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文檔簡介

miRNA靶基因識別和功能調(diào)節(jié)一、mRNA簡介microRNA（miRNA）是一類能夠調(diào)節(jié)基因表達的短單鏈內(nèi)源非編碼RNA（約22nt），通過與互補的mRNA選擇性地結合抑制蛋白的產(chǎn)生，廣泛存在于動物、植物、病毒等多種有機體中。

miRNA通常位于基因間或者內(nèi)含子區(qū)域，在細胞核內(nèi)有RNA聚合酶Ⅱ轉錄產(chǎn)生具有帽子結構多聚腺苷酸尾巴的pri-miRNA。在核酸酶Drosha及其輔助因子Pasha的作用下，pri-miRNA被處理成70個核苷酸組成具有莖環(huán)結構的pre-miRNA，然后由Exportin

5等轉運至細胞質。Dicer將pre-miRNA切割成約22nt的雙鏈miRNA。雙鏈miRNA講解形成單鏈的成熟miRNA。成熟miRNA還需要與Argonaute蛋白等組裝形成RNA誘導沉默復合體（RISC），RISC作用于特異mRNA的3’UTR，從而抑制翻譯過程或者直接降解mRNA。SiRNA與mRNA比較SiRNA和mRNA也有區(qū)別。1.根本區(qū)別是miRNA是內(nèi)源的，在基因組中有固定的基因座位；siRNA可以是人工體外合成的，也可以是基因組的轉錄片斷，降解片斷和轉座片斷，病毒基因組轉錄片斷等，關鍵在于siRNA沒有固定的基因座位，本身不是基因組的功能片斷，是隨機產(chǎn)生的，即加工位點不是保守的。2.二者結構上沒有本質區(qū)別，功能分子都是單鏈RNA，miRNA轉錄出來時必然是發(fā)夾狀的，siRNA可以由完全互補的雙鏈切斷而來，也可以從發(fā)夾來。二、靶基因預測方法盡管對miRNA功能的認識還不是非常清楚，但miRNA在許多生物過程中起關鍵作用，包括發(fā)育、細胞分化、增殖、凋亡、腫瘤轉移等。準確快速地預測miRNA靶基因對于研miRNA功能以及分析miRNA參與的生物學過程具有十分重要的意義。目前尋找miRNA靶基因的方法主要有生物信息學以及生物實驗方法。1、生物信息學方法生物信息學方法主要是利用某種算法對靶基因樣本進行評分及篩選。生物信息學的方法只是通過算法為研究人員提供可能性最大的參考信息，還需要通過實驗進行驗證。目前常規(guī)的算法主要遵循以下幾個常用原則：（a）miRNA與靶基因的互補性；（b）miRNA靶位點在不同物種之間的保守性；（c）miRNA-mRNA雙鏈之間的熱穩(wěn)定性；（d）miRNA靶位點不會有復雜的二級結構；（e）miRNA

5’端于靶基因

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