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文檔簡(jiǎn)介
產(chǎn)品臨床試驗(yàn)工作小結(jié)技術(shù)支持劉遠(yuǎn)澤《基礎(chǔ)分子生物學(xué)》中的幾個(gè)概念1/分子生物學(xué)(molecularbiology):(廣義)在分子水平上研究生命現(xiàn)象的科學(xué)。通過研究生物大分子(核酸、蛋白質(zhì))的結(jié)構(gòu)、功能和生物合成等方面來闡明各種生命現(xiàn)象的本質(zhì)。研究?jī)?nèi)容包括各種生命過程,比如光合作用、發(fā)育的分子機(jī)制、神經(jīng)活動(dòng)的機(jī)理、癌的發(fā)生等。(狹義)范疇偏重于核酸(基因)的分子生物學(xué),主要研究基因或DNA結(jié)構(gòu)與功能、復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、表達(dá)和調(diào)節(jié)控制等過程。2/核酸(nucleicacid):是生物體細(xì)胞內(nèi)一類重要的生物大分子。其主要生物學(xué)功能是作為遺傳信息的載體。核酸以核苷酸(nucleotide)為基本結(jié)構(gòu)單位,通過3’,5’-磷酸二酯鍵形成的鏈狀多聚體。核苷酸由戊糖(核糖)、磷酸、含氮堿基三部分構(gòu)成。核酸分類:脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid,DNA)核糖核酸(ribonucleicacid,RNA)堿基:嘧啶堿:T、C、U嘌呤堿:A、G核糖:D-2-脫氧核糖(D-2-deoxyribose)D-核糖(D-ribose)3/染色體的組裝(真核生物)4/染色體組一、工作前的計(jì)劃與準(zhǔn)備
種類與數(shù)量試驗(yàn)用品的準(zhǔn)備:1、試劑盒:
基因型檢測(cè)試劑盒:反應(yīng)液/反應(yīng)酶/質(zhì)控品
血液基因組DNA提取試劑盒2、耗材:
移液器(槍):1000ul/200ul/50ul/10ul/2ul(白色長(zhǎng)尖)
吸頭(槍尖):20ul(白色長(zhǎng)尖)/200ul(黃色)/1000ul(藍(lán)色)
吸頭盒(三種規(guī)格)
熒光PCR管(長(zhǎng)且不透明、8聯(lián)排)和蓋子Eppendrof管(1.5ml)
多空板(96孔/60孔)、樣本儲(chǔ)存盒(72孔)、Marker
筆、手套3、樣本信息對(duì)照表二、試驗(yàn)樣本準(zhǔn)備:人全血基因組DNA提取
節(jié)奏與程度提取前的檢查與準(zhǔn)備:
1、檢查試劑盒各溶液,若產(chǎn)生沉淀,須在室溫放置一段時(shí)間,必要時(shí)可在37℃
水浴預(yù)熱;2、依據(jù)提取步驟,為溶液編號(hào);3、緩沖液GD和漂洗液PW
需加入適量無水乙醇;
4、剪去吸附柱的蓋子提取步驟:
1、第二次加入細(xì)胞裂解液CL(裂解紅細(xì)胞)時(shí),需要?jiǎng)×艺袷?,以充分混勻沉淀(可見管中液體深紅,并有較多泡沫,管底無結(jié)塊沉淀);
2、加入緩沖液GB后,充分顛倒混勻(如不充分,可能會(huì)產(chǎn)生白色沉淀,一般37℃放置時(shí)會(huì)消失,不影響后續(xù)試驗(yàn));
3、56℃水浴時(shí)間延長(zhǎng)至30~40min,其間顛倒混勻數(shù)次,觀察溶液是否變得清亮,并為收集管編號(hào)(如未變清亮,說明細(xì)胞裂解不徹底,可能導(dǎo)致提取DNA量少、純度不加,直接影響熒光檢測(cè));
4、水浴后加入200ul無水乙醇,出現(xiàn)絮狀沉淀,輕柔顛倒混勻(此時(shí)DNA析出,故自此步驟開始,顛倒要輕柔緩慢,否則破壞DNA結(jié)構(gòu));
5、最后向吸附膜中間位置懸空滴加100ul超純水。RT-PCR反應(yīng)體系的分裝與加樣:1、移液器的“連續(xù)吸放液”—調(diào)移液器量程至23ul,將排放按鈕按至第一停點(diǎn)(第一檔),再將吸頭垂直浸入液面,平穩(wěn)松開按鈕,在液面之下,再次將排放按鈕按至第一檔,排出吸頭尖端的氣泡后,松開按鈕,吸入液體,之后放液只需按至第一檔即是23ul(如吸頭尖端仍有氣泡,可反復(fù)吸放,直至排凈氣泡);
2、樣本放置順序、吸頭安裝順序、試驗(yàn)者感知順序三者形成“校正機(jī)制”,保障順序加樣(校正機(jī)制的建立,有助于連貫而正確地加樣);3、移液器的吸放液要“慢吸快放”,且試驗(yàn)者要觀察吸頭尖端,進(jìn)行視覺“校正”,避免吸空放空;4、放液時(shí),吸頭先伸入液面以下放出液體,再在管壁處打凈殘液(如吸頭仍存殘液,將移液器按至第二檔,將殘液打至吸頭尖端處,拔掉吸頭,并再次安裝回去,將殘液打回管中);5、不能直接用手觸摸PCR管,因?yàn)槿说氖稚虾袩晒馑?,沾染在管壁上的熒光素?huì)影響熒光儀檢測(cè)。操作時(shí)必須戴不含熒光物質(zhì)的一次性手套并且要經(jīng)常更換(應(yīng)使用鑷子夾取管子和管蓋);6、吸頭不要長(zhǎng)時(shí)間暴露于空氣中,避免氣溶膠的污染;7、加樣完成后,蓋緊蓋子,并離心;8、超凈工作臺(tái)使用后,用次氯酸鈉擦拭,避免試驗(yàn)環(huán)境污染;結(jié)果分析:分析的思路:1、基線和閾值的選擇和設(shè)置是否正確(直接與Ct值相關(guān));2、陽性和空白對(duì)照的結(jié)果是否正常(既可驗(yàn)證PCR反應(yīng)的可靠性,又可以協(xié)助判斷擴(kuò)增系統(tǒng)的可信性,空白對(duì)照的污染將導(dǎo)致結(jié)果失信。如空白對(duì)照
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