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文檔簡介

生物醫(yī)學文獻

主題標引基礎余恩琳

汕頭大學醫(yī)學院圖書館

elyu@Basicknowledgeofbiomedicalliteraturesubjectindexing

一、基本知識1.標引(Indexing)的概念:是對文獻進行主題分析,從自然語言轉換成規(guī)范化的檢索語言的過程。對文獻給予分類號標識的過程,稱為分類標引(Classificationindexing);給予主題詞標識的過程,稱為主題標引(SubjectIndexing)。-------國家標準局GB3860-83《文獻主題標引規(guī)則》

簡言之,標引就是對文獻主題分析的結果賦予檢索標識的過程。而檢索標識,是一種代表文獻主題的標記符號。如分類號、主題詞、關鍵詞等。

2.文獻檢索標識:

外部特征:著者、文獻號內容特征:分類號標識主題詞標識:關鍵詞(自然標識)單元詞、標題詞及敘詞(人為標識)3.主題標引的幾個基本概念(1)主題詞(SubjectHeadings):

也稱敘詞(Descriptors),是一些以概念為基礎的,經過規(guī)范化和優(yōu)選處理的,具有組配功能,并能顯示詞間語義關系和動態(tài)性的詞和詞組。是用來揭示文獻主題內容,標引和檢索文獻的一種信息檢索語言詞匯。主題詞主要特點:①概念性(concept):事物概念自然語言文獻信息內容概念信息檢索語言注:主題詞為實詞,指事物的具體層面②規(guī)范化(Normalize):指對自然語言的詞形和詞義進行限制,使一個詞只能表達一個概念,或一個概念只能用一個詞來表達,即詞和概念是一一對應的關系。通過詞表來控制。③優(yōu)選處理(Priority):詞表收詞有限,不是所有的自然語言詞匯都可以作用主題詞。通過詞頻統(tǒng)計確定。④組配(Cooperation)⑤語義關系(semanticrelation):指主題詞之間的內在聯(lián)系。主要包括等同關系、等級關系和相關關系⑥動態(tài)性(Dynamic):指主題詞表中的詞的更新變化。(2)主題詞法(敘詞法)是直接以代表事物名稱或概念的規(guī)范化的名詞術語,作為表達文獻主題內容的標識符號,并依據這些標識符號的語義和字順,編排和組織文獻檢索工具的一種方法。簡言之就是利用敘詞原理建立檢索系統(tǒng)的一種方法。敘詞法的基本特征:①按文獻所論述的事物(即主題)集中文獻;②用人們日常使用的名詞術語經過規(guī)范化后直接表達文獻所論述的事物;③用參照系統(tǒng)等間接顯示事物概念之間(即主題之間)的關系;④用字順序列直接提供按事物名稱檢索文獻的途徑(即主題檢索途徑)。(3)主要主題詞(MajorMeSHHeadings,Mjme)對文獻核心主題概念的標識。某種實驗研究的直接目的和結果;臨床疾病的預防、診斷、治療等主要手段、方法和創(chuàng)新;

一篇文獻中占篇幅較多的內容等。

在MEDLARS-MEDLINE系統(tǒng)中,用加權符號“*”表示如:*Aspirin/therapeuticuse注:主要主題詞對應主題檢索中的加權概念(4)次要主題詞(MinorMeSHHeadings,Mime)指對文章論述的次重點概念的標識

它們可能是主要標引的組配標引詞,為了某種研究目的所提供的載體、條件、方法和手段、治療學中提到的藥物制劑、實驗動物類型、人類的性別與年齡組、文獻類別、語種等。(5)組配(Cooperation)按一定規(guī)則,用兩個或兩個以上的主題詞(或主題詞與副主題詞)構成邏輯關系組合來表達一個專指概念的方法。形式:(A)主題詞+主題詞交叉組配

病毒性心臟病+心肌炎病毒性心肌炎

(B)主題詞/副主題詞限定組配錳/中毒鋅/缺乏4、標引與檢索的關系文獻主題概念主題分析規(guī)范語標引過程課題主題概念主題分析檢索過程檢索提問式詞表檢索系統(tǒng)檢索結果轉換轉換標引是手段檢索是目的標引為檢索服務標引和檢索關系圖,即檢索原理圖5、學習文獻標引的意義:(1)方便檢索,提高檢索效率,使查準率與查全率保持合理的水平;(2)了解標引知識,便于專業(yè)研究

如發(fā)表文章

標識“中圖類號”標識關鍵詞(盡量使用規(guī)范化的主題詞,提高文章被檢索出來的概率,從而提高被引用率)6.目前常用的幾種文獻分類法(1)《中國人民大學圖書館圖書分類法》(2)《中國科學院圖書館圖書分類法》(3)《中國圖書館分類法》(4)《杜威十進分類法》(DC)(5)《美國國會圖書館圖書分類法》(LC)(6)《美國國立醫(yī)學圖書館圖書分類法》(NLMC)1、中國生物醫(yī)學文獻標引系統(tǒng)中國醫(yī)學科學院、中國中醫(yī)研究院聯(lián)合設計以NLMMEDLARS及《漢語主題詞表》為依托標引依據:《MeSH》、《中醫(yī)藥學主題詞表》2、醫(yī)學主題詞表(MedicalsubjectHeadings,MeSH)NLM編制,21,000個主題詞,83個副主題詞(Subheadings)嚴規(guī)范化字順表,樹狀結構表(輔表)用途:標引和檢索(確保主題標引者和主題檢索者在用語上的一致)MeSH對文獻作者、讀者所使用的自然語言進行規(guī)范,主要體現(xiàn)單一性、動態(tài)性兩個特點二、主題標引(SubjectIndexing)單一性:(1)規(guī)定概念與主題詞的單一對應,即一個主題詞只能表達一個概念,決不允許一詞多義或一義多詞;(2)目的是使討論同一概念的文獻不至于分散,保證檢索方便、準確和全面。如:乙酰水楊酸見阿司匹林;KidneyCancer/KidneyTumor/KidneyCarcinomor/Neoplasms,Kidney

seeKidneyNeoplasms動態(tài)性:指詞表的每年增刪修訂。主題詞及副主題詞隨學科研究的不斷深化加以補充和新舊更替3、醫(yī)學主題詞選詞范圍

(1)器官、組織、細胞A(2)疾病病理學C(3)藥物、化學物質、內源性物質和其他物質D(4)操作技術,含診斷、治療、外科、麻醉、分析E(5)行為醫(yī)學、心理學及精神病學F(6)有機體:微生物、動植物B(7)生理、生物學G(8)公共衛(wèi)生保健科學及事業(yè)N(9)與醫(yī)學相關的自然科學H、社會科學I、人文科學K、情報科學等L、工業(yè)農業(yè)J(10)地理區(qū)域Z4、主題詞的基本形式:(1)單個詞:Brain、Electrocardiography

(2)詞組:

直接形式:BloodChemicalAnalysis,LungNeoplasms倒置形式:KidneyFailure(字順表)KidneyFailure,Acute

KidneyFailure,ChronicCardiovascularDiseases(樹狀結構表)VascularDiseasesHypertension

Hypertension,MalignantHypertension,Pregnancy-InducedHypertension,RenalHypertension,Renovascular注:主題詞采用倒置形式的主要目的,是使同屬某一概念的文獻能按字順相對集中在一起;也方便在檢索過程中選詞。免疫和生物因子

生物因子

生長物質

白細胞介素類

白細胞介素1

白細胞介素2

白細胞介素3

白細胞介素4

白細胞介素5

白細胞介素6

白細胞介素7

白細胞介素8

白細胞介素9

白細胞介素10

白細胞介素11

白細胞介素12

白細胞介素13

白細胞介素14

白細胞介素15

白細胞介素16

白細胞介素17

白細胞介素18

BiologicalFactorsIntercellularSignalingPeptidesandProteinsCytokinesInterleukins

Interleukin-1Interleukin-1alphaInterleukin-1betaInterleukin-10Interleukin-11Interleukin-12Interleukin-12Subunitp35Interleukin-12Subunitp40Interleukin-13Interleukin-15Interleukin-16Interleukin-17Interleukin-18Interleukin-2Interleukin-23Interleukin-12Subunitp40Interleukin-23Subunitp19Interleukin-3Interleukin-4Interleukin-5Interleukin-6Interleukin-7Interleukin-8Interleukin-9(樹狀結構表)5、醫(yī)學主題詞表(MeSH)的局限

(1)有關中醫(yī)中藥的主題詞極少;(2)有些概念不能找到合適的主題詞來表達

如:藥物治療的量、原發(fā)與繼發(fā)(腫瘤除外)、經常與罕見

(3)對某些綜合征沒有適當?shù)闹黝}詞表達,有關反映新技術、新概念的詞匯出現(xiàn)仍嫌較晚

如SARS(4)地理主題詞:美國的地理名詞較詳,美國以外的國家只有國家名及部分大城市名6、副主題詞(Subheadings)也稱限定詞(Qualifiers)用于對某個主題詞進行限定,將同一主題內容的文獻再按照不同的研究側面作進一步的劃分,提高主題詞的專指度,以便檢索者準確快捷定位自己最關心的文獻所在區(qū)域;此外還可以擴大詞匯量。MeSH詞表有83個副主題詞,中醫(yī)藥學主題詞表有11個副主題詞

注意:副主題詞與主題詞相組配使用,但并不是所有的副主題詞可以與任何一個主題詞隨意組配,它有一定的組配限定,而且為適應學科發(fā)展,其限定范圍及時變更。副主題詞常常是事物的通用層面7、常用副主題詞簡介(1)Adverseeffects副作用(AE)用于診斷、治療、預防或麻醉的藥物,化學物質、生物和物理作用物,以及制造的產品在正常用量時引起的不良反應(包括:過敏或特異性反應),也用于診斷、治療、預防、麻醉、外科手術及其他措施時的副作用或并發(fā)癥,但不包括禁忌癥。

例1、冷凍療法的并發(fā)癥冷凍療法(CRYOTHERAPY)/副作用

例2、青霉素引起過敏(Penicilins)Penicilins/AE或Penicilins/Adverseeffects(2)Analysis分析(AN)

用于一種物質,其成分或其代謝產物的鑒定或定量測定,注意與/化學、/血液、/尿、/腦脊髓液、/分離與提純、代謝、/藥代動力學等區(qū)別例3、肝臟的青霉素濃度

青霉素類/分析肝/代謝

(3)Biosynthesis生物合成(BI)用于生物體的活細胞或亞細胞成分的化學物質的形成例4、痛風時肝內的氨基酸合成

氨基酸類/生物合成肝/代謝痛風/代謝(4)Blood血液(BL)(/Urine尿/CerebrospinalFluid腦脊髓液)用于正?;蚣膊顟B(tài)血液中的內含物及其分析、檢查或變化。不包括血清診斷和血清學,前者用/診斷,后者用/免疫學例5、妊娠期中血青霉素G的含量妊娠/血液青霉素G/血液

(5)Chemicalsynthesis化學合成(CS)用于體外分子的化學制備。在生物、細胞或亞細胞領域內形成化學物質時用/生物合成

例6、青霉素的制備青霉素類/化學合成(6)Chemicalinduced化學誘導(CI)用于人或動物由于化學化合物引起的疾病,綜合征、先天性異?;蝮w征。注意用在藥物或化學物質名稱之后加/副作用、/中毒、/毒性的副主題詞作配伍

例7、與氯喹有關的眼疾病眼疾病/化學誘導

氯喹/副作用

(7)Complications并發(fā)癥(CO)用于疾病同時或隨后發(fā)生的狀態(tài),即同時存在的疾病,并發(fā)癥或后遺癥。注意與/病因學的區(qū)別

例8、眼弓形體病并發(fā)的青光眼眼弓形體病/并發(fā)癥青光眼/并發(fā)癥(8)Contraindications禁忌癥(CT)與藥品、化學物質以及生物和物理因素主題詞組配,表明在任何疾病或生理狀態(tài)時可能使這些治療成為不合適、不需要或不可取,也用于診斷、治療、預防、麻醉、外科手術或其他操作的禁忌癥。注意與/副作用、/中毒、/毒性區(qū)別

例9、孕婦禁用奎寧奎寧/禁忌癥妊娠/藥物作用

(9)Cytology細胞學(CY)用于單細胞或多細胞生物的正常細胞形態(tài)學,注意與/病理學、/超微結構區(qū)別

例10、胰腺的細胞學胰腺/細胞學(10)Diagnosis診斷(DI)用于各種疾病的診斷,包括檢查、鑒別診斷及預后,但不包括普查或放射線診斷,前者用/預防和控制,后者用/放射照相術,超聲診斷用/超聲檢查例11、癲癇的腦電描記法診斷

癲癇/診斷腦電描記術

(11)Diagnositcuse診斷應用(DU)用于應用化學物質、藥物,物理動因來研究某些器官的臨床功能或診斷人或動物的疾病。注意與/診斷配伍(12)Diettherapy飲食療法(DH)用于疾病的飲食性或營養(yǎng)性治療;但不包括維生素和礦物質的補充,后者用/藥物療法例12、消化性潰瘍的飲食治療

消化性潰瘍/飲食療法

(13)Drugeffects藥物作用(DE)用于藥物和化學物質對器官、部位、組織或機體的生理和精神過程作用。注意藥物要與/藥理學組配配伍例13、青霉素G對心臟的影響

青霉素G/藥理學

心臟/藥物作用(14)Drugtherapy藥物療法(DT)用于疾病通過投給藥物,化學物質及抗生素來治療或預防疾病,不包括免疫治療或生物制品治療,后者用/治療,注意與/飲食療法、/放射療法的區(qū)別,可與/治療應用配伍

(15)Etiology病因學(ET)用于疾病以探討致病原因,包括微生物、環(huán)境和社會因素,起病因作用的個人習慣等,包括致病機理,如果引起疾病的因素是藥物,應用/化學誘導

可與/并發(fā)癥配伍(16)Immunology免疫學(IM)用于組織、器官、微生物、真菌、病毒和動植物的免疫學研究,包括疾病的免疫方面,但不包括用于診斷、預防或治療等目的免疫手段,這些應用/診斷、/預防和控制、/治療等,

例14、痛風的抗體形成痛風/免疫學抗體形成

例15、痛風的血清學診斷

痛風/診斷血清診斷

(17)Metabolism代謝(ME)

用于器官、細胞和亞細胞結構、生物和生物化學變化及代謝。也用于藥物或化學物質的合成代謝(由小分子轉化成大分子)及分解代謝(即由復雜物質裂解成簡單物質)。但/生物合成、/酶學、/分泌、/藥代動力學另有專門副主題詞

例16、精神分裂癥時腦的血清素代謝血清素(Serotonin)/代謝

腦(Brain)/代謝

精神分裂癥(Schizophrenia)/代謝(18)Microbiology微生物學:用于器官、動物、高等植物和疾病的微生物學研究;(MI)Parasiology/寄生蟲學:用于動物、高等植物、器官和疾病的寄生蟲因素,不用于診斷中暗示的寄生蟲因素;(PS)Pathogenicity/致病力:用于微生物、病毒、寄生蟲對人和動物引致疾病的能力(PY)

例17、從牛的腸道中分離出真菌真菌/分離和提純腸/微生物學牛/微生物學(19)Pathology病理學(PA)用于疾病狀態(tài)的器官、組織和細胞的結構,注意與/解剖學和組織學、/細胞學、/超微結構區(qū)別

例18、正常的肝細胞和病理性肝細胞

肝/細胞學肝/病理學(20)Pharmacology藥理學(PD)用于藥物和投給的化學物質對組織和機體的作用,包括對生理和對生物化學過程的加速抑制及其藥理作用機理。

例19、新斯的明對呼吸動力的影響

新斯的明/藥理學呼吸/藥物作用(21)Physiology生理學(PH)用于器官、組織、單細胞和多細胞生物的正常功能,也用于內源性生化物質所產生的生理作用。例20、肝臟的功能

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