NCBI上下載基因序列

1、文案大全文案大全.打開的信息，找到自己需要的基因。空色框中表示的是物種，和網站，第一個框選擇，第二個框輸入基因名稱，如基因，點擊上下載基因序列、序列的方法.打開的信息，找到自己需要的基因。空色框中表示的是物種，和網站，第一個框選擇，第二個框輸入基因名稱，如基因，點擊進入第二頁面后，會看到如下一系列跟基因相關的信息，根據(jù)我需要的是人類的基因，故選擇第一個。點擊進入下一個頁面。Items:1to20of2G51SearchresultsItems:1to20of2G51Page|l|of133NextLastOSee3信口73dismntinuHd出口laced漁卬苜一Name/GeneIDDes

2、criptionLocationAliasesMIMALKwnmpEsticIvmphoFniareceptortyrosineChromosome2,NC_DDQ002.1I2CD246,NBLST3105590ID：23Skin召sjHome&ap電加(huimar)|(29192774.2992161kcomplementAikanaplasticlymphomiakinaseMumChromosome17:NC_OOD083.6CD246,TcrzID:11632fntfsculus(housemouse)(71B6898a.7260648,complennentAikArapIast

3、iclymphomakinaseChromosome2RNT_033778.4Dmel_CGS250:ALK,CG825C:DAIk.ID;53426Drasophiarneanogaster(fruitfly)(16625291.16640011complement)DAlk53:DmelCG8250,alk,dALK,mili進入后，會看到以下關于基因的詳細信息:WNCEYResourcesHowitt叵GeneGenevSearchAdvancedSendlo.WNCEYResourcesHowitt叵GeneGenevSearchAdvancedSendlo.ALKanaplastic

4、lymphomareceptortyrosinekinaseHomosapiens(huinan)GeneID:238,updatedan6-EJec-2016上Summarys?OfficialSymbolOffkidFullNamePriniisiysourceSeerelatedOfficialSymbolOffkidFullNamePriniisiysourceSeerelatedGenetypeRefSeqstatusOrganismLineageA出口knowna服SummaiyanaplasliclymphiomareceptortyrosinekinasepovidedHGNC

5、UGNCHGNC.427匚口口口口口771094MIM:1Q559QYep30TTHUMG口口口001殳D34proteincodingREVIEWEDHmo3曰pie：n5Eukaryota;Metazoa;Chordata:Crianiata;Vertebrata;Euteleostomi;P/lammalia;Eutheria:Euarchortcglires;Priiinfiates;Haplorrhirii;Catarrhini:Hominidae:HomoC口246;NBLST3ThisgenesncodGaireceptortyrosinekinase,whichtslDings

6、totheinsulinreceptorsuperfamily.Thisproteincomprisesan白xirmcHlulardomain,anhydrophobicstrBtehcorrespondingtoasinglepasstransmembraneregion,andanintracelularkina&edomain.Itplar/s：2nimportailroleinthedlev&lnpmientofthebrainandexertsitseffectsrimcnariHrnoiimncinFhanorx/nai-c；-CictiOrnThicm口rt口卜口。Ke-onf

7、rimnlhnh口rsoarraninadmai+a+orlnramrilifiiorlincoricrtffiimmiremr-hirllinnainsrilociilarnordI這些信息可以略過，往下查看，點擊下圖紅色框中的,進入下個頁面。4GenomiccontextExoncount:29Location:2p232-p2i.1qNCBIResourcesHowToAnnotatioorefeaseStatusAssemblyChrLocation避currentSRChJS.p?(GCF_OOQCO打3.33)2NC_0OOOO2.12(29192774.29921611,cdfi

8、pigment)105previousassemblyGiRCh37.pl33CF_0氮叫405.2NC_000002.11(29J1&plernemt)進入后會看到如下頁面，：GenomeDataViewerSequentGLocatwNC_DEOQQ2.1229192.71-26,921,611竽*s明印MHptntrsjigeWtPkkAs&enrfetily|口CPJlilOMl*D6玷fQRChmg甲等7Lot級n用電GeflEALK/IdeciorannView-no三，二-Mnllnl15nrn-nrmrcl.-rrrm,-mrTTTTHG8B1a-sans7*HSUOs.mn-

9、n-SHHHUdmnnr將鼠標箭頭放在圖中紅色框中的綠色線上2-秒5，不用點擊。會看到下面的界面：（有些基因會出現(xiàn)好幾個，根據(jù)自己的要求選擇）k空逑K即盛之咕.2H卅Download:NF尤429工工NM配書口.士Liniks&Tools|Vi/w8口工95兆1721髭wGsD:238(AIK)一ViewHGHC：4Z7ViewHIM:10.5590Titte:ansplasticlymplhomareceptartycsinekinaseLocdti口口：0301口后叩總門2959乙774,29221r611)Length:72_IP4IIIIIlliIINP,001274457.1IIII

10、II11IInIIIIII11IIIIIIIIH11IIIIIIIII11IIiiIII口1IIIllllllllllIIIIIIIUIIIIIIIII11IIIIIIIIIIIIXP_0052GG19.LXP_01153112.1XPfG8712167.：lWPj302eie201BLASTGenomic:1N60g0022(2丸15277429r92L611)FASTRViH：NC000002.工工f因.,為IGEnEankVievM：NCQQQCO2.12129：15乙774.29：9216后第一個紅色框中：表示蛋白質序列，代表蛋白質，是編號，后面的代表更新狀態(tài)，數(shù)值越大，版本越新。表示

11、序列，表示，是編號，后面的代表更新狀態(tài)，數(shù)值越大，版本越新。第二個紅色框中：表示序列，表示，命名規(guī)則同上。第三個紅色框中：表示7整的基因序列，表示基因組。括號中的數(shù)字表示這個基因的堿基長度，從到要下載蛋白序列、序列、序列、基因序列，直接點擊紅色框中的鏈接即可。這里下載基因序列，點擊后出現(xiàn)如下界面：點擊右邊的d1e（有好幾種格式）常用的是格式和格式。格式保存的信息更全面。AdvancedSend:tComp|用eReuondOCodingSequences(./GeneSend:tComp|用eReuondOCodingSequences(./GeneFeaturesChooseDestinat

12、ionoard。CollectionsOAnalysisToolshownke(abbrn城29LOCUSDEFINITIONACCESSICNVERSIONDE二二KKK3_3D00D272Ez33bpDNAlinearCD：N06-JUN-2D16Hamosapiena3hromosone2fGRC?j38PrimaryAsserrbly.一匚口口?？贠WREGION:291?277.29921611GZC_C-CDDOL294NC_000002.12BioProject:PRJNA16BAsaembly:GCF000001405.33KEYWORDSSOURCECRGAHISMRefSe

13、q.Home-sapiens(hrnian)HeangsapiinmEukaryota;Metazoa;Chordata;Craniata;1-ni-n，ThVertebrata;TTEliteLeoston!;Tl1-Download1items.ShowGlCreateFileGenBankHomosapienschromosome2,GRCh38.p7PrimaryAssemblyNCBIReferenceSequence:NC00000212FASTAGiwhicsGoto:至此就把基因的序列下載了。二幾種代號的意思ACCESSION是NCBI序列數(shù)據(jù)中我們常用到編號（另一個是Gl）0

14、ACCESSION形式為Cr其中CC為兩個字母r其不同組合又可以區(qū)分為蛋白序列、核酸序列或基因組序列,而題位數(shù)不等的數(shù)字；ACCESSION后面又會加版本號，以形式表示，最后的尾數(shù)遞增表示序列信息、較之前的版本有所修改,這樣ACCE%I。N+版本號就是一個唯一的表示,代表一個唯一的序列,而且這個驛號不會改變.ACCESSIONMOLECULEMETHODNOTE4C_123456GenomicMixed一些可供選擇的注釋白?；蚪M序列主要用來標記病毒和原核生物。AP_123456ProteinMixed匚標記序列西應的蛋白產物NC_123456GenomicMixed完整的基因組分子序列，;標

15、記的類別包話基因組、染色體、細胞器、質粒。NG_123456GenomicMixed不完整的基因組區(qū)域一提供NCBI基因組注釋途徑。比較有代表性有不轉錄的假基因或者那些啜雅自行北注警的基因組簇。NM_123456mRNAMixed轉錄產物序列；成熟mRN2轉錄本序列:NM_12345&7B9汨微信號：Hll/Llf-一般采說,mRNA和基因組序列是我們主要的尋找對如果想找標準序列的話rmRNA就采用NM_開頭的，基因組用NC_或者AC_開頭的口soeas/!NP_123456NP_123456789ProteinMixed將白聲煙；主要是生長轉裝氫郵序列，但也有T只有部分蛋白質的部分瓦基魄序列，NR.123456RNAMixed本編碼的轉錄子序列，包恁結構knag班基因轉子等。NT_123456GenomicAutomate