酶催化反應(yīng)動(dòng)力學(xué) (生物化學(xué))._第1頁(yè)
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1、Chapter 9 Enzyme kinetics第一節(jié)第一節(jié) 底物濃度對(duì)酶促反應(yīng)速率的影響底物濃度對(duì)酶促反應(yīng)速率的影響 第二節(jié)第二節(jié) pHpH對(duì)酶反應(yīng)速率的影響對(duì)酶反應(yīng)速率的影響 第三節(jié)第三節(jié) 溫度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響溫度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響第四節(jié)第四節(jié) 酶濃度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響酶濃度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響第五節(jié)第五節(jié) 激活劑對(duì)酶反應(yīng)速率的影響激活劑對(duì)酶反應(yīng)速率的影響第六節(jié)第六節(jié) 酶的抑制劑酶的抑制劑 第一節(jié)第一節(jié) 底物濃度對(duì)酶促反應(yīng)速率的影響底物濃度對(duì)酶促反應(yīng)速率的影響 (1 1)當(dāng)?shù)孜餄舛刃r(shí),酶未被底物飽和,反應(yīng))當(dāng)?shù)孜餄舛刃r(shí),酶未被底物飽和,反應(yīng)速率取快于底物濃度,為一級(jí)反應(yīng);速率取快于底

2、物濃度,為一級(jí)反應(yīng);(2 2)底物濃度變大,)底物濃度變大,ESES生成較多,反應(yīng)速率取生成較多,反應(yīng)速率取快于快于ESES的濃度,為混合級(jí)反應(yīng);的濃度,為混合級(jí)反應(yīng);(3 3)當(dāng)?shù)孜餄舛认喈?dāng)高時(shí),酶全部被底物飽和,)當(dāng)?shù)孜餄舛认喈?dāng)高時(shí),酶全部被底物飽和,反應(yīng)速度不會(huì)因底物濃度增加而提高,反應(yīng)為反應(yīng)速度不會(huì)因底物濃度增加而提高,反應(yīng)為0 0級(jí)。級(jí)。 為了要解釋這一現(xiàn)象,為了要解釋這一現(xiàn)象, 19031903年由年由HenriHenri和和WurtzWurtz提提出了中間絡(luò)合物學(xué)說(shuō)出了中間絡(luò)合物學(xué)說(shuō):當(dāng)酶催化某一化學(xué)反應(yīng)時(shí),酶:當(dāng)酶催化某一化學(xué)反應(yīng)時(shí),酶首先與底物結(jié)合生成中間復(fù)合物(首先與底物結(jié)

3、合生成中間復(fù)合物(ESES),然后生成產(chǎn)),然后生成產(chǎn)物(物(P P),并釋放出酶:),并釋放出酶: 一中間絡(luò)合物學(xué)說(shuō):一中間絡(luò)合物學(xué)說(shuō): E + S ES E + PK3K4K1K2 MichaelisMichaelis & Menten & Menten推導(dǎo)米氏方程。推導(dǎo)米氏方程。 二酶促反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)方程式二酶促反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)方程式 1. 1. 米氏方程的推導(dǎo)米氏方程的推導(dǎo)V =Vmax S Km + S KsKsKs為為ESES的解離常數(shù)的解離常數(shù)(Ks=kKs=k2 2/k/k1 1) 二酶促反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)方程式二酶促反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)方程式 E + S ES E + PK3K4K1K2EE 酶

4、總量;酶總量; E Et t 反應(yīng)后反應(yīng)后t t時(shí)的酶量;時(shí)的酶量;ESES 中間產(chǎn)物濃度中間產(chǎn)物濃度Et E-ESE-ES19251925年年Briggs and HaldaneBriggs and Haldane提出了穩(wěn)態(tài)理論,對(duì)米提出了穩(wěn)態(tài)理論,對(duì)米氏方程做了修正氏方程做了修正 : (1 1)反應(yīng)分二步進(jìn)行:)反應(yīng)分二步進(jìn)行:(2)(2)反應(yīng)體系處于穩(wěn)態(tài)反應(yīng)體系處于穩(wěn)態(tài) 即即ESES不變不變 ES ES的生成量的生成量 = ES= ES的分解量。的分解量。剛反應(yīng)時(shí),若剛反應(yīng)時(shí),若ESES形成的速度為形成的速度為v v1 1, ,則則v v1 1 k k1 1 EEt t SS k k1

5、1 (E E)- -(ESES)S (1)S (1)ESES消失速度消失速度v v2323 :v v2 2 k k2 2ES; vES; v3 3 k k3 3ESESv v23 23 k k2 2 ESES k k3 3ES ES (k k2 2 k k3 3)ES (2) ES (2) ESES的生成量的生成量 = ES= ES的分解量的分解量即:即:v v1 1 =v=v2323k k1 1 (E E)- -(ESES)S S = ES = ES (k k2 2 k k3 3) (E E)- -(ESES)S/ S/ ES = ES = (k k2 2 k k3 3)/ k/ k1 1

6、(3) (3)設(shè)設(shè) K Km m=(k=(k2 2+k+k3 3)/k)/k1 1 將將(3)(3)重排得重排得ES =ES/ KES =ES/ Km m S S (4)(4)當(dāng)當(dāng)S ES E時(shí),即時(shí),即E =ES,E =ES,v=Vmax = Kv=Vmax = K3 3ES= KES= K3 3E E (7 7)將(將(7 7)式代入()式代入(6 6)式)式v=kv=k3 3ES ES (5 5)v=kv=k3 3ES / Km ES / Km SS (6 6)V =Vmax S Km + S KmKm米氏常數(shù)米氏常數(shù),當(dāng)酶反應(yīng)速率達(dá)到最大反應(yīng)速率一半時(shí)的底,當(dāng)酶反應(yīng)速率達(dá)到最大反應(yīng)速率

7、一半時(shí)的底物濃度,單位:物濃度,單位:mol/Lmol/L; Km=Km= (k (k2 2+k+k3 3)/k)/k1 1 Km Km是酶的特征常數(shù),近似表示酶與底物的親和力。是酶的特征常數(shù),近似表示酶與底物的親和力。(1 1)當(dāng))當(dāng)SSKmKm時(shí),反應(yīng)速率與底物濃度成正比,時(shí),反應(yīng)速率與底物濃度成正比,v v與與SS的的關(guān)系符合一級(jí)動(dòng)力學(xué)。酶沒(méi)有全部被底物所飽和。關(guān)系符合一級(jí)動(dòng)力學(xué)。酶沒(méi)有全部被底物所飽和。(2 2)當(dāng))當(dāng)SSKmKm時(shí),反應(yīng)速率已達(dá)到最大速率,這時(shí)酶全部時(shí),反應(yīng)速率已達(dá)到最大速率,這時(shí)酶全部被底物所飽和,被底物所飽和,v v與與SS無(wú)關(guān),符合無(wú)關(guān),符合0 0級(jí)動(dòng)力學(xué),只有

8、在此級(jí)動(dòng)力學(xué),只有在此條件下才能正確測(cè)得酶活力。條件下才能正確測(cè)得酶活力。(3 3)當(dāng))當(dāng)S=KmS=Km時(shí),反應(yīng)速率為最大速率的一半,因此時(shí),反應(yīng)速率為最大速率的一半,因此KmKm就就代表反應(yīng)速率達(dá)到最大反應(yīng)速率一半時(shí)的底物濃度。代表反應(yīng)速率達(dá)到最大反應(yīng)速率一半時(shí)的底物濃度。 SKm 2. 2.動(dòng)力學(xué)參數(shù)動(dòng)力學(xué)參數(shù)的意義的意義 (1 1)米氏常數(shù)的意義:)米氏常數(shù)的意義: KmKm是酶的一個(gè)特性常數(shù):是酶的一個(gè)特性常數(shù): KmKm可以判斷酶的專(zhuān)一性和天然底物:可以判斷酶的專(zhuān)一性和天然底物: 若已知某個(gè)酶的若已知某個(gè)酶的KmKm,就可計(jì)算出在,就可計(jì)算出在某一底物濃度時(shí)的反應(yīng)速率相當(dāng)于某一底物

9、濃度時(shí)的反應(yīng)速率相當(dāng)于VmaxVmax的百分?jǐn)?shù)。的百分?jǐn)?shù)。 KmKm可以幫助推斷某一代謝反應(yīng)的方可以幫助推斷某一代謝反應(yīng)的方向和途徑:向和途徑:(2 2)VmaxVmax和和k k3 3(kcatkcat)的意義:)的意義: 當(dāng)當(dāng)SS很大時(shí),很大時(shí),Vmax = kVmax = k3 3EE,說(shuō)明,說(shuō)明VmaxVmax與與EE成成線性關(guān)系,而直線的斜率為線性關(guān)系,而直線的斜率為k k3 3,為一級(jí)反應(yīng)速率常數(shù)。,為一級(jí)反應(yīng)速率常數(shù)。K K3 3表示當(dāng)酶被底物飽和時(shí)每秒鐘每個(gè)酶分子轉(zhuǎn)換底物表示當(dāng)酶被底物飽和時(shí)每秒鐘每個(gè)酶分子轉(zhuǎn)換底物的分子數(shù),這個(gè)常數(shù)又叫做的分子數(shù),這個(gè)常數(shù)又叫做轉(zhuǎn)換數(shù)(轉(zhuǎn)換數(shù)(

10、TNTN),),通稱(chēng)為通稱(chēng)為催催化常數(shù)(化常數(shù)(kcatkcat),),kcatkcat越大,表示酶的催化效率越高。越大,表示酶的催化效率越高。(3 3)k kcatcat/Km/Km的意義:在生理?xiàng)l件下,大多數(shù)酶的意義:在生理?xiàng)l件下,大多數(shù)酶并不被底物所飽和,在體內(nèi)并不被底物所飽和,在體內(nèi)S/KmS/Km的比值通常的比值通常介于介于0.01-1.00.01-1.0之間。之間。 Vmax=kVmax=kcatcatEET T 當(dāng)當(dāng)SKmSESE,酶反應(yīng),酶反應(yīng)速度達(dá)到最大反應(yīng)速度。速度達(dá)到最大反應(yīng)速度。 當(dāng)當(dāng) SESE,由于由于V Vmaxmax=kE=kE0,反應(yīng)速度與酶反應(yīng)速度與酶濃度成正

11、比。濃度成正比。 酶濃度曲線酶濃度曲線第五節(jié)第五節(jié) 激活劑對(duì)酶反應(yīng)速度的影響激活劑對(duì)酶反應(yīng)速度的影響激活劑:能提高酶活性的物質(zhì)。激活劑:能提高酶活性的物質(zhì)。 無(wú)機(jī)離子:無(wú)機(jī)離子: 主要是金屬離子,它們有的本身就是酶的輔主要是金屬離子,它們有的本身就是酶的輔助因子,有的是酶的輔助因子的必要成分。助因子,有的是酶的輔助因子的必要成分。 如如: : 激酶需要激酶需要MgMg2+2+激活激活 唾液淀粉酶需要唾液淀粉酶需要ClCl- -激活激活主要的激活劑有:主要的激活劑有: 有機(jī)小分子:有機(jī)小分子: 一些還原劑,如抗壞血酸、半胱氨酸,使含一些還原劑,如抗壞血酸、半胱氨酸,使含-SH-SH的酶處于還原態(tài)

12、的酶處于還原態(tài) 金屬螯合劑,如金屬螯合劑,如EDTA(EDTA(乙二胺四乙酸乙二胺四乙酸) ),可絡(luò)合,可絡(luò)合一些重金屬雜質(zhì),解除它們對(duì)酶的抑制,從而使酶一些重金屬雜質(zhì),解除它們對(duì)酶的抑制,從而使酶活升高?;钌摺R种谱饔茫河行┪镔|(zhì)與酶結(jié)合后,引起酶的活性中心抑制作用:有些物質(zhì)與酶結(jié)合后,引起酶的活性中心或必需基團(tuán)的化學(xué)性質(zhì)發(fā)生改變,從而使或必需基團(tuán)的化學(xué)性質(zhì)發(fā)生改變,從而使酶活力降低或喪失。酶活力降低或喪失。第六節(jié)第六節(jié) 酶的抑制劑酶的抑制劑抑制作用:抑制作用:失活作用:凡可使酶蛋白變性而引起酶活力失活作用:凡可使酶蛋白變性而引起酶活力喪失的作用。喪失的作用。抑制作用:凡使酶活力下降,但并不

13、引起酶抑制作用:凡使酶活力下降,但并不引起酶蛋白變性的作用。蛋白變性的作用。抑制劑:能引起對(duì)酶的抑制作用的物質(zhì)。抑制劑:能引起對(duì)酶的抑制作用的物質(zhì)。 可逆抑制作用可逆抑制作用不可逆抑制作用不可逆抑制作用二類(lèi)抑制用途的鑒別?二類(lèi)抑制用途的鑒別?抑制程度的表示方法:一般用反應(yīng)速率的變化來(lái)表示。抑制程度的表示方法:一般用反應(yīng)速率的變化來(lái)表示。不加抑制劑時(shí)的反應(yīng)速率為不加抑制劑時(shí)的反應(yīng)速率為v v0 0,加入抑制劑后的反應(yīng),加入抑制劑后的反應(yīng)速率為速率為v vi i,則表示:,則表示:(1 1)相對(duì)活力分?jǐn)?shù)(殘余活力分?jǐn)?shù)):)相對(duì)活力分?jǐn)?shù)(殘余活力分?jǐn)?shù)): a = va = vi i / v / v0

14、 0(2 2)相對(duì)活力百分?jǐn)?shù)(殘余活力百分?jǐn)?shù)):)相對(duì)活力百分?jǐn)?shù)(殘余活力百分?jǐn)?shù)): a % = va % = vi i / v / v0 0 100%100%(3 3)抑制分?jǐn)?shù):指被抑制而失去活力的分?jǐn)?shù))抑制分?jǐn)?shù):指被抑制而失去活力的分?jǐn)?shù) i = 1i = 1a = 1a = 1v vi i / v / v0 0(4 4)抑制百分?jǐn)?shù))抑制百分?jǐn)?shù)( (抑制率抑制率) ): i % = i % = (1 1a a)% = % = (1 1v vi i / v / v0 0)% % 可逆抑制作用可分為三種類(lèi)型:可逆抑制作用可分為三種類(lèi)型: 1. 1. 競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用 2. 2. 非競(jìng)

15、爭(zhēng)性抑制作用非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用 3. 3. 反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用 酶與抑制劑非共價(jià)地可逆結(jié)合,當(dāng)用透析或超酶與抑制劑非共價(jià)地可逆結(jié)合,當(dāng)用透析或超濾等方法除去抑制劑后酶的活性可以恢復(fù),這種抑濾等方法除去抑制劑后酶的活性可以恢復(fù),這種抑制作用叫可逆抑制作用。制作用叫可逆抑制作用。( (一)可逆抑制作用一)可逆抑制作用 某些抑制劑的化學(xué)結(jié)構(gòu)與底物相似,與底物某些抑制劑的化學(xué)結(jié)構(gòu)與底物相似,與底物競(jìng)爭(zhēng)酶的活性中心并與之結(jié)合,從而減少了酶與競(jìng)爭(zhēng)酶的活性中心并與之結(jié)合,從而減少了酶與底物的結(jié)合,因而降低酶反應(yīng)速度。這種作用稱(chēng)底物的結(jié)合,因而降低酶反應(yīng)速度。這種作用稱(chēng)為競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用。為競(jìng)爭(zhēng)性抑

16、制作用。1. 1. 競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用例如,丙二酸是琥珀酸脫氫酶的競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑。例如,丙二酸是琥珀酸脫氫酶的競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑。 這種抑制作用可通過(guò)增加底物濃度而使整這種抑制作用可通過(guò)增加底物濃度而使整個(gè)反應(yīng)平衡向生成產(chǎn)物的方向移動(dòng),因而能削個(gè)反應(yīng)平衡向生成產(chǎn)物的方向移動(dòng),因而能削弱或解除這種抑制作用。弱或解除這種抑制作用。 琥珀酸琥珀酸延胡索酸延胡索酸丙二酸丙二酸S)/ I (1SVvimmaxKKEIIEiKmaximaxV1S1) I 1 (V1KKvmLineweveryLinewevery-Burk-Burk圖圖 米氏方程Lineweaver-Burk plot of compe

17、titive inhibition競(jìng)爭(zhēng)性抑制中,競(jìng)爭(zhēng)性抑制中,VmaxVmax不變,不變,KmKm增大增大可通過(guò)增加底物濃度可通過(guò)增加底物濃度而使整個(gè)反應(yīng)平衡向而使整個(gè)反應(yīng)平衡向生成產(chǎn)物的方向移動(dòng),生成產(chǎn)物的方向移動(dòng),因而能削弱或解除這因而能削弱或解除這種抑制作用。種抑制作用。 某些抑制劑結(jié)合在酶活性中心以外的部位,某些抑制劑結(jié)合在酶活性中心以外的部位,因而與底物和酶的結(jié)合無(wú)競(jìng)爭(zhēng),即底物與酶結(jié)合因而與底物和酶的結(jié)合無(wú)競(jìng)爭(zhēng),即底物與酶結(jié)合后還能與抑制劑結(jié)合,同樣抑制劑與酶結(jié)合后還后還能與抑制劑結(jié)合,同樣抑制劑與酶結(jié)合后還能與底物結(jié)合。但酶分子上有了抑制劑后其催化能與底物結(jié)合。但酶分子上有了抑制劑

18、后其催化功能基團(tuán)的性質(zhì)發(fā)生改變,從而降低了酶活性。功能基團(tuán)的性質(zhì)發(fā)生改變,從而降低了酶活性。這種作用稱(chēng)為非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用。這種作用稱(chēng)為非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用。 2. 2. 非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用這種抑制作用不能用增加底物濃度的方法來(lái)消除。這種抑制作用不能用增加底物濃度的方法來(lái)消除。 非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑,非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑,例如:金屬絡(luò)合劑,如例如:金屬絡(luò)合劑,如:EDTA:EDTA、F F - -、CNCN - -、N N3 3- - 等,可以絡(luò)合金屬酶中的金屬離子,從而抑制等,可以絡(luò)合金屬酶中的金屬離子,從而抑制酶的活性。酶的活性。Noncompetitive inhibitionNoncompetitive inhibition)S)(/ I (1SVmimaxKKv) I 1 (V11) I 1 (V1imaximaxKSKKvmLineweveryLinewevery-Burk-Burk圖圖 非競(jìng)爭(zhēng)性抑制中,非競(jìng)爭(zhēng)性抑制中,VmaxVmax變小,變小,KmKm

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