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第四章微生物的生理
第一節(jié)微生物的酶
酶是動(dòng)物、植物及微生物等生物體內(nèi)合成的、催化生物化學(xué)反應(yīng)的、并傳遞電子、原子和化學(xué)基團(tuán)的生物催化劑。能在機(jī)體中十分溫和的條件下,高效率地催化各種生物化學(xué)反應(yīng),促進(jìn)生物體的新陳代謝。生命活動(dòng)中的消化、吸收、呼吸、運(yùn)動(dòng)和生殖都是酶促反應(yīng)過(guò)程。酶是細(xì)胞賴(lài)以生存的基礎(chǔ)。細(xì)胞新陳代謝包括的所有化學(xué)反應(yīng)幾乎都是在酶的催化下進(jìn)行的。第四章微生物的生理
第一節(jié)微生物的酶1一、酶的組成按照酶的化學(xué)組成可將酶分為單純酶和結(jié)合酶兩大類(lèi)。單純酶分子中只有氨基酸殘基組成的肽鏈,結(jié)合酶分子中則除了多肽鏈組成的蛋白質(zhì),還有非蛋白成分,如金屬離子、鐵卟啉或含B族維生素的小分子有機(jī)物。結(jié)合酶的蛋白質(zhì)部分稱(chēng)為酶蛋白,非蛋白質(zhì)部分統(tǒng)稱(chēng)為輔助因子,兩者一起組成全酶;只有全酶才有催化活性,如果兩者分開(kāi)則酶活力消失。非蛋白質(zhì)部分如鐵卟啉或含B族維生素的化合物若與酶蛋白以共價(jià)鍵相連的稱(chēng)為輔基,用透析或超濾等方法不能使它們與酶蛋白分開(kāi);反之兩者以非共價(jià)鍵相連的稱(chēng)為輔酶,可用上述方法把兩者分開(kāi)。一、酶的組成2第一節(jié)微生物的酶(一)酶的組成形式微生物的酶單成分酶全酶酶蛋白+非蛋白質(zhì)小分子有機(jī)物脫氫酶酶蛋白+金屬離子細(xì)胞色素氧化酶
酶蛋白+非蛋白質(zhì)小分子有機(jī)物+金屬離子丙酮酸脫氫酶水解酶第一節(jié)微生物的酶(一)酶的組成形式微生物的酶單成分酶全酶3一、酶的組成酶的輔助因子包括金屬離子及小分子復(fù)雜有機(jī)化合物。它們本身無(wú)催化作用,但參與氧化還原或運(yùn)載?;d體的作用,現(xiàn)在還認(rèn)為有些蛋白質(zhì)也屬于這一類(lèi),稱(chēng)為蛋白輔酶。大多數(shù)情況下,可以通過(guò)透析或其他的方法將全酶中的輔助因子除去。例如,酵母提取物有催化葡萄糖發(fā)酵的能力,透析除去輔助因子I(C0I)后,酵母提取物就失去了催化能力,這種與酶蛋白松弛結(jié)合的輔助因子稱(chēng)為輔酶。一、酶的組成酶的輔助因子包括金屬離子及小分子復(fù)雜有機(jī)化合物。4一、酶的組成但是在少數(shù)情況下,有一些輔助因子是以共價(jià)鍵和酶蛋白較牢固的結(jié)合在一起的,不易透析除去,這種輔助因子稱(chēng)為輔基。例如,細(xì)胞色素氧化酶與鐵卟啉輔基結(jié)合較牢固,輔基鐵卟啉不易除去。所以,輔基與輔酶的區(qū)別只在于它們與酶蛋白結(jié)合的牢固程度不同,并無(wú)嚴(yán)格的界限。一、酶的組成但是在少數(shù)情況下,有一些輔助因子是以共價(jià)鍵和酶蛋5一、酶的組成輔酶及輔基一般在酶促反應(yīng)中起攜帶及轉(zhuǎn)移電子、原子或功能基中間體的作用,因此有的輔酶或輔基也叫做底物載體。在催化反應(yīng)中,酶蛋白與輔助因子所起的作用不同,酶反應(yīng)的專(zhuān)一性及高效率取決于酶蛋白本身,而輔助因子則直接對(duì)電子、原子或某些化學(xué)基因起傳遞作用。金屬離子的功能可能是酶活性中心的組成成分;有的可能在穩(wěn)定酶分子的構(gòu)象上起作用;有的可能作為橋梁使酶與底物相連接。輔酶與輔基在催化反應(yīng)中作為氫(H+和e)或某些化學(xué)基團(tuán)的載體,起傳遞氫或化學(xué)基團(tuán)的作用。一、酶的組成輔酶及輔基一般在酶促反應(yīng)中起攜帶及轉(zhuǎn)移電子、原子6一、酶的組成(二)幾種重要輔基和輔酶見(jiàn)(P101~104)常見(jiàn)的輔酶和輔基有:輔酶A(CoA或CoASH)、NAD(輔酶I)和NADP(輔酶II)、FMN(黃素單核苷酸)和FAD(黃素腺嘌呤二核苷酸)、輔酶Q(CoQ)、磷酸腺苷及其他核苷酸類(lèi)(包括AMP、ADP、ATP、GTP、UTP、CTP等)。專(zhuān)性厭氧菌特有的輔酶:輔酶M、F420(輔酶420)、F430(輔酶430)等。一、酶的組成(二)幾種重要輔基和輔酶見(jiàn)(P101~104)7二、酶蛋白的結(jié)構(gòu)
蛋白的結(jié)構(gòu)分為一級(jí)、二級(jí)、和三級(jí),少數(shù)酶具有四級(jí)結(jié)構(gòu)。一級(jí)結(jié)構(gòu):指多肽本身結(jié)構(gòu)。(由肽鍵—C0—NH—連接氨基酸)二級(jí)結(jié)構(gòu):由多肽鏈形成的初級(jí)空間結(jié)構(gòu),由氫鍵>C=0…H—N<維持其穩(wěn)定性。三級(jí)結(jié)構(gòu):是在二級(jí)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上,多肽進(jìn)一步彎曲盤(pán)繞形成更復(fù)雜的構(gòu)型。由氫鍵>C=0…H—N<、鹽鍵—NH3+—00C—及疏水鍵盤(pán)維持三級(jí)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。四級(jí)結(jié)構(gòu):由幾個(gè)或幾十個(gè)亞基形成。二、酶蛋白的結(jié)構(gòu)蛋白的結(jié)構(gòu)分為一級(jí)、二級(jí)、和三級(jí),少數(shù)酶具8第一節(jié)微生物的酶二、酶蛋白的結(jié)構(gòu)二級(jí)結(jié)構(gòu)三級(jí)結(jié)構(gòu)四級(jí)結(jié)構(gòu)第一節(jié)微生物的酶二、酶蛋白的結(jié)構(gòu)二級(jí)結(jié)構(gòu)三級(jí)結(jié)構(gòu)四級(jí)結(jié)9酶蛋白結(jié)構(gòu)圖酶蛋白10三、酶的活性中心酶的活性中心是指酶蛋白分子中與底物結(jié)合,并起催化作用的小部分氨基酸微區(qū)。對(duì)于不需要輔酶的酶來(lái)說(shuō),活性中心就是酶分子中在三級(jí)結(jié)構(gòu)上比較靠近的少數(shù)幾個(gè)氨基酸殘基或是這些殘基上的某些基團(tuán),它們?cè)谝患?jí)結(jié)構(gòu)上可能相距甚遠(yuǎn),甚至位于不同肽鏈上,通過(guò)肽鍵的盤(pán)繞、折疊而在空間構(gòu)象上相互靠近;對(duì)于需要輔酶的酶來(lái)說(shuō),輔酶分子或輔酶分子上的某一部分結(jié)構(gòu)往往就是活性中心的組成部分。三、酶的活性中心酶的活性中心是指酶蛋白分子中與底物結(jié)合,并起11三、酶的活性中心一般認(rèn)為活性中心有兩個(gè)功能部位:①結(jié)合部位:一定的底物靠近此部位結(jié)合到酶分子上。②催化部位:底物的鍵在此部位被打斷或形成新的鍵,從而發(fā)生一定的化學(xué)變化?;钚灾行牡男纬梢竺傅鞍追肿泳哂幸欢ǖ目臻g構(gòu)象,因此,酶分子中的其它部分的作用對(duì)于酶的催化來(lái)說(shuō),可能是次要的,但絕不是毫無(wú)意義的,它們至少為酶活性中心的形成提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。所以酶的活性中心與酶蛋白空間構(gòu)象的完整性之間,是辯證統(tǒng)一的關(guān)系。當(dāng)外界物理化學(xué)因素破壞了酶的結(jié)構(gòu)時(shí),首先就可能影響活性中心的特定結(jié)構(gòu),結(jié)果就必然影響酶活力。三、酶的活性中心一般認(rèn)為活性中心有兩個(gè)功能部位:①結(jié)合部位:12牛胰核糖核酸酶的活性中心牛胰核糖核酸酶13微生物的酶9課件14微生物的酶9課件15四、酶的分類(lèi)與命名(一)酶的分類(lèi)1、國(guó)際系統(tǒng)分類(lèi)法及酶的編號(hào)按酶所催化的化學(xué)反應(yīng)類(lèi)型,把酶化分為6類(lèi),即1、水解酶類(lèi):是催化大分子有機(jī)物水解成小分子的酶。2、氧化還原酶類(lèi):是催化氧化還原反應(yīng)的酶。3、轉(zhuǎn)移酶類(lèi):是催化底物因團(tuán)轉(zhuǎn)移到另一有機(jī)物上的酶。4、異構(gòu)酶類(lèi):催化同分異構(gòu)分子內(nèi)的基團(tuán)重新排列。5、裂解酶類(lèi):催化有機(jī)物裂解分小分子有機(jī)物。6、合成酶類(lèi):催化底物的合成反應(yīng)。四、酶的分類(lèi)與命名(一)酶的分類(lèi)16四、酶的分類(lèi)與命名(二)酶的命名1、按酶在細(xì)胞的不同部位,可把酶分為:胞外酶、胞內(nèi)酶和表面酶。2、按酶作用底物的不同,可把酶分為:淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、纖維素酶、核糖核酸酶。四、酶的分類(lèi)與命名(二)酶的命名17四、酶的分類(lèi)與命名(三)根據(jù)酶蛋白分子特點(diǎn)又可將酶分為三類(lèi)1、單體酶只有一條多肽鏈,屬于這一類(lèi)的酶很少,一般都是催化水解反應(yīng)酶,分子量在13,000~35,000之間,如溶菌酶、胰蛋白酶等。2、寡聚酶由幾個(gè)甚至幾十個(gè)亞基組成,這些亞基可以是相同的多肽鏈,也可以是不同的多肽鏈。亞基之間不是共價(jià)結(jié)合,彼此很容易分開(kāi)。寡聚酶分子量從35,000到幾百萬(wàn)。3、多酶體系是由幾種酶彼此嵌合形成的復(fù)合體。它有利于一系列反應(yīng)的連續(xù)進(jìn)行。例如在脂肪合成中的脂肪酸合成酶復(fù)合體。四、酶的分類(lèi)與命名(三)根據(jù)酶蛋白分子特點(diǎn)又可將酶分為三類(lèi)18五、酶的催化特性
酶作為生物催化劑,具有一般催化劑的特征:(1)能加快化學(xué)反應(yīng)的速度,而本身在反應(yīng)前后沒(méi)有結(jié)構(gòu)和性質(zhì)的改變;(2)只能縮短反應(yīng)達(dá)到平衡所需要的時(shí)間而不能改變反應(yīng)的平衡點(diǎn)。五、酶的催化特性
酶作為生物催化劑,具有一般催化劑的特征:19五、酶的催化特性
酶作為一種生物大分子又有其不同之處:
1、酶具有一般催化劑的共性用量少而催化效率高;不改變化學(xué)反應(yīng)的平衡點(diǎn),可降低反應(yīng)的活化能2
酶具有高度專(zhuān)一性酶對(duì)底物及催化的反應(yīng)有嚴(yán)格的選擇性(專(zhuān)一性),一種酶僅能作用于一種物質(zhì)或一類(lèi)結(jié)構(gòu)相似的物質(zhì),發(fā)生一定的化學(xué)反應(yīng),這種對(duì)底物的選擇性稱(chēng)為酶的專(zhuān)一性。如蛋白酶只能水解蛋白質(zhì)、脂肪酶只能水解脂肪、而淀粉酶只能作用于淀粉。3反應(yīng)條件溫和酶催化的反應(yīng)是在常溫、常壓和近中性的溶液條件下進(jìn)行。酶本身是蛋白質(zhì),故強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、高溫、高壓、紫外線、重金屬鹽等一切導(dǎo)致蛋白質(zhì)不可逆變性的因素,都能使酶受到破壞而喪失其催化活性。五、酶的催化特性
酶作為一種生物大分子又有其不同之處:20酶作為一種生物大分子又有其不同之處:4
酶對(duì)環(huán)境條件的變化極為敏感
酶是生物大分子,對(duì)環(huán)境的變化非常敏感,高溫、強(qiáng)酸或強(qiáng)堿、重金屬等引起蛋白質(zhì)變性的條件,都能使酶喪失活性。同時(shí)酶也常因溫度、pH的輕微改變或抑制劑的存在而使其活性發(fā)生改變。5、催化效率高
酶催化反應(yīng)的速率比非催化反應(yīng)高108-1020倍,比非生物催化劑高107-1013倍。如過(guò)氧化氫酶催化過(guò)氧化氫分解的的反應(yīng),若用鐵離子作為催化劑,反應(yīng)速率為6×10-4;若用過(guò)氧化氫酶催化,反應(yīng)速率為6×106。酶能高效催化主要是能降低反應(yīng)的活化能。酶作為一種生物大分子又有其不同之處:4
酶對(duì)環(huán)境條件的變化21
六、影響酶活力的因素
影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:
1、酶濃度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響在酶促反應(yīng)中,如果底物濃度足夠大,足以使酶飽和則反應(yīng)速度與酶濃度成正比。這里使用的酶必須是純酶制劑或不含抑制物的粗酶制劑。2、底物濃度對(duì)酶反應(yīng)速度的影響在生化反應(yīng)中,若酶的濃度為定值,底物的起始濃度較低時(shí),酶促反應(yīng)速度與底物濃度成正比,即隨底物濃度的增加而增加。但在實(shí)際測(cè)定中,即使酶濃度足夠高,隨著底物濃度的升高,酶促反應(yīng)速度并沒(méi)有因此增加,甚至受到抑制。
六、影響酶活力的因素
影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:
122其原因是:①高濃度的底物降低了水的有效濃度,降低了分子擴(kuò)散性,從而降低了酶促反應(yīng)速度。②過(guò)量的底物與激化劑結(jié)構(gòu),降低了激活劑的有效濃度,也會(huì)降低酶促反應(yīng)速度。③過(guò)量的底物聚集在酶分子上,生成無(wú)活性的中間產(chǎn)物,不能釋放出酶分子,從而也會(huì)降低反應(yīng)速度。其原因是:231.酶濃度對(duì)酶促反應(yīng)的影響酶促反應(yīng)速度與酶分子濃度成正比。當(dāng)?shù)孜锓肿訚舛茸銐驎r(shí),酶分子越多,底物轉(zhuǎn)化的速度越快。1.酶濃度對(duì)酶促反應(yīng)的影響242.底物濃度對(duì)酶促反應(yīng)的影響若酶的濃度為定值,底物的起始濃度較低時(shí),酶促反應(yīng)速度與底物濃度成正比,即隨底物濃度的增加而增加。當(dāng)所有的酶與底物結(jié)合生成ES后,即使再增加底物濃度,中間產(chǎn)物濃度[ES]也不會(huì)增加,酶促反應(yīng)速度也不增加在底物濃度相同的條件下,酶促反應(yīng)速度與酶的初始濃度成正比。酶的初始濃度大,其酶促反應(yīng)速度就大。2.底物濃度對(duì)酶促反應(yīng)的影響25影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:
3、溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響各種酶在最適溫度范圍內(nèi),酶活性最強(qiáng),酶促反應(yīng)速度最大。在適宜的溫度范圍內(nèi),溫度每升高10C0,酶促反應(yīng)速度可相應(yīng)提高1~2倍。用溫度系數(shù)Q10來(lái)表示溫度對(duì)酶促反應(yīng)的影響。Q10表示溫度每升高10C0,酶反應(yīng)速度隨之相應(yīng)提高的因素。影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:
3、溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影26影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響有兩個(gè)方面:一方面是當(dāng)溫度升高時(shí),反應(yīng)速度也加快,這與一般化學(xué)反應(yīng)一樣。另一方面,隨溫度升高而使酶逐步變性,即通過(guò)減少有活性的酶而降低酶的反應(yīng)速度。酶反應(yīng)的最適溫度就是這兩種過(guò)程平衡的結(jié)果,在低于最適溫度時(shí),前一種效應(yīng)為主,在高于最適溫度時(shí),后一效應(yīng)為主,因而酶活性迅速喪失,反應(yīng)速度很快下降。大部分酶在60C0下上變性,少數(shù)酶能耐受較高的溫度,如細(xì)菌淀粉酶在93C0下活力最高,又如牛胰核糖核酸酶加熱到100C0仍不失活。影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響有兩27影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:最適溫度不是酶的特征物理常數(shù),而是上述影響的綜合結(jié)果,它不是一個(gè)固定值,而與酶作用時(shí)間的長(zhǎng)短有關(guān),酶可以在短時(shí)間內(nèi)耐受較高的溫度,然而當(dāng)酶反應(yīng)時(shí)間延長(zhǎng)時(shí),最適溫度向溫度降低的方向移動(dòng)。因此,嚴(yán)格的講,僅僅在酶反應(yīng)時(shí)間已經(jīng)規(guī)定了的情況下,才有最適溫度。酶在干燥狀態(tài)下,比在潮濕狀態(tài)下,對(duì)溫度的耐受力要高。這一點(diǎn)已用于指導(dǎo)酶的保藏。有些酶的干粉制劑可在濕適溫下放置一段時(shí)間。而其水溶液則必須保存于冰箱中;制成冰凍干粉的酶制劑可于冰箱中放置幾個(gè)月,甚至更長(zhǎng)時(shí)間,而未制成這種干粉的酶溶液在冰箱中只能保存幾周,甚至幾天就會(huì)失活。影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:最適溫度不是酶的特征物理常數(shù)28一般微生物的溫度最適范圍在25~60℃。溫度的影響存在三基點(diǎn):最高、最適、最低。溫度過(guò)高會(huì)破壞酶蛋白,造成變性;(約60℃)溫度過(guò)低會(huì)使酶作用降低或停止,但可以恢復(fù)。(約4℃)不同微生物的溫度適應(yīng)范圍不同。微生物的酶9課件29影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:4、PH對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響大部分酶的活力受其環(huán)境PH的影響,在一定PH下,酶反應(yīng)具有最大速度,高于或低于此值,反應(yīng)速度下降,通常稱(chēng)此PH為酶反應(yīng)的最適PH。最適PH有時(shí)因底物種類(lèi)、濃度及緩沖液成分不同而不同。而且常與酶的等電點(diǎn)不一致,此因,酶的最適PH并不是一個(gè)常數(shù),只是在一定條件下才有意義。影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:4、PH對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響30PH影響活力的原因可能有以下幾個(gè)方面:①過(guò)酸過(guò)堿會(huì)影響酶蛋白的構(gòu)象,甚至使酶變性而失活。②當(dāng)PH改變不很劇烈時(shí),酶雖不變性,但活力受影響。因?yàn)镻H會(huì)影響底物分子的解離狀態(tài);也會(huì)影響酶分子解離狀態(tài),最適PH與酶活力中心結(jié)合底物的基團(tuán)及參與催化的基團(tuán)的PH值有關(guān),往往只有一種解離狀態(tài)最有利于與底物結(jié)合,在此PH下酶活力最高;也可能影響到中間產(chǎn)物ES的解離狀態(tài)。總之,都影響到ES的形成,從而降低酶活性。③PH影響分子中另一些基團(tuán)的解離,這些基團(tuán)的離子化狀態(tài)與酶的專(zhuān)一性及酶分子活力中心的構(gòu)象有關(guān)。PH影響活力的原因可能有以下幾個(gè)方面:31影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:5、激活劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響能激活酶的物質(zhì)稱(chēng)為酶的激活劑。激活劑有:無(wú)機(jī)陽(yáng)離子;無(wú)機(jī)陰離子;有機(jī)化合物。許多酶只有當(dāng)某一種適應(yīng)的激活劑存在時(shí),才表現(xiàn)出催化活性或強(qiáng)化其催化活性,這稱(chēng)為對(duì)酶的激活作用。影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:5、激活劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影32影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:6、抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響酶是蛋白質(zhì),凡使酶蛋白變性而起酶活力喪失的作用稱(chēng)為失活作用。凡使酶活力下降,但并不引起酶蛋白變性的作用稱(chēng)為抑制作用。所以,抑制作用與變性作用是不同的。某些物質(zhì),它們并不引起酶蛋白變性,但能與酶分子上的某些必需基團(tuán)(主要是指酶活性中心上的一些基團(tuán))發(fā)生化學(xué)反應(yīng),因而引起酶活力下降,甚至喪失,致使酶反應(yīng)速度降低。能引起這種抑制作用的物質(zhì)叫做酶的抑制劑。影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:6、抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影336、抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響
研究抑制劑對(duì)酶的作用是非常重要的,它有力地推動(dòng)了生物機(jī)體代謝途徑、某些藥物的作用機(jī)理、酶活性中心內(nèi)功能基團(tuán)的性質(zhì)、維持酶分子構(gòu)象的功能基的性質(zhì),酶的底物專(zhuān)一性以及酶的作用機(jī)理等重要課題等研究的進(jìn)展。根據(jù)抑制劑與酶作用方式及抑制作用是否可逆,可將抑制作用分為兩大類(lèi)。(1)不可逆的抑制作用:這類(lèi)抑制劑通常以比較牢固的共價(jià)鍵與酶蛋白中的基團(tuán)結(jié)合,而使酶失活。不能用透析、超濾等方法除去抑制劑而恢復(fù)酶活性。6、抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響
研究抑制劑對(duì)酶的作用是非常重346、抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響(2)可逆的抑制作用:這類(lèi)抑制劑與酶蛋白的結(jié)合是可逆的,可用透析法除去抑制劑,恢復(fù)酶的活性。根據(jù)抑制劑與底物的關(guān)系,可逆抑制作用分為三種類(lèi)型:①競(jìng)爭(zhēng)性抑制:抑制劑與底物競(jìng)爭(zhēng),從而阻止底物與酶的結(jié)合。因酶的活性中心不能同時(shí)即與抑制劑(I)作用,又與底物(S)作用。這是最常見(jiàn)的一種可逆的抑制作用。但可以通過(guò)增加底物濃度而解除這種抑制。6、抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響(2)可逆的抑制作用:35②非競(jìng)爭(zhēng)性抑制:酶可以同時(shí)與底物及抑制劑結(jié)合。兩者沒(méi)有競(jìng)爭(zhēng)作用。酶與抑制劑結(jié)合后,還可以與底物結(jié)合:EI+I→ESI;酶與底物結(jié)合后也可還可以與抑制劑結(jié)合ES+I→ESI。但是中間物ESI不能進(jìn)一步分解為產(chǎn)物,因此酶活性降低。③反競(jìng)爭(zhēng)性抑制:酶只有在與底物結(jié)合,才能與抑制劑結(jié)合,即ES+I→ESI,E+I→X。比較起來(lái),這種抑制作用最不重要。②非競(jìng)爭(zhēng)性抑制:36補(bǔ)充:酶的應(yīng)用1.皮革脫毛傳統(tǒng)方式:灰堿法(生石灰和硫化鈉)缺點(diǎn):污染、勞動(dòng)強(qiáng)度大、效率低。蛋白酶法:蛋白酶分解優(yōu)點(diǎn):效率高、勞動(dòng)條件好;無(wú)污染。2.生物制漿利用微生物的酶分解原料中的木質(zhì)素,形成纖維素用于造紙。補(bǔ)充:酶的應(yīng)用37[總結(jié)新課]1、酶是生物催化劑,它于一般催化劑有五個(gè)方面的共性:用量少催化效果率高;不改變化學(xué)反應(yīng)的平衡點(diǎn);可降低反應(yīng)的活化能;酶活力的調(diào)節(jié)控制;酶的催化活力與輔酶、輔基和金屬離子有關(guān)。2、酶蛋白具有一、二、三、四級(jí)結(jié)構(gòu)3、酶的分類(lèi)4、影響酶活力的因素
[布置作業(yè)]P1611、2、3、4、5、6、[總結(jié)新課]38第四章微生物的生理
第一節(jié)微生物的酶
酶是動(dòng)物、植物及微生物等生物體內(nèi)合成的、催化生物化學(xué)反應(yīng)的、并傳遞電子、原子和化學(xué)基團(tuán)的生物催化劑。能在機(jī)體中十分溫和的條件下,高效率地催化各種生物化學(xué)反應(yīng),促進(jìn)生物體的新陳代謝。生命活動(dòng)中的消化、吸收、呼吸、運(yùn)動(dòng)和生殖都是酶促反應(yīng)過(guò)程。酶是細(xì)胞賴(lài)以生存的基礎(chǔ)。細(xì)胞新陳代謝包括的所有化學(xué)反應(yīng)幾乎都是在酶的催化下進(jìn)行的。第四章微生物的生理
第一節(jié)微生物的酶39一、酶的組成按照酶的化學(xué)組成可將酶分為單純酶和結(jié)合酶兩大類(lèi)。單純酶分子中只有氨基酸殘基組成的肽鏈,結(jié)合酶分子中則除了多肽鏈組成的蛋白質(zhì),還有非蛋白成分,如金屬離子、鐵卟啉或含B族維生素的小分子有機(jī)物。結(jié)合酶的蛋白質(zhì)部分稱(chēng)為酶蛋白,非蛋白質(zhì)部分統(tǒng)稱(chēng)為輔助因子,兩者一起組成全酶;只有全酶才有催化活性,如果兩者分開(kāi)則酶活力消失。非蛋白質(zhì)部分如鐵卟啉或含B族維生素的化合物若與酶蛋白以共價(jià)鍵相連的稱(chēng)為輔基,用透析或超濾等方法不能使它們與酶蛋白分開(kāi);反之兩者以非共價(jià)鍵相連的稱(chēng)為輔酶,可用上述方法把兩者分開(kāi)。一、酶的組成40第一節(jié)微生物的酶(一)酶的組成形式微生物的酶單成分酶全酶酶蛋白+非蛋白質(zhì)小分子有機(jī)物脫氫酶酶蛋白+金屬離子細(xì)胞色素氧化酶
酶蛋白+非蛋白質(zhì)小分子有機(jī)物+金屬離子丙酮酸脫氫酶水解酶第一節(jié)微生物的酶(一)酶的組成形式微生物的酶單成分酶全酶41一、酶的組成酶的輔助因子包括金屬離子及小分子復(fù)雜有機(jī)化合物。它們本身無(wú)催化作用,但參與氧化還原或運(yùn)載?;d體的作用,現(xiàn)在還認(rèn)為有些蛋白質(zhì)也屬于這一類(lèi),稱(chēng)為蛋白輔酶。大多數(shù)情況下,可以通過(guò)透析或其他的方法將全酶中的輔助因子除去。例如,酵母提取物有催化葡萄糖發(fā)酵的能力,透析除去輔助因子I(C0I)后,酵母提取物就失去了催化能力,這種與酶蛋白松弛結(jié)合的輔助因子稱(chēng)為輔酶。一、酶的組成酶的輔助因子包括金屬離子及小分子復(fù)雜有機(jī)化合物。42一、酶的組成但是在少數(shù)情況下,有一些輔助因子是以共價(jià)鍵和酶蛋白較牢固的結(jié)合在一起的,不易透析除去,這種輔助因子稱(chēng)為輔基。例如,細(xì)胞色素氧化酶與鐵卟啉輔基結(jié)合較牢固,輔基鐵卟啉不易除去。所以,輔基與輔酶的區(qū)別只在于它們與酶蛋白結(jié)合的牢固程度不同,并無(wú)嚴(yán)格的界限。一、酶的組成但是在少數(shù)情況下,有一些輔助因子是以共價(jià)鍵和酶蛋43一、酶的組成輔酶及輔基一般在酶促反應(yīng)中起攜帶及轉(zhuǎn)移電子、原子或功能基中間體的作用,因此有的輔酶或輔基也叫做底物載體。在催化反應(yīng)中,酶蛋白與輔助因子所起的作用不同,酶反應(yīng)的專(zhuān)一性及高效率取決于酶蛋白本身,而輔助因子則直接對(duì)電子、原子或某些化學(xué)基因起傳遞作用。金屬離子的功能可能是酶活性中心的組成成分;有的可能在穩(wěn)定酶分子的構(gòu)象上起作用;有的可能作為橋梁使酶與底物相連接。輔酶與輔基在催化反應(yīng)中作為氫(H+和e)或某些化學(xué)基團(tuán)的載體,起傳遞氫或化學(xué)基團(tuán)的作用。一、酶的組成輔酶及輔基一般在酶促反應(yīng)中起攜帶及轉(zhuǎn)移電子、原子44一、酶的組成(二)幾種重要輔基和輔酶見(jiàn)(P101~104)常見(jiàn)的輔酶和輔基有:輔酶A(CoA或CoASH)、NAD(輔酶I)和NADP(輔酶II)、FMN(黃素單核苷酸)和FAD(黃素腺嘌呤二核苷酸)、輔酶Q(CoQ)、磷酸腺苷及其他核苷酸類(lèi)(包括AMP、ADP、ATP、GTP、UTP、CTP等)。專(zhuān)性厭氧菌特有的輔酶:輔酶M、F420(輔酶420)、F430(輔酶430)等。一、酶的組成(二)幾種重要輔基和輔酶見(jiàn)(P101~104)45二、酶蛋白的結(jié)構(gòu)
蛋白的結(jié)構(gòu)分為一級(jí)、二級(jí)、和三級(jí),少數(shù)酶具有四級(jí)結(jié)構(gòu)。一級(jí)結(jié)構(gòu):指多肽本身結(jié)構(gòu)。(由肽鍵—C0—NH—連接氨基酸)二級(jí)結(jié)構(gòu):由多肽鏈形成的初級(jí)空間結(jié)構(gòu),由氫鍵>C=0…H—N<維持其穩(wěn)定性。三級(jí)結(jié)構(gòu):是在二級(jí)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上,多肽進(jìn)一步彎曲盤(pán)繞形成更復(fù)雜的構(gòu)型。由氫鍵>C=0…H—N<、鹽鍵—NH3+—00C—及疏水鍵盤(pán)維持三級(jí)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。四級(jí)結(jié)構(gòu):由幾個(gè)或幾十個(gè)亞基形成。二、酶蛋白的結(jié)構(gòu)蛋白的結(jié)構(gòu)分為一級(jí)、二級(jí)、和三級(jí),少數(shù)酶具46第一節(jié)微生物的酶二、酶蛋白的結(jié)構(gòu)二級(jí)結(jié)構(gòu)三級(jí)結(jié)構(gòu)四級(jí)結(jié)構(gòu)第一節(jié)微生物的酶二、酶蛋白的結(jié)構(gòu)二級(jí)結(jié)構(gòu)三級(jí)結(jié)構(gòu)四級(jí)結(jié)47酶蛋白結(jié)構(gòu)圖酶蛋白48三、酶的活性中心酶的活性中心是指酶蛋白分子中與底物結(jié)合,并起催化作用的小部分氨基酸微區(qū)。對(duì)于不需要輔酶的酶來(lái)說(shuō),活性中心就是酶分子中在三級(jí)結(jié)構(gòu)上比較靠近的少數(shù)幾個(gè)氨基酸殘基或是這些殘基上的某些基團(tuán),它們?cè)谝患?jí)結(jié)構(gòu)上可能相距甚遠(yuǎn),甚至位于不同肽鏈上,通過(guò)肽鍵的盤(pán)繞、折疊而在空間構(gòu)象上相互靠近;對(duì)于需要輔酶的酶來(lái)說(shuō),輔酶分子或輔酶分子上的某一部分結(jié)構(gòu)往往就是活性中心的組成部分。三、酶的活性中心酶的活性中心是指酶蛋白分子中與底物結(jié)合,并起49三、酶的活性中心一般認(rèn)為活性中心有兩個(gè)功能部位:①結(jié)合部位:一定的底物靠近此部位結(jié)合到酶分子上。②催化部位:底物的鍵在此部位被打斷或形成新的鍵,從而發(fā)生一定的化學(xué)變化?;钚灾行牡男纬梢竺傅鞍追肿泳哂幸欢ǖ目臻g構(gòu)象,因此,酶分子中的其它部分的作用對(duì)于酶的催化來(lái)說(shuō),可能是次要的,但絕不是毫無(wú)意義的,它們至少為酶活性中心的形成提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。所以酶的活性中心與酶蛋白空間構(gòu)象的完整性之間,是辯證統(tǒng)一的關(guān)系。當(dāng)外界物理化學(xué)因素破壞了酶的結(jié)構(gòu)時(shí),首先就可能影響活性中心的特定結(jié)構(gòu),結(jié)果就必然影響酶活力。三、酶的活性中心一般認(rèn)為活性中心有兩個(gè)功能部位:①結(jié)合部位:50牛胰核糖核酸酶的活性中心牛胰核糖核酸酶51微生物的酶9課件52微生物的酶9課件53四、酶的分類(lèi)與命名(一)酶的分類(lèi)1、國(guó)際系統(tǒng)分類(lèi)法及酶的編號(hào)按酶所催化的化學(xué)反應(yīng)類(lèi)型,把酶化分為6類(lèi),即1、水解酶類(lèi):是催化大分子有機(jī)物水解成小分子的酶。2、氧化還原酶類(lèi):是催化氧化還原反應(yīng)的酶。3、轉(zhuǎn)移酶類(lèi):是催化底物因團(tuán)轉(zhuǎn)移到另一有機(jī)物上的酶。4、異構(gòu)酶類(lèi):催化同分異構(gòu)分子內(nèi)的基團(tuán)重新排列。5、裂解酶類(lèi):催化有機(jī)物裂解分小分子有機(jī)物。6、合成酶類(lèi):催化底物的合成反應(yīng)。四、酶的分類(lèi)與命名(一)酶的分類(lèi)54四、酶的分類(lèi)與命名(二)酶的命名1、按酶在細(xì)胞的不同部位,可把酶分為:胞外酶、胞內(nèi)酶和表面酶。2、按酶作用底物的不同,可把酶分為:淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、纖維素酶、核糖核酸酶。四、酶的分類(lèi)與命名(二)酶的命名55四、酶的分類(lèi)與命名(三)根據(jù)酶蛋白分子特點(diǎn)又可將酶分為三類(lèi)1、單體酶只有一條多肽鏈,屬于這一類(lèi)的酶很少,一般都是催化水解反應(yīng)酶,分子量在13,000~35,000之間,如溶菌酶、胰蛋白酶等。2、寡聚酶由幾個(gè)甚至幾十個(gè)亞基組成,這些亞基可以是相同的多肽鏈,也可以是不同的多肽鏈。亞基之間不是共價(jià)結(jié)合,彼此很容易分開(kāi)。寡聚酶分子量從35,000到幾百萬(wàn)。3、多酶體系是由幾種酶彼此嵌合形成的復(fù)合體。它有利于一系列反應(yīng)的連續(xù)進(jìn)行。例如在脂肪合成中的脂肪酸合成酶復(fù)合體。四、酶的分類(lèi)與命名(三)根據(jù)酶蛋白分子特點(diǎn)又可將酶分為三類(lèi)56五、酶的催化特性
酶作為生物催化劑,具有一般催化劑的特征:(1)能加快化學(xué)反應(yīng)的速度,而本身在反應(yīng)前后沒(méi)有結(jié)構(gòu)和性質(zhì)的改變;(2)只能縮短反應(yīng)達(dá)到平衡所需要的時(shí)間而不能改變反應(yīng)的平衡點(diǎn)。五、酶的催化特性
酶作為生物催化劑,具有一般催化劑的特征:57五、酶的催化特性
酶作為一種生物大分子又有其不同之處:
1、酶具有一般催化劑的共性用量少而催化效率高;不改變化學(xué)反應(yīng)的平衡點(diǎn),可降低反應(yīng)的活化能2
酶具有高度專(zhuān)一性酶對(duì)底物及催化的反應(yīng)有嚴(yán)格的選擇性(專(zhuān)一性),一種酶僅能作用于一種物質(zhì)或一類(lèi)結(jié)構(gòu)相似的物質(zhì),發(fā)生一定的化學(xué)反應(yīng),這種對(duì)底物的選擇性稱(chēng)為酶的專(zhuān)一性。如蛋白酶只能水解蛋白質(zhì)、脂肪酶只能水解脂肪、而淀粉酶只能作用于淀粉。3反應(yīng)條件溫和酶催化的反應(yīng)是在常溫、常壓和近中性的溶液條件下進(jìn)行。酶本身是蛋白質(zhì),故強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、高溫、高壓、紫外線、重金屬鹽等一切導(dǎo)致蛋白質(zhì)不可逆變性的因素,都能使酶受到破壞而喪失其催化活性。五、酶的催化特性
酶作為一種生物大分子又有其不同之處:58酶作為一種生物大分子又有其不同之處:4
酶對(duì)環(huán)境條件的變化極為敏感
酶是生物大分子,對(duì)環(huán)境的變化非常敏感,高溫、強(qiáng)酸或強(qiáng)堿、重金屬等引起蛋白質(zhì)變性的條件,都能使酶喪失活性。同時(shí)酶也常因溫度、pH的輕微改變或抑制劑的存在而使其活性發(fā)生改變。5、催化效率高
酶催化反應(yīng)的速率比非催化反應(yīng)高108-1020倍,比非生物催化劑高107-1013倍。如過(guò)氧化氫酶催化過(guò)氧化氫分解的的反應(yīng),若用鐵離子作為催化劑,反應(yīng)速率為6×10-4;若用過(guò)氧化氫酶催化,反應(yīng)速率為6×106。酶能高效催化主要是能降低反應(yīng)的活化能。酶作為一種生物大分子又有其不同之處:4
酶對(duì)環(huán)境條件的變化59
六、影響酶活力的因素
影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:
1、酶濃度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響在酶促反應(yīng)中,如果底物濃度足夠大,足以使酶飽和則反應(yīng)速度與酶濃度成正比。這里使用的酶必須是純酶制劑或不含抑制物的粗酶制劑。2、底物濃度對(duì)酶反應(yīng)速度的影響在生化反應(yīng)中,若酶的濃度為定值,底物的起始濃度較低時(shí),酶促反應(yīng)速度與底物濃度成正比,即隨底物濃度的增加而增加。但在實(shí)際測(cè)定中,即使酶濃度足夠高,隨著底物濃度的升高,酶促反應(yīng)速度并沒(méi)有因此增加,甚至受到抑制。
六、影響酶活力的因素
影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:
160其原因是:①高濃度的底物降低了水的有效濃度,降低了分子擴(kuò)散性,從而降低了酶促反應(yīng)速度。②過(guò)量的底物與激化劑結(jié)構(gòu),降低了激活劑的有效濃度,也會(huì)降低酶促反應(yīng)速度。③過(guò)量的底物聚集在酶分子上,生成無(wú)活性的中間產(chǎn)物,不能釋放出酶分子,從而也會(huì)降低反應(yīng)速度。其原因是:611.酶濃度對(duì)酶促反應(yīng)的影響酶促反應(yīng)速度與酶分子濃度成正比。當(dāng)?shù)孜锓肿訚舛茸銐驎r(shí),酶分子越多,底物轉(zhuǎn)化的速度越快。1.酶濃度對(duì)酶促反應(yīng)的影響622.底物濃度對(duì)酶促反應(yīng)的影響若酶的濃度為定值,底物的起始濃度較低時(shí),酶促反應(yīng)速度與底物濃度成正比,即隨底物濃度的增加而增加。當(dāng)所有的酶與底物結(jié)合生成ES后,即使再增加底物濃度,中間產(chǎn)物濃度[ES]也不會(huì)增加,酶促反應(yīng)速度也不增加在底物濃度相同的條件下,酶促反應(yīng)速度與酶的初始濃度成正比。酶的初始濃度大,其酶促反應(yīng)速度就大。2.底物濃度對(duì)酶促反應(yīng)的影響63影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:
3、溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響各種酶在最適溫度范圍內(nèi),酶活性最強(qiáng),酶促反應(yīng)速度最大。在適宜的溫度范圍內(nèi),溫度每升高10C0,酶促反應(yīng)速度可相應(yīng)提高1~2倍。用溫度系數(shù)Q10來(lái)表示溫度對(duì)酶促反應(yīng)的影響。Q10表示溫度每升高10C0,酶反應(yīng)速度隨之相應(yīng)提高的因素。影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:
3、溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影64影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響有兩個(gè)方面:一方面是當(dāng)溫度升高時(shí),反應(yīng)速度也加快,這與一般化學(xué)反應(yīng)一樣。另一方面,隨溫度升高而使酶逐步變性,即通過(guò)減少有活性的酶而降低酶的反應(yīng)速度。酶反應(yīng)的最適溫度就是這兩種過(guò)程平衡的結(jié)果,在低于最適溫度時(shí),前一種效應(yīng)為主,在高于最適溫度時(shí),后一效應(yīng)為主,因而酶活性迅速喪失,反應(yīng)速度很快下降。大部分酶在60C0下上變性,少數(shù)酶能耐受較高的溫度,如細(xì)菌淀粉酶在93C0下活力最高,又如牛胰核糖核酸酶加熱到100C0仍不失活。影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:溫度對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響有兩65影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:最適溫度不是酶的特征物理常數(shù),而是上述影響的綜合結(jié)果,它不是一個(gè)固定值,而與酶作用時(shí)間的長(zhǎng)短有關(guān),酶可以在短時(shí)間內(nèi)耐受較高的溫度,然而當(dāng)酶反應(yīng)時(shí)間延長(zhǎng)時(shí),最適溫度向溫度降低的方向移動(dòng)。因此,嚴(yán)格的講,僅僅在酶反應(yīng)時(shí)間已經(jīng)規(guī)定了的情況下,才有最適溫度。酶在干燥狀態(tài)下,比在潮濕狀態(tài)下,對(duì)溫度的耐受力要高。這一點(diǎn)已用于指導(dǎo)酶的保藏。有些酶的干粉制劑可在濕適溫下放置一段時(shí)間。而其水溶液則必須保存于冰箱中;制成冰凍干粉的酶制劑可于冰箱中放置幾個(gè)月,甚至更長(zhǎng)時(shí)間,而未制成這種干粉的酶溶液在冰箱中只能保存幾周,甚至幾天就會(huì)失活。影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:最適溫度不是酶的特征物理常數(shù)66一般微生物的溫度最適范圍在25~60℃。溫度的影響存在三基點(diǎn):最高、最適、最低。溫度過(guò)高會(huì)破壞酶蛋白,造成變性;(約60℃)溫度過(guò)低會(huì)使酶作用降低或停止,但可以恢復(fù)。(約4℃)不同微生物的溫度適應(yīng)范圍不同。微生物的酶9課件67影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:4、PH對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響大部分酶的活力受其環(huán)境PH的影響,在一定PH下,酶反應(yīng)具有最大速度,高于或低于此值,反應(yīng)速度下降,通常稱(chēng)此PH為酶反應(yīng)的最適PH。最適PH有時(shí)因底物種類(lèi)、濃度及緩沖液成分不同而不同。而且常與酶的等電點(diǎn)不一致,此因,酶的最適PH并不是一個(gè)常數(shù),只是在一定條件下才有意義。影響酶活力的因素有以下幾個(gè)方面:4、PH對(duì)酶促反應(yīng)速度的影響68PH影響活力的原因可能有以下幾個(gè)方面:①過(guò)酸過(guò)堿會(huì)影響酶蛋白的構(gòu)象,甚至使酶變性而失活。②當(dāng)PH改變不很劇烈時(shí),酶雖不變性,但活力受影響。因?yàn)镻H會(huì)影響底物分子的解離狀態(tài);也會(huì)影響酶分子解離狀態(tài),最適PH與酶活力中心結(jié)合底物的基團(tuán)及參與催化的基團(tuán)的PH值有關(guān),往往只有一種解離狀態(tài)最有利于與底物結(jié)合,在此PH下酶活力最高;也可能影響到中間產(chǎn)物ES的解離狀態(tài)??傊?,都影響到ES的形成,從而降低酶活性
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