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1、大數(shù)據(jù)時代醫(yī)院圖書館館員的新要求CONTENTS142536大數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)監(jiān)護醫(yī)療應(yīng)用館員知識與技能數(shù)據(jù)科學家圖書館未來發(fā)展BIG DATAAPPLICATIONS IN MEDICAL CAREDATA SCIENTISTDATA CURATIONSKILLS AND KNOWLEDGEFUTURE DEVELOPMENT 1大數(shù)據(jù)BIG DATAXX省醫(yī)院協(xié)會醫(yī)院圖書情報管理專業(yè)委員會2015年學術(shù)年會8月2022日XXXX 1大數(shù)據(jù)BIG DATA定義DEFINITIONS“大數(shù)據(jù)”概念最早是由咨詢公司麥肯錫(McKensey)提出,在其報告Big data: The next fronti

2、er for innovation, competition, and productivity中給出的大數(shù)據(jù)定義是:大數(shù)據(jù)指的是大小超出常規(guī)的數(shù)據(jù)庫工具獲取、存儲、管理和分析能力的數(shù)據(jù)集。Wikipedia : Big data is a broad term for data sets so large or complex that traditional data processing applications are inadequate. 特征CHARACTERISTICSVolume 數(shù)據(jù)量龐大數(shù)據(jù)以幾何級數(shù)增長,數(shù)據(jù)量很容易達到TB(Tera Bytes,兆位元組),甚至PB(

3、Peta Bytes,千兆位元組)或 EB(Exabytes,百萬兆位元組)的等級。Variety 包羅萬象大數(shù)據(jù)的來源種類十分多樣化,數(shù)據(jù)的形態(tài)包含文字、音畫、視訊、網(wǎng)頁、串流等等,主要分類為結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)、半結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)和非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)。Velocity 輸入輸出速度快資料的傳輸流動(data streaming)是連續(xù)且快速的,要迅速地分析、處理數(shù)據(jù),作出回應(yīng)、輸出結(jié)果,保證處理的時效。許多資料要能即時得到結(jié)果才能發(fā)揮最大的價值。Veracity 真實性存疑當數(shù)據(jù)的來源變得更多元時,數(shù)據(jù)本身的可靠度和質(zhì)量就會存疑,應(yīng)當分析并過濾有偏差、偽造、異常的部分,防止這些dirty data損害到資料系統(tǒng)

4、的完整及正確性,進而影響決策。1大數(shù)據(jù)BIG DATA 1大數(shù)據(jù)BIG DATA大數(shù)據(jù)在越來越多的領(lǐng)域當中逐漸得到廣泛的應(yīng)用,比如:政府部門、國際開發(fā)、制造業(yè)、媒體、民間部門、科學領(lǐng)域等。數(shù)據(jù)處理思維方式正逐步從抽樣分析向全體性、混沌性以及相關(guān)性演變,以適應(yīng)數(shù)據(jù)量的爆發(fā)式增長。大數(shù)據(jù)情報分析:梳理所有可以獲得的數(shù)據(jù)庫, 對相關(guān)信息進行確認,并將其整合起來。醫(yī)療:大數(shù)據(jù)可以通過利用各種采集人們身體健康指數(shù)的設(shè)備采集數(shù)據(jù),對數(shù)據(jù)進行分析,對醫(yī)療技術(shù)產(chǎn)生幫助。影響 INFLUENCES 2醫(yī)療應(yīng)用APPLICATIONS IN MEDICAL CAREXX省醫(yī)院協(xié)會醫(yī)院圖書情報管理專業(yè)委員會2015

5、年學術(shù)年會8月2022日XXXX 2醫(yī)療應(yīng)用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE大數(shù)據(jù):生物醫(yī)學變革新契機世界正在由資本經(jīng)濟時代向數(shù)據(jù)經(jīng)濟時代過渡,數(shù)據(jù)及其服務(wù)成為國家戰(zhàn)略和經(jīng)濟的基礎(chǔ)設(shè)施。歐美主導(dǎo)的國際生命科學計劃產(chǎn)生的數(shù)據(jù)和知識,已成為重要的國家資源。例如國際人類基因組單體型圖計劃、DNA元件百科全書計劃、人類表觀基因組計劃、國際癌基因組計劃、千人基因組計劃等,這些計劃形成的數(shù)據(jù)資源潛在價值十分巨大。大數(shù)據(jù)不僅為生物醫(yī)學研究帶來了新的技術(shù)手段,還可能大幅度降低醫(yī)療費用。麥肯錫全球研究院報告顯示,如果美國醫(yī)療保健行業(yè)對大數(shù)據(jù)進行有效利用,就能把成本降低8%左右,從而每年創(chuàng)

6、造出超過3000億美元的產(chǎn)值。 基因測序和基因模型人類基因組有30億個堿基對,一個完全測序的人類基因組包含100-1,000GB的數(shù)據(jù)量。一百萬個人的數(shù)據(jù)合計能達到1EB或者說1,000,000TB的數(shù)據(jù)量。蘋果公司的傳奇總裁史蒂夫.喬布斯在與癌癥斗爭的過程中采用了不同的方式,成為世界上第一個對自身所有DNA和腫瘤DNA進行排序的人。他得到的不是一個只有一系列標記的樣本,而是包括整個基因密碼的數(shù)據(jù)文檔。對于一個普通的癌癥患者,醫(yī)生只能期望她的DNA排列同試驗中使用的樣本足夠相似。但是,喬布斯的醫(yī)生們能夠基于喬布斯的特定基因組成,按所需效果用藥。如果癌癥病變導(dǎo)致藥物失效,醫(yī)生可以及時更換另一種藥

7、。2014年”Google X”實驗室推出的”Baseline Study”計劃,不僅可以讓醫(yī)療專家預(yù)測治療重大疾病,最終目的是利用大數(shù)據(jù)分析找到健康完美的人類基因模型。2醫(yī)療應(yīng)用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE 美國FDA向社會開放健康和醫(yī)療大數(shù)據(jù)大數(shù)據(jù)被認為是能夠改變未來健康和醫(yī)療產(chǎn)業(yè)版圖的重要資源。美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)開始逐步向社會開放醫(yī)療和健康方面的大數(shù)據(jù)。2014年6月2日,F(xiàn)DA的公共數(shù)據(jù)開放項目OpenFDA()正式上線。其先導(dǎo)項目開放了“300萬份藥物不良反應(yīng)報告”的數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)是2004至2013年間提交給FDA的

8、藥物不良反應(yīng)和醫(yī)療過失記錄。健康和醫(yī)療相關(guān)的大數(shù)據(jù)通常都匯集到政府監(jiān)管部門(如FDA)或政府控制的機構(gòu)和基礎(chǔ)設(shè)施(如醫(yī)保和數(shù)據(jù)庫)中。這些數(shù)據(jù)的開放對于基于數(shù)據(jù)的健康和醫(yī)療產(chǎn)業(yè)的發(fā)展至關(guān)重要。2醫(yī)療應(yīng)用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE 2醫(yī)療應(yīng)用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE大數(shù)據(jù):醫(yī)療保健和疾病預(yù)防更加個性化、精準化美國學者埃里克拖.托普在新著顛覆醫(yī)療:大數(shù)據(jù)時代的個人健康革命中稱:醫(yī)療保健的數(shù)字化,已經(jīng)勢不可當。數(shù)字世界和醫(yī)學的交匯是不可避免的,變革已經(jīng)在這個交匯的舞臺上初見端倪。大數(shù)據(jù),不僅將臨床治療推向新時代,發(fā)揮著對醫(yī)改的科技支撐作用

9、,而且將醫(yī)療保健和疾病預(yù)防變得更加個性化、精準化。這種變化是一種從未有過的爆炸性革命。 2醫(yī)療應(yīng)用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE電腦醫(yī)生-“沃森”美國安德森癌癥中心(M.D. Anderson Cancer Center)和IBM聯(lián)合開發(fā)出一款癌癥治療軟件,名叫“腫瘤專家顧問(Oncology Expert Advisor, OEA)。OEA的核心正是IBM沃森電腦(Dr. Watson),它通過沃森的認知計算能力,從病人的病例和豐富的研究資料庫中尋找資料,為臨床醫(yī)生提供有價值的見解,幫助醫(yī)護人員針對每位患者的特質(zhì),找到精準、有效的治療方案。 Lumiata-用大數(shù)據(jù)

10、建醫(yī)療圖譜,提高診療的精準性Lumiata是首家提出“醫(yī)療圖譜(medical graph)”的公司,他們把電子病歷和病理生理學等數(shù)據(jù)整合起來,并通過圖譜分析的方式去模擬人類的多維推理過程,進而預(yù)測出病人會需要什么、以及何時需要。利用這些數(shù)據(jù),Lumiata還可以去分析和預(yù)測一個人群整體的健康狀態(tài)。通過把數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化成圖譜,Lumiata可以更有效地對病人分類,并獲得更準確的處方信息,這些處方信息主要是關(guān)于癥狀、藥物、病情的風險因素、醫(yī)生的診斷等。利用這個圖譜,醫(yī)生可以對病人做出更迅速、更有針對性地診斷。比如,Lumiata在一個有數(shù)百位病人的急救中心進行試點,結(jié)果顯示,對病人分診的時間縮短了30

11、%40%。2醫(yī)療應(yīng)用APPLICATIONS IN MEDICAL CARE 3數(shù)據(jù)科學家DATA SCIENTISTXX省醫(yī)院協(xié)會醫(yī)院圖書情報管理專業(yè)委員會2015年學術(shù)年會8月2022日XXXX DATA SCIENCE數(shù)據(jù)科學數(shù)據(jù)科學家采用科學方法、運用數(shù)據(jù)挖掘工具尋找新的數(shù)據(jù)洞察的工程師。其核心能力一開始被定義為:SQL、統(tǒng)計、預(yù)測建模和編程、Python等,很快又加入Hadoop/MapReduce、機器學習、可視化,甚至還有傳統(tǒng)的數(shù)學、物理、計算機科學等類似能力。利用計算機的運算能力對數(shù)據(jù)進行處理,從數(shù)據(jù)中提取信息,進而形成“知識”。數(shù)據(jù)采集數(shù)據(jù)可視化數(shù)據(jù)分析3數(shù)據(jù)科學家DATA

12、SCIENTIST 3數(shù)據(jù)科學家DATA SCIENTIST醫(yī)院圖書館員:醫(yī)學數(shù)據(jù)的科學家信息轉(zhuǎn)化、文獻整序、信息公開數(shù)據(jù)科學的核心技能是信息的管理和組織,這正是圖書館員所擅長的,在大數(shù)據(jù)問題的數(shù)據(jù)監(jiān)護中也起到突出作用。信息轉(zhuǎn)化許多圖書館員還是出色的溝通人員,并且通常經(jīng)過教育和培訓,熟知如何將用戶的信息需求轉(zhuǎn)化為調(diào)查策略和研究數(shù)據(jù)來源。文獻整序數(shù)據(jù)科學的重要任務(wù)是把原始的、雜亂的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為可行動的知識,提供給決策制定者使用;而圖書館文獻整序的職能、文獻交流的情報職能正是要把資料、期刊、書籍等文獻轉(zhuǎn)化為有序的知識傳遞給讀者。信息公開圖書館員代表了信息的公開獲取,為公眾提供信息。大數(shù)據(jù)時代對公眾也

13、提出了查找、檢驗、分析、理解各種數(shù)據(jù)來源的要求,這就需要圖書館員的協(xié)助,為公眾提供一個接觸和學習知識的地方。 4數(shù)據(jù)監(jiān)護DATA CURATIONXX省醫(yī)院協(xié)會醫(yī)院圖書情報管理專業(yè)委員會2015年學術(shù)年會8月2022日XXXX 概念:為確保數(shù)據(jù)當前使用目的, 并能用于未來再發(fā)現(xiàn)及再利用, 從數(shù)據(jù)產(chǎn)生伊始即對其進行管理和完善的活動。對于動態(tài)數(shù)據(jù)集而言, 數(shù)據(jù)監(jiān)護意味著需進行持續(xù)性補充和更新, 以使數(shù)據(jù)符合用戶需求。數(shù)據(jù)監(jiān)護中的“數(shù)據(jù)”專指科學數(shù)據(jù)。Data curation is the active and on-going management of data through its lif

14、ecycle of interest and usefulness to scholarship, science, and education; curation activities enable data discovery and retrieval, maintain quality, add value, and provide for re-use over time.數(shù)據(jù)保管/保存、數(shù)據(jù)典藏、數(shù)據(jù)維護、數(shù)據(jù)監(jiān)護、數(shù)據(jù)策管、數(shù)據(jù)策展4數(shù)據(jù)監(jiān)護DATA CURATION 4數(shù)據(jù)監(jiān)護DATA CURATION國外現(xiàn)狀案例國外圖書館已充分意識到數(shù)據(jù)監(jiān)護和大數(shù)據(jù)帶來的機遇和挑戰(zhàn),并設(shè)法將

15、圖書館服務(wù)邊界拓展到科學研究和學術(shù)交流的新階段數(shù)據(jù)階段;數(shù)據(jù)監(jiān)護服務(wù)逐漸成為國外圖書館界科研及實踐的新熱點,其中以美國高校圖書館表現(xiàn)最為活躍。開始設(shè)置專門的數(shù)據(jù)監(jiān)護崗位,較典型的如:數(shù)據(jù)專家(Data Scientist)、數(shù)據(jù)研究專家(Data Research Scientist)、數(shù)據(jù)服務(wù)館員(Data Services Librarian)、數(shù)據(jù)人文專家(Data Humanist)等,將圖書館的服務(wù)邊界加以拓展。美國國家科學基金會NSF (National Science Foundation)在2007年啟動“DataNet”計劃,預(yù)算花1億美元,明確以圖書館為主體,用五年時間資助

16、5項數(shù)據(jù)監(jiān)護重點研究課題,以推動數(shù)據(jù)監(jiān)護工作。目前已有兩個獲全額資助的研究項目,一個由新墨西哥大學圖書館主持,另一個由約翰霍普金斯大學圖書館主持。實際上參與這兩個項目的高校圖書館多達10余所,各圖書館均有長期承擔數(shù)據(jù)監(jiān)護的意向。美國制定了明確的數(shù)據(jù)監(jiān)護發(fā)展策略,即:數(shù)據(jù)監(jiān)護要能實現(xiàn)經(jīng)濟上的可持續(xù)發(fā)展。NSF的“DataNet”計劃就明確要求被資助者提出經(jīng)濟模式,在5年資助期滿后具備自生存能力。它實際要求的是“圖書館 - 學科”共建模式,其成員不僅要有圖書館員及信息技術(shù)員,還必須有相關(guān)學科的學者參與,通過為科研人員提供服務(wù),吸引其加入該活動并注資。 4數(shù)據(jù)監(jiān)護DATA CURATION1423完

17、成“數(shù)據(jù)監(jiān)護員”角色轉(zhuǎn)變。接納自己在數(shù)據(jù)處理上的一個新的角色,即把大數(shù)據(jù)集變得更加有用、可視化程度更高和更易獲取。醫(yī)院圖書館員應(yīng)學習數(shù)據(jù)監(jiān)護搶占數(shù)據(jù)監(jiān)護服務(wù)陣地。醫(yī)院每天產(chǎn)生大量的管理、科研和臨床數(shù)據(jù)。圖書館應(yīng)當立即對可獲得的數(shù)據(jù)展開收集工作,探索數(shù)據(jù)監(jiān)護的一系列活動。加強與其它科室的合作。向本院醫(yī)護管理人員宣傳數(shù)據(jù)監(jiān)護的知識和作用,共同開發(fā)可用的數(shù)據(jù),并能夠?qū)︶t(yī)院、各??瓶剖业拇髷?shù)據(jù)集的存儲和獲取給與指導(dǎo)性建議。加快元數(shù)據(jù)建設(shè)。元數(shù)據(jù)價值尚待挖掘,應(yīng)幫助研究人員通過新型分析方法,從全新的視角來觀察數(shù)據(jù),發(fā)掘出原本信息以外的價值。 5館員知識與技能SKILLS AND KNOWLEDGEXX省

18、醫(yī)院協(xié)會醫(yī)院圖書情報管理專業(yè)委員會2015年學術(shù)年會8月2022日XXXX 5館員知識與技能SKILLS AND KNOWLEDGE程序Programming數(shù)據(jù)庫工程Database統(tǒng)計Statistics可視化Visualization熟悉數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換技術(shù)及軟件的工作方法(程序員)清楚描述性統(tǒng)計匯總和數(shù)字數(shù)據(jù)基本測試哪些情況是正確運用,哪些情況是不恰當運用(統(tǒng)計員)明白信息檢索工具的理論基礎(chǔ)(數(shù)據(jù)庫工程師)認識有效數(shù)據(jù)呈現(xiàn)的特征(視圖設(shè)計師) 5館員知識與技能SKILLS AND KNOWLEDGE人才儲備豐富人才儲備,讓醫(yī)院圖書館在大數(shù)據(jù)時代發(fā)揮應(yīng)有的功能。方法一方法二所有館員都學習相應(yīng)的基礎(chǔ)知識,并針對各館員的專長加以培訓,使其更符合大數(shù)據(jù)的要求。培訓對專業(yè)性較強的技能要求,可以考慮直接引進具備該項知識和技能的人員加入。引進提升館員在理解讀者的信息需求到完成數(shù)據(jù)監(jiān)護中間,還有很多高深的知識和復(fù)雜的技術(shù)等待醫(yī)院圖書館員去學習和掌握。 6圖書館未來發(fā)展FUTURE DEVELOPMENT 管理人員和館員在大數(shù)據(jù)時代為圖書館思考:利用大數(shù)據(jù)工具,本館可以

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