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文檔簡介
炭疽實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)
云南省地方病防治所
楊發(fā)蓮
目錄一、前言二、炭疽病原檢驗(yàn)程序三、血清中炭疽抗體水平檢測四、實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目五、實(shí)驗(yàn)方法六、炭疽實(shí)驗(yàn)室防護(hù)和實(shí)驗(yàn)操作注意事項(xiàng)一、前言炭疽桿菌屬芽胞桿菌科(Bacillaceae),需氧芽胞桿菌屬(Bacillus),是最大的一類細(xì)菌(寬1~3μm,長5~8μm)。最佳生長溫度37℃(12~45℃),最佳生長pH為7.0~7.4。細(xì)胞結(jié)構(gòu)中有特點(diǎn)的是其多聚谷氨酸莢膜(poly-γ-D-glutamicacid,PGA),無鞭毛。炭疽桿菌的毒力因素主要是外毒素(保護(hù)性抗原PA、致死因子LF和水腫因子EF)三組分和莢膜,并分別由它僅含的兩個(gè)毒性質(zhì)粒(pX01,pX02)分別編碼和控制,失去任何一個(gè)質(zhì)粒因此也就失去其中一個(gè)毒力因素的炭疽桿菌就變成了難以致病的弱毒株。炭疽是由炭疽桿菌所引起的一種危害嚴(yán)重的人畜共患傳染病,若控制不及時(shí)就會(huì)引起大批的牲畜死亡造成重大的經(jīng)濟(jì)損失,嚴(yán)重影響人、畜健康和生產(chǎn)力發(fā)展。隨著我國市場經(jīng)濟(jì)的發(fā)展,人民生活需求的提高,飼養(yǎng)畜密度的增加,動(dòng)物性食品和毛、皮革制品的利用日趨普及,以及土地資源的開發(fā)和環(huán)境的改造,各類物資的頻繁交流,炭疽對(duì)我國人民生命安全和財(cái)產(chǎn)構(gòu)成很大威脅,如不采取及時(shí)、有效的監(jiān)控措施,炭疽發(fā)病勢將有增無減,隱患無窮。鑒于此種傳染性疾病在我國仍屬一種高、危病種,加以它尚有自外輸入我國的潛在可能,在今后加速發(fā)展市場經(jīng)濟(jì)的的新形勢下,加強(qiáng)各級(jí)領(lǐng)導(dǎo)對(duì)炭疽防制工作的重視和支持,提高廣大的基層相關(guān)工作人員對(duì)炭疽的認(rèn)識(shí)和防病能力,是很有必要的。要做到早發(fā)現(xiàn)、早治療、早控制,必須有相關(guān)豐富的流行病學(xué)和臨床知識(shí)外,一定要熟練掌握相關(guān)的實(shí)驗(yàn)室檢測技術(shù)。二、炭疽病原檢驗(yàn)程序
圖1示。
三、血清中炭疽抗體水平檢測(一)意義人血清中炭疽抗體水平檢測的意義主要在于下列幾個(gè)方面:正常人群血清炭疽抗體水平資料收集,特殊人群(產(chǎn)業(yè)工人、畜牧人員、實(shí)驗(yàn)室人員)血清炭疽抗體水平觀察,疫苗接種人群血清炭疽抗體水平分析,患病人群血清炭疽抗體水平研究,在患者標(biāo)本中未獲得炭疽芽胞桿菌陽性檢測和分離結(jié)果的情況下,血清抗炭疽特異性抗體滴度出現(xiàn)4倍或4倍以上升高也可以結(jié)合流行病學(xué)線索和臨床表現(xiàn)進(jìn)行確診。(二)檢測方法目前均為酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)(ELISA)
1.標(biāo)本的采集和保存:發(fā)病初期和恢復(fù)期(發(fā)病后15天左右)各采一次血,血清采集時(shí)應(yīng)盡量避免溶血,因紅細(xì)胞破裂可釋放過氧化物酶活性物質(zhì)干擾讀取方法的結(jié)果,可造成假陽性,長菌的標(biāo)本同樣的道理易產(chǎn)生假陽性;抗凝不完全的標(biāo)本因纖維蛋白元的干擾而造成假陽性,建議盡量不用抗凝血尤其是用肝素抗凝劑;標(biāo)本在冰箱中保存時(shí)間過長易導(dǎo)致血清IgG聚合,使試劑本底加深,一般血清置4℃冰箱5天內(nèi)完成測試,如需保存一周以上則要-20℃冰凍保存,融解時(shí)應(yīng)上下顛倒充分混勻,同時(shí)避免氣泡。
2.注意事項(xiàng):ELISA實(shí)驗(yàn)的結(jié)果受操作影響很大,每個(gè)步驟包括加樣、溫育、洗滌、顯色、酶標(biāo)儀讀數(shù)均應(yīng)認(rèn)真負(fù)責(zé)才能充分發(fā)揮ELISA的高靈敏、強(qiáng)特異的優(yōu)點(diǎn)。因此,應(yīng)建立實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目的標(biāo)準(zhǔn)操作程序(SOP)。報(bào)告方式以定量分析結(jié)果的滴度單位表示;檢測時(shí)應(yīng)以接種疫苗前或初報(bào)告病例地方的人或動(dòng)物的血清作為陰性血清,如有可能也可設(shè)陽性血清對(duì)照。陰性血清每次都要和待測標(biāo)本同時(shí)做。(三)具體程序
1.包被抗原:用包被緩沖液將已知抗原稀釋至0.3μg/ml,每孔加0.1ml,4℃過夜。次日,棄去孔內(nèi)溶液,用洗滌緩沖液洗3次,每次3分鐘。洗滌緩沖液配方為:Tris2.42克,1mol/LHCI13mL,吐溫-20(0.05%)0.5mL,加蒸餾水至1000mL。
2.待檢血清反應(yīng):加1:8稀釋(稀釋液為生理鹽水)的待檢樣品0.1ml于上述已包被之反應(yīng)孔中,置37℃孵育60分鐘,洗滌3次,每次3分鐘。(同時(shí)做空白、陰性及陽性孔對(duì)照)
3.酶標(biāo)抗體反應(yīng):于反應(yīng)孔中,加入新鮮稀釋的酶標(biāo)第二抗體(抗抗體)或SPA0.1ml,37℃孵育60分鐘,洗滌3次,每次3分鐘。
4.顯色反應(yīng):于各反應(yīng)孔中加入等體積混合的顯色底物A、B溶液0.1ml,37℃20分鐘。底物A液(磷酸鹽枸櫞酸緩沖液,pH5.0)配方為:0.2mol/LNa2HPO4(28.4g/L)25.7mL,0.1mol/L枸櫞酸(19.2g/L)24.3mL,H2O20.1%,蒸餾水50mL。底物B液[TMB(四甲基聯(lián)苯胺)使用液]配方為:TMB3.90g,枸櫞酸10.52g,EDTA1.86g,甘油2000mL,DMSO300mL,加熱溶解后加蒸餾水至10000mL。
5.終止顯色:于各反應(yīng)孔中加入顯色終止液(0.5mol/LH2SO4)0.1mL終止反應(yīng)。
6.結(jié)果判定:實(shí)驗(yàn)結(jié)果用酶標(biāo)儀判讀,被檢孔OD值達(dá)陰性血清對(duì)照孔OD值的2.1倍時(shí),始可判為陽性。四、實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目(一)標(biāo)本采集(二)細(xì)菌培養(yǎng)(三)涂片、G染色、莢膜染色、芽孢染色、光鏡檢查(四)噬菌體裂解和青霉素敏感性試驗(yàn)(五)PCR基因檢測(六)菌種保存五、實(shí)驗(yàn)方法(一)標(biāo)本采集
1.采集標(biāo)本時(shí)應(yīng)遵循的原則:盡可能在抗生素治療開始前采集標(biāo)本,除必要時(shí)并在具備操作病毒細(xì)菌條件的實(shí)驗(yàn)室內(nèi),不得用解剖的方式獲得標(biāo)本。所需的血液與組織標(biāo)本,均應(yīng)以穿刺方式取得。所有標(biāo)本均置無菌容器中
2.血液標(biāo)本:所有疑似病例,采取血液標(biāo)本5-10ml(不加抗凝劑)。
3.皮膚損害處標(biāo)本:玻片直接在皮膚破損處壓蘸;再用棉簽采皮膚損害處滲出物,(不加增菌肉湯)。
4.糞便與嘔吐物標(biāo)本:有消化道癥狀的采糞便或嘔吐物標(biāo)本,注意選取其中混有血液的部分。
5.痰與咽拭子標(biāo)本:有呼吸道癥狀的收集痰液及咽拭子標(biāo)本。
6.腦脊液標(biāo)本:表現(xiàn)腦膜刺激癥狀的病人,腰椎穿刺獲取腦脊液。
7.尸體標(biāo)本的采?。嚎赏ㄟ^穿刺心臟獲得血液或穿刺肝臟等實(shí)質(zhì)性臟器獲得組織標(biāo)本。
8.有病死動(dòng)物接觸史可采病死動(dòng)物標(biāo)本或相關(guān)土壤等環(huán)境標(biāo)本。(二)細(xì)菌分離培養(yǎng):全部標(biāo)本均應(yīng)進(jìn)行細(xì)菌分離培養(yǎng)。
1.標(biāo)本處理:在生物安全柜內(nèi)打開裝標(biāo)本的專用容器。在正常情況下應(yīng)該是無菌的標(biāo)本,如血液或腦脊液,直接涂布平板,每平板0.1ml左右,組織標(biāo)本應(yīng)先以無菌剪刀剪開一斷面,在培養(yǎng)基表面壓印,然后以接種環(huán)涂開。疑似病例的滲出液標(biāo)本,直接涂布平板后,剩余標(biāo)本可放入肉湯增菌液中增菌。土壤等有污染或陳舊的標(biāo)本,均首先制成懸液(土壤等標(biāo)本經(jīng)自然沉淀除去粗大沉淀物),10000轉(zhuǎn)/分鐘離心5分鐘,棄去大部分上清液,留少量液體與沉淀物混勻,沸水浴加熱15分鐘后,取適量涂布平板。
2.細(xì)菌分離培養(yǎng):將上述處理過的標(biāo)本冷卻后,用移液器吸取0.1ml左右于固體培養(yǎng)基上,用接種環(huán)涂布均勻,在37℃孵育12-24h后,檢查是否長出可疑的炭疽芽胞桿菌菌落。
3.挑選可疑菌落:上述平板在37℃孵育12-24小時(shí)后,檢查是否長出可疑的炭疽芽胞桿菌菌落。炭疽芽胞桿菌菌落的形態(tài)為:灰白色、不透明、中等大小,常不規(guī)則,表面呈毛玻璃樣。如圖2示。圖2(三)涂片、G染色、莢膜染色、芽孢染色、光鏡檢查
1.在低倍鏡下觀察,可見菌落呈卷發(fā)狀,羊毛狀如圖3,4示。
2.革蘭氏染色陽性,細(xì)菌呈鏈狀排列,菌體兩端平齊,呈竹節(jié)狀圖5,6,7示。在機(jī)體內(nèi)或特殊培養(yǎng)條件下能形成莢膜,印度墨汁負(fù)染時(shí)可見菌體周圍有肥厚的莢膜,多色美蘭染色時(shí)菌體染成藍(lán)色、莢膜染成紅色。在固體培養(yǎng)基上,于大氣條件下可形成芽胞,芽胞體染不上顏色(革蘭氏),位于細(xì)菌中央,呈卵圓形,不膨脹圖8示;石炭酸復(fù)紅染色,芽胞為紅色,菌體為藍(lán)色圖9示。圖3圖4圖5圖6圖7圖8圖9(四)噬菌體裂解和青霉素敏感性試驗(yàn)將上述可疑菌落挑出,劃線接種于平板之上,在劃線區(qū)內(nèi)一處滴一滴診斷用炭疽噬菌體,另一處貼一片青霉素紙片。37℃孵育8-24小時(shí)后,在滴噬菌體處有透明噬菌斑,青霉素紙片周圍有明顯的抑菌環(huán)(圖9)示,便可判定接種物為炭疽芽胞桿菌。在患者或尸體中分離獲得炭疽芽胞桿菌,炭疽的診斷即可確立。圖10(五)PCR基因檢測
1.PCR標(biāo)本處理:用于PCR模板制備的標(biāo)本類型有土壤,毛皮,臟器,組織標(biāo)本,棉拭子。(1)土壤標(biāo)本:用硬紙條對(duì)折取約0.1~0.3g土壤標(biāo)本置于1.5ml離心管中,加入蒸餾水或pH8.0的TE溶液至0.5ml,用移液器輕輕攪動(dòng),使其懸浮,蓋嚴(yán)蓋子。(2)毛皮標(biāo)本:為避免毛皮受氣流影響飛到各處,在安全柜中放一個(gè)紙袋,在袋子中用無菌剪刀將毛皮標(biāo)本剪碎成小塊,取剪碎的標(biāo)本置于1.5ml離心管中,用移液器或吸管加入蒸餾水或pH8.0的TE溶液至0.5ml,蓋嚴(yán)蓋子。用過的剪刀、鑷子放入盛有消毒液的加蓋容器內(nèi)。(3)臟器(心、肝、脾、肺等),組織標(biāo)本:用無菌剪刀和鑷子約取1g標(biāo)本,放入研磨器中研磨,再加入0.5ml蒸餾水或pH8.0的TE溶液懸浮,混勻后,用移液器將液體部分移入1.5ml離心管中,蓋嚴(yán)。用過的容器及標(biāo)本碎塊放入可封閉容器中,剪刀、鑷子等放入盛有消毒液的加蓋容器內(nèi)。(4)棉拭子標(biāo)本:在棉拭子容器中加0.5ml蒸餾水或pH8.0的TE溶液,用無菌鑷子擠壓拭子幾次,用移液器或吸管吸液體放入1.5ml離心管中,蓋嚴(yán)。將以上放有標(biāo)本的離心管蓋子封好,100℃加熱20min。10000rpm離心10min,用注射器將上清液吸出,必要時(shí)應(yīng)用0.22μm濾器過濾除菌,濾液用一個(gè)新離心管收集即為模板。制備好的模板暫時(shí)不用時(shí),要放在-20℃保存。
2.PCR操作程序:(1)所用引物序列如下:其中cap外和cap內(nèi)檢測的是同一個(gè)基因,可只使用一對(duì)。引物名稱序列基因定位擴(kuò)增長度(bp)pagA普F:ATTTGCGGTAACACTTCACTpagA基因-pXO1923R:AGACCGTGACAATGATGGAAcap外F:CCTGGTTGTTCTTTTCGTTGCcap基因-pXO21242R:CGGATTGTATATGGAGTGGGcap內(nèi)F:TTTCACCAGCACCCACATAGcap基因-pXO21002R:GGGACAGGAATGTTTGGATCrpoB普2F:CCAACAGTAGAAATGCCR:AATTTCACCAGTTTCTGGATCTrpoB基因-染色體197(2)反應(yīng)體系:在PCR管內(nèi)依次加入以下成分,反應(yīng)體系總共25ul,10×反應(yīng)緩沖液2.5μl4×dNTP混合物(每種2.5mM)2μl引物(上游)1μl引物(下游)1μl待測模板1μlTaqDNA聚合酶0.5μl(2-3U)無菌去離子水17μl使用2×mix的反應(yīng)體系:25μl2×mix12.5μl引物(上游)1μl引物(下游)1μl待測模板1μl無菌去離子水9.5μl
(3)反應(yīng)條件:預(yù)變性95℃5min;然后95℃1min,55℃1min,72℃1min,30個(gè)循環(huán);最后72℃延伸5min。(4)電泳:1%瓊脂糖凝膠熔化,稍涼后,加入核酸染料(100ml凝膠加入染料5ul),倒入模具中,插入梳子,待凝固后放入電泳槽內(nèi),拔掉梳子。從擴(kuò)增好的PCR管內(nèi)吸取5ul與1ul6×loadingbuffer混勻后加入加樣孔內(nèi),兩側(cè)孔內(nèi)加入5ulDNAMarker,100V,電泳1小時(shí)左右,在紫外透射儀或讀膠儀上觀察結(jié)果。
(5)結(jié)果分析:圖10示。pagA擴(kuò)增結(jié)果,片段長度為923bpcap內(nèi)擴(kuò)增結(jié)果,片段長度為1002bpcap外擴(kuò)增結(jié)果,片段長度為1242bprpoB2擴(kuò)增結(jié)果,片段長度為197bp圖11(六)菌種保存
1.50%甘油液保存:在固體培養(yǎng)基表面,于37℃培養(yǎng)4天以上,應(yīng)有70%以上可形成芽胞。用磷酸鹽緩沖液洗下培養(yǎng)物,根據(jù)混濁度配制成約每毫升2×109個(gè)細(xì)菌的懸液,加入等量的滅菌甘油后,分裝入2ml螺口菌種管內(nèi),每管1ml。每株菌至少應(yīng)制備2支,記錄制備支數(shù)。將菌種管置于菌種保藏盒中,4℃保存。
2.半固體保存:從培養(yǎng)一天的固體培養(yǎng)基上用接種針挑取細(xì)菌,穿刺半固體培養(yǎng)管,37℃過夜培養(yǎng),第二天取出,在半固體表面滴加一滴滅菌甘油。每株菌至少應(yīng)制備2支,記錄制備支數(shù)。將菌種管置于菌種保藏盒中,4℃保存。
3.菌種保存管保存:從培養(yǎng)兩天以上的固體培養(yǎng)基上用接種環(huán)挑取細(xì)菌,加入菌種保存管中,混勻,去掉適量液體,做好標(biāo)記,置于菌種保藏盒中,-80℃保存。每株菌至少應(yīng)制備2支,記錄制備支數(shù)。六、炭疽實(shí)驗(yàn)室防護(hù)和實(shí)驗(yàn)操作注意事項(xiàng)在炭疽桿菌的研究、檢測中,特別要求注意“控制”
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