DNA的粗提取與鑒定使用_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

會(huì)計(jì)學(xué)1DNA的粗提取與鑒定使用課題目標(biāo)

目標(biāo):1本課題通過(guò)嘗試對(duì)植物或動(dòng)物組織中的DNA進(jìn)行粗提取,了解DNA的物理化學(xué)性質(zhì),2理解DNA粗提取以及DNA鑒定的原理。課題重點(diǎn):DNA的粗提取和鑒定方法。知識(shí)要點(diǎn):

1.

DNA的物理化學(xué)性質(zhì),尤其是DNA的溶解性2.

二苯胺法鑒定DNA的方法和原理。第1頁(yè)/共53頁(yè)基礎(chǔ)知識(shí)1、提取大分子的基本思路是什么?

選用一定的物理、化學(xué)方法分離具有不同物理或化學(xué)性質(zhì)的大分子。2、提取DNA分子的基本思路又是什么?

利用DNA與RNA、蛋白質(zhì)和脂質(zhì)等在物理和化學(xué)性質(zhì)上的差異,提取DNA,去除其他成分。第2頁(yè)/共53頁(yè)3、提取和鑒定DNA的具體的依據(jù)有哪些方面?(原理)1)、DNA的溶解性

①DNA和蛋白質(zhì)等其它成分在不同濃度的NaCl溶液中溶解度不同。

1、在什么濃度下,DNA的溶解度最???DNA在Nacl溶液中的溶解度是如何變化的?在NaCl溶液濃度低于0.14mol/L時(shí),DNA的溶解度隨NaCl溶液濃度的增加而逐漸降低;在0.14mol/L時(shí),DNA溶解度最??;當(dāng)NaCl溶液濃度繼續(xù)增加時(shí),DNA的溶解度又逐漸增大。第3頁(yè)/共53頁(yè)2、如何通過(guò)控制NaCl溶液的濃度使DNA在鹽溶液中溶解或析出?

當(dāng)氯化鈉的物質(zhì)的量濃度為2mol/L時(shí),DNA的溶解度最大,濃度為0.14mol/L時(shí),DNA的溶解度最低。利用這一原理,可以使DNA在鹽溶液中溶解或析出第4頁(yè)/共53頁(yè)3、提取和鑒定DNA的具體的依據(jù)有哪些方面?1)DNA的溶解性

①DNA和蛋白質(zhì)等其它成分在不同濃度的NaCl溶液中溶解度不同。

②DNA不溶于酒精溶液,但是細(xì)胞中的某些蛋白質(zhì)則溶于酒精第5頁(yè)/共53頁(yè)2)、DNA對(duì)酶、高溫和洗滌劑的耐受性①蛋白酶只能使蛋白質(zhì)水解②大多數(shù)蛋白質(zhì)不能忍受60—80℃的高溫而變性,但DNA在80℃以上才變性。③洗滌劑能瓦解細(xì)胞膜,但對(duì)DNA沒(méi)有影響。第6頁(yè)/共53頁(yè)3、DNA的鑒定①沸水浴下,DNA遇二苯胺被染成藍(lán)色;二苯胺鑒定DNA的化學(xué)原理:

DNA中嘌呤核苷酸上的脫氧核糖遇酸生成ω-羥基-γ酮基戊醛,它再和二苯胺作用而呈現(xiàn)藍(lán)色(溶液呈淺藍(lán)色)。鑒定時(shí)溶液藍(lán)色的深淺,與溶液中DNA含量的多少有關(guān)。②紫外燈照射法:

紫外燈照射法用蒸餾水配制質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.05%的溴化乙錠(EB)溶液,將玻璃棒上纏繞的白色絮狀物抹到蠟紙上,再滴1滴EB溶液染色。將蠟紙放在紫外燈(260nm)下照射(暗室中),可呈現(xiàn)橙紅色的螢光(DNA的紫外吸收高峰在260nm處)。③甲基綠(藍(lán)綠色)第7頁(yè)/共53頁(yè)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)(一)實(shí)驗(yàn)材料的選取(二)破碎細(xì)胞,獲取含DNA的濾液(三)去除濾液中的雜質(zhì)(四)DNA的析出與鑒定第8頁(yè)/共53頁(yè)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)(一)實(shí)驗(yàn)材料的選取含有DNA的組織且DNA含量較多的組織。比較下列材料哪些DNA含量高、適于提取DNA?為什么?第9頁(yè)/共53頁(yè)哺乳動(dòng)物紅細(xì)胞:大腸桿菌:

雞血細(xì)胞:沒(méi)有細(xì)胞核,沒(méi)有DNA。原核生物,DNA含量少。DNA含量豐富,材料易得,易吸水脹破。DNA含量相對(duì)較高的生物組織。第10頁(yè)/共53頁(yè)。較好的實(shí)驗(yàn)材料應(yīng)該滿足以下幾個(gè)條件

:1.組織中DNA的含量比較豐富,能夠適合大量提取。2.該組織中所含化合物種類應(yīng)比較單純,避免由于其他

物質(zhì)化學(xué)性質(zhì)與DNA相近,從而對(duì)實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象產(chǎn)生某

些干擾。3.實(shí)驗(yàn)材料的價(jià)格適宜,從而能相對(duì)的降低實(shí)驗(yàn)成本。4.實(shí)驗(yàn)材料在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的可操作性較強(qiáng),在相對(duì)簡(jiǎn)單

的條件下能大量提取出DNA,便于學(xué)生實(shí)驗(yàn)操作第11頁(yè)/共53頁(yè)(二)破碎細(xì)胞,獲取含DNA的濾液1、動(dòng)物細(xì)胞:蒸餾水?dāng)嚢?、為什么加入蒸餾水能使雞血細(xì)胞破裂?

蒸餾水對(duì)于雞血細(xì)胞來(lái)說(shuō)是一種低滲液體,水分可以大量進(jìn)入血細(xì)胞內(nèi),使血細(xì)胞脹裂,再加上攪拌的機(jī)械作用,就加速了雞血細(xì)胞的破裂(細(xì)胞膜和核膜的破裂),從而釋放出DNA。

旁欄問(wèn)題第12頁(yè)/共53頁(yè)(二)破碎細(xì)胞,獲取含DNA的濾液1、動(dòng)物細(xì)胞:蒸餾水?dāng)嚢?、植物細(xì)胞:洗滌劑和食鹽攪拌和研磨若探究提取效果,可設(shè)置對(duì)照實(shí)驗(yàn)。2、加入洗滌劑和食鹽的作用分別是什么?

洗滌劑是一些離子去污劑,能溶解細(xì)胞膜,有利于DNA的釋放;食鹽的主要成分是NaCl,有利于DNA的溶解。

旁欄問(wèn)題第13頁(yè)/共53頁(yè)3.如果研磨不充分,會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果產(chǎn)生怎樣的影響?

研磨不充分會(huì)使細(xì)胞核內(nèi)的DNA釋放不完全,提取的DNA量變少,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果,導(dǎo)致看不到絲狀沉淀物、用二苯胺鑒定不顯示藍(lán)色等。旁欄問(wèn)題4.此步驟獲得的濾液中可能含有哪些細(xì)胞成分?

可能含有核蛋白、多糖和RNA等雜質(zhì)。第14頁(yè)/共53頁(yè)(三)去除濾液中的雜質(zhì)方案一:

DNA在不同濃度NaCl中溶解度不同;實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)旁欄問(wèn)題5.為什么反復(fù)地溶解與析出DNA,能夠去除雜質(zhì)?

用高鹽濃度的溶液溶解DNA,能除去在高鹽中不能溶解的雜質(zhì);用低鹽濃度使DNA析出,能除去溶解在低鹽溶液中的雜質(zhì)。因此,通過(guò)反復(fù)溶解與析出DNA,就能夠除去與DNA溶解度不同的多種雜質(zhì)。第15頁(yè)/共53頁(yè)(三)去除濾液中的雜質(zhì)方案一:

DNA在不同濃度NaCl中溶解度不同;方案二:

加入嫩肉粉(含木瓜蛋白酶)方案三:

60—75℃恒溫水浴保溫10—15min實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)第16頁(yè)/共53頁(yè)旁欄問(wèn)題6.方案二與方案三的原理有什么不同?方案二是利用蛋白酶分解雜質(zhì)蛋白,從而使提取的DNA與蛋白質(zhì)分開(kāi);方案三利用的是DNA和蛋白質(zhì)對(duì)高溫耐受性的不同,從而使蛋白質(zhì)變性,與DNA分離。第17頁(yè)/共53頁(yè)(四)DNA的析出與鑒定:95%的冷酒精靜置2—3min,出現(xiàn)白色絲狀物玻璃棒卷起加入2mol/L氯化鈉溶解,加入4mL二苯胺試劑,搖勻,沸水浴5min,觀察顏色變化。

(注意設(shè)置空白對(duì)照)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)第18頁(yè)/共53頁(yè)使用冷的乙醇溶液具哪些優(yōu)點(diǎn)?一、抑制核酸水解酶活性,防止DNA降解;二、降低分子運(yùn)動(dòng),易于形成沉淀析出;三、低溫有利于增加DNA分子柔韌性,減少斷裂。第19頁(yè)/共53頁(yè)P(yáng)56操作提示1、血液應(yīng)加入檸檬酸鈉(抗凝劑)防止血液凝固;2、加洗滌劑,動(dòng)作要輕緩,防止產(chǎn)生大量氣泡;加酒精、玻棒攪拌,動(dòng)作要輕緩,以免加劇DNA分子的斷裂。3、二苯胺試劑現(xiàn)配現(xiàn)用。第20頁(yè)/共53頁(yè)結(jié)果分析與評(píng)價(jià)(一)是否提取出了DNA

觀察你提取的DNA顏色,如果不是白色絲狀物,說(shuō)明DNA中的雜質(zhì)較多;二苯胺鑒定出現(xiàn)藍(lán)色說(shuō)明實(shí)驗(yàn)基本成功,如果不呈現(xiàn)藍(lán)色,可能所提取的DNA含量低,或是實(shí)驗(yàn)操作中出現(xiàn)錯(cuò)誤,需要重新制備。第21頁(yè)/共53頁(yè)結(jié)果分析與評(píng)價(jià)(二)分析DNA中的雜質(zhì)

本實(shí)驗(yàn)提取的DNA粗制品有可能仍然含有核蛋白、多糖等雜質(zhì)。(三)不同實(shí)驗(yàn)方法的比較

對(duì)于不同的實(shí)驗(yàn)方法,本課題可以采用分組的方法進(jìn)行研究。首先選取不同的實(shí)驗(yàn)材料,其次同種材料還可以采用不同方法,從多方面比較實(shí)驗(yàn)結(jié)果,如DNA的純度、DNA的顏色、二苯胺顯色的深淺等,看看哪種實(shí)驗(yàn)材料、哪種提取方法的效果更好。第22頁(yè)/共53頁(yè)練習(xí)

提取DNA的第一步是材料的選取,其目的是一定要選取DNA含量較高的生物材料,否則會(huì)由于實(shí)驗(yàn)過(guò)程中或多或少的損失而造成檢測(cè)的困難;第二步是DNA的釋放和溶解,這一步是實(shí)驗(yàn)成功與否的關(guān)鍵,要盡可能使細(xì)胞內(nèi)的DNA全部溶解;第三步是DNA的純化,即根據(jù)DNA的溶解特性、對(duì)酶及高溫的耐受性的不同等特性,最大限度地將DNA與雜質(zhì)分開(kāi);最后一步是對(duì)DNA進(jìn)行鑒定,這是對(duì)整個(gè)實(shí)驗(yàn)的結(jié)果的檢測(cè)。1、請(qǐng)解釋提取DNA的實(shí)驗(yàn)操作中主要步驟的目的。第23頁(yè)/共53頁(yè)練習(xí)

提取蛋白質(zhì)比提取DNA的難度大。這是因?yàn)椋cDNA相比,蛋白質(zhì)對(duì)溫度、鹽濃度、pH等條件要敏感得多,很容易失活;并且蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)多種多樣,理化性質(zhì)各不相同,使得蛋白質(zhì)的提取沒(méi)有一種統(tǒng)一的方法,只能根據(jù)特定蛋白質(zhì)的特性摸索提取的條件,設(shè)計(jì)特定的方法。

2、你認(rèn)為從細(xì)胞中提取某種特定的蛋白質(zhì)與提取DNA一樣容易嗎?為什么?第24頁(yè)/共53頁(yè)案例一:以雞血為實(shí)驗(yàn)材料進(jìn)行DNA的粗提取實(shí)驗(yàn)案例②雞血細(xì)胞極易吸水脹破,而用動(dòng)物肝臟細(xì)胞作實(shí)驗(yàn)材料常常需要?jiǎng)驖{和離心,對(duì)設(shè)備要求較高,操作繁瑣,歷時(shí)較長(zhǎng)1、雞血細(xì)胞做實(shí)驗(yàn)材料的原因①雞血細(xì)胞核的DNA含量豐富,材料易得第25頁(yè)/共53頁(yè)2、實(shí)驗(yàn)原理①DNA在NaCl溶液中的溶解度,是隨著NaCl的濃度的變化而改變的。當(dāng)NaCl的物質(zhì)的量濃度為0.14mol/L時(shí),DNA的溶解度最低。利用這一原理,可以使溶解在NaCl溶液中的DNA析出。②DNA不溶于酒精溶液,但是細(xì)胞中的某些蛋白質(zhì)可以溶于酒精溶液。利用這一原理,可以進(jìn)一步提取出含雜質(zhì)較少的DNA。③DNA遇二苯胺(沸水浴)會(huì)染成藍(lán)色,因此,二苯胺可以作為鑒定DNA的試劑。第26頁(yè)/共53頁(yè)4、課前準(zhǔn)備雞血細(xì)胞液取質(zhì)量濃度為0.1g/ml的檸檬酸納溶液(抗凝劑)100ml,置于500ml燒杯中。注入新鮮的雞血(約180ml),同時(shí)用玻璃棒攪拌,使血液與檸檬酸納溶液充分混合,以免凝血。將燒杯中的血液置于冰箱內(nèi),精置一天,使血細(xì)胞自行沉淀。(也可以將血液倒入離心管內(nèi),用1000r/min(轉(zhuǎn)每分)的離心機(jī)離心2min,血細(xì)胞沉淀于離心管底部。實(shí)驗(yàn)時(shí)。用吸管除去離心管上部的澄清液,就可以得到雞血細(xì)胞液。)①過(guò)程第27頁(yè)/共53頁(yè)②檸檬酸鈉作用防止血液凝固③作用機(jī)理檸檬酸鈉能與血漿中的Ca2+發(fā)生反應(yīng),生成檸檬酸鈣絡(luò)合物,血漿中游離的Ca2+大大減少,血液就不會(huì)凝固雞血細(xì)胞破碎以后釋放出的DNA,容易被玻璃容器吸附,所以在提取過(guò)程中為了減少DNA的損失,最好使用塑料的燒杯和試管盛放雞血細(xì)胞液④注意事項(xiàng)第28頁(yè)/共53頁(yè)討論:提取雞血中的DNA時(shí),為什么除去血液中的上清液?答:血液分為兩部分,一部分是血漿,一部分是血細(xì)胞,離心后除去的上清液是血漿5、方法步驟將制備好的雞血細(xì)胞液5mL~10mL,注入到50mL燒杯中。向燒杯中加入蒸餾水20mL,同時(shí)用玻璃棒充分?jǐn)嚢?min,使血細(xì)胞加速破裂。然后,用放有紗布的漏斗將血細(xì)胞液過(guò)濾至500mL。取其濾液。①提取雞血細(xì)胞的細(xì)胞核物質(zhì)第29頁(yè)/共53頁(yè)第30頁(yè)/共53頁(yè)討論:答:讓細(xì)胞內(nèi)濃度大于周圍溶液的濃度,細(xì)胞會(huì)吸水以至脹破(1)為什么要加入蒸餾水?加入蒸餾水后細(xì)胞會(huì)有什么變化?(2)用玻璃棒攪拌有什么意義?答:用玻璃棒攪拌可以加速血細(xì)胞和細(xì)胞核的破裂。注意應(yīng)沿一個(gè)方向快速攪拌,但也不能太快太猛,防止打碎DNA(3)濾去的是什么物質(zhì)?得到的是什么?答:過(guò)濾將濾去的是細(xì)胞膜和核膜等物質(zhì);得到的是與蛋白質(zhì)等物質(zhì)結(jié)合在一起的DNA第31頁(yè)/共53頁(yè)②溶解細(xì)胞核內(nèi)的DNA將氯化鈉的物質(zhì)的量濃度為2mol的溶40mL加入到濾液中,并用玻璃棒沿一個(gè)方向攪拌1min,使其混合均勻,這時(shí)DNA在溶液中呈溶解狀態(tài)沿?zé)瓋?nèi)壁緩緩加入蒸餾水,同時(shí)用玻璃棒不停地輕輕攪拌,這時(shí)燒杯中有絲狀物出現(xiàn),注意觀察絲狀物呈什么顏色。繼續(xù)加入蒸餾水,溶液中出現(xiàn)的粘稠物會(huì)越來(lái)越多。當(dāng)粘稠物不再增加時(shí)停止加入蒸餾水(這時(shí)溶液中氯化鈉的物質(zhì)的量濃度相當(dāng)于0.14mol/L)③析出含DNA的粘稠物第32頁(yè)/共53頁(yè)第33頁(yè)/共53頁(yè)討論:加入蒸餾水的目的?降低NaCl溶液濃度到使DNA溶解度最低點(diǎn),使DNA從NaCl溶液中析出將溶液中的DNA與其他雜質(zhì)分離,這一步驟是實(shí)驗(yàn)成敗的關(guān)鍵。實(shí)驗(yàn)中應(yīng)該緩慢貼壁加入蒸餾水,并輕輕地沿一個(gè)方向不停地均勻攪拌,以利于DNA分子的附著和纏繞注意事項(xiàng):第34頁(yè)/共53頁(yè)④濾取含DNA的粘稠物用放有多層紗布的漏斗,過(guò)濾步驟3中的溶液至500mL的燒杯中,含DNA的粘稠物被留在紗布上⑤將DNA的粘稠物再溶解取1個(gè)50mL燒杯,向燒杯內(nèi)注入氯化鈉的物質(zhì)的量濃度為2mol/L的溶液20mL。用鈍頭鑷子將紗布上的粘稠物夾至氯化鈉溶液中,用玻璃擇不停地?cái)嚢瑁拐吵砦锉M可能多地溶解于溶液中第35頁(yè)/共53頁(yè)第36頁(yè)/共53頁(yè)⑥過(guò)濾含有DNA的氯化鈉溶液取1個(gè)100mL燒杯,用放有兩層紗布的漏斗過(guò)濾步驟5中的溶液。取其濾液,DNA溶于濾液中⑦提取含雜質(zhì)較少的DNA在上述濾過(guò)的溶液中,加入冷卻的、酒精的體積分?jǐn)?shù)為95%的溶液50mL(使用冷卻的酒精,對(duì)DNA的凝集效果較佳),并用玻璃棒攪拌,溶液中會(huì)出現(xiàn)含雜質(zhì)較少的絲狀物。用玻璃棒將絲狀物卷起,并用濾紙吸取上面的水分。這種絲狀物的主要成分就是DNA第37頁(yè)/共53頁(yè)第38頁(yè)/共53頁(yè)答:因?yàn)镈NA不溶于冷酒精,而其他物質(zhì)可以溶解在酒精中,使含雜質(zhì)較少的DNA絲狀物可以析出,懸浮于溶液中討論:(2)觀察絲狀物呈什么顏色?答:白色(1)為什么要加50mL的冷酒精?第39頁(yè)/共53頁(yè)取兩支20mL的試管,各加入氯化鈉的物質(zhì)的量濃度為0.015mol/L的溶液5mL,將絲狀物放入其中一支試管中,用玻璃棒攪拌,使絲狀物溶解。然后,向兩支試管中各加入4mlL的二苯胺試劑?;旌暇鶆蚝?,將試管置于沸水中加熱5min,待試管冷卻后,觀察并且比較兩支試管中溶液顏色的變化⑧DNA的鑒定第40頁(yè)/共53頁(yè)第41頁(yè)/共53頁(yè)討論:答:有絲狀物的試管變成藍(lán)色,另一試管還是原來(lái)顏色(2)這一鑒定結(jié)果說(shuō)明什么問(wèn)題?(1)比較兩個(gè)試管中溶液的顏色有什么不同?答:提取出的絲狀物是DNA(3)DNA的直徑約為20×10-10m,實(shí)驗(yàn)中出現(xiàn)的絲狀物的粗細(xì)是否表示1個(gè)DNA分子直徑的大?。看穑篋NA分子直徑只有2nm。絲狀物是多個(gè)DNA子聚在一起形成的

第42頁(yè)/共53頁(yè)第43頁(yè)/共53頁(yè)答:整個(gè)實(shí)驗(yàn)共“兩次蒸餾水,三次過(guò)濾,兩次析出,六次攪拌”6、討論:①兩次蒸餾水第一次:細(xì)胞吸水脹破第一步第二次:使DNA黏稠物析出第三步(1)此實(shí)驗(yàn)過(guò)程中有幾次使用蒸餾水?幾次過(guò)濾,幾次析出,幾次攪拌?分別在哪一步?第44頁(yè)/共53頁(yè)

過(guò)濾時(shí)使用的紗布層數(shù)與需用濾液或黏稠物有關(guān),第二次要用其濾出的黏稠物有關(guān),所以要使用多層紗布,第一次和第三次均要用其濾液,使用的紗布為1-2層②三次過(guò)濾第一次:DNA存在于濾液里第一步第二次:DNA被留在紗布上第四步第三次:DNA存在于濾液里第六步第45頁(yè)/共53頁(yè)③兩次析出第一次:用0.14mol/L的NaCI溶液含雜質(zhì)多第三步第二次:用冷卻的95%的酒精第七步④六次攪拌:第一、二、三、五、七步

其中除第八步外,其余均要朝一個(gè)方向攪拌,在第三、五步攪動(dòng)還要輕緩,玻璃棒不要直插燒杯底部,這樣才能保證得到完整的DNA第46頁(yè)/共53頁(yè)(2)為什么反復(fù)地溶解與析出DNA,能夠去除雜質(zhì)?答:用高鹽濃度的溶液溶解DNA,能除去在高鹽中不能溶解的雜質(zhì);用低鹽濃度使DNA析出,能除去溶解在低鹽溶液中的雜質(zhì)。因此,通過(guò)反復(fù)溶解與析出DNA,就能夠除去與DNA溶解度不同的多種雜質(zhì)第47頁(yè)/共53頁(yè)方法步驟

加入物質(zhì)

目的

1.制備雞血細(xì)胞液

檸檬酸鈉溶液

2.提取雞血細(xì)胞細(xì)胞核物質(zhì)

20m1蒸餾水

3.溶解細(xì)胞核內(nèi)的DNA

2m1/L的NaCI溶液40mL

4.析出含DNA的黏稠物

蒸餾水

5.濾取含DNA的黏稠物

6.將DNA的黏稠物再溶解

2mol/L的NaCl溶液20mL

7.過(guò)濾含DNA的NaCl溶液

8.提取含有雜質(zhì)較少的DNA

冷卻的95%的酒精50mL

A:(1)向試管中加入0.015mol/L的NaCl溶液5mL

(2)加入DNA

(3)4mL二苯胺試劑

9.DNA的鑒定

B:(1)向試管中加入0.015mol/L

的NaCl溶液5mL

(2)4mL二苯胺試劑

以雞血為實(shí)驗(yàn)材料進(jìn)行DNA的粗提取第48頁(yè)/共53頁(yè)案例二

以菜花為實(shí)驗(yàn)材料進(jìn)行DNA的粗提取課前準(zhǔn)備

將新鮮菜花和體積分?jǐn)?shù)為95%的乙醇溶液放入冰箱冷凍室24h。提取DNA的具體步驟1.取材

稱取30

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