高級(jí)微生物第一次課

高級(jí)微生物第一次課高級(jí)微生物第一次課第1頁聯(lián)絡(luò)方式：/kech/jycz/index.htmTel:87283455(office)87281510(home)E-mail:m98sun@孫明高級(jí)微生物第一次課第2頁華中農(nóng)業(yè)大學(xué)微生物學(xué)國家重點(diǎn)學(xué)科高級(jí)微生物第一次課第3頁中科院院士陳華癸教授等老一輩科學(xué)家創(chuàng)建自上世紀(jì)40年代初到如今經(jīng)歷了四代老師連續(xù)創(chuàng)業(yè)和建設(shè)發(fā)展微生物學(xué)學(xué)科奠基人之一中國科學(xué)院院士陳華癸教授1953年指導(dǎo)學(xué)生實(shí)習(xí)80年代輔導(dǎo)學(xué)生一、學(xué)科創(chuàng)建高級(jí)微生物第一次課第4頁二、微生物學(xué)國家重點(diǎn)學(xué)科發(fā)展歷程20世紀(jì)40年代初創(chuàng)建1953年招收第一屆土壤微生物學(xué)3年制碩士1972年創(chuàng)辦農(nóng)業(yè)微生物學(xué)專業(yè)，招收本專科學(xué)生1977年微生物學(xué)本科專業(yè)招生1981年被國務(wù)院學(xué)位辦同意為博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)1989、、年三次被評(píng)為國家重點(diǎn)學(xué)科1994年從土化系轉(zhuǎn)移到生科院（覆蓋多院系）高級(jí)微生物第一次課第5頁三、學(xué)科師資隊(duì)伍老師41人其中教授19人，副教授14人含有博士學(xué)位32人,占78％45歲及以下老師31人，占76％高級(jí)微生物第一次課第6頁依據(jù)國家科技發(fā)展方針，圍繞國家發(fā)展戰(zhàn)略目標(biāo)，針對(duì)學(xué)科發(fā)展前沿和國民經(jīng)濟(jì)、社會(huì)發(fā)展及國家安全重大科技問題，以農(nóng)業(yè)有益微生物利用和有害微生物防治為主要研究內(nèi)容，深入開展農(nóng)業(yè)微生物學(xué)應(yīng)用基礎(chǔ)研究，并向基礎(chǔ)研究和應(yīng)用開發(fā)兩個(gè)方面延伸（一）總體定位獲取原始創(chuàng)新和含有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)科研結(jié)果，建立和發(fā)展農(nóng)業(yè)微生物學(xué)新理論、新技術(shù)和新方法，為我國農(nóng)業(yè)可連續(xù)性發(fā)展提供新產(chǎn)品和新材料（二）主要研究目標(biāo)四、總體定位和研究方向高級(jí)微生物第一次課第7頁（三）主要研究方向生物固氮與菌植互作微生物農(nóng)藥農(nóng)業(yè)環(huán)境微生物微生物功效基因組與蛋白質(zhì)組應(yīng)用微生物和發(fā)酵工程高級(jí)微生物第一次課第8頁

1.生物固氮與菌植互作以根瘤菌、藍(lán)細(xì)菌、菌根真菌等為主要研究對(duì)象，開展資源調(diào)查、分類、分子互作機(jī)理、功效基因組、重組微生物等研究以及其它植物有益微生物開發(fā)應(yīng)用主要學(xué)術(shù)帶頭人趙開弘張忠明高級(jí)微生物第一次課第9頁AngewChemIntEd()

IF11.8

ProcNatlAcadSci()

IF9.6

JAmChemSoc()

IF8.5JBiolChem()

IF5.3

MolMicrobiol

()

IF5.6Plant

Physiology

(,,)

IF6.2NewPhytologist() IF6.0發(fā)覺了4個(gè)光合藻膽色素生物轉(zhuǎn)化、藻膽蛋白12個(gè)位點(diǎn)色素化、3種藻膽蛋白裂合酶，對(duì)光合作用捕光及元件設(shè)計(jì)有重大意義創(chuàng)造了基因編碼光控開關(guān)熒光藻膽蛋白，會(huì)像綠色熒光蛋白發(fā)揮主要作用分析了魚腥藍(lán)細(xì)菌周質(zhì)空間調(diào)整碳氮運(yùn)輸、蛋白激酶調(diào)控異形胞發(fā)育根瘤菌類菌體分化與共生固氮基因功效研究，豆科植物調(diào)控根瘤形成和發(fā)育分子機(jī)理高級(jí)微生物第一次課第10頁2.微生物農(nóng)藥以蘇云金芽胞桿菌、鏈霉菌等為主要研究對(duì)象，從菌種資源、新基因克隆、功效基因組學(xué)、代謝調(diào)控、殺蟲抗病機(jī)理、殺蟲抗病重組菌構(gòu)建與應(yīng)用等方面開展研究孫明何璟喻子牛主要學(xué)術(shù)帶頭人高級(jí)微生物第一次課第11頁JBioChem() IF5.3JBacteriol

(,,,,,,) IF3.9AppEnvironMicrobiol(,) IF

3.7PloSOne(,) IF

4.4AntimicrobAgentsChemother(,) IF

4.8EnvironMicrobiol() IF

5.5MolPlant-MicrobeInteract() IF

4.4BMCGenomics() IF4.0Proteomics() IF4.4繪制了4個(gè)菌株基因組完成圖或精細(xì)圖以及20個(gè)菌株基因組草圖分離到了6個(gè)I級(jí)新型殺蟲晶體蛋白基因,占近5年國際上三分之一克隆到蘇云金素和ZwA兩個(gè)殺蟲素基因簇推導(dǎo)并驗(yàn)證了其合成路徑發(fā)覺YBT-1520菌株中質(zhì)粒DNA含量可達(dá)染色體DNA含量1.6倍發(fā)覺多個(gè)抗生素合成全局性調(diào)控基因,能提升各種抗生素產(chǎn)量，并激活緘默抗生素合成高級(jí)微生物第一次課第12頁以土壤重金屬和廢棄物轉(zhuǎn)化、污水治理相關(guān)微生物和極端環(huán)境微生物等為研究對(duì)象，研究其代謝路徑和適應(yīng)環(huán)境機(jī)理，發(fā)掘和利用抗重金屬、抗有毒物質(zhì)污染微生物資源，重點(diǎn)處理農(nóng)業(yè)面污染難題。3.農(nóng)業(yè)環(huán)境微生物王革嬌主要學(xué)術(shù)帶頭人黃巧云杰青，長江學(xué)者，全國百篇優(yōu)博高級(jí)微生物第一次課第13頁MolMicrobiol() IF

5.6

4.8JBacteriol() IF

3.9

ApplEnvironMicrobiol() IF

3.7Microbiology(,) IF

3.0BMCMicrobiology() IF2.8BiochemSocTrans(,) IF

3.3Extremephiles() IF2.0JHazardMater

(,) IF4.1超嗜熱古菌DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制研究:發(fā)覺了多個(gè)古菌在Cdc6復(fù)制起始蛋白相互作用并協(xié)同識(shí)別復(fù)制原點(diǎn);判定了古菌蛋白激酶及其磷酸化底物砷細(xì)菌轉(zhuǎn)化機(jī)理與砷污染微生物修復(fù):發(fā)覺細(xì)菌砷氧化受砷感應(yīng)多信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和群體密度感應(yīng)信號(hào)路徑調(diào)控土壤與DNA、細(xì)菌相互作用與機(jī)制研究:發(fā)覺低量粘土礦物可促進(jìn)細(xì)菌代謝，但高量粘土礦物能顯著抑制細(xì)菌活性高級(jí)微生物第一次課第14頁主要針對(duì)農(nóng)業(yè)微生物領(lǐng)域中最主要模式微生物如結(jié)核分枝桿菌、固氮藍(lán)細(xì)菌、古菌和鏈霉菌等功效基因組和蛋白質(zhì)組開展系統(tǒng)研究，揭示關(guān)鍵代謝路徑和關(guān)鍵酶結(jié)構(gòu)與功效，處理農(nóng)業(yè)領(lǐng)域基礎(chǔ)科學(xué)及應(yīng)用基礎(chǔ)科學(xué)根本問題。4.微生物功效基因組與蛋白質(zhì)組何正國杰青主要學(xué)術(shù)帶頭人陳玲玲高級(jí)微生物第一次課第15頁P(yáng)rocNatlAcadSciUSA

()

IF

9.6GenomeResearch()

IF

11.3JBacteriol()

IF3.9

JProteomeRes(，) IF5.1

NucleicAcidsResearch() IF7.4

PloSOne() IF4.3BMCGenomics()

IF

4創(chuàng)建了結(jié)核桿菌基因網(wǎng)絡(luò)研究新技術(shù)，率先繪制了全局性蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)，發(fā)覺了新抗原基因和主要調(diào)控因子，揭示了細(xì)菌生長調(diào)控新機(jī)制這些研究加深了對(duì)結(jié)核桿菌基因調(diào)控機(jī)制以及致病機(jī)理了解，同時(shí)為抗結(jié)核新藥靶標(biāo)發(fā)覺提供了新思緒高級(jí)微生物第一次課第16頁5.應(yīng)用微生物和發(fā)酵工程主要針對(duì)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和服務(wù)中問題，利用微生物開發(fā)相關(guān)產(chǎn)品，經(jīng)過研發(fā)微生物肥料、飼料、農(nóng)藥，以及環(huán)境修復(fù)和保護(hù)制劑等處理農(nóng)業(yè)領(lǐng)域基礎(chǔ)科學(xué)及應(yīng)用基礎(chǔ)科學(xué)問題。陳守文梁運(yùn)祥主要學(xué)術(shù)帶頭人高級(jí)微生物第一次課第17頁“十一五”期間負(fù)擔(dān)科研項(xiàng)目(競爭性)139項(xiàng)，到帳經(jīng)費(fèi)5100萬元，總經(jīng)費(fèi)累計(jì)8100萬元五、科學(xué)研究9739項(xiàng)8636項(xiàng)轉(zhuǎn)基因?qū)ｎ}4項(xiàng)國家科技支撐計(jì)劃3項(xiàng)國家自然科學(xué)基金48項(xiàng)(2杰青，2重點(diǎn)，1國際合作)9482項(xiàng)其它省部/國際67項(xiàng)高級(jí)微生物第一次課第18頁六、微生物學(xué)國家重點(diǎn)學(xué)科科研基地1990“農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)微生物重點(diǎn)開放試驗(yàn)室”1992“農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)微生物研究所”“微生物農(nóng)藥國家工程研究中心”和

“農(nóng)業(yè)部微生物產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)測(cè)試中心”

農(nóng)業(yè)微生物教育部重點(diǎn)開放試驗(yàn)室

“農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國家重點(diǎn)試驗(yàn)室”

高級(jí)微生物第一次課第19頁1996、1999、年連續(xù)3輪參加農(nóng)業(yè)部組織重點(diǎn)開放試驗(yàn)室評(píng)定，3次均被評(píng)為農(nóng)業(yè)部優(yōu)異重點(diǎn)開放試驗(yàn)室1996、、，年連續(xù)4輪參加國家組織重點(diǎn)試驗(yàn)室評(píng)定高級(jí)微生物第一次課第20頁生物固氮與菌植互作微生物農(nóng)藥植物病原微生物農(nóng)業(yè)環(huán)境微生物微生物功效基因組與蛋白質(zhì)組應(yīng)用微生物和發(fā)酵工程動(dòng)物病原微生物微生物學(xué)科和農(nóng)業(yè)微生物國家重點(diǎn)試驗(yàn)室交叉高級(jí)微生物第一次課第21頁七、人才培養(yǎng)基地形成了本科、碩士、博士和博士后完整人才培養(yǎng)體系生物學(xué)一級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)生物學(xué)博士后流動(dòng)站“國家生物學(xué)基礎(chǔ)科學(xué)研究與教學(xué)人才培養(yǎng)基地”(連續(xù)兩次被國家評(píng)定為優(yōu)異)“國家生命科學(xué)與技術(shù)人才培養(yǎng)基地”(連續(xù)三年教育部年檢為優(yōu)異)國家級(jí)生物學(xué)試驗(yàn)教學(xué)示范中心（）高級(jí)微生物第一次課第22頁1.國家精品課程微生物學(xué)趙斌教授（湖北省教學(xué)名師）

基因操作原理孫明教授2.多年來出版教材微生物生物學(xué) 周俊初（主編）

科學(xué)出版社微生物基因組 喻子牛（主編）

科學(xué)出版社釀造學(xué)葛向陽（主編）

高等教育出版社基因工程 孫明（主編）

高等教育出版社微生物學(xué)(第六版)李阜棣胡正嘉

中國農(nóng)業(yè)出版社微生物學(xué)試驗(yàn) 陳雯莉（主編）

中國農(nóng)業(yè)出版社酶工程陳守文（主編）

科學(xué)出版社微生物學(xué)趙斌（主編）高等教育出版社高級(jí)微生物第一次課第23頁八、碩士培養(yǎng)1953年招收第一屆土壤微生物學(xué)3年制碩士1981年被國務(wù)院學(xué)位辦同意為博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)84級(jí)吳捷1987畢業(yè)碩士：博士：.6累積151人博士畢業(yè)(生科院)高級(jí)微生物第一次課第24頁各位微生物學(xué)科老師，您們好,今年國家基金資助情況已經(jīng)公布,微生物學(xué)科老師和博士后共取得13項(xiàng)資助,見下面列表，在此對(duì)取得資助老師表示祝賀.

今年獲資助項(xiàng)目有幾個(gè)主要特點(diǎn)。首先,首次取得資助老師有6位,陳守文,彭楠,趙述淼,鄭世學(xué),馬彬廣,張巨源.至此,具博士學(xué)位老師以及絕大多數(shù)副教授及以上老師都取得了國家基金資助,這是非常主要進(jìn)展,表明微生物學(xué)科負(fù)擔(dān)國家基金已經(jīng)進(jìn)入全民普及層面。

第二，微生物工程老師今年基金申報(bào)取得突破，有3位老師取得資助，陳守文，彭楠,趙述淼。對(duì)于提升工程應(yīng)用理論層次和理性設(shè)計(jì)，以致提升應(yīng)用水平有主要作用。主題：祝賀微生物學(xué)科今年取得13項(xiàng)國家基金資助高級(jí)微生物第一次課第25頁

第三，青年老師連續(xù)負(fù)擔(dān)國家基金能力得到提升。其中王莉第二次取得資助，阮麗芳第三次取得資助。

第四，特色項(xiàng)目保持實(shí)力。國際(地域)合作與交流項(xiàng)目在去年王革嬌老師取得資助情況下，今年趙開弘老師繼續(xù)取得資助，同時(shí)佘群新老師取得海外及港澳學(xué)者合作研究基金。藍(lán)細(xì)菌組博士后張巨源也取得青年基金資助。高級(jí)微生物第一次課第26頁然取得了很好成績，不過問題也有不少。第一，總資助數(shù)量依然有待提升。今年學(xué)?？傎Y助數(shù)量為155項(xiàng)，微生物學(xué)科占8.39%,與以往平均百分比相當(dāng)，記得年到達(dá)百分之十點(diǎn)幾。學(xué)校有7個(gè)國家重點(diǎn)學(xué)科，而對(duì)于咱們這么以理科為主國家重點(diǎn)學(xué)科，取得國家基金資助百分比占10%是完全應(yīng)該。從絕對(duì)數(shù)字來看，山東大學(xué)微生物學(xué)科往年平均數(shù)量是20項(xiàng)，今年預(yù)計(jì)會(huì)更高。為此，咱們要為年均保底15項(xiàng)，沖擊20項(xiàng)而去努力。

第三，除了國家基金以外，其它國家重點(diǎn)重大項(xiàng)目標(biāo)申報(bào)和資助還需要做更大努力。咱們微生物學(xué)科特色是農(nóng)業(yè)微生物，不過在服務(wù)國家需求方面國家重點(diǎn)重大課題爭取方面差距很大，咱們負(fù)擔(dān)國家973，863，支撐計(jì)劃，948，轉(zhuǎn)基因?qū)ｎ}，行業(yè)計(jì)劃等項(xiàng)目和課題數(shù)量屈指可數(shù)，在過去5年中，滿打滿算也就是21項(xiàng)，與國家重點(diǎn)學(xué)科地位是不相當(dāng)。高級(jí)微生物第一次課第27頁第二，高水平項(xiàng)目差距很大。國家級(jí)團(tuán)體項(xiàng)目，今年學(xué)校陳煥春院士上了一項(xiàng)，而咱們微生物學(xué)科當(dāng)前還沒有看到雛形。杰青項(xiàng)目，咱們當(dāng)前只有何正國老師一項(xiàng)杰青，對(duì)于國家重點(diǎn)學(xué)科來說，這是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。對(duì)于45歲以下老師，希望每個(gè)老師都能針對(duì)杰青要求，將杰青做為一個(gè)自我奮斗目標(biāo)。不論未來是否取得資助，努力方向和意志是非常主要。3.對(duì)于45歲以上老師，希望針對(duì)重點(diǎn)項(xiàng)目做好規(guī)劃，并將其作為主要努力目標(biāo)之一。當(dāng)前，咱們有喻子牛和何正國老師兩項(xiàng)在研重點(diǎn)項(xiàng)目，希望咱們未來能連續(xù)保持兩項(xiàng)在研重點(diǎn)項(xiàng)目。高級(jí)微生物第一次課第28頁一、高級(jí)微生物學(xué)內(nèi)容和涵義什么是高級(jí)微生物學(xué)在普通微生物學(xué)基礎(chǔ)上，從微觀和宏觀層面對(duì)微生物生物學(xué)做深入深入系統(tǒng)描述以及對(duì)微生物前沿領(lǐng)域進(jìn)展做概述一門?；茖W(xué)。高級(jí)微生物第一次課第29頁1.高級(jí)微生物發(fā)展演變歷程以前有專業(yè)基礎(chǔ)課，微生物遺傳、生理、分類以后無系統(tǒng)專業(yè)基礎(chǔ)課，但有通識(shí)生物學(xué)基礎(chǔ)主干課程作支撐，選修課程作擴(kuò)充知識(shí)結(jié)構(gòu)和框架方面矛盾和迷惑補(bǔ)修高級(jí)微生物第一次課第30頁認(rèn)識(shí)深度和廣度急速擴(kuò)張帶來巨大挑戰(zhàn)

知識(shí)和技術(shù)交叉（對(duì)其它學(xué)科知識(shí)依賴增強(qiáng)）本身特點(diǎn)帶來挑戰(zhàn)？高級(jí)微生物第一次課第31頁2.高級(jí)微生物學(xué)術(shù)定位/內(nèi)容?；A(chǔ)知識(shí)前沿進(jìn)展普通------易于取得國際------身邊分支學(xué)科:生理遺傳分類生態(tài)免疫基因組學(xué)分泌系統(tǒng)biofilm雙組分調(diào)整QS

Plasmid

S-layer極端微生物固氮/光合系統(tǒng)活性產(chǎn)物染色體結(jié)構(gòu)高級(jí)微生物第一次課第32頁序號(hào)講課時(shí)間日期講課內(nèi)容教室1第3周一3-4節(jié)9.19導(dǎo)論（孫明）二教1012第3周三5-6節(jié)9.21微生物基因組和功效基因（李林）二教1013第4周一3-4節(jié)9.26微生物基因組和功效基因（李林）二教1014第4周三5-6節(jié)9.28微生物基因組和功效基因（李林）二教1015第6周一3-4節(jié)10.1微生物蛋白質(zhì)組（何正國）二教1016第6周三5-6節(jié)10.12微生物蛋白質(zhì)組（何正國）二教1017第7周一3-4節(jié)10.17未能培養(yǎng)微生物（陳雯莉）二教1018第7周三5-6節(jié)10.19未能培養(yǎng)微生物（陳雯莉）二教1019第9周一3-4節(jié)10.31未能培養(yǎng)微生物（陳雯莉）二教10110第9周三5-6節(jié)11.02微生物細(xì)胞通訊與分化（李友國）二教10111第10周一3-4節(jié)11.07微生物細(xì)胞通訊與分化（李友國）二教10112第10周三5-6節(jié)11.09微生物細(xì)胞通訊與分化（李友國）二教10113第11周一3-4節(jié)11.14微生物與生物固氮(張忠明)二教10114第11周三5-6節(jié)11.16微生物與生物固氮(張忠明)二教10115第12周一3-4節(jié)11.21藥用微生物(何璟)二教10116第12周三5-6節(jié)11.23藥用微生物(何璟)二教10117第13周一3-4節(jié)11.28重金屬微生物代謝(王革嬌)二教10118第13周三5-6節(jié)11.3重金屬微生物代謝(王革嬌)二教10119第14周一3-4節(jié)12.05微生物系統(tǒng)生物學(xué)(何進(jìn))二教10120第14周三5-6節(jié)12.07微生物系統(tǒng)生物學(xué)(何進(jìn))二教10121第15周一3-4節(jié)12.12微生物系統(tǒng)生物學(xué)(何進(jìn))二教10122第15周三5-6節(jié)12.14藍(lán)細(xì)菌光合作用(趙開弘)二教10123第16周一3-4節(jié)12.19微生物新基因發(fā)掘（孫明）二教10124第16周三5-6節(jié)12.21微生物新基因發(fā)掘總結(jié)(孫明)二教101高級(jí)微生物第一次課第33頁序號(hào)講課內(nèi)容1導(dǎo)論（孫明）2微生物基因組和功效基因（李林）5微生物蛋白質(zhì)組（何正國）7未能培養(yǎng)微生物（陳雯莉）10微生物細(xì)胞通訊與分化（李友國）13微生物與生物固氮(張忠明)15藥用微生物(何璟)17重金屬微生物代謝(王革嬌)19微生物系統(tǒng)生物學(xué)(何進(jìn))22藍(lán)細(xì)菌光合作用(趙開弘)23微生物新基因發(fā)掘（孫明）高級(jí)微生物第一次課第34頁課次課程內(nèi)容課時(shí)講課老師上課時(shí)間1一、微生物分類學(xué)進(jìn)展4方呈祥9月9日2二、微生物(試驗(yàn))技術(shù)概論4陳向東9月16日3三、微生物基因組學(xué)4唐

兵9月23日4四、酵母細(xì)胞生物學(xué)4高向東9月30日5五、生物轉(zhuǎn)化與催化4湯亞杰10月14日6六、土壤重金屬污染微生物修復(fù)研究進(jìn)展4王革嬌10月21日7七