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文檔簡介
新版PubMed檢索新版PubMed檢索新版PubMed檢索PubMed及NCBI相關(guān)數(shù)據(jù)庫PubMed數(shù)據(jù)范圍認(rèn)識新版PubMedPubMed檢索方法PubMedRSS學(xué)科跟蹤新版PubMed檢索PubMed及相關(guān)數(shù)據(jù)庫NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation,美國國立生物技術(shù)信息中心)NCBI是目前國際上幾個(gè)重要分子生物信息網(wǎng)站之一,其成立的原因是為已故的參議院議員ClaudePepper發(fā)現(xiàn)計(jì)算信息處理方法對生物醫(yī)學(xué)研究的重要性,因此,在1988年11月4日成立NCBI。NCBI是NationalInstitutesofHealth(NIH)底下的NationalLibraryofMedicine(NLM)的部門之一。由于NLM具有建立與維護(hù)生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫經(jīng)驗(yàn),且因它是NIH的單位,因此可執(zhí)行計(jì)算分子生物計(jì)劃。NIH目前是全世界最大的生物醫(yī)學(xué)研究單位。NCBI成立的主要任務(wù)為:提供生物醫(yī)學(xué)的分析與計(jì)算工具,協(xié)助研究人員了解生物的語言--DNA在健康與疾病中所扮演的角色發(fā)展新技術(shù)協(xié)助了解調(diào)控健康與疾病的基本分子與遺傳過程,包括建立儲存與分析分子生物、生化與遺傳學(xué)知識的自動(dòng)系統(tǒng);促進(jìn)研究與醫(yī)學(xué)社群使用數(shù)據(jù)庫與軟件;協(xié)調(diào)生物技術(shù)信息的傳遞與管理;執(zhí)行以計(jì)算機(jī)為基礎(chǔ)的進(jìn)階信息分析過程,用以分析生物重要分子的結(jié)構(gòu)與功能。新版PubMed檢索NCBI組織架構(gòu)ComputationalBiologyBranch(CBB)InformationEngineeringBranch(IEB)InformationResourcesBranch(IRB)新版PubMed檢索NCBI組織架構(gòu)ComputationalBiologyBranch(CBB)處理運(yùn)算、數(shù)學(xué)及分子生物、生物與遺傳學(xué)理論問題的基礎(chǔ)與應(yīng)用研究,包括基因體分析、序列比對、序列搜尋方法、巨分子結(jié)構(gòu)、動(dòng)力學(xué)與交互作用、結(jié)構(gòu)/功能預(yù)測等。建立NIH實(shí)驗(yàn)室、政府機(jī)構(gòu)、學(xué)術(shù)單位與產(chǎn)業(yè)界之生物學(xué)家、化學(xué)家、數(shù)學(xué)家與計(jì)算機(jī)科學(xué)家間的計(jì)算分子生物合作研究計(jì)劃。提供研究分子生物分析工具的咨詢與建議。與分子生物社群互動(dòng),利用計(jì)算與理論方法提高實(shí)驗(yàn)研究質(zhì)量。新版PubMed檢索NCBI組織架構(gòu)InformationEngineeringBranch(IEB)進(jìn)行數(shù)據(jù)表現(xiàn)與分析的應(yīng)用研究,包括在分子生物、遺傳學(xué)與生物化學(xué)的計(jì)算機(jī)儲存、管理與檢索系統(tǒng)。設(shè)計(jì)各種呈現(xiàn)分子生物信息的數(shù)據(jù)庫架構(gòu)與規(guī)格書,包括核酸、蛋白質(zhì)與結(jié)構(gòu)信息。設(shè)計(jì)與發(fā)展分布式軟件系統(tǒng),提供研究人員本機(jī)與遠(yuǎn)程的計(jì)算服務(wù)。協(xié)調(diào)公開序列、遺傳、結(jié)構(gòu)、目錄信息,建立管理與整合數(shù)據(jù)庫或連結(jié)至外部數(shù)據(jù)庫。建立NIH內(nèi)部與外部學(xué)術(shù)單位的信息學(xué)合作研究計(jì)劃。提供軟件與數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)咨詢與建議。發(fā)展與提倡數(shù)據(jù)庫、數(shù)據(jù)交換與生物命名的標(biāo)準(zhǔn)。新版PubMed檢索NCBI組織架構(gòu)InformationResourcesBranch(IRB)計(jì)劃、監(jiān)督與管理NCBI的計(jì)算機(jī)技術(shù)操作,包含用來研究、發(fā)展與存取公開數(shù)據(jù)庫的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)。提供NCBI人員與外來使用者技術(shù)支持。提供NCBI服務(wù)之網(wǎng)絡(luò)操作指導(dǎo)。規(guī)劃使用NCBI資源的教育訓(xùn)練與研討會。計(jì)劃、發(fā)展與管理政府合約與合作協(xié)議書,已獲得支持NCBI信息功能的設(shè)備與服務(wù)。作為基因體計(jì)劃使用者與服務(wù)辦事處之聯(lián)絡(luò)人。執(zhí)行應(yīng)用研究與發(fā)展,提供技術(shù)支持與指導(dǎo),鑒定使用者需求;管理生物使用社群之問卷調(diào)查,以評估NCBI發(fā)展的軟件使用情形。協(xié)調(diào)政府其它辦事處與生物信息資源,促進(jìn)NCBI數(shù)據(jù)儲存的發(fā)展。新版PubMed檢索NCBI組織架構(gòu)NCBI還有一個(gè)跨多學(xué)科的基礎(chǔ)研究群,組成人員包括計(jì)算機(jī)科學(xué)家、分子生物學(xué)家、數(shù)學(xué)家、生化學(xué)家與物理學(xué)家,共同致力于計(jì)算分子生物的基礎(chǔ)與應(yīng)用研究。他們一起研究利用數(shù)學(xué)與計(jì)算機(jī)方法解決分子層面的基本生物醫(yī)學(xué)問題,這些問題包含了基因結(jié)構(gòu)偵測與分析、序列分析、立體結(jié)構(gòu)預(yù)測、重復(fù)序列類型(Pattern)、建立基因體圖譜、HIV感染動(dòng)力學(xué)的數(shù)學(xué)模型、分析序列錯(cuò)誤對數(shù)據(jù)庫搜尋的影響、發(fā)展數(shù)據(jù)庫搜尋與多重序列比對的新算法、建立無重復(fù)的序列數(shù)據(jù)庫、使用數(shù)學(xué)模型評估序列相似性在統(tǒng)計(jì)學(xué)上的重要性、建立文章檢索的載體(Vector)模型等。除此之外,這些研究人員尚與NIH的研究單位、學(xué)術(shù)單位的研究實(shí)驗(yàn)室與政府機(jī)構(gòu)的研究實(shí)驗(yàn)室間維持合作關(guān)系,目前仍有多項(xiàng)研究計(jì)劃正在進(jìn)行當(dāng)中。新版PubMed檢索NCBI資源NCBI目前提供的生物信息資源主要分為生物數(shù)據(jù)庫生物信息工具新版PubMed檢索NCBI資源生物數(shù)據(jù)庫生物數(shù)據(jù)庫是一個(gè)永久數(shù)據(jù)的大的組織體,通常結(jié)合計(jì)算機(jī)軟件執(zhí)行更新、查詢與存取數(shù)據(jù)的功能。對于研究人員而言,數(shù)據(jù)庫必須符合:容易取得信息以及只取得回答特殊生物問題的信息兩項(xiàng)功能。NCBI的數(shù)據(jù)庫搜尋與存取系統(tǒng)-Entrez,可用來獲取單一數(shù)據(jù)庫或許多數(shù)據(jù)庫的整合數(shù)據(jù)。例如Entrez蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫除了可查詢蛋白質(zhì)信息,同時(shí)亦可連結(jié)到生物分類數(shù)據(jù)庫查詢生物分類信息。目前,NCBI提供的公開(OpenAccess)數(shù)據(jù)庫包括如下:新版PubMed檢索新版PubMed檢索Entrez以及BLASTEntrez是NCBI的為用戶提供整合的訪問序列,定位,分類,和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的搜索和檢索系統(tǒng)。Entrez同時(shí)也提供序列和染色體圖譜的圖形視圖。Entrez是一個(gè)用以整合NCBI數(shù)據(jù)庫中信息的搜尋和檢索工具。這些數(shù)據(jù)庫包括核酸序列,蛋白序列,大分子結(jié)構(gòu),全基因組,和通過PubMed檢索的MEDLINE。Entrez的一個(gè)強(qiáng)大和獨(dú)特的特點(diǎn)是檢索相關(guān)的序列,結(jié)構(gòu)和參考文獻(xiàn)的能力。PubMed是一個(gè)網(wǎng)絡(luò)搜索界面,可以提供對在MEDLINE上的九百萬雜志引用的訪問,包含了鏈接到參與的出版商網(wǎng)絡(luò)站點(diǎn)的全文文章。BLAST是一個(gè)NCBI開發(fā)的序列相似搜索程序,還可作為鑒別基因和遺傳特點(diǎn)的手段。BLAST能夠在小于15秒的時(shí)間內(nèi)對整個(gè)DNA數(shù)據(jù)庫執(zhí)行序列搜索。NCBI提供的附加的軟件工具有:開放閱讀框?qū)ひ捚鳎∣RFFinder),電子PCR,和序列提交工具,Sequin和BankIt。所有的NCBI數(shù)據(jù)庫和軟件工具可以從HTTP或FTP來獲得。新版PubMed檢索Entrez可以檢索的數(shù)據(jù)庫Books出版社提供之?dāng)?shù)字生醫(yī)圖書與醫(yī)生參考書籍?dāng)?shù)據(jù)庫CancerChromosomes美國國立癌癥研究所的MitelmanDatabaseofChromosomeAberrationsinCancer數(shù)據(jù)庫里已經(jīng)整合好的cytogenetic、臨床與文獻(xiàn)相關(guān)數(shù)據(jù)ConservedDomainDatabase(CDD),蛋白質(zhì)功能區(qū)塊保留序列數(shù)據(jù)庫3DDomains,蛋白質(zhì)功能區(qū)塊立體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)Gene,包含許多物種的基因數(shù)據(jù)庫Genome,包含超過800種物種的基因組數(shù)據(jù)庫GENSAT,小鼠中樞神經(jīng)系統(tǒng)基因表現(xiàn)圖譜GEODatasets,基因表現(xiàn)實(shí)驗(yàn)與生物芯片數(shù)值結(jié)果數(shù)據(jù)GEOProfiles,基因表現(xiàn)圖譜HomoloGene,同源基因批注數(shù)據(jù)庫Journals,期刊文獻(xiàn)(包含PubMed)MeSH,醫(yī)學(xué)主題詞數(shù)據(jù)庫NCBIWebSite,所有NCBI網(wǎng)頁NLMCatalog,美國國立醫(yī)學(xué)圖書館館藏書目、期刊、視聽數(shù)據(jù)目錄Nucleotidesequencedatabase,核酸序列數(shù)據(jù)庫(包含GenBank、RefSeq和PDB等三大序列數(shù)據(jù)庫)新版PubMed檢索Entrez可以檢索的數(shù)據(jù)庫OnlineMendelianInheritanceinMan(OMIM),人類遺傳疾病相關(guān)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫PopSet,族群演化分析相關(guān)研究資料Proteinsequencedatabase,蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(包含Swiss-Prot、PIR、PRF、PDB等數(shù)據(jù)庫與從GenBank、RefSeq核酸序列轉(zhuǎn)譯之蛋白質(zhì)序列資料)PubChemBioAssay,化學(xué)成分之生物活性篩選資料PubChemCompound,小分子化學(xué)物質(zhì)結(jié)構(gòu)PubChemSubstance,具生物活性之化學(xué)物質(zhì)篩選數(shù)據(jù)PubMed,科學(xué)文獻(xiàn)報(bào)導(dǎo)數(shù)據(jù)庫PubMedCentral,科學(xué)文獻(xiàn)數(shù)字全文數(shù)據(jù)庫SiteSearch,可搜尋NCBI的網(wǎng)頁與FTPSNP,單點(diǎn)核酸多樣性數(shù)據(jù)庫(dbSNP)Structure,分子模型數(shù)據(jù)(MMDB)Taxonomy,以核酸或蛋白質(zhì)為基礎(chǔ)的分類學(xué)信息UniGene,人類unique基因序列數(shù)據(jù)庫UniSTS,unique序列卷標(biāo)地址數(shù)據(jù)庫新版PubMed檢索PubMed數(shù)據(jù)范圍數(shù)據(jù)類型:期刊論文、綜述以及與其他數(shù)據(jù)資源鏈接。特點(diǎn):免費(fèi)提供題錄和文摘提供與原文的網(wǎng)址鏈接(部分免費(fèi)獲?。┨峁z索詞自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配操作簡便、快捷新版PubMed檢索PubMed數(shù)據(jù)范圍MEDLINE4800余種生物醫(yī)學(xué)期刊,內(nèi)容涉及醫(yī)學(xué)、護(hù)理、牙科、獸醫(yī)、健康保健系統(tǒng)、前臨床醫(yī)學(xué)等學(xué)科。這些期刊來源于美國和世界上70多個(gè)國家和地區(qū)。文獻(xiàn)量達(dá)1千2百多萬條記錄,并回溯到1966年。記錄中用[PubMed-indexedforMEDLINE]標(biāo)記表示[注]截止2006年3月15日PubMed公布的數(shù)據(jù)新版PubMed檢索Inprocesscitation提供MEDLINE尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。獲MeSH詞后,再加入MEDLINE。記錄中用[PubMed-inprocess]標(biāo)記表示。新版PubMed檢索PublisherSuppliedCitations出版商直接向PubMed提供電子記錄包括MEDLINE未收錄的部分記錄記錄中用[PubMed-assuppliedbypublisher]標(biāo)記表示。新版PubMed檢索OldMedline1950-1965年間發(fā)表的200多萬篇文獻(xiàn)沒有MeSH字段和摘要記錄中用[PubMed-OLDMEDLINEforPre1966]標(biāo)記表示。新版PubMed檢索PubMednotMedlinePubMed收錄Medline不收錄的文獻(xiàn)。記錄中用[PubMed]標(biāo)記表示。新版PubMed檢索PreMedlinePubMedMedline新版PubMed檢索PubMed與MEDLINE的區(qū)別收錄范圍廣:MEDLINE收錄的部分生命科學(xué)相關(guān)文章的非醫(yī)學(xué)專業(yè)期刊(物理、天文、化學(xué)等)收錄記錄新:在MEDLINE數(shù)據(jù)標(biāo)引前的最新題錄文獻(xiàn)類型全:提供電子原文鏈接(部分免費(fèi))新版PubMed檢索認(rèn)識新版PubMedPubMed首頁P(yáng)ubMed檢索結(jié)果頁P(yáng)ubMed結(jié)果顯示PubMed摘要顯示新版PubMed檢索新版PubMed特色:簡潔、清新檢索速度較快新版PubMed檢索常用工具WelcometoPubMed使用幫助更多服務(wù)檢索詞輸入框新版PubMed檢索出處SO篇名TI作者AU文獻(xiàn)類型(狀態(tài))Summary結(jié)果篩選檢索提示認(rèn)識新版PubMed新版PubMed檢索認(rèn)識新版PubMed調(diào)整顯示設(shè)置可改變顯示模式,顯示數(shù)量及檢索結(jié)果排序顯示設(shè)置顯示摘要顯示數(shù)量排序模式新版PubMed檢索在摘要顯示模式下可以看到詳細(xì)的文獻(xiàn)信息作者地址文獻(xiàn)摘要文獻(xiàn)作者文獻(xiàn)篇名全文鏈接文獻(xiàn)類型文獻(xiàn)主題詞認(rèn)識新版PubMed新版PubMed檢索出版社上傳PreMedlinePubMedMedlinePubMed數(shù)據(jù)庫收錄的文獻(xiàn)的狀態(tài),主要為Medline相關(guān)數(shù)據(jù)庫檢索檢索詳情認(rèn)識新版PubMed新版PubMed檢索非英文的文獻(xiàn)篇名上有中括號[]且注明有語種英文文獻(xiàn)土耳其語[篇名]英文文獻(xiàn)認(rèn)識新版PubMed新版PubMed檢索電子優(yōu)先即最新文獻(xiàn),一般比印刷出版提前三個(gè)月以上電子優(yōu)先2009年5月2008年9月認(rèn)識新版PubMed新版PubMed檢索PubMed檢索方法PubMed基本檢索PubMed高級檢索PubMed限定檢索PubMed主題檢索臨床查詢檢索PubMed全文獲取新版PubMed檢索
PubMed基本檢索在檢索框中鍵入一個(gè)或多個(gè)英文單詞(大寫或小寫均可),點(diǎn)擊GO按鈕,PubMed系統(tǒng)會自動(dòng)在主題詞表,期刊名表,短語表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式,這就是它特有的“自動(dòng)詞匯匹配功能”。例如:檢索腫瘤(cancer)方面的文章。在檢索框中輸入:“cancer”,再點(diǎn)擊“Go”按鈕。PubMed將自動(dòng)地利用它的“自動(dòng)詞匯匹配”功能將重要的詞語結(jié)合在一起,并將不規(guī)范的詞語轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中規(guī)范的用詞進(jìn)行檢索,比如,檢索“cancer”將自動(dòng)轉(zhuǎn)換為:"neoplasms"[MeSHTerms]OR"neoplasms"[AllFields]OR"cancer"[AllFields]新版PubMed檢索自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配:
PubMed對輸入檢索框中的檢索詞進(jìn)行智能化地校對,將其逐步地與其數(shù)據(jù)庫中的各類術(shù)語匹配的原則。MeSHTranslationTable主題詞注釋表JournalsTranslationTable期刊注釋表CommonPhraseList常用詞組表AuthorIndex作者索引表NoMapping檢索詞拆分AND新版PubMed檢索自由詞檢索時(shí)PubMed自動(dòng)將不規(guī)范的詞轉(zhuǎn)換成規(guī)范的詞進(jìn)行檢索自動(dòng)詞匯轉(zhuǎn)換PubMed基本檢索新版PubMed檢索布爾邏輯組合檢索,常用的邏輯關(guān)系詞有AND,OR,NOT等ABAB
邏輯與(AND)--檢出記錄中同時(shí)含有檢索詞A和檢索詞B.
如:AANDB
邏輯非(NOT)--在含檢索詞A的記錄中,去掉含檢索詞B的記錄。如:ANOTB
邏輯或(OR)--檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B或同時(shí)含有檢索詞A和B的文獻(xiàn)。如:AORBABPubMed基本檢索新版PubMed檢索
作者姓名檢索按照姓+名縮寫(不用標(biāo)點(diǎn))的格式鍵入作者姓名,如:smithja或jonesk,系統(tǒng)會自動(dòng)在作者字段內(nèi)進(jìn)行檢索。姓名第一個(gè)字母可用大寫也可用小寫,姓前名后,姓用全稱,名字一般用縮寫??紤]到作者姓名的不同形式,PubMed采用自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能進(jìn)行作者姓名檢索,如:smithj將檢索成smithja,smithjb,smithjr等。精確檢索:可以用雙引號將作者名引起來,再加作者字段限定[AU],如:"smithj"[au],這樣可避免PubMed自動(dòng)轉(zhuǎn)換,實(shí)現(xiàn)精確查找。PubMed基本檢索新版PubMed檢索作者姓名檢索按照姓(全寫)+名(縮寫),之間不用標(biāo)點(diǎn)鍵入作者姓名smithjPubMed基本檢索新版PubMed檢索精確檢索避免PubMed自動(dòng)詞匯轉(zhuǎn)換,實(shí)現(xiàn)精確查找"smithj"[au]PubMed基本檢索新版PubMed檢索期刊檢索在檢索框中鍵入期刊名,如:molecularbiologyofthecell,系統(tǒng)的“自動(dòng)詞語匹配”功能會將它轉(zhuǎn)換成molbiolcell[journal]進(jìn)行檢索。也可以直接輸入Medline的期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式,如:molbiolcell,或者是輸入刊物的ISSN(國際標(biāo)準(zhǔn)出版物代碼)進(jìn)行檢索,如:1059-1524。如果一個(gè)雜志名恰好是主題詞或關(guān)鍵詞,如:cancer,science,cell等,PubMed會首先將這些詞轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中的主題詞進(jìn)行檢索。因此,需要將檢索請求進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理,即在雜志名后面加[TA]。如:"cell"[ta]PubMed基本檢索新版PubMed檢索期刊的一般檢索,是在檢索輸入框中鍵入期刊名或期刊的ISSN號EurJImmunolPubMed基本檢索新版PubMed檢索期刊的標(biāo)準(zhǔn)檢索,是在期刊名后面加字段限定[TA].比如:"cell"[ta]"cell"[ta]PubMed基本檢索新版PubMed檢索期刊數(shù)據(jù)庫(journaldatabase)期刊數(shù)據(jù)庫的作用:1、可以查看期刊的詳細(xì)信息,包括出版國家,出版社,出版語言,期刊類目等等;2、可以根據(jù)期刊的主題分類,查看medline收錄的各學(xué)科的期刊,比如查看medline收錄的關(guān)于麻醉學(xué)(Anesthesiology)方面的期刊;2、方便檢索某本期刊上被PubMed收錄的所有文章。比如:我們想知道期刊AcadPediatr的全稱以及具體的出版社,以方便投稿,如何查?操作方法:點(diǎn)擊導(dǎo)航欄上的Journaldatabase,打開期刊數(shù)據(jù)庫檢索界面,在檢索框中輸入AcadPediatr,再點(diǎn)擊Go按鈕即可。PubMed基本檢索新版PubMed檢索期刊數(shù)據(jù)庫在PubMed首頁導(dǎo)航欄的右下角部分期刊數(shù)據(jù)庫PubMed基本檢索新版PubMed檢索期刊數(shù)據(jù)庫可以查看指定期刊的詳細(xì)信息Elsevier出版期刊數(shù)據(jù)庫PubMed基本檢索新版PubMed檢索按期刊主題瀏覽medline收錄的各學(xué)科的期刊期刊主題期刊數(shù)據(jù)庫PubMed基本檢索新版PubMed檢索按字母順序?yàn)g覽medline收錄的各學(xué)科期刊麻醉學(xué)方面PubMed基本檢索新版PubMed檢索期刊數(shù)據(jù)庫可以方便的查看medline收錄的各學(xué)科方面的期刊medline收錄的麻醉學(xué)方面的期刊PubMed基本檢索新版PubMed檢索
截詞檢索截詞檢索的作用:擴(kuò)大檢索范圍,提高查全率。截詞符:用*表示,代表多個(gè)字符,將*加在檢索詞后可以表示對所有以該詞開頭的詞進(jìn)行檢索。如:bacter*,可以檢出bacter,bacteria,bacteriophage,bacterium,等最多600個(gè)單詞。PubMed基本檢索新版PubMed檢索截詞檢索可以擴(kuò)大檢索范圍提高查全率。bacter*[TI]PubMed基本檢索新版PubMed檢索字段限制檢索采用字段限制方式進(jìn)行檢索,其規(guī)則是:檢索詞1[字段標(biāo)識]邏輯運(yùn)算符檢索詞2[字段標(biāo)識]如:查找作者為crick在1993年發(fā)表的有關(guān)DNA方面的文獻(xiàn).檢索式:DNA[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]PubMed基本檢索新版PubMed檢索字段限制檢索其規(guī)則是:檢索詞+[字段標(biāo)識]
DNA[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]PubMed基本檢索新版PubMed檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識Title[ti]:篇名字段Abstract[ab]:摘要字段Affiliation[ad]:著者地址字段。Authorname[au]:文章的作者,檢索格式:姓+名。如:"smithja"[au]Journaltitle[ta]:期刊名稱。如:cell[ta]Language[la]:論文出版語種。語種檢索時(shí)可只輸入前3個(gè)字母,如:chi[la]=chinese[la];English[lang]=eng[la]比如:檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻(xiàn)檢索式:hypertension[ti]ANDchi[la]PubMed基本檢索新版PubMed檢索hypertension[ti]ANDchi[la]檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻(xiàn)PubMed基本檢索新版PubMed檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識Publicationdate[dp]:出版日期指論文所在期刊的出版日期日期檢索的形式為:YYYY/MM/DD[DP]要檢索一段時(shí)期內(nèi)的文章,日期之間可以加冒號,如:1993/01:1995/06[DP]Publicationtype[pt]:出版類型。有綜述,新聞,傳記,臨床試驗(yàn)等。如:review[pt]MeSHterms[mh]:主題詞字段。如:hypertension[mh]Subheadings[sh]:副主題詞。與主題詞組配檢索.比如:檢索1995年到1996年出版的關(guān)于高血壓方面的綜述性文獻(xiàn)。hypertension[mh]AND1995/01:1996/12[DP]ANDreview[pt]PubMed基本檢索新版PubMed檢索檢索1995年到1996年出版的關(guān)于高血壓方面的綜述性文獻(xiàn)hypertension[mh]AND1995/01:1996/12[DP]ANDreview[pt]PubMed基本檢索新版PubMed檢索強(qiáng)制檢索功能PubMed允許使用雙引號來強(qiáng)制系統(tǒng)進(jìn)行短語檢索。如:在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“singlecell”,并用雙引號引起來。點(diǎn)擊“GO”按鈕,系統(tǒng)會將其作為一個(gè)不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進(jìn)行檢索。如果不使用雙引號進(jìn)行強(qiáng)制檢索,系統(tǒng)就會將其分成2個(gè)詞:single和cell檢索,其檢索表達(dá)式為:singleANDcell.很明顯這樣的檢索結(jié)果是不符號要求的。PubMed基本檢索新版PubMed檢索強(qiáng)制檢索普通檢索"singlecell"singlecellPubMed基本檢索新版PubMed檢索高級檢索PubMed高級檢索新版PubMed檢索PubMed高級檢索預(yù)覽檢索詳情檢索史高級檢索界面下可以看到明細(xì)欄,預(yù)覽,檢索史,限定和組合檢索等姚開泰院士2001年以來被Medline收錄的文獻(xiàn)新版PubMed檢索PubMed限定檢索限定檢索范圍為發(fā)表在臨床核心期刊上的有全文鏈接的英文文獻(xiàn)出版時(shí)間臨床核心期刊限定為英文Limit限定有全文鏈接文獻(xiàn)類型年齡段新版PubMed檢索PubMed主題檢索《醫(yī)學(xué)主題詞表》數(shù)據(jù)庫(MeSHDatabase)
《醫(yī)學(xué)主題詞表》是對生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行主題分析、標(biāo)引和檢索的權(quán)威性詞表,它的作用是使醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的主題標(biāo)引和檢索達(dá)到統(tǒng)一和一致,并指導(dǎo)用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)。它可以指導(dǎo)用戶從同義詞發(fā)現(xiàn)主題詞,告訴用戶主題詞如何使用,顯示主題詞之間的相互關(guān)系。新版PubMed檢索《醫(yī)學(xué)主題詞表》數(shù)據(jù)庫(MeSHDatabase)利用主題詞進(jìn)行檢索方法:1、點(diǎn)擊主頁右下角的MeSHDatabase進(jìn)入主題詞檢索界面;2、輸入檢索詞后,點(diǎn)擊go按鈕,系統(tǒng)將顯示與該詞有關(guān)主題詞;3、點(diǎn)擊該主題詞進(jìn)一步顯示該主題詞的定義、樹狀結(jié)構(gòu)、組配的副主題詞;4、選擇合適的主題詞與副主題詞后,點(diǎn)擊sendto按鈕,進(jìn)入檢索表達(dá)式瀏覽窗口;5、點(diǎn)擊SearchPubMed將顯示檢索結(jié)果。PubMed主題檢索新版PubMed檢索主題詞數(shù)據(jù)庫在PubMed首頁導(dǎo)航欄的右下角主題詞數(shù)據(jù)庫PubMed主題檢索新版PubMed檢索輸入普通詞查找對應(yīng)主題詞MeSH主題詞檢索可以指導(dǎo)用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)PubMed主題檢索新版PubMed檢索一般一個(gè)主題詞還要配合一個(gè)副主題詞進(jìn)行組合檢索選擇副主題詞PubMed主題檢索新版PubMed檢索SearchBoxwithAND點(diǎn)Sentto將檢索詞添加到檢索表達(dá)式瀏覽窗口PubMed主題檢索新版PubMed檢索SearchPubMed主題詞檢索可以達(dá)到比較滿意的查全率和查準(zhǔn)率PubMed主題檢索新版PubMed檢索主題詞檢索是在有主題標(biāo)引的Medline數(shù)據(jù)庫中檢索主題詞檢索結(jié)果PubMed主題檢索新版PubMed檢索普通詞不是規(guī)范化的主題詞檢索結(jié)果相關(guān)度低普通詞檢索結(jié)果PubMed主題檢索新版PubMed檢索PubMed記錄字段說明文摘第一著者單位地址出版商提供文獻(xiàn)識別號著者群版權(quán)說明參考評論文獻(xiàn)合著者文獻(xiàn)參考評論定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期新版PubMed檢索電子出版日期文獻(xiàn)出版日期數(shù)據(jù)加入PubMed日期文獻(xiàn)勘誤參考文獻(xiàn)勘誤全部著者姓名全部調(diào)研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻(xiàn)相關(guān)注釋基金編號基因符號期編號資助調(diào)研者資助調(diào)研單位國際標(biāo)準(zhǔn)期刊號美國立醫(yī)學(xué)圖書館識別號期刊全稱新版PubMed檢索最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權(quán)擁有者題錄提供機(jī)構(gòu)的識別號病史相關(guān)與原始記錄其他關(guān)鍵詞提供其他關(guān)鍵詞的機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)提供者機(jī)構(gòu)文章總頁數(shù)出版商提供數(shù)據(jù)時(shí)間期刊出版國數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)編號新版PubMed檢索作為主題詞的個(gè)人姓名出版狀態(tài)文獻(xiàn)類型出版模式(紙張或電子)參考文獻(xiàn)數(shù)已撤回的文獻(xiàn)酶或化學(xué)物質(zhì)代碼正在撤消中的文章初版文獻(xiàn)修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的數(shù)據(jù)二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻(xiàn)內(nèi)部處理代碼新版PubMed檢索臨床查詢檢索
“Clinicalqueries”是專門為臨床醫(yī)生研究設(shè)計(jì)的內(nèi)置的臨床方法學(xué)“過濾器”(ClinicalMethodologyFilters),這組檢索策略模型是由加拿大臨床流行病學(xué)和生物統(tǒng)計(jì)學(xué)研究人員HaynesRB等人在1994年提出來的,并進(jìn)行了查全率和查準(zhǔn)率分析。用戶通過這一臨床方法學(xué)檢索過濾器,不需掌握復(fù)雜的檢索策略,即可檢索所需的臨床研究文獻(xiàn)。新版PubMed檢索
使用方法:1、點(diǎn)擊主頁左側(cè)導(dǎo)航欄的ClinicalQueries進(jìn)入臨床查詢頁面;2、在檢索框中輸入檢索詞,并選擇副主題詞組配,指定檢索結(jié)果是查全(sensitive),還是查準(zhǔn)(specific);3、點(diǎn)擊GO按鈕執(zhí)行檢索。例如:檢索“鼻咽癌nasopharyngealcancer治療方面的研究文獻(xiàn)”臨床查詢檢索新版PubMed檢索臨床查詢在PubMed首頁導(dǎo)航欄的中間部分臨床查詢臨床查詢檢索新版PubMed檢索臨床查詢主要用于檢索臨床方面的研究文獻(xiàn)臨床查詢檢索臨床查詢檢索新版PubMed檢索臨床查詢主要包括某種疾病的治療,診斷病因和預(yù)后四個(gè)方面檢索結(jié)果臨床查詢檢索新版PubMed檢索PubMed全文獲取
通過PubMed檢索出來的文獻(xiàn),部分我們通過瀏覽摘要即可,部分我們還需要查看全文,以作進(jìn)一步的研究,那么,我們?nèi)绾潍@取全文呢?一:免費(fèi)的全文新版PubMed檢索PubMed收錄的文獻(xiàn)大約有10%是免費(fèi)的可以直接打開全文免費(fèi)全文可直接打開PubMed全文獲取新版PubMed檢索打開PDF全文免費(fèi)的全文并不代表學(xué)術(shù)價(jià)值低,大部分的生命科學(xué)的全文都是免費(fèi)的PubMed全文獲取新版PubMed檢索二:學(xué)校已訂購的全文如果我們所
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