基因組技術(shù)與精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)

基因組技術(shù)與精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究進(jìn)展、個人基因組檢測與診斷青海大學(xué)醫(yī)學(xué)院魏曉星2017-10-8細(xì)胞學(xué)層面上的基因組(Genome)ACGT四種脫氧核苷酸的排列形成DNA人類基因組是由多少個堿基（basepair）組成的,編碼多少基因？從父母繼承下來的共23對，46條染色體基因組測序就是確定堿基的排列順序30億個堿基=3,000,000,000=3x109=3Gbp(3吉）

IlluminaHiSeq系列測序儀（高通量系列）有大量的臨床樣本需要非常高的通量臨床癌基因組測序腫瘤異質(zhì)性三代測序技術(shù)：PacificBiosciences單分子測序儀最新版本的PB，可以最長測到20Kb準(zhǔn)確率也大幅提高。1Gb價格8000元左右，建高精準(zhǔn)庫要5000元以上。微生物基因組人類基因組測序費用2016年基本達(dá)到1000美元測一套人類基因組（30倍覆蓋率）2017年基本達(dá)到100美元測一套人類基因組（30倍覆蓋率）生物信息學(xué):解碼基因組的學(xué)科應(yīng)用計算機和信息學(xué)技術(shù)解釋DNA里面蘊含的基因信息。AGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGT生物信息學(xué)(bioinformatics)應(yīng)用計算機和信息學(xué)技術(shù)解釋DNA里面蘊含的基因信息。AGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTTCTGATAAATGGAGCACCGCAGTGACGGCGACCAAACCCAGCTAGGTCAGACGAGAAAGATAAAAACTCTCCAGATGTCTTCCAGTAATGTCGAAGTTTTTATCCCAGTGTCACAAGGAAACACCAATGGCTTCCCCGCGACAGCTTCCAATGACCTGAAGGCATTTACTGAAGGAGCTGTGTTAAGTTTTCATAACATCTGCTATCGAGTAAAACTGAAGAGTGGCTTTCTACCTTGTCGAAAACCAGTTGAGAAAGAAATATTATCGAATATCAATGGGATCATGAAACCTGGTCTCAACGCCATCCTGGGACCCACAGGTGGAGGCAAATCTTCGTTATTAGATGTCTTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAGTGGATTATCTGGAGATGTGene1Gene2Gene3單核苷酸多態(tài)性(SNP)分析

SingleNucleotidePolymorphism/Indel正常人遺傳病患者GAC(Asp/D)天冬氨酸GCC(Ala/A)丙氨酸SNV點突變檢測Insertion/deletion(indel)檢測1、2、3basesindel，一般小于10個堿基的，稱為indel非3的倍數(shù)的indel，會導(dǎo)致讀碼框的改變，更為致病精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)應(yīng)用的范疇醫(yī)療臨床診斷技術(shù)（體細(xì)胞突變檢測，Somaticmutation）通過檢測DNA突變，實現(xiàn)對疾病的診斷輔助生殖與第三代試管（生殖細(xì)胞突變檢測,Germlinemutation）降低先天性出生缺陷，提高試管成功率基因組大健康（易感基因突變檢測,Predisposinggene）預(yù)測發(fā)病風(fēng)險，疾病防控腫瘤精準(zhǔn)治療精準(zhǔn)用藥、化療各類基因檢測產(chǎn)業(yè)的發(fā)展階段賺錢中…虧本中…燒錢中…觀望中…政府出手規(guī)范市場行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)重新洗牌2016/11/01

來源：銀河證券2016/11/01

來源：銀河證券精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)應(yīng)用的范疇醫(yī)療臨床診斷技術(shù)（體細(xì)胞突變檢測，Somaticmutation）通過檢測DNA突變，實現(xiàn)對疾病的診斷輔助生殖與第三代試管（生殖細(xì)胞突變檢測,Germlinemutation）降低先天性出生缺陷，提高試管成功率基因組大健康（易感基因突變檢測,Predisposinggene）預(yù)測發(fā)病風(fēng)險，疾病防控以腫瘤為代表的疾病精準(zhǔn)治療精準(zhǔn)用藥、化療精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)是基因組數(shù)據(jù)與基因組技術(shù)共同驅(qū)動的結(jié)果輔助臨床診斷類基因檢測——單基因遺傳病單基因遺傳病特點傳統(tǒng)檢測方法染色體原位雜交AFLPPCR-RFLPPCR-SSCP現(xiàn)代檢測方法二代測序（WGS、WES）特點：低效確診率低高胱氨酸尿癥（homocystinuria）阜外醫(yī)院；編號：AD387；男孩臨床癥狀：高挑身材；細(xì)長手指；萎縮紋患者父母均正常全外顯子測序發(fā)現(xiàn)患者CBS（胱硫醚β-合酶）基因存在復(fù)合雜合突變（compoundheterozygote）來自父親的突變?yōu)镹M_000071.2:c.1359-1G>C，位于剪接受體區(qū)（spliceacceptor）

來自母親的突變?yōu)镹M_000071.2:c.749T>A，造成250位甲硫氨酸突變?yōu)橘嚢彼幔∕ET250LYS）初期懷疑為馬凡氏綜合征（Marfansyndrome）擴(kuò)張性心肌?。―ilatedcardiomyopathy）阜外醫(yī)院；編號：HJ30；男孩臨床癥狀：擴(kuò)張性心肌病患者父母均正常檢測結(jié)果:發(fā)現(xiàn)符合臨床癥狀的疑似致病基因突變檢測到的基因突變:[命名方式遵從HGVS國際規(guī)范(/mutnomen/)]DOLK(NM_014908.3);c.1413G>C;p.Lys471Asn

雜合，疑似致病突變DOLK(NM_014908.3);c.1617G>C;p.Ter539TyrextTer28雜合，疑似致病突變結(jié)果解釋:1.檢測到受檢者DOLK基因的一個雜合錯義突變和一個雜合終止密碼子突變。2．DOLK基因突變可引起擴(kuò)張性心肌病，以常染色體隱性的方式遺傳。臨床突變解讀:DOLK(NM_014908.3:c.1413G>C;p.Lys471Asn)雜合，疑似致病突變。該突變?yōu)殄e義突變（預(yù)期造成編碼蛋白第471位氨基酸由Lys變?yōu)锳sn），突變遺傳自受檢者母親。統(tǒng)計學(xué)分析預(yù)測該突變?yōu)橛泻ν蛔儯≒olyPhen=0.999；SIFT=0），且該位點保守性較高（GERP=3.57，AF=0）。DOLK(NM_014908.3:c.1617G>C;p.Ter539TyrextTer28)雜合，疑似致病突變。該突變?yōu)榻K止密碼子突變（預(yù)期造成編碼蛋白不能夠正常終止），突變遺傳自受檢者父親。突變分別來自受檢者父母，形成復(fù)合雜合突變。綜合考慮，認(rèn)為這兩個突變?yōu)橐伤浦虏⊥蛔儭Ｏ拗菩孕募〔。≧estrictiveCardiomyopathy）阜外醫(yī)院；編號：HJ23；男孩臨床癥狀：限制性心肌??；心房撲動；右心房擴(kuò)張受檢者父親：房顫，右心房擴(kuò)張受檢者祖母：房顫檢測結(jié)果:發(fā)現(xiàn)符合臨床癥狀的疑似致病基因突變檢測到的基因突變:[命名方式遵從HGVS國際規(guī)范(/mutnomen/)]FLNC(NM_001127487.1)Exon40;c.6790G>A;p.Val2264Met雜合，疑似致病突變FLNC(NM_001127487.1)剪接區(qū);c.7463-5C>T;雜合，未知突變結(jié)果解釋:1.檢測到受檢者FLNC基因的一個雜合錯義突變和一個剪接區(qū)雜合突變。2．FLNC基因突變可引起限制性心肌病，以常染色體顯性的方式遺傳，雜合突變的患者有50%的幾率將致病突變傳遞給子代?；颊吒改傅钠渌H屬亦具有攜帶相同致病突變的風(fēng)險。臨床突變解讀:FLNC(NM_001127487.1)Exon40:c.6790G>A;p.Val2264Met雜合，常染色體顯性遺傳。該突變?yōu)殄e義突變（預(yù)期造成編碼蛋白第2264位氨基酸由Val變?yōu)镸et），突變遺傳自受檢者父親，受檢者祖母同樣攜帶此突變。統(tǒng)計學(xué)分析預(yù)測該突變?yōu)橛泻ν蛔儯≒olyPhen=0.999；SIFT=0），且該位點為保守位點（GERP=4.86）。文獻(xiàn)報道顯示該基因產(chǎn)物在1624或2160位置的氨基酸突變會造成限制性心肌病，癥狀為心房擴(kuò)張[1]。綜合考慮，認(rèn)為該突變?yōu)橐伤浦虏⊥蛔?。此外，該受檢者還存在一個遺傳自母親的FLNC基因剪接區(qū)的雜合突變（AF=0.00174），有可能造成受檢者的情況比父親和祖母更嚴(yán)重。通過全外發(fā)現(xiàn)罕見遺傳?。╮aregeneticdisorder）的致病基因主要目的主要方法臨床外顯子組測序（CES）家系全外（trio-CES）vs病人全外（prohand-CES）文章結(jié)論：總體診斷率26%；其中trio-CES31%，

prohand-CES22%。大健康：易感基因檢測

遺傳風(fēng)險評估癌癥易感(predeposited)基因篩查癌癥易感基因篩查結(jié)果CHEK2全基因測序已知SNP位點樣品的變異位點中度風(fēng)險的基因CHEK2，這個基因旁邊的相關(guān)癌癥清單很長：女性乳腺癌、男性乳腺癌、結(jié)腸癌、前列腺炎、甲狀腺癌、腎癌、子宮癌腎近曲小管上皮細(xì)胞尿酸鹽由血液向尿液運輸基因尿酸鹽由尿液向血液逆向運輸基因尿液血液發(fā)生突變的尿酸鹽運輸基因陰離子陰離子尿酸鹽尿酸鹽尿酸鹽

高血尿酸癥及痛風(fēng)發(fā)生的分子機理

腎小管上皮細(xì)胞中負(fù)責(zé)尿酸鹽運輸?shù)幕虬l(fā)生突變，可以導(dǎo)致尿酸鹽在血液和尿液之間的運輸效率降低，從而引起尿酸在血液中的積累，導(dǎo)致高血尿酸癥以及誘發(fā)痛風(fēng)。精準(zhǔn)醫(yī)療：痛風(fēng)基因檢測原理介紹HGPRT基因缺陷60余個基因的100余個變異位點與痛風(fēng)發(fā)生相關(guān)應(yīng)用全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)在14萬名歐美和1萬名漢族高血尿酸癥和痛風(fēng)患者中的研究，發(fā)現(xiàn)60余個基因的100余個變異位點，與高血尿酸癥和痛風(fēng)的發(fā)生有關(guān)。這些基因的變異位點將作為痛風(fēng)基因檢測的分子標(biāo)記，可采用基因分析設(shè)備對痛風(fēng)病患的基因突變類型進(jìn)行分析。正常人的葡萄糖激酶調(diào)節(jié)基因GCKR的DNA序列痛風(fēng)病人的測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)GCKR發(fā)生了T到C的變異即單核苷酸多態(tài)性(SNP)痛風(fēng)基因檢測原理介紹常見腫瘤與慢病易感基因檢測檢測項目檢測內(nèi)容男性高發(fā)腫瘤易感基因檢測肺癌、肝癌、胃癌、結(jié)直腸癌、食管癌、胰腺癌、膠質(zhì)瘤、腎癌、膀胱癌、前列腺癌女性高發(fā)腫瘤易感基因檢測肺癌、肝癌、胃癌、結(jié)直腸癌、食管癌、甲狀腺癌、乳腺癌、宮頸癌、子宮內(nèi)膜癌、卵巢癌心腦血管疾病易感基因檢測心肌梗死、腦卒中、高血壓、高血脂“四高”易感基因檢測高血壓、高血脂、高血糖、高尿酸常見慢病易感基因檢測肺癌、肝癌、胃癌、結(jié)直腸癌、食管癌、胰腺癌、膠質(zhì)瘤、腎癌、膀胱癌、甲狀腺癌、前列腺癌、乳腺癌、宮頸癌、子宮內(nèi)膜癌、卵巢癌、高血壓、高血脂、高血糖、高尿酸、心肌梗死、腦卒中、肥胖、阿爾茲海默癥、抑郁癥唇腭裂基因篩查、風(fēng)險評估與孕前營養(yǎng)預(yù)防綜合征型(染色體異常)、非綜合征型(遺傳缺陷)唇腭裂唇裂(“兔唇”)、腭裂(“狼咽”)、唇腭裂并發(fā)單側(cè)腭裂、雙側(cè)腭裂、隱性腭裂按發(fā)病程度分為Io、IIo、IIIo中國1.8‰vs.歐美0.6‰

維族3.1‰vs.漢族1.8‰唇腭裂在中國人群的高發(fā)生率是遺傳基礎(chǔ)(基因變異)的差異，還是孕期營養(yǎng)管理不善所致？能否通過對孕婦的精準(zhǔn)營養(yǎng)管理，降低新生兒唇腭裂發(fā)生率？能否通過對夫妻雙方的唇腭裂基因篩查，預(yù)測新生兒唇腭裂的遺傳風(fēng)險？能否通過對唇腭裂患兒的基因篩查，提高患兒術(shù)后恢復(fù)效果？唇腭裂易感基因篩查的臨床意義唇腭裂由60-70%遺傳因素和20-30%環(huán)境因素導(dǎo)致漢族、維族病例與對照樣本選擇500名亞洲正常人（對照組）100名漢族唇腭裂（病例組）200名維族正常人（對照組）300名維族唇腭裂（病例組）對43個SNP標(biāo)記（20個唇腭裂易感基因）在對照和病例組進(jìn)行基因型分析分析方法計算43個風(fēng)險基因標(biāo)記在病歷與對照組的分布頻率計算每個標(biāo)記的OR值、確認(rèn)風(fēng)險基因型與保護(hù)基因型建立唇腭裂易感基因的遺傳風(fēng)險評估模型建立羅杰斯蒂回歸模型對某一樣品進(jìn)行分類單個標(biāo)記預(yù)測效力的評估、建立最小標(biāo)記集合從已發(fā)表的GWAS數(shù)據(jù)篩選43個標(biāo)記重點關(guān)注風(fēng)險突變的純和基因型頻率變化IRF6基因的rs642961風(fēng)險突變的頻率在對照與病例組變化顯著唇腭裂對照組漢族人群維族人群風(fēng)險基因型頻率1.9%19.4%風(fēng)險型等位基因：A保護(hù)性等位基因：G漢族唇腭裂遺傳風(fēng)險評估模型相對風(fēng)險概率相對風(fēng)險概率唇腭裂對照組1-Specificity

相對風(fēng)險概率是絕對風(fēng)險系數(shù)在對照人群中的排序位置

維族唇腭裂遺傳風(fēng)險評估模型相對風(fēng)險概率相對風(fēng)險概率1-Specificity對照組唇腭裂在維族群體中，43個標(biāo)記對唇腭裂和對照組的區(qū)分效果不是很顯著，可能主要是由于標(biāo)記在漢族和維族群體中的差異所致羅杰斯蒂回歸模型分類效果明顯應(yīng)用了七種機器學(xué)習(xí)的方法進(jìn)行分類預(yù)測，其中羅杰斯蒂回歸表現(xiàn)最好標(biāo)記逐步遞增方法對分類效果評估其他胚胎發(fā)育相關(guān)已知基因葉酸代謝途徑基因維生素代謝途徑基因雄性激素響應(yīng)相關(guān)基因風(fēng)險基因型

ACGTGACGGGTAGGTCAC正常基因型

ACGTGACGAGTAGGTCAC根據(jù)SNP標(biāo)記設(shè)計基因檢測探針取樣口腔內(nèi)壁擦拭獲取少量細(xì)胞，提取DNA就醫(yī)產(chǎn)檢唇腭裂患兒、孕婦、備孕夫妻24個唇腭裂易感基因標(biāo)記篩查基因檢測G:AG:G唇腭裂易感基因篩查應(yīng)用模式指導(dǎo)建議風(fēng)險評估唇腭裂基因檢測報告羅杰斯蒂回歸發(fā)病概率預(yù)測遺傳風(fēng)險評估與因素分析葉酸代謝基因參與唇腭裂的發(fā)生rs1801133,667位置的C->T非同義突變，導(dǎo)致Ala->Val氨基酸改變

攜帶TT純和風(fēng)險基因型的人會有，高同型半胱氨酸、低葉酸、低B12的癥狀攜帶TT風(fēng)險突變的孕婦極可能是由于葉酸的供應(yīng)不足導(dǎo)致胎兒唇腭裂的發(fā)生，以及引起神經(jīng)管缺陷、先天性心臟病、唇腭裂、妊娠期高血壓疾病，自發(fā)性流產(chǎn)5-甲基四氫葉酸鹽(L-甲基葉酸鹽)100%level正常CC風(fēng)險CTTT10%水平65%水平folicacidtomethylfolate四氫葉酸葉酸維生素A代謝基因參與唇腭裂的發(fā)生(2011)NutritionReviewsVol.69(10):613–624視黃醇結(jié)合蛋白RBPretinolbindingproteinrs10882272(RBP4)風(fēng)險突變：CC攜帶CC突變的孕婦血清RBP蛋白運輸維生素A的能力，以及胎兒吸收維生素A的能力都有可能大幅降低，從而誘發(fā)唇腭裂的發(fā)生RBP4在唇腭裂中的分子機制尚無報道RBP4風(fēng)險突變可導(dǎo)致先天性眼失明作者建議：RBP4基因缺陷孕婦，可考慮用視黃醛或視黃酯替代維生素A唇腭裂基因篩查應(yīng)用范疇婚前：直系或旁系家族成員中有唇腭裂病史的未婚男女男女雙方基因檢測，估算唇腭裂出生概率區(qū)間給予婚配建議，購買生育險等孕前：頭胎為唇腭裂患兒，想繼續(xù)生育第二胎的家庭患兒、夫妻雙方基因檢測，推測遺傳與環(huán)境因素比例給予二胎懷孕建議，科學(xué)營養(yǎng)管理，積極防范，B超重點篩查孕期：高齡產(chǎn)婦、妊娠嘔吐等反應(yīng)劇烈者夫妻雙方基因檢測，估算唇腭裂出生概率區(qū)間科學(xué)營養(yǎng)管理，積極防范，B超重點篩查孕期：3~6個月B超疑似唇腭裂胎兒胎兒DNA基因檢測，進(jìn)一步確認(rèn)，重點篩查產(chǎn)后：夫妻雙方為唇腭裂風(fēng)險基因攜帶者新生兒DNA基因檢測，排除隱性腭裂風(fēng)險治療：確診為唇腭裂患兒，建立精確序列治療方案排除隱性腭裂，確認(rèn)唇腭裂類型和等級，建立術(shù)后骨愈合營養(yǎng)方案精準(zhǔn)用藥基因檢測藥物不良反應(yīng)的嚴(yán)峻狀況05

2015年全國藥品不良反應(yīng)監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)收到新的和嚴(yán)重藥品不良反應(yīng)/事件報告:顯示過去10年之間我國的藥物不良反應(yīng)報告數(shù)目一直是處于增長狀態(tài)。什么是藥物不良反應(yīng)？WHO（聯(lián)合國世界衛(wèi)生組織）對于藥物不良反應(yīng)的定義為“預(yù)防、診斷或治療疾病，或為改善生理功能而服用適當(dāng)劑量藥物所引起的有害的、非預(yù)期的或治療上不需要的反應(yīng)。

指合格的藥品在正常用法用量下出現(xiàn)的與用藥目的無關(guān)或意外的有害反應(yīng)。0405環(huán)境因素藥物相互作用遺傳變異在藥物毒性發(fā)生中的作用環(huán)節(jié)藥物毒性遺傳變異細(xì)胞靶點代謝轉(zhuǎn)運體藥物基因組學(xué)基因組藥物學(xué)或基因組藥理學(xué)，是藥理學(xué)或基因組學(xué)的一個分支。它是研究基因組或基因變異對藥物在人體內(nèi)吸收、代謝、療效及不良反應(yīng)產(chǎn)生影響的現(xiàn)象及其機制，從而指導(dǎo)新藥開發(fā)和合理用藥的一門新學(xué)科。06基因檢測和藥物吸收的關(guān)系——藥物基因組學(xué)藥物A無效、有毒副作用有效精準(zhǔn)分類藥物B藥物A有效有效基因檢測傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)和現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的區(qū)別0708衛(wèi)生部關(guān)于印發(fā)《醫(yī)療機構(gòu)臨床檢驗項目目錄》的通知衛(wèi)醫(yī)發(fā)〔2007〕180號

各省、自治區(qū)、直轄市衛(wèi)生廳局，新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)衛(wèi)生局：為加強對醫(yī)療機構(gòu)臨床實驗室管理，提高臨床檢驗水平，保證醫(yī)療質(zhì)量和醫(yī)療安全，根據(jù)《醫(yī)療機構(gòu)臨床實驗室管理辦法》（衛(wèi)醫(yī)發(fā)[2006]73號）的規(guī)定，醫(yī)療機構(gòu)臨床實驗室應(yīng)當(dāng)按照衛(wèi)生部規(guī)定的臨床檢驗項目和臨床檢驗方法開展臨床檢驗工作?；驒z測指導(dǎo)用藥在我國的開展情況腫瘤亞型分類與靶向藥用藥指導(dǎo)我國衛(wèi)計委于今年7月發(fā)布《腫瘤個體化治療檢測技術(shù)指南（試行）》，推薦腫瘤患者治療前進(jìn)行基因檢測，指導(dǎo)醫(yī)生用藥方案抗栓治療的個體化用藥之“氯吡格雷”心和泰檢測項目卡馬西平，三環(huán)抗抑郁劑相關(guān)的芳香族抗驚厥劑，獲FDA批準(zhǔn)