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文檔簡介

1、第三節(jié) 微生物獨特合成途徑舉例,1 定義: N2 +6H 2NH3,生物固氮,固氮生物,Mg2+ATP,2 固氮生物的種類 (1)自生固氮菌:能獨立進行固氮的微生物 (2)共生固氮菌:與它種生物共生時才能固氮的微生物 (3)聯(lián)合固氮菌:必須生活在植物跟際、葉面或動物腸道等處才能固氮的微生物 從固氮生物在分類上高度分散來推斷,固氮作用應(yīng)是原始生物的基本代謝之一,3 固氮生物的生化機制 (1)固氮的必要條件 ATP供應(yīng) 還原力及其載體 固氮酶 還原底物N2 鎂離子 嚴(yán)格的厭氧微環(huán)境 (2)固氮酶,(3)固氮酶活力測定 定氮法 同位素法 乙炔法(1965年) HC CH H2C CH2 (4)固氮的

2、生化機制,固氮酶,H2,3 固氮菌中對固氮酶的保護 (1)自生固氮菌的保護 呼吸保護作用 構(gòu)象保護作用 (2)藍細(xì)菌固氮酶的保護 還原性異形胞 時空分隔、束狀群體、微氧環(huán)境等等 (3)根瘤菌的抗氧保護 豆血紅蛋白,微生物特有的結(jié)構(gòu)大分子: 細(xì)菌:肽聚糖、磷壁酸、脂多糖、各種莢膜成分等 真菌:葡聚糖、甘露聚糖、纖維素、幾丁質(zhì)等 肽聚糖:絕大多數(shù)原核微生物細(xì)胞壁所含有的獨特成分;在細(xì)菌的生命活動中有重要功能,尤其是許多重要抗生素如青霉素、頭孢霉素、萬古霉素、環(huán)絲氨酸(惡唑霉素)和桿菌肽等呈現(xiàn)其選擇毒力(selective toxicity)的物質(zhì)基礎(chǔ)。是在抗生素治療上有特別意義的物質(zhì)。,三、肽聚糖

3、的合成,合成特點:合成機制復(fù)雜,步驟多,且合成部位幾經(jīng)轉(zhuǎn)移;合成過程中須要有能夠轉(zhuǎn)運與控制肽聚糖結(jié)構(gòu)元件的載體(UDP和細(xì)菌萜醇)參與。 合成過程:依發(fā)生部位分成三個階段: 細(xì)胞質(zhì)階段:合成派克(Park)核苷酸 細(xì)胞膜階段:合成肽聚糖單體 細(xì)胞膜外階段:交聯(lián)作用形成肽聚糖,第一階段:,在細(xì)胞質(zhì)中合成N-乙酰胞壁酸五肽(“Park”核苷酸)。 這一階段起始于N-乙酰葡萄糖胺-1-磷酸,它是由葡萄糖經(jīng)一系列反應(yīng)生成的; 自N-乙酰葡萄糖胺-1-磷酸開始,以后的N-乙酰葡萄糖胺、 N-乙酰胞壁酸,以及胞壁酸五肽,都是與糖載體UDP結(jié)合的;,由葡萄糖合成N-乙酰葡糖胺和N-乙酰胞壁酸,“Park”核

4、苷酸的合成,在細(xì)胞膜上由N-乙酰胞壁酸五肽與N-乙酰葡萄糖胺合成肽聚糖單體雙糖肽亞單位。 這一階段中有一種稱為細(xì)菌萜醇(bactoprenol,Bcp)類脂載體參與,這是一種由11個類異戊烯單位組成的C55 類異戊烯醇,它 通過兩個磷酸基與N-乙酰胞壁酸相連,載著在細(xì)胞質(zhì)中形成的胞壁酸到細(xì)胞膜上,在那里與N-乙酰葡萄糖胺結(jié)合,并在L-Lys上接上五肽(Gly)5 ,形成雙糖亞單位。 這一階段的詳細(xì)步驟如圖所示。其中的反應(yīng)與分別為萬古霉素和桿菌肽所阻斷。,第二階段:,肽聚糖單體的合成,UDP UDP- G ,UDP UDP - M,桿菌肽,萬古霉素,5 甘氨酰-tRNA 5 tRNA,插入至膜外

5、肽 聚糖合成處,肽聚糖單體的合成細(xì)菌萜醇,細(xì)菌萜醇(bactoprenol):又稱類脂載體;運載“Park”核苷酸進入細(xì)胞膜,連接N-乙酰葡糖胺和甘氨酸五肽“橋”,最后將肽聚糖單體送入細(xì)胞膜外的細(xì)胞壁生長點處。 結(jié)構(gòu)式: CH3CH3 CH3 CH3C=CHCH2(CH2C=CHCH2)9CH2C=CHCH2OH 功能:除肽聚糖合成外還參與微生物多種細(xì)胞外多糖和脂多糖的生物合成, 如:細(xì)菌的磷壁酸、脂多糖, 細(xì)菌和真菌的纖維素, 真菌的幾丁質(zhì)和甘露聚糖等。,已合成的雙糖肽插在細(xì)胞膜外的細(xì)胞壁生長點中,并交聯(lián)形成肽聚糖。 這一階段分兩步: 第一步:是多糖鏈的伸長雙糖肽先是插入細(xì)胞壁生長點上作為引

6、物的肽聚糖骨架(至少含68個肽聚糖單體分子)中,通過轉(zhuǎn)糖基作用(transglycosylation)使多糖鏈延伸一個雙糖單位; 第二步:通過轉(zhuǎn)肽酶的轉(zhuǎn)肽作用(transpeptitidation)使相鄰多糖鏈交聯(lián)轉(zhuǎn)肽時先是D-丙氨酰-D-丙氨酸間的肽鏈斷裂,釋放出一個D-丙氨酰殘基,然后倒數(shù)第二個D-丙氨酸的游離羧基與相鄰甘氨酸五肽的游離氨基間形成肽鍵而實現(xiàn)交聯(lián)。,第三階段:,肽聚糖的生物合成與某些抗生素的作用機制,一些抗生素能抑制細(xì)菌細(xì)胞壁的合成,但是它們的作用位點和作用機制是不同的。 -內(nèi)酰胺類抗生素(青霉素、頭孢霉素): 是D-丙氨酰-D-丙氨酸的結(jié)構(gòu)類似物,兩者相互競爭轉(zhuǎn)肽酶的活性中

7、心。當(dāng)轉(zhuǎn)肽酶與青霉素結(jié)合后,雙糖肽間的肽橋無法交聯(lián),這樣的肽聚糖就缺乏應(yīng)有的強度,結(jié)果形成細(xì)胞壁缺損的細(xì)胞,在不利的滲透壓環(huán)境中極易破裂而死亡。 桿菌肽: 能與十一異戊烯焦磷酸絡(luò)合,因此抑制焦磷酸酶的作用,這樣也就阻止了十一異戊烯磷酸糖基載體的再生,從而使細(xì)胞壁(肽聚糖)的合成受阻。,微生物次生代謝物是指某些微生物生長到穩(wěn)定期前后,以結(jié)構(gòu)簡單、代謝途徑明確、產(chǎn)量較大的初生代謝物作前體,通過復(fù)雜的次生代謝途徑所合成的各種結(jié)構(gòu)復(fù)雜的化學(xué)物。 與初生代謝物不同的是,次生代謝物往往具有分子結(jié)構(gòu)復(fù)雜、代謝途徑獨特、在生長后期合成、產(chǎn)量較低、生理功能不很明確(尤其是抗生素)以及其合成一般受質(zhì)??刂频忍攸c。

8、一般地說,形態(tài)構(gòu)造和生活史越復(fù)雜的微生物(如放線菌和絲狀真菌),其次生代謝物的種類也就越多。,四、微生物次生代謝物的合成,微生物次生代謝物合成途徑主要有4條: 糖代謝延伸途徑,由糖類轉(zhuǎn)化、聚合產(chǎn)生的多糖類、糖苷類和核酸類化合物進一步轉(zhuǎn)化而形成核苷類、糖苷類和糖衍生物類抗生素; 莽草酸延伸途徑,由莽草酸分支途徑產(chǎn)生氯霉素等;,氨基酸延伸途徑,由各種氨基酸衍生、聚合形成多種含氨基酸的抗生素,如多肽類抗生素、-內(nèi)酰胺類抗生素、D-環(huán)絲氨酸和殺腺癌菌素等; 乙酸延伸途徑,又可分2條支路,其一是乙酸經(jīng)縮合后形成聚酮酐,進而合成大環(huán)內(nèi)酯類、四環(huán)素類、灰黃霉素類抗生素和黃曲霉毒素;另一分支是經(jīng)甲羥戊酸而合成

9、異戊二烯類,進一步合成重要的植物生長刺激素赤霉素或真菌毒素隱杯傘素等。,作業(yè),試述肽聚糖的生物合成過程,Chapter 6 Microbial Growth and Its Control 微生物的生長繁殖及其控制,第 一 節(jié),生長的定義及測定方法,微生物生長(Growth):是指細(xì)胞物質(zhì)有規(guī)律地、不可逆增加的生物過程。 微生物繁殖(Reproduction):是微生物生長到一定階段由于細(xì)胞內(nèi)各種細(xì)胞結(jié)構(gòu)的復(fù)制和重建導(dǎo)致產(chǎn)生新的生命個體,即引起生命個體數(shù)量增加的整個生物學(xué)過程。微生物生長一般指群體生長,一、測生長量,(一)直接法: 測體積法; 稱干重法 (二)間接法 1、比濁法 2、生理指標(biāo)法

10、,1.比濁法,原理是在一定范圍內(nèi),菌懸液中的細(xì)胞濃度與混濁度成正比,即與光密度成正比,菌數(shù)越多,光密度越大。因此,借助于分光光度計,在一定波長下測定菌懸液的光密度,就可反應(yīng)出菌液的濃度。,特點:快速、簡便;但易受干擾。,1、比濁法,菌液濃度,吸光值(OD值),2.生理指標(biāo)測定法,測含氮量法 蛋白質(zhì)總量=含氮量 6.25 細(xì)胞總量=蛋白質(zhì)總量/(50%80%(或65%)=蛋白總量1.54 測含碳量以及測磷、DNA、RNA、ATP、DAP(二氨基庚二酸)、幾丁質(zhì)等。 產(chǎn)酸、產(chǎn)氣、耗氧、粘度和產(chǎn)熱等。,二、計繁殖數(shù),1、直接計數(shù)法 2、間接計數(shù)法,1、直接計數(shù)法:指用計數(shù)板在光學(xué)顯微鏡下直接觀察細(xì)胞

11、并進行計數(shù)的方法。,原理:將1cm20.1mm的薄層空間劃分為400小格,從中選取80或100小格,計數(shù)其中的細(xì)胞數(shù)目,換算成單位體積中的細(xì)胞數(shù)。 適用范圍:個體較大細(xì)胞或顆粒,如血球、酵母菌等。不適用于細(xì)菌等個體較小的細(xì)胞,因為(1)細(xì)菌細(xì)胞太小,不易沉降;(2)在油鏡下看不清網(wǎng)格線,超出油鏡工作距離。 特點:快速,準(zhǔn)確,對酵母菌可同時測定出芽率,或在菌懸液中加入少量美藍可以區(qū)分死活細(xì)胞。,血球計數(shù)板法,2.涂片染色法,應(yīng)用:可同時計數(shù)不同微生物的菌數(shù),適 于土壤、牛奶中細(xì)菌計數(shù)。 方法:用鏡臺測微尺計算出視野面積;取 0.1ml菌液涂于1cm2面積上,計數(shù)后代 入公式: 每ml原菌液含菌數(shù)

12、 =視野中平均菌數(shù)涂布面積/視野面積100 稀釋倍數(shù),2、間接計數(shù)法,(1)平板菌落計數(shù)法 (2)膜過濾法,(1)平板菌落計數(shù)法,平板菌落計數(shù)法:澆注平板或涂布平板,平板菌落計數(shù)法,技術(shù)要求:樣品充分混勻,操作熟練快速(1520min完成操作),嚴(yán)格無菌操作; 注意事項:每一支吸管只能用于一個稀釋度,樣品混勻處理,傾注平板時的培養(yǎng)基溫度; 適用范圍:中溫、好氧和兼性厭氧、能在營養(yǎng)瓊脂上生長的微生物, 誤差:多次稀釋造成的誤差是主要來源,其次還有由于樣品內(nèi)菌體分布不均勻、以及不當(dāng)操作,A standard plate count (viable count) reflects the numbe

13、r of viable microbes and assumes that each bacterium grows into a single colony; plate counts are reported as number of colony-forming units (CFU) per ml (CFU/ml) or per g (CFU/g) of sample.,(2)薄膜過濾計數(shù)法,常用該法測定含菌量較少的空氣和水中的微生物數(shù)目。 將定量的樣品通過薄膜(硝化纖維素薄膜、醋酸纖維薄膜)過濾,菌體被阻留在濾膜上,取下濾膜進行培養(yǎng),然后計算菌落數(shù),可求出樣品中所含菌數(shù)。,膜過濾法,

14、第二節(jié)、微生物的生長規(guī)律,一、純培養(yǎng)技術(shù) 1、純培養(yǎng)的定義: 純培養(yǎng)(Pure culture):微生物學(xué)中將在實驗室條件下從一個細(xì)胞或一種細(xì)胞群繁殖得到的后代稱為純培養(yǎng),2、獲得純培養(yǎng)的技術(shù),1) 稀釋平皿分離法 2) 平皿劃線分離法 3) 單細(xì)胞挑取法,1)pour plate method (稀釋倒平板法),10-1,10-2,10-3 10-4 10-5 10-6 10-7 10-8 10-9,2)spread plate method(涂布平板法),3)streak plate method(平板劃線分離法),3.單細(xì)胞挑取法,接種針,解剖鏡,. . ,同步培養(yǎng):是一種培養(yǎng)方法,它能

15、使群體中不同步的細(xì)胞轉(zhuǎn)變成能同時進行生長或分裂的群體細(xì)胞。 同步生長:以同步培養(yǎng)方法使群體細(xì)胞能處于同一生長階段,同時進行分裂的生長方式稱為同步生長。 同步細(xì)胞或同步培養(yǎng)物:通過同步培養(yǎng)方法獲得的細(xì)胞稱。 同步培養(yǎng)物常被用來研究在單個細(xì)胞上難以研究的生理與遺傳特性和作為工業(yè)發(fā)酵的種子,它一種理想的材料。,二、微生物的個體生長和同步生長,1、機械篩選方法 (1)離心方法 (2)過濾分離法 (3)硝酸纖維素濾膜法 2、環(huán)境條件控制技術(shù) (1)溫度 (2)培養(yǎng)基成分控制 (3)其他,(1)離心方法 (2)過濾分離法 (3)硝酸纖維素濾膜法,2、環(huán)境條件控制技術(shù) (1)溫度:通過適宜與不適宜溫度的交替

16、處理之后,通過培養(yǎng)可獲得同步細(xì)胞。 (2)培養(yǎng)基成分控制:將不同步的細(xì)菌在營養(yǎng)不足的條件下培養(yǎng)一段時間,然后轉(zhuǎn)移至營養(yǎng)豐富的培養(yǎng)基中培養(yǎng),能獲得同步細(xì)胞。 (3)其他:光照與黑暗交替培養(yǎng)獲得光合細(xì)菌的同步細(xì)菌;加熱殺死芽孢桿菌獲得芽孢桿菌的同步細(xì)胞。 環(huán)境條件控制獲得同步細(xì)胞的機理不完全了解。這種處理可能是導(dǎo)致胞內(nèi)某些物質(zhì)合成,它合成和積累可導(dǎo)致細(xì)胞分裂,從而獲得同步細(xì)胞。,三、單細(xì)胞微生物的典型生長曲線,回憶: 一步生長曲線(one-step growth curve),這種用來測定噬菌體侵染和成熟病毒體釋放的時間間隔,并用以估計每個被侵染的細(xì)胞釋放出來的新的噬菌體粒子的數(shù)量的生長曲線,稱為

17、一步生長曲線。,潛伏期 隱晦期 胞內(nèi)積累期 裂解期 平穩(wěn)期,將少量單細(xì)胞純培 養(yǎng)接種到一恒定容 積的新鮮液體培養(yǎng) 基中,在適宜的條 件下培養(yǎng),定時取 樣測定其細(xì)菌含量, 可以看到以下現(xiàn)象: 開始有一短暫時間, 細(xì)菌數(shù)量并不增加, 隨之細(xì)菌數(shù)目增加 很快,既而細(xì)菌數(shù)又趨穩(wěn)定,最后逐漸下降。如果以培養(yǎng)時間為橫坐標(biāo),以細(xì)菌數(shù)目的對數(shù)或生長速度為縱坐標(biāo)作圖,可以得到一條曲線,稱為繁殖曲線,通常又稱為生長曲線。,(一) 延滯期停滯期、調(diào)整期、適應(yīng)期(Lag phase) 少量細(xì)菌接種到新鮮培養(yǎng)基后,一般不立即進行繁殖,生長速度近于零。因此在開始一段時間,細(xì)菌數(shù)幾乎保持不變,甚至稍有減少。這段時間被稱為延

18、遲期,又稱為遲緩期、調(diào)整期或滯留適應(yīng)期。,1、延滯期出現(xiàn)原因 2、延滯的特點 3、影響延滯期限長短的因素 4、縮短延滯期的意義及方法,A、微生物接種到一個新的環(huán)境,暫缺乏足夠的能量和必需的生長因子; B、“種子”老化(即處于非對數(shù)生長期)或未充分活化。 C、接種時造成的損傷,1、延滯期出現(xiàn)原因,2、延滯期的特點,特點: 1)生長速率常數(shù)為零;細(xì)菌數(shù)量不增加或增加很少。 2)細(xì)胞形態(tài)變大或增長,許多桿菌可長成絲狀。 3)細(xì)胞內(nèi)的RNA尤其是rRNA含量增高,原生質(zhì)呈嗜堿性。 3)合成代謝十分活躍,核糖體、酶類和ATP的合成加速,易產(chǎn)生各種誘導(dǎo)酶。 4) 對外界不良條件如NaCl溶液、溫度和抗生素

19、等理、理化因素反應(yīng)敏感。,3、影響延滯期時間長短的因素,B、接種齡:以對數(shù)期接種齡的種子接種,延滯期短,C、接種量:發(fā)酵工業(yè)上通常采用種子:發(fā)酵培養(yǎng)基=1:10,D、培養(yǎng)基成分:一般要求發(fā)酵培養(yǎng)基的成分或種子培養(yǎng)基的成分盡量接近,且應(yīng)適當(dāng)豐富些。,A、菌種特性,4、縮短延滯期的意義及方法 (1)意義: 可以縮短生產(chǎn)周期,提高設(shè)備利用率 (2)縮短延滯期的方法 A、通過遺傳學(xué)方法改變種的遺傳特性使遲緩期 縮短 B、接種對數(shù)生長期的菌種,采用最適菌齡 C、盡量使接種前后所使用的培養(yǎng)基組成不要相 差太大 D、加大接種量,(二) Exponential phase (指數(shù)期) 對數(shù)期又稱指數(shù)期。這一階段突出特點是細(xì)菌數(shù)以幾何級數(shù)增加,代時穩(wěn)定,細(xì)菌數(shù)目的增加與原生質(zhì)總量的增加,與菌液混濁度的增加均呈正相關(guān)性。,1、特點 1)生長速率常數(shù)R最大代時最短,生長速度最快; 2)細(xì)胞穩(wěn)定(平衡)生長:細(xì)胞內(nèi)各種物質(zhì)按比例生長,菌體成分均勻; 3)酶系活躍,代謝旺盛 。,(2)三個重要參數(shù): 繁殖代數(shù),生長速率常數(shù),代時 A 繁殖代數(shù)(n) X2=X12n 取對數(shù)表示,2,2,生長速率常數(shù):單位時間內(nèi)繁殖的代數(shù),代時(G):細(xì)胞每分裂一次所需的 時間,(三)Sta

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