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文檔簡介

生物化學習題及答案第一局部:名詞解釋氨基酸〔aminoacids〕:是含有一個堿性氨基和一個酸性羧基的有機化合物,氨基一般連接在α-碳上。氨基酸是肽和蛋白質(zhì)的構(gòu)件分子。必需氨基酸〔essentialaminoacids〕:指人〔或其它脊椎動物〕自己不能合成,需要從飲食中獲得的氨基酸,例如賴氨酸、蘇氨酸等氨基酸。非必需氨基酸〔nonessentialaminoacids〕:指人〔或其它脊椎動物〕自己能由簡單的前體合成的,不需要由飲食供給的氨基酸,例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。等電點〔pI,isoelectricpoint〕:使分子處于兼性分子狀態(tài),在電場中不遷移〔分子的凈電荷為零〕的pH值。茚三酮反響〔ninhydrinreaction〕:在加熱條件下,氨基酸或肽與茚三酮反響生成紫色〔與脯氨酸反響生成黃色〕化合物的反響。肽鍵〔peptidebond〕:一個氨基酸的羧基與另一個氨基酸的氨基縮合,除去一分子水形成的酰胺鍵。肽〔peptides〕:兩個或兩個以上氨基酸通過肽鍵共價連接形成的聚合物。蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)(primarystructure):指蛋白質(zhì)中共價連接的氨基酸殘基的排列順序。層析(chromatography):按照在移動相〔可以是氣體或液體〕和固定相〔可以是液體或固體〕之間的分配比例將混合成分分開的技術(shù)。離子交換層析(ion-exchangecolumnchromatography):使用帶有固定的帶電基團的聚合樹脂或凝膠層析柱別離離子化合物的層析方法。透析〔dialysis〕:通過小分子經(jīng)半透膜擴散到水〔或緩沖液〕的原理將小分子與生物大分子分開的一種別離純化技術(shù)。凝膠過濾層析(gelfiltrationchromatography):也叫做分子排阻層析〔molecular-exclusionchromatography〕。一種利用帶孔凝膠珠作基質(zhì),按照分子大小別離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。親和層析〔affinitychromatography〕:利用共價連接有特異配體的層析介質(zhì)別離蛋白質(zhì)混合物中能特異結(jié)合配體的目的蛋白或其它分子的層析技術(shù)。高壓液相層析〔HPLC,high-pressureliquidchromatography〕:使用顆粒極細的介質(zhì),在高壓下別離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。凝膠電泳〔gelelectrophoresis〕:以凝膠為介質(zhì),在電場作用下別離蛋白質(zhì)或核酸等分子的別離純化技術(shù)。SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳:〔SDS,sodiumdodecylsulfate-polyacrylamidegelelectrohoresis〕

在有去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰胺凝膠電泳。SDS只是按照分子大小別離的,而不是根據(jù)分子所帶的電荷和大小別離的。等電聚焦電泳〔IFE,isoelectricfocusingelectrophoresis〕:利用特殊的一種緩沖液〔兩性電解質(zhì)〕在聚丙烯酰胺凝膠內(nèi)制造一個pH梯度,電泳時每種蛋白質(zhì)就將遷移到它的等電點〔pI〕處,即梯度中的某一pH時,就不再帶有凈的正或負電荷了。雙向電泳〔two-dimensionalelectrophoresis〕:是等電聚焦電泳和SDS的組合,即先進行等電聚焦電泳〔按照pI別離〕,然后再進行SDS〔按照分子大小〕,經(jīng)染色得到的電泳圖是個二維分布的蛋白質(zhì)圖。Edman降解(Edmandegradation):從多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經(jīng)層析鑒定,余下的多肽鏈〔少了一個殘基〕被回收再進行下一輪降解循環(huán)。同源蛋白質(zhì)〔homologousproteins〕:來自不同種類生物、而序列和功能類似的蛋白質(zhì)。例如血紅蛋白。構(gòu)型〔configuration〕:一個有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。這種排列不經(jīng)過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。構(gòu)型的改變往往使分子的光學活性發(fā)生變化。構(gòu)象〔conformation〕:指一個分子中,不改變共價鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周圍的原子旋轉(zhuǎn)所產(chǎn)生的原子的空間排布。一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時,不要求共價鍵的斷裂和重新形成。構(gòu)象改變不會改變分子的光學活性。肽單位〔peptideunit〕:又稱之肽基〔peptidegroup〕,是肽鏈主鏈上的重復結(jié)構(gòu)。是由參與肽鍵形成的氮原子和碳原子和它們的4個取代成分:羰基氧原子、酰胺氫原子和兩個相鄰的α-碳原子組成的一個平面單位。蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)〔proteinsecondarystructure〕:在蛋白質(zhì)分子中的局部區(qū)域內(nèi)氨基酸殘基的有規(guī)那么的排列,常見的二級結(jié)構(gòu)有α-螺旋和β-折疊。二級結(jié)構(gòu)是通過骨架上的羰基和酰胺基團之間形成的氫鍵維持的。蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)〔proteintertiarystructure〕:蛋白質(zhì)分子處于它的天然折疊狀態(tài)的三維構(gòu)象。三級結(jié)構(gòu)是在二級結(jié)構(gòu)的根底上進一步盤繞、折疊形成的。三級結(jié)構(gòu)主要是靠氨基酸側(cè)鏈之間的疏水相互作用、氫鍵范德華力和鹽鍵〔靜電作用力〕維持的。蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)〔quaternarystructure〕:多亞基蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。實際上是具有三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈〔亞基〕以適當方式聚合所呈現(xiàn)出的三維結(jié)構(gòu)。α-螺旋(α-helix):蛋白質(zhì)中常見的一種二級結(jié)構(gòu),肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu),螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。每個氨基酸殘基〔第n個〕的羰基氧與多肽鏈C端方向的第4個殘基〔第n+4個〕的酰胺氮形成氫鍵。在典型的右手α-螺旋結(jié)構(gòu)中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的長軸上升0.15nm。β-折疊(β-sheet):是蛋白質(zhì)中的常見的二級結(jié)構(gòu),是由伸展的多肽鏈組成的。折疊片的構(gòu)象是通過一個肽鍵的羰基氧和位于同一個肽鏈或相鄰肽鏈的另一個酰胺氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列〔走向都是由N到C方向〕;或者是反平行排列〔肽鏈反向排列〕。β-轉(zhuǎn)角〔β-turn〕:也是多肽鏈中常見的二級結(jié)構(gòu),連接蛋白質(zhì)分子中的二級結(jié)構(gòu)〔α-螺旋和β-折疊〕,使肽鏈走向改變的一種非重復多肽區(qū),一般含有2~16個氨基酸殘基。含有5個氨基酸殘基以上的轉(zhuǎn)角又常稱之環(huán)〔loops〕。常見的轉(zhuǎn)角含有4個氨基酸殘基,有兩種類型。轉(zhuǎn)角I的特點是:第1個氨基酸殘基羰基氧與第4個殘基的酰胺氮之間形成氫鍵;轉(zhuǎn)角II的第3個殘基往往是甘氨酸。這兩種轉(zhuǎn)角中的第2個殘基大都是脯氨酸。超二級結(jié)構(gòu)〔super-secondarystructure〕:也稱之基元〔motif〕。在蛋白質(zhì)中,特別是球蛋白中,經(jīng)??梢钥吹接杉僭O(shè)干相鄰的二級結(jié)構(gòu)單元組合在一起,彼此相互作用,形成的有規(guī)那么、在空間上能識別的二級結(jié)構(gòu)組合體。結(jié)構(gòu)域(domain):在蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)內(nèi)的獨立折疊單元。結(jié)構(gòu)域通常都是幾個超二級結(jié)構(gòu)單元的組合。纖維蛋白(fibrousproteins):一類主要的不溶于水的蛋白質(zhì),通常都含有呈現(xiàn)相同二級結(jié)構(gòu)的多肽鏈。許多纖維蛋白結(jié)合緊密,并為單個細胞或整個生物體提供機械強度,起著保護或結(jié)構(gòu)上的作用。球蛋白(globularproteins):一類蛋白質(zhì),許多都溶于水,球蛋白是緊湊的、近似球形的、含有折疊緊密的多肽鏈。典型的球蛋白含有能特異識別和結(jié)合其它化合物的凹陷或裂隙部位。角蛋白〔keratins〕:由處于α-螺旋或β-折疊構(gòu)象的平行的多肽鏈組成的不溶于水的起著保護或結(jié)構(gòu)作用的蛋白質(zhì)。膠原〔蛋白〕〔collagen〕:是動物結(jié)締組織中最豐富的一種結(jié)構(gòu)蛋白,它是由原膠原蛋白分子組成,原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結(jié)構(gòu)的蛋白。每個原膠原分子都是由3條特殊的左手螺旋〔螺距0.95nm,每一圈含有3.3個殘基〕的多肽鏈右手旋轉(zhuǎn)形成的。疏水相互作用(hydrophobicinteraction):非極性分子之間的一種弱的、非共價的相互作用。這些非極性分子〔如一些中性氨基酸殘基,也稱之疏水殘基〕在水相環(huán)境中具有避開水而相互聚集的傾向。伴娘蛋白〔chaperone〕:與一種新合成的多肽鏈形成復合物并協(xié)助它正確折疊成具有生物功能構(gòu)象的蛋白質(zhì)。伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒有組裝的蛋白亞基的不正確的聚集,協(xié)助多肽鏈跨膜轉(zhuǎn)運以及大的多亞基蛋白質(zhì)的組裝和解體。二硫鍵〔disulfidebond〕:通過兩個〔半胱氨酸〕巰基的氧化形成的共價鍵。二硫鍵在穩(wěn)定某些蛋白的三維結(jié)構(gòu)上起著重要的作用。范德華力〔vanderWaalsforce〕:中性原子之間通過瞬間靜電相互作用產(chǎn)生的一種弱的分子之間的力。當兩個原子之間的距離為它們的范德華半徑之和時,范德華引力最強。強的范德華排斥作用可以防止原子相互靠近。蛋白質(zhì)變性〔denaturation〕:生物大分子的天然構(gòu)象遭到破壞導致其生物活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在受到光照、熱、有機溶劑以及一些變性劑的作用時,次級鍵受到破壞,導致天然構(gòu)象的破壞,使蛋白質(zhì)的生物活性喪失。復性〔renaturation〕:在一定的條件下,變性的生物大分子恢復成具有生物活性的天然構(gòu)象的現(xiàn)象。肌紅蛋白〔myoglobin〕:是由一條肽鏈和一個血紅素輔基組成的結(jié)合蛋白,是肌肉內(nèi)儲存氧的蛋白質(zhì),它的氧飽和曲線為雙曲線型。血紅蛋白〔hemoglobin〕:是由含有血紅素輔基的4個亞基組成的寡聚蛋白。血紅蛋白負責將氧由肺運輸?shù)酵庵芙M織,它的氧飽和曲線為S型。波爾效應(yīng)〔Bohreffect〕:CO2濃度的增加降低細胞內(nèi)的pH,引起紅細胞內(nèi)血紅蛋白的氧親和力下降的現(xiàn)象。別構(gòu)效應(yīng)〔allostericeffect〕:又稱之變構(gòu)效應(yīng)。是寡聚蛋白與配基結(jié)合改變蛋白質(zhì)的構(gòu)象,導致蛋白質(zhì)生物活性改變的現(xiàn)象。鐮刀型細胞貧血病〔sickle-cellanemia〕:血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大局部紅細胞呈鐮刀狀。其特點是病人的血紅蛋白β-亞基N端的第6個氨基酸殘基是纈氨酸,而不是正常的谷氨酸殘基。酶〔enzyme〕:生物催化劑,除少數(shù)RNA外幾乎都是蛋白質(zhì)。酶不改變反響的平衡,只是通過降低活化能加快反響的速度。全酶〔holoenzyme〕:具有催化活性的酶,包括所有的必需的亞基、輔基和其它的輔助因子。脫輔基酶蛋白〔apoenzyme〕:酶中除去催化活性可能需要的有機或無機輔助因子或輔基后的蛋白質(zhì)局部。酶活力單位〔U,activeunit〕:酶活力的度量單位。1961年國際酶學會議規(guī)定:1個酶活力單位是指在特定條件〔25℃,其它為最適條件〕下,在1分鐘內(nèi)能轉(zhuǎn)化1微摩爾底物的酶量,或是轉(zhuǎn)化底物中1微摩爾的有關(guān)基團的酶量。比活(specificactivity):每分鐘每毫克酶蛋白在25℃下轉(zhuǎn)化的底物的微摩爾數(shù)〔μm〕。比活是酶純度的測量?;罨堋瞐ctivationenergy〕:將一摩爾反響底物中的所有分子由基態(tài)轉(zhuǎn)化為過渡態(tài)所需要的能量?;钚圆课弧瞐ctivesite〕:酶中含有底物結(jié)合部位和參與催化底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的氨基酸殘基的局部?;钚圆课煌ǔ6嘉挥诘鞍踪|(zhì)的結(jié)構(gòu)域或亞基之間的裂隙或是蛋白質(zhì)外表的凹陷部位,通常都是由在三維空間上靠得很近的一些氨基酸殘基組成的。酸-堿催化〔acid-basecatalysis〕:質(zhì)子轉(zhuǎn)移加速反響的催化作用。共價催化〔covalentcatalysis〕:一個底物或底物的一局部與催化劑形成共價鍵,然后被轉(zhuǎn)移給第二個底物。許多酶催化的基團轉(zhuǎn)移反響都是通過共價催化方式進行的。靠近效應(yīng)〔proximityeffect〕:非酶促反響或酶促反響速率的增加是由于活性部位處反響劑有效濃度增大〔底物靠近活性部位〕的結(jié)果,這將導致更頻繁地形成過渡態(tài)。初速度(initialvelocity):酶促反響最初階段底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的速度,這一階段產(chǎn)物的濃度非常低,其逆反響可以忽略不計。米氏方程〔Michaelis-Mentenequation〕:表示一個酶促反響的起始速度〔v〕與底物濃度〔[S]〕關(guān)系的速度方程,v=Vmax[S]/〔Km+[S]〕。米氏常數(shù)〔Michaelisconstant,〕〔Km〕:對于一個給定反響,導致酶促反響速度的起始速度〔v0〕到達最大反響速度〔Vmax〕一半時的底物濃度。催化常數(shù)〔catalyticnumber〕〔Kcat〕:也稱之轉(zhuǎn)換數(shù)(turnovernumber)。一個動力學常數(shù),是在底物濃度處于飽和狀態(tài)下,一個酶〔或一個酶活性部位〕催化一個反響有多快的測量。催化常數(shù)等于最大反響速度除以總的酶濃度〔Vmax/[E]total〕,或者是每摩爾酶活性部位每秒鐘轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的底物的摩爾數(shù)。雙倒數(shù)作圖〔double-reciprocalplot〕:也稱之Lineweaver-Burk作圖。一個酶促反響速度的倒數(shù)〔1/v〕對底物濃度的倒數(shù)〔1/[s]〕的作圖。X和y軸上的截距分別代表米氏常數(shù)〔Km〕和最大反響速度〔Vmax〕的倒數(shù)。競爭性抑制作用〔competitiveinhibition〕:通過增加底物濃度可以逆轉(zhuǎn)的一種酶抑制類型。一個競爭性抑制劑通常與正常的底物或配體競爭同一個蛋白質(zhì)的結(jié)合部位。這種抑制使得Km增大,而Vmax不變。競爭性抑制作用〔noncompetitiveinhibition〕:抑制劑不僅與游離酶結(jié)合,也可以與酶-底物復合物結(jié)合的一種酶促反響抑制作用。這種抑制使得Vmax變小,但Km不變。反競爭性抑制作用〔uncompetitiveinhibition〕:抑制劑只與酶-底物復合物結(jié)合,而不與游離酶結(jié)合的一種酶促反響抑制作用。這種抑制作用使得Vmax,Km都變小,但Vmax/Km比值不變。絲氨酸蛋白酶〔serineprotease〕:活性部位含有在催化期間起著親核體作用的絲氨酸殘基的蛋白酶。酶原〔zymogen〕:通過有限蛋白水解能夠由無活性變成具有催化活性的酶前體。調(diào)節(jié)酶〔regulatoryenzyme〕:位于一個或多個代謝途徑內(nèi)的一個關(guān)鍵部位的酶,它的活性根據(jù)代謝的需要被增加或降低。別構(gòu)酶〔allostericenzyme〕:一種其活性受到結(jié)合在活性部位以外部位的其它分子調(diào)節(jié)的酶。別構(gòu)調(diào)節(jié)劑〔allostericmodulator〕:結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位調(diào)節(jié)該酶催化活性的生物分子,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑可以是激活劑,也可以是抑制劑。齊變模式〔concertedmodel〕:相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的一種模式。按照最簡單齊變模式,由于一個底物或別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的結(jié)合,蛋白質(zhì)的構(gòu)象在T〔對底物親和性低的構(gòu)象〕和R〔對底物親和性高的構(gòu)象〕之間變換。這一模式提出所有蛋白質(zhì)的亞基都具有同樣的構(gòu)象,或是T,或是R構(gòu)象。序變模式〔sequentialmodel〕:相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的另外一種模式。按照最簡單的序變模式,一個配體的結(jié)合會誘導它結(jié)合的亞基的三級結(jié)構(gòu)的變化,以及使相鄰亞基的構(gòu)象發(fā)生很大的變化。按照序變模式,只有一個亞基對配體具有高的親和性。同功酶(isoenzyme或isozyme):催化同一化學反響而化學組成不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列、底物的親和性等方面都存在著差異。別構(gòu)調(diào)節(jié)物(allostericmodulator):也稱之別構(gòu)效應(yīng)物〔allostericeffector〕。結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位,調(diào)節(jié)酶催化活性的生物分子。別構(gòu)調(diào)節(jié)物可以是激活劑或抑制劑。維生素(vitamin):是一類動物本身不能合成但對動物生長和健康又是必需的有機化合物,所以必須從飲食中獲得。許多輔酶都是由維生素衍生的。水溶性維生素〔water-solublevitamins〕:一類能溶于水的有機營養(yǎng)分子。其中包括在酶的催化中起著重要作用的B族維生素以及抗壞血酸〔維生素C〕等。脂溶性維生素〔lipidvitamins〕:由長的碳氫鏈或稠環(huán)組成的聚戊二烯化合物。脂溶性維生素包括維生素A、D、E和K,這類維生素能被動物貯存。輔酶〔coenzyme〕:某些酶在發(fā)揮催化作用時所需要的一類輔助因子,其成分中往往含有維生素。輔基(prostheticgroup):是與酶蛋白共價結(jié)合的金屬離子或一類有機化合物,用透析法不能除去。輔基在整個酶促反響過程中始終與酶的特定部位結(jié)合。尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸〔NADP+,nicotinamideadeninedinucleotidephosphate〕:含有尼克酰胺的輔酶,在某些氧化復原反響中起著氫原子和電子載體的作用,常常作為脫氫酶的輔酶。黃素單核苷酸〔FMN,flavinmononucleotide〕:核黃素磷酸,是某些氧化復原酶的輔酶。黃素腺嘌呤二核苷酸〔FAD,flavinadeninedinucleotide〕:是某些氧化復原酶的輔酶,含有核黃素。硫胺素焦磷酸〔thiaminepyrophosphate〕:是維生素B1的輔酶形式,參與轉(zhuǎn)醛基反響。磷酸吡哆醛〔pyidoxalphosphate〕:是維生素B6〔吡哆醇〕的衍生物,是轉(zhuǎn)氨酶、脫羧酶和消旋酶的輔酶。生物素〔biotin〕:參與脫羧反響的一種酶的輔助因子。輔酶A〔coenzymeA〕:一種含有泛酸的輔酶,在某些酶促反響中作為?;妮d體。類胡蘿卜素〔carotenoids〕:由異戊二烯組成的脂溶性光合色素。轉(zhuǎn)氨酶〔transaminases〕:也稱之氨基轉(zhuǎn)移酶〔aminotransferases〕,在該酶的催化下一個α-氨基酸的氨基轉(zhuǎn)可移給另一個α-酮酸。醛糖〔aldoses〕:一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的碳原子〔指定為C-1〕是個醛基。酮糖〔ketoses〕:一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的碳原子〔指定為C-2〕是個酮基。異頭物〔anomers〕:僅在氧化數(shù)最高的碳原子〔異頭碳〕具有不同構(gòu)型的糖分子的兩種異構(gòu)體。異頭碳〔anomericcarbon〕:一個環(huán)化單糖的氧化數(shù)最高的碳原子。異頭碳具有一個羰基的化學反響性。變旋〔mutarotation〕:一個吡喃糖、呋喃糖或糖苷伴隨著它們的α-和β-異構(gòu)形式的平衡而發(fā)生的比旋度變化。單糖〔monosaccharide〕:由三個或更多碳原子組成的具有經(jīng)驗公式〔CH2O〕n的簡單糖。糖苷(glycosides):單糖半縮醛羥基與另一個分子〔例如醇、糖、嘌呤或嘧啶〕的羥基、胺基或巰基縮合形成的含糖衍生物。糖苷鍵(glycosidicbond):一個糖半縮醛羥基與另一個分子〔例如醇、糖、嘌呤或嘧啶〕的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛或縮酮鍵,常見的糖苷鍵有O-糖苷鍵和N-糖苷鍵。寡糖〔oligoccharide〕:由2個~20個單糖殘基通過糖苷鍵連接形成的聚合物。多糖〔polysaccharide〕:20個以上的單糖通過糖苷鍵連接形成的聚合物。多糖鏈可以是線性的或帶有分支的。復原糖〔reducingsugar〕:羰基碳〔異頭碳〕沒有參與形成糖苷鍵,因此可被氧化充當復原劑的糖。淀粉〔starch〕:一類可作為植物中貯存多糖的葡萄糖殘基的同聚物。由兩種形式的淀粉:一種是直鏈淀粉,是沒有分支的只是通過α-〔1→4〕糖苷鍵連接的葡萄糖殘基聚合物。另一種是支鏈淀粉,是含有分支的α-〔1→4〕糖苷鍵連接的葡萄糖殘基聚合物,支鏈在分支點處通過α-〔1→6〕糖苷鍵與主鏈相連。糖原〔glycogen〕:是含有分支的α-〔1→4〕糖苷鍵連接在一起的葡萄糖的同聚物,支鏈在分支點處通過α-〔1→6〕糖苷鍵與主鏈相連。極限糊精〔limitdexitrin〕:是指支鏈淀粉中帶有支鏈的核心局部,該局部在支鏈淀粉經(jīng)淀粉酶水解作用、糖原磷酸化酶或淀粉磷酸化酶作用后仍然存在。糊精的進一步降解需要α〔1→6〕糖苷鍵的水解。肽聚糖〔peptidoglycan〕:N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰唾液酸交替連接的雜多糖與不同組成的肽交叉連接形成的大分子。肽聚糖是許多細菌細胞壁的主要成分。糖蛋白〔glycoprotein〕:含有共價連接的葡萄糖殘基的蛋白質(zhì)。蛋白聚糖〔proteoglycans〕:由雜多糖與一個多肽鏈組成的雜化的大分子,多糖是分子的主要成分。脂肪酸〔fattyacid〕:是指一端含有一個羧基的長的脂肪族碳氫鏈。脂肪酸是最簡單的一種脂,它是許多更復雜的脂〔例如三脂酰甘油、甘油磷脂、鞘磷脂和蠟〕的成分。飽和脂肪酸〔saturatedfattyacid〕:不含有-C=C-雙鍵的脂肪酸。不飽和脂肪酸〔unsaturatedfattyacid〕:至少含有一個-C=C-雙鍵的脂肪酸。必需脂肪酸〔ossentialfattyacids〕:維持哺乳動物正常生長所需的,而動物又不能合成的脂肪酸,例如亞油酸和亞麻酸。三脂酰甘油〔triacylglycerol〕:也稱之甘油三酯〔triglyceride〕。一種含有與甘油酯化的3個脂酰基的脂。脂肪和油是三脂酰甘油的混合物。磷脂〔phospholipid〕:含有磷酸成分的脂。例如卵磷脂、腦磷脂等。鞘脂〔sphingolipids〕:一類含有鞘氨醇骨架的兩性脂,一端連接著一個長鏈的脂肪酸,了一端為一個極性的醇。鞘脂包括鞘磷脂、腦磷脂以及神經(jīng)節(jié)苷脂,一般存在于植物和動物膜內(nèi),尤其是在中樞神經(jīng)系統(tǒng)的組織內(nèi)含量豐富。鞘磷脂〔sphingomyelin〕:一種由神經(jīng)酰胺的C-1羥基上連接了磷酸膽堿〔或磷酸乙醇胺〕構(gòu)成的鞘脂。鞘磷脂存在于大多數(shù)哺乳動物細胞的質(zhì)膜內(nèi),是髓鞘的主要成分。卵磷脂〔lecithin〕:就是磷脂酰膽堿〔PC,phosphatidylcholine〕,是磷脂酸與膽堿形成的酯。腦磷脂〔cephalin〕:就是磷脂酰乙醇胺〔PE,phosphatidylethanolamine〕,是磷脂酸與乙醇胺形成的酯。脂質(zhì)體〔liposome〕:是由包圍水相空間的磷脂雙層形成的囊泡〔小泡〕。生物膜〔bioligicalmembrane〕:鑲嵌有蛋白質(zhì)的脂雙層,起著劃分和分隔細胞和細胞器的作用。生物膜也是許多與能量轉(zhuǎn)化和細胞內(nèi)通訊有關(guān)的重要部位。內(nèi)在膜蛋白〔integralmembraneproteins〕:插入脂雙層的疏水核和完全跨越脂雙層的膜蛋白。外周膜蛋白〔peripheralmembraneproteins〕:通過與膜脂的極性頭部或內(nèi)在膜蛋白的離子相互作用和形成氫鍵與膜的內(nèi)、外外表弱結(jié)合的膜蛋白。膜蛋白一旦從膜上釋放出來,通常都是水溶性的。流體鑲嵌模型(fluidmosaicmodel):針對生物膜的結(jié)構(gòu)提出的一種模型。在這個模型中,生物膜被描述成鑲嵌有蛋白質(zhì)的流體脂雙層,脂雙層在結(jié)構(gòu)和功能上都表現(xiàn)出不對稱性。有的蛋白質(zhì)"鑲"在脂雙層外表,有的那么局部或全部嵌入其內(nèi)部,有的那么橫跨整個膜。另外脂和膜蛋白都可以進行橫向擴散。通透系數(shù)〔permeabilitycoefficient〕:是離子或小分子擴散過脂雙層膜能力的一種量度。通道蛋白〔channelproteins〕:是一種帶有中央水相通道的內(nèi)在膜蛋白,它可以使大小適宜的離子和分子從膜的任一方向穿過膜。〔膜〕孔蛋白〔poreproteins〕:其含義與通道蛋白類似,只是該術(shù)語常用于細菌。被動轉(zhuǎn)運〔passivetransport〕:也稱之易化擴散〔facilitateddiffusion〕。是一種轉(zhuǎn)運方式,通過該方式溶質(zhì)特異結(jié)合于一個轉(zhuǎn)運蛋白,然后被轉(zhuǎn)運過膜,但轉(zhuǎn)運是沿著濃度梯度下降方向進行,所以被動轉(zhuǎn)運不需要能量支持。主動轉(zhuǎn)運〔activetransport〕:一種轉(zhuǎn)運方式,通過該方式溶質(zhì)特異結(jié)合于一個轉(zhuǎn)運蛋白,然后被轉(zhuǎn)運過膜,但與被動轉(zhuǎn)運方式相反轉(zhuǎn)運是逆著濃度梯度方向進行的,所以主動轉(zhuǎn)運需要能量來驅(qū)動。在原發(fā)主動轉(zhuǎn)運過程中,能源可以是光、ATP或電子傳遞。而第二級主動轉(zhuǎn)運是在離子濃度梯度驅(qū)動下進行的。協(xié)同運送(cotransport):兩種不同溶質(zhì)跨膜的耦聯(lián)轉(zhuǎn)運。可以通過一個轉(zhuǎn)運蛋白進行同一方向〔同向轉(zhuǎn)運〕或反方向〔反向轉(zhuǎn)運〕轉(zhuǎn)運。胞吞〔作用〕〔endocytosis〕:物質(zhì)被質(zhì)膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形式〔物質(zhì)在囊泡內(nèi)〕并被帶入到細胞內(nèi)的過程。胞吐〔作用〕〔exocytosis〕:確定要分泌的物質(zhì)被包裹在脂囊泡內(nèi),該囊泡與質(zhì)膜融合,然后將物質(zhì)釋放到細胞外空間的過程。核苷〔nucleoside〕:是由嘌呤或嘧啶堿基通過共價鍵與戊糖連接組成的化合物。核糖與堿基一般都是由糖的異頭碳與嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之間形成的β-N-糖苷鍵連接的。核苷酸〔nucleotide〕:核苷的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。cAMP〔cyclicAMP〕:3ˊ,5ˊ-環(huán)腺苷酸,細胞內(nèi)的第二信使,由于某些激素或其它分子信號刺激激活腺苷酸環(huán)化酶催化ATP環(huán)化形成的。磷酸二酯鍵〔phosphodiesterlinkage〕:一種化學基團,指一分子磷酸與兩個醇〔羥基〕酯化形成的兩個酯鍵。該酯鍵成了兩個醇之間的橋梁。例如一個核苷的3ˊ羥基與另一個核苷的5ˊ羥基與同一分子磷酸酯化,就形成了一個磷酸二酯鍵。脫氧核糖核酸〔DNA,deoxyribonucleicacid〕:含有特殊脫氧核糖核苷酸序列的聚脫氧核苷酸,脫氧核苷酸之間是通過3ˊ,5ˊ-磷酸二酯鍵連接的。DNA是遺傳信息的載體。核糖核酸〔RNA,ribonucleicacid〕:通過3ˊ,5ˊ-磷酸二酯鍵連接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。核糖體核糖核酸〔rRNA,ribosomalrobonucleicacid〕:作為核糖體組成成分的一類RNA,rRNA是細胞內(nèi)最豐富的RNA。信使核糖核酸〔mRNA,messengerribonucleicacid〕:一類用作蛋白質(zhì)合成模板的RNA。轉(zhuǎn)移核糖核酸〔tRNA,transferribonucleicacid〕:一類攜帶激活氨基酸,將它帶到蛋白質(zhì)合成部位并將氨基酸整合到生長著的肽鏈上的RNA。tRNA含有能識別模板mRNA上互補密碼的反密碼。轉(zhuǎn)化〔作用〕〔transformation〕:一個外源DNA通過某種途徑導入一個宿主菌,引起該細菌的遺傳特性改變的作用。轉(zhuǎn)導〔作用〕〔transduction〕:借助于病毒載體,遺傳信息從一個細胞轉(zhuǎn)移到另一個細胞。堿基對〔basepair〕:通過堿基之間氫鍵配對的核酸鏈中的兩個核苷酸,例如A與T或U,以及G與C配對。查格夫法那么〔Chargaff'srules〕:所有DNA中腺嘌呤與胸腺嘧啶的摩爾含量相等,〔A=T〕,鳥嘌呤和胞嘧啶的摩爾含量相等〔G=C〕,即嘌呤的總含量與嘧啶的總含量相等〔A+G=T+C〕。DNA的堿基組成具有種的特異性,但沒有組織和器官的特異性。另外生長發(fā)育階段、營養(yǎng)狀態(tài)和環(huán)境的改變都不影響DNA的堿基組成。DNA雙螺旋(DNAdoublehelix):一種核酸的構(gòu)象,在該構(gòu)象中,兩條反向平行的多核苷酸鏈圍繞彼此纏繞形成一個右手的雙螺旋結(jié)構(gòu)。堿基位于雙螺旋內(nèi)側(cè),磷酸與糖基在外側(cè),通過磷酸二酯鍵相連,形成核酸的骨架。堿基平面與假想的中心軸垂直,糖環(huán)平面那么與軸平行。兩條鏈皆為右手螺旋。雙螺旋的直徑為2nm,堿基堆積距離為0.34nm,兩核苷酸之間的夾角是36°,每對螺旋由10對堿基組成,堿基按A-T,G-C配對互補,彼此以氫鍵相連系。維持DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的力主要是堿基堆積力。雙螺旋外表有兩條寬窄、深淺不一的一個大溝和一個小溝。大溝(majorgroove)和小溝(minorgroove):繞B-DNA雙螺旋外表上出現(xiàn)的螺旋槽〔溝〕,寬的溝稱之大溝,窄溝稱之小溝。大溝、小溝都是由于堿基對堆積和糖-磷酸骨架扭轉(zhuǎn)造成的。DNA超螺旋〔DNAsupercoiling〕:DNA本身的卷曲,一般是DNA雙螺旋的彎曲、欠旋〔負超螺旋〕或過旋〔正超螺旋〕的結(jié)果。拓撲異構(gòu)酶〔topoisomerase〕:通過切斷DNA的一條或兩條鏈中的磷酸二酯鍵,然后重新纏繞和封口來改變DNA連環(huán)數(shù)的酶。拓撲異構(gòu)酶I通過切斷DNA中的一條鏈減少負超螺旋,增加一個連環(huán)數(shù);而拓撲異構(gòu)酶II切斷DNA的兩條鏈增加負超螺旋,減少2個連環(huán)數(shù)。某些拓撲異構(gòu)酶II也稱之DNA促旋酶。核小體〔nucleosome〕:用于包裝染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)單位,是由DNA鏈繞一個組蛋白核纏繞構(gòu)成的。染色質(zhì)(chromatin):是存在于真核生物間期細胞核內(nèi),易被堿性染料著色的一種無定形物質(zhì)。染色質(zhì)中含有作為骨架的完整的雙鏈DNA,以及組蛋白、非組蛋白和少量的RNA。染色體(chromosome):是染色質(zhì)在細胞分裂過程中經(jīng)過緊密纏繞、折疊、凝縮和精細包裝形成的具有固定形態(tài)的遺傳物質(zhì)存在形式。簡言之,染色體是一個大的單一的雙鏈DNA分子與相關(guān)蛋白質(zhì)組成的復合物,DNA中含有許多基因,貯存和傳遞遺傳信息。DNA變性(DNAdenaturation):DNA雙鏈解鏈別離成兩條單鏈的現(xiàn)象。退火〔annealing〕:即DNA由單鏈復性變成雙鏈結(jié)構(gòu)的過程。來源相同的DNA單鏈經(jīng)退火后完全恢復雙鏈結(jié)構(gòu),同源DNA之間、DNA和RNA之間退火后形成雜交分子。融解溫度(meltingtemperature,Tm):雙鏈DNA融解徹底變成單鏈DNA的溫度范圍的中點溫度。增色效應(yīng)〔hyperchromiceffect〕:當雙螺旋DNA融解〔解鏈〕時,260nm處紫外吸收增加的現(xiàn)象。減色效應(yīng)〔hypochromiceffect〕:隨著核酸復性,紫外吸收降低的現(xiàn)象。核酸內(nèi)切酶(endonuclease):核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶中能夠水解核酸分子內(nèi)磷酸二酯鍵的酶。核酸外切酶(exonuclease):從核酸鏈的一端逐個水解下核苷酸的酶。限制性內(nèi)切酶〔restrictionendonucleases〕:一種在特殊核苷酸序列處水解雙鏈DNA的內(nèi)切酶。I型限制性內(nèi)切酶既催化宿主DNA的甲基化,又催化非甲基化的DNA的水解;而II型限制性內(nèi)切酶只催化非甲基化的DNA的水解。限制酶圖譜(restrictionmap):同一DNA用不同的限制酶進行切割從而獲得各種限制酶的切割位點,由此建立的位點圖譜有助于對DNA的結(jié)構(gòu)進行分析。反向重復序列(invertedrepeatsequence):在同一多核苷酸鏈內(nèi)的相反方向上存在的重復的核苷酸序列。在雙鏈DNA中反向重復可能引起十字形結(jié)構(gòu)的形成。重組DNA技術(shù)〔recombinationDNAtechnology〕:也稱之基因工程(genomicengineering)。利用限制性內(nèi)切酶和載體,按照預(yù)先設(shè)計的要求,將一種生物的某種目的基因和載體DNA重組后轉(zhuǎn)人另一生物細胞中進行復制、轉(zhuǎn)錄和表達的技術(shù)?;颉瞘ene〕:也稱之順反子〔cistron〕。泛指被轉(zhuǎn)錄的一個DNA片段。在某些情況下,基因常用來指編碼一個功能蛋白或RNA分子的DNA片段。分解代謝反響〔catabolicreaction〕:降解復雜分子為生物體提供小的構(gòu)件分子和能量的代謝反響。合成代謝反響〔anabolicreaction〕:合成用于細胞維持和生長所需要的分子的代謝反響。反響抑制〔feedbackinhibition〕:催化一個代謝途徑中前面反響的酶受到同一途徑的終產(chǎn)物抑制的現(xiàn)象。前饋激活〔feed-forwardactivation〕:代謝途徑中一個酶被該途徑中前面產(chǎn)生的代謝物激活的現(xiàn)象。標準自由能變化〔ΔG°〕〔standardfree-energychange〕:在一系列標準條件〔溫度:298K;壓力:1個大氣壓;所有溶質(zhì)的濃度都是1M〕下發(fā)生的反響的自由能變化。ΔG°ˊ表示pH7.0條件下的標準自由能變化。標準復原電位〔E°ˊ〕〔standardreductionpotential〕:25℃和pH7.0條件下一個復原劑和它的氧化形式在1M濃度下表現(xiàn)出的電動勢。酵解(glycolysis):一個由10步酶促反響組成的糖分解代謝途徑,通過該途徑,一分子葡萄糖轉(zhuǎn)換為兩分子丙酮酸,同時凈生成兩分子ATP和兩分子NADH。發(fā)酵(fermentation):營養(yǎng)分子〔例如葡萄糖〕產(chǎn)能的厭氧降解,在乙醇發(fā)酵中,丙酮酸轉(zhuǎn)化為乙醇和CO2。巴斯德效應(yīng)(Pasteureffect):氧存在下,酵解速度放慢的現(xiàn)象。底物水平磷酸化(substratephosphorylation):ADP或某些其它的核苷-5ˊ-二磷酸的磷酸化是通過來自一個非核苷酸底物的磷?;霓D(zhuǎn)移實現(xiàn)的。這種磷酸化與電子傳遞鏈無關(guān)。檸檬酸循環(huán)〔citricacidcycle〕:也稱之三羧酸循環(huán)(tricarboxylicacidcycle),Krebs循環(huán)〔Krebscycle〕。是用于乙酰CoA中的乙?;趸蒀O2的酶促反響的循環(huán)系統(tǒng),該循環(huán)的第一步反響是由乙酰CoA和草酰乙酸縮合形成檸檬酸回補反響〔anapleroticreaction〕:酶催化的補充檸檬酸循環(huán)中間代謝物的供給的反響,例如由丙酮酸羧化生成草酰乙酸的反響。乙醛酸循環(huán)〔glyoxylatecycle〕:是某些植物、細菌和酵母中檸檬酸循環(huán)的修改形式,通過該循環(huán)可以由乙酰CoA經(jīng)草酰乙酸凈生成葡萄糖。乙醛酸循環(huán)繞過了檸檬酸循環(huán)中生成兩個CO2的步驟。戊糖磷酸途徑〔pentosephosphatepathway〕:也稱之磷酸己糖支路〔hexosemonophosphateshunt〕。是一個葡萄糖-6-磷酸經(jīng)代謝產(chǎn)生NADPH和核糖-5-磷酸的途徑。該途徑包括氧化和非氧化兩個階段,在氧化階段,葡萄糖-6-磷酸轉(zhuǎn)化為核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成兩分子的NADPH;在非氧化階段,核酮糖-5-磷酸異構(gòu)化生成核糖-5-磷酸或轉(zhuǎn)化為酵解中的兩個中間代謝物果糖-6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。糖醛酸途徑(glucuronatepathway):從葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1-磷酸開始,經(jīng)UDP-葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗壞血酸的途徑。但只有在植物和那些可以合成抗壞血酸〔維生素C〕動物體內(nèi),通過該途徑可以合成維生素C。無效循環(huán)〔futilecycle〕:也稱之底物循環(huán)〔substratecycle〕。一對催化兩個途徑的中間代謝物之間循環(huán)的方向相反、代謝上不可逆的反響。有時該循環(huán)通過ATP的水解導致熱能的釋放。例如,葡萄糖+ATP=葡萄糖-6-磷酸+ADP與葡萄糖-6-磷酸+H2O=葡萄糖+Pi反響組成的循環(huán)反響,其凈反響實際上是ATP+H2O=ADP+Pi。磷酸解〔作用〕〔phosphorolysis〕:在分子內(nèi)通過引入一個無機磷酸形成磷酸酯鍵而使原來鍵斷裂的方式。實際上引入了一個磷酰基。半乳糖血癥〔galactosemia〕:人類的一種基因型遺傳代謝缺陷,特點是由于缺乏1-磷酸半乳糖尿苷酰轉(zhuǎn)移酶導致嬰兒不能代謝奶汁中乳糖分解生成的半乳糖。尾部生長〔tailwardgrowth〕:一種聚合反響機理,經(jīng)過活化的單體的頭部結(jié)到聚合物的尾部,連接到聚合物尾部的單體的尾部又成了接收下一個單體的受體。糖異生作用(gluconeogenesis):由簡單的非糖前體轉(zhuǎn)變?yōu)樘堑倪^程。糖異生不是糖酵解的簡單逆轉(zhuǎn)。雖然由丙酮酸開始的糖異生利用了糖酵解中的7步近似平衡反響的逆反響,但還必須利用另外4步酵解中不曾出現(xiàn)的酶促反響繞過酵解中的三個不可逆反響。呼吸電子傳遞鏈〔respiratoryelectron-transportchain〕:由一系列可作為電子載體的酶復合體和輔助因子構(gòu)成,可將來自復原型輔酶或底物的電子傳遞給有氧代謝的最終電子受體分子氧〔O2〕。氧化磷酸化(oxidativephosphorylation):電子從一個底物傳遞給分子氧的氧化與酶催化的由ADP和Pi生成ATP的磷酸化相偶聯(lián)的過程?;瘜W滲透理論(chemiosmotictheory):一種學說,主要論點是底物氧化期間建立的質(zhì)子濃度梯度提供了驅(qū)動由ADP和Pi形成ATP的能量。解偶聯(lián)劑〔uncouplingagent〕:一種使電子傳遞與ADP磷酸化之間的緊密偶聯(lián)關(guān)系解除的化合物,例如2,4-二硝基苯酚。P/O比(P/Oratio):在氧化磷酸化中,每1/2O2被復原時形成的ATP的摩爾數(shù)。電子從NADH傳遞給O2時,P/O比為3,而電子從FADH2傳遞給O2時,P/O比為2。高能化合物(highenergycompound):在標準條件下水解時自由能大幅度減少的化合物。一般是指水解釋放的能量能驅(qū)動ADP磷酸化合成ATP的化合物。葉綠體〔chloroplast〕:藻類和植物中含有葉綠素進行光合作用的器官。葉綠素〔chlorophyll〕:光合作用膜中的綠色色素,它是光合生物中主要的捕獲光的成分。輔助色素〔accessorypigments〕:在植物和光合細菌中象類胡蘿卜素、葉黃素和藻膽〔色〕素那樣吸收可見光的色素,這類色素是對葉綠素捕獲光能的補充。光合作用(photosynthesis):綠色植物或光合細菌利用光能將CO2轉(zhuǎn)化成有機化合物的過程。光合磷酸化(photophosphorylation):在葉綠體ATP合成酶催化下依賴于光的由ADP和Pi合成ATP的過程。光反響(lightreactions):光合色素將光能轉(zhuǎn)變成化學能并形成ATP和NADPH的過程。暗反響(darkreactions):利用光反響生成的ATP和NADPH的化學能使CO2復原成糖或其它有機物的一系列酶促過程。β氧化途徑(βoxidationpathway):是脂肪酸氧化分解的主要途徑,脂肪酸被連續(xù)地在β碳氧化降解生成乙酰CoA,同時生成NADH和FADH2,因此可產(chǎn)生大量的ATP。該途徑因脫氫和裂解均發(fā)生在β位碳原子而得名。每一輪脂肪酸β氧化都是由4步反響組成:氧化、水化、再氧化和硫解。肉毒堿穿梭系統(tǒng)〔carnitineshuttlesystem〕:脂酰CoA通過形成脂酰肉毒堿從細胞質(zhì)轉(zhuǎn)運到線粒體的一個穿梭循環(huán)途徑。酮體(acetonebody):在肝臟中由乙酰CoA合成的燃料分子〔β羥基丁酸、乙酰乙酸和丙酮〕。在饑餓期間酮體是包括腦在內(nèi)的許多組織的燃料,酮體過多將導致中毒。檸檬酸轉(zhuǎn)運系統(tǒng)〔citratetransportsystem〕:將乙酰CoA從線粒體轉(zhuǎn)運到細胞質(zhì)的穿梭循環(huán)途徑。在轉(zhuǎn)運乙酰CoA的同時,細胞質(zhì)中的NADH氧化成NAD+、NADP+復原為NADPH。每循環(huán)一次消耗2分子ATP。酰基載體蛋白〔ACP,acylcarrierprotein〕:通過硫酯鍵結(jié)合脂肪酸合成的中間代謝物的蛋白質(zhì)〔原核生物〕或蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域〔真核生物〕。生物固氮作用(Biologicalnitrogenfixation):大氣中的氮被復原為氨的過程。生物固氮只發(fā)生在少數(shù)的細菌和藻類中。尿素循環(huán)〔ureacycle〕:是一個由4步酶促反響組成的可以將來自氨和天冬氨酸的氮轉(zhuǎn)化為尿素的代謝循環(huán)。該循環(huán)是發(fā)生在脊椎動物肝臟中的一個代謝循環(huán)。脫氨(deamination):在酶的催化下從生物分子〔氨基酸或核苷酸分子〕中除去氨基的過程。氧化脫氨〔oxidativedeamination〕:α-氨基酸在酶的催化下脫氨生成相應(yīng)α-酮酸的過程。氧化脫氨過程實際上包括脫氫和水解兩個步驟。轉(zhuǎn)氨酶〔transaminases〕:也稱之氨基轉(zhuǎn)移酶〔aminotransferases〕。催化一個α-氨基酸的α-氨基向一個α-酮酸轉(zhuǎn)移的酶。轉(zhuǎn)氨(transamination):一個α-氨基酸的α-氨基借助轉(zhuǎn)氨酶的催化作用轉(zhuǎn)移到一個α-酮酸的過程。乒乓反響〔ping-pongreaction〕:在該反響中,酶結(jié)合一個底物并釋放出一個產(chǎn)物,留下一個取代酶,然后該取代酶再結(jié)合第二個底物和釋放出第二個產(chǎn)物,最后酶恢復到它的起始狀態(tài)。生糖氨基酸(glucogenicaminoacids):那些降解能生成可作為糖異生前體分子,例如丙酮酸或檸檬酸循環(huán)中間代謝物的氨基酸。生酮氨基酸(acetonegenicaminoacid):那些降解可生成乙酰CoA或酮體的氨基酸。苯酮尿癥〔phenylketonuria〕:是由于苯丙氨酸羥化酶缺乏引起苯丙酮酸堆積的代謝遺傳病。缺乏苯丙氨酸羥化酶,苯丙氨酸只能靠轉(zhuǎn)氨生成苯丙酮酸,病人尿中排出大量苯丙酮酸。苯丙酮酸堆積對神經(jīng)有毒害,智力發(fā)育出現(xiàn)障礙。尿黑酸癥〔alcaptonuria〕:是酪氨酸代謝中缺乏尿黑酸氧化酶引起的代謝遺傳病。這種病人尿中含有尿黑酸,在堿性條件下暴露于氧氣氧化并聚合為類似于黑色素的物質(zhì),從而使尿成黑色。核苷磷酸化酶(nucleosidephosphorylase):能分解核苷生成含氮堿和戊糖的磷酸酯的酶。核苷水解酶(nucleosidehydrolase):能分解核苷生成含氮堿和戊糖的酶。從頭合成(denovosynthesis):生物體內(nèi)用簡單的前體物質(zhì)合成生物分子的途徑,例如核苷酸的從頭合成。補救途徑(salvagepathway):與從頭合成途徑不同,生物分子的合成,例如核苷酸可以由該類分子降解形成的中間代謝物,如堿基等來合成,該途徑是一個再循環(huán)途徑。痛風〔gout〕:是尿酸過量生產(chǎn)或尿酸排泄不充分引起的尿酸堆積造成的,尿酸結(jié)晶堆積在軟骨、軟組織、腎臟以及關(guān)節(jié)處。在關(guān)節(jié)處的沉積會造成劇烈的疼痛。別嘌呤醇〔allopurinol〕:是結(jié)構(gòu)上〔嘌呤環(huán)上第7位是C,第8位是N〕類似于次黃嘌呤的化合物,對黃嘌呤氧化酶有很強抑制作用,常用來治療痛風。自殺抑制作用〔suicidesubstrate〕:底物類似物經(jīng)酶催化生成的產(chǎn)物變成了該酶的抑制劑。例如別嘌呤醇對黃嘌呤氧化酶的抑制就屬于這種抑制類型。Lesch-Nyhan綜合癥〔Lesch-Nyhan〕:也稱之自毀容貌癥,是由于次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶的遺傳缺陷引起的。缺乏該酶使得次黃嘌呤和鳥嘌呤不能轉(zhuǎn)換為IMP和GMP,而是降解為尿酸,過量尿酸將導致Lesch-Nyhan綜合癥。激素〔hormone〕:一類由內(nèi)分泌組織合成的微量的化學物質(zhì),它由血液運輸?shù)桨薪M織,起著一個信使的作用調(diào)節(jié)靶組織〔器官〕的功能。激素受體〔hormonereceptor〕:位于細胞外表或細胞內(nèi)結(jié)合特異激素并引發(fā)細胞響應(yīng)的蛋白質(zhì)。第二信使(secondmessenger):響應(yīng)外部信號〔第一信使〕,例如激素而在細胞內(nèi)合成的效應(yīng)分子,例如cAMP、肌醇三磷酸或二?;视偷?。第二信使再去調(diào)節(jié)靶酶,引起細胞內(nèi)各種效應(yīng)。級聯(lián)放大(cascade):在體內(nèi)的不同部位,通過一系列的酶促反響來傳遞一個信息,并且初始信息在傳到系列反響的最后時,信號得到放大,這樣的一個系列叫做級聯(lián)系統(tǒng)。最普通的類型是蛋白水解和蛋白質(zhì)磷酸化的級聯(lián)放大。G蛋白(Gproteins):在細胞內(nèi)信號傳導途徑中起著重要作用的GTP結(jié)合蛋白質(zhì),由α、β、γ三個不同亞基組成。與激素受體結(jié)合的配體誘導GTP與G蛋白結(jié)合的GDP進行交換,結(jié)果激活位于信號傳導途徑中下游的腺苷酸環(huán)化酶。G蛋白將胞外的第一信使腎上腺素等激素和胞內(nèi)的腺苷酸環(huán)化酶催化的腺苷酸環(huán)化生成的第二信使cAMP聯(lián)系起來。G蛋白具有內(nèi)源GTP酶活性。激素效應(yīng)元件〔hormoneresponseelements,HRE〕:是指類固醇、甲狀腺素等激素受體結(jié)合的一段短的DNA序列〔12~20bp〕,這類受體結(jié)合DNA后可改變相鄰基因的表達。半保存復制(semiconservativereplication):DNA復制的一種方式。每條鏈都可用作合成互補鏈的模板,合成出兩分子的雙鏈DNA,每個分子都是由一條親代鏈和一條新合成的鏈組成。復制叉〔replicationforks〕:Y字型結(jié)構(gòu),在復制叉處作為模板的雙鏈DNA解旋,同時合成新的DNA鏈。DNA聚合酶〔DNApolymerase〕:以DNA為模板催化核苷酸殘基加到已存在的聚核苷酸的3ˊ末端反響的酶。某些DNA聚合酶具有外切核酸酶的活性,可用來校正新合成的核苷酸序列。Klenow片段(Klenowfragment):E.coliDNA聚合酶I經(jīng)局部水解生成的C末端605個氨基酸殘基片段。該片段保存了DNA聚合酶I的5ˊ-3ˊ聚合酶和3ˊ-5ˊ外切酶活性,但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切酶活性。前導鏈〔leadingstrand〕:與復制叉移動的方向一致,通過連續(xù)地5ˊ→3ˊ聚合合成的新的DNA鏈。滯后鏈〔laggingstrand〕:與復制叉移動的方向相反,通過不連續(xù)地5ˊ→3ˊ聚合合成的新的DNA鏈。岡崎片段(Okazakifragments):相比照擬短的DNA鏈〔大約1000核苷酸殘基〕,是在DNA的滯后鏈的不連續(xù)合成期間生成的片段,這是ReijiOkazaki在DNA合成實驗中添加放射性的脫氧核苷酸前體觀察到的。引發(fā)體〔primosome〕:一種多蛋白復合體,E.coli中的引發(fā)體包括催化滯后鏈不連續(xù)DNA合成所需要的短的RNA引物合成的引發(fā)酶、解旋酶。復制體(replisome):一種多蛋白復合體,包含DNA聚合酶、引發(fā)酶、解旋酶、單鏈結(jié)合蛋白和其它輔助因子。復制體位于每個復制叉處執(zhí)行著細菌染色體DNA復制的聚合反響。單鏈結(jié)合蛋白〔SSB,single-strandbindingprotein〕:一種與單鏈DNA結(jié)合緊密的蛋白質(zhì),它的結(jié)合可以防止復制叉處的單鏈DNA本身重新折疊回雙鏈區(qū)。滾環(huán)復制〔rolling-circlereplication〕:復制環(huán)狀DNA的一種模式,在該模式中,DNA聚合酶結(jié)合在一個缺口鏈的3ˊ端,繞環(huán)合成與模板鏈互補的DNA,每一輪都是新合成的DNA取代前一輪合成的DNA。逆轉(zhuǎn)錄酶〔reversetranscriptase〕:一種催化以RNA為模板合成DNA的DNA聚合酶,具有RNA指導的DNA合成、水解RNA和DNA指導的DNA合成的酶活性?;パaDNA(cDNA,complementaryDNA):通過逆轉(zhuǎn)錄酶由mRNA模板合成的雙鏈DNA。聚合酶鏈式反響〔PCR,polymerasechainreaction〕:擴增樣品中的DNA量和富集眾多DNA分子中的一個特定DNA序列的一種技術(shù)。在該反響中,使用與目的DNA序列互補的寡核苷酸作為引物,進行多輪的DNA合成。其中包括DNA變性、引物退火和在TaqDNA聚合酶催化下的DNA合成。直接修復〔directrepair〕:是通過一種可連續(xù)掃描DNA,識別出損傷部位的蛋白質(zhì)將損傷部位直接修復的方法。該修復方法不用切斷DNA或切除堿基。切除修復〔excisionrepair〕:通過切除-修復內(nèi)切酶使DNA損傷消除的修復方法。一般是切去損傷區(qū),然后在DNA聚合酶的作用下以露出的單鏈為模板合成新的互補鏈,最后用連接酶將缺口連接起來。錯配修復〔mismatchrepair〕:在含有錯配堿基的DNA分子中使正常核苷酸序列恢復的修復方式。這種修復方式的特點是:識別出正確的鏈,切除掉不正確鏈的局部,然后通過DNA聚合酶和DNA連接酶的作用合成正確配對的雙鏈DNA。遺傳學中心法那么〔geneticcentraldogma〕:描述從一個基因到相應(yīng)蛋白質(zhì)的信息流的途徑。遺傳信息貯存在DNA中,DNA被復制傳給子代細胞,信息被拷貝或由DNA被轉(zhuǎn)錄成RNA,然后RNA被翻譯成多肽鏈。不過由于逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn),也可以以RNA為模板合成DNA。轉(zhuǎn)錄〔transcription〕:在由RNA聚合酶和輔助因子組成的轉(zhuǎn)錄復合體的催化下,從雙鏈DNA分子中拷貝生物信息生成單一一條RNA鏈的過程。模板鏈(templatestrand):可作為模板轉(zhuǎn)錄為RNA的那條鏈,該鏈與轉(zhuǎn)錄的RNA堿基互補〔A-U,G-C〕。在轉(zhuǎn)錄過程中,RNA聚合酶與模板鏈結(jié)合,并沿著模板鏈的3ˊ→5ˊ方向移動,按照5ˊ→3ˊ方向催化RNA的合成。編碼鏈〔codingstrand〕:雙鏈DNA中,不能進行轉(zhuǎn)錄的那條DNA鏈,該鏈的核苷酸序列與轉(zhuǎn)錄生成的RNA的序列一致〔在RNA中是以U取代了DNA中的T〕。核心酶(coreenzyme):大腸桿菌的RNA聚合酶全酶由五個亞基〔α2ββ'δ〕組成,沒有δ亞基的酶叫核心酶。核心酶只能使已開始合成的RNA鏈延長,但不具有起始合成RNA的能力,必需參加δ亞基才表現(xiàn)出全部聚合酶的活性。RNA聚合酶(RNApolymerase):以一條DNA鏈或RNA為模板催化由核苷-5ˊ-三磷酸合成RNA的酶。啟動子〔promoter〕:DNA分子中RNA聚合酶能夠結(jié)合并導致轉(zhuǎn)錄起始的序列。內(nèi)含子〔introns〕:在轉(zhuǎn)錄后的加工中,從最初的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物除去的內(nèi)部的核苷酸序列。術(shù)語內(nèi)含子也指編碼相應(yīng)RNA內(nèi)含子的DNA中的區(qū)域。外顯子〔exons〕:既存在于最初的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。術(shù)語外顯子也指編碼相應(yīng)RNA外顯子的DNA中的區(qū)域。終止因子(terminationfactors):協(xié)助RNA聚合酶識別終止信號的輔助因子〔蛋白質(zhì)〕。核酶〔ribozymes〕:具有象酶那樣催化功能的RNA分子。剪接體〔spliceosome〕:大的蛋白質(zhì)-RNA復合體,它催化內(nèi)含子從mRNA前體中除去的反響。RNA加工過程〔RNAprocessing〕:將一個RNA原初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物轉(zhuǎn)換成成熟RNA分子的反響過程。加工包括從原初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中刪除一些核苷酸,添加一些基因沒有編碼的核苷酸,和對某些堿基進行共價修飾。RNA剪接〔RNAsplicing〕:從DNA模板鏈轉(zhuǎn)錄出的最初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中除去內(nèi)含子,并將外顯子連接起來形成一個連續(xù)的RNA分子的過程。翻譯〔translation〕:在蛋白質(zhì)合成期間將存在于mRNA上代表一個多肽鏈的核苷酸殘基序列轉(zhuǎn)換為多肽鏈氨基酸殘基序列的過程。遺傳密碼〔geneticcode〕:核酸中的核苷酸殘基序列與蛋白質(zhì)中的氨基酸殘基序列之間的對應(yīng)關(guān)系。連續(xù)的3個核苷酸殘基序列為一個密碼,特指一個氨基酸。標準的遺傳密碼是由64個密碼組成的,幾乎為所有生物通用。起始密碼〔iniationcodon〕:指定蛋白質(zhì)合成起始位點的密碼。最常見的起始密碼是蛋氨酸密碼:AUG。終止密碼〔terminationcodon〕:任何tRNA分子都不能正常識別的、但可被特殊蛋白結(jié)合并引起新合成的肽鏈從翻譯機器上釋放的密碼。存在三個終止密碼:UAG,UAA和UGA。密碼子(codon):mRNA〔或DNA〕上的三聯(lián)體核苷酸殘基序列,該序列編碼著一個指定的氨基酸,tRNA的反密碼子與mRNA的密碼子互補。反密碼子〔anticodon〕:tRNA分子的反密碼環(huán)上的三聯(lián)體核苷酸殘基序列。在翻譯期間,反密碼與mRNA中的互補密碼結(jié)合。兼并密碼子(degeneratecodon):也稱之同義密碼子〔synonymouscodon〕。是指編碼相同氨基酸的幾個不同的密碼子。氨基酸臂〔aminoarm〕:也稱之接納莖〔acceptorstem〕。tRNA分子中靠近3ˊ端的核苷酸序列和5ˊ端的序列堿基配對,形成的可接收氨基酸的臂〔莖〕。TψC臂〔TψCarm〕:tRNA中含有胸腺嘧啶核苷酸-假尿嘧啶核苷酸-胞嘧啶核苷酸殘基序列的莖環(huán)結(jié)構(gòu)。氨酰-tRNA〔aminoacyl-tRNA〕:在氨基酸臂的3ˊ端的腺苷酸殘基共價連接了氨基酸的tRNA分子。同工tRNA〔isoacceptortRNA〕:結(jié)合相同氨基酸的不同的tRNA分子。擺動(wobble):處于密碼子3ˊ端的堿基和與之互補的反密碼的5ˊ端的堿基之間的堿基配對有一定的寬容性,即處于反密碼的5ˊ端的堿基〔也稱之擺動位置〕,例如I可以與密碼子上3ˊ端的U、C和A配對。由于存在擺動現(xiàn)象所以使得一個tRNA反密碼子可以和一個以上的mRNA密碼子結(jié)合。氨酰-tRNA合成酶〔aminoacyl-tRNAsynthetase〕:催化特定氨基酸激活并共價結(jié)合在相應(yīng)的tRNA分子3ˊ端的酶。翻譯起始復合體〔translationinitiationcomplex〕:由核糖體亞基、一個mRNA模板、一個起始的tRNA分子和起始因子組成并組裝在蛋白質(zhì)合成起始點的復合體。讀碼框(readingframe):代表一個氨基酸序列的mRNA分子的非重疊密碼序列。一個mRNA的讀碼框是由轉(zhuǎn)錄起始位置〔通常是AUG密碼〕確定的。SD序列〔Shine-Dalgarnosequence〕:mRNA中用于結(jié)合原核生物核糖體的序列。肽酰轉(zhuǎn)移酶〔peptidyltransferase〕:蛋白質(zhì)合成期間負責轉(zhuǎn)移肽?;痛呋逆I形成的酶。嘌呤霉素〔puromycin〕:通過整合到生長著的肽鏈,引起肽鏈合成提前終止來抑制多肽鏈合成的一種抗生素。開放讀碼框(openreadingframe):DNA或RNA序列中一段不含終止密碼的連續(xù)的非重疊核苷酸密碼。信號肽〔signalpeptide〕:常指新合成多肽鏈中用于指導蛋白質(zhì)跨膜轉(zhuǎn)移〔定位〕的N-末端的氨基酸序列〔有時不一定在N端〕。轉(zhuǎn)錄因子〔transcriptionfactor〕:在轉(zhuǎn)錄起始復合體的組裝過程中,與啟動子區(qū)結(jié)合并與RNA聚合酶相互作用的一種蛋白質(zhì)。某些轉(zhuǎn)錄因子在RNA延伸時一直維持著結(jié)合狀態(tài)。操縱子〔operons〕:是由一個或多個相關(guān)基因以及調(diào)控它們轉(zhuǎn)錄的操縱基因和啟動子序列組成的基因表達單位。操縱基因〔operator〕:與特定阻遏蛋白相互作用調(diào)控一個基因或一組基因表達的DNA區(qū)。結(jié)構(gòu)基因〔structuralgene〕:編碼一個蛋白質(zhì)或一個RNA的基因。轉(zhuǎn)錄激活劑〔transcriptionalactivator〕:通過增加RNA聚合酶的活性來加快轉(zhuǎn)錄速度的一種調(diào)節(jié)DNA結(jié)合蛋白。阻遏物〔repressor〕:與一個基因的調(diào)控序列或操縱基因結(jié)合以阻止該基因轉(zhuǎn)錄的一類蛋白質(zhì)。衰減作用〔attenuation〕:一種翻譯調(diào)控機制。在該機制中,核糖體沿著mRNA分子的移動的速率決定轉(zhuǎn)錄是進行還是終止。亮氨酸拉鏈〔leucinezipper〕:出現(xiàn)在DNA結(jié)合蛋白質(zhì)和其它蛋白質(zhì)中的一種結(jié)構(gòu)基元〔motif〕。當來自同一個或不同多肽鏈的兩個兩性的α-螺旋的疏水面〔常常含有亮氨酸殘基〕相互作用形成一個圈對圈的二聚體結(jié)構(gòu)時就形成了亮氨酸拉鏈。鋅指〔zincfinger〕:也是一種常出現(xiàn)在DNA結(jié)合蛋白質(zhì)中的一種結(jié)構(gòu)基元。是由一個含有大約30個氨基酸殘基的環(huán)和一個與環(huán)上的4個Cys或2個Cys和2個His配位的Zn2+構(gòu)成,形成的結(jié)構(gòu)象個手指狀。第二局部各章節(jié)習題及答案蛋白質(zhì)和氨基酸的一級結(jié)構(gòu)1、氨基酸的側(cè)鏈對多肽或蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和生物學功能非常重要。用三字母和單字母縮寫形式列出其側(cè)鏈為如下要求的氨基酸:

〔a〕含有一個羥基。

〔b〕含有一個氨基。

〔c〕含有一個具有芳香族性質(zhì)的基團。

〔d〕含有分支的脂肪族烴鏈。

〔e〕含有硫。

〔f〕含有一個在pH7-10范圍內(nèi)可作為親核體的基團或原子,指出該親核基團或原子。

答:〔a〕Ser〔S〕,Thr〔T〕,Tyr〔Y〕

〔b〕Asn〔N〕,Gln〔Q〕,Arg〔R〕,Lys〔K〕

〔c〕Phe〔F〕,Trp〔W〕,Tyr〔Y〕,

〔d〕Ile〔I〕,Leu〔L〕,Val〔V〕

〔e〕Cys〔C〕,Met〔M〕

〔f〕可以作為親核試劑的側(cè)鏈基團或原子有位于Ser〔S〕,Thr〔T〕和Tyr〔Y〕中的-OH;位于Cys〔C〕和Met〔M〕中的硫原子,位于Asp〔D〕和Glu〔E〕中的-COO-;以及位于His〔H〕和Lys〔k〕中的氮原子。2、一種氨基酸的可解離基團可以帶電或中性狀態(tài)存在,這取決于它的pK值和溶液的pH。

〔a〕組氨酸有3種可解離基團,寫出相應(yīng)于每個pK值的3種解離狀態(tài)的平衡方程式。每種解離狀態(tài)下的組氨酸分子的凈電荷是多少?

〔b〕在pH1、4、8和12時,組氨酸的凈電荷分別是多少?將每一pH下的組氨酸置于電場中,它們將向陰極還是陽極遷移?

答:〔a〕、〔b〕見圖3、某種溶液中含有三種三肽:Tyr-Arg-Ser,Glu-Met-Phe和Asp-Pro-Lys,α-COOH基團的pKa為3.8;α-NH3基團的pKa為8.5。在哪種pH〔2.0,6.0或13.0〕下,通過電泳別離這三種多肽的效果最好?答:pH=6.0比pH=2.0或pH=13.0時電泳能提供更好的分辨率。因為在pH=6.0的條件下每種肽都帶有不同的凈電荷(+1,-1,和0),而在pH=2.0的條件下凈電荷分別為+2,+1和+2,在pH=13.0的條件下凈電荷分別為-2,-2和-2。4、利用陽離子交換層析別離以下每一對氨基酸,哪一種氨基酸首先被pH7緩沖液從離子交換柱上洗脫出來?!瞐〕Asp和Lys〔b〕Arg和Met〔c〕Glu和Val〔d〕Gly和Leu〔e〕Ser和Ala答:〔a〕Asp〔b〕Met〔c〕Glu〔d〕Gly〔e〕Ser5、氨基酸的定量分析說明牛血清白蛋白含有0.58%的色氨酸〔色氨酸的分子量為204〕。

〔a〕試計算牛血清白蛋白的最小分子量〔假設(shè)每個蛋白分子只含有一個色氨酸殘基〕。

〔b〕凝膠過濾測得的牛血清白蛋白的分子量為70,000,試問血清白蛋白分子含有幾個色氨酸殘基?答:〔a〕32,100g/mol〔b〕26、胃液〔pH=1.5〕的胃蛋白酶的等電點約為1,遠比其它蛋白質(zhì)低。試問等電點如此低的胃蛋白酶必須存在有大量的什么樣的官能團?什么樣的氨基酸才能提供這樣的基團?

答:-COO-;Asp,Glu7、某蛋白是由一定數(shù)量的鏈內(nèi)二硫鍵連接的兩個多肽鏈組成的。1.00g該蛋白樣品可以與25.0mg復原型谷胱甘肽〔GSH,MW=307〕反響。

〔a〕該蛋白的最小分子量是多少?

〔b〕如果該蛋白的真實分子量為98240,那么每分子中含有幾個二硫鍵?

〔c〕多少mg的巰基乙醇〔MW=78.0〕可以與起始的1.00g該蛋白完全反響?

答:〔a〕MW=24560;〔b〕4個二硫鍵;〔c〕6.35mg8、一個含有13個氨基酸殘基的十三肽的氨基酸組成為:Ala,Arg,2Asp,2Glu,3Gly,Leu,3Val。局部酸水解后得到以下肽段,其序列由Edman降解確定,試推斷原始寡肽的序列。

〔a〕Asp-Glu-Val-Gly-Gly-Glu-Ala

〔b〕Val-Asp-Val-Asp-Glu

〔c〕Val-Asp-Val

〔d〕Glu-Ala-Leu-Gly-Arg

〔e〕Val-Gly-Gly-Glu-Ala-Leu

〔f〕Leu-Gly–Arg答:該肽鏈的序列可以通過將肽片段的相同序列重疊排列起來獲得整個序列。見圖9、以下試劑和酶常用于蛋白質(zhì)化學的研究中:

CNBr異硫氰酸苯酯丹黃酰氯脲6mol/LHClβ-巰基乙醇水合茚三酮過甲酸胰蛋白酶胰凝乳蛋白酶,其中哪一個最適合完成以下各項任務(wù)?

〔a〕測定小肽的氨基酸序列。

〔b〕鑒定肽的氨基末端殘基。

〔c〕不含二硫鍵的蛋白質(zhì)的可逆變性。假設(shè)有二硫鍵存在時還需加什么試劑?

〔d〕在芳香族氨基酸殘基羧基側(cè)水解肽鍵。

〔e〕在蛋氨酸殘基羧基側(cè)水解肽鍵。

〔f〕在賴氨酸和精氨酸殘基側(cè)水解肽鍵。

答:〔a〕異硫氰酸苯酯。〔b〕丹黃酰氯?!瞔〕脲;β-巰基乙醇復原二硫鍵。〔d〕胰凝乳蛋白酶。〔e〕CNBr。〔f〕胰蛋白酶10、由以下信息求八肽的序列。

〔a〕酸水解得Ala,Arg,Leu,Met,Phe,Thr,2Val

〔b〕Sanger試劑處理得DNP-Ala。

〔c〕胰蛋白酶處理得Ala,Arg,Thr和Leu,Met,Phe,2Val。當以Sanger試劑處理時分別得到DNP-Ala和DNP-Val。

〔d〕溴化氰處理得Ala,Arg,高絲氨酸內(nèi)酯,Thr,2Val,和Leu,Phe,當用Sanger試劑處理時,分別得DNP-Ala和DNP-Leu。答:Ala-Thr-Arg-Val-Val-Met-Leu-Phe蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)和功能1、在結(jié)晶肽的X-射線研究中,LinusPauling和Robertcorey發(fā)現(xiàn)肽鏈中的肽鍵〔C-N〕長度〔1.32A〕介于典型的C-N單鍵〔1.49A〕和C=N雙鍵〔1.27A〕之間。他們也發(fā)現(xiàn)肽鍵呈平面狀〔與肽鍵相連接的4個原子位于同一個平面〕以及兩個碳原子彼此呈反式〔位于肽鍵的兩側(cè)〕與肽鍵連接。

〔a〕肽鍵的長度與它的鍵的強度和鍵級〔是單鍵、雙鍵或三鍵〕有什么關(guān)系?

〔b〕從Pauling等人的觀察,就肽鍵旋轉(zhuǎn)能得出什么看法?答:〔a〕鍵越短其強度越高,而且其鍵級越高〔在單鍵以上〕。肽鍵的強度比單鍵強,鍵的特性介于單鍵和雙鍵之間。〔b〕在生理溫度下,肽鍵旋轉(zhuǎn)比擬困難,因為它有局部雙鍵特性。2、羊毛衫等羊毛制品在熱水中洗后在電枯燥器內(nèi)枯燥,那么收縮。但絲制品進行同樣處理,卻不收縮。如何解釋這兩種現(xiàn)象?答:羊毛纖維多肽鏈的主要結(jié)構(gòu)單位是連續(xù)的α-螺旋圈,其螺距為5.4A。當處于熱水〔或蒸汽〕環(huán)境下,使纖維伸展為具有β-折疊構(gòu)象的多肽鏈。在β-折疊構(gòu)象中相鄰R基團之間的距離是7.0A。當枯燥后,多肽鏈重新由β折疊轉(zhuǎn)化為α螺旋構(gòu)象,所以羊毛收縮了。而絲制品中的主要成分是絲心蛋白,它主要是由呈現(xiàn)β折疊構(gòu)象的多肽鏈組成的,絲中的β-折疊含有一些小的、包裝緊密的氨基酸側(cè)鏈,所以比羊毛中的α-螺旋更穩(wěn)定,水洗和枯燥其構(gòu)象根本不變。3、人的頭發(fā)每年以15至20cm的速度生長,頭發(fā)主要是α角蛋白纖維,是在表皮細胞的里面合成和組裝成"繩子"。α角蛋白的根本結(jié)構(gòu)單元是α-螺旋。如果α-螺旋的生物合成是頭發(fā)生長的限速因素,計算α-螺旋鏈的肽鍵以什么樣的速度〔每秒鐘〕合成才能解釋頭發(fā)每年的生長長度?答:每秒鐘大約需合成43個肽鍵?!惨紤]到α-螺旋的每一圈含有3.6個氨基酸殘基,螺距為0.54nm〕。4、合成的多肽多聚谷氨酸〔〔Glu〕n〕,當處在pH3.0以下時,在水溶液中形成α螺旋,而在pH5.0以上時卻為伸展的形態(tài)。

〔a〕試解釋該現(xiàn)象。

〔b〕在哪種PH條件下多聚賴氨酸〔Lys〕會形成α-螺旋?答:〔a〕由可離子化側(cè)鏈的氨基酸殘基構(gòu)成的α-螺旋對pH值的變化非常敏感,因為溶液的pH值決定了側(cè)鏈是否帶有電荷,由單一一種氨基酸構(gòu)成的聚合物只有當側(cè)鏈不帶電荷時才能形成α-螺旋,相鄰殘基的側(cè)鏈上帶有同種電荷會產(chǎn)生靜電排斥力從而阻止多肽鏈堆積成α-螺旋構(gòu)象。Glu側(cè)鏈的pKa約為4.1,當pH值遠遠低于4.1〔大約3左右〕時,幾乎所有的多聚谷氨酸側(cè)鏈為不帶電荷的狀態(tài),多肽鏈能夠形成α-螺旋。在pH值為5或更高時,幾乎所有的側(cè)鏈都帶負電荷,鄰近電荷之間的靜電排斥力阻止螺旋的形成,因此使同聚物呈現(xiàn)出一種伸展的構(gòu)象。

〔b〕Lys側(cè)鏈的pK為10.5,當pH值遠遠高于10.5時,多聚賴氨酸大多數(shù)側(cè)鏈為不帶電荷的狀態(tài),該多肽可能形成一種α-螺旋構(gòu)象,在較低的pH值時帶有許多正電荷的分子可能會呈現(xiàn)出一種伸展的構(gòu)象。5、一個α-螺旋片段含有180個氨基酸殘基,該片段中有多少圈螺旋?計算該α-螺旋片段的軸長。答:該片段中含有50圈螺旋,其軸長為27nm。6、如何用二氧化碳與水的反響來解釋Bohr效應(yīng)?

〔a〕寫出由二氧化碳和水形成碳酸氫根的方程式,并解釋H+和CO2在血紅蛋白氧合中的作用。

〔b〕解釋向休克病人靜脈注射碳酸氫根的生理學依據(jù)。答:二氧化碳與水的反響說明了為什么當CO2的濃度增加時,同時會引起pH值下降,迅速進行新陳代謝的組織所產(chǎn)生的CO2</SUB與水反響生成了碳酸根離子和H+。

(a)該反響生成的H+降低了血液的pH值,從而穩(wěn)定了血紅蛋白的脫氧形式(T構(gòu)象),凈結(jié)果是P50的增加,即血紅蛋白對氧的親和力降低,于是更多的氧氣被釋放到組織中。CO2也可以通過與四條鏈的N端形成氨甲酸加合物降低血紅蛋白對氧氣的親和力、該加合物使脫氧構(gòu)象(T)保持穩(wěn)定,因而進一步增加了P50,并且促進了氧氣向組織中的釋放。

(b)休克病人組織中嚴重缺乏氧氣供給,碳酸鹽靜脈給藥為組織提供了一種CO2的來源,通過降低血紅蛋白對氧氣的親和力,CO2促使氧合血紅蛋白向組織中釋放氧氣7、一個寡聚蛋白〔MW=72000〕是由相同亞基組成的,該蛋白可以完全解離并與2,4-二硝基氟苯反響。由100mg該蛋白可以獲得5.56μM的DNP-Gly,該蛋白含有幾個亞基?

答:4個亞基。8、對懷孕的哺乳動物中氧的轉(zhuǎn)運研究顯示在同樣條件下測量嬰兒和母親的血液氧飽和曲線明顯不同。這是因為嬰兒的紅細胞中含有結(jié)構(gòu)不同的血紅蛋白F〔a2g2〕,而母親的紅細胞含有一般的血紅蛋白A〔a2g2〕。

〔a〕在生理狀況下,哪一種血紅蛋白對氧有更高的親和性。請解釋。

〔b〕不同的氧親和性有何生理意義?〕當所有的2,3-二磷酸甘油酸〔BPG〕從血紅蛋白A和F中移去后,測得的氧飽和曲線往左移。不過此時的血紅蛋白A比血紅蛋白F對氧有更高的親和性。當加回BPG時,氧飽和曲線又恢愎正常情形。BPG對血紅蛋白的氧親和性有何影響?用以上資料解釋嬰兒和母親的血紅蛋白的不同氧親和性?

答:〔a〕當氧分

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