化學(xué)化工常用化學(xué)辦公軟件的分析與應(yīng)用

化學(xué)化工常用化學(xué)辦公軟件的分析與應(yīng)用

作為一種重要的化學(xué)教材和研究工具，計(jì)算機(jī)在當(dāng)今社會(huì)中起著不可替代的作用。在信息技術(shù)的快速發(fā)展中，有許多關(guān)于化學(xué)教材和化工的軟件，它們涵蓋了化學(xué)教材和化工的各個(gè)方面。它簡(jiǎn)要介紹了使用化學(xué)辦公軟件、圖紙、數(shù)據(jù)處理、圖像分析和其他軟件。有關(guān)化學(xué)辦公軟件市面上很多,各有其優(yōu)缺點(diǎn),當(dāng)前國(guó)內(nèi)外流行的ChemOffice系列軟件,美國(guó)劍橋公司最新版本ChemOfficeUltra2008是世界上最優(yōu)秀的桌面化學(xué)辦公軟件,集強(qiáng)大的應(yīng)用功能于一身,該軟件主要包括ChemDraw(化學(xué)繪圖),Chem3D(化學(xué)分子模擬及仿真)、ChemFinder(化學(xué)信息搜尋整合系統(tǒng))等一系列完整的軟件。此外還加入了E-NotebookUltra10.0,BioAssayPro10.0,量化軟件MOPAC、Gaussian和GAMESS的界面,ChemSAR,ServerExcel,CLogP,CombiChem/Excel等等,ChemOfficePro還包含了全套ChemInfo數(shù)據(jù)庫(kù),有ChemACX和ChemACX-SC,Merck索引和ChemMSDX。其中ChemDraw具有簡(jiǎn)單易懂、畫圖快、結(jié)構(gòu)精確特點(diǎn),是世界上最受歡迎的化學(xué)結(jié)構(gòu)繪圖軟件之一,是各種期刊雜志要求的化學(xué)結(jié)構(gòu)繪圖軟件,可以將化合物名稱直接轉(zhuǎn)為結(jié)構(gòu)圖,省去繪圖的麻煩;也可以對(duì)已知結(jié)構(gòu)的化合物命名,給出正確的化合物名稱;Chem3D分子輪廓及分子軌道特性分析,可以和多種離子化軟件結(jié)合使用;提供工作站級(jí)的3D分子輪廓圖及分子軌道特性分析,并和數(shù)種量子化學(xué)軟件結(jié)合在一起。由于Chem3D提供完整的界面及功能,已成為分子仿真分析最佳的前端開發(fā)環(huán)境。ChemFinde模塊-化學(xué)信息搜尋整合系統(tǒng),可以建立化學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)、儲(chǔ)存及搜索,或與ChemDraw、Chem3D聯(lián)合使用,也可以使用現(xiàn)成的化學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。ChemFinder是一個(gè)智能型的快速化學(xué)搜尋引擎,所提供的ChemInfo信息系統(tǒng)是目前世界上最豐富的數(shù)據(jù)庫(kù)之一,包含ChemACX、ChemINDEX、ChemRXN、ChemMSDX,并不斷有新的數(shù)據(jù)庫(kù)加入。ChemFinder可以從本機(jī)或網(wǎng)上搜尋Word、Excel、Powerpoint、ChemDraw和ISIS格式的分子結(jié)構(gòu)文件。還可以與微軟的Excel結(jié)合,可連結(jié)的關(guān)連式數(shù)據(jù)庫(kù)包括Oracle及Access,輸入的格式包括ChemDraw、MDLISISSD及RD文件。Visio2003是一種專業(yè)的化工繪圖軟件,它可以幫助用戶創(chuàng)建系統(tǒng)的業(yè)務(wù)和技術(shù)圖表,說明復(fù)雜的流程或設(shè)想,展示結(jié)構(gòu)或空間圖,此軟件可將用戶的信息形象化、并能簡(jiǎn)單有效的輸出。Visio2003中文版軟件可以直接讀入的圖件(筆者將圖形和圖像合稱為圖件)類型主要有vsd(Visio文件)、svg(可縮放的向量圖形)、dwg(AutoCAD繪圖)、jpg(JPEG文件交換格式)、tif(Tag圖像文件格式)、bmp(Windows位圖)、png(可移植網(wǎng)絡(luò)圖形)、gif(圖形交換格式)、emf(增強(qiáng)型圖元文件);但在實(shí)際操作中,由于不同版本軟件不完全兼容,并且許多作者常將各種類型的圖件混排于Word文檔中,而Visio與Word軟件之間具有良好的兼容性,所以常用“復(fù)制粘貼法”把圖件讀入到Visio中。此外,由于系統(tǒng)共用一個(gè)剪貼板,所以對(duì)于只能用其他專業(yè)軟件打開的圖件也可用“復(fù)制粘貼法”將選中的圖件直接讀入到Visio中,在任何圖件被讀入Visio后,右鍵點(diǎn)擊圖件,將指針指向快捷鍵對(duì)話框中的“形狀”,并在下一級(jí)選項(xiàng)中選擇“取消組合”,將該圖件各元素分開,以便于逐個(gè)編輯。Visio自帶的圖形模板庫(kù)繪制,點(diǎn)擊標(biāo)題欄中的“文件”指向“新建”,在其下一級(jí)選單中可看到各種模板,選中所需要的模板圖形,按住鼠標(biāo)左鍵直接將其拖曳到工作區(qū)界面,就可很方便地進(jìn)行繪制或修改各類圖件?；瘜W(xué)化工數(shù)據(jù)處理軟件種類繁多,不同的數(shù)據(jù)可采用不同的處理軟件,如Origin、SigmaPlot等,其中應(yīng)用最廣泛的是Origin系列,目前,Origin最新版本為8.0。該軟件主要特點(diǎn):使用簡(jiǎn)單,采用直觀的、圖形化的、面向?qū)ο蟮拇翱诓藛魏凸ぞ邫诓僮?全面支持鼠標(biāo)右鍵、支持拖方式繪圖等。兩大類功能:數(shù)據(jù)分析和繪圖。數(shù)據(jù)分析包括數(shù)據(jù)的排序、調(diào)整、計(jì)算、統(tǒng)計(jì)、頻譜變換、曲線擬合等各種完善的數(shù)學(xué)分析功能。準(zhǔn)備好數(shù)據(jù)后,進(jìn)行數(shù)據(jù)分析時(shí),只需選擇所要分析的數(shù)據(jù),然后再選擇響應(yīng)的菜單命令就可。Origin的繪圖是基于模板的,Origin本身提供了幾10種二維和三維繪圖模板而且允許用戶自己定制模板。繪圖時(shí),只要選擇所需要的模版就行。用戶可以自定義數(shù)學(xué)函數(shù)、圖形樣式和繪圖模板;可以和各種數(shù)據(jù)庫(kù)軟件、辦公軟件、圖像處理軟件等方便的連接;可以用C等高級(jí)語言編寫數(shù)據(jù)分析程序,還可以用內(nèi)置的LabTalk語言編程等。紅外、核磁、質(zhì)譜及晶體等專用的解析軟件,如SHELXL、Wingx、ChemNMR等,SHELXL是為晶體結(jié)構(gòu)精修而編寫的程序,雖可以解析尺寸在0.25nm及更大的大分子化合物數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu),但主要是為了處理小分子結(jié)構(gòu)而編寫的。由于采用綜合結(jié)構(gòu)因子評(píng)價(jià)方法,因而在解析大分子結(jié)構(gòu)時(shí)比傳統(tǒng)的基于FFT法的大分子解析方法要慢得多,適于所有的空間群和各種類型的結(jié)構(gòu)。極性軸限制與特殊位置限制可以自動(dòng)的產(chǎn)生。該程序可以處理孿晶、復(fù)雜無序、絕對(duì)構(gòu)型判定、CIF和PDB文件輸出,還可以為困難精修控制提供大量不同的限制方法。SHELXPRO界面程序可以輸出大分子的PS格式圖片產(chǎn)生map和其他廣泛大分子程序采用的格式。輔助程序CIFTAB利用cif文件產(chǎn)生小分子結(jié)構(gòu)精修結(jié)果列表。在收集參考文獻(xiàn)過程中,采用文獻(xiàn)管理系統(tǒng)可有效的收集、整理、插入?yún)⒖嘉墨I(xiàn),提高文獻(xiàn)利用率,常用的有EndNote4、ReferenceManager和ProCite等。EndNote4是著名的參考文獻(xiàn)查找和引用管理軟件,擁有上百萬用戶。能實(shí)現(xiàn)主題書目在線查找,靈活的圖片管理。該軟件支持PalmOS,以靈活移動(dòng)收集的參考文獻(xiàn)。此軟件的優(yōu)點(diǎn):根據(jù)雜志的要求自動(dòng)生產(chǎn)參考文獻(xiàn),所以在寫文章的時(shí)候你再也不要考慮如何根據(jù)雜志的要求進(jìn)行排版了;隨時(shí)調(diào)整參考文獻(xiàn)的格式。使用這些軟件可以在需要的時(shí)候隨時(shí)調(diào)整參考文獻(xiàn)的格式;方便自己查找文獻(xiàn)?？梢园炎约鹤x過的參考文獻(xiàn)全部輸入到Endnote里頭,這樣