利用biosispreviews數(shù)據(jù)庫有效挖掘生命科學信息

利用biosispreviews數(shù)據(jù)庫有效挖掘生命科學信息第1頁/共70頁生命科學和生物醫(yī)學研究領(lǐng)域的綜合資源，來源于期刊、會議、專利和書籍。由原美國生物學文摘生命科學信息服務社（現(xiàn)隸屬于ThomsonReuters）編輯出版BiologicalAbstracts與BiologicalAbstracts/RRM(Reports,Reviews,Meetings)整合在一起的互聯(lián)網(wǎng)版本涵蓋了自1926年以來的近1800萬條記錄，數(shù)據(jù)每周更新BIOSISPreviews簡介第2頁/共70頁BIOSISPreviews傳統(tǒng)生物學應用動物學生物醫(yī)學生物技術(shù)微生物學行為學與生態(tài)科學淡水/海水水產(chǎn)業(yè)動物控制野生生物管理昆蟲經(jīng)濟學人類流行病獸類流行病傳染病學寄生蟲病學生物制藥生物化學細胞生物學分子遺傳學生物物理學生物通訊生物種群密度環(huán)境污染與保護園藝學森林學土壤科學Proteomics、藥物反應遺傳學遺傳作物育種、信號傳導、納米技術(shù)Phytomedicine、MicroarrayTechnology生物信息學、基因治療神經(jīng)科學免疫學生殖學發(fā)育學營養(yǎng)學細菌學病毒學生理學農(nóng)業(yè)與植物學分子生物學第3頁/共70頁檢索詞——turkey？？第4頁/共70頁

根據(jù)詞語在上、下文中的明確含義，將關(guān)鍵詞提取并且分門別類歸入到如下大類：BIOSISPreviews–RelationalIndexing（關(guān)聯(lián)性索引）

生物體 疾病名稱

化學物質(zhì) 基因名稱

序列 地理區(qū)劃

地質(zhì)年代 實驗方法與儀器

細胞器/器官/系統(tǒng)

其他例2：Sudan蘇丹紅（化學物質(zhì)概念）蘇丹（非洲國家/地理概念）例1：Turkey火雞（生物體概念）土耳其（地理概念）例3：Cancer

腫瘤（疾病概念）甲殼類動物（生物體概念）第5頁/共70頁ISIproductsareregisteredtrademarksandservicemarksusedunderlicenseBIOSISPreviews:關(guān)聯(lián)性標引

BIOSIS在文獻標引過程中采用關(guān)聯(lián)性標引(RelationalIndexing)：標引出每一個檢索字段和控制字匯之間的關(guān)聯(lián)性。關(guān)鍵詞同義詞描述詞上級分類第6頁/共70頁在BIOSISPreviews全記錄中有關(guān)Coronavirus的標引全記錄頁面關(guān)聯(lián)性標引第7頁/共70頁所有數(shù)據(jù)庫主題標題作者出版物名稱出版年地址第8頁/共70頁第9頁/共70頁１６個檢索字段主題標題作者出版物名稱地址出版年分類數(shù)據(jù)主概念概念代碼化學和生化名稱會議信息識別碼語種出版類型文獻類型分類注釋第10頁/共70頁幫助文檔—隨時隨地查詢字段含義第11頁/共70頁BP中的檢索字段（常規(guī)檢索字段）作者名：zhangjing期刊名：EnvironmentalPollution

主題詞：aspirinsameantithrombotic例：查找有關(guān)阿斯匹林抗血栓形成的文獻地址：266003第12頁/共70頁常規(guī)字段的檢索作者:作者的檢索方式是姓在前，名或明的縮寫在后出版物名稱:可以用出版物全名，也可以用截詞符*，還可以從出版物列表中選擇。如果檢索一本書，可以通過主題和出版物兩種途徑檢索地址：包括作者、編者、發(fā)明者地址。由于地址的多種寫法，可以使用截詞符“*”以簡化檢索。常用的地址詞用截詞的方式表達，通常使用“SAME”算符連接同一地址中出現(xiàn)的多個地址詞第13頁/共70頁BP中的檢索字段（專業(yè)檢索字段）第14頁/共70頁BIOSISPreviews——生物學家不可缺少的科研工具如何快速檢索宏觀課題：中國林業(yè)？如何精準檢索某類生物體的相關(guān)文獻：薔薇科植物殺蟲劑？如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻？如何對課題進行新進展跟蹤：定題跟蹤服務？問題解答提綱第15頁/共70頁主要概念同BA相同，BiosisPreviews有168個主要概念詞．主要概念通過主題方式來類聚文獻主要概念是涉及生命和生物科學領(lǐng)域的相關(guān)詞匯點擊放大鏡圖標可以瀏覽主概念的列表。列表中分為兩種格式：字順列表和按照概念的層級排列。通過拷貝粘貼將主概念檢索詞添加到檢索框中。檢索框中不同的檢索術(shù)語用邏輯算符“OR”連接。第16頁/共70頁例:檢索有關(guān)中國林業(yè)和林學方面相關(guān)文獻China主要概念第17頁/共70頁在輔助索引中輸入檢索詞forest*第18頁/共70頁例:檢索有關(guān)中國林業(yè)和林學方面相關(guān)文獻第19頁/共70頁檢索結(jié)果列表第20頁/共70頁BIOSISPreviews——生物學家不可缺少的科研工具如何快速檢索宏觀課題：中國林業(yè)？如何精準檢索某類生物體的相關(guān)文獻：薔薇科植物殺蟲劑？如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻？如何對課題進行新進展跟蹤：定題跟蹤服務？問題解答提綱第21頁/共70頁分類數(shù)據(jù)(上位生物分類／生物系統(tǒng)名稱)采用自然主題分類法，按照生物界的自然分類系統(tǒng)分類。全部生物體按照類、門、綱、目、科、屬、種的順序排列。大類分為微生物、植物、古生物、動物，每大類分為四級類目（門、綱、目、科）使用任一生物體的科以上類目，都可以查出與該生物相關(guān)的文獻生物系統(tǒng)學代碼/名稱是一個五位的代碼，代表種級別以上的分類組。點擊list連接可以看到生物系統(tǒng)學代碼第22頁/共70頁概念代碼概念代碼是一個五位數(shù)的編碼，代表生命科學中的廣泛的學科領(lǐng)域，每一個編碼對應著一個學科名稱。點擊相應的鏈接可以看到概念代碼和相應的名稱。概念代碼與名稱用于標引自1993—目前年的BIOSIS的紀錄。共計571個五位的概念代碼代表了生命科學的大類。檢索代碼和名稱結(jié)果相同。一組相關(guān)的概念代碼放在上一級主題下。例如：toxicology的概念代碼為22501-22508，可通過通配符*檢索225*而獲得。第23頁/共70頁例:檢索有關(guān)薔薇科植物殺蟲劑的研究輸入檢索詞概念代碼第24頁/共70頁在輔助索引中輸入檢索詞Insectic*第25頁/共70頁例:檢索有關(guān)薔薇科植物殺蟲劑的研究輸入檢索詞分類數(shù)據(jù)第26頁/共70頁第27頁/共70頁BIOSISPreviews關(guān)于薔薇科植物殺蟲劑的文獻第28頁/共70頁BIOSISPreviews具有精煉和分析檢索結(jié)果功能第29頁/共70頁第30頁/共70頁第31頁/共70頁獲取全文全文鏈接:查看全文與作者聯(lián)系第32頁/共70頁獲取全文的方法全文鏈接按鈕館際互借圖書館文獻傳遞免費全文網(wǎng)站//提供免費全文的期刊

作者E-mai聯(lián)系或作者主頁……第33頁/共70頁化學和生化名稱

可使用化合物\基因名\序列名或者化學物質(zhì)登記號進行檢索利用化合物\基因名\序列名或者化學物質(zhì)登記號進行檢索第34頁/共70頁例:檢索有關(guān)蘇丹紅的研究文獻SudanredORSudanI第35頁/共70頁BIOSISPreviews——生物學家不可缺少的科研工具如何快速檢索宏觀課題：中國林業(yè)？如何精準檢索某類生物體的相關(guān)文獻：薔薇科植物殺蟲劑？如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻？如何對課題進行新進展跟蹤：定題跟蹤服務？問題解答提綱第36頁/共70頁

誰能讀這么多？

誰需要讀這么多?

發(fā)現(xiàn)與創(chuàng)新是不是一個數(shù)字的游戲?“首先必需認識到，科研工作者都十分寶貴自己的時間，除極少數(shù)和自己工作關(guān)系十分密切的論文以外，絕大多數(shù)讀者都不會閱讀全文?！?/p>

-鄒承魯“我的科學之路”，2003年10月為什么我們需要分析工具？第37頁/共70頁例:檢索轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物相關(guān)文獻主要概念第38頁/共70頁轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物相關(guān)文獻列表第39頁/共70頁11個角度深入分析出版年概念代碼主要概念SuperTaxa語種學科類別來源出版物文獻類型出版物類型作者專利權(quán)人第40頁/共70頁

文獻發(fā)表按年代分布（保存文件后Excel打開作圖）

第41頁/共70頁發(fā)表文獻的主要類型第42頁/共70頁文獻涉及的主要學科類別第43頁/共70頁涉及的研究角度第44頁/共70頁研究主要涉及的生物體第45頁/共70頁發(fā)表文獻最多的作者第46頁/共70頁發(fā)表論文的首選出版物第47頁/共70頁BIOSISPreviews——生物學家不可缺少的科研工具如何快速檢索宏觀課題：中國林業(yè)？如何精準檢索某類生物體的相關(guān)文獻：薔薇科植物殺蟲劑？如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻？如何對課題進行新進展跟蹤：定題跟蹤服務？問題解答提綱第48頁/共70頁高級檢索舉例：檢索有關(guān)小龍蝦白斑病的文獻

在任意字段進行自由檢索TA=((Crayfishorcrawdads)andhost)andTA=((whitespot*orwssv)andpathogen)第49頁/共70頁檢索結(jié)果：有關(guān)小龍蝦白斑病的文獻第50頁/共70頁TA=((Crayfishorcrawdads)andhost)andTA=((whitespot*orwssv)andpathogen)andMQ=spectrophotometry

高級檢索舉例：檢索有關(guān)小龍蝦白斑病的研究,并且在實驗中應用了分光光度法的文獻，HQ字段進行限制第51頁/共70頁第52頁/共70頁BIOSISPreviews——生物學家不可缺少的科研工具如何快速檢索宏觀課題：中國林業(yè)？如何精準檢索某類生物體的相關(guān)文獻：薔薇科植物殺蟲劑？如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻？如何對課題進行新進展跟蹤：定題跟蹤服務？問題解答提綱第53頁/共70頁免費注冊，登錄后可以使用個性化服務第54頁/共70頁創(chuàng)建定題服務,隨時跟蹤課題最新進展第55頁/共70頁可以保存檢索歷史在服務器或本地計算機上可以訂制定題服務第56頁/共70頁定期檢索相關(guān)課題，并把最新結(jié)果發(fā)送到指定的郵箱中有效期半年，到時間后可以續(xù)訂支持RSSFeed第57頁/共70頁操作演示機構(gòu)IP范圍內(nèi)輸入所有數(shù)據(jù)庫-選擇一個數(shù)據(jù)庫-BIOSISPreviews檢索一個課題查看主要概念、分類數(shù)據(jù)、概念代碼等專業(yè)字段左邊精煉檢索結(jié)果點擊檢索，到達檢索結(jié)果頁面按照SuperTaxa、概念代碼、主要概念等分析按照來源出版物分析檢索結(jié)果，查看期刊列表查看具體記錄頁面的標簽第58頁/共70頁BIOSISPreviews——生物學家不可缺少的科研工具如何快速檢索宏觀課題：中國林業(yè)？如何精準檢索某類生物體的相關(guān)文獻：薔薇科植物殺蟲劑？如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻？如何對課題進行新進展跟蹤：定題跟蹤服務？問題解答提綱第59頁/共70頁布爾邏輯算符檢索包含所有關(guān)鍵字的數(shù)據(jù)。標題：“stemcell*”ANDlymphoma檢索含有“stemcell”或者”stemcells”同時含有及詞語“l(fā)ymphoma”。

等效于檢索“stemcell*”lymphoma檢索的數(shù)據(jù)中至少含有一個所給關(guān)鍵字。用語檢索同義詞或者詞的不同表達方式標題:aspartameORsaccharineORsweetener*檢索至少含有一個關(guān)鍵字的數(shù)據(jù)。排除含有某一特定關(guān)鍵字的數(shù)據(jù)標題:aidsNOThearing檢索含有“aids”的數(shù)據(jù)，排除含有“hearing”的文獻。第60頁/共70頁通配符符號意義*零個或多個字符gene*gene,genetics,generation$零或一個字符colo$rcolor,colour?只代表一個字符en?oblastentoblast,endoblast第61頁/共70頁精確檢索詞組檢索如果希望精確地檢索某個短語，應將其放置在引號內(nèi)。范例:“stemcell”SameSame算符連接的