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1、GelRed核酸染料(10,000 x水溶液)GelRed核酸染料特點無毒性:GelRed獨特的油性和大分子量特點使其不能穿透細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),艾姆斯氏試驗結(jié)果也表明,該染料的誘變性遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于EB。靈敏度高:適用于各種大小片段的電泳染色,對核酸遷移的影響小于SYBRGreenI。穩(wěn)定性高:適用于使用微波或其它加熱方法制備瓊脂糖凝膠;室溫下在酸或堿緩沖液中極其穩(wěn)定,耐光性強。信噪比高:樣品熒光信號強,背景信號低。操作簡單:與EB一樣,在預(yù)制膠和電泳過程中染料不降解;而電泳后染色過程也只需30分鐘且無需脫色或沖洗,即可直接用紫外凝膠透射儀觀察。適用范圍廣:可選擇電泳前染色(膠染法)或電泳后染色(泡染
2、法);適用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠電泳;可用于dsDNA或ssDNA或RNA染色。無需改變?yōu)V光片及觀察裝置:標(biāo)準(zhǔn)的EB濾光片或SYBR濾光片都適用,使用與觀察EB相同的普通紫外凝膠透射儀觀察即可,在300nm紫外光附近可得到最佳激發(fā)。GelRed使用方法簡介膠染法(用法同EB)(推薦方法)(1)制膠時加入GelRed核酸染料。每50mL膠中加入5yLGelRed核酸染料。(2)按照常規(guī)方法進(jìn)行電泳即可。注:此方法染色染料用量相對較少。500gL染料大約可以做100塊50mL的膠。當(dāng)染料稀釋在TBE或者類似的電泳緩沖溶液中時可以使用微波爐加熱,從而與通常制備預(yù)制凝膠的方法相同。含有染料的預(yù)制
3、凝膠可以成批制備,并可以長期保存直到使用。泡染法(1)按照常規(guī)方法進(jìn)行電泳。(2)用0.1M的NaCl水溶液按照3300:1的比例稀釋GelRed濃縮液,混勻,制成3xGelRed染色溶液。(例如:在45mL水溶液中加入5mL1M的NaC1溶液及15gL10,000 xGelRed水溶液。)(3)將染色溶液倒入合適的聚丙烯容器中,放入凝膠,用鋁箔等蓋住容器使染料避光。室溫振蕩染色30分鐘左右,染色時間因凝膠濃度和厚度而定。聚丙烯酰胺凝膠直接在玻璃平皿上染色,將配好的稀釋溶液輕輕地倒在膠板上,讓稀釋液均勻地覆蓋整個膠板,并染色30分鐘。玻璃平皿必須預(yù)先經(jīng)過硅烷化溶液處理(避免染料吸附在玻璃表面上)。注:用泡染法染色時,染料用量較多。單次制備的染色溶液可重復(fù)使用3次左右。幾種核酸染料比較名稱靈敏度穩(wěn)定性適用性安全性價格GelRed高高通用大小片段電泳染色美國安全認(rèn)定無毒中GelGreenI高高通用大小片段電泳染色美國安全認(rèn)定無毒中SYBRGreenI極咼稍差lOObp以上片段電泳染色花菁染料,低毒高SYBRGreenII極咼稍差單鏈核酸分子電泳染色花菁染料,低毒高GoldViewI低高500bp以上片段電泳染色認(rèn)定不清低EB低高lOObp以上片段電泳染色強致癌,強誘變低特
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