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蛋白質(zhì)的相關(guān)計(jì)算Protein-relatedcalculationsPre-classquestiononproteins蛋白質(zhì)課前提問1、氨基酸的元素組成、結(jié)構(gòu)通式、結(jié)構(gòu)特點(diǎn)、種類2、氨基酸形成蛋白質(zhì)的方式、水中H和O的來源3、多肽的命名原則是什么?4、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性的原因是什么?目錄CONTENT01蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)復(fù)習(xí)Proteinstructurereview04Protein-relatedcalculations蛋白質(zhì)相關(guān)計(jì)算01040104蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)復(fù)習(xí)PARTONE蛋白質(zhì)的基本單位——氨基酸1.元素組成除
外,有的還含有
等。C、H、O、NS2.結(jié)構(gòu)通式CHH2NR氨基羧基側(cè)鏈基團(tuán)COHO分子式C2H4O2N-R3.種類21種氨基酸非必需氨基酸必需氨基酸人體可自身合成的氨基酸,共13種人體不能自身合成的氨基酸,必須從外界環(huán)境中獲取,共8種
諧音巧記八種必需氨基酸苯丙氨酸、蛋(甲硫)氨酸、賴氨酸、蘇氨酸、色氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸"笨蛋,來宿舍晾一晾鞋”1.脫水縮合:
H2O肽鍵-OH‖O-C-CR2H---NH--C-CR1H2NH--‖OOH-H二肽一、氨基酸的結(jié)合方式2.肽命名原則:
肽鍵-C-COOHR3H---NH-HOH-肽鍵‖O-CR1H2NH---C-C-CR2H---NH-‖O三肽H2OH2O脫出來的H2OH來自氨基和羧基1O來自羧基2一、氨基酸的結(jié)合方式2.肽命名原則:
肽鍵-C-COOHR3H--NH-肽鍵‖O-CR1H2NH---C-C-CR2H---NH-‖O三肽H2OH2O以此類推,多個(gè)氨基酸分子脫水縮合而成的含有多個(gè)肽鍵的化合物,叫多肽。一、氨基酸的結(jié)合方式氨基酸層次肽鏈層次氨基酸的種類不同氨基酸的數(shù)量不同氨基酸的排列順序千變?nèi)f化多肽鏈盤曲、折疊的方式及其形成的空間結(jié)構(gòu)千差萬別蛋白質(zhì)功能的多樣性3.蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性的原因:
蛋白質(zhì)相關(guān)計(jì)算PARTTWO1.肽鍵與氨基酸的關(guān)系氨基酸數(shù)肽鏈數(shù)肽鍵數(shù)脫水?dāng)?shù)888123765765---======規(guī)律1:在鏈狀多肽中:
肽鍵數(shù)=脫去的水分子數(shù)=氨基酸數(shù)-肽鏈數(shù)氨基酸數(shù)肽鍵數(shù)脫水?dāng)?shù)333555====1.肽鍵與氨基酸的關(guān)系規(guī)律2:在環(huán)肽中:
肽鍵數(shù)=脫去的水分子數(shù)=氨基酸數(shù)一.計(jì)算脫水?dāng)?shù)/肽鍵數(shù)數(shù)1.胰島素分子有A、B兩條肽鏈,A鏈有21個(gè)氨基酸,B鏈有30個(gè)氨基酸,胰島素分子中肽鍵的數(shù)目是()A.48個(gè)B.49個(gè)
C.50個(gè)D.51個(gè)B2.游離—NH2(—COOH
)數(shù)目①一條肽鏈至少含有____個(gè)羧基和_____個(gè)氨基。②m條肽鏈至少含有____個(gè)羧基和_____個(gè)氨基。11mm2.游離—NH2(—COOH
)數(shù)目規(guī)律3:至少含有的游離氨基(羧基
)=肽鏈數(shù)規(guī)律4:游離氨基(羧基)=肽鏈數(shù)+R基中氨基(羧基
)數(shù)環(huán)肽呢?2.游離—NH2(—COOH
)數(shù)目環(huán)肽:游離氨基(羧基
)=R基中氨基(羧基
)數(shù)2.現(xiàn)有氨基酸800個(gè),其中氨基總數(shù)為810個(gè),羧基總數(shù)為808個(gè),則由這些氨基酸合成的含有2條肽鏈的蛋白質(zhì)共有肽鍵、氨基和羧基的數(shù)目依次分別為()A.798、2和2B.798、12和10C.799、1和1D.799、11和9B3.蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量【規(guī)律】每形成一個(gè)肽鍵,脫去
,相對(duì)分子質(zhì)量減去
。【擴(kuò)展】每形成一個(gè)二硫鍵,脫去
,相對(duì)分子質(zhì)量減去
。
1個(gè)H2O182個(gè)H2SHSHSS+2H3.蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量SHSHSS+2H=氨基酸數(shù)×氨基酸平均分子質(zhì)量-
。
脫水?dāng)?shù)×18=氨基酸數(shù)×氨基酸平均分子質(zhì)量-
。
脫水?dāng)?shù)×18-二硫鍵數(shù)×23.組成某蛋白質(zhì)的氨基酸的平均相對(duì)分子質(zhì)量為128,1條含有100個(gè)肽鍵的多肽鏈的分子質(zhì)量為多少?蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量=氨基酸數(shù)×氨基酸的平均相對(duì)分子質(zhì)量—脫水?dāng)?shù)×18蛋白質(zhì)分子質(zhì)量=101×128-100×18=11128肽鏈數(shù)目氨基酸數(shù)肽鍵數(shù)目脫去水分子數(shù)氨基數(shù)目羧基數(shù)目多肽(蛋白質(zhì))的相對(duì)分子質(zhì)量1條nm條n環(huán)狀多肽nn-1n-1至少1個(gè)至少1個(gè)na-18(n-1)n-mn-m至少m個(gè)至少m個(gè)na-18(n-m)nn至少0個(gè)至少0個(gè)na-18n蛋白質(zhì)的計(jì)算相關(guān)小結(jié)
設(shè)氨基酸的平均相對(duì)分子質(zhì)量為a,由n個(gè)氨基酸分別形成1條鏈狀多肽或m條鏈狀多肽。注:若肽鏈間含有二硫鍵,則蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量=
。(p為二硫鍵的個(gè)數(shù),n為氨基酸數(shù),m為肽鏈數(shù),a為氨基酸的平均相對(duì)分子質(zhì)量)。na-18(n-m)-2p4.蛋白質(zhì)中原子個(gè)數(shù)的計(jì)算?一個(gè)氨基酸中:
C2H4O2N-R①C原子數(shù)=R基中的C原子數(shù)+2②H原子數(shù)=R基中的H原子數(shù)+4③
O原子數(shù)=R基中的O原子數(shù)+2④N原子數(shù)=R基中的N原子數(shù)+1
氨基酸脫水縮合形成多肽過程中,脫去水,H、O原子數(shù)目減少,C、N原子數(shù)目不減少CHRCOOHH2N
—CH2NR1H—C—ON—H
C—R2H—C—ON—H
C—R3H—C—ON—HR4HCCOOH4.蛋白質(zhì)中原子個(gè)數(shù)的計(jì)算C原子、H原子規(guī)律?蛋白質(zhì)上C原子數(shù)=
蛋白質(zhì)上H原子數(shù)=
R基中的C原子數(shù)氨基酸數(shù)×2(主鏈上)各氨基酸中H原子總數(shù)脫去水分子數(shù)×2+-蛋白質(zhì)上N原子數(shù)=
蛋白質(zhì)上O原子數(shù)=
肽鏈上的N原子、O原子規(guī)律?肽鍵數(shù)肽鏈數(shù)R基上的N原子數(shù)肽鍵數(shù)肽鏈數(shù)×2R基上的O原子數(shù)=各氨基酸中N原子的總數(shù)=各氨基酸中O原子總數(shù)-脫水?dāng)?shù)
—CH2NR1H—C—ON—H
C—R2H—C—ON—H
C—R3H—C—ON—HR4HCCOOH4.蛋白質(zhì)中原子個(gè)數(shù)的計(jì)算++++4.某蛋白質(zhì)分子中有M個(gè)氨基酸,其中有N條肽鏈,則此蛋白質(zhì)中至少含有多少個(gè)氧原子()A.2MB.M-NC.MD.M+N
—CH2NHR1—C—ON—H
CHR2—C—ON—H
C—COOHHR3O=肽鍵數(shù)+2×肽鏈數(shù)+R基上O原子數(shù)D四.計(jì)算N、O原子的數(shù)目常用公式總結(jié)①脫水?dāng)?shù)=肽鍵數(shù)=__________-肽鏈數(shù)②氨基數(shù)=肽鏈數(shù)+________________=各氨基酸中氨基的總數(shù)-肽鍵數(shù)③羧基數(shù)=肽鏈數(shù)+R基上的羧基數(shù)=_______________________-肽鍵數(shù)④蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量=
各氨基酸平均相對(duì)分子質(zhì)量×氨基酸數(shù)-18×脫水?dāng)?shù)⑤N原子數(shù)=肽鍵數(shù)+肽鏈數(shù)+R基上的N原子數(shù)=各氨基酸中N的總數(shù)⑥O原子數(shù)=肽鍵數(shù)+_____________+R基上的O原子數(shù)=各氨基酸中O的總數(shù)-___________氨基酸數(shù)R基上的氨基數(shù)各氨基酸中羧基的總數(shù)2×肽鏈數(shù)脫水?dāng)?shù)5.氨基酸的排列與多肽的種類計(jì)算1、3種氨基酸,每種足量,可形成
種三肽2、n種氨基酸,每種足量,可形成
種m肽?3、3種氨基酸,每種只有一個(gè),可形成
種三肽4、n種氨基酸,每種只有一個(gè),可形成
種多肽33nm3×2×1n×(n-1)×(n-2)×....×1333、、、nnnn321、、、nn-1n-21氨基酸肽鍵3×3×3n×n×n×、、、×n當(dāng)堂小測(cè)1
如圖為牛胰島素結(jié)構(gòu)圖,該物質(zhì)中—S—S—是由兩個(gè)—SH脫去兩個(gè)H形成的。下列說法正確的是A.牛胰島素含有50個(gè)肽鍵B.牛胰島素中至少含有2個(gè)—NH2和2個(gè)
—COOHC.牛胰島素水解產(chǎn)物含有21種不同的氨基酸D.牛胰島素形成時(shí),減少的相對(duì)分子質(zhì)量為882當(dāng)堂小測(cè)2如圖表示某蛋白質(zhì)(無環(huán)狀肽)中氨基酸和相關(guān)基團(tuán)的數(shù)目。下列有關(guān)敘述錯(cuò)誤的是A.共有2條肽鏈B.共有124個(gè)肽鍵C.形成此蛋白質(zhì)時(shí),相對(duì)
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