醫(yī)學信息檢索與利用概論

《醫(yī)學信息檢索與利用》概論南昌大學醫(yī)學院文獻檢索教研室鐘麗萍Whereisthewisdomwehavelostinknowledge?

Whereistheknowledgewehavelostininformation?

——T.S.Eliot(1888-1965)我們在信息里面失去的知識，到哪里去了？我們在知識里面失去的智慧，到哪里去了？艾略特（1888-1965）第一節(jié)基本概念1信息（Information)英國科學家K.Popper認為信息可分為：有關(guān)客觀物質(zhì)世界的信息有關(guān)人類主觀精神世界的信息有關(guān)概念世界的信息基本概念2知識(knowledge)人類在認識世界、改造世界的過程中，不斷接受客觀事物發(fā)出的信息，經(jīng)過思維加工，獲得對事物本質(zhì)及其運動規(guī)律的認識，由此信息轉(zhuǎn)化為知識。國際經(jīng)濟合作與發(fā)展組織提出知識的4W概念：know-what;know-why;know-how;know-who基本概念3情報（Information)當人們?yōu)榱私鉀Q某一特定問題去搜尋所需要的知識，那一部分知識就是情報，是被傳遞的知識或事實。情報的三個基本屬性：知識性、傳遞性、效用性基本概念4文獻（document,literature)文獻是記錄有知識的一切載體。4個概念之間的關(guān)系信息知識系統(tǒng)化文獻記錄情報交流網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下的信息資源1電子信息資源文本型(text)多媒體型(multimedia)超文本型(hypertext)網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下的信息資源2傳統(tǒng)文獻印刷型縮微型聲像型按文獻發(fā)布的類型分類圖書期刊特種文獻按揭示文獻內(nèi)容程度分類一次文獻二次文獻三次文獻第二節(jié)計算機檢索與數(shù)據(jù)庫計算機檢索：利用計算機從文獻數(shù)據(jù)庫或因特網(wǎng)上查尋所需文獻信息的過程。包括：聯(lián)機檢索、光盤檢索、網(wǎng)絡(luò)檢索計算機檢索發(fā)展簡史脫機檢索(off-lineretrieval)聯(lián)機檢索(on-lineretrieval)光盤檢索(opticaldiscretrieval)網(wǎng)絡(luò)檢索數(shù)據(jù)庫的類型與結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫是指有計算機進行處理的一定數(shù)量同類信息的有序集合，是用來存儲和查找文獻的電子化檢索工具。數(shù)據(jù)庫的類型書目型數(shù)據(jù)庫(bibliographicdatabase)事實型數(shù)據(jù)庫(factdatabase)數(shù)值型數(shù)據(jù)庫(numericdatabase)全文數(shù)據(jù)庫(fulltextdatabase)圖像型數(shù)據(jù)庫(imagedatabase,atlasonline)書目數(shù)據(jù)庫(BibliographicDatabase)存儲的是二次文獻,包括文獻的外部特征、題錄、文摘和主題詞等，檢索結(jié)果是所需文獻的線索而非原文。許多書目數(shù)據(jù)庫是印刷型文獻檢索工具的機度版，如MEDLINE、CBMDISC等數(shù)值數(shù)據(jù)庫（NumericDatabase)

主要包含的是數(shù)字數(shù)據(jù)，如各種統(tǒng)計數(shù)據(jù)、科學實驗數(shù)據(jù)、科學測量數(shù)據(jù)等。例如醫(yī)學上使用的化學制劑、藥物的各種理化參數(shù)、人體生理上的各種數(shù)值，人口統(tǒng)計數(shù)據(jù)都可收入數(shù)值數(shù)據(jù)庫。美國國立醫(yī)學圖書館編制的化學物質(zhì)毒性數(shù)據(jù)庫RTECS，包含10萬多種化學物質(zhì)的急、慢性毒理實驗數(shù)據(jù)。事實數(shù)據(jù)庫（FactDatabase)存儲的是用來描述人物、機構(gòu)、事物等信息的情況、過程、現(xiàn)象的事實數(shù)據(jù)。如名人錄、機構(gòu)指南、大事記等，均可歸入事實數(shù)據(jù)庫。美國MEDLARS系統(tǒng)的醫(yī)生咨詢數(shù)據(jù)庫（PDQ），能提供有關(guān)癌癥治療和臨床實驗的相關(guān)病因、診斷標準、治療方案以及最新研究進展等信息。全文數(shù)據(jù)庫（FullTextDatabase)存儲的是原始文獻的全文，如雜志論文、報紙新聞、法院案例等。全文檢索可直接獲取原始資料，而不是書目檢索時的線索，提高了用戶的檢索效率。在DIALOG中有48種醫(yī)藥期刊全文數(shù)據(jù)庫，我國有《中國學術(shù)期刊》數(shù)據(jù)庫、萬方數(shù)據(jù)庫、維普數(shù)據(jù)庫等全文數(shù)據(jù)庫。圖像數(shù)據(jù)庫（ImageDatabase)以圖像為信息主體，配有文字解釋，如：解剖圖譜、中藥圖譜、診斷圖譜、手術(shù)圖譜等。如：NLM的ThevisibleHumanProject;哈佛大學醫(yī)學院的TheWholeBrainAtlas等。數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)文檔(file)記錄(record)字段(field)數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)文檔（file)數(shù)據(jù)是能滿足某種特定目的或某一特定數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)需要的一種數(shù)據(jù)集合，由一個或多個文檔構(gòu)成現(xiàn)期文檔、回溯文檔（如MEDLINE）順排文檔、倒排文檔記錄（record)數(shù)據(jù)庫中基本文獻單元一個記錄在數(shù)據(jù)庫中通常記錄著一篇文獻的相關(guān)信息字段（field)組成記錄的基本信息單元。每一個字段都描述文獻的某一方面特征，包括外表特征和內(nèi)容特征。每個字段有自己的名稱和縮寫，如：題名(ti)、著者(au)、文摘(ab)、出版年(py)等計算機檢索的途徑檢索途徑是指用記錄的某一特征為檢索切入點進行檢索。自由詞檢索自由詞又稱文本詞（textword),是作者寫文章時所使用的自然詞語，包括：標題詞(titleword)關(guān)鍵詞(keyword)文摘詞(abstractword)全文詞(fulltextword)主題詞檢索主題詞（subject,subjectheadings)又稱敘詞，是一種規(guī)范化的檢索語言。主題詞的規(guī)范作用在于：對同義詞、近義詞、異形詞、全稱與縮寫進行歸并，以保證一詞輸入，多詞命中。規(guī)范的依據(jù)：醫(yī)學主題詞表（MESH）例：renalfailureseekidneyfailure分類檢索分類法（Classification):利用學科、專業(yè)、概念之間的邏輯關(guān)系建立起來的一種等級體系。分類號：由數(shù)字或數(shù)字加字母構(gòu)成，代表一個個概念；概念間有上下隸屬關(guān)系，也有同位間的并列關(guān)系。國內(nèi)常用的分類法是：《中國圖書資料分類法》著者檢索著者（author)檢索是用文獻上署名的作者或編者的姓名作為檢索入口詞。檢索時注意著者姓名的處理：姓前，名后；姓用全稱，名用首字母。如：CharlesGreenberg處理為:Greenbergc聞玉梅處理為：wenym引文檢索參考文獻：在學術(shù)論文、綜述、專著文獻后面，列有的著者撰文借鑒利用過的書目清單。引用文獻：列有參考文獻的文獻。參考文獻又稱為被引用文獻。引文檢索：以被引用文獻為檢索起點來查找引用文獻的過程。機構(gòu)檢索以機構(gòu)名稱為檢索詞，來查找該機構(gòu)學者發(fā)表的文獻?？麢z索檢索指定刊物上發(fā)表的文章。有的數(shù)據(jù)庫提供刊名瀏覽，只需點擊刊名鏈接即可有的數(shù)據(jù)庫則需輸入刊名：刊名全稱或刊名縮寫刊名縮寫全稱轉(zhuǎn)換可查Pubmed的JournalDatabase()默認檢索默認檢索又稱缺省檢索、隱含檢索，是指在檢索系統(tǒng)預先設(shè)定的多個字段中進行檢索。如：在WinSPIRS系統(tǒng)的MEDLINE數(shù)據(jù)庫中，Search狀態(tài)為默認檢索所有非限制字段，包括：ti,ab,MH等字段。CBMdisc中的“缺省”檢索是在中文標題、文摘、主題詞、關(guān)鍵詞、特征詞、刊名等6個字段中搜詞檢索。限定檢索不少數(shù)據(jù)庫提供limit檢索功能,用來對檢出結(jié)果進行數(shù)量限制.常用的限定檢索有:語種(language)、文獻類型(publicationtype)、出版日期(publicationdate)、只要含有全文的記錄(fulltextonly)、限于臨床醫(yī)學期刊(clinicaljournals)等。其他檢索途徑專利號、國際連續(xù)出版物編號、化學物質(zhì)登記號檢索，分子式檢索、特征詞檢索、記錄順序號檢索等。計算機檢索途徑的另一劃分法簡單檢索復合檢索高級檢索目錄檢索導航檢索專家檢索簡單檢索(SimpleSearch)也稱初級檢索、自由詞檢索、基本檢索。指在數(shù)據(jù)庫首頁的檢索詞輸入框（查詢提問框）內(nèi)輸入一個單詞或詞組，提交檢索工具查詢的一種檢索方式。基本檢索說明基本檢索說明檢索字段基本檢索復合檢索（CombineSearch)也稱布爾邏輯組配檢索（BooleanSearch)，或簡稱組配檢索。復合檢索指在任意字段情況下在檢索詞輸入框中輸入復合邏輯檢索式提交檢索工具查詢的一種檢索方式。高級檢索(AdvancedSearch)高級檢索指在已設(shè)定的高級檢索窗口中輸入多個檢索詞，運用邏輯組配關(guān)系，查找同時滿足多個檢索條件的數(shù)據(jù)，在高級檢索界