PubMed檢索完全攻略

PubMed檢索完全攻略免疫細胞研究bioworld微信號antibody-king新朋友點圖片上方藍字免疫細胞研究bioworld關(guān)注，統(tǒng)計你探索生命科學(xué)的軌跡，分享科研旅途中的點點滴滴。第一章進入PubMed魔法學(xué)校--PubMed概述有位退休的老專家不止一次的向我感慨：'你們現(xiàn)在真是幸福，我們那時候要查一篇有關(guān)的文獻，要到圖書館一本一本目錄去檢索。特別是做某些別人不太做的課題時，要收集幾篇有用的文獻，竟要花上3，4個月時間，而你們現(xiàn)在……。'趁他打頓的時候，我告訴他，'快的話，可能只要3秒鐘'。從他兩個厚厚的酒瓶底背面露出一絲羨慕的眼神。我能夠想見他當(dāng)時在一大堆期刊中埋頭查閱的情形，但對于現(xiàn)在的醫(yī)學(xué)工作者來說，我已經(jīng)無法想像，如果我們失去PubMed，世界將會如何。盡管在因特網(wǎng)上，類似于PubMed的醫(yī)學(xué)文獻檢索系統(tǒng)并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。尚有非常重要的一點，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的,PubMed是免費向公眾開放的。無論何時何地，你只要在瀏覽器地址欄中輸入：。俗話說，喝水不忘掘井人。PubMed是美國國家醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)所屬的國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的因特網(wǎng)生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng)，位于美國國立衛(wèi)生研究院（NIH）的平臺上。有不少西方人有在飯前祈禱感恩的習(xí)慣，不懂得我們與否也有必要每次使用PubMed前都感謝NCBI呢？PubMed覆蓋了全世界70多個國家4300多個重要生物醫(yī)學(xué)期刊的摘要和部分全文。其覆蓋的時間段也非常長，早的能夠追溯到20世紀(jì)60年代，普通而言，這已經(jīng)足夠早了，極少有人會需要查閱在此之前的文獻。固然，碩士物醫(yī)學(xué)史的工作者可能是個例外。而最新的文獻幾乎就在此時此刻。與PubMed掛鉤的出版商會自動向PubMed提供最新的文獻摘要，而往往在這個時候文獻還沒有正式出版。因此盡管生物醫(yī)學(xué)的文章從被期刊接受到出版往往要好幾個月的時間，但借助于PubMed，我們?nèi)耘f能夠隨時掌握最新的動向，從而大大有助于自己的臨床和研究工作。尚有些出版商通過PubMed提供文獻的全文，有時甚至是免費的，這樣，我們就能夠在PubMed上真正享有'坐擁書城'的感覺了（有關(guān)如何獲取全文將在后來的章節(jié)中詳述）。進入PubMed的主界面后，首先映入我們眼簾的就是頁面上方的檢索框和功效鍵（以下圖）。這是PubMed的核心部分。大部分工作，我們只要運用這'一框五鍵'（檢索框，Limit鍵,Preview/Index鍵,History鍵，Clipboard鍵和Details鍵）即可完畢。在主界面的左側(cè)框（如左圖），有：·JournalBrowser期刊瀏覽·MeShBrowser能夠用它來分層流覽MeSH表·SingleCitationMatcher輸入期刊的信息能夠找到某單篇的文獻或整個期刊的內(nèi)容?！atchCitutionMatcher用一種特定的形式輸入期刊的信息一次搜索多篇文獻?！linicalQueries這一部分為臨床醫(yī)生設(shè)立，通過過濾的方式將搜索的文獻固定在4個范疇：治療、診療、病原學(xué)與預(yù)后?！ldPubMed(使用舊式的PubMed查詢方式)3)RelatedResources·OrderDocuments能夠使顧客在本地得到文獻的全文，但這是要收費的，至于如何免費獲得文獻全文，我將在背面的有關(guān)章節(jié)中詳述?！ratefulMed是對另一種NLM基于網(wǎng)絡(luò)的查詢系統(tǒng)的鏈接。GratefulMed也提供MEDLINE的接入，并且尚有某些其它的數(shù)據(jù)庫如AIDSLINE、HISTLINE等等?！onsumerHealth提供與MEDLINEplus的鏈接，MEDLINEplus是與消費者健康信息有關(guān)的國家醫(yī)學(xué)圖書館的網(wǎng)絡(luò)節(jié)點?！linicalAlerts此部分的目的是加緊NIH資助的臨床研究成果的公布。運用左側(cè)框的這些服務(wù)，我們不僅能夠進行功效更加強大的檢索，并且還能得到不少非常有用的服務(wù)。這些都將在后續(xù)章節(jié)中介紹?？傮w而言，PubMed的界面相稱簡潔清晰，幾乎是傻瓜式的。然而傻瓜式的界面并不意味著傻瓜式的操作。我看到諸多人用了幾年的PubMed，還是只懂得在檢索框里輸入一種核心字，然后按一下'Go'按鈕這樣一種單一原始的檢索方式。即使有二分之一左右的狀況，這樣的操作就足以得到令人滿意的信息，但對于另二分之一狀況，就沒有那么幸運了，要么你真正所需的信息湮沒在大量紛繁蕪雜的'無用'信息中，要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。令人費解的是，諸多醫(yī)務(wù)工作者寧可在每次檢索時都花上成倍的時間，卻不肯花上幾個小時的時間去認真研究一下PubMed。'君欲善其事，必先利其器'，PubMed就仿佛一把功效強大的槍，你決不能僅僅滿足于懂得扣動扳機就能夠發(fā)射子彈，更重要的是，你要懂得如何運用準(zhǔn)星瞄準(zhǔn)，如何把這把槍的功效發(fā)揮到及至。在后來的章節(jié)中，我們將逐步進一步地理解PubMed，相信通過這些章節(jié)的學(xué)習(xí)，我們能夠真正純熟掌握PubMed，從而使自己的工作事半功倍。第二章PUBMED簡樸檢索技巧一．在這一章里，我們將對如何應(yīng)用PUBMED這一得力助手檢索文獻，作以簡樸介紹。1．當(dāng)你打開瀏覽器，在地址欄內(nèi)鍵入://.gov/后，就進入了PUBMED檢索系統(tǒng)主頁,能夠見到以下的頁面。2．在靠近頁面上部的地方，首先映入我們眼簾的，即是供我們輸入所需查詢內(nèi)容的檢索框。在檢索框中輸入查詢詞，然后單擊'go'按鈕或按回車鍵，PubMed將會自動開始檢索，并將檢索到的有關(guān)條目顯示在屏幕上。在檢索框前面，你還能夠選定所要檢索內(nèi)容的數(shù)據(jù)庫范疇，除NCBI的數(shù)據(jù)庫以外，可供選擇的尚有：PROTEIN,STRUCTURE,POPSET等等。說到這里，諸多人可能覺得只需傻瓜式的輸入幾個字符然后回車一敲便可萬事大吉，其實否則。每個人搜索效率的高低往往存在很大差別。在這里提供下列建議僅供讀者參考：明確你索要檢索的核心概念及詞語，即核心字；考慮到核心字的類似說法，即有可能出現(xiàn)的同義詞；通過限定DATES,STUDYGROUP等，精煉你的檢索范疇；多向有經(jīng)驗的人討教，由于不同的專業(yè)背景以及個人的差別，都有可能形成不同的辦法和技巧。3．通過布爾（BOOLEAN）運算來提高你的效率最慣用的三種布爾運算即是AND,OR,和NOT。AND提供的運算方式即不管所輸入的兩個核心詞語所出現(xiàn)的位置在哪，只要他們都出現(xiàn)在索引文章的某一處，就將其列出。而OR則是將出現(xiàn)最少一種核心詞的文章列出，這種運算在想將相似主題的文章羅列在一起時，十分有效。NOT運算能夠在你的檢索范疇內(nèi)將某些不需要的部分除去。但是在使用的時候要特別注意，會有可能將某些你所需要的文章遺漏。例如當(dāng)你的檢索詞為LEADPOISONINGNOTCHILDREN時，除了會刪除掉那些僅討論小朋友的文章，同時也會刪去那些同時討論小朋友及其它年紀(jì)組的文章。4．PUBMED檢索類型普通我們所要查詢的單詞類型大致能夠分為：詞語（主題）檢索這時我們在PubMed主頁的檢索框中鍵入的是英文單詞或短語（大寫或小寫均可）。然后回車或點擊'Go'，PubMed即使用其詞匯自動轉(zhuǎn)換功效進行檢索，并將檢索成果直接顯示在主頁下方。例如：鍵入'vitaminccommoncold'后回車或點擊'Go'，PubMed開始檢索并將檢索成果顯示出來。著者檢索當(dāng)我們所要查詢的是著作者時，在檢索框中鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母縮寫，格式為：'著者姓空格名字首字母縮寫'，例如smithja，然后回車或點擊Go，系統(tǒng)會自動到著者字段去檢索，并顯示檢索成果?？麢z索在檢索框中鍵入刊名全稱或MEDLINE形式的簡稱、ISSN號，例如：molecularbiologyofthecell,或molbiolcell,或1059-1524，然后回車或點擊Go,系統(tǒng)將在刊名字段檢索，并顯示檢索成果。日期或日期范疇檢索能夠在檢索框中鍵入日期或日期范疇，然后回車或點擊Go，系統(tǒng)會按日期段檢索，并將符合條件的統(tǒng)計予以顯示。日期的錄入格式為YYYY/MM/DD；如：1999/09/08也能夠不錄月份和日子，如：或1999/12。檢索期刊子集（輯）檢索的格式為：檢索詞ANDjsubseta,如：neoplasmANDjsubseta?？晒z索的期刊子庫有3種：AbridgedIndexMedicus(有120種重要核心期刊)、Dental和Nursing。分別使用jsubseta,jsubsetd,jsubsetn進行限定。檢索帶文摘的統(tǒng)計檢索的格式為：檢索詞ANDhasabstract,如：livercancerANDhasabstract。要注意的是在1975年前出版的文章，其MEDLINE統(tǒng)計中沒有文摘。布爾邏輯檢索PubMed系統(tǒng)允許使用布爾邏輯檢索，只要在檢索框中鍵入布爾邏輯運算符（AND，OR或NOT）。具體使用時要注意的問題，詳見上第3點所述。5．如何解決檢索成果當(dāng)你點擊GO或回車后，PubMed將會自動運行檢索命令，在屏幕的下方顯示出符合檢索規(guī)定的項目，并且在查詢框內(nèi)保存原檢索詞。此時要注意的是符合檢索規(guī)定的項目是以SUMMARY（簡要格式）顯示出來的，就是列出作者，文章題目，以及文章來源的某些信息。在DISPLAY鍵后還能夠選擇別的顯示格式，點擊DISPLAY鍵后，系統(tǒng)按所選格式全部檢索成果。如果只需要顯示其中一部分統(tǒng)計，則需點擊該統(tǒng)計左邊的查詢框，使標(biāo)記后，再點擊Display鍵；如果只需顯示一條統(tǒng)計，則可直接點擊該統(tǒng)計中的作者姓名超鏈接，系統(tǒng)會自動顯示該統(tǒng)計的文摘格式。尚有一點，系統(tǒng)所設(shè)定的默認值為每頁顯示20條選項，這點能夠在SHOW后的下拉菜單處選擇。如果選