標(biāo)準(zhǔn)解讀
《GA/T 1694-2020 序列多態(tài)STR等位基因命名規(guī)則》這一標(biāo)準(zhǔn)是由中國(guó)公安部發(fā)布,旨在為DNA鑒定領(lǐng)域中短串聯(lián)重復(fù)序列(Short Tandem Repeats,簡(jiǎn)稱(chēng)STR)的等位基因提供一套統(tǒng)一、規(guī)范的命名體系。這一規(guī)則對(duì)于確保法醫(yī)DNA分析結(jié)果的準(zhǔn)確交流與比對(duì)具有重要意義。下面是該標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)容的基本闡述:
該標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了STR等位基因如何進(jìn)行命名的方法,確保全國(guó)乃至國(guó)際間STR分型數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化和可比性。STR是指DNA序列中一段基序(由幾個(gè)堿基組成)以串聯(lián)重復(fù)的方式存在,不同個(gè)體在這些重復(fù)單位的數(shù)量上可能有差異,形成不同的等位基因。
命名規(guī)則主要包括以下幾個(gè)方面:
-
等位基因描述:每個(gè)STR標(biāo)記的等位基因以其核心重復(fù)單位的堿基數(shù)表示,如“4”代表核心重復(fù)序列重復(fù)四次的等位基因。
-
命名前綴:對(duì)于已知的STR基因座,使用國(guó)際公認(rèn)的基因座名稱(chēng)作為前綴,例如“DYS385”或“CSF1PO”。這有助于明確指代特定的遺傳標(biāo)記位置。
-
重復(fù)單位的詳細(xì)描述:如果一個(gè)STR基因座包含兩種或以上不同序列的重復(fù)單位,需要詳細(xì)描述每種重復(fù)單位及其重復(fù)次數(shù),采用括號(hào)分隔不同單位類(lèi)型及其重復(fù)次數(shù),如“(ATG)6(ATC)4”。
-
等位基因命名中的不確定性處理:當(dāng)無(wú)法精確確定一個(gè)STR等位基因的重復(fù)次數(shù)時(shí),采用“.”表示不確定的堿基數(shù)目,如“DYS391 .”表明該基因座的等位基因具體重復(fù)次數(shù)不明。
-
特殊命名情況:對(duì)于某些特殊情況,如復(fù)雜的STR結(jié)構(gòu)或難以直接計(jì)數(shù)的情況,該標(biāo)準(zhǔn)提供了一套詳細(xì)的指導(dǎo)原則,確保即使在復(fù)雜情形下也能實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確命名。
-
更新與兼容性:標(biāo)準(zhǔn)還考慮了與先前命名方法的兼容性,以及未來(lái)新發(fā)現(xiàn)STR基因座的命名擴(kuò)展性,確保命名系統(tǒng)能夠隨技術(shù)進(jìn)步而持續(xù)適用。
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....
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- 現(xiàn)行
- 正在執(zhí)行有效
- 2020-10-30 頒布
- 2021-01-01 實(shí)施
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GA/T 1694-2020序列多態(tài)STR等位基因命名規(guī)則-免費(fèi)下載試讀頁(yè)文檔簡(jiǎn)介
ICS13310
A92.
中華人民共和國(guó)公共安全行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)
GA/T1694—2020
序列多態(tài)STR等位基因命名規(guī)則
Nomenclatureforsequence-basedSTRalleles
2020-10-30發(fā)布2021-01-01實(shí)施
中華人民共和國(guó)公安部發(fā)布
GA/T1694—2020
目次
前言
…………………………Ⅰ
引言
…………………………Ⅱ
范圍
1………………………1
規(guī)范性引用文件
2…………………………1
術(shù)語(yǔ)和定義
3………………1
縮略語(yǔ)
4……………………2
命名原則
5…………………2
命名規(guī)則
6…………………2
附錄規(guī)范性附錄法庭科學(xué)基因座序列信息
A()STR…………………5
參考文獻(xiàn)
……………………14
GA/T1694—2020
前言
本標(biāo)準(zhǔn)按照給出的規(guī)則起草
GB/T1.1—2009。
請(qǐng)注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專(zhuān)利本文件的發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識(shí)別這些專(zhuān)利的責(zé)任
。。
本標(biāo)準(zhǔn)由全國(guó)刑事技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)法醫(yī)檢驗(yàn)分技術(shù)委員會(huì)提出并
(SAC/TC179/SC6)
歸口
。
本標(biāo)準(zhǔn)起草單位公安部物證鑒定中心四川大學(xué)廣州市公安局遼寧省公安廳北京市公安局
:、、、、、
北京愛(ài)普益生物科技有限公司
。
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人季安全葉健王樂(lè)康克萊王正劉超劉鋒焦章平張馳周騁
:、、、、、、、、、。
Ⅰ
GA/T1694—2020
引言
遺傳標(biāo)記廣泛應(yīng)用于法庭科學(xué)醫(yī)療診斷以及人類(lèi)學(xué)研究本標(biāo)準(zhǔn)面向的應(yīng)用需求制
STR、。STR,
訂統(tǒng)一的序列多態(tài)等位基因命名規(guī)則提高的應(yīng)用價(jià)值
STR,STR。
Ⅱ
GA/T1694—2020
序列多態(tài)STR等位基因命名規(guī)則
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了人類(lèi)序列多態(tài)等位基因命名規(guī)則
STR。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于所有從事測(cè)序的實(shí)驗(yàn)室和產(chǎn)品制造商
STRDNA。
2規(guī)范性引用文件
本標(biāo)準(zhǔn)沒(méi)有規(guī)范性引用文件
。
3術(shù)語(yǔ)和定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件
。
31
.
基因座locus
染色體上基因所占的位置或基因組中的一段
DNA。
定義
[GB/T37226—2018,2.2]
32
.
等位基因allele
位于一對(duì)同源染色體的相同位置上控制同一性狀的不同形式的基因
。
33
.
基因型genotype
個(gè)體一個(gè)或多個(gè)基因座上等位基因的組合是生物體可見(jiàn)性狀的實(shí)際基因組成
,。
34
.
短串聯(lián)重復(fù)序列shorttandemrepeat
一類(lèi)廣泛存在于真核生物基因組中的串聯(lián)重復(fù)序列其重復(fù)單位通常由個(gè)個(gè)堿基構(gòu)
DNA。2~6
成重復(fù)次數(shù)通常在次次
,5~60。
35
.
單核苷酸多態(tài)性singlenucleotidepolymorphism
在人類(lèi)基因組范圍內(nèi)任何單堿基突變使特異核苷酸位置上出現(xiàn)兩種或兩種以上堿基其中最少的
,,
一種在群體中的頻率不少于所形成的多態(tài)性遺傳標(biāo)記
1%,。
36
.
長(zhǎng)度多態(tài)性lengthpolymorphism
同一基因座上各等位基因之間的長(zhǎng)度差異構(gòu)成的多態(tài)性
,DNA。
37
.
序列多態(tài)性sequencepolymorphism
同一基因座上因不同個(gè)體序列堿基差異構(gòu)成的多態(tài)性
,DNA。
38
.
重復(fù)區(qū)序列repeatregionsequence
溫馨提示
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