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文檔簡介
無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測簡介
內(nèi)容提要sd_bao@常見染色體疾病概述染色體非整倍體病發(fā)病機(jī)理傳統(tǒng)產(chǎn)前篩查與診斷技術(shù)介紹無創(chuàng)產(chǎn)前項(xiàng)目、院內(nèi)流程四一二三一,染色體非整倍體概述(唐氏綜合征為例)sd_bao@7世紀(jì)考古學(xué)家挖掘出典型唐氏綜合征體征顱骨。素描畫中見到具有唐氏綜合征樣面容的兒童。JohnLangdonDown醫(yī)生第一次對唐氏綜合征的典型體征進(jìn)行完整的描述并發(fā)表。Down’ssyndrome.法國遺傳學(xué)家(JeromeLeJeune)發(fā)現(xiàn)唐氏綜合征是由人體的第21號染色體的三體變異造成的現(xiàn)象。16世紀(jì)1866年1959年21、18、13-三體綜合征是人類最常見的三種染色體疾病,患兒面容特殊,絕大多數(shù)為嚴(yán)重智力障礙及器官畸形,對家庭和社會造成巨大危害和負(fù)擔(dān)。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)對胎兒染色體疾病尚無有效治療方法,最好的方法是在孕期通過產(chǎn)前篩查及診斷,發(fā)現(xiàn)異常并及時采取相應(yīng)措施染色體非整倍體疾病臨床表現(xiàn)21-三體照片a.同源染色體不分離;b.姐妹染色單體不分離
二,染色體非整倍體病發(fā)病機(jī)理減數(shù)分裂中染色體不分離第一次減數(shù)分裂第二次減數(shù)分裂三,現(xiàn)有的產(chǎn)前篩查與診斷手段sd_bao@產(chǎn)前篩查母血清學(xué)篩查頸項(xiàng)透明膜厚度篩查產(chǎn)前診斷羊水穿刺絨毛取樣
臍靜脈穿刺7侵入性診斷方式風(fēng)險計(jì)算現(xiàn)有產(chǎn)前篩查和產(chǎn)前診斷的缺陷性來源:Estimatedprenatalscreeningperformance1991-2006(2006dataareprovisional),EnglandandWales.sd_bao@產(chǎn)前篩查(S)100,000篩查結(jié)果陽性(SP)7,000篩查結(jié)果陰性(SN)93,000唐氏綜合征胎兒400真陽性(TSP)340假陰性(FSN)60非唐氏綜合征胎兒99,600假陽性(FSP)6,660真陰性(TSN)92,9401992-2006傳統(tǒng)診斷方法(穿刺)導(dǎo)致的正常胎兒流失5619最緊迫任務(wù):新方法的探索:提高檢測的準(zhǔn)確性與檢出率、降低檢測過程中的假陽性率和假陰性率。sd_bao@
四,無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測技術(shù)產(chǎn)生前提一:孕婦外周血中存在胎兒DNA
胎兒DNA來源和特點(diǎn)來源:1胎兒細(xì)胞通過胎盤滲透到母血中,被母體免疫系統(tǒng)破壞,胎兒DNA殘留下來;2胎兒細(xì)胞凋亡;3胎盤滋養(yǎng)層細(xì)胞的凋亡基本特點(diǎn):1含量有一定的變化規(guī)律。妊娠第4周開始可檢出胎兒游離DNA,隨著孕周增加而增加,存在個體差異,平均濃度。2分娩后短時間內(nèi)消失,平均半衰期為16.3min(4-30min),2h就無法檢出。再次妊娠不影響檢測結(jié)果。3DNA片段較小,平均166bp左右。常規(guī)技術(shù)很難檢測前提二:第二代高通量測序儀發(fā)明6億個DNA片段/次,全基因組測序只要10天/臺;90個DNA片段/次,全基因組測通要50年/臺。(2012年)無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測:母血漿DNA+高通量測序2023/1/11母體和胎兒DNA的混合物13Uniquereads(單一序列讀取):nomismatch,onelocation(Loetal,PNAS,2008)理論模型
母親Chr21:95×2=190母體外周血中Chr21=190+10=200以21-三體為例:100DNA單位/毫升血漿。其中,95個單位來源于母親,5個單位來源于胎兒通過大規(guī)模并行測序,獲得分布在每條染色體上的真實(shí)的核酸片段數(shù)量,經(jīng)過計(jì)數(shù)與比較:正常胎兒或者
21-三體胎兒
正常胎兒
Chr21:5×2=10
母親Chr21:95×2=190
21-三體胎兒
Chr21:5×3=15母體外周血中Chr21=190+15=205醫(yī)院華大基因無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測流程sd_bao@準(zhǔn)確性高于99%;早期診斷,12孕周即可檢測;減少妊娠晚期引產(chǎn)對孕婦造成的傷害;非侵入性,減輕孕婦心理負(fù)擔(dān),無流產(chǎn)風(fēng)險以及產(chǎn)前診斷引起的并發(fā)癥;可以同時檢測其它染色體異常所需樣本量少,只需5毫升母體外周血。無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測的優(yōu)勢:無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測的優(yōu)勢:保險保障檢測結(jié)果為高風(fēng)險受檢者產(chǎn)前診斷所產(chǎn)生的費(fèi)用{含:羊膜腔穿刺術(shù)(或經(jīng)皮臍靜脈穿刺術(shù))和染色體核型分析和染色體熒光原位雜交(或FISH)},保險公司給予報(bào)銷超過2500元。檢測結(jié)果為低風(fēng)險,若受檢者嬰兒出生后一年內(nèi)經(jīng)縣級以上檢測醫(yī)院??漆t(yī)生明確診斷患有“21-三體綜合征”、“18-三體綜合征”、“13-三體綜合征”,保險公司支付受檢者保險二十萬元整
孕期各項(xiàng)檢測信息圖10-13.5周早孕期篩查(檢出率85%)中孕期篩查(檢出率81%)15-20周16-22周羊水穿刺(流產(chǎn)率0.5-1%)9-11周絨毛取樣(流產(chǎn)率1-5%)
24-28周臍帶血取樣(流產(chǎn)率1-3%)040周12-24周無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(準(zhǔn)確率>99%)適應(yīng)人群和適應(yīng)癥經(jīng)B超確認(rèn)為單、活胎孕婦;可檢測胎兒-13三體、18三體和21三體;孕12周以上均可進(jìn)行檢測。禁忌人群、禁忌癥懷多胞胎的孕婦;孕婦本人為染色體非整倍體疾病患者;孕婦接受過異體輸血、移植手術(shù)、干細(xì)胞治療、接受過配偶或親屬淋巴細(xì)胞免疫治療等;無法精確檢測胎兒染色體嵌合型、易位型、微缺失、微重復(fù)、微缺失等結(jié)構(gòu)性異常;院內(nèi)流程檢測前確認(rèn)事項(xiàng):1.單活胎(超聲確認(rèn))2.孕后未接受過異體的血液制品;3.孕12周以后開始檢測產(chǎn)前診斷中心/產(chǎn)科就診,醫(yī)生解釋該項(xiàng)目孕婦簽署知情同意書/送檢單,領(lǐng)取保險卡孕婦交費(fèi)后返回產(chǎn)前診斷護(hù)士站抽血(附知情同意/送檢單)采血:EDTA抗凝管采集外周血5ml(輕微顛倒采血管4次)護(hù)士打印2張條形碼1張貼于采血管上,1張貼于申請單的右上角采血后護(hù)士立即交給標(biāo)本處理人員(附申請單)(產(chǎn)前診斷中心3樓標(biāo)本接收處(標(biāo)本4℃保存,不可室溫放置);標(biāo)本處理人員8小時內(nèi)分離血漿,并填寫樣本信息單全血采集
抽取孕婦外周血5mL,采用EDTA抗凝;采血完畢后,輕微顛倒采血管4次,并及時將采血管放置于4℃冰箱中,在4小時內(nèi)進(jìn)行血漿分離工作?!咀⒁馐马?xiàng)】采血時孕婦無需空腹;采血管為5mLEDTA抗凝管;顛倒混勻時動作不能太劇烈,防止溶血。血漿分離(本步驟在華大基因完成)
1、將采血管4℃
1600g離心10min,上清(血漿)分裝到置于冰盒上且已編號的2.0ml的EP管中?!咀⒁馐马?xiàng)】1)嚴(yán)格核對樣本編號、確保編號唯一;2)開啟離心管時,不能碰到管內(nèi)蓋;3)吸取血漿過程中不要吸到中間層的白細(xì)胞;2、上述血漿4℃
16000g離心10min,冰盒上將上清轉(zhuǎn)入已編號的2.0mlEP管中,每個離心管轉(zhuǎn)入600ul血漿。同時在每個2.0ml離心管上標(biāo)記樣本編號、血漿體積、分離日期?!咀⒁馐马?xiàng)】1)嚴(yán)格核對樣本編號、確保樣本編號唯一;2)開啟離心管管蓋時,不能碰到離心管內(nèi)蓋;3)將分離好的血漿貼上對應(yīng)的條碼并用封口膜密封,密封結(jié)束后立即將血漿放入-20℃或-80℃冰箱中,避免反復(fù)凍融?!咀⒁馐马?xiàng)】全血須保證在8小時內(nèi)進(jìn)行血漿分離;分離后的血漿在-20℃冰箱中可保存3天,長期保存需存放于-80℃冰箱。樣本儲存與運(yùn)輸
1、全血樣本在冰袋(4℃)條件下運(yùn)輸,且在4小時內(nèi)送達(dá)樣本接收處,樣本接收后要立即完成血漿分離。2、血漿樣本在干冰(-20℃
)條件下運(yùn)輸,并確保樣本送達(dá)時有干冰剩余,到達(dá)后及時存放于-80℃冰箱中,禁止將樣本在室溫下放置。【注意事項(xiàng)】1)泡沫箱的規(guī)格:壁厚6cm、外徑長39cm、外徑寬32cm、外徑高35cm。2)干冰用量:10公斤/2-3天;15公斤/4-5天;根據(jù)運(yùn)送時間的長短,相應(yīng)增加干冰用量。樣本數(shù)T21T18T13XOXXYXXXXYY樣本總數(shù)26619272891513753核型分析347619163108643假陽性—1101000假陰性—0000000檢出率—100%100%100%100%100%100%100%假陽性率—0.03%0.03%0.00%0.02%0.00%0.00%0.00%陽性預(yù)測值—99.48%98.44%100%88.89%100%100%100%假陰性率-0%0%0%0%0%0%0%陰性預(yù)測值—100%100%100%100%100%100%100%數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)(截至2012年3月)全球100多家合作醫(yī)院。完成核型驗(yàn)證3476例,產(chǎn)后隨訪驗(yàn)證5489例。病例分析:單純型/標(biāo)準(zhǔn)型標(biāo)準(zhǔn)型T21樣本編號:
PDP10003761孕婦年齡:31唐篩:1/510(低風(fēng)險)無創(chuàng)檢測:T21核型分析:47,XX,+21T13樣本編號:PDP100003321孕婦年齡:32
無創(chuàng)檢測:T13核型分析:47,XX,+13病例分析:單純型/標(biāo)準(zhǔn)型T18樣本編號:PDP100002190孕婦年齡:32
無創(chuàng)檢測:T18核型分析:47,XY,+18T9PDB11AJ00026,41歲,孕23w+4周
無創(chuàng)檢測:T9羊水核型:T9T16PDB11AJ00783,30歲,孕19周
無創(chuàng)檢測:16號染色體偏多羊水FISH:T16病例分析:其它染色非整倍體病例分析:T9嵌合體PDB11AG00106,39歲,孕20周無創(chuàng)檢測:兩次測序結(jié)果均顯示9號染色體偏多羊水核型:47,XX,+9[55]/46,XX[33]臍血核型:47,XX,+9[3]/46,XX,[225]晚期B超發(fā)現(xiàn)嚴(yán)重畸形,已引產(chǎn)羊水臍血母親核型正常父親核型正常胎
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