生物數(shù)據(jù)庫的學(xué)習(xí)資料

生物數(shù)據(jù)庫的學(xué)習(xí)資料第1頁/共132頁生物信息學(xué)與功能基因組學(xué)

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/131第2頁/共132頁面對堆積如山的生物學(xué)數(shù)據(jù)3

/131第3頁/共132頁主要內(nèi)容一、分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫簡介二、NCBI（Entrez）簡介子數(shù)據(jù)庫，數(shù)據(jù)格式，數(shù)據(jù)檢索，工具軟件4

/131第4頁/共132頁

思考題：根據(jù)自己的知識和經(jīng)驗(yàn)，你認(rèn)為網(wǎng)上應(yīng)該會有哪些分子生物學(xué)的數(shù)據(jù)庫？數(shù)據(jù)庫中應(yīng)該存放哪些數(shù)據(jù)？應(yīng)該提供什么類型的數(shù)據(jù)處理服務(wù)。以下是一些關(guān)鍵詞：DNA，RNA，Protein，Genome，物種，文獻(xiàn)，疾病，結(jié)構(gòu)，蛋白質(zhì)家族，Gene，染色體。。。5

/131第5頁/共132頁一、分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫各自按照一定的目標(biāo)收集和整理實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，并提供相關(guān)的數(shù)據(jù)查詢、數(shù)據(jù)處理的服務(wù)，并大多提供網(wǎng)絡(luò)服務(wù)。建立生物分子數(shù)據(jù)庫生物分子數(shù)據(jù)高速增長（HGP）分子生物學(xué)及其相關(guān)領(lǐng)域研究人員需要迅速獲得最新實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)6

/131第6頁/共132頁生物數(shù)據(jù)分類生物信息數(shù)據(jù)庫種類繁多，就目前來看，大體可以分為四個大類：1.基因組數(shù)據(jù)庫；2.核酸和蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)序列數(shù)據(jù)庫；3.生物大分子（主要是蛋白質(zhì)）

三維空間結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫；4.根據(jù)以上三類數(shù)據(jù)庫和文獻(xiàn)資料為基礎(chǔ)構(gòu)建的二次數(shù)據(jù)庫。也稱專門數(shù)據(jù)庫、專業(yè)數(shù)據(jù)庫或?qū)Ｓ脭?shù)據(jù)庫。一次數(shù)據(jù)庫7

/131第7頁/共132頁生物分子信息生物分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)生物分子功能數(shù)據(jù)最基本直觀復(fù)雜核酸序列數(shù)據(jù)生物分子數(shù)據(jù)類型蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)8

/131第8頁/共132頁生物學(xué)數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計(jì)《NucleicAcidsResearch》雜志每年的第一期中詳細(xì)介紹最新版本的各種數(shù)據(jù)庫。/

/nar/database/c/

9

/131第9頁/共132頁1核酸序列數(shù)據(jù)庫2.RNA序列數(shù)據(jù)庫3.蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫4.結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫5.基因組數(shù)據(jù)庫（非脊椎動物）6.代謝酶相關(guān)產(chǎn)物7.人類和其他脊椎動物基因組8.人類基因和疾病9.其他數(shù)據(jù)和其他基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫10.蛋白組資源11.其他分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫12.細(xì)胞器官數(shù)據(jù)庫13.植物數(shù)據(jù)庫14.免疫學(xué)數(shù)據(jù)庫10

/131第10頁/共132頁核酸序列數(shù)據(jù)庫國際上著名的一級核酸數(shù)據(jù)庫（1）美國生物技術(shù)信息中心的GenBank/（2）歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的EMBL/（3）日本遺傳研究所的DDBJhttp://www.ddbj.nig.ac.jp/11

/131第11頁/共132頁數(shù)據(jù)相同GenBank數(shù)據(jù)庫每天與歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的核酸序列數(shù)據(jù)庫（EuropeanMolecularBiologyLaboratoryNucleotideSequenceDatabase，EMBL）和日本的DNA數(shù)據(jù)庫（DNADataBankofJapanDDBJ）進(jìn)行數(shù)據(jù)交換，以保證數(shù)據(jù)庫內(nèi)容在全世界范圍的同步性。12

/131第12頁/共132頁特殊類型核酸序列數(shù)據(jù)庫：非編碼RNA數(shù)據(jù)庫（ncRNA）；表達(dá)序列標(biāo)簽數(shù)據(jù)庫（dbEST）；序列標(biāo)簽位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫（dbSTS）；miRBase；tRNAdb等。13

/131第13頁/共132頁基因組相關(guān)數(shù)據(jù)庫：人類基因組數(shù)據(jù)庫（HGD）；基因組序列數(shù)據(jù)庫（GSDB）；基因組在線數(shù)據(jù)庫（GOLD）等。14

/131第14頁/共132頁核酸三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫：核苷酸三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫（NDB）；普納大學(xué)核酸結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫（BNASDB）等。15

/131第15頁/共132頁基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫：基因表達(dá)庫（GEO）；斯坦福微陣列數(shù)據(jù)庫（SMD）；ArrayExpress；CGED；GXD；BodyMap等。16

/131第16頁/共132頁人類基因突變及疾病相關(guān)數(shù)據(jù)庫：人類基因變異數(shù)據(jù)庫（HMGD）、人類遺傳雙等位基因序列數(shù)據(jù)庫（HGBASE）、人類孟德爾遺傳在線（OMIM）、國際單體型計(jì)劃（HapMap）、人類單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫（dbSNP）、腫瘤基因數(shù)據(jù)庫（TGDB）、疾病關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫（GAD）、癌癥基因數(shù)據(jù)庫（CGAP）、人類表觀遺傳數(shù)據(jù)庫（HEP）、人類DNA甲基化與癌癥數(shù)據(jù)庫（MethylCancer）等。17

/131第17頁/共132頁蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫隨著分子生物學(xué)的發(fā)展，人們獲得了越來越多關(guān)于蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)和功能的信息。世界各國的生物學(xué)家和計(jì)算機(jī)科學(xué)家合作利用這些信息構(gòu)建了蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫、蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫（二維凝膠電泳數(shù)據(jù)庫）、信號傳導(dǎo)及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用相關(guān)數(shù)據(jù)庫、DNA和蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫等蛋白質(zhì)相關(guān)數(shù)據(jù)庫。18

/131第18頁/共132頁常用的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫：PIRMIPSSwiss-ProtUniProt19

/131第19頁/共132頁蛋白質(zhì)功能、結(jié)構(gòu)域和蛋白質(zhì)家族有關(guān)的數(shù)據(jù)庫：PROSITEInterProPfamProDomSMART等20

/131第20頁/共132頁蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)相關(guān)數(shù)據(jù)庫：PDBBioMagResBankSWISS-MODELRepositoryModBaseCATHSCOPReLiBaseTOPSSWISS-3DIMAGEBioImage等21

/131第21頁/共132頁蛋白質(zhì)二維凝膠電泳數(shù)據(jù)庫：WORLD-2DPAGEPhoretixlinks22

/131第22頁/共132頁信號傳導(dǎo)及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用相關(guān)數(shù)據(jù)庫：DIPINTERACTProNetKEGGCANSITESPADCSNDB等23

/131第23頁/共132頁DNA和蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫：DPInteract蛋白質(zhì)翻譯后修飾相關(guān)數(shù)據(jù)庫：O-GlycBase、PhosphoBase、RES蛋白質(zhì)等蛋白質(zhì)24

/131第24頁/共132頁UniProt-通用蛋白質(zhì)資源庫（/）是存儲和鏈接其他蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫的資源庫，并且是蛋白質(zhì)序列和具有綜合功能注釋目錄的中心資源庫。使用UniprotKB可以檢索準(zhǔn)確、可靠的蛋白綜合信息。使用UniRef可以減少冗余，加速序列相似性搜索。使用UniParc可以檢索存檔序列和它們來源的數(shù)據(jù)庫。25

/131第25頁/共132頁

（蛋白數(shù)據(jù)庫）26

/131第26頁/共132頁MIPS數(shù)據(jù)庫慕尼黑蛋白質(zhì)序列信息中心（MIPS）（http://www.helmholtz-muenchen.de/en/ibis），它的重點(diǎn)工作是基因組生物信息學(xué)，特別注重基因組信息系統(tǒng)分析，包括應(yīng)用生物信息學(xué)方法注釋基因組、表達(dá)分析和蛋白質(zhì)組學(xué)方面研究。MIPS支持和維護(hù)一系列基因組數(shù)據(jù)庫以及系統(tǒng)，可以提供細(xì)菌、真菌和植物基因組比較分析服務(wù)。在該站點(diǎn)提供基因組分析工具、數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng)、表達(dá)分析、蛋白相互作用等網(wǎng)絡(luò)服務(wù)。27

/131第27頁/共132頁http://www.helmholtz-muenchen.de/en/ibis28

/131第28頁/共132頁其他重要的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫：PRINTSPfam29

/131第29頁/共132頁P(yáng)RINTSPRINTS（http://www.bioinf.manchester.ac.uk/dbbrowser/PRINTS/index.php）是蛋白基序指紋圖綜合數(shù)據(jù)庫，每個指紋圖都是使用數(shù)據(jù)掃描程序ADSP或VISTAS序列分析軟件包反復(fù)優(yōu)化后定義的。數(shù)據(jù)庫中有兩種類型指紋圖，根據(jù)指紋圖的復(fù)雜性分為簡單和復(fù)合指紋圖：簡單指紋圖基本上是單一的基序，而復(fù)合指紋圖包含多個基序。30

/131第30頁/共132頁P(yáng)fam蛋白質(zhì)一般是由一個或多個功能區(qū)域組成，這些功能區(qū)域通常稱作域（domain）。在不同的蛋白質(zhì)中不同的域以不同的組合出現(xiàn)，導(dǎo)致在自然界發(fā)現(xiàn)多種多樣組成成分的蛋白質(zhì)。識別出現(xiàn)在蛋白質(zhì)中的域可以了解蛋白質(zhì)的功能。Pfam數(shù)據(jù)庫（http://pfam.sanger.ac.uk/）是一個大的蛋白質(zhì)域家族集合，每個家族是用多序列比對和隱馬模型（HMMs）分析結(jié)果的代表。31

/131第31頁/共132頁/

（結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫）

32

/131第32頁/共132頁/index.html33

/131第33頁/共132頁ENSEMBL簡介ENSEMBL旨在開發(fā)一種能夠?qū)φ婧松锘蚪M進(jìn)行自動詮釋(automaticannotation)并加以維護(hù)的軟件。該計(jì)劃由英國Sanger研究所Wellcome基金會及歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室（EMBL）所屬分部歐洲生物信息學(xué)研究所（EBI）共同協(xié)作運(yùn)營。該計(jì)劃開放所有源信息，所有由該計(jì)劃所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)及軟件都可以免費(fèi)及自由地從網(wǎng)絡(luò)上獲取并使用。該計(jì)劃所開發(fā)并使用的大部分軟件是用Perl語言編寫的，并基于BiopPerl的基礎(chǔ)框架。其他基因組計(jì)劃亦可輕易使用Perl語言的應(yīng)用程序接口(Applicationprogramminginterface，API)。34

/131第34頁/共132頁http://www.geneo/biologicalprocess生物過程molecularfunction分子功能cellularcomponent細(xì)胞組分。35

/131第35頁/共132頁NationalCenterforBiotechnologyInformation(NCBI)二、NCBI子數(shù)據(jù)庫，數(shù)據(jù)格式，數(shù)據(jù)檢索，工具軟件。36

/131第36頁/共132頁NCBI美國國家生物技術(shù)信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBI）

NCBI成立于1988年，其主要工作是開發(fā)以GenBank為代表的數(shù)據(jù)庫，進(jìn)行計(jì)算生物學(xué)研究，開發(fā)用于分析基因組數(shù)據(jù)的軟件工具，發(fā)布生物醫(yī)學(xué)信息。Entrez是NCBI著名的用于提取序列信息的工具，它將科學(xué)文獻(xiàn)、DNA和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)、種群研究數(shù)據(jù)以及全基因組組裝數(shù)據(jù)整合成一個高度集成的系統(tǒng)。類似于EBI的SRS，是一個查詢、提取和顯示系統(tǒng)。37

/131第37頁/共132頁首頁38

/131第38頁/共132頁學(xué)習(xí)利用NCBI/books/bv.fcgi?rid=handbook39

/131第39頁/共132頁sitemap【舊版本】40

/131第40頁/共132頁第一個子數(shù)據(jù)庫GenBank介紹/genbank41

/131第41頁/共132頁簡介GenBank

?

istheNIH（美國國立衛(wèi)生研究院）geneticsequencedatabase,anannotatedcollectionofallpubliclyavailableDNAsequences(

NucleicAcidsResearch,2011Jan;39(Databaseissue):D32-7

).Thereareapproximately126,551,501,141basesin135,440,924sequencerecordsinthetraditionalGenBankdivisionsand191,401,393,188basesin62,715,288sequencerecordsintheWGSdivisionasofApril2011.Thecomplete

releasenotes

forthecurrentversionofGenBankareavailableontheNCBIftpsite.Anewreleaseismadeeverytwomonths.GenBankispartofthe

InternationalNucleotideSequenceDatabaseCollaboration

,whichcomprisestheDNADataBankofJapan(DDBJ),theEuropeanMolecularBiologyLaboratory(EMBL),andGenBankatNCBI.Thesethreeorganizationsexchangedataonadailybasis.42

/131第42頁/共132頁GenBank簡介GenBank是一個綜合數(shù)據(jù)庫，該數(shù)據(jù)庫中包含了已經(jīng)公開的30萬余種不同物種生物的核酸序列，這些數(shù)據(jù)主要來源于全世界不同實(shí)驗(yàn)室和大規(guī)模測序計(jì)劃項(xiàng)目。由美國國家醫(yī)學(xué)圖書館的國家生物技術(shù)信息中心構(gòu)建、維護(hù)和管理。該中心位于美國馬里蘭國家健康研究所（NIH）。GenBank數(shù)據(jù)庫的序列數(shù)據(jù)來源于序列發(fā)現(xiàn)者提交的序列、批量提交的表達(dá)序列標(biāo)簽（expressedsequencetag,EST）、基因組測序序列（genomesurveysequence,GSS）和其他測序中心提供的高通量數(shù)據(jù)，還包括美國專利商標(biāo)局提供的已發(fā)表專利的序列數(shù)據(jù)。43

/131第43頁/共132頁統(tǒng)計(jì)（/genbank/statistics

）44

/131第44頁/共132頁45

/131第45頁/共132頁/genbank/gbrel.txt46

/131第46頁/共132頁數(shù)椐庫訪問示例視黃醇結(jié)合蛋白RBP4（retinol-bindingprotein）一種大量分泌的、小體積的蛋白，能結(jié)合血液中的視黃醇（維生素A）。視黃醇可從胡羅卜中以維生素A的形式獲得，疏水程度大。RBP4幫助轉(zhuǎn)運(yùn)這個配體到眼睛為視覺系統(tǒng)所用。47

/131第47頁/共132頁數(shù)據(jù)庫檢索工具集成檢索系統(tǒng)：Entrez48

/131第48頁/共132頁Entrez1991年由美國生物信息技術(shù)中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBI）（）開發(fā)。EricW.Sayers.DatabaseresourcesoftheNationalCenterforBiotechnologyInformation.NucleicAcidsResearch,2010,Vol.38,DatabaseissueD5-D1649

/131第49頁/共132頁50

/131第50頁/共132頁http://www.ebi.ac.uk/Tools/51

/131第51頁/共132頁SRSSRSisapowerfuldataintegrationplatform,providingrapid,easyanduserfriendlyaccesstothelargevolumesofdiverseandheterogeneousLifeSciencedatastoredinmorethan400internalandpublicdomaindatabases...more

52

/131第52頁/共132頁FromtheNCBIhomepage,type“rbp4”andhit“Search”53

/131第53頁/共132頁54

/131第54頁/共132頁55

/131第55頁/共132頁56

/131第56頁/共132頁圖形顯示57

/131第57頁/共132頁數(shù)據(jù)庫格式思考題：如果從數(shù)據(jù)庫里面得到一個序列，你希望能得到些什么樣的附加信息？以什么樣的格式提供？所謂格式是對信息描述的統(tǒng)一規(guī)范，規(guī)范的格式為數(shù)據(jù)的收集、整理、交流和應(yīng)用提供了方便。58

/131第58頁/共132頁1，F(xiàn)ASTA（pearson）式FASTA格式是記錄序列最簡單的一種格式，將一個DNA或者蛋白質(zhì)序列表示為一個帶有一些標(biāo)記的核苷酸或氨基酸字符串。/blast/fasta.shtml59

/131第59頁/共132頁FASTA格式的一個例子“>”開始的單行：該序列的一些基本信息。后面是分行的序列數(shù)據(jù)特點(diǎn)：具有極大的可讀性，F(xiàn)ASTA格式在許多分子生物學(xué)軟件包中得到了廣泛的應(yīng)用。60

/131第60頁/共132頁2，GBFF（GenBankflatfile）格式/Sitemap/samplerecord.html頭部：包含整個記錄的信息61

/131第61頁/共132頁/entrez/viewer.fcgi?db=nuccore&id/p>

/131第62頁/共132頁locusname長度分子類型分類碼修改時間63

/131第63頁/共132頁GenBank分類碼64

/131第64頁/共132頁DEFINITION行該行主要對GenBank記錄所包含的生物學(xué)意義作出總結(jié)。65

/131第65頁/共132頁檢索號登錄號或檢索號66

/131第66頁/共132頁/Sequin/acc.html

67

/131第67頁/共132頁VERSION在數(shù)據(jù)庫中，如果某條序列數(shù)據(jù)發(fā)生了變化，即使是單堿基的改變，它的版本號也將增加，同時得到一個新的GI號，而檢索號保持不變。68

/131第68頁/共132頁GISequenceidentificationnumber69

/131第69頁/共132頁關(guān)鍵詞70

/131第70頁/共132頁SOURCE71

/131第71頁/共132頁Reference72

/131第72頁/共132頁

73

/131第73頁/共132頁第二部分：FEATURES（特性表）它描述基因和基因產(chǎn)物以及與序列相關(guān)的生物學(xué)特性。74

/131第74頁/共132頁FEATURES這一部分描述基因和基因產(chǎn)物以及與序列相關(guān)的生物學(xué)特性。特性表格式是按表單的方式設(shè)計(jì)的，包含3個主要部分。第一，特性關(guān)鍵詞；第二，特性位置；第三，限定詞，相關(guān)特性的輔助信息，限定詞使用一組標(biāo)準(zhǔn)化的對照詞匯表以利于計(jì)算機(jī)從中提取信息。75

/131第75頁/共132頁FEATURESTheformatdesignisbasedonatabularapproachandconsistsofthefollowingitems:Featurekey

asinglewordorabbreviationindicatingfunctionalgroup

LocationinstructionsforfindingthefeatureQualifiersauxiliaryinformationaboutafeature76

/131第76頁/共132頁特性表/projects/collab/FT/index.htmlKey

Location/QualifiersCDS

join(544..589,688..>1032)

/product="T-cellreceptorbeta-chain”whichmightbereadas:Thisfeature,whichisapartialcodingsequence,

isformedbyjoiningelementsindicatedtoformonecontiguoussequenceencodingaproductcalledT-cellreceptorbeta-chain.77

/131第77頁/共132頁

第三部分：序列78

/131第78頁/共132頁其他子數(shù)據(jù)庫介紹79

/131第79頁/共132頁/RefSeq/80

/131第80頁/共132頁參考序列數(shù)據(jù)庫NCBIReferenceSequencesTheReferenceSequence(RefSeq)collectionaimstoprovideacomprehensive,integrated,non-redundant,well-annotatedsetofsequences,includinggenomicDNA,transcripts,andproteins.RefSeqisafoundationformedical,functional,anddiversitystudies;theyprovideastablereferenceforgenomeannotation,geneidentificationandcharacterization,mutationandpolymorphismanalysis(especiallyRefSeqGenerecords),expressionstudies,andcomparativeanalyses.[more...]81

/131第81頁/共132頁參考序列82

/131第82頁/共132頁UniGene:uniquegenesviaESTsFindUniGeneatNCBI:/UniGeneUniGene（uniquegene）項(xiàng)目的目標(biāo)是為每一個基因創(chuàng)造一個唯一的條目，然后收集對應(yīng)于這個基因的所有EST（表達(dá)序列標(biāo)簽）。EST來源于一定環(huán)境下一個組織總mRNA所構(gòu)建的cDNA文庫，一個EST代表一個完整基因的一小部分。83

/131第83頁/共132頁ClustersizesinUniGeneThisisagenewith1ESTassociated;theclustersizeis184

/131第84頁/共132頁ClustersizesinUniGeneThisisagenewith10ESTsassociated;theclustersizeis1085

/131第85頁/共132頁ClustersizesinUniGene(human)Clustersize(ESTs)

Numberofclusters 1

42,800 2 6,500 3-4 6,500 5-8 5,400 9-16 4,100 17-32 3,300

500-1000 2,128

2000-4000 233

8000-16,000 21

16,000-30,000 886

/131第86頁/共132頁/unigene/statistics/87

/131第87頁/共132頁/unigene/statistics/88

/131第88頁/共132頁RBP4UniGeneNucleotideProteinPubMed視黃醇結(jié)合蛋白RBP4：retinolbindingprotein4。89

/131第89頁/共132頁90

/131第90頁/共132頁頂端部分91

/131第91頁/共132頁中間部分92

/131第92頁/共132頁底端部分93

/131第93頁/共132頁94

/131第94頁/共132頁95

/131第95頁/共132頁96

/131第96頁/共132頁97

/131第97頁/共132頁98

/131第98頁/共132頁檢索的一個例子（案例1）許多細(xì)菌在與抗生素的對抗中發(fā)展出多種能力從而使抗生素失效，其中一個例子就是結(jié)核桿菌（mycobacteriumtuberculosis），很多結(jié)核桿菌株都進(jìn)化出了青霉素抗性，那么具有青霉素抗性的結(jié)核桿菌編碼青霉素結(jié)合蛋白的基因在其基因組中是否發(fā)生了改變呢？99

/131第99頁/共132頁

選擇數(shù)據(jù)庫Penicillin-binding100

/131第100頁/共132頁Entrez101

/131第101頁/共132頁20090601搜索結(jié)果102

/131第102頁/共132頁103

/131第103頁/共132頁網(wǎng)頁右邊部分104

/131第104頁/共132頁限定物種中檢索Mycobacteriumtuberculosis105

/131第105頁/共132頁結(jié)果106

/131第106頁/共132頁107

/131第107頁/共132頁交集108

/131第108頁/共132頁舊數(shù)據(jù)109

/131第109頁/共132頁組合檢索“Mycobacteriumtuberculosis”[ORGN]AND“penicillin-binding”110

/131第110頁/共132頁20090601搜索結(jié)果111

/131第111頁/共132頁/sites/batchentrez112

/131第112頁/共132頁/genomes/FLU/FLU.html

113

/131第113頁/共132頁114

/131第114頁/共132頁115

/131第115頁/共132頁116

/131第116頁/共132頁課后練習(xí)通過流感病毒資源庫了解H1N1病毒。117

/131第117頁/共132頁其他重要數(shù)據(jù)