生物專業(yè)的軟件介紹

1、生物專業(yè)的軟件介紹三維分子類 HYPERLINK /3d/rasmol.htm RASMOL 2.7.5觀看生物分子3D微觀立體結(jié)構(gòu)的軟件。 HYPERLINK /3d/rastop.htm RasTop 2.2為RasMol的圖形用戶界面軟件，免費，簡化RASMOL的使用。 HYPERLINK /3d/DSViewerPro.htm DS Visualizer 3.03維分子瀏覽工具，30天試用版， 功能也十分強大。 HYPERLINK /3d/ICMBrowser.htm ICM-Browser 3.7 2a3維分子瀏覽工具，并具有序列比對顯示功能，免費推出。 HYPERLINK /3d/

2、activeICM.htm ActiveICM 1.1.4可在Office軟件和瀏覽器中顯示查看三維ICM分子圖片文件軟件。 HYPERLINK /3d/vmd.htm VMD 1.9用來顯示生物分子的微觀立體結(jié)構(gòu)，更棒的功能是可以利用內(nèi)建的功能，做出動畫效果。 HYPERLINK /3d/cn3d.htm CN3D 4.1See in 3D的縮寫。允許你在線作為客戶端可視并交互地觀察NCBI Entrez數(shù)據(jù)庫的立體蛋白序列。 HYPERLINK /3d/wpdb.htm WPDB 2.2美國國家計算機科學(xué)與工程學(xué)實驗室開發(fā)的基于Windows的PDB文件查詢與處理分析軟件。 HYPERLI

3、NK /3d/dtmm.htm DTMM 4.2 Demo是一個簡單易用的3維分子模型顯示、編輯與構(gòu)建程序。 HYPERLINK /3d/gopenmol.htm gopenmol 3.0是一個顯示并分析分子結(jié)構(gòu)及其特性，計算分子軌道、電子勢的軟件包。 HYPERLINK /3d/povray.htm POV-Ray 3.7b38是一個高質(zhì)量、完全免費創(chuàng)造最棒三維圖像的非常有名的工具。 HYPERLINK /3d/MegaPov.htm MegaPov 1.2.1 r3 是Pov-Ray非官方編譯版本，三維渲染效果更好。需要安裝Pov-Ray。 HYPERLINK /3d/mol2mol.ht

4、m Mol2Mol 5.6.2 Demo主要用來進行各種分子文件的轉(zhuǎn)換，支持30種主要分子格式，也可以用來進行3維分子的簡單顯示。 HYPERLINK /3d/molpov.htm MolPOV 2.0.8MolPOV是PDB格式至POV格式轉(zhuǎn)化工具。 HYPERLINK /3d/povchem.htm PovChem 2.1.1免費軟件，注冊碼：APyUrblJnYZr，將PDB格式分子文件轉(zhuǎn)化為POV格式，再使用POV-Ray v3.1g進行3D加工。 HYPERLINK /3d/Ortep.htm ORTEP-III 2.02 用來生成分子的熱橢圓形點圖。 HYPERLINK /3d/p

5、wt.htm PWT(PLATON for Windows Taskbar) 1.15PLATON是通用結(jié)晶學(xué)軟件工具。 HYPERLINK /3d/mage.htm Mage 6.47讀取并演示Kinemage格式文件的專用軟件。 HYPERLINK /3d/Prekin.htm Prekin 6.42將PDB格式文件轉(zhuǎn)換為對應(yīng)的kinemage格式的專用軟件。 HYPERLINK /3d/KiNG.htm KiNG 2.17(Kinemage, Next Generation)的縮寫。三維分子Kinemage的顯示軟件。 HYPERLINK /3d/pdbviewer.htm Swiss-

6、PdbViewer 4.01是一個界面非常友好的同時分析幾個蛋白PDB文件。 HYPERLINK /3d/StrukEd.htm StrukEd Demo化學(xué)分子編輯與三維模型生成軟件StrukEd Demo。 HYPERLINK /3d/jmvc.htm JMVC 4 041122版Java3D Molecular Visualisation System 的縮寫，使用JAVA技術(shù)編寫的三維分子查看器。 HYPERLINK /3d/review.htm Re_View 1.0 為讀取及分析XYZ格式三維分子文件的軟件。 HYPERLINK /3d/OscailX.htm Oscail X 2

7、010用來處理、定義與檢查小分子單晶的軟件包。 HYPERLINK /3d/MoilinX.htm Moilin X 2010分子構(gòu)建與觀察軟件，是Tinker軟件的Windows界面程序。 HYPERLINK /3d/tinker.htm Tinker 5.1為DOS下的分子設(shè)計建模軟件，可使用許多常用參數(shù)集。 HYPERLINK /3d/Biodesigner.htm Biodesigner 0.75免費的分子建模與顯示軟件，支持多種三維分子格式。 HYPERLINK /3d/MoluCAD.htm MoluCAD 1.034 Demo分子建模與顯示工具軟件演示版。 HYPERLINK /

8、3d/qmol.htm Qmol 4.01含源代碼。一個基于OpenGL的三維分子顯示軟件。 HYPERLINK /3d/pe.htm Protein Explorer 2.80顯示蛋白和核酸等大分子三維結(jié)構(gòu)的免費瀏覽器插件，是RASMOL衍生出的軟件，速度快。 HYPERLINK /3d/Chimera.htm Chimera 1.5.3免費的交互式分子模型顯示程序。 HYPERLINK /3d/Jmol.htm Jmol 12.0.12java語言寫成的開放源代碼的免費三維分子顯示程序。 HYPERLINK /3d/rpe.htm Ramachandran Plot Explorer 1.

9、0 蛋白分子顯示軟件。 HYPERLINK /3d/ps.htm ProteinScope LE 1.0.5免費PDB蛋白三維顯示軟件，需要系統(tǒng)支持 DirectX 9.0b。 HYPERLINK /3d/CHIME.htm CHIME 2.6 SP8IE與NetScape瀏覽器插件,安裝后,可以直接用瀏覽器觀看PDB格式的文件。 HYPERLINK /3d/YASARA.htm YASARA View 9.11.22是免費分子顯示軟。 HYPERLINK /3d/noc.htm NOC 3.01免費的蛋白3維結(jié)構(gòu)構(gòu)建、顯示、分析軟件。 HYPERLINK /3d/3dna.htm 3DNA

10、1.5分析、構(gòu)建、顯示核酸三維結(jié)構(gòu)的軟件。軟件需要Cygwin環(huán)境。 HYPERLINK /3d/ArgusLab.htm ArgusLab 4.0.1分子構(gòu)型、繪圖和藥物設(shè)計軟件。 HYPERLINK /3d/CueMol.htm CueMol 96免費的分子結(jié)構(gòu)顯示和三維渲染軟件。 HYPERLINK /3d/jimp.htm jimp 2 0.091顯示三維分子軟件。 HYPERLINK /3d/smg.htm SweetMollyGrace 1.3三維分子渲染與動畫軟件?？勺x取各種三維格式的文件。 HYPERLINK /3d/facio.htm Facio 14.3.1三維分子建模、顯

11、示與量子化學(xué)計算程序。 HYPERLINK /3d/vega.htm VEGA ZZ 2.3.2支持多種三維格式并可進行顯示、計算、分析的免費軟件。 HYPERLINK /3d/gdis.htm GDIS 0.90三維分子顯示軟件。 HYPERLINK /3d/PDBlib.htm PDBlib 2.2顯示PDB文件的C+庫，可用于編程。 HYPERLINK /3d/agm.htm Ascalaph 1.7.7 Demo 三維分子顯示軟件 和分子設(shè)計建模軟件。 HYPERLINK /3d/QuteMol.htm QuteMol 0.4.1開源的三維分子顯示軟件。 HYPERLINK /3d/b

12、allview.htm BALLView 2.0-r1分子三維建模、顯示軟件 HYPERLINK /3d/bioeditor.htm bioeditor 1.6.1 HYPERLINK /3d/bioeditor.htm BioViewer 1.5.7三維分子結(jié)構(gòu)編輯軟件和三維分子結(jié)構(gòu)顯示軟件 HYPERLINK /3d/proteinshader.htm ProteinShader beta 0.9.4蛋白三維分子顯示渲染工具 HYPERLINK /3d/pdbeditor.htm PDB Editor 090203界面友好的PDB文件編輯器 HYPERLINK /3d/zodiac.htm

13、 Zodiac 0.65用于藥物設(shè)計的分子三維建模軟件包 HYPERLINK /3d/mmPDBViewer.htm mmPDBViewer 200 PDB分子三維顯示軟件 HYPERLINK /3d/avogadro.htm Avogadro 1.0.1免費三維分子編輯器 。 HYPERLINK /3d/bioclipse.htm Bioclipse 2.4.0生物信息學(xué)分子顯示平臺。 HYPERLINK /3d/antheprot3d.htm ANTHEPROT 3D 1.0.162蛋白三維結(jié)構(gòu)查看軟件 。 HYPERLINK /3d/chem3d.htm Chemis3D 2.89b三維

14、分子網(wǎng)頁顯示Java小程序。 HYPERLINK /3d/Chemitorium.htm Chemitorium 3.0三維分子分析與現(xiàn)實工具軟件。 HYPERLINK /3d/LigandScout.htm LigandScout 3.01用三維模型高分子 / 配合物構(gòu)建藥效團模型結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)工具軟件。 HYPERLINK /3d/autodock.htm AutoDock 4.2.3小分子三維建模軟件 。 HYPERLINK /3d/bench3d.htm Benchware 3D Explorer 2.6三維分子顯示分析軟件。 HYPERLINK /3d/pyrx.htm PyRx 0.7三

15、維分子藥物輔助設(shè)計軟件。 HYPERLINK /3d/visprot3ds.htm VisProt3DS 2.0觀察蛋白質(zhì)和DNA分子PDB結(jié)構(gòu)軟件 。 HYPERLINK /3d/OpenAstexViewer.htm OpenAstexViewer 3.0三維顯示Java插件。 HYPERLINK /3d/cosmos.htm COSMOS 5.0 PRO trial HYPERLINK /3d/cosmos.htm COSMOS Viewer 3.0三維分子分析、建模、顯示軟件。免費的三維顯示軟件。 HYPERLINK /3d/moil.htm MOIL 11.0.478免費分子模型建模

16、軟件。 HYPERLINK /3d/mmv.htm MMV 2.0.0免費跨平臺三維分子顯示軟件。 HYPERLINK /3d/openmm.htm OpenMM 2.0分子三維建模程序庫。DNA分析類 HYPERLINK /dna/jambw.htm jambw 1.1 一個分子生物學(xué)軟件包。 HYPERLINK /dna/annhyb.htm AnnHyb v.4.943DNA工具軟件。 HYPERLINK /dna/chromas.htm ChromasPro 2.33可打開ABI格式序列文件。 HYPERLINK /dna/dnasp.htm DnaSP 5.10.01基因多態(tài)性分析軟

17、件，輸入比對后的DNA序列文件，進行基因多態(tài)性分析。 HYPERLINK /dna/dfw.htm DFW 2.51 trailDNA for Windows的縮寫，是一個易于使用的DNA分析軟件，主要用于小規(guī)模序列分析。注冊費50英鎊。 HYPERLINK /dna/Artemis.htm Artemis R12Artemis是a DNA sequence viewer and annotation tool的縮寫，為一個免費的DNA序列查看器與注釋工具。 HYPERLINK /dna/act.htm ACT R9.05是Artemis Comparison Tool的縮寫，DNA序列比較查

18、看器。 HYPERLINK /dna/gda.htm GDA 1.1GDA為(Genetic Data Analysis)的縮寫，用來進行不連續(xù)基因數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析。 HYPERLINK /dna/Sequencher.htm Sequencher 4.10.1 Demo序列拼接軟件，還具有ORF分析、蛋白翻譯、酶切位點作圖、雜合子識別等分析功能。價格單機版3350美元。 HYPERLINK /dna/MeltCalc.htm MeltCalc 免費簡易版 HYPERLINK /dna/MeltCalc.htm MeltCalc 2.0 6天限時專業(yè)版自動計算DNA序列熱力學(xué)數(shù)據(jù)的Excel電子

19、表格宏軟件。注冊費140歐元。 HYPERLINK /dna/GenomeP.htm GenomePixelizer 2003.10.1版顯示基因組中重復(fù)基因與基因簇成員之間的相互關(guān)系的軟件。 HYPERLINK /dna/GenescanView.htm GenescanView1.2 4 HYPERLINK /dna/GenescanView.htm GenescanView1.2 8查看基因掃描（genescan）格式.fsa文件并計算峰大小的小軟件。 HYPERLINK /dna/Sequin.htm Sequin 10.00S用來向三大核酸數(shù)據(jù)庫GenBank, EMBL, DDBJ

20、 查詢與提交序列數(shù)據(jù)。 HYPERLINK /dna/gck.htm Gene Construction Kit 3.0.4 Demo管理并顯示克隆策略中的分子構(gòu)建過程，包括分子構(gòu)建，電泳條帶。另外，還可以質(zhì)粒作圖（有序列沒序列均可）。 HYPERLINK /dna/genomec.htm GenomeComp 1.3中科院生物物理所生物信息實驗室推出的可視化的微生物基因組比較工具。 HYPERLINK /dna/Apollo.htm Apollo 1.11.6Java語言開發(fā)的基因組注釋顯示編輯軟件。 HYPERLINK /dna/SNPHunter.htm SNPHunter 1.75SN

21、P（單核苷酸多態(tài)性）查找軟件。 HYPERLINK /dna/SSRHunter.htm SSRHunter 1.3SSR（Simple Sequence Repeat，即簡單序列重復(fù)，又稱微衛(wèi)星DNA）位點查找軟件。 HYPERLINK /dna/ice.htm iCE 3.5Java語言編寫的顯示基因指紋圖及相關(guān)數(shù)據(jù)的軟件。 HYPERLINK /dna/MB.htm MB6.84免費的DNA分析軟件。 HYPERLINK /dna/FinchTV.htm FinchTV 1.4免費的DNA圖譜分析軟件。 HYPERLINK /dna/ss.htm Sequence Scanner v1.

22、0顯示分析ABI基因分析儀DNA圖譜數(shù)據(jù)軟件。 HYPERLINK /dna/cca.htm CodonCode Aligner 3.7.1DNA測序trace圖編輯、突變分析、contig編輯、序列拼接軟件。 HYPERLINK /dna/WinGene.htm WinGene 2.31分析核酸序列的多用工具軟件。 HYPERLINK /dna/BioLign.htm BioLign 4.0.6免費序列拼接軟件。 HYPERLINK /dna/pic.htm PIC_Calc 0.6多態(tài)信息含量計算程序。 HYPERLINK /dna/sviewer.htm SequenceViewer 1

23、.0DNA序列圖形顯示軟件； HYPERLINK /dna/scloner.htm SERIAL CLONER 2.1 DNA序列分析工具軟件 HYPERLINK /dna/Xplorer.htm Xplorer 2.4.2DNA圖譜查看分析軟件 HYPERLINK /dna/dnacounter.htm DNA Counter v1.0.2統(tǒng)計DNA序列各核苷酸百分比軟件。 HYPERLINK /dna/fcv.htm Chromatogram Explorer 3.0顯示、處理序列層析圖譜文件軟件。 HYPERLINK /dna/NSA.htm NSA 3.3核酸序列分析軟件 HYPERL

24、INK /dna/ycdma.htm YCDMA 3.1.1管理微衛(wèi)星數(shù)據(jù)的軟件。 HYPERLINK /dna/ginforbio.htm G-InforBIO V1.90基因組數(shù)據(jù)建庫與分析軟件 HYPERLINK /dna/igb.htm IGB 6.3基因組顯示軟件 HYPERLINK /dna/goldminer.htm goldMINER 2.0.27根據(jù)蛋白功能分類數(shù)據(jù)庫對基因序列進行功能注釋與分類軟件 HYPERLINK /dna/dnamaster.htm DNA Master 5.1免費DNA編輯分析軟件 HYPERLINK /dna/dnaplotter.htm DNAP

25、lotter 1.4 環(huán)形與線型DNA序列、基因組圖形顯示軟件 HYPERLINK /dna/associationv.htm AssociationViewer 2.0 基因序列SNPs查看顯示軟件 HYPERLINK /dna/gbench.htm gbench 2.2.2NCBI開發(fā)的分析序列數(shù)據(jù)軟件平臺 HYPERLINK /dna/localmotif.htm LocalMotif 1.0查找分析DNA序列Motif軟件 HYPERLINK /dna/repeataround.htm RepeatAround 2.1在基因組中查找重復(fù)(同向、反向、鏡像、互補重復(fù))序列的工具軟件 HY

26、PERLINK /dna/dnaux.htm DNAux 3.0DNA序列分析輔助軟件 HYPERLINK /dna/dnabaser.htm DNA Baser 2.91DNA序列裝配、分析、格式轉(zhuǎn)換軟件 HYPERLINK /dna/seqool.htm Seqool 10.05.2008免費核酸序列分析工具。 HYPERLINK /dna/dnadragon.htm DNA Dragon 1.0.5DNA序列裝配軟件。 HYPERLINK /dna/cisgenome.htm CisGenome Browser 1.2基因組數(shù)據(jù)顯示軟件。 HYPERLINK /dna/priorsedi

27、tor.htm PriorsEditor 1.0.10dna序列調(diào)控區(qū)和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點分析軟件平臺。 HYPERLINK /dna/savant.htm Savant 適用于高通量測序數(shù)據(jù)的基因組瀏覽器。 HYPERLINK /dna/biq.htm BiQ Analyzer 2.0DNA甲基化分析軟件。 HYPERLINK /dna/dnamend.htm DNAmend 1.02A簡單的對DNA序列進行操作的軟件。 HYPERLINK /dna/bqgb.htm BQGB 090528Berkeley定量基因組瀏覽器。RNA分析類 HYPERLINK /rna/RNAdraw.htm R

28、NA draw 1.1 bRNA draw 1.1b2 RNA二級結(jié)構(gòu)分析軟件。 HYPERLINK /rna/RNAstructure.htm RNAstructure 5.2Unix平臺軟件mfold的for Windows版本。 HYPERLINK /rna/RnaViz.htm RnaViz 2.0界面友好的RNA二級結(jié)構(gòu)圖繪制程序?？缮砂l(fā)表質(zhì)量的二級結(jié)構(gòu)圖，可顯示一些特殊結(jié)構(gòu)。 HYPERLINK /rna/loopDloop.htm loopDloop 2.07bJava語言寫成的繪制RNA二級結(jié)構(gòu)的軟件，需要安裝JAVA虛擬機。 HYPERLINK /rna/Circles.h

29、tm Circles 0.1.1使用比較的方法分析RNA二級結(jié)構(gòu)軟件，并以標(biāo)準(zhǔn)格式輸出預(yù)測的二級結(jié)構(gòu)。 HYPERLINK /rna/SStructView.htm SStructView 1.2用JAVA腳本語言寫成的RNA二級結(jié)構(gòu)顯示軟件。 HYPERLINK /rna/Vienna.htm t _top Vienna RNA Package 1.8.1維也納大學(xué)RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測與比較軟件包。 HYPERLINK /rna/XRNA.htm XRNA 1.2.0b基于java的生成、顯示、注釋RNA二級結(jié)構(gòu)的軟件，可很容易地編輯、修改、生成發(fā)表質(zhì)量的RNA二級結(jié)構(gòu)圖。 HYPERLINK

30、 /rna/PseudoViewer.htm PseudoViewer 3 2.5RNA二級結(jié)構(gòu)顯示軟件。 HYPERLINK /rna/OligoEngine.htm OligoEngine 2.0 RNAi設(shè)計軟件。 HYPERLINK /rna/KineViewer.htm KineViewer查看RNA折疊在線預(yù)測工具KineFold結(jié)果的軟件。 HYPERLINK /rna/pknotsRG.htm pknotsRG 1.3預(yù)測RNA二級結(jié)構(gòu)軟件，包括pseudoknots（假扭結(jié)）結(jié)構(gòu)。 HYPERLINK /rna/RNAshapes.htm RNAshapes 2.1.6分析R

31、NA二級結(jié)構(gòu)軟件。 HYPERLINK /rna/miRanda.htm miRanda 201008查找基因組中潛在的RNA位點軟件。軟件運行需要安裝JAVA運行環(huán)境。 HYPERLINK /rna/RNAz.htm RNAz 1.0 預(yù)測結(jié)構(gòu)保守?zé)岱€(wěn)定RNA結(jié)構(gòu)，可用于基因組中篩查功能RNA結(jié)構(gòu)等等。 HYPERLINK /rna/RnaFamily.htm RnaFamilyjava編寫的用于顯示一個RNA分子族的所有二級結(jié)構(gòu)小軟件。 HYPERLINK /rna/RNApasta.htm RNApasta 1.6Java語言所寫的比對和結(jié)構(gòu)注釋RNA序列統(tǒng)計分析工具。 HYPERLIN

32、K /rna/clcrnawb.htm CLC RNA Workbench 4.4分析RNA序列的綜合工具。 HYPERLINK /rna/rnadv.htm RnaDv 1_0RNA二級結(jié)構(gòu)顯示軟件 HYPERLINK /rna/rnabaser.htm RNA Baser2.77.2RNA序列分析工具軟件 HYPERLINK /rna/assemble.htm Assemble 1.0構(gòu)建和研究RNA結(jié)構(gòu)的圖形軟件 HYPERLINK /rna/varna.htm VARNA 3.6RNA二級結(jié)構(gòu)顯示插件 HYPERLINK /rna/nocornac.htm nocoRNAc 1.2非編

33、碼RNA鑒定軟件 以上軟件，除特別注明外，均在 HYPERLINK /biosoftdvd1.html 生物軟件DVD光盤1中。在線工具 HYPERLINK http:/design.rnai.jp/ t _top siDirect 2.0 siRNA在線設(shè)計軟件。 HYPERLINK /tRNAscan-SE/ tRNAscan-SE 1.21 在基因組數(shù)據(jù)中尋找tRNA基因的在線工具。蛋白質(zhì)分析類 HYPERLINK /protein/AnthePro.htm AnthePro 6.0 蛋白序列分析軟件包。 HYPERLINK /protein/PSAAM.htm PSAAM蛋白質(zhì)序列分析

34、軟件包。 HYPERLINK /protein/VHMPT.htm VHMPT螺旋狀膜蛋白拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)觀察與編輯軟件。 HYPERLINK /protein/MPEx.htm MPEx 3.2研究膜蛋白拓?fù)鋵W(xué)結(jié)構(gòu)和其它特性的JAVA軟件。 HYPERLINK /protein/Osprey.htm Osprey 1.2.0蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)可視化系統(tǒng)。 HYPERLINK /protein/InterViewer.htm InterViewer 4.0顯示和分析蛋白交互作用軟件。 HYPERLINK /protein/Fiter.htm Fiter 1.0本免費中文軟件可以對蛋白質(zhì)的MALDI-T

35、OF分析結(jié)果數(shù)據(jù)（其它數(shù)據(jù)作者未做測試）進行角蛋白、牛胰蛋白和豬胰蛋白自切峰的濾除，也可對自定義任意數(shù)據(jù)進行濾除。角蛋白、牛胰蛋白和豬胰蛋白自切峰由NCBA提供。 HYPERLINK /protein/GPMAW.htm GPMAW 9.01 DEMO蛋白質(zhì)質(zhì)譜與序列分析軟件。 HYPERLINK /protein/STORM.htm STORM 1.01可以同時對蛋白序列進行BLAST/FASTA/Pfam/ProtParam分析軟件。 HYPERLINK /protein/PIVOT.htm PIVOT 2.0顯示蛋白交互作用圖的JAVA軟件。 HYPERLINK /protein/Win

36、Pep.htm WinPep 3.01分析蛋白序列的工具軟件。 HYPERLINK /protein/PAT.htm PAT 0.9JAVA語言寫成的蛋白序列比對工具。 HYPERLINK /protein/clcp.htm CLC Protein Workbench 5.3 Demo蛋白序列分析軟件。 HYPERLINK /protein/protag.htm ProTag 1.4Office軟件的插件蛋白標(biāo)簽軟件。 HYPERLINK /protein/submito.htm SubMito 1.1蛋白質(zhì)亞線粒體定位預(yù)測的軟件。 HYPERLINK /protein/pcs.htm PCS

37、 v1.3.3873已鑒別蛋白序列殘基片段覆蓋率軟件。 HYPERLINK /protein/proteowiz.htm ProteoWizard 2.0蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析軟件 。 HYPERLINK /protein/hbat.htm HBAT 1.1蛋白序列氫鍵分析工具。 HYPERLINK /protein/proteinvis.htm ProteinVis 2.1.6人類基因組蛋白序列層次聚類(hierarchical clusterings)樹顯示軟件。 HYPERLINK /protein/procope.htm ProCope 1.2 蛋白復(fù)合物預(yù)測評價軟件 。 HYPERLIN

38、K /protein/pride.htm PRIDE Converter 2.4.9轉(zhuǎn)換蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)為PRIDE XML格式軟件。生物教學(xué)類 HYPERLINK /biocai/mmp.htm mmp.zip本軟件將生化代謝中的各種途徑用圖表的形式表示出來。 HYPERLINK /biocai/linpath.htm linpath線性酶反應(yīng)模擬軟件，免費軟件。 HYPERLINK /biocai/protlab.htm protlab 3.01 用軟件模擬蛋白純化過程。 HYPERLINK /biocai/molmed.htm molmed.zip本軟件包主要用于教學(xué)，以動畫、圖形與文字演示

39、生物化學(xué)的基本概念。 HYPERLINK /biocai/bioavi.htm 多媒體動畫教學(xué)材料以動畫的形式講述了一些專業(yè)知識。 HYPERLINK /biocai/Photo.htm Photo光合作用教學(xué)程序，演示光合作用過程。 HYPERLINK /biocai/biodraw.htm 金排生物畫板 6.2專門用于編寫教學(xué)文檔、電子備課，課件制作及生物多媒體教學(xué)的通用工具。 HYPERLINK /biocai/Virtlab.htm Virtlab 2.0用于教學(xué)目的的虛擬的分子生物學(xué)實驗室軟件。 HYPERLINK /biocai/GENUP.htm GENUP 5.5定量遺傳學(xué)輔助

40、教學(xué)軟件，用于掌握其概念和應(yīng)用。 HYPERLINK /biocai/hands.htm hands on genetics 12個生物教學(xué)程序。輔助學(xué)習(xí)一些基本概念。 HYPERLINK /biocai/ScienceMatrix.htm ScienceMatrix Demo細(xì)胞結(jié)構(gòu)和功能教育軟件， HYPERLINK /biocai/digfrog.htm Digital Frog 2.5a數(shù)字青蛙 教學(xué)軟件。 HYPERLINK /biocai/ctb.htm CTB 2.0細(xì)胞、組織、身體動畫圖解軟件 HYPERLINK /biocai/mg.htm Molecular Genetic

41、s 3.1教學(xué)軟件演示版。 HYPERLINK /biocai/onscreendna.htm OnScreen DNA三維DNA展示教學(xué)程序 HYPERLINK /biocai/sat.htm SAT采用dynamic programming算法的序列比對教學(xué)程序 HYPERLINK /biocai/tour.htm TOUR OF THE BASICS HYPERLINK /biocai/sat.htm 遺傳學(xué)基本知識教學(xué)動畫 HYPERLINK /biocai/tour.htm HYPERLINK /biocai/genex.htm GeneExplorer 1.3基因序列表達模擬教學(xué)程

42、序 HYPERLINK /biocai/proteini.htm Protein Investigator 3.0.2蛋白序列二維折疊結(jié)構(gòu)顯示教學(xué)軟件 HYPERLINK /biocai/aipotu.htm Aipotu 1.2.3模擬遺傳、生化化學(xué)、分子生物學(xué)教學(xué)軟件 HYPERLINK /biocai/vglii.htm VGLII 2.1.1虛擬遺傳實驗室教學(xué)軟件生化工程類 HYPERLINK /bioengi/brd.htm BRD 4.0 生物反應(yīng)器（發(fā)酵罐）設(shè)計軟件。 HYPERLINK /bioengi/BioStat.htm BioStat 4.4BioStat B發(fā)酵罐控制

43、程序。 HYPERLINK /bioengi/PenSim.htm PenSim v2.0青霉素發(fā)酵模擬軟件， 通過改動初始條件和控制參數(shù)，模擬出不同的發(fā)酵結(jié)果。安裝有些麻煩，注意查看軟件內(nèi)的README.TXT。 HYPERLINK /bioengi/SuperPro.htm SuperPro Designer 8b06EF源自MIT的技術(shù)，用來進行計算機輔助設(shè)計的軟件包。正式版年費用5,550美元，不過有簡化版，價格稍低。PCR相關(guān) HYPERLINK /pcr/NoePrimer.htm NoePrimer 2.03獨特的引物設(shè)計軟件 HYPERLINK /pcr/Primer.htm

44、Primer Premier 6.0 DEMO序列分析與引物設(shè)計，非常棒的一個軟件。正式版885美元。 HYPERLINK /pcr/Oligo.htm Oligo 7.41 Demo引物設(shè)計分析著名軟件，主要應(yīng)用于核酸序列引物分析設(shè)計軟件。正式版1250美元。 HYPERLINK /thread-574-1-1.html t _blank 代為購買及價格。 HYPERLINK /pcr/DSigner.htm Primer DSigner 1.1免費的引物設(shè)計輔助軟件，專門用于pASK-IBA和pPR-IBA表達載體，簡化引物設(shè)計工作。 HYPERLINK /pcr/ad.htm Array

45、 Designer 4.25 DemoDNA微陣列（microarray）軟件，批量設(shè)計DNA和寡核苷酸引物工具。正式版4885美元。 HYPERLINK /pcr/Beacon.htm Beacon Designer 7.90 Demo實時熒光定量PCR分子信標(biāo)(Molecular beacon )及TaqMan探針設(shè)計軟件。 HYPERLINK /pcr/NetPrimer.htm NetPrimerJAVA語言寫成的免費引物設(shè)計軟件，用IE打開運行。 HYPERLINK /pcr/TGGE.htm TGGE-STARDOS軟件，PCR結(jié)合梯度凝膠電泳實驗引物設(shè)計軟件。 HYPERLINK

46、 /pcr/e-PCR.htm e-PCR 2.3.9 電子克隆是一種電腦軟件，用來識別DNA序列標(biāo)簽位點（STSs)。 HYPERLINK /pcr/FastPCR.htm FastPCR 6.0.165b2快速設(shè)計各種類型PCR引物，還包括一些常用的DNA與蛋白序列軟件工具； HYPERLINK /pcr/OligoMaster.htm OligoMaster 1.0.164多用戶寡核苷酸管理軟件，可建立寡核苷酸數(shù)據(jù)庫 HYPERLINK /pcr/PerlPrimer.htm PerlPrimer v1.1.19一個免費的用來設(shè)計引物的開源軟件。 HYPERLINK /pcr/Ampli

47、fX.htm AmplifX 1.5.4設(shè)計與管理引物的軟件。 HYPERLINK /pcr/AutoDimer.htm AutoDimer 1.0快速篩選二聚體引物軟件。 HYPERLINK /pcr/MutaPrimer.htm MutaPrimer 1.00用于定點突變的引物設(shè)計桌面工具軟件 HYPERLINK /pcr/ORFprimer.htm ORFprimer JAVA語言設(shè)計的引物設(shè)計軟件 HYPERLINK /pcr/ppflash.htm Primer Primer 5.6.0Flash制作的PCR引物設(shè)計軟件。 HYPERLINK /pcr/pcra.htm PCR An

48、alyzer 1.0 實時RT-PCR反應(yīng)中估算初始擴增子濃度軟件 HYPERLINK /pcr/methyl.htm Methyl Primer Express 1.0 甲基化研究引物設(shè)計軟件在線工具 HYPERLINK /dnaworks/index.html t _blank DNAWorks 3.0 是一個幫助進行基因合成的設(shè)計寡核苷酸序列的免費程序。 程序僅需要輸入一些簡單的信息，比如，目標(biāo)蛋白的氨基酸序列及合成核酸序列的溫度。程序輸出的為適合所選擇生物表達的優(yōu)化密碼子的核酸序列。利用DNAWorks的幫助，用兩步PCR法，可以成功合成長度達到3000堿基對的基因。 HYPERLIN

49、K /lubkowski_sw.html t _blank 原始網(wǎng)站。 HYPERLINK /medcenter/primer/primer.cgi t _blank The Primer Generator在線引物設(shè)計程序。 HYPERLINK / t _blank Primer 3比較有名的在線引物設(shè)計程序。 HYPERLINK /primo/ t _blank Primo Pro 3.4在線PCR引物設(shè)計java系列軟件。 HYPERLINK /cgi-bin/SGD/web-primer t _blank Web Primer斯坦福大學(xué)提供的在線引物設(shè)計軟件。 HYPERLINK ht

50、tp:/www.autoprime.de/ t _blank AutoPrime快速設(shè)計真核表達實時定量PCR引物在線軟件。序列格式轉(zhuǎn)換 HYPERLINK /geshi/SeqCorator.htm SeqCorator 2.03編輯各種可供發(fā)表文章用的序列展示格式軟件。 HYPERLINK /geshi/vised.htm vised11.exeVisual Sequence Editor 1.1 序列輸入分析和格式轉(zhuǎn)換軟件。 HYPERLINK /geshi/ForCon.htm ForCon 1.0核酸與蛋白質(zhì)不同序列格式文件的轉(zhuǎn)換軟件，可雙向轉(zhuǎn)換各種常見的多序列格式文件。 HYPER

51、LINK /geshi/SeqVerter.htm SeqVerter 一個序列格式轉(zhuǎn)換軟件。 HYPERLINK /geshi/GeneStudio.htm GeneStudio Pro 序列格式顯示、編輯與轉(zhuǎn)換工具軟件，與上一個軟件為同一個公司編制，可以免費使用60天。 HYPERLINK /geshi/Fbscan.htm FASTA/BLAST SCAN 2.3FASTA/BLAST SCAN是一個補充程序，用來對FASTA與BLAST查詢輸出的文件進行處理，并以Pearson 格式輸出序列文件。 HYPERLINK /geshi/RevComp.htm RevComp 2.4序列格式

52、轉(zhuǎn)換軟件，獲得DNA序列的互補序列并保存為文本格式。 HYPERLINK /geshi/BioCocoa.htm BioCocoa 2.2.2提供給軟件開發(fā)者Objective-C語言的各種序列格式的讀寫支持模塊，極大方便生物信息學(xué)軟件開發(fā)。 HYPERLINK /geshi/DNACompress.htm DNACompress免費的DNA序列壓縮軟件。 HYPERLINK /geshi/Readseq.htm Readseq 2.1.27序列編輯與格式轉(zhuǎn)換軟件，JAVA語言編寫。 HYPERLINK /geshi/etstools.htm ETSToolsEST數(shù)據(jù)庫建立系統(tǒng)輔助軟件。 大

53、規(guī)模地將原始序列轉(zhuǎn)換為 FASTA 格式，將 Blast 軟件分析結(jié)果中大量的基因注釋項提取出來，將目標(biāo)序列從序列庫中提取出來等功能的軟件。 HYPERLINK /geshi/xml2pdb.htm XML2PDBXML格式3維分子文件轉(zhuǎn)換為PDB格式文件的軟件。 HYPERLINK /geshi/DNAsmac.htm DNAsmac 序列管理與格式轉(zhuǎn)換軟件； HYPERLINK /geshi/DataConvert.htm DataConvert 1.0序列格式轉(zhuǎn)換軟件軟件。 HYPERLINK /geshi/Fasta2M.htm Fasta2MultiFasta v08.10.31 H

54、YPERLINK /geshi/Fasta2M.htm multi-FASTA to FASTA converter 1.0將多個單序列fasta格式文件合并為多序列fasta格式文件軟件。將多序列FASTA格式文件轉(zhuǎn)換為單序列fasta格式文件軟件。 HYPERLINK /geshi/abi2xml.htm abi2xml 1.2將ABI格式的DNA序列文件轉(zhuǎn)化為XML格式文件的軟件 。 HYPERLINK /geshi/abi2fasta.htm ABI to FASTA converter 1.1.2ABI轉(zhuǎn)換為FASTA格式軟件。 HYPERLINK /geshi/gbk2fasta.

55、htm GenBank to FASTA converter 08.11.1將GenBank格式文件轉(zhuǎn)換為FASTA格式文件軟件。 HYPERLINK /geshi/Convertrix.htm Convertrix 1.0DNA序列格式批量轉(zhuǎn)換軟件。專業(yè)電子書以下內(nèi)容均加入到生物軟件光盤中。 HYPERLINK /bookhtml/ca.htm 美國化學(xué)文摘查閱法彭海卿1978年編，較老，但仍然有參考價值。 HYPERLINK /bookhtml/chemengineer.htm 化學(xué)工程手冊生化工程/生物化工包括生物學(xué)概念、生物反應(yīng)器、產(chǎn)物提取、過程模擬等。 HYPERLINK /book

56、html/mit.htm MIT的生物學(xué)超文本格式電子書MIT的英文生物學(xué)圖文并茂的電子書。 HYPERLINK /bookhtml/gened.htm 生物學(xué)教科書英文。又一本圖文并茂的超文本生物學(xué)教科書。 HYPERLINK /bookhtml/primer.htm 分子遺傳學(xué)基礎(chǔ)讀本美國Human Genome Management Information System - Oak Ridge National Laboratory)所著。 HYPERLINK /bookhtml/NetBiochem.htm NetBiochem尤他大學(xué)編制的網(wǎng)上生物化學(xué)教材。 HYPERLINK /b

57、ookhtml/biophys.htm 生物物理學(xué)在線讀本包括生物能學(xué)與光合作用、通道、受體與運輸體、等章。 HYPERLINK /bookhtml/bowtell.htm 分子生物學(xué)實驗室實驗手冊澳大利亞墨爾本大學(xué)的分子生物學(xué)實驗室實驗手冊。 HYPERLINK /bookhtml/mobio.htm 分子生物學(xué)網(wǎng)書圖文并茂，內(nèi)容全面。 HYPERLINK /bookhtml/biocum.htm Biocomputing德國University of Bielefeld生物計算超文本教科書。 HYPERLINK /bookhtml/genetherapy.htm Gene TherapyP

58、rinciples and Applications 99年版的Gene TherapyPrinciples and Applications 基因治療原理與應(yīng)用。 HYPERLINK /bookhtml/clone2.htm 分子克隆實驗指南（第二版）1062頁的經(jīng)典圖書，需要安裝超星圖書閱覽器才能查看。 HYPERLINK /bookhtml/biohistory.htm 生物學(xué)思想發(fā)展的歷史譯自THE GROWTH OF BIOLOGICAL THOUGHT DIVERSITY EVOLUTION AND INHERITANCE。 HYPERLINK /bookhtml/origin.h

59、tm 物種起源達爾文的驚世名著中譯本。 HYPERLINK /bookhtml/eorigin.htm Origin of SpeciesCHARLES DARWIN英文原著，PDF格式。 HYPERLINK /bookhtml/Alkami.htm Alkami Quick Guide for PCRPCR實驗的實驗室參考手冊，共計158頁，PDF格式，可供實驗室參考。 HYPERLINK /bookhtml/Monoclonal.htm Monoclonal Antibody Production單克隆抗體的生產(chǎn)，1999年出版,共計60余頁，GIF格式。 HYPERLINK /bookh

60、tml/#htm 生物統(tǒng)計學(xué)作者：李春喜 王文林 頁數(shù)：264 。 HYPERLINK /bookhtml/shentong.htm 生物化學(xué)第二版作者：沈同 王鏡巖 趙邦悌等。 HYPERLINK /bookhtml/selfish.htm 自私的基因Win98的CHM幫助格式，R.道金斯所著，中譯本。 HYPERLINK /bookhtml/jiedu.htm 解密生命作者：周祥，生物科普讀物，從細(xì)胞到基因直到基因芯片。 HYPERLINK /bookhtml/jydgm.htm 基因的革命作者：白玄等。 HYPERLINK /bookhtml/ccp.htm A Guide