎng)箱上海精宏DNP-9052型460014600雜交用05生物安全柜上海力康HFsafe900A22680012680006PCR擴增儀Hema9600基因打增儀47000147000合計485900(適合二級醫(yī)院,標(biāo)本量少,常規(guī)檢測,不涉及科研)方案二專業(yè)性配置方案序號設(shè)備品牌型號單價數(shù)量金額備注01熒光顯微鏡成像分析系統(tǒng)德國LeicaDM250005700001570000生物顯微鏡雙速單色冷CCD5位熒光濾塊軟件CytoVisionkaryotyping02原位雜交儀美國StatSpinThermobrite890001790

38、0003臺式局速離心機國產(chǎn)3200013200004實時熒光定量PCR凱杰Rotor-GeneQ6plex360000136000005生物安全柜上海力康HFsafe-1200TE380001380001089000適合三級醫(yī)院病理科方案三科研型配置方案序號設(shè)備品牌型號單價數(shù)量金額備注01熒光顯微鏡成像分析系統(tǒng)德國LeicaDM40007500001750000智能顯微鏡高端配置02原位雜交儀美國StatSpinThermobrite8900018900003臺式局速冷凍離心機國產(chǎn)4000014000004實時熒光定量PCR羅氏LightCycler?4806800001680000最先進的P

39、CR05生物安全柜上海力康HFsafe-1200TE3800013800006基因測序儀IlluminaHiSeq2000270萬1選配1597000適合綜合性醫(yī)院病理科,承擔(dān)科研項目。第六部分分子病理常用試劑及價格序號名稱規(guī)格單位生產(chǎn)廠家中標(biāo)價1丙肝病毒熒光定量檢測10人份盒中山大學(xué)達安基因760.002結(jié)核桿菌DNA-PCR20T(定量)盒中山大學(xué)達安基因760.003乙肝病毒PCR熒光定量20T(定量)盒中山大學(xué)達安基因760.004乙肝病毒PCR熒光質(zhì)控低值300ul*7盒中山大學(xué)達安基因70.005BCR/ABL融合基因檢測試劑盒10人份盒北京金菩嘉醫(yī)療科技4520.006EGFR基

40、因擴增檢測盒10人份盒北京金菩嘉醫(yī)療科技7000.007EGFR基因突變檢測盒10人份盒北京金菩嘉醫(yī)療科技4250.008HER-2基因擴增檢測盒20人份盒北京金菩嘉醫(yī)療科技18000.009TOP2A基因異常檢測盒10人份盒北京金菩嘉醫(yī)療科技7000.0010膀胱癌細胞染色體及基因異常10人份盒北京金菩嘉醫(yī)療科技10540.0011子宮頸細胞TERC位點擴增10人份盒北京金菩嘉醫(yī)療科技3680.0012kras基因突變檢測盒10人份盒北京金菩嘉醫(yī)療科技11800.0013VysisSS18BreakApartFISHProbeKit(CE)150ul+20ul包vysis12694.0014

41、N-MYCSpectrumGreen(2p24)/CEP2SpectrumOrangeProbe150ul+20ul包vysis19231.0015EWSR1(22q12)DualColor,BreakApartRearrangementProbe150ul+20ul包vysis12681.00161p36/LSI1q25andLSI19q13/19p13DualColor1000ul*2包vysis21023.00Probe17IGH/MYC,CEP8Tri-color,DualFusionTranslocationProbe150ul+20ul包vysis12925.0018IGH/MAL

42、T1t(14;18)(q32;q21)DualColor,DualFusionTranslocationProbe,20uL150ul+20ul包vysis13124.0019IGH/CCND1DualColor,DualFusionTranslocationProbe150ul+20ul包vysis12925.0020IGH/BCL2DualColor,DualFusionTranslocationProbe(CE)200ul+200ul盒vysis12925.0021TaqMan預(yù)混試劑盒200R盒ABI美國生物應(yīng)用5170.00FISH技術(shù)其他試劑及耗材編p說明編p說明試齊Ij1二甲苯(

43、脫蠟)2無水乙醇(脫蠟脫水、老化)3蛋白酶K(組織切片消化)4胃蛋白酶(細胞滴片消化)520XSSC(預(yù)處理及洗滌)620XPBS(配制蛋白酶K溶液、樣本處理)7SDS(配制蛋白酶K溶液)8NP-40(雜交后洗滌)9聚乙二醇1500(細胞保存液)10KCl(低滲液)11甲醇(固定液)12:冰醋酸(固定液)13鹽酸(配胃蛋白酶溶液)14多聚甲醛(固定液)15NaOH(配多聚甲醛固定液)16MgCb(配多聚甲醛固定液)17甲酰胺(洗脫液)18:純化水或蒸儲水(配制溶液)耗材1防脫載玻片(經(jīng)多聚賴氨酸或硅膠處理)2圓形玻璃染色缸3pH計及pH試紙(測量溫度)4蓋玻片(22mm<22mm5鐐子6:橡皮膠(封片用,牙膏狀

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