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文檔簡介
植物病原細(xì)菌學(xué)實驗課件第一頁,共九十四頁,2022年,8月28日實驗一植物病原細(xì)菌常用培養(yǎng)基
的制作與滅菌
第二頁,共九十四頁,2022年,8月28日1.了解細(xì)菌培養(yǎng)基的種類;2.掌握常用細(xì)菌培養(yǎng)基的配方和制作方法;3.掌握培養(yǎng)基的滅菌方法。一、實驗?zāi)康?/p>
第三頁,共九十四頁,2022年,8月28日二、實驗內(nèi)容和操作方法
(1)配方:牛肉膏3g,蛋白胨10g,NaCl5g,瓊脂20g,蒸餾水1000mL。1.牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基(NA):分離和培養(yǎng)最常用(2)配制過程:將牛肉膏、蛋白胨、NaCl溶于蒸餾水后,調(diào)節(jié)pH7.2,加入瓊脂溶化后分裝于三角瓶和試管。(一)培養(yǎng)基的配制第四頁,共九十四頁,2022年,8月28日2.Hugh和Leifson(HL)培養(yǎng)基:細(xì)菌的好氧性和厭氧性測定蛋白胨2.0g氯化鈉5.0g磷酸氫二鉀0.2g瓊脂3.0g蒸餾水1000.0mlpH7.4~7.8溴百里酚蘭(1.6%酒精溶液1.5ml)待培養(yǎng)基融化,并調(diào)pH后,裝于試管中,每支試管裝9ml
滅菌。培養(yǎng)基凝固后,用接種針蘸細(xì)菌懸浮液針刺接種,一直刺到管底。分別在培養(yǎng)2、4和7d后觀察記錄。好氧性細(xì)菌,只在開管的上部生長;兼性厭氧性細(xì)菌,則在開管的上下部都能生長;厭氧性細(xì)菌,則只能在開管的下部和閉管中生長。第五頁,共九十四頁,2022年,8月28日(1)配方:NH4H2PO41.0g,氯化鉀0.2g,MgSO4.7H2O0.2g,蒸餾水1000mL,溴百里酚蘭(1.6%酒精溶液)1.5mL;1%碳素化合物。3.Ayers培養(yǎng)基:碳素化合物產(chǎn)酸試驗
單糖(葡萄糖、半乳糖);雙糖(麥芽糖、乳糖);多糖(淀粉);醇(甘露醇)。有的細(xì)菌不產(chǎn)酸和氣,有的只產(chǎn)酸不產(chǎn)氣,少數(shù)植物病原細(xì)菌既產(chǎn)酸又產(chǎn)氣第六頁,共九十四頁,2022年,8月28日(3)分裝:將上述培養(yǎng)基分裝于試管中,每管10mL左右。如果測定氣體產(chǎn)生,加上杜氏發(fā)酵小玻管后滅菌。產(chǎn)酸時培養(yǎng)液變黃,產(chǎn)堿時變藍(lán),產(chǎn)氣則小玻管內(nèi)培養(yǎng)液被部分排出,出現(xiàn)空隙。(2)配制過程:將NH4H2PO4、氯化鉀、MgSO4.7H2O溶于蒸餾水,調(diào)節(jié)pH7.0后加入溴百里酚蘭,最后加入碳素化合物(也可分別滅菌后加入)第七頁,共九十四頁,2022年,8月28日4.MR和VP試驗:對葡萄糖的分解能力
(1)配方:蛋白胨5g,葡萄糖5g,磷酸氫二鉀5g,蒸餾水1000mL。(2)配制過程:將蛋白胨、葡萄糖、磷酸氫二鉀溶于蒸餾水,調(diào)節(jié),每管分裝5mL即可。第八頁,共九十四頁,2022年,8月28日5.硝酸鹽還原(1)配方:硝酸鉀1.0g,蛋白胨5.0g,酵母膏3.0g,蒸餾水1000mL,(2)配制過程:將硝酸鉀、蛋白胨、酵母膏稱好后,溶解于蒸餾水后,調(diào)節(jié)pH。第九頁,共九十四頁,2022年,8月28日6.半胱氨酸培養(yǎng)液:測定產(chǎn)H2S能力(1)配方:蛋白胨10g,硫酸鈉0.1g,半胱氨酸0.1g,蒸餾水1000mL。(2)配制過程:將半胱氨酸、蛋白胨、硫酸鈉稱好后,溶解于水中,調(diào)節(jié)即可。第十頁,共九十四頁,2022年,8月28日7.吲哚試驗(1)配方:蛋白胨20.0g,磷酸氫二鈉2.0g,葡萄糖10.0g,蒸餾水1000mL。(2)配制過程:將蛋白胨等稱好后,溶解于蒸餾水,調(diào)節(jié)即可。第十一頁,共九十四頁,2022年,8月28日8.明膠液化(1)配方:牛肉浸膏3.0g,蛋白胨5.0g,明膠10-12%,蒸餾水1000mL。(2)配制過程:將牛肉浸膏、蛋白胨溶解于蒸餾水中,調(diào)節(jié)后,將明膠溶解于此溶液中,即可分裝于試管中。第十二頁,共九十四頁,2022年,8月28日9.淀粉水解試驗(1)配方:牛肉浸膏3.0g,蛋白胨17.5g,淀粉1.5g,瓊脂15-20g,蒸餾水1000mL。(2)配制過程:將牛肉浸膏、蛋白胨、淀粉稱好后,溶解于蒸餾水中,加入稱好的瓊脂,待融化后調(diào)節(jié)。第十三頁,共九十四頁,2022年,8月28日10.石蕊牛乳反應(yīng)
(1)配方:脫脂牛乳1000mL,石蕊液(4%)15-20mL。(2)配制過程:提前配制石蕊液第十四頁,共九十四頁,2022年,8月28日(二)培養(yǎng)基的滅菌上述培養(yǎng)基應(yīng)按培養(yǎng)基配方中規(guī)定的條件及時進(jìn)行滅菌。普通培養(yǎng)基為121℃20~30min,以保證滅菌效果和不損傷培養(yǎng)基的有效成份。培養(yǎng)基經(jīng)滅菌后,如需要作斜面固體培養(yǎng)基,則滅菌后立即擺放成斜面,斜面長度一般以不超過試管長度的1/2為宜;半固體培養(yǎng)基滅菌后,垂直冷凝成半固體深層瓊脂。第十五頁,共九十四頁,2022年,8月28日明膠培養(yǎng)基滅菌12-15分鐘。石蕊牛乳培養(yǎng)基間歇滅菌3次,每次通蒸汽20-30分鐘。滅菌方法
滅菌是指殺死或消滅一定環(huán)境中的所有微生物,滅菌的方法分物理和化學(xué)滅菌法兩大類。本實驗主要介紹物理方法的一種,即加熱滅菌。
第十六頁,共九十四頁,2022年,8月28日加熱滅菌包括濕熱和干熱滅菌兩種。通過加熱使菌體內(nèi)蛋白質(zhì)凝固變性,從而達(dá)到殺菌目的。高壓蒸汽滅菌法
高壓蒸汽滅菌用途廣,效率高,是基于水的沸點隨著蒸汽壓力的升高而升高的原理設(shè)計的。第十七頁,共九十四頁,2022年,8月28日當(dāng)蒸汽壓力達(dá)到1.05kg/cm2時,水蒸氣的溫度升高到121℃,經(jīng)20~30min,可全部殺死鍋內(nèi)物品上的各種微生物和它們的孢子或芽孢。一般培養(yǎng)基、玻璃器皿以及傳染性標(biāo)本和工作服等都可應(yīng)用此法滅菌。操作方法和注意事項如下:
加水
打開滅菌鍋蓋,向鍋內(nèi)加水到水位線。注意水要加夠,防止滅菌過程中干鍋。
第十八頁,共九十四頁,2022年,8月28日裝料、加蓋
滅菌材料放好后,關(guān)閉滅菌器蓋,采用對角式均勻擰緊鍋蓋上的螺旋,使蒸汽鍋密閉,勿使漏氣。
排氣打開放氣閥。用電爐加熱,待水煮沸后,水蒸氣和空氣一起從排氣孔排出,當(dāng)有大量蒸汽排出時,維持5min,使鍋內(nèi)冷空氣完全排凈。
第十九頁,共九十四頁,2022年,8月28日升壓、保壓和降壓
當(dāng)鍋內(nèi)冷空氣排凈時,即可關(guān)閉排氣閥,壓力開始上升。當(dāng)壓力上升至所需壓力時,控制電壓以維持恒溫,并開始計算滅菌時間,待時間達(dá)到要求(一般培養(yǎng)基和器皿滅菌控制在121℃,20min)后,停止加熱,待壓力降至接近“0”時,打開放氣閥。注意不能過早過急地排氣,否則會由于瓶內(nèi)壓力下降的速度比鍋內(nèi)慢而造成瓶內(nèi)液體沖出容器之外。
第二十頁,共九十四頁,2022年,8月28日干熱滅菌法
通過使用干熱空氣殺滅微生物的方法叫干熱滅菌。一般是把待滅菌的物品包裝就緒后,放入電烘箱中烘烤,即加熱至160~170℃維持1~2h。
干熱滅菌法常用于空玻璃器皿、金屬器具的滅菌。凡帶有膠皮的物品,液體及固體培養(yǎng)基等都不能用此法滅菌。
第二十一頁,共九十四頁,2022年,8月28日1細(xì)菌(NA)和真菌(PDA)常用培養(yǎng)基的配方和制作過程有何異同點?2試述高壓蒸汽滅菌的操作方法和注意事項。三、作業(yè)第二十二頁,共九十四頁,2022年,8月28日實驗二植物病原細(xì)菌的分離
和致病性測定第二十三頁,共九十四頁,2022年,8月28日二、實驗內(nèi)容和操作方法
(1)首先要選擇典型、新鮮病組織;(2)以滅菌剪將病斑剪下,略帶健康組織,大小約0.5~1公分左右,放在滅菌載玻片中央,加無菌水1d。加上滅菌蓋玻片,靜置約10min左右,觀察是否有云霧狀自破口處涌出(一)細(xì)菌溢現(xiàn)象觀察
第二十四頁,共九十四頁,2022年,8月28日(1)斑點型:如棉花角斑病。A.剪取新鮮的典型病斑,約1cm見方。(二)植物病原細(xì)菌的分離1.細(xì)菌懸浮液的配制(不同癥狀類型分離材料的選擇和表面消毒)第二十五頁,共九十四頁,2022年,8月28日B.表面消毒:將切取的組織塊在70%乙醇中浸一下立即取出,然后用表面消毒劑進(jìn)行表面消毒,可以采用0.1%升汞,15″-2min或0.5%的次亞氯酸鹽如漂白粉(1:9稀釋液)2minC.消毒后用滅菌水洗滌3次,將病組織放在另一個培養(yǎng)皿的滅菌水中,剪破中心或以滅菌玻璃棒研碎病組織靜置20-30分鐘,等細(xì)菌游出。第二十六頁,共九十四頁,2022年,8月28日(2)萎蔫型如茄青枯病將莖部剪成1-2寸長,表面用70%酒精輕拭,在火焰上表面消毒,以滅菌刀縱剖,選擇輕微變色病部,以滅菌刀切出薄片或以解剖針挑出病健交界處組織(可以不再消毒),加滅菌水浸泡20-30分鐘。如果莖部較粗,也可以在表面消毒后用解剖刀橫斷莖部,用夾子或手緊壓莖部橫斷面,擠出溢膿或汁液。第二十七頁,共九十四頁,2022年,8月28日(3)腫瘤組織
軟瘤比較容易分離;木質(zhì)瘤可以磨碎后接種在向日葵、番茄等幼株上長出瘤后再分離。由于細(xì)菌位于表皮細(xì)胞和木質(zhì)部之間,因此應(yīng)用酒精棉花擦拭表面,在火焰上表面消毒,再在滅菌皿中實行解剖后以滅菌玻棒將其搗碎,靜置浸泡24h。第二十八頁,共九十四頁,2022年,8月28日(4)腐爛組織較簡單,選擇近病部交界處以接種環(huán)挑取少量腐爛組織,稀釋。(5)種子帶菌的分離
選擇病種子,以0.1%升汞液表面消毒1-2min,滅菌水洗滌,再將此種子在70%酒精中浸幾分鐘,洗滌2-3次,取出放在研缽中磨碎,離心取上清液。第二十九頁,共九十四頁,2022年,8月28日2.分離方法A.倒平板:注意培養(yǎng)基的溫度不能太高,否則冷凝水太多,細(xì)菌在水中游動而影響單個分散菌落的形成。(1)平板劃線分離法:被普遍采用第三十頁,共九十四頁,2022年,8月28日B.用接種環(huán)蘸取上述配制好的菌懸液,在已凝固的平板培養(yǎng)基表面劃線如果菌液濃度大,培養(yǎng)皿轉(zhuǎn)動角度減小,增加劃線的次數(shù)劃4條線后,將接種環(huán)滅菌,培養(yǎng)皿轉(zhuǎn)動90°,從第2條線開始劃4-5條線第三十一頁,共九十四頁,2022年,8月28日(2)培養(yǎng)皿稀釋分離法0原液1取1環(huán)菌液0.5mL滅菌水2混勻后取1環(huán)3混勻后取1環(huán)4混勻后取1環(huán)5混勻后取1環(huán)第三十二頁,共九十四頁,2022年,8月28日3.培養(yǎng)
一般放置在28-30℃溫箱中倒置培養(yǎng),時間2~3d。將冷卻至45℃左右的培養(yǎng)基倒入裝有稀釋菌液的培養(yǎng)皿中,輕輕轉(zhuǎn)動培養(yǎng)皿,使菌液和培養(yǎng)基混勻,待其凝固后培養(yǎng)。第三十三頁,共九十四頁,2022年,8月28日4.細(xì)菌的純化
挑取分離出的典型單菌落平板劃線培養(yǎng)(2皿),如此重復(fù)1-2次,最后,在均勻一致的平板中,挑取典型菌落移植在斜面培養(yǎng)基上培養(yǎng),長成后在4℃環(huán)境中保存菌種。第三十四頁,共九十四頁,2022年,8月28日1.配制107-108CFU/mL的細(xì)菌懸浮液,菌齡48小時左右;(二)致病性測定
2.指示植物的選擇:一般用煙草,在假單胞和黃單胞菌屬上較適用。第三十五頁,共九十四頁,2022年,8月28日3.接種方法:用注射器將細(xì)菌液從煙草下表皮注入葉肉細(xì)胞間。用滅菌水作陰性對照,同屬HR陽性的菌株作陽性對照。4.培養(yǎng)條件:接種后的植物應(yīng)保持在25℃,相對濕度較高(85%)的條件下。5.結(jié)果觀察:在24~48h表現(xiàn)枯斑為陽性反應(yīng),3d左右出現(xiàn)黃斑為陰性反應(yīng)。第三十六頁,共九十四頁,2022年,8月28日三作業(yè):1.簡述本實驗中植物病原細(xì)菌的分離步驟及其操作注意事項2.煙草過敏性反應(yīng)試驗?zāi)軌虼_定細(xì)菌的致病性嗎?為什么?第三十七頁,共九十四頁,2022年,8月28日實驗三植物病原細(xì)菌的形態(tài)觀察
1.了解革蘭氏染色鑒定的快速鑒定方法;2.掌握革蘭氏染色和鞭毛染色的方法;3.掌握細(xì)菌培養(yǎng)性狀的描述特征。
一、實驗?zāi)康?/p>
第三十八頁,共九十四頁,2022年,8月28日二、實驗內(nèi)容和操作方法
1.結(jié)晶紫草酸銨染色(一)革蘭氏染色
(1)試劑A.結(jié)晶紫草酸銨染劑:溶液Ⅰ:結(jié)晶紫2.0g,酒精(95%)20mL混合溶液Ⅰ和Ⅱ,過濾,貯藏于試劑瓶中,24h后使用。溶液Ⅱ:草酸銨0.8g,蒸餾水80mL第三十九頁,共九十四頁,2022年,8月28日C.復(fù)染劑原液:番紅O2.5g,95%酒精100mL復(fù)染劑:原液10mL,蒸餾水90mLB.魯戈爾碘液:碘1.0g,碘化鉀2g蒸餾水300mL。將碘和碘化鉀在研缽中研和,慢慢加水并繼續(xù)研和直至碘和碘化鉀溶解,然后加水稀釋到300mL,盛入棕色試劑瓶,放暗處備用。第四十頁,共九十四頁,2022年,8月28日(2)染色程序A.配制細(xì)菌懸浮液:菌齡16hB.在干凈的載玻片上涂片、風(fēng)干,不要加熱,然后在火焰上通過2次,固定玻片。C.結(jié)晶紫染色1分鐘,水洗數(shù)秒鐘,吸干。D.碘液處理1分鐘,水洗,吸干。E.用95%酒精褪色約30秒。水洗,吸干F.番紅O復(fù)染10秒,水洗,吸干G.加1滴香柏油,在油鏡下鏡檢,紅色為革蘭氏陰性菌,紫色為革蘭氏陽性菌。第四十一頁,共九十四頁,2022年,8月28日2.氫氧化鉀溶解試驗(1)試劑:3%氫氧化鉀(2)方法:取1-2滴3%氫氧化鉀溶液置于干凈的玻片上,用牙簽取新鮮細(xì)菌培養(yǎng)物與氫氧化鉀混合,充分?jǐn)嚢?0-20秒,如果液滴變粘稠并可拉出絲狀物體,表示測試菌為革蘭氏陰性菌,反之則為革蘭氏陽性菌。第四十二頁,共九十四頁,2022年,8月28日1.試劑(二)鞭毛染色(西薩-基爾法)
(1)媒染劑:單寧酸10g,ALCL3.6H2O18g,ZnCL210g,堿性品紅1.5g,60%酒精40mL在研缽中加入酒精和上述各種成分,充分研磨后,再加入其余的酒精。使用前用蒸餾水稀釋2倍,染色時過濾,濾液直接滴在涂片上。第四十三頁,共九十四頁,2022年,8月28日溶液Ⅰ:堿性品紅0.3g,酒精(95%)10mL溶液Ⅰ和Ⅱ分別配制后混合。溶液Ⅱ:苯酚(結(jié)晶)5g,蒸餾水95mL(2)染液:2.染色步驟(1)載玻片準(zhǔn)備:選用新的或沒有傷痕的,先用洗潔精浸泡洗滌,用清水洗凈后,再放入酸酒精(硫酸與酒精等量混合)中浸泡24-48h,取出后用清水洗凈,再用蒸餾水洗,瀝干水后,浸泡在95%酒精中備用。第四十四頁,共九十四頁,2022年,8月28日(2)配制細(xì)菌懸浮液,菌齡很重要,一般適溫培養(yǎng)16-24h。用吸管沿試管壁緩緩加入無菌水5mL,,靜置30分鐘左右,配成菌懸液。(3)涂片:取浸在酒精中的載玻片,在火焰上燒去酒精,平放,用吸管吸取細(xì)菌懸浮液(以上層為好)在載玻片的一端滴一滴,然后將載玻片稍稍傾斜,使菌懸液從一端緩緩流向另一端,使涂片自然風(fēng)干。第四十五頁,共九十四頁,2022年,8月28日(4)媒染劑過濾后,直接將濾液滴在涂片上,處理5-7分鐘(5)用水輕輕洗去染媒劑,甩去載玻片上剩余的水,在空氣中干燥后,再加苯酚品紅染劑染色5分鐘。(6)水洗,在空氣中干燥后,加1滴香柏油,在油鏡下觀察鞭毛的數(shù)量和著生位置。第四十六頁,共九十四頁,2022年,8月28日1.革蘭氏染色反應(yīng)和鞭毛染色在植物病原細(xì)菌鑒定中有何作用?為什么?2.細(xì)菌鞭毛染色對菌齡的要求比較嚴(yán)格,在操作過程中也要注意動作的輕柔,為什么?3觀察和記錄NA平板上的細(xì)菌菌落性狀、菌體形狀、運動性和革蘭氏染色結(jié)果。三作業(yè)第四十七頁,共九十四頁,2022年,8月28日實驗四
植物病原細(xì)菌生理生化測定
1.掌握無菌操作技術(shù);2.了解各種生理生化性狀測定常用試劑的配制方法;3.掌握各種生理生化性狀的觀察方法。一、實驗?zāi)康?/p>
第四十八頁,共九十四頁,2022年,8月28日二、實驗內(nèi)容和方法
1.產(chǎn)酸和產(chǎn)氣試驗(一)碳素化合物的利用1)接菌培養(yǎng):一般每5mL培養(yǎng)液接種0.1mL108CFU/ml菌懸液,適溫下培養(yǎng)3-4周。2)結(jié)果觀察:產(chǎn)酸:培養(yǎng)液變?yōu)辄S色產(chǎn)堿:培養(yǎng)液變?yōu)樗{(lán)色CK:培養(yǎng)液為草綠色變色產(chǎn)氣:杜氏發(fā)酵小玻管出現(xiàn)空隙CK:杜氏發(fā)酵小玻管不出現(xiàn)空隙產(chǎn)氣第四十九頁,共九十四頁,2022年,8月28日(1)配方:NH4H2PO41.0g,氯化鉀0.2g,MgSO4.7H2O0.2g,蒸餾水1000mL,溴百里酚蘭(1.6%酒精溶液)1.5mL;1%碳素化合物。Ayers培養(yǎng)基:碳素化合物產(chǎn)酸試驗
單糖(葡萄糖、半乳糖);雙糖(麥芽糖、乳糖);多糖(淀粉);醇(甘露醇)。
有的細(xì)菌不產(chǎn)酸和氣,有的只產(chǎn)酸不產(chǎn)氣,少數(shù)植物病原細(xì)菌既產(chǎn)酸又產(chǎn)氣第五十頁,共九十四頁,2022年,8月28日(3)分裝:將上述培養(yǎng)基分裝于試管中,每管10mL左右。測定氣體產(chǎn)生時,加上杜氏發(fā)酵小玻管后滅菌。(2)配制過程:將NH4H2PO4、氯化鉀、MgSO4.7H2O溶于蒸餾水,調(diào)節(jié)pH7.0后加入溴百里酚蘭,最后加入碳素化合物(也可分別滅菌后加入)第五十一頁,共九十四頁,2022年,8月28日
3)MR試驗結(jié)果觀察:取上述培養(yǎng)液5ml,加甲基紅試劑2~3滴,呈明顯紅色為陽性,呈黃色為陰性。2.甲基紅(MR)和VP(產(chǎn)3-羥基丁酮)試驗1)接菌培養(yǎng):一般每5mL培養(yǎng)液接種0.1mL108CFU菌懸液,適溫下培養(yǎng)1周。2)甲基紅試劑配制:甲基紅0.1g溶解于300ml的95%酒精中,然后用蒸餾水稀釋至500ml。
4)VP試驗結(jié)果觀察:每毫升加0.1mL40%KOH溶液,置48-50℃水浴處理2h,充分搖動后觀察結(jié)果。在4h內(nèi)出現(xiàn)紅色者為陽性反應(yīng)。第五十二頁,共九十四頁,2022年,8月28日測定亞硝酸,每試管加試劑A和試劑B各1ml如呈紅色,表示有亞硝酸根。1)接菌:在培養(yǎng)液中接菌后培養(yǎng)1周(二)氮素化合物的分解2)Griess-Llosvary試劑測定法試劑A:對氨基苯磺酸8.0g,5mol/L醋酸(286.0ml冰醋酸加715.0ml水)1000ml試劑B:二甲基-α-萘胺6ml,5mol/L醋酸1000ml1.硝酸鹽還原第五十三頁,共九十四頁,2022年,8月28日1)醋酸鉛濾紙條的制備:將濾紙剪成5mm×50mm的小條浸在5%醋酸鉛溶液中,空氣中干燥后,在120℃烘箱中滅菌1h。2)接菌:將細(xì)菌接種于試管中的培養(yǎng)液中后,用上述制備的濾紙條夾在棉花塞和試管壁之間,使紙條懸在培養(yǎng)液面上,但不要碰到培養(yǎng)液,25℃培養(yǎng)2周。3)結(jié)果觀察:紙條變黑表示有硫化氫產(chǎn)生,為陽性反應(yīng)。2.硫化氫產(chǎn)生第五十四頁,共九十四頁,2022年,8月28日1)草酸濾紙條的制備:將濾紙剪成5mm×50mm的小條浸在飽和草酸溶液中,空氣中干燥后,在120℃烘箱中滅菌1h。2)接菌:將細(xì)菌接種于試管中的培養(yǎng)液中后,用上述制備的濾紙條夾在棉花塞和試管壁之間,使紙條懸在培養(yǎng)液面上,但不要碰到培養(yǎng)液,適溫培養(yǎng)1周。3)結(jié)果觀察:紙條變淡紅色表示有吲哚產(chǎn)生,為陽性反應(yīng)。3.吲哚產(chǎn)生第五十五頁,共九十四頁,2022年,8月28日1)接菌:采用穿刺法接菌后,放在適溫中培養(yǎng)1-3周。以不接菌試管為對照。(三)大分子化合物的利用2)結(jié)果觀察:將經(jīng)過培養(yǎng)的接菌試管取出后,放在4℃冰箱中,看其是否凝固,如不凝固,則說明明膠分解而導(dǎo)致液化,為陽性反應(yīng)。1.明膠液化第五十六頁,共九十四頁,2022年,8月28日A.酸的產(chǎn)生:石蕊牛乳變成粉紅色,表示從乳糖產(chǎn)酸1)接菌:將培養(yǎng)基接種細(xì)菌于28℃培養(yǎng)1-3周,以不接種的石蕊牛乳做對照。2)結(jié)果觀察:2.石蕊牛乳反應(yīng)B.凝固:產(chǎn)酸達(dá)到pH4.7發(fā)生凝塊,如產(chǎn)氣凝塊斷裂;凝乳酶的作用而凝固,凝塊收縮與乳清分離。C.胨化:牛乳變清,往往從表層開始D.堿的產(chǎn)生:石蕊牛乳變藍(lán)色,胨化時常呈堿性E.石蕊還原:石蕊變?yōu)闊o色第五十七頁,共九十四頁,2022年,8月28日
在平板上加碘液后,培養(yǎng)基為深蘭色,菌落周圍有無色透明圈者為陽性。1)接菌:將細(xì)菌接種于淀粉瓊脂平板上,適溫下培養(yǎng)24-48小時。2)結(jié)果觀察:3.淀粉水解試驗第五十八頁,共九十四頁,2022年,8月28日四、細(xì)菌的好氧性和厭氧性測定蛋白胨2.0g氯化鈉5.0g磷酸氫二鉀0.2g瓊脂3.0g蒸餾水1000.0mlpH7.4~7.8溴百里酚蘭(1.6%酒精溶液1.5ml)待培養(yǎng)基融化,并調(diào)pH后,裝于試管中,每支試管裝9ml
滅菌。培養(yǎng)基凝固后,用接種針蘸細(xì)菌懸浮液針刺接種,一直刺到管底。分別在培養(yǎng)2、4和7d后觀察記錄。
好氧性細(xì)菌,只在開管的上部生長;兼性厭氧性細(xì)菌,則在開管的上下部都能生長;厭氧性細(xì)菌,則只能在開管的下部和閉管中生長。第五十九頁,共九十四頁,2022年,8月28日1)試劑:1%二甲基對苯二胺鹽酸鹽或1%四甲基對苯二胺鹽酸鹽。(五)其他生理生化試驗2)測定方法:1.氧化酶試驗A.Kovacs:在培養(yǎng)皿內(nèi)放一張濾紙,濾紙上加3-4滴試劑使其濕潤,用牙簽挑取24h菌苔涂在濾紙上,60秒內(nèi)變成紫色為陽性反應(yīng),60秒后或不便色為陰性。B.濾紙條法:用濾紙條蘸少許菌苔,加1d試劑,立即呈粉紅色為陽性第六十頁,共九十四頁,2022年,8月28日1)試劑:3%過氧化氫2)測定方法:挑取固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)24-48h的菌苔,置于干凈玻片上,滴加過氧化氫。2.過氧化氫酶(接觸酶)試驗3)結(jié)果觀察:在半分鐘內(nèi)有大量氣泡產(chǎn)生的為陽性,不產(chǎn)生氣泡的為陰性。第六十一頁,共九十四頁,2022年,8月28日三作業(yè):1若有吲哚和硫化氫產(chǎn)生,其實驗的試管口上的濾紙條會發(fā)生什么樣的顏色變化,為什么?2在石蕊牛乳不能和其他細(xì)菌培養(yǎng)基一起滅菌,為什么?反應(yīng)中會出現(xiàn)多種不同的反應(yīng),試分析其發(fā)生的原因?3觀察和記錄細(xì)菌氧化發(fā)酵試驗、MR試驗以及接觸酶試驗結(jié)果。第六十二頁,共九十四頁,2022年,8月28日實驗五
植物病原細(xì)菌的PCR分子鑒定
1了解PCR反應(yīng)的原理;掌握PCR反應(yīng)的操作方法。一、實驗?zāi)康?/p>
第六十三頁,共九十四頁,2022年,8月28日二、PCR擴增聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChainReaction,簡稱PCR)第六十四頁,共九十四頁,2022年,8月28日1、PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與目標(biāo)序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性--退火--延伸三個反應(yīng)步驟構(gòu)成:①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至94℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈(以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備);②模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;第六十五頁,共九十四頁,2022年,8月28日③引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復(fù)制鏈,重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。第六十六頁,共九十四頁,2022年,8月28日2TheprocedureofPCR5’5’3’3’d.NTPsTaqPrimers5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’componentdenaturation5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’(94℃)
第六十七頁,共九十四頁,2022年,8月28日extension5’3’5’3’5’3’5’3’3’5’3’TaqTaq5’5’repeatedanneal(72℃)
(50℃)
第六十八頁,共九十四頁,2022年,8月28日5’3’5’3’5’3’5’3’5’5’3’3’5’3’5’3’2cycles4copies3cycles8copies5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’5’3’3’5’5’3’5’3’5’3’5’3’第六十九頁,共九十四頁,2022年,8月28日10×反應(yīng)緩沖液(含Mg2+)5.0ldNTP混合物,10mmol/L1.0l上游引物,20mol/L1.0l下游引物,20mol/L1.0l模板DNA1.0lTaq
plusDNA聚合酶,5U/l0.5l加雙蒸水至終體積為50l
3反應(yīng)體系取一0.5mlPCR薄壁管,依次加入以下試劑:
第七十頁,共九十四頁,2022年,8月28日第七十一頁,共九十四頁,2022年,8月28日第七十二頁,共九十四頁,2022年,8月28日第七十三頁,共九十四頁,2022年,8月28日第七十四頁,共九十四頁,2022年,8月28日第七十五頁,共九十四頁,2022年,8月28日第七十六頁,共九十四頁,2022年,8月28日第七十七頁,共九十四頁,2022年,8月28日第七十八頁,共九十四頁,2022年,8月28日第七十九頁,共九十四頁,2022年,8月28日第八十頁,共九十四頁,2022年,8月28日第八十一頁,共九十四頁,2022年,8月28日
M1234
3kb2kb0.8%agrosegelelectrophoresisoffulllengthPCRproductfromY160M:DNAmarker;1:Y160;2:positivecontrol;34:CK-2.7kb第八十二頁,共九十四頁,2022年,8月28日引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以最低引物量產(chǎn)生所需要的結(jié)果為好,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴增,且可增加引物之間形成二聚體的機會。
酶及其濃度:目前有兩種TaqDNA聚合酶供應(yīng),一種是從棲熱水生桿菌中提純的天然酶,另一種為大腸菌合成的基因工程酶。催化一典型的PCR反應(yīng)約需酶量2.5U(指總反應(yīng)體積為100ul時),濃度過高可引起非特異性擴增,濃度過低則合成產(chǎn)物量減少。4PCR反應(yīng)操作注意事項:第八十三頁,共九十四頁,2022年,8月28日dNTP的質(zhì)量與濃度
dNTP的質(zhì)量與濃度和PCR擴增效率有密切關(guān)系,dNTP粉呈顆粒狀,如保存不當(dāng)易變性失去生物學(xué)活性。dNTP溶液呈酸性,使用時應(yīng)配成高濃度后,以1MNaOH或1MTris。HCL的緩沖液將其PH調(diào)節(jié)到7.0~7.5,小量分裝,-20℃冰凍保存。多次凍融會使dNTP降解。在PCR反應(yīng)中,dNTP應(yīng)為50~200umol/L,尤其是注意4種dNTP的濃度要相等(等摩爾配制),如其中任何一種濃度不同于其它幾種時(偏高或偏低),就會引起錯配。濃度過低又會降低PCR產(chǎn)物的產(chǎn)量。dNTP能與Mg2+結(jié)合,使游離的Mg2+濃度降低。第八十四頁,共九十四頁,2022年,8月28日模板(靶基因)核酸模板核酸的量與純化程度,是PCR成敗與否的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一。Mg2+濃度
Mg2+對PCR擴增的特異性和產(chǎn)量有顯著的影響,在一般的PCR反應(yīng)中,各種dNTP濃度為200umol/L時,Mg2+濃度為1.5~2.0mmol/L為宜。Mg2+濃度過高,反應(yīng)特異性降低,出現(xiàn)非特異擴增,濃度過低會降低TaqDNA聚合酶的活性,使反應(yīng)產(chǎn)物減少。第八十五頁,共九十四頁,2022年,8月28日
PCR反應(yīng)條件的選擇
PCR反應(yīng)條件為溫度、時間和循環(huán)次數(shù)。溫度與時間的設(shè)置:基于PCR原理三步驟而設(shè)置變性-退火-延伸三個溫度點。①變性溫度與時間:變性溫度低,解鏈不完全是導(dǎo)致PCR失敗的最主要原因。一般情況下,93℃~94℃lmin足以使模板DNA變性,若低于93℃則需延長時間,但溫度不能過高,因為高溫環(huán)境對酶的活性有影響。此步若不能使靶基因模板或PCR產(chǎn)物完全變性,就會導(dǎo)致PCR失敗。第八十六頁,共九十四頁,2022年,8月28日②退火(復(fù)性)溫度與時間:重要因素。變性后溫度快速冷卻至40℃~60℃,可使引物和模板發(fā)生結(jié)合。由于模板DNA比引物復(fù)雜得多,引物和模板之間的碰撞結(jié)合機會遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于模板互補鏈之間的碰撞。退火溫度與時間,取決于引物的長度、堿基組成及其濃度,還有靶基序列的長度。③延伸溫度與時間:PCR反應(yīng)的延伸溫度一般選擇在70~
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