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文檔簡介
生物統(tǒng)計(jì)學(xué)
(BiologyStatistic)統(tǒng)計(jì)遺傳教研室分子生物學(xué)館106張明明本課內(nèi)容的主要安排:(1)擬合優(yōu)度檢驗(yàn)(2)回歸分析(一元、多元、logistic)(3)方差分析(4)試驗(yàn)設(shè)計(jì)第一章生物統(tǒng)計(jì)學(xué)概述
總體樣本統(tǒng)計(jì)量描述作出推斷隨機(jī)抽樣什么是統(tǒng)計(jì)學(xué)?1.生物統(tǒng)計(jì)學(xué)概念生物統(tǒng)計(jì)學(xué)是以概率理論為基礎(chǔ),研究生命科學(xué)中隨機(jī)現(xiàn)象規(guī)律性的應(yīng)用數(shù)學(xué)科學(xué)。2.應(yīng)用領(lǐng)域
林學(xué)、農(nóng)學(xué)、醫(yī)藥學(xué)等等。3.研究內(nèi)容
用統(tǒng)計(jì)方法研究生物問題。4.常用軟件
SAS、SPSS、Excel、Statistic第一節(jié)、中心趨勢指標(biāo)常用的中心趨勢指標(biāo)有:算術(shù)均數(shù)、幾何均數(shù)、中位數(shù)、眾數(shù),統(tǒng)稱為平均數(shù)(average)一、算術(shù)平均數(shù)(TheArithmeticmean)簡稱均數(shù)(Mean)或均值,定義為所有測量值之和除以變量值個(gè)數(shù)(即,樣本含量SampleSize)。反映一組呈對(duì)稱分布的變量值在數(shù)量上的平均水平。(1)直接計(jì)算法
公式:舉例1:試計(jì)算1,3,7,9的均數(shù)?例2:試計(jì)算1,3,3,7,7,9,9,9的均數(shù)?(2)加權(quán)法
均數(shù)的特征二、
中位數(shù)與百分位數(shù)11個(gè)大鼠存活天數(shù):4,10,7,50,3,15,2,9,13,>60,>60平均存活天數(shù)?(一)中位數(shù)(median)是將每個(gè)變量值從小到大排列,位置居于中間的那個(gè)變量值。
存活天數(shù)2,
3,
4,7,9,10,13,15,50,>60,>60秩次1234567891011計(jì)算公式:
n為奇數(shù)時(shí)
n為偶數(shù)時(shí)
例
9名中學(xué)生甲型肝炎的潛伏期分別為12,13,14,14,15,15,15,17,天,求其中位數(shù)。19頻數(shù)表資料的中位數(shù)下限值L上限值Ui;fm中位數(shù)M中位數(shù)=4.5+0.5x[(150x50%-68)/37]=4.59中位數(shù)的特征計(jì)算時(shí)只利用了位置居中的測量值優(yōu)點(diǎn):對(duì)極值不敏感缺點(diǎn):并非考慮到每個(gè)觀測值適用于各種分布類型的資料,特別適合于:大樣本偏態(tài)分布資料或者一端或兩端無確切數(shù)值的資料
百分位數(shù)示意圖(二)百分位數(shù)(percentile)1.直接計(jì)算法
設(shè)有n個(gè)原始數(shù)據(jù)從小到大排列,第X百分位數(shù)的計(jì)算公式為:當(dāng)為帶有小數(shù)位時(shí):
當(dāng)為整數(shù)時(shí):Trunc()取整函數(shù)
例
對(duì)某醫(yī)院細(xì)菌性痢疾治愈者的住院天數(shù)統(tǒng)計(jì),120名患者的住院天數(shù)從小到大排列如下,試求第5百分位數(shù)和第99百分位數(shù)。患者:住院天數(shù):
(1)n=120,
,為整數(shù):
(2),帶有小數(shù),故取整trunc(118.8)=118患者:住院天數(shù):2.頻數(shù)表法
公式:
例
試分別求表1.3頻數(shù)表的第25、第75百分位數(shù)。P25=4.0+0.5x[(150x25%-36)/32]=4.02P75=5.0+0.5x[(150x75%-105)/22]=5.17三、幾何均數(shù)(geometricmean)
可用于反映一組經(jīng)對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換后呈對(duì)稱分布或正態(tài)分布的變量值在數(shù)量上的平均水平。(1)直接法幾何均數(shù):變量對(duì)數(shù)值的算術(shù)均數(shù)的反對(duì)數(shù)。
其他對(duì)數(shù)(如自然對(duì)數(shù))變換獲得相同的幾何均數(shù)例6測定10名傷寒病人血清抗體滴度分別為1:4,1:4,1:4,1:4,1:4,1:16,1:16,1:16,1:64,1:128,求其平均抗體滴度。以其滴度的倒數(shù)為原變量值,代入公式有:平均抗體滴度為:1:11(2)加權(quán)法公式:例6的血清抗體滴度資料的頻數(shù)表1、幾何均數(shù)適用于對(duì)數(shù)正態(tài)分布,如藥物的效價(jià)、抗體的滴度、傳染性疾病的潛伏期等資料。2、變量x服從對(duì)數(shù)正態(tài)分布,即表示變量lg(xi)服從正態(tài)分布。對(duì)于lg(xi),具有正態(tài)分布的所有特性。幾何均數(shù)的特征四、眾數(shù)(Mode)是一群數(shù)據(jù)中出現(xiàn)次數(shù)(頻數(shù))最多的值。適用于大樣本;較粗糙。例
有16例高血壓病人的發(fā)病年齡(歲)為:42,45,48,51,52,54,55,55,,61,61,62,62,試求眾數(shù)。眾數(shù)的特征1、對(duì)于某些數(shù)據(jù)而言,例如均勻分布,并不存在眾數(shù);2、對(duì)于某些數(shù)據(jù)存在兩個(gè)或多于兩個(gè)的眾數(shù);3、定性數(shù)據(jù)可以存在眾數(shù);眾數(shù)對(duì)于進(jìn)一步的統(tǒng)計(jì)學(xué)計(jì)算與分析不具備應(yīng)用價(jià)值。58,58,58,58五、其他位置指標(biāo)1、四分位數(shù)(Quartile)(三個(gè)四分位數(shù))2、十分位數(shù)(Centile):9個(gè)十分位數(shù)3、百分位數(shù)(Percentile)99個(gè)百分位數(shù)離散與變異性指標(biāo)全距四分位間距方差標(biāo)準(zhǔn)差變異系數(shù)
一、全距(Range)與絕對(duì)差全距為最大值與最小值之差,也叫極差缺點(diǎn):僅利用了兩個(gè)極端值。二、方差與標(biāo)準(zhǔn)差方差(Variance)也稱均方差(meansquaredeviation),反映一組數(shù)據(jù)的平均離散水平。(一)樣本方差為各變量值到樣本均數(shù)距離的平方和除以自由度的商值,即(二)總體方差定義為樣本標(biāo)準(zhǔn)差為樣本方差的平方根;
總體標(biāo)準(zhǔn)差為總體方差的平方根。標(biāo)準(zhǔn)差(standarddeviation)樣本標(biāo)準(zhǔn)差實(shí)用公式樣本標(biāo)準(zhǔn)差的加權(quán)公式隨機(jī)變量xi的標(biāo)準(zhǔn)化如果隨機(jī)變量xi服從正態(tài)分布,均數(shù)和標(biāo)準(zhǔn)差分別為和s,則隨機(jī)變量xi的標(biāo)準(zhǔn)化正態(tài)離差值(Standardnormaldeviation)又稱為標(biāo)準(zhǔn)化得分值(StandardScores)為:三、變異系數(shù)
(coefficientofvariation)
變異系數(shù)(coefficientofvariation,CV)常用于比較度量單位不同或均數(shù)相差懸殊的兩組(或多組)資料的變異程度。
某地7歲男孩身高的均數(shù)為123.10cm,標(biāo)準(zhǔn)差為4.71;體重均數(shù)為22.59kg,標(biāo)準(zhǔn)差為2.26kg,
比較其變異度?
四、四分位數(shù)間距
(inter-quartilerange)
四分位數(shù)間距,用IQR表示:
IQR=第三四分位數(shù):Q3
第一四分位數(shù):Q1第三節(jié)率、比及其注意事項(xiàng)一、率(rate):在特定條件下,可能發(fā)生某現(xiàn)象的總例數(shù)中,實(shí)際發(fā)生某現(xiàn)象的強(qiáng)度或頻率。構(gòu)成比(Proportion,constituentratio):構(gòu)成比指標(biāo)用以表示事物內(nèi)部某一構(gòu)成成分在全部構(gòu)成中所占的比例或比重。相對(duì)比(relativeratio)是由兩個(gè)有關(guān)聯(lián)的指標(biāo)之比。二、比(ratio)第四節(jié)常用統(tǒng)計(jì)圖介紹1.條圖:單式條圖和復(fù)式條圖2.圓圖(餅圖)3.百分條圖4.線圖5.直方圖6.概率—概率散點(diǎn)圖(P—P概率圖)7.莖葉圖8.盒式圖地區(qū)北非及中東西歐北美洲拉丁美洲南亞及東南亞成人感染率/%0.130.250.560.570.69復(fù)式條圖例:19941998受檢人數(shù)異常人數(shù)檢出率%受檢人數(shù)異常人數(shù)檢出率%血壓519558.89582386.52心率519448.48582396.70(2)圓圖(餅圖)用圓的總面積表示事物的全部,各個(gè)扇形的面積(圓心角的大?。┍硎靖鱾€(gè)部分的比重,適用于百分比資料。類別老年青年中年小孩比例/%33%15%45%7%(3)百分條圖百分條圖是用一個(gè)矩形的面積表示事物的全部,而用其中各段表示個(gè)構(gòu)成部分。例:(4)線圖(i)簡單線圖:一條折線或一條曲線(ii)多重線圖:多條折線折線圖年份結(jié)核病死亡率白喉死亡率1947150.220.11950148.016.61951141.014.01952130.011.81953110.410.7195498.26.5195572.63.9195668.02.4195754.81.3(5)直方圖直方圖以各矩形的面積表示各組段的頻數(shù),各矩形面積的總和為總頻數(shù),用于表示連續(xù)性資料的頻數(shù)分布。(6)概率——概率散點(diǎn)圖(P-P概率圖)是以橫軸表示一個(gè)變量的經(jīng)驗(yàn)累積分布函
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