生物信息學參考答案_第1頁
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1、二、參考答案單項選擇題 (每題3分,共30分)CDABBDACBA填空題 (每題2分,共20分)0.34, 0.377.45, 1.19, 10.97, 0.8787.50%, 95.19%, 94.82%三、綜合題 (每題10分,共50分)1. (1) 隨機選取M個點,作為每一個類的中心點 (2) 計算其他點與這M個中心點的距離,將每個點按照離哪個中心點近,歸在哪個類中 (3) 針對每一類中的每一個點,計算其與其他點的距離,加和,除以該類點的數(shù)目,找到新的中心點,即改點到該類中其他點的平均值最小,從而確定新的M個中心點 (4) 重復(fù)步驟2, 3,直到結(jié)果收斂 (5) 最終結(jié)果:N個基因表達數(shù)

2、據(jù)被聚成M類2. P(A) = 0.0216, P(B)=0.0446(1) Needleman-Wunsch算法比對結(jié)果:SQYYRKDLEYKRK-得分:13(2) Smith-Waterman算法QYYRKEYKRK得分:224. 5. (1) 漸進算法:a. 將所有序列兩兩比對,計算距離矩陣b. 構(gòu)建鄰接進化樹(neighbor-joining tree)/指導樹(guide tree)c. 將距離最近的兩條序列用動態(tài)規(guī)劃的算法進行比對d. “漸進”的加上其他的序列(2) T-coffee算法:a. 采用Clustal程序計算兩兩序列之間的全局最優(yōu)比對結(jié)果b. 采用LALIGN程序計算兩兩序列之間的局部最優(yōu)比對的結(jié)果c. 設(shè)計加權(quán)系統(tǒng),綜合考慮以上兩類結(jié)

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