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文檔簡(jiǎn)介
酶譜法檢測(cè)血清中基質(zhì)金屬蛋白酶MMP-2和MMP-9活性綜合性設(shè)計(jì)性實(shí)驗(yàn)-2此實(shí)驗(yàn)共包括如下三個(gè)部分第一部分,電泳技術(shù)簡(jiǎn)介第二部分,酶譜法檢測(cè)血清中基質(zhì)金屬蛋白酶MMP-2和MMP-9的活性第三部分,食管癌患者血液中MMP-2和MMP-9的活性變化及其臨床意義第一部分,電泳技術(shù)簡(jiǎn)介影響泳動(dòng)率u的因素內(nèi)因:1.凈電荷:電荷愈多愈快2.粒子大?。侯w粒直徑愈小愈快3.粒子形狀:愈接近球形愈快
外因:1.V(U/L):電場(chǎng)強(qiáng)度越高電泳速度越快2.緩沖液的pH(pH恒定):PH值決定帶電顆粒的解離程度,決定物質(zhì)所帶凈電荷的多少3.離子強(qiáng)度[I]最適:0.02-0.2緩沖液的離子強(qiáng)度越高,電泳速度越慢4.電滲:液體對(duì)固體支持物的相對(duì)移動(dòng),應(yīng)盡量避免選用有電滲作用的支持物按支持介質(zhì)的不同可分為:
紙電泳(Paperelectrophorisis)
醋酸纖維薄膜電泳(CelluloseAcetateelectrophoresis)
瓊脂凝膠電泳(AgarGelelectrophoresis)聚丙烯酰胺凝膠電泳(PolyacrylamideGel-electrophoresis)
SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS,十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳法)按支持介質(zhì)形狀不同可它為:
薄層電泳板電泳柱電泳電泳設(shè)備垂直電泳系統(tǒng)聚丙烯酰胺凝膠電泳原理
聚丙烯酰胺凝膠是由單體丙烯酰胺(acrylamide,簡(jiǎn)稱Acr)和交聯(lián)劑N,N′-甲叉雙丙烯酰胺(N,N′-methylene-bisacylamide,簡(jiǎn)稱Bis)在加速劑N,N,N,N-四甲基乙二胺(N,N,N,N-tetram-ethylethylenediamine,簡(jiǎn)稱TEMED)和催化劑過(guò)硫酸銨(ammoniumpersulfate(NH4)2S2O3,簡(jiǎn)稱AP)的作用下聚合交聯(lián)成三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的凝膠,以此凝膠為支持物的電泳稱為聚丙烯酰胺凝膠電泳(polyacrylamidegelelectrophoresis,簡(jiǎn)稱PAGE)。N,N′-甲叉(亞甲基)雙丙烯酰胺催化劑
丙烯酰胺
聚丙烯酰胺聚丙烯酰胺凝膠有下列特性:在一定濃度時(shí),凝膠透明,有彈性,機(jī)械性能好;化學(xué)性能穩(wěn)定,與被分離物不起化學(xué)反應(yīng),在很多溶劑中不溶;對(duì)pH和溫度變化較穩(wěn)定;幾乎無(wú)吸附和電滲作用,只要Acr純度高,操作條件一致,則樣品分離重復(fù)性好;樣品不易擴(kuò)散,且用量少,其靈敏度可達(dá)10-6g;凝膠孔徑可調(diào)節(jié),根據(jù)被分離物的分子量選擇合適的濃度,通過(guò)改變單體及交聯(lián)劑的濃度調(diào)節(jié)凝膠的孔徑;分辨率高,尤其在不連續(xù)凝膠電泳中,集濃縮、分子篩和電荷效應(yīng)為一體。因而較醋酸纖維薄膜電泳、瓊脂糖電泳等有更高的分辨率。SDS-PAGE的原理聚丙烯酰胺凝膠電泳是網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),具有分子篩效應(yīng),蛋白質(zhì)在電泳中保持完整的狀態(tài),蛋白在其中依三種因素分開(kāi):蛋白大小,形狀和電荷。而SDS僅根據(jù)蛋白分子量亞基的不同而分離蛋白。這個(gè)技術(shù)首先是1967年由shapiro建立,他們發(fā)現(xiàn)在樣品介質(zhì)和丙烯酰胺凝膠中加入離子去污劑和強(qiáng)還原劑后,蛋白質(zhì)亞基的電泳遷移率主要取決于亞基分子量的大小,電荷因素可以忽視。SDS(SodiumDodecylSulfate)是陰離子去污劑,作為變性劑和助溶試劑,它能斷裂分子內(nèi)和分子間的氫鍵,使分子去折疊,破壞蛋白分子的二、三級(jí)結(jié)構(gòu)。而強(qiáng)還原劑如巰基乙醇,二硫蘇糖醇能使絆胱氨酸殘基間的二硫鍵斷裂。在樣品和凝膠中加入還原劑和SDS后,分子被解聚成多肽鏈,解聚后的氨基酸側(cè)鏈和SDS結(jié)合成蛋白-SDS膠束,所帶的負(fù)電荷大大超過(guò)了蛋白原有的蛋白量,這樣就消除了不同分子間的電荷差異和結(jié)構(gòu)差異。因此在電泳時(shí),蛋白質(zhì)分子的遷移速度則主要取決于蛋白質(zhì)分子大小。不同聚丙烯酰胺凝膠濃度對(duì)不同分子量的蛋白質(zhì)混合物分離能力的關(guān)系5%10%15%294566972002945669720029456697200第二部分,酶譜法檢測(cè)血清中基質(zhì)金屬蛋白酶MMP-2和MMP-9的活性腫瘤細(xì)胞的侵襲移動(dòng)CBAD腫瘤細(xì)胞侵襲是指腫瘤細(xì)胞粘附并穿越細(xì)胞外基質(zhì),包括三個(gè)重要的步驟:粘附于基膜,裂解基膜蛋白形成缺口,細(xì)胞經(jīng)缺口移動(dòng)。腫瘤細(xì)胞對(duì)周圍組織和血管的侵襲是腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵步驟。轉(zhuǎn)移的腫瘤細(xì)胞在原灶外存活和增殖,這是癌癥對(duì)人類生命的最大威脅。腫瘤細(xì)胞的侵襲是需要與細(xì)胞增殖、分化、移動(dòng)的相關(guān)基因及其表達(dá)調(diào)控模式的改變和促進(jìn)細(xì)胞移動(dòng)的外界因素兩者的共同作用。雖然腫瘤細(xì)胞侵襲的分子機(jī)制還不是十分清楚,但已發(fā)現(xiàn)許多調(diào)控細(xì)胞侵襲轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵分子及其信號(hào)通路。腫瘤細(xì)胞通過(guò)其表面受體與ECM中的各種成分粘附后激活或分泌蛋白降解酶類來(lái)降解基質(zhì),從而形成局部溶解區(qū),構(gòu)成了腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移運(yùn)行通道。一般惡性程度高的腫瘤細(xì)胞具有較強(qiáng)的蛋白水解作用,可侵蝕破壞包膜,促進(jìn)轉(zhuǎn)移。目前較為關(guān)注的酶主要是絲氨酸蛋白酶類,如纖溶酶原激活物(plasminogenactivator,PA)和金屬蛋白酶(metalproteinase,MMP)類,如膠原酶IV、基質(zhì)降解酶、透明質(zhì)酸酶。MMPs家族成員根據(jù)其在細(xì)胞中表達(dá)部位的不同,分為胞質(zhì)型和膜型兩大類。前者分布在胞質(zhì)中,后者表達(dá)在膜上。胞質(zhì)型MMPs根據(jù)其作用底物的特異性、敏感性及氨基酸序列的同源性分為三大類:(1)間質(zhì)膠原酶,包括MMP-1、MMP-5、MMP-8、MMP-13,其作用底物主要為間質(zhì)膠原,即Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅶ、Ⅹ型膠原,但不能降解明膠和Ⅳ型膠原;(2)明膠酶,包括MMP-2和MMP-9,其作用底物主要是Ⅳ型膠原和明膠,還可降解Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ型膠原,但不能降解間質(zhì)膠原;(3)間充質(zhì)溶解素,包括MMP-3、MMP-7、MMP-10和MMP-11,其作用底物主要是基質(zhì)中的蛋白多糖和糖蛋白,如纖維粘連蛋白(FN)、層粘連蛋白(LN),間充質(zhì)溶解素對(duì)膠原的作用不同于間質(zhì)膠原酶和明膠酶,它們能降解Ⅳ、Ⅴ、Ⅷ、Ⅹ型膠原酶以及Ⅰ型膠原的氨基端。通過(guò)影響細(xì)胞外基質(zhì),基質(zhì)金屬蛋白酶蛋白家族參與胚胎發(fā)育、形態(tài)發(fā)生、組織重塑等過(guò)程,并參與炎癥、腫瘤、心血管、神經(jīng)等許多疾病過(guò)程?;|(zhì)金屬蛋白酶蛋白家族MMP-2又叫明膠酶A,其蛋白主要由纖維結(jié)締組織細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞產(chǎn)生,分子量為72kDa。MMP-9又稱為明膠酶B,主要由單核細(xì)胞、巨噬細(xì)胞多形核白細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞產(chǎn)生。分子量為92kDa,是MMPs中分子量最大的酶。中性粒細(xì)胞明膠酶相關(guān)載脂蛋白(neutrophil
gelatinaseassociatedlipocalin,NGAL)是1993年Kjeldsen等人在研究MMP-9在細(xì)胞內(nèi)存在形式時(shí)發(fā)現(xiàn)的,它能夠與MMP-9聚合形成異源二聚體,保護(hù)和調(diào)節(jié)MMP-9活性,從而促進(jìn)惡變細(xì)胞的浸潤(rùn)和轉(zhuǎn)移。檢測(cè)MMP-9和MMP-2的活性,對(duì)分析腫瘤細(xì)胞惡性程度和預(yù)后提供幫助。MMP-2的結(jié)構(gòu)Pre:信號(hào)肽序列Pro:帶巰基的前肽Zn:Zn離子結(jié)合部分II:能結(jié)合膠原的II型纖維結(jié)合素結(jié)構(gòu)域H:絞鏈區(qū)Hemopexin:類血紅素蛋白結(jié)構(gòu),由四段重復(fù)序列組成,其中第一個(gè)與第四個(gè)間存在一個(gè)二硫鍵。MMP-9的結(jié)構(gòu)由三個(gè)α螺旋與5個(gè)β折疊構(gòu)成含有2個(gè)鋅離子和5個(gè)鈣離子右圖可見(jiàn)一個(gè)小分子化合物位于酶活性中心,并與一個(gè)鋅離子結(jié)合NGAL能與MMP-9以二硫鍵的方式結(jié)合,能起到保護(hù)和調(diào)節(jié)MMP-9功能的作用,所以NGAL與腫瘤的侵襲移動(dòng)有密切的聯(lián)系。汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室李恩民教授課題組以轉(zhuǎn)染有pcDNA3空白質(zhì)粒載體的SHEEC細(xì)胞為對(duì)照,酶譜法檢測(cè)結(jié)果表明,轉(zhuǎn)染有pcDNA-NGAL(-)的SHEEC細(xì)胞分泌的MMP-9和MMP-2的活性均明顯降低;而與此同時(shí),轉(zhuǎn)染有pcDNA-NGAL(+)的SHEEC細(xì)胞分泌的MMP-9和MMP-2的活性均明顯升高。表明通過(guò)有義、反義技術(shù)使NGAL基因表達(dá)發(fā)生改變可以對(duì)SHEEC細(xì)胞分泌的MMP-9和MMP-2的活性產(chǎn)生明顯影響。M:蛋白marker;1.細(xì)胞培養(yǎng)基;2.pcDNA3;3.pcDNA-NGAL(+);4.pcDNA-NGAL(-)實(shí)驗(yàn)操作樣品制備:血清、血漿和尿樣品可取適量直接與2×SDS樣品緩沖液等體積混勻進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn),如酶活性太高造成顯帶不理想,可適當(dāng)進(jìn)行稀釋;凝膠的制備:
玻璃板對(duì)齊后放入夾中垂直卡緊。按表格配10%分離膠,加入TEMED后立即搖勻即可灌膠,灌膠時(shí),可用5ml加樣槍吸取凝膠沿玻璃板加進(jìn)去,然后膠上加一層異丙醇,以隔離空氣中的氧,促進(jìn)凝膠聚合(灌膠時(shí)開(kāi)始可快一些,膠面快到所需高度時(shí)要放慢速度。操作時(shí)凝膠一定要沿玻璃板流下,這樣膠中才不會(huì)有氣泡)。約幾分鐘后當(dāng)異丙醇和膠之間有一條折射線時(shí),說(shuō)明膠已凝了,再等3min使膠充分凝固就可倒去膠上層水并用吸水紙將水吸干。按前面表格配4%的濃縮膠,加入TEMED后立即搖勻即可灌膠。將剩余空間灌滿濃縮膠,然后將梳子插入濃縮膠中。灌膠時(shí)也要使膠沿玻璃板流下以免膠中有氣泡產(chǎn)生。插梳子時(shí)要使梳子保持水平。待到濃縮膠凝固后,兩手分別捏住梳子的兩邊豎直向上輕輕將其拔出;在每個(gè)加樣孔中加入10μl樣品;電泳:在4℃100V下,約2h;凝膠的處理:(1)電泳結(jié)束后,取下凝膠,放入平皿中,用洗滌緩沖液在室溫?fù)u動(dòng)下洗滌1h,其間換液一次;(2)棄去洗滌緩沖液,然后加入孵育緩沖液沒(méi)過(guò)膠面,至37℃恒溫箱中,24h后取出;(3)棄去孵育緩沖液,加入0.1%考馬斯亮藍(lán)染液染色約30min
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