第二章微生物資源的開發(fā)與利用課件

第二章、微生物資源及其

開發(fā)利用

應用微生物學-2第二章、微生物資源及其

開發(fā)利用

應用微生物學-2本章內(nèi)容微生物資源的定義及其特點微生物資源開發(fā)的基本程序微生物資源開發(fā)的專利申請資源微生物的特殊要求資源微生物的研究方向本章內(nèi)容微生物資源的定義及其特點2.1

微生物資源的定義及其特點生物資源的權(quán)威定義（《生物多樣性公約》）：對人類具有實際或潛在用途、價值的遺傳資源、生物體或其部分、生物群體或生態(tài)系統(tǒng)中任何其他生物組成部分。生物資源三大支柱：動物、植物、微生物，而微生物資源是一類與動植物資源不同、生產(chǎn)特性優(yōu)越、開發(fā)前景廣闊的生物資源。2.1微生物資源的定義及其特點生物資源的權(quán)威定義（《生物多微生物資源的特點：（1）對其發(fā)現(xiàn)較晚，僅300年而已；（2）形體較小，代謝類型多樣化，生長繁殖速度驚人；（3）變異性大；（4）種源豐富，未知者眾；（5）對其開發(fā)研究比動植物晚很多，但取得了極其輝煌的成就。微生物資源的特點：（1）對其發(fā)現(xiàn)較晚，僅300年而已；第二章微生物資源的開發(fā)與利用ppt課件第二章微生物資源的開發(fā)與利用ppt課件2.2微生物資源開發(fā)的基本程序總體設計：找出目的菌：核心問題。效果試驗申請專利菌種改良及發(fā)酵工藝研究產(chǎn)品報批產(chǎn)品生產(chǎn)市場開發(fā)2.2微生物資源開發(fā)的基本程序總體設計：總體設計：總體設計是微生物資源開發(fā)利用的首要任務，核心是市場。市場又是活的，既要考慮現(xiàn)有市場，也要分析潛在市場，更要分析競爭對手和自己的市場開拓能力。總體設計：總體設計是微生物資源開發(fā)利用的首要任務，核心是市場總體設計還包括開發(fā)的策略，自己的工作基礎，已具備的條件，自己的優(yōu)勢和劣勢，合作伙伴的力量及誠信度，投資大小、投資周期及風險等。微生物資源開發(fā)往往需要合作伙伴，如果有力量互補、誠信度高的國內(nèi)外合作伙伴參與，必然對開發(fā)大有益處。為了使合作更富成效，訂立一項分工明確、成果分享公道的協(xié)議是完全必要的?？傮w設計還包括開發(fā)的策略，自己的工作基礎，已具備的條件，自己總體設計一旦確定，明確開發(fā)意圖并貫徹始終，是微生物資源開發(fā)最基本、時刻不離的原則，核心問題就是千方百計盡早找到所需的目的菌。這是開發(fā)成敗的關鍵，所有的策略、路線、方法都要為這個中心服務，而不要有所偏離?？傮w設計一旦確定，明確開發(fā)意圖并貫徹始終，是微生物資源開發(fā)最20世紀50年代從1000株菌就可能找到一種新抗生素，現(xiàn)在卻要從10000個新化合物中才有可能開發(fā)成功一個有臨床價值的藥物，可見難度和風險之大。如果你的開發(fā)目標跟別人相重，而且別人占了上風(如在你之先申請了專利)，你就不得不及時改變戰(zhàn)略，力爭別處領先。一套好的總體設計往往有幾套方案，根據(jù)情況變化而隨機應變。創(chuàng)新是微生物資源開發(fā)的靈魂創(chuàng)新是微生物資源開發(fā)的靈魂尋找目的菌:菌種的來源與分離：（1）目前至少有58個國家建有484個菌種保藏中心，菌種80多萬株，可作為菌種的重要來源；（2）如自己分離菌種，要根據(jù)開發(fā)目標，選擇取樣地域、環(huán)境。土壤是微生物種類最豐富的場所；海洋微生物是特別值得開發(fā)的資源；極端環(huán)境微生物（高溫溫泉、鹽湖、雪山、冰川、放射性地區(qū)等）也是重要的微生物資源；（3）采用混合菌分離方法分離有用菌。尋找目的菌:菌種的來源與分離：微生物開發(fā)最活躍的領域，可根據(jù)作用機制、代謝途徑的靶位、酶反應機制、基因操作中調(diào)控因子、目的化合物的類型等設計初選模型。模型設計：微生物開發(fā)最活躍的領域，可根據(jù)作用機制、代謝途徑的靶位、酶反多篩選模型，可意外找到用途更大的非目的菌。一菌多篩：多篩選模型，可意外找到用途更大的非目的菌。一菌多篩：高通量篩選與組合生化相結(jié)合：前者是采用相關設備，將許多模型固定在各自不同的載體上，用機器人加樣、培養(yǎng)后，用計算機記錄結(jié)果、分析，實現(xiàn)快速、準確、微量；后者是用已知有用化合物或已知骨架的化合物分別與不同的微生物共培養(yǎng)，分析不同培養(yǎng)時間化合物的結(jié)構(gòu)及其活性的變化（發(fā)生修飾或轉(zhuǎn)化），增加化合物的多樣性，相應增加獲得理想化合物的可能性。如兩者組合會使篩選效率大大提高。高通量篩選與組合生化相結(jié)合：前者是采用相關設備，將許多模型固采樣地點:土壤是微生物種類最豐富的場所，是取之不盡的微生物產(chǎn)地。海洋微生物是特別值得開發(fā)的資源。在某種意義上講，海洋微生物還可以算是處女地，是大有開發(fā)潛力的微生物資源。極端環(huán)境微生物也是重要的微生物資源。采樣地點:土壤是微生物種類最豐富的場所，是取之不盡的微生物產(chǎn)關于混合菌：在微生物學發(fā)展的歷程中，分離純培養(yǎng)曾經(jīng)是一個巨大的進步，現(xiàn)代工業(yè)微生物發(fā)酵幾乎都是用純種。在一些情況下，分離資源微生物不一定需要純培養(yǎng)。關于混合菌：在微生物學發(fā)展的歷程中，分離純培養(yǎng)曾經(jīng)是一個巨大2.3微生物資源開發(fā)的專利申請2.3微生物資源開發(fā)的專利申請注意事項（1）申請時機應在確定某種新活性、新用途或新化合物時立即申請；（2）在可能別人仿制你的技術(shù)，而你又無法找到明確證據(jù)的條件下最好采取保密手段（在專利中實施技術(shù)保密）；注意事項（1）申請時機應在確定某種新活性、新用途或新化合物時（3）研究人員往往對法律程序不熟悉，最好的申請專利的途徑是聘請法律顧問或?qū)＠暾埓砣?；?）新菌種也可以申請專利，但不同的國家有不同的規(guī)定。美國：新菌種發(fā)表后就不能申請；西歐國家規(guī)定發(fā)表一年內(nèi)可以申請。因此在新菌種被接受發(fā)表時（到發(fā)表還有約3個月到半年時間）立即申請專利最為合適。（3）研究人員往往對法律程序不熟悉，最好的申請專利的途徑是聘生產(chǎn)菌種和專利菌種的保護專利菌種和生產(chǎn)菌種都是有價值的資源。專利菌種不一定有生產(chǎn)價值。生產(chǎn)菌種不一定可以申請專利。專利菌種及其產(chǎn)物一定得新，有可能開發(fā)成生產(chǎn)菌種，實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化，但不一定在申請專利時就有現(xiàn)實生產(chǎn)力。生產(chǎn)菌種必須有現(xiàn)實生產(chǎn)力。在某些情況下專利菌種就是生產(chǎn)菌。這兩者的保護均與當事人的經(jīng)濟利益有關，都是對知識產(chǎn)權(quán)的保護。生產(chǎn)菌種和專利菌種的保護專利菌種和生產(chǎn)菌種都是有價值的資源。專利申請的必要性要全程開發(fā)一種新的抗生素，大約需要兩億多美元的投資、10年左右時間、大量的人力物力，還有極大的風險。各國通常的做法是一旦證明某種新菌種產(chǎn)生某種新物質(zhì)并具有某種活性(不一定就有臨床價值)，馬上要做的第一件事就是申請專利。然后再繼續(xù)研究開發(fā)。這說明專利對于促進微生物資源開發(fā)的極端重要性。沒有專利保護，簡直就不會有人敢搞抗生素及其他微生物制品的開發(fā)。專利申請的必要性要全程開發(fā)一種新的抗生素，大約需要兩億多美元

能夠利用廉價的原料，簡單的培養(yǎng)基，大量高效地合成產(chǎn)物

有關合成產(chǎn)物的途徑盡可能地簡單，或者說菌種改造的可操作性要強

遺傳性能要相對穩(wěn)定

不易感染它種微生物或噬菌體

產(chǎn)生菌及其產(chǎn)物的毒性必須考慮（在分類學上最好與致病菌無關）

生產(chǎn)特性要符合工藝要求1.工業(yè)微生物應用的要求2.4資源微生物的特殊要求能夠利用廉價的原料，簡單的培養(yǎng)基，大量高效地合成有關合成2.5資源微生物的研究方向

分子生物學的實驗手段，在微生物鑒別及特定目標產(chǎn)物的篩選方面發(fā)揮了著越來越重要的作用。如:16SRNA同源性分析，基因序列分析及DNA/DNA雜交技術(shù)等

目前土壤中能夠培養(yǎng)的微生物不到總數(shù)的1%。微生物的多樣性及資源的開發(fā)仍然是今后若干年的研究重點。

極端環(huán)境微生物開發(fā)應用前景廣闊。

2.5資源微生物的研究方向分子生物學的實驗手段，在微生物海洋微生物資源浩瀚的海洋是地球上生命的搖籃，它覆蓋著地球表面積71%

，海水總體積占地球總水量97%。海洋中生物資源極為豐富，生物活性物質(zhì)種類繁多，僅在過去10年中，有近5,000種新的海洋天然產(chǎn)物被發(fā)現(xiàn)，大多數(shù)都分離自海洋微生物，且許多是陸地生物所沒有的，顯示出巨大開發(fā)潛力。海洋微生物資源研究已成為海洋資源研究的重要內(nèi)容之一。海洋微生物資源浩瀚的海洋是地球上生命的搖籃，它覆蓋著地球表面海洋微生物的生物多樣性海洋是一個十分獨特的生態(tài)環(huán)境，包羅了高鹽、高壓、低溫(尤其是深海)、低光照、寡營養(yǎng)等特點,還有無光照以及局部高溫的極端環(huán)境。來自海洋的微生物大部分都是適應了極端環(huán)境的極端微生物。據(jù)估計海洋微生物可達0.1～2億種。已發(fā)現(xiàn)的類群主要包括:病毒、古菌、細菌、粘細菌、微藻、真菌。海洋微生物的物種多樣性決定了其代謝產(chǎn)物多樣性，海洋環(huán)境是新型生物活性物質(zhì)的源泉。海洋微生物的生物多樣性海洋是一個十分獨特的生態(tài)環(huán)境，包羅了高海洋微生物藥物資源現(xiàn)已從海水、海底泥、海魚胃內(nèi)容物、珊瑚表面、叉珊藻、毒蟹、河豚、毛顎動物等的體內(nèi)或體表等各種采自海洋的樣品中分離到的細菌、放線菌可產(chǎn)生多種生物活性物質(zhì)。海洋真菌的次級代謝產(chǎn)物70%～80%具有生物活性。海洋微生物藥物資源現(xiàn)已從海水、海底泥、海魚胃內(nèi)容物、珊瑚表面已經(jīng)分離到的新成分抗氨基糖苷類耐藥菌株的新氨基糖苷類抗生素。對綠膿桿菌和一些耐藥性革蘭氏陰性菌具有較強的活性、抗菌譜廣、毒性低的抗菌物質(zhì)和肌醇胺霉素。寡霉素2A

的20-羥衍生物、腸菌素的5-脫氧衍生物以及兩種全新的細菌化合物辛內(nèi)酰亞胺(Octalactins)A和B八氫內(nèi)酰亞胺、亞酮乳酰胺、大環(huán)內(nèi)酰亞胺、喹唑啉哈利凱(halichomycin)

等具有抗病毒或抗腫瘤活性的物質(zhì)。一種具有增強免疫活性、促進體液免疫和細胞免疫,能抑制多種動物移植腫瘤的雜多糖,與化療藥物在抗腫瘤方面有協(xié)同作用,已用于臨床。已經(jīng)分離到的新成分抗氨基糖苷類耐藥菌株的新氨基糖苷類抗生素。海洋微生物極端酶資源嗜冷菌能產(chǎn)生很多種在低溫下才顯示高效的酶，已被提取出來的嗜冷酶有α-淀粉酶，磷酸丙糖異構(gòu)酶、蛋白酶、脂肪酶、膠原酶，嗜冷堿性蛋白酶在工業(yè)洗滌劑、保持食品營養(yǎng)和風味起著重要作用。海洋微生物極端酶資源嗜冷菌能產(chǎn)生很多種在低溫下才顯示高效的酶嗜熱微生物從嗜熱微生物中已篩選到多種熱穩(wěn)定性的酶,如淀粉酶、蛋白酶、葡萄糖苷酶、木聚糖酶、磷酸烯醇丙酮酸激酶及DNA聚合酶,這些酶在75℃～100℃之間具有良好熱穩(wěn)定性。新發(fā)現(xiàn)一種耐高溫菌如烈火球菌(Pyrococcus

furiosus)中獲得一種聚合酶,稱之為pfr聚合酶,在100℃下能有效發(fā)揮酶功能反應,此酶有可能取代第一個進入商業(yè)化的taq聚合酶,在聚合酶鏈反應(PCR)技術(shù)方面發(fā)揮重要作用。嗜熱微生物從嗜熱微生物中已篩選到多種熱穩(wěn)定性的酶,如淀粉酶嗜壓微生物深海嗜壓微生物是嗜壓酶重要來源,高壓增加了酶活性和熱穩(wěn)定性，且使酶具有良好的立體專一性，在高溫和高壓下，底物溶解度增加，溶劑黏度減少，提高了物質(zhì)的傳輸速率和反應速率，決定了嗜熱嗜壓酶在