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SectionPTHEGENETICCODEANDtRNA1精選課件pptP1THEGENETICCODE遺傳密碼是核酸中核苷酸序列編碼蛋白質(zhì)中的氨基酸序列的一種方式,是由三個(gè)核苷酸組成的三聯(lián)體密碼。(一)三聯(lián)子密碼定義
mRNA鏈上每三個(gè)核甘酸翻譯成蛋白質(zhì)多肽鏈上的一個(gè)氨基酸,這三個(gè)核甘酸就稱為密碼子或三聯(lián)子密碼(tripletcoden)
。mRNA5’GCUAGUACAAAACCU3’2精選課件ppt(二)遺傳密碼的性質(zhì)1、簡(jiǎn)并性由一種以上密碼子編碼同一個(gè)氨基酸的現(xiàn)象稱為簡(jiǎn)并(degeneracy),對(duì)應(yīng)于同一氨基酸的密碼子稱為同義密碼子(synonymouscodon)。由于64個(gè)密碼子中的許多是編碼統(tǒng)一氨基酸的,遺傳密碼具有兼并性(有豐余)3精選課件ppt4精選課件ppt減少了變異對(duì)生物的影響5精選課件ppt編碼某一氨基酸的密碼子越多,該氨基酸在蛋白質(zhì)中出現(xiàn)的頻率就越高。Arg例外6精選課件ppt2、普遍性與特殊性蛋白質(zhì)生物合成的整套密碼,從原核生物到人類都通用。已發(fā)現(xiàn)少數(shù)例外,如動(dòng)物細(xì)胞的線粒體、植物細(xì)胞的葉綠體。7精選課件ppt生物密碼子線粒體DNA編碼的氨基酸核DNA編碼的氨基酸所有UGA色氨酸終止子酵母CUA蘇氨酸亮氨酸果蠅AGA絲氨酸精氨酸哺乳類AGA/G終止子精氨酸哺乳類AUA甲硫氨酸異亮氨酸線粒體與核DNA密碼子使用情況的比較8精選課件ppt3、連續(xù)性編碼蛋白質(zhì)氨基酸序列的各個(gè)三聯(lián)體密碼連續(xù)閱讀,密碼間既無間斷也無交叉。密碼子是相連的(不重疊)、中間沒有任何的停頓9精選課件ppt開放閱讀框架(可讀框,ORF)是指新測(cè)DNA序列中,由計(jì)算機(jī)辨認(rèn)出的可能編碼趨于,它是從mRNA5
端起始密碼子AUG到3
端終止密碼子之間的核苷酸序列基因損傷引起mRNA閱讀框架內(nèi)的堿基發(fā)生插入或缺失,可能導(dǎo)致框移突變(frameshiftmutation)。10精選課件ppt4、擺動(dòng)性轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸的tRNA上的反密碼子需要通過堿基互補(bǔ)與mRNA上的遺傳密碼子反向配對(duì)結(jié)合,在密碼子與反密碼子的配對(duì)中,前兩對(duì)嚴(yán)格遵守堿基配對(duì)原則,第三對(duì)堿基有一定的自由度,可以“擺動(dòng)”,這種現(xiàn)象稱為密碼子的擺動(dòng)性。11精選課件pptMolecularBiology12精選課件pptP2tRNASTRUCTUREANDFUNCTION
一級(jí)結(jié)構(gòu)長(zhǎng)度60-95nt,通常76,含許多修飾核苷,特別是胸腺嘧啶核苷、假尿嘧啶核苷、二氫尿苷和肌苷。分子中有15個(gè)不變殘基和8個(gè)半可變殘基。MolecularBiologytRNA的結(jié)構(gòu)13精選課件ppt二級(jí)結(jié)構(gòu)三葉草結(jié)構(gòu),四個(gè)臂三個(gè)環(huán)的結(jié)構(gòu)。氨基酸接受臂在5‘和3’處。大部分不變和半可變殘基位于環(huán)上。三級(jí)結(jié)構(gòu)單鏈環(huán)堿基間形成9個(gè)氫鍵,L形三級(jí)結(jié)構(gòu),分子兩端是反密碼子及氨基酸接受臂14精選課件pptFig.2.tRNAstructure.(a)Cloverleafstructureshowingtheinvariantandsemi-variantnucleotides,whereI=inosine,Ψ=pseudouridine,R=purine,Y=pyrimidineand*indicatesamodification.(b)TertiaryhydrogenbondsbetweenthenucleotidesintRNAareshownasdashedlines.(c)TheL-shapedtertiarystructureofyeasttRNATyr.Part(c)reproducedfromD.M.Freifelder(1987)MolecularBiology,2ndEdn.
tRNAstructureMolecularBiology15精選課件ppttRNA的功能1、解讀mRNA的遺傳信息2、運(yùn)輸?shù)墓ぞ?,運(yùn)載氨基酸t(yī)RNA有兩個(gè)關(guān)鍵部位:
●3’端CCA:接受氨基酸,形成氨酰-tRNA。
●與mRNA結(jié)合部位—反密碼子部位16精選課件ppt3’5’ICCA-OH5’3’CCA-OHGGCCCGtRNA憑借自身的反密碼子與mRNA鏈上的密碼子相識(shí)別,把所帶氨基酸放到肽鏈的一定位置。17精選課件pptFig.3.Formationofaminoacyl-tRNA.First,theaminoacyl-tRNAsynthetaseattachesadenosinemonophosphate(AMP)tothe–COOHgroupoftheaminoacidtocreatanaminoacyladenylateintermediate.ThentheappropriatetRNAdisplacestheAMP.MolecularBiology氨酰tRNA的合成氨酰腺苷酸18精選課件pptAminoacyl-tRNAsynthetases根據(jù)亞基結(jié)構(gòu)分4類,長(zhǎng)度334-1000個(gè)aa不等。識(shí)別tRNA分子上的鑒別元件,反密碼子序列+接受臂bp。19精選課件pptFig.4.IdentityelementsinvarioustRNAmolecules.Thesynthetaseshavetobeabletodistinguishbetweenabout40similarlyshaped,butdifferent,tRNAmoleculesincells,andtheyuseparticularpartsofthetRNAmolecules,calledidentityelements,tobeabletodothis.20精選課件ppt氨基酸的活化翻譯的起始肽鏈的延伸肽鏈的終止蛋白質(zhì)前體的加工Q蛋白質(zhì)合成21精選課件ppt22精選課件ppt
表14-7原核和真核生物核糖體的組成及功能核糖體亞基rRNAs蛋白R(shí)NA的特異順序和功能
細(xì)菌
70S50S23S=2904b31種(L1-L31)含CGAAC和GTψCG互補(bǔ)2.5×106D5S=120b66%RNA30S16S=1542b21種(S1-S21)16SRNA(CCUCCU)和S-D
順序(AGGAGG)互補(bǔ)
哺乳動(dòng)物
80S60S28S=4718b49種有GAUC和tRNAfMat的TψCG互補(bǔ)4.2×106D5S=120b60%RNA5.8S=160b
40S18S=1874b33種和Capm7G結(jié)合
23精選課件ppt核糖體的功能:合成蛋白質(zhì)在單個(gè)核糖體上,可化分多個(gè)功能活性中心,在蛋白質(zhì)合成過程中各有專一的識(shí)別作用和功能。●mRNA結(jié)合部位——小亞基●結(jié)合或接受AA-tRNA部位(A位)——大亞基●結(jié)合或接受肽基tRNA的部位——大亞基●肽基轉(zhuǎn)移部位(P位)——大亞基●形成肽鍵的部位(轉(zhuǎn)肽酶中心)——大亞基
24精選課件ppt(一)氨基酸的活化氨基酸+tRNA氨基酰-tRNAATP
AMP+PPi氨基酰-tRNA合成酶原核生物中,起始氨基酸是:起始AA-tRNA是:真核生物中,起始氨基酸是:起始AA-tRNA是:甲酰甲硫氨酸fMet-tRNAfMet甲硫氨酸Met-tRNAMet25精選課件ppt第一步反應(yīng)氨基酸+ATP-E—→氨基酰-AMP-E
+AMP+PPi
目錄26精選課件ppt第二步反應(yīng)氨基酰-AMP-E+
tRNA↓
氨基酰-tRNA+AMP
+
E目錄27精選課件ppt(二)翻譯的起始原核生物(細(xì)菌)為例:所需成分:30S小亞基、50S大亞基、模板mRNA、fMet-tRNAfMet、GTP、Mg2+翻譯起始因子:IF-1、IF-2、IF-3、28精選課件pptIF-3IF-1翻譯起始(翻譯起始復(fù)合物形成)又可被分成3步:
(P122)1.核蛋白體大小亞基分離29精選課件ppt2、30S小亞基通過SD序列與mRNA模板相結(jié)合。AUG5'3'IF-3IF-130精選課件pptS-D序列31精選課件pptIF-3IF-1IF-2GTP3.在IF-2和GTP的幫助下,fMet-tRNAfMet進(jìn)入小亞基的P位,tRNA上的反密碼子與mRNA上的起始密碼子配對(duì)。AUG5'3'32精選課件pptIF-3IF-1IF-2GTPGDPPi4、帶有tRNA、mRNA和3個(gè)翻譯起始因子的小亞基復(fù)合物與50S大亞基結(jié)合,GTP水解,釋放翻譯起始因子。AUG5'3'33精選課件ppt真核生物翻譯起始的特點(diǎn)
●核糖體較大,為80S;●起始因子比較多;●mRNA5′端具有m7Gppp帽子結(jié)構(gòu)●Met-tRNAMet
●mRNA的5′端帽子結(jié)構(gòu)和3′端polyA都參與形成翻譯起始復(fù)合物;
34精選課件ppt真核生物翻譯起始復(fù)合物形成(區(qū)別原核生物)原核生物中30S小亞基首先與mRNA模板相結(jié)合,再與fMet-tRNAfMet結(jié)合,最后與50S大亞基結(jié)合。而在真核生物中,40S小亞基首先與Met-tRNAMet相結(jié)合,再與模板mRNA結(jié)合,最后與60S大亞基結(jié)合生成80S·mRNA·Met-tRNAMet起始復(fù)合物(P120)。35精選課件pptmet40S60SMetMet40S60SmRNAeIF-2B、eIF-3、
eIF-6①elF-3②GDP+Pi各種elF釋放elF-5④ATPADP+PielF4E,elF4G,elF4A,elF4B,PAB③MetMet-tRNAMet-elF-2
-GTP真核生物翻譯起始復(fù)合物形成過程36精選課件ppt肽鏈延伸由許多循環(huán)組成,每加一個(gè)氨基酸就是一個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)包括:AA-tRNA與核糖體結(jié)合、肽鍵的生成和移位。
延伸因子(elongationfactor,EF):
原核生物:EF-T(EF-Tu,EF-Ts)EF-G
真核生物:EF-1、EF-2(三)肽鏈的延伸37精選課件ppt1、AA-tRNA與核糖體A位點(diǎn)的結(jié)合
需要消耗GTP,并需EF-Tu、EF-Ts兩種延伸因子38精選課件ppt通過延伸因子EF-Ts再生GTP,形成EF-Tu?GTP復(fù)合物
EF-Tu-GDP+EF-TsEF-Tu-Ts+GDP
EF-Tu-Ts+GTPEF-Tu-GTP+EF-Ts重新參與下一輪循環(huán)39精選課件ppt2、肽鍵形成
是由轉(zhuǎn)肽酶/肽基轉(zhuǎn)移酶催化
40精選課件ppt3、移位核糖體向mRNA3’端方向移動(dòng)一個(gè)密碼子。需要消耗GTP,并需EF-G延伸因子41精選課件pptfMetAUG5'3'fMetTuGTP目錄42精選課件ppt43精選課件ppt原核肽鏈合成終止過程
(四)肽鏈的終止44精選課件ppt
RF1:識(shí)別終止密碼子UAA和UAG
終止因子RF2:識(shí)別終止密碼子UAA和UGA
RF3:具GTP酶活性,刺激RF1和
RF2活性,協(xié)助肽鏈的釋放(原核生物)真核生物只有一個(gè)終止因子(eRF)45精選課件ppt(五)蛋白質(zhì)前體的加工1、N端fMet或Met的切除新生蛋白質(zhì)經(jīng)蛋白酶切后變成有功能的成熟蛋白質(zhì)46精選課件ppt2、二硫鍵的形成兩個(gè)半胱氨酸-SH
-SH
-SH
二硫鍵氧化3、特定氨基酸的修飾磷酸化、糖基化
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